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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0315900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0315900.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA-directed RNA polymerase subunit beta; TAIR: AT1G29940.1 nuclear RNA polymerase A2; Swiss-Prot: sp|F4I366|NRPA2_ARATH DNA-directed RNA polymerase I subunit 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0GQW5|A0A0R0GQW5_SOYBN DNA-directed RNA polymerase subunit beta; Found in the gene: LotjaGi3g1v0315900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:66926144..66952232) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTCTTTCTGCTTTCTCTTACGGCGTCGCCTCCATCCTCTTCATCTCAGAACCCAAACCACCACCCAAACGACACCGTTC TACTCCCCTCACCTTCAAACCCTACCTTCCCCAAAGATGGTTGTAAAACCAGGTTCGGTTCCAGACTTGGAGCCACTGCG GGAGCTCTTGAAGCCTCACATAGAGTCCTTCGATTACATGGCTGATGCTGGATTGGAAATCATGTTCCGCCATATCAAAC CCATCGAAGTTCTCGACTCCGCGACATCCACGAAGCTCAGAGATATCCTTTTTGTTGAAAAATTTGCATTTTAATTTTCT TACTTAGCTTTGAATGAATTTAATTGAAGTTGCTATTTGGATTGAATTGGTGTTTGTACTACTTAACCTGGATCTTACTC TGGTTGGATAACCCGATGGTGTATCCGCCTCAGAAGGAGGGGTTTTCGAGGACCATGAAGTCGGCCTTACTTCCTTTTGA AGCAAGTTTTCAAGTTTCATGATTTAGTATTCAGAATGTTGTTGTTTTGATAGGGATTTTTTTTAACTCATTGTGTGCTT TTTTCTTCGAGCAGTGCAGACAGGCGAAAATTTCATATACAGGGAAGTTTACAGCTGATGTTTGCTTTCAATATAATGAT GGGCCTGTGATAAGAGAAAATTTGAATCTTGGGCAGCTACCCATAATGCTACAGGTCTCATTTTTTTTTTTTTACCTTTT GTTTGGATTTATAACAATTATTGGTATGTTATGGTTTTGTCTGTGAAAGTAACCAATGCATTCGGGAATCATTATTTATC CTCATAAGTTTCCTACTGCCACAAAGCTTTAACCTCATTATTTGCTTGCTATTTTATACTCCAATCCAACCTTAAAATTT ATCATTGCTTTGATTCTAAGTTCATAATATTAGGTCGTTCAATTTCAATCAATTTGAATGTGTTTAAATGGAATTTTATA 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TGTATCTTCAGCTTTTCAATAATCAATGATAAACACTTTTCACAATTCTGAGTTTATCTAACAGAAGAGTTTGAAGAAGA TAAAAGGATTGATTTTACACATCATTTGGATGGAGAGAAATGAAATAAAGAACTTTGAGAACATCTTTCTTGTGTGGGGG TGGAAACAGAGGAGACTGAAAATTTATTTGTTAAATGACTTTTATATCCTTGTAATTTAATGGTGGGCAGGTGAGGAAAC AAGTAAAATTTTCATATCAACATTTGCTTCCCCCTCTTTACTATTTTATTCCCCTAAGTGGGAAGAAATTTGTGTGGCCC AAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTCTCTCCCCATTTTGGAGGTGGGCCACAAGACTGATGTA AACAAAGATGGCATATTCCTTCATCTAAATAACATGGGCTAAGTATATTAAGTCTTACTGTCTAAGTAATGCTAATCTTC AATTATTTTTGTTTGGTAAAATATTCACAAATTACATGAGATAATTTTTATTGATTAGCAAGATTACTCATTGTTCATTG TAATACAACAATTATAGCTCACTGTTCTTTTCTTCTCTATTTCAGGGATTACGTCATATTTTGACTCCCAAGGAAGCATT AAAGATTATTTTAAAATTAAAATATCTATCCTCGATATTTTAGTTGACAGTGGAATGACACAATTAGTGCCAAAGCTACT TCTACCTGGCCCACCTGAAGTTCTTACTGTTCTTTTAGATGGTTGCATTGTTGGTTGTATCCCTTCTGGTGAAGTTGAGA AAATTGTGGCTCACATTCGAGAATTAAAAGTGTCATCTTCTGCAATGGTTTGTTTTTGTCAAATTTACTTTGCTTGCATG ATAATATATTCCTTCCTTGATATTGACTTAAAATCATGTGATGCAGATTCCTGATGATCTCGAAGTGGGATATGTTCCTT TGAGCATGGGTGGAGCATATCCTGGTCTCTACCTCTTCACTTCTCCTTCAAGATTTGTTCGGCCAGTGAGAAATATATCA ATTCTTTCCAATGAAAACAAAAACATTGAACTCATTGGACCATTTGAACAGGTCAATATTGATTTTTTTTGTGCATAATA TAATTGTCTGCAATTATTCAAGTATAATGGAGATGAGTACTTTCAATTCCGGATAAGTGTTTATTTACTTTTTTTTTCCA GGTTTTTATGGAGATACGATGTCCTGATGGTGGAGATGGTGGAAGAAAGAGTTCATTTCCTGCAACTCATGAGGAAATTC ATCCAACAGGAATGCTTAGTGTAGTTGCTAATCTTACGCCATGGTCAGATCATAATCAGAGTCCACGAAATATGTATCAG TGTCAGGTTCTATAATATTTTAAATTTGGTCTTGCCGTCTCGATGTGTAAATCTGCTTCAGGTATAGATTTTTATAGTGT GGGTGTTTATGGTGCAGATGGCAAAGCAAACAATGGCATTCTCGTCACAAACAATTCAGCATCGTGCTGATCAAAAGTTA TATCATCTTCAGGTTTGTTCAAATATACTTTATTGAAATTTGATTTGCCCTCTGTTCCAAATAGATACAGATTCGGTCTT TTAATGTTGGAAACCCAATCTGAGAATGGCCATATTAATTGGTCTTGTAAGTTATATCCTTTACATCTGAAATAGCATTA CCTACACTTTTCCTACCCTTAGACTGTTATAAGCAGAATATTTTGTGACATTTTCAGACTCCCCAAACTCCCATCGTTCG CACAAGCACATATACCAAATACAACATTGATGAATATCCAACAGGCACAAATGCTATAGTTGCAGTTCTGGCATATACAG GGTAACTGCTTTAATGGAAGCAACTGCAGTTTTTTACTTTCTGTGTGCTATTTACGAATATCCTTTATTAATGGATTACA GATATGATATGGAGGATGCCATGATTCTAAATAAGTCATCAGTAGAACGTGGAATGTTTCACGGACAAATTTATCAGGTT TGATGCCTTAACATGAATGATTAAGCTTTCTTGATTTGGATGCATGCCATTTTTACTTTCTTATGACACTATATTGTGAG ATGCTATGACTTTATTGTTCATTTTGAAGTTAAGTTTGCTCTAATTGGTTCTCTTTTGATTGAAACTACGCTGTTGCTCT AAGCTTACCACCATCTTTTGTATAGTTTTAGTATCATCCTAGAACCTTGTTATGGGTTACCTTGGATATCTATTCTATGA TCCTGTTTTGTATGGCTTATACTGTGATCCTTGGCTTCTTACTCTGGTAATTCAGGAGATTTTTCTCCTGAGCCCCATTT CTAGGCAATGGCAAGAGTCGCATGACCATTGATCTCTTCATATATCTGTCCTTGTTTTTCTAACAAAATTATGTAGGTAC GAGGTATTTATGATTGAATCTATTAGGCTATGTAATCACTTTTAGGTTTGGCCCAGATCAGTCTTTATGCTCTTTCTGAG AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGGGAGAAGCATGTGCTGTAAACTGTGTCAAAGTACTC TATGGATGACTGAATATATAATTATGAATATTCAGGTCTTAGTTTCCCAATTTTGTGTGTACTATGAACCCCCGGCCTTA CTAATCATATGTACAGTTAAGTTAGATCAATTATGGATCCAATGTTTTTGTAACTTTATTTCTCTTGTTTTTGTATTGCC ATAGTATGCTTATCTTGACTTTTTCTGTTGTTTCCATTGGACTTATAGATAATGTTTCCTGCTGTGAATTCTGAGTCTAA ACTTGCTTCTATGTATTGTTTTGGCAGACTGAAACTGTTGACTTGACTGAACAAGGCAGCAGGTCTGACCCATCTTCAAG AATGTTCAGAAAAAGTAACATAGAGAAGTCCAAGCTTGATTCAGATGGACTTCCACATGTTGGTCAGGTTTGCCTTCATC TCCCCATCTCTCTTTTCTCTTGACTTCAACTTCGCTTTAAAAAAAATCTTCATGCATGACTTTCAGATGATACGGCCAGA TGAACCCTACTGTAGCATTTATAATGCTTCAACGAGTTCCACGCACACCTTAAAAAAAAAGGGTTCTGAACCTGTTTATG TTGACTATGTTGCTGTTGATGTAAAAAACAAGAAGGACCTTCAAAAGGTGAGCAATGAATTTTATTATAATTTTCTTCTT TGTTGTAATGATTTTTTATTAGAAGAAATAACAATATAAGTTGGTTTTACTTCTAAGCACAAGATGGTCTTGTCTATGAA TGAACCATGTTATTTATATCTTTGTTCTTTGGTGCCCCATTTATTTCTCCTTGGAGTTCCTTTACATTTTGATATGCAAA GAACTGGAGAGATTTATTATACCAATTATTTTTTTCTGTCTTGTTATCCTATTGTTAATACGGTATAGGGGTGGTATTTT AGCCTCTCTGTCACCCTAGGATGCGCGGTCATGATACCGGGTACGGGTACATTATTTTCAATAAATTTTAGGTACCGGTA AGTTAGTTTGAGTGTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGTATTGGAGTATATCTAGAGAGAGGTTTTTTATGTGAGAGGAACAAT TTATAACCTTTGGATTAAAAACCAATTGCTAAGATTAAAACATTCTAAAAAAACCTCACGTGCCTTTTACACTTGTTGTC TCTCTCCCTACCTTGTGCGAAGTAACGTGCCTCCCTTTTTGTTTGTAAACCCTTGTTTCTAATTCTTCCCACCACAATCT CAACGTGTCATCGTTATTCTGGCAAAAATTCCTTTTCTTCATCTTCTCTTCTTCCTTTCATTTGTTTGGCCACATTTCAC CTTGCCTTCCAATATCAGATTCAATATCTTAAATCCCAACCAGGTATCAAATGATGAAGAAGGACTCGGATAAAGTGGAG TGAAGGATTGGATCTACCCGAGTCAAGAAGGAGCCTGGGCTTATTGTTTCATACTTTCTTTTCACTCTTTGGAAGATATT TTTTCTGTTGCAGCAAATGTATTTGCCCTTTTTCCCGATAATTTTCCTGTTGGAAGATTCCAATCAGTTGTGCCATTTTG ATTTTCAGCAGTTATTGGGTTTTTTCTTGTTCGAAGACTTCTTGAAAAGTTTGAGAGGAAAATGATTATAGTCAAACCTC ATTTTGATTTACTGAGTTGATAATGAATTTTTGTGAGAACTGCAAGAACGAGAACAGCATATTGAAGAAGAAGAAGAAGA AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAAGGGTTTATGAAAAGGGAGCACCTT CGCACCAGCGGTGGAAAGAAGGATGATGTCACATTCGAAGAGACACATGAGGTTTTTTTAGATTGTTTTAATCCTAGCCA TTTGTTTTAATCCAAAGGTTAGAAATAGCCCCTCTCACCCTCACATGAAAAACCTCCTCTCTCTAGATAAAACCTCCATA GTTTTAATTGAAGAATCAAGGGAAGCAGTAGATTCGAAACTAGAGGTTAGGAGGAGGACTTTGAAATCCAAGGGGTTTAG ATTTAGCAGATGCAGAGCAGAGTATATGCATTGTTATTTTAGTAAGACTGATGTTGGAGGTAATATGGAAGTCAAAACTG GAAACGACACCATACCACTAGTTTCACAGTTAAGCTACCTTGGATCGAAGATAATGGAGAAATTGACAAAGATGTTACAC AAAGTGGAGTCAAGTACGCACTGCGCACCCACAAAGTACCCACCATCTACCCGTTTGTTTTTGTTTGGAAATACTTTTGG GTACGTACCCACCCGTACCAGGTGCGGGTATTCAGACATTTTTTTAGTAGTGTGCTTAAGAGCTGTCGCTACTCGCTTGA ATGTTTTTCCATTTTAAATAAGATTTTCCTTTCTATAATATATAAAACAGCAATTGAATGCGTTAATTTGGTTTGTTCAT TTGTCACGACTCTCGAGGGTCTGAGTTATTAAAGTATCTATTTTTAGTTTTTTACTCATTTTGGATAACTTTTTTCATTT GTCCCCCACAGTCCACACTGCATAATCCTGACTGTTAAAAATGTTGTTACAACAATATATGTGGAAGAATAGAAGCTAAC CATATACTCAGAATAGGTTGATTTGATTAGTAATGTTATCAAGTGTCAGCCATGGCGGAATCTCATGGCGGATTTTTGGC TCTTCGCCATGGCTGATATCCCACCATAATCCGCCATCATATTATTTGCCAAATAAGGCGGGTTTTTGCTCTCCGCCATA GGCTCCCGTCCGCCATTAACAACACTATTTGATTAGCCAGTTTGATATATTTATTTATCGGGCTGGTAGTTCTCTTTTAA GTTTTTACTATTTTGTTTGATCTGTTAATTTTGGCTCATGCTTATTGTTAATGGAGCAGGTTAATATTCGTTTTCGACAT CCGCGGAACCCGGTGATTGGTGATAAATTTAGTAGTAGGCATGGACAGAAAGGTGTTTGCTCTCAGTTGTGGCCAGATGT TGATATGCCATTTTGTGGAACTACTGGGATGCGCCCAGATCTCATTATCAATCCTCATGCATTTCCTTCTCGGATGACAA TTGCCATGCTTCTGGAATCTGTTGCTGCTAAGGTACTAAAATTAGATATAATATGTGAAGATACAAGATAACATGGTATG TAGCCCTTGAAGAGAGGTAGAGGGCCAAAAAGAACGTGGGAAGATATTGTTAAAGATGATCTTATTATATAATATCCCTC ATGATCTGATCTTTTATCGAGCTCAATGGCGTAGTATGATCCATATAGCCGACCCCACTTAGTATGATATTGCTCTTGTT GTTGTCGACAAGTAATAACTATCTCTCATTTCTATGTTGTCTTAATTTTTTCCCTGAAGATCATTTTGTCCGAGGCTTTT ACCTATTATGGGTTATGATGTTTTTATTATGTCAGGAACAATGAAGCATTATATACTTACACTTCAAAATGGATACTGCT TTAGTGCCGGGCATGTATCATGTCAGATATTCTTATACTTTGTTACGGTTAACCGTGGTTAGGTAGTTAGAAAGTTGTTA ATAGTTTGTTCAGTTTGTTAGTTTGTTGAGTTTGTTGAGTAACAGCAGTGTATATAAGCTGTGAAAAGCCATTGTAATAT TCATGATTGCAGATGAATAAACTACTTCTTCTATTCTCTCTCTGATTCTCTCCTGTTCTTCCCTCTTTCTACCCTAATCC TAACATACTTCTGGCTTTCATATTGAAATTATTTTGTGAATTTTGTGTGTGTGCAAGTGGGATGCCGCAAAGGTTCAATA AAATACTTATAAAACATTGGTATCTTTATGTTAATATAATGTGTGTCAATTTAAAATGGTGTATCTAAGCCTTGCTATAT CTTTGTTTATTGCATCTGGGTTAGGATATTAGGAAGTTAGGGAAAGGTCTAAAGCTTTTATGATAATTTCTTCTTGCAGG GAGGTAGCCTACATGGAGAATTTGTAAATGCAACTCCATTTCGTGGTTCAGTGAAGAAAGATAATGGGGAATCTGAAAAG TCAGGTTTGCTCCTTGATGATCTTGGTCAAATGCTAAGAGAAAAGGGATTTAACTATCATGGTTTAGAGGTTCTGTACAG TGGGGTTTACGGGAAAGAATTAACATGCGAGATATTCATTGGACCTGTTTATTATCAGCGGCTACGCCACATGGTTTCAG ACAAATTTCAGGTGGACAACTTTTTCGCTCTTTTGCCTTCCTATAGCACTAGCAATCAGCAAATAATACTCATCCATACT TTCTGTGTTATTTGGTTTTAACTTAGTATGATTTATGTTTGGCCTTTTGAACCTGAAAAAGAAGTTCATTTCTTGAGTTA ACTTCTGTCTATCCCAATCTTTTGCTTGGACGGTTTTAATTAGCTTTCAAAATAGAAATGGTTGGTGACTGGTGGCTTTT CTGGATTAGAGTACTGATTTCTATGCTACTACTTTGTTCAGATTGTTTTAGATATTCCTATAGAAGGGGTCAGCGGTTAG GTGTGATCTTCTCTGGTGCTAATTACTGATCTGCATCGTTTGTTGTTTCATACCGAGTGCTCTTTCTGTTACAGGTTCGA TCTACCGGCACAGTTGACCAGGTTACACGGCAGCCAATAAAAGGACGAAAGCGTGGTGGTGGGATCCGATTTGGTGAAAT GGAACGCGACTCTCTACTCGCACATGGTGCTGCATATCTTCTTCATGATAGGCTGCACACTTGTTCTGATTATCACATTG CTGATGTATGTTCCCTTTGTGGAAGCATGCTTGCAACATCATTTATCCAGCCTCAGAAGCTTCCGAGGCGCGAGATTGGT GGGCTGCCCCCAAGAAAAGCTCCGAAAAAGGTCATCTGTCATGCTTGCCAAACCAGTAAAGGCATGGAGACAGTTGCCAT GCCCTATGTGTTTAGATATTTGGCAGCTGAGTTTGCAGCAATGAACATTAAAATGACTCTTAAACTAAATAATGGAGCTA GCGCCTGATATATATGAGTTGAGAGTATAGTGGATGTGTTAAGATTATGATTTTGCATGAACTTGAATGTCTAATGGAGA GCTCAAATGAGCCATGCATACATCTTAGTGCGACGATGCAGAATGCAATTTGAATTGTTGGCTGGTTTTAACAGTTTCAG ATAGATGGACAAGCATGAGGTTCATCCATGTTGTCATGTAGAATTAGTCATTTATTTAATGGATTCAGAAGATGGGAGGA GATAGATAGGTTATGTAATATTGGCATGTAAAATGTGTGGTAACATTGAGTTTTGATGAAAGTTACTTAAATGGTTTGAG CACTGTTAC
CDS sequence (LotjaGi3g1v0315900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTTGTAAAACCAGGTTCGGTTCCAGACTTGGAGCCACTGCGGGAGCTCTTGAAGCCTCACATAGAGTCCTTCGATTA CATGGCTGATGCTGGATTGGAAATCATGTTCCGCCATATCAAACCCATCGAAGTTCTCGACTCCGCGACATCCACGAAGC TCAGAGTCTGGTTGGATAACCCGATGGTGTATCCGCCTCAGAAGGAGGGGTTTTCGAGGACCATGAAGTCGGCCTTACTT CCTTTTGAATGCAGACAGGCGAAAATTTCATATACAGGGAAGTTTACAGCTGATGTTTGCTTTCAATATAATGATGGGCC TGTGATAAGAGAAAATTTGAATCTTGGGCAGCTACCCATAATGCTACAGTCAAAACTATGCAACTTGAGTGGTGCTGATC CCCGAAAACTTGTGTCCTACAAGGAAGAAGCATCAGAAATGGGTGGTTACTTCATCTTGAATGGCCTTGAGAGAGTCATT CGACTATTAATTTTGCCAAAAAGGAACTATCCCATGAGTACAGTACGGAATTCATTTAGTCAGCGGCGGGAGGGATATAC TGATAAAGCAGTTGTAATAAGGTGTGTAAGAGCTGATCAATCCTCACTAACCGTAAAATTGTATTACCTTCGTAATGACA GTGCAAGACTTGGTTTCTGGGTAAAAGGGAGGGAGTACTTGCTTCCCGTAGGCATTGTTTTGAAGGCCCTCATTGACACC AGTGACCTTGAAATTCGTACAAATTTGAAAAGCTGCTACAATGAGAAGTATGAAAAGGGAAAGGGTGCTGTTGGAACCCA GCGTGTTGACGATAGGGCAAGAATGATAATAGAGGAAGTTCGACAGTTGTCTCTTTTCACTCGCCTTCAATGTCTAAATT ATATCGGAGAGCATTTCCAACCTATTCTGACTGAACTTAAAAATGACAGCTATGATACCGTGGCCAAGGCAGTTCTAAAG GACTACGTGTTTGTTCATCTGGATGATAATTTTGACAAGTTCAATCTGCTCATCTTCATGCTGCAGAAACTTTTCTCACT TGTAGATGGTACGTCAGTGTTGGACAACCCTGATTCTTTACAAAATCAGGAGGTTTTACTCCCTGGACATCTGATTACAC TTTATCTTAAGGAAAAACTAGAAGATTGGTTGCAAAGTGGAAAAGATGAGATGAAGAGAAAAAGCGGGACGTTTGATTTC AGTGAAATTTTTGTAGTTAAGAAGTGTTTTGATAAAACTCCAGCAAGAGCTATCAGTACATCAATTGAGAATATGTTGAA AACTGGAAGATTGGTTACCAACACAGGTCTGGATCTGCAGCAGAGGGCGGGCTATACAGTTCAGGCTGATAGACTGAACT ACTTGCGCTTCCTCTCACATTTTCGTGCTGTTCATCGAGGGGCCTCATTTGCTGGACTCCGTACTACAACTGTGCGGAAG CTGTTGCCTGAATCTTGGGGTTTTCTTTGCCCTGTCCACACACCTGATGGGGAGCCCTGTGGATTGTTGAATCATATGAC TTGCACTTGTAGGATTACGTCATATTTTGACTCCCAAGGAAGCATTAAAGATTATTTTAAAATTAAAATATCTATCCTCG ATATTTTAGTTGACAGTGGAATGACACAATTAGTGCCAAAGCTACTTCTACCTGGCCCACCTGAAGTTCTTACTGTTCTT TTAGATGGTTGCATTGTTGGTTGTATCCCTTCTGGTGAAGTTGAGAAAATTGTGGCTCACATTCGAGAATTAAAAGTGTC ATCTTCTGCAATGATTCCTGATGATCTCGAAGTGGGATATGTTCCTTTGAGCATGGGTGGAGCATATCCTGGTCTCTACC TCTTCACTTCTCCTTCAAGATTTGTTCGGCCAGTGAGAAATATATCAATTCTTTCCAATGAAAACAAAAACATTGAACTC ATTGGACCATTTGAACAGGTTTTTATGGAGATACGATGTCCTGATGGTGGAGATGGTGGAAGAAAGAGTTCATTTCCTGC AACTCATGAGGAAATTCATCCAACAGGAATGCTTAGTGTAGTTGCTAATCTTACGCCATGGTCAGATCATAATCAGAGTC CACGAAATATGTATCAGTGTCAGATGGCAAAGCAAACAATGGCATTCTCGTCACAAACAATTCAGCATCGTGCTGATCAA AAGTTATATCATCTTCAGACTCCCCAAACTCCCATCGTTCGCACAAGCACATATACCAAATACAACATTGATGAATATCC AACAGGCACAAATGCTATAGTTGCAGTTCTGGCATATACAGGATATGATATGGAGGATGCCATGATTCTAAATAAGTCAT CAGTAGAACGTGGAATGTTTCACGGACAAATTTATCAGACTGAAACTGTTGACTTGACTGAACAAGGCAGCAGGTCTGAC CCATCTTCAAGAATGTTCAGAAAAAGTAACATAGAGAAGTCCAAGCTTGATTCAGATGGACTTCCACATGTTGGTCAGAT GATACGGCCAGATGAACCCTACTGTAGCATTTATAATGCTTCAACGAGTTCCACGCACACCTTAAAAAAAAAGGGTTCTG AACCTGTTTATGTTGACTATGTTGCTGTTGATGTAAAAAACAAGAAGGACCTTCAAAAGGTTAATATTCGTTTTCGACAT CCGCGGAACCCGGTGATTGGTGATAAATTTAGTAGTAGGCATGGACAGAAAGGTGTTTGCTCTCAGTTGTGGCCAGATGT TGATATGCCATTTTGTGGAACTACTGGGATGCGCCCAGATCTCATTATCAATCCTCATGCATTTCCTTCTCGGATGACAA TTGCCATGCTTCTGGAATCTGTTGCTGCTAAGGGAGGTAGCCTACATGGAGAATTTGTAAATGCAACTCCATTTCGTGGT TCAGTGAAGAAAGATAATGGGGAATCTGAAAAGTCAGGTTTGCTCCTTGATGATCTTGGTCAAATGCTAAGAGAAAAGGG ATTTAACTATCATGGTTTAGAGGTTCTGTACAGTGGGGTTTACGGGAAAGAATTAACATGCGAGATATTCATTGGACCTG TTTATTATCAGCGGCTACGCCACATGGTTTCAGACAAATTTCAGGTTCGATCTACCGGCACAGTTGACCAGGTTACACGG CAGCCAATAAAAGGACGAAAGCGTGGTGGTGGGATCCGATTTGGTGAAATGGAACGCGACTCTCTACTCGCACATGGTGC TGCATATCTTCTTCATGATAGGCTGCACACTTGTTCTGATTATCACATTGCTGATGTATGTTCCCTTTGTGGAAGCATGC TTGCAACATCATTTATCCAGCCTCAGAAGCTTCCGAGGCGCGAGATTGGTGGGCTGCCCCCAAGAAAAGCTCCGAAAAAG GTCATCTGTCATGCTTGCCAAACCAGTAAAGGCATGGAGACAGTTGCCATGCCCTATGTGTTTAGATATTTGGCAGCTGA GTTTGCAGCAATGAACATTAAAATGACTCTTAAACTAAATAATGGAGCTAGCGCCTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0315900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVVKPGSVPDLEPLRELLKPHIESFDYMADAGLEIMFRHIKPIEVLDSATSTKLRVWLDNPMVYPPQKEGFSRTMKSALL PFECRQAKISYTGKFTADVCFQYNDGPVIRENLNLGQLPIMLQSKLCNLSGADPRKLVSYKEEASEMGGYFILNGLERVI RLLILPKRNYPMSTVRNSFSQRREGYTDKAVVIRCVRADQSSLTVKLYYLRNDSARLGFWVKGREYLLPVGIVLKALIDT SDLEIRTNLKSCYNEKYEKGKGAVGTQRVDDRARMIIEEVRQLSLFTRLQCLNYIGEHFQPILTELKNDSYDTVAKAVLK DYVFVHLDDNFDKFNLLIFMLQKLFSLVDGTSVLDNPDSLQNQEVLLPGHLITLYLKEKLEDWLQSGKDEMKRKSGTFDF SEIFVVKKCFDKTPARAISTSIENMLKTGRLVTNTGLDLQQRAGYTVQADRLNYLRFLSHFRAVHRGASFAGLRTTTVRK LLPESWGFLCPVHTPDGEPCGLLNHMTCTCRITSYFDSQGSIKDYFKIKISILDILVDSGMTQLVPKLLLPGPPEVLTVL LDGCIVGCIPSGEVEKIVAHIRELKVSSSAMIPDDLEVGYVPLSMGGAYPGLYLFTSPSRFVRPVRNISILSNENKNIEL IGPFEQVFMEIRCPDGGDGGRKSSFPATHEEIHPTGMLSVVANLTPWSDHNQSPRNMYQCQMAKQTMAFSSQTIQHRADQ KLYHLQTPQTPIVRTSTYTKYNIDEYPTGTNAIVAVLAYTGYDMEDAMILNKSSVERGMFHGQIYQTETVDLTEQGSRSD PSSRMFRKSNIEKSKLDSDGLPHVGQMIRPDEPYCSIYNASTSSTHTLKKKGSEPVYVDYVAVDVKNKKDLQKVNIRFRH PRNPVIGDKFSSRHGQKGVCSQLWPDVDMPFCGTTGMRPDLIINPHAFPSRMTIAMLLESVAAKGGSLHGEFVNATPFRG SVKKDNGESEKSGLLLDDLGQMLREKGFNYHGLEVLYSGVYGKELTCEIFIGPVYYQRLRHMVSDKFQVRSTGTVDQVTR QPIKGRKRGGGIRFGEMERDSLLAHGAAYLLHDRLHTCSDYHIADVCSLCGSMLATSFIQPQKLPRREIGGLPPRKAPKK VICHACQTSKGMETVAMPYVFRYLAAEFAAMNIKMTLKLNNGASA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 9 | 1161 | 1153 | 3.97E-300 | – | |
| PANTHER | 13 | 1159 | 1147 | 0.0 | ||
| PANTHER | 13 | 1159 | 1147 | 0.0 | – | |
| Pfam | 16 | 396 | 381 | 8.0E-29 | ||
| CDD | 17 | 1158 | 1142 | 0.0 | ||
| Gene3D | 169 | 356 | 188 | 5.2E-59 | ||
| Pfam | 187 | 365 | 179 | 3.6E-14 | ||
| Pfam | 449 | 512 | 64 | 2.7E-27 | ||
| Gene3D | 528 | 617 | 90 | 2.2E-22 | – | |
| Pfam | 566 | 623 | 58 | 5.6E-19 | ||
| Pfam | 681 | 1048 | 368 | 4.2E-111 | ||
| Gene3D | 682 | 1033 | 352 | 2.5E-141 | ||
| Gene3D | 712 | 883 | 172 | 2.5E-141 | ||
| MobiDBLite | 792 | 823 | 32 | - | – | |
| MobiDBLite | 805 | 819 | 15 | - | – | |
| ProSitePatterns | 887 | 899 | 13 | - | ||
| Gene3D | 1035 | 1161 | 127 | 7.5E-38 | – | |
| Pfam | 1050 | 1158 | 109 | 7.1E-22 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity | Catalysis of the reaction: nucleoside triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1). Utilizes a DNA template, i.e. the catalysis of DNA-template-directed extension of the 3'-end of an RNA strand by one nucleotide at a time. Can initiate a chain 'de novo'. | ||
| Cellular component | Nucleus | A membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. In most cells, the nucleus contains all of the cell's chromosomes except the organellar chromosomes, and is the site of RNA synthesis and processing. In some species, or in specialized cell types, RNA metabolism or DNA replication may be absent. | ||
| Biological process | Transcription, DNA-templated | The cellular synthesis of RNA on a template of DNA. | ||
| Molecular function | Ribonucleoside binding | Interacting selectively and non-covalently with a ribonucleoside, a compound consisting of a purine or pyrimidine nitrogenous base linked to ribose. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0315900.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…