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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0471100 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0471100.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT2G27210.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9SHS7|BSL3_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B0P825|A0A0B0P825_GOSAR Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0471100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:88687066..88700040) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTAAAACCTCCCTTAGAACTAGGAACCGGTGAACCCCGTTAATTAGCCATCACAATCCCCGGTTATTCCAGTCACATCTC CTCCGTCCTCCCTTCCACCGCCGCCCCACAACCTCCTCCATACCGGCACATTCCGGTCACCCTTCTTCAAACCTTCTACC CAAACAAGAAAAAAAAGACATTTATTAGAAAAATTAGAAAGCCAGAAAAGAAAAAAACAAATACACAGCACAATCCACTC GTCATAGAGAAAAGTAATTGGATTTTGTTTTTATTATTATCAATTTATCATCATCATCATTTTTTTTCATTTTTATTAAT TTTATCTTTCGCTATTGGTTTTGCGATTGAACCTTGTGAACAAGAACAAGAACAAGAAGATCGTGCCCTTCGTCACGTTT CGTTTCGCTTCTTCGTTCACCGTTTCTTCCAATTTCGTCAGATTCACGTGTTTTCGATTCAAGAGCCAAGAATCTGAGTT AGGGTTTTGGAAATTTCTCGAAAAACCGAATCGGAATGCTGGTTCGGGACGCGGAATTGGAAGAATTCATCTAGCTCCGA TCTTAGCAAAATTGCTGGAATCTTAGGGGTTGGAGAATGGACGTTGATTCCTCGATGTCACCGGAGACCGATCACGTTGA CGCGGCGGCGGTGCTCAACCATGCCGAGAAAGAGCAGCAGCAGATAGGGGACCCGCAGCCGCCATCCCCGACTTCCGATG CCGGATCTCCGGTTCTGCCGCCGGGGCCGCCTGCCGCGGCTCTGGGGCAGCAAGGTTCTGTTGTTGGCCCGAGGCTTGCG CCGACTTACACCGTGGTGGATGCGATTATAGAGAAGAAGGATGACGGGCCCGGGCCGCGGTGTGGACACACGTTGACGGC GGTGGCGGCTGTTGGAGAGGAAGGCACGCCGGGGTACATTGGTCCGAGGCTGATTTTGTTCGGCGGTGCCACGGCGCTTG AAGGGAATTCTGGGGCTTCCGGGACTCCTTCATCTGCTGGAAATGCAGGCATCCGTATGTATTTCACTTTCTTCTTGTGT TTTTCAGTTAGTAATGTAGTTGCAGTTGCTGAGTACTTTGCATTTTGGTGTTTAGTTTGATTAGAATCAGGAAATTTATG CTAGGAAATTTATGTAGGCTTTTGTTTTGTCTAGTTATGGTAGATGGTTATATTGTTGTTTTAGGACACAGGGATGGTTT TTGAGGCCTGTTCGATTTTCATGGCATCTTTTTGGTCTTTGGAAACTATGGCTCTTATAAACCTTGTTTTGGATACTTCA TCTTGGGAGCACTGTGCAATTAAATGATTTGAGAATCTATTGAATGTTTACCAATTACGCTGTTCTATAACATCGTTTCC TTTTTCGTTTTGGATATTTTGTCGGTGGGTAAACTTAGAAACTCATGAAATTTAATTTTGAAACATTACCATTCCCACGG CTCTGGACCCCCTTTTGTAGGGGAGAAGAAGTGGTGGTGGAAACATATGCCCTATGAAGCATTTCATTGCATTGAATGGC TTCGGTTCCTTCAGTATAGGGTGGCCAAACAATGGATTTAGTGGTTCTTTATGTTGTTTCCATTTACGGTTCATCATGTT TCATTTAGGGTTGTTAATGACGGATAGCGTAGCGTAGCGGCAAGCCCAAAAAACACTATTTCAAGCACTATTGCGTTGCT ATAGCAGCAAATAACAGACAATAGCGGCAAATAGCGGTGAGCCCCCAGGACGCTATGCTATAACGCTATTGCGCCGCTAC AGCGTGCTGTTAACAAGCCTGGTTTCATTACGTTCCAATCCACTTAATTGTATTTACTCTCTTAGCCTCTCTATGCTTAT TTGCGTGCCAGATTCTTTTTCATTATCTTTTAGGGCTGCTGCACCCGTATCTGGATCGAGCTAGTGAACCCCAATTCAAC 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GTTAATTTTTTTCATTATTCTAGAAATCCATATTGATATTGGTGATGCTGAATTTGATGCATCATATGAAACTTTTTAAA TATACAGTATTTGTCCGCGGAAATCTTTGTGATCTATCAGGTATCTATTAGATGTGCTTTATCTATAGACATGAATTTGA AAGGACAGACTAGTTCCATTTATTAGTGCCGTTGCTTTAAGTTGTTTTACTGCATTCTCGTTTATTCTCTTCTTTACTGA TCCTGCTGTTAATGCTGGAAATTGATATTTTCTCTAATTTGATGATTGCCTTTTAAGATGCTGGGTGTTATTTTTATTAT TATTTTTAGGCACTTGCCTTGTTGGACATGGTCTGTACTTAATTTTTAAACTCCTGCTATCTGAAGAGGTTAAACTTGCA TATGGCATTATGCTTTTCTAAATGATTGCTGTTGCAGCCTGATCGAGTCATGGAATTTTGCAACAACAATGATCTTCAGT TGATTGTTCGTGCACATGAATGTGTGATGGATGGCTTTGAGCGATTTGCCCAGGGACATTTGATCACCCTTTTCTCAGCT ACAAATTACTGTGGTATTTGTTGTGCTGGCTTGTAGATTGAACTTCGTTCCTTAGATTATTTTCCCTTTAAATTTGACAC TTTCTTGGTGACAACAGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCGATATTAGTTTTGGGTAGAGATCTTGTCGTGGTTCCTAAAC TGATTCATCCACTACCACCTGCAATTTCTTCACCTGAAACGTCTCCAGAACGTCATATTGAGGATACGTGGATGCAGGTA TTACTTCAAATATTACTCATCAAATGGGCGGGCACCCCCATTAGTGTTGTGAAATATTGCACCTATCAAACATAAACGAG CACATTTAAGTAAATATTAAGATGATCTATTGCAGTTACTCTGGGATTAAACAAACTTTCTGCTGTTTTTTAATTATTTA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0471100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi3g1v0471100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDVDSSMSPETDHVDAAAVLNHAEKEQQQIGDPQPPSPTSDAGSPVLPPGPPAAALGQQGSVVGPRLAPTYTVVDAIIEK KDDGPGPRCGHTLTAVAAVGEEGTPGYIGPRLILFGGATALEGNSGASGTPSSAGNAGIRLAGATADVHCYDVLTNKWSR ITPYGEPPSPRAAHVATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQRPRWHRVGVPGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAI GGNDGKRPLADVWALDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDASSVPLASAYGLAKHRDGRWEWA IAPGVSPSPRYQHAAVFVNARLHVSGGALGGGRTVEDSSSVAVLDTAAGVWCDTKSVVTSPRTGRYSADAAGGDASVELT RRCRHAAAAVGDLIFIYGGLRGGILLDDLLVAEDLAAAETTSAASHAAAAAAASNVQVGRVPGQYGFVDDRTRPTMPEVT ADGAVILGNPVAPPVNGDMYTDISTENAMLQGTRRTSKGVEYLVEASAAEAEAISATLAAAKARQVNGEVELPDRDRGAE ATPSGKQTPSFIKPDSAGSNSIAPGGVRLHHRAVVVAAETGGALGGMVRQLSIDQFENEGRRVSYGTPENATAARKLLDR QMSINSVPKKVIAHLLKPRGWKPPVRRQFFLDCNEIADLCDSAERIFSSEPTVIQLRAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEY GAPSTAGDIAYIDYLFLGDYVDRGQHSLETISLLLSLKVEYPNNVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGERDGIWAW HRINRLFNWLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINHVEQIENIQRPITMEAGSIVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLV TFGPDRVMEFCNNNDLQLIVRAHECVMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPAISS PETSPERHIEDTWMQELNANRPPTPTRGRPQVTNDRGSLAWI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 61 | 61 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 1002 | 1002 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1002 | 1002 | 0.0 | – | |
| PIRSF | 35 | 1002 | 968 | 0.0 | ||
| MobiDBLite | 38 | 52 | 15 | - | – | |
| Gene3D | 134 | 396 | 263 | 2.7E-26 | ||
| SUPERFAMILY | 143 | 432 | 290 | 2.88E-40 | ||
| Pfam | 240 | 284 | 45 | 1.1E-4 | – | |
| Pfam | 329 | 375 | 47 | 2.5E-5 | ||
| MobiDBLite | 547 | 584 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 563 | 577 | 15 | - | – | |
| Gene3D | 632 | 974 | 343 | 9.3E-110 | ||
| CDD | 651 | 953 | 303 | 0.0 | ||
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| SMART | 671 | 955 | 285 | 9.0E-106 | ||
| Pfam | 699 | 906 | 208 | 5.5E-33 | ||
| PRINTS | 699 | 726 | 28 | 1.5E-60 | ||
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| ProSitePatterns | 768 | 773 | 6 | - | ||
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| MobiDBLite | 978 | 1002 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 978 | 993 | 16 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Phosphoprotein phosphatase activity | Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Biological process | Brassinosteroid mediated signaling pathway | A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid. | ||
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0471100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…