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LotjaGi3g1v0315900.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0315900
Transcript ID LotjaGi3g1v0315900.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description DNA-directed RNA polymerase subunit beta; TAIR: AT1G29940.1 nuclear RNA polymerase A2; Swiss-Prot: sp|F4I366|NRPA2_ARATH DNA-directed RNA polymerase I subunit 2; TrEMBL-Plants: tr|I1M0N3|I1M0N3_SOYBN DNA-directed RNA polymerase subunit beta; Found in the gene: LotjaGi3g1v0315900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:66926036..66952683) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTAAAAACCATACAAACTACTAAAAAAAAAACACAAAAAAGCAGCACTTCCGACCAAAAAAACAAAACCCTCAACACCAT ATAAAATCATAAACCCCGCTTCAACCCTCTTCTTTCTGCTTTCTCTTACGGCGTCGCCTCCATCCTCTTCATCTCAGAAC CCAAACCACCACCCAAACGACACCGTTCTACTCCCCTCACCTTCAAACCCTACCTTCCCCAAAGATGGTTGTAAAACCAG GTTCGGTTCCAGACTTGGAGCCACTGCGGGAGCTCTTGAAGCCTCACATAGAGTCCTTCGATTACATGGCTGATGCTGGA TTGGAAATCATGTTCCGCCATATCAAACCCATCGAAGTTCTCGACTCCGCGACATCCACGAAGCTCAGAGATATCCTTTT TGTTGAAAAATTTGCATTTTAATTTTCTTACTTAGCTTTGAATGAATTTAATTGAAGTTGCTATTTGGATTGAATTGGTG TTTGTACTACTTAACCTGGATCTTACTCTGGTTGGATAACCCGATGGTGTATCCGCCTCAGAAGGAGGGGTTTTCGAGGA CCATGAAGTCGGCCTTACTTCCTTTTGAAGCAAGTTTTCAAGTTTCATGATTTAGTATTCAGAATGTTGTTGTTTTGATA GGGATTTTTTTTAACTCATTGTGTGCTTTTTTCTTCGAGCAGTGCAGACAGGCGAAAATTTCATATACAGGGAAGTTTAC AGCTGATGTTTGCTTTCAATATAATGATGGGCCTGTGATAAGAGAAAATTTGAATCTTGGGCAGCTACCCATAATGCTAC AGGTCTCATTTTTTTTTTTTTACCTTTTGTTTGGATTTATAACAATTATTGGTATGTTATGGTTTTGTCTGTGAAAGTAA CCAATGCATTCGGGAATCATTATTTATCCTCATAAGTTTCCTACTGCCACAAAGCTTTAACCTCATTATTTGCTTGCTAT 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AGGCGGTTATGCTTAGCTGGCTAACTGAATCTGTTAGAGTTCTGTTAGAATGCTTGTTAAGCTTGTTGAGCAAGCTATAG AGTTCTATATAAGCTGTAATCAAACTCTTGTATCTTCAGCTTTTCAATAATCAATGATAAACACTTTTCACAATTCTGAG TTTATCTAACAGAAGAGTTTGAAGAAGATAAAAGGATTGATTTTACACATCATTTGGATGGAGAGAAATGAAATAAAGAA CTTTGAGAACATCTTTCTTGTGTGGGGGTGGAAACAGAGGAGACTGAAAATTTATTTGTTAAATGACTTTTATATCCTTG TAATTTAATGGTGGGCAGGTGAGGAAACAAGTAAAATTTTCATATCAACATTTGCTTCCCCCTCTTTACTATTTTATTCC CCTAAGTGGGAAGAAATTTGTGTGGCCCAAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTCTCTCCCCAT TTTGGAGGTGGGCCACAAGACTGATGTAAACAAAGATGGCATATTCCTTCATCTAAATAACATGGGCTAAGTATATTAAG TCTTACTGTCTAAGTAATGCTAATCTTCAATTATTTTTGTTTGGTAAAATATTCACAAATTACATGAGATAATTTTTATT GATTAGCAAGATTACTCATTGTTCATTGTAATACAACAATTATAGCTCACTGTTCTTTTCTTCTCTATTTCAGGGATTAC GTCATATTTTGACTCCCAAGGAAGCATTAAAGATTATTTTAAAATTAAAATATCTATCCTCGATATTTTAGTTGACAGTG GAATGACACAATTAGTGCCAAAGCTACTTCTACCTGGCCCACCTGAAGTTCTTACTGTTCTTTTAGATGGTTGCATTGTT GGTTGTATCCCTTCTGGTGAAGTTGAGAAAATTGTGGCTCACATTCGAGAATTAAAAGTGTCATCTTCTGCAATGGTTTG TTTTTGTCAAATTTACTTTGCTTGCATGATAATATATTCCTTCCTTGATATTGACTTAAAATCATGTGATGCAGATTCCT GATGATCTCGAAGTGGGATATGTTCCTTTGAGCATGGGTGGAGCATATCCTGGTCTCTACCTCTTCACTTCTCCTTCAAG ATTTGTTCGGCCAGTGAGAAATATATCAATTCTTTCCAATGAAAACAAAAACATTGAACTCATTGGACCATTTGAACAGG TCAATATTGATTTTTTTTGTGCATAATATAATTGTCTGCAATTATTCAAGTATAATGGAGATGAGTACTTTCAATTCCGG ATAAGTGTTTATTTACTTTTTTTTTCCAGGTTTTTATGGAGATACGATGTCCTGATGGTGGAGATGGTGGAAGAAAGAGT TCATTTCCTGCAACTCATGAGGAAATTCATCCAACAGGAATGCTTAGTGTAGTTGCTAATCTTACGCCATGGTCAGATCA TAATCAGAGTCCACGAAATATGTATCAGTGTCAGGTTCTATAATATTTTAAATTTGGTCTTGCCGTCTCGATGTGTAAAT CTGCTTCAGGTATAGATTTTTATAGTGTGGGTGTTTATGGTGCAGATGGCAAAGCAAACAATGGCATTCTCGTCACAAAC AATTCAGCATCGTGCTGATCAAAAGTTATATCATCTTCAGGTTTGTTCAAATATACTTTATTGAAATTTGATTTGCCCTC TGTTCCAAATAGATACAGATTCGGTCTTTTAATGTTGGAAACCCAATCTGAGAATGGCCATATTAATTGGTCTTGTAAGT TATATCCTTTACATCTGAAATAGCATTACCTACACTTTTCCTACCCTTAGACTGTTATAAGCAGAATATTTTGTGACATT TTCAGACTCCCCAAACTCCCATCGTTCGCACAAGCACATATACCAAATACAACATTGATGAATATCCAACAGGCACAAAT GCTATAGTTGCAGTTCTGGCATATACAGGGTAACTGCTTTAATGGAAGCAACTGCAGTTTTTTACTTTCTGTGTGCTATT TACGAATATCCTTTATTAATGGATTACAGATATGATATGGAGGATGCCATGATTCTAAATAAGTCATCAGTAGAACGTGG AATGTTTCACGGACAAATTTATCAGGTTTGATGCCTTAACATGAATGATTAAGCTTTCTTGATTTGGATGCATGCCATTT TTACTTTCTTATGACACTATATTGTGAGATGCTATGACTTTATTGTTCATTTTGAAGTTAAGTTTGCTCTAATTGGTTCT CTTTTGATTGAAACTACGCTGTTGCTCTAAGCTTACCACCATCTTTTGTATAGTTTTAGTATCATCCTAGAACCTTGTTA TGGGTTACCTTGGATATCTATTCTATGATCCTGTTTTGTATGGCTTATACTGTGATCCTTGGCTTCTTACTCTGGTAATT CAGGAGATTTTTCTCCTGAGCCCCATTTCTAGGCAATGGCAAGAGTCGCATGACCATTGATCTCTTCATATATCTGTCCT TGTTTTTCTAACAAAATTATGTAGGTACGAGGTATTTATGATTGAATCTATTAGGCTATGTAATCACTTTTAGGTTTGGC CCAGATCAGTCTTTATGCTCTTTCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGGGAGAAGC ATGTGCTGTAAACTGTGTCAAAGTACTCTATGGATGACTGAATATATAATTATGAATATTCAGGTCTTAGTTTCCCAATT TTGTGTGTACTATGAACCCCCGGCCTTACTAATCATATGTACAGTTAAGTTAGATCAATTATGGATCCAATGTTTTTGTA ACTTTATTTCTCTTGTTTTTGTATTGCCATAGTATGCTTATCTTGACTTTTTCTGTTGTTTCCATTGGACTTATAGATAA TGTTTCCTGCTGTGAATTCTGAGTCTAAACTTGCTTCTATGTATTGTTTTGGCAGACTGAAACTGTTGACTTGACTGAAC AAGGCAGCAGGTCTGACCCATCTTCAAGAATGTTCAGAAAAAGTAACATAGAGAAGTCCAAGCTTGATTCAGATGGACTT CCACATGTTGGTCAGGTTTGCCTTCATCTCCCCATCTCTCTTTTCTCTTGACTTCAACTTCGCTTTAAAAAAAATCTTCA TGCATGACTTTCAGATGATACGGCCAGATGAACCCTACTGTAGCATTTATAATGCTTCAACGAGTTCCACGCACACCTTA AAAAAAAAGGGTTCTGAACCTGTTTATGTTGACTATGTTGCTGTTGATGTAAAAAACAAGAAGGACCTTCAAAAGGTGAG CAATGAATTTTATTATAATTTTCTTCTTTGTTGTAATGATTTTTTATTAGAAGAAATAACAATATAAGTTGGTTTTACTT CTAAGCACAAGATGGTCTTGTCTATGAATGAACCATGTTATTTATATCTTTGTTCTTTGGTGCCCCATTTATTTCTCCTT GGAGTTCCTTTACATTTTGATATGCAAAGAACTGGAGAGATTTATTATACCAATTATTTTTTTCTGTCTTGTTATCCTAT TGTTAATACGGTATAGGGGTGGTATTTTAGCCTCTCTGTCACCCTAGGATGCGCGGTCATGATACCGGGTACGGGTACAT TATTTTCAATAAATTTTAGGTACCGGTAAGTTAGTTTGAGTGTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGTATTGGAGTATATCTAGA GAGAGGTTTTTTATGTGAGAGGAACAATTTATAACCTTTGGATTAAAAACCAATTGCTAAGATTAAAACATTCTAAAAAA ACCTCACGTGCCTTTTACACTTGTTGTCTCTCTCCCTACCTTGTGCGAAGTAACGTGCCTCCCTTTTTGTTTGTAAACCC TTGTTTCTAATTCTTCCCACCACAATCTCAACGTGTCATCGTTATTCTGGCAAAAATTCCTTTTCTTCATCTTCTCTTCT TCCTTTCATTTGTTTGGCCACATTTCACCTTGCCTTCCAATATCAGATTCAATATCTTAAATCCCAACCAGGTATCAAAT GATGAAGAAGGACTCGGATAAAGTGGAGTGAAGGATTGGATCTACCCGAGTCAAGAAGGAGCCTGGGCTTATTGTTTCAT ACTTTCTTTTCACTCTTTGGAAGATATTTTTTCTGTTGCAGCAAATGTATTTGCCCTTTTTCCCGATAATTTTCCTGTTG GAAGATTCCAATCAGTTGTGCCATTTTGATTTTCAGCAGTTATTGGGTTTTTTCTTGTTCGAAGACTTCTTGAAAAGTTT GAGAGGAAAATGATTATAGTCAAACCTCATTTTGATTTACTGAGTTGATAATGAATTTTTGTGAGAACTGCAAGAACGAG AACAGCATATTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA ACAAGGGTTTATGAAAAGGGAGCACCTTCGCACCAGCGGTGGAAAGAAGGATGATGTCACATTCGAAGAGACACATGAGG TTTTTTTAGATTGTTTTAATCCTAGCCATTTGTTTTAATCCAAAGGTTAGAAATAGCCCCTCTCACCCTCACATGAAAAA CCTCCTCTCTCTAGATAAAACCTCCATAGTTTTAATTGAAGAATCAAGGGAAGCAGTAGATTCGAAACTAGAGGTTAGGA GGAGGACTTTGAAATCCAAGGGGTTTAGATTTAGCAGATGCAGAGCAGAGTATATGCATTGTTATTTTAGTAAGACTGAT GTTGGAGGTAATATGGAAGTCAAAACTGGAAACGACACCATACCACTAGTTTCACAGTTAAGCTACCTTGGATCGAAGAT AATGGAGAAATTGACAAAGATGTTACACAAAGTGGAGTCAAGTACGCACTGCGCACCCACAAAGTACCCACCATCTACCC GTTTGTTTTTGTTTGGAAATACTTTTGGGTACGTACCCACCCGTACCAGGTGCGGGTATTCAGACATTTTTTTAGTAGTG TGCTTAAGAGCTGTCGCTACTCGCTTGAATGTTTTTCCATTTTAAATAAGATTTTCCTTTCTATAATATATAAAACAGCA ATTGAATGCGTTAATTTGGTTTGTTCATTTGTCACGACTCTCGAGGGTCTGAGTTATTAAAGTATCTATTTTTAGTTTTT TACTCATTTTGGATAACTTTTTTCATTTGTCCCCCACAGTCCACACTGCATAATCCTGACTGTTAAAAATGTTGTTACAA CAATATATGTGGAAGAATAGAAGCTAACCATATACTCAGAATAGGTTGATTTGATTAGTAATGTTATCAAGTGTCAGCCA TGGCGGAATCTCATGGCGGATTTTTGGCTCTTCGCCATGGCTGATATCCCACCATAATCCGCCATCATATTATTTGCCAA ATAAGGCGGGTTTTTGCTCTCCGCCATAGGCTCCCGTCCGCCATTAACAACACTATTTGATTAGCCAGTTTGATATATTT ATTTATCGGGCTGGTAGTTCTCTTTTAAGTTTTTACTATTTTGTTTGATCTGTTAATTTTGGCTCATGCTTATTGTTAAT GGAGCAGGTTAATATTCGTTTTCGACATCCGCGGAACCCGGTGATTGGTGATAAATTTAGTAGTAGGCATGGACAGAAAG GTGTTTGCTCTCAGTTGTGGCCAGATGTTGATATGCCATTTTGTGGAACTACTGGGATGCGCCCAGATCTCATTATCAAT CCTCATGCATTTCCTTCTCGGATGACAATTGCCATGCTTCTGGAATCTGTTGCTGCTAAGGTACTAAAATTAGATATAAT ATGTGAAGATACAAGATAACATGGTATGTAGCCCTTGAAGAGAGGTAGAGGGCCAAAAAGAACGTGGGAAGATATTGTTA AAGATGATCTTATTATATAATATCCCTCATGATCTGATCTTTTATCGAGCTCAATGGCGTAGTATGATCCATATAGCCGA CCCCACTTAGTATGATATTGCTCTTGTTGTTGTCGACAAGTAATAACTATCTCTCATTTCTATGTTGTCTTAATTTTTTC CCTGAAGATCATTTTGTCCGAGGCTTTTACCTATTATGGGTTATGATGTTTTTATTATGTCAGGAACAATGAAGCATTAT ATACTTACACTTCAAAATGGATACTGCTTTAGTGCCGGGCATGTATCATGTCAGATATTCTTATACTTTGTTACGGTTAA CCGTGGTTAGGTAGTTAGAAAGTTGTTAATAGTTTGTTCAGTTTGTTAGTTTGTTGAGTTTGTTGAGTAACAGCAGTGTA TATAAGCTGTGAAAAGCCATTGTAATATTCATGATTGCAGATGAATAAACTACTTCTTCTATTCTCTCTCTGATTCTCTC CTGTTCTTCCCTCTTTCTACCCTAATCCTAACATACTTCTGGCTTTCATATTGAAATTATTTTGTGAATTTTGTGTGTGT GCAAGTGGGATGCCGCAAAGGTTCAATAAAATACTTATAAAACATTGGTATCTTTATGTTAATATAATGTGTGTCAATTT AAAATGGTGTATCTAAGCCTTGCTATATCTTTGTTTATTGCATCTGGGTTAGGATATTAGGAAGTTAGGGAAAGGTCTAA AGCTTTTATGATAATTTCTTCTTGCAGGGAGGTAGCCTACATGGAGAATTTGTAAATGCAACTCCATTTCGTGGTTCAGT GAAGAAAGATAATGGGGAATCTGAAAAGTCAGGTTTGCTCCTTGATGATCTTGGTCAAATGCTAAGAGAAAAGGGATTTA ACTATCATGGTTTAGAGGTTCTGTACAGTGGGGTTTACGGGAAAGAATTAACATGCGAGATATTCATTGGACCTGTTTAT TATCAGCGGCTACGCCACATGGTTTCAGACAAATTTCAGGTGGACAACTTTTTCGCTCTTTTGCCTTCCTATAGCACTAG CAATCAGCAAATAATACTCATCCATACTTTCTGTGTTATTTGGTTTTAACTTAGTATGATTTATGTTTGGCCTTTTGAAC CTGAAAAAGAAGTTCATTTCTTGAGTTAACTTCTGTCTATCCCAATCTTTTGCTTGGACGGTTTTAATTAGCTTTCAAAA TAGAAATGGTTGGTGACTGGTGGCTTTTCTGGATTAGAGTACTGATTTCTATGCTACTACTTTGTTCAGATTGTTTTAGA TATTCCTATAGAAGGGGTCAGCGGTTAGGTGTGATCTTCTCTGGTGCTAATTACTGATCTGCATCGTTTGTTGTTTCATA CCGAGTGCTCTTTCTGTTACAGGTTCGATCTACCGGCACAGTTGACCAGGTTACACGGCAGCCAATAAAAGGACGAAAGC GTGGTGGTGGGATCCGATTTGGTGAAATGGAACGCGACTCTCTACTCGCACATGGTGCTGCATATCTTCTTCATGATAGG CTGCACACTTGTTCTGATTATCACATTGCTGATGTATGTTCCCTTTGTGGAAGCATGCTTGCAACATCATTTATCCAGCC TCAGAAGCTTCCGAGGCGCGAGATTGGTGGGCTGCCCCCAAGAAAAGCTCCGAAAAAGGTCATCTGTCATGCTTGCCAAA CCAGTAAAGGCATGGAGACAGTTGCCATGCCCTATGTGTTTAGATATTTGGCAGCTGAGTTTGCAGCAATGAACATTAAA ATGACTCTTAAACTAAATAATGGAGCTAGCGCCTGATATATATGAGTTGAGAGTATAGTGGATGTGTTAAGATTATGATT TTGCATGAACTTGAATGTCTAATGGAGAGCTCAAATGAGCCATGCATACATCTTAGTGCGACGATGCAGAATGCAATTTG AATTGTTGGCTGGTTTTAACAGTTTCAGATAGATGGACAAGCATGAGGTTCATCCATGTTGTCATGTAGAATTAGTCATT TATTTAATGGATTCAGAAGATGGGAGGAGATAGATAGGTTATGTAATATTGGCATGTAAAATGTGTGGTAACATTGAGTT TTGATGAAAGTTACTTAAATGGTTTGAGCACTGTTACCTCATCTATTGTTTTTCTTTTTAGGCTTAAATATGATTTTGGT CCCTCGGTCTTTGGGTTTAGGCCCCTCTTAATATTTTTTGTTGGTGTACACCCTTATTTTGAAAATAATATGGAGAGATA AGCCTCCACCATTAACTTTACCTAATGGATGGTGGCGTGGCATATTTTAGAGAGATCTAAACCAATGAACTATAATTTAG AGGGATCTAAACCAGAGAACCATAATTTTAGAGGGACCTAAAACTCAATTTTTATCATGTCTTAGGTCCCTCTTAAATCA TGGTTCTTTGGTTTAGGGCCCTCTAAATGATGTAAGGTGACGGCAGGAGCTGAAACCTCAGTATTATTTTGTATATAGGT GTGTATATCAACAAAAAATATTTTGAGGGGCCTAAACCAAAATACCTTAATTTTAGAGGGACCATGAACATATTTAAGCC TTCTTTTT 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0315900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTACAGTCAAAACTATGCAACTTGAGTGGTGCTGATCCCCGAAAACTTGTGTCCTACAAGGAAGAAGCATCAGAAAT GGGTGGTTACTTCATCTTGAATGGCCTTGAGAGAGTCATTCGACTATTAATTTTGCCAAAAAGGAACTATCCCATGAGTA CAGTACGGAATTCATTTAGTCAGCGGCGGGAGGGATATACTGATAAAGCAGTTGTAATAAGGTGTGTAAGAGCTGATCAA TCCTCACTAACCGTAAAATTGTATTACCTTCGTAATGACAGTGCAAGACTTGGTTTCTGGGTAAAAGGGAGGGAGTACTT GCTTCCCGTAGGCATTGTTTTGAAGGCCCTCATTGACACCAGTGACCTTGAAATTCGTACAAATTTGAAAAGCTGCTACA ATGAGAAGTATGAAAAGGGAAAGGGTGCTGTTGGAACCCAGCGTGTTGACGATAGGGCAAGAATGATAATAGAGGAAGTT CGACAGTTGTCTCTTTTCACTCGCCTTCAATGTCTAAATTATATCGGAGAGCATTTCCAACCTATTCTGACTGAACTTAA AAATGACAGCTATGATACCGTGGCCAAGGCAGTTCTAAAGGACTACGTGTTTGTTCATCTGGATGATAATTTTGACAAGT TCAATCTGCTCATCTTCATGCTGCAGAAACTTTTCTCACTTGTAGATGGTACGTCAGTGTTGGACAACCCTGATTCTTTA CAAAATCAGGAGGTTTTACTCCCTGGACATCTGATTACACTTTATCTTAAGGAAAAACTAGAAGATTGGTTGCAAAGTGG AAAAGATGAGATGAAGAGAAAAAGCGGGACGTTTGATTTCAGTGAAATTTTTGTAGTTAAGAAGTGTTTTGATAAAACTC CAGCAAGAGCTATCAGTACATCAATTGAGAATATGTTGAAAACTGGAAGATTGGTTACCAACACAGGTCTGGATCTGCAG CAGAGGGCGGGCTATACAGTTCAGGCTGATAGACTGAACTACTTGCGCTTCCTCTCACATTTTCGTGCTGTTCATCGAGG GGCCTCATTTGCTGGACTCCGTACTACAACTGTGCGGAAGCTGTTGCCTGAATCTTGGGGTTTTCTTTGCCCTGTCCACA CACCTGATGGGGAGCCCTGTGGATTGTTGAATCATATGACTTGCACTTGTAGGATTACGTCATATTTTGACTCCCAAGGA AGCATTAAAGATTATTTTAAAATTAAAATATCTATCCTCGATATTTTAGTTGACAGTGGAATGACACAATTAGTGCCAAA GCTACTTCTACCTGGCCCACCTGAAGTTCTTACTGTTCTTTTAGATGGTTGCATTGTTGGTTGTATCCCTTCTGGTGAAG TTGAGAAAATTGTGGCTCACATTCGAGAATTAAAAGTGTCATCTTCTGCAATGATTCCTGATGATCTCGAAGTGGGATAT GTTCCTTTGAGCATGGGTGGAGCATATCCTGGTCTCTACCTCTTCACTTCTCCTTCAAGATTTGTTCGGCCAGTGAGAAA TATATCAATTCTTTCCAATGAAAACAAAAACATTGAACTCATTGGACCATTTGAACAGGTTTTTATGGAGATACGATGTC CTGATGGTGGAGATGGTGGAAGAAAGAGTTCATTTCCTGCAACTCATGAGGAAATTCATCCAACAGGAATGCTTAGTGTA GTTGCTAATCTTACGCCATGGTCAGATCATAATCAGAGTCCACGAAATATGTATCAGTGTCAGATGGCAAAGCAAACAAT GGCATTCTCGTCACAAACAATTCAGCATCGTGCTGATCAAAAGTTATATCATCTTCAGACTCCCCAAACTCCCATCGTTC GCACAAGCACATATACCAAATACAACATTGATGAATATCCAACAGGCACAAATGCTATAGTTGCAGTTCTGGCATATACA GGATATGATATGGAGGATGCCATGATTCTAAATAAGTCATCAGTAGAACGTGGAATGTTTCACGGACAAATTTATCAGAC TGAAACTGTTGACTTGACTGAACAAGGCAGCAGGTCTGACCCATCTTCAAGAATGTTCAGAAAAAGTAACATAGAGAAGT CCAAGCTTGATTCAGATGGACTTCCACATGTTGGTCAGATGATACGGCCAGATGAACCCTACTGTAGCATTTATAATGCT TCAACGAGTTCCACGCACACCTTAAAAAAAAAGGGTTCTGAACCTGTTTATGTTGACTATGTTGCTGTTGATGTAAAAAA CAAGAAGGACCTTCAAAAGGTTAATATTCGTTTTCGACATCCGCGGAACCCGGTGATTGGTGATAAATTTAGTAGTAGGC ATGGACAGAAAGGTGTTTGCTCTCAGTTGTGGCCAGATGTTGATATGCCATTTTGTGGAACTACTGGGATGCGCCCAGAT CTCATTATCAATCCTCATGCATTTCCTTCTCGGATGACAATTGCCATGCTTCTGGAATCTGTTGCTGCTAAGGGAGGTAG CCTACATGGAGAATTTGTAAATGCAACTCCATTTCGTGGTTCAGTGAAGAAAGATAATGGGGAATCTGAAAAGTCAGGTT TGCTCCTTGATGATCTTGGTCAAATGCTAAGAGAAAAGGGATTTAACTATCATGGTTTAGAGGTTCTGTACAGTGGGGTT TACGGGAAAGAATTAACATGCGAGATATTCATTGGACCTGTTTATTATCAGCGGCTACGCCACATGGTTTCAGACAAATT TCAGGTTCGATCTACCGGCACAGTTGACCAGGTTACACGGCAGCCAATAAAAGGACGAAAGCGTGGTGGTGGGATCCGAT TTGGTGAAATGGAACGCGACTCTCTACTCGCACATGGTGCTGCATATCTTCTTCATGATAGGCTGCACACTTGTTCTGAT TATCACATTGCTGATGTATGTTCCCTTTGTGGAAGCATGCTTGCAACATCATTTATCCAGCCTCAGAAGCTTCCGAGGCG CGAGATTGGTGGGCTGCCCCCAAGAAAAGCTCCGAAAAAGGTCATCTGTCATGCTTGCCAAACCAGTAAAGGCATGGAGA CAGTTGCCATGCCCTATGTGTTTAGATATTTGGCAGCTGAGTTTGCAGCAATGAACATTAAAATGACTCTTAAACTAAAT AATGGAGCTAGCGCCTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0315900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLQSKLCNLSGADPRKLVSYKEEASEMGGYFILNGLERVIRLLILPKRNYPMSTVRNSFSQRREGYTDKAVVIRCVRADQ SSLTVKLYYLRNDSARLGFWVKGREYLLPVGIVLKALIDTSDLEIRTNLKSCYNEKYEKGKGAVGTQRVDDRARMIIEEV RQLSLFTRLQCLNYIGEHFQPILTELKNDSYDTVAKAVLKDYVFVHLDDNFDKFNLLIFMLQKLFSLVDGTSVLDNPDSL QNQEVLLPGHLITLYLKEKLEDWLQSGKDEMKRKSGTFDFSEIFVVKKCFDKTPARAISTSIENMLKTGRLVTNTGLDLQ QRAGYTVQADRLNYLRFLSHFRAVHRGASFAGLRTTTVRKLLPESWGFLCPVHTPDGEPCGLLNHMTCTCRITSYFDSQG SIKDYFKIKISILDILVDSGMTQLVPKLLLPGPPEVLTVLLDGCIVGCIPSGEVEKIVAHIRELKVSSSAMIPDDLEVGY VPLSMGGAYPGLYLFTSPSRFVRPVRNISILSNENKNIELIGPFEQVFMEIRCPDGGDGGRKSSFPATHEEIHPTGMLSV VANLTPWSDHNQSPRNMYQCQMAKQTMAFSSQTIQHRADQKLYHLQTPQTPIVRTSTYTKYNIDEYPTGTNAIVAVLAYT GYDMEDAMILNKSSVERGMFHGQIYQTETVDLTEQGSRSDPSSRMFRKSNIEKSKLDSDGLPHVGQMIRPDEPYCSIYNA STSSTHTLKKKGSEPVYVDYVAVDVKNKKDLQKVNIRFRHPRNPVIGDKFSSRHGQKGVCSQLWPDVDMPFCGTTGMRPD LIINPHAFPSRMTIAMLLESVAAKGGSLHGEFVNATPFRGSVKKDNGESEKSGLLLDDLGQMLREKGFNYHGLEVLYSGV YGKELTCEIFIGPVYYQRLRHMVSDKFQVRSTGTVDQVTRQPIKGRKRGGGIRFGEMERDSLLAHGAAYLLHDRLHTCSD YHIADVCSLCGSMLATSFIQPQKLPRREIGGLPPRKAPKKVICHACQTSKGMETVAMPYVFRYLAAEFAAMNIKMTLKLN NGASA 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 1039 1039 0.0
CDD 1 1038 1038 0.0
SUPERFAMILY 1 1041 1041 7.02E-280
PANTHER 1 1039 1039 0.0
Pfam 1 276 276 1.5E-14
Gene3D 49 236 188 4.4E-59
Pfam 67 245 179 3.0E-14
Pfam 329 392 64 2.4E-27
Gene3D 408 497 90 2.0E-22
Pfam 446 503 58 5.0E-19
Pfam 561 928 368 3.4E-111
Gene3D 562 913 352 2.0E-141
Gene3D 592 763 172 2.0E-141
MobiDBLite 672 703 32 -
MobiDBLite 685 699 15 -
ProSitePatterns 767 779 13 -
Gene3D 915 1041 127 6.4E-38
Pfam 930 1038 109 6.1E-22

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function DNA binding Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid).
Molecular function DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity Catalysis of the reaction: nucleoside triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1). Utilizes a DNA template, i.e. the catalysis of DNA-template-directed extension of the 3'-end of an RNA strand by one nucleotide at a time. Can initiate a chain 'de novo'.
Cellular component Nucleus A membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. In most cells, the nucleus contains all of the cell's chromosomes except the organellar chromosomes, and is the site of RNA synthesis and processing. In some species, or in specialized cell types, RNA metabolism or DNA replication may be absent.
Biological process Transcription, DNA-templated The cellular synthesis of RNA on a template of DNA.
Molecular function Ribonucleoside binding Interacting selectively and non-covalently with a ribonucleoside, a compound consisting of a purine or pyrimidine nitrogenous base linked to ribose.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0315900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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