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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0555700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0555700.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | TATA-binding protein associated factor-like protein; TAIR: AT3G54280.1 ROOT GROWTH DEFECTIVE 3; Swiss-Prot: sp|B5BT18|BTAF1_ARATH TATA-binding protein-associated factor BTAF1; TrEMBL-Plants: tr|K7LS80|K7LS80_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0555700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:97329741..97346634) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCCCAGCAGTCATCTAGGCTTCAGCGCTTGCTTACTCTCTTGGACAGTATCCTTCACATTTTCTTTATCTTTATTAC TTTTACGTATCATTTGTTTTTCTTGAATTTTCTTTAACCATACCTTTAAAGCTGGGTCAACCCAAGCAACAAGGTTGACT GCTGCTCGTCAGATAGGGGATATTGCAAAATCACACCCTCAAGACTTATCCAGTCTTCTTAAGAAGGTATTGATTTTTTC TACTGTTCTATTCACCCTGCTTTTGTGGTAATATGTTTTTTTTTCTCCCTTAGTGATTTTGTATTATTGATAATGTGTGT CAGTTATTTGTCAAATTGATTTTAACTACCTATTGTTATGTGATGTTTAGGTTTCTCAATATTTGCGGAGTAAAAATTGG GATACAAGAGTTGCAGCTGCCCATGCAATTGGGTCTATTGCTGAGAATGTTAAACACATAAGCCTGAATGAACTTATTAC TTCTGTCGTGTCAAAAATATCGGAGTATGGGAAATCTTGTAGCGTCGAGGATCTGTGCGCATGGCCGTATTTACAATCAA AAATTTCAGGAAGCTCATTTAGAAGGTTGTACATTGAATTTGAATTATTCTTTGACTTTTTTCTGTTTGCATAAAAAATA CATTCCTGTTTGAGAGAAAATAATTAAATTACAAATTTGCGGCGTAGATATCCTCCAAAATAGAAATGATTATAAAAAAG GGAATATATGATAATTGGGAGTGCAGCACCAGGCTGCCTTATCCTCTACATATAAAAATTGAAAATTTCTTGAAACAGCA GTGGGCAGAACACCAAAGAGAAGCACATACTAGATTATATGCAATAACATGTTCAAGGGCAGAGTGACACCTTTAAAAGT TGCAGCATTACACTCCAATCTGATGCACCAAAAAATTGTAGAAACTGCGTACTGCCACAAAGTTTTAGCCCCTTGTTTTT 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0555700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCCCAGCAGTCATCTAGGCTTCAGCGCTTGCTTACTCTCTTGGACACTGGGTCAACCCAAGCAACAAGGTTGACTGC TGCTCGTCAGATAGGGGATATTGCAAAATCACACCCTCAAGACTTATCCAGTCTTCTTAAGAAGGTTTCTCAATATTTGC GGAGTAAAAATTGGGATACAAGAGTTGCAGCTGCCCATGCAATTGGGTCTATTGCTGAGAATGTTAAACACATAAGCCTG AATGAACTTATTACTTCTGTCGTGTCAAAAATATCGGAGTATGGGAAATCTTGTAGCGTCGAGGATCTGTGCGCATGGCC GTATTTACAATCAAAAATTTCAGGAAGCTCATTTAGAAGCTTTGATATGAACAAGGTGCTTGAATTTGGAGCTTTATTAG CATCTGGTGGACAGGAATATGATATTGGAAATGATAATTCAAAGAACCCGAAGGAGCGATTGGTTCGCCAGAAGCAAAAT CTTCGACGTCGATTAGGTTTGGATGTCTGCGAACAATTTATGGATATCAATGATGTAATAAGAGATGAAGATCTTATGGC ACCGAAATTTGAATCACAGATCAATGGAATAGATCATAGAGTTTTTACATCTTGTTCTGTACATAATATCCAGAAAATGG TTGCAAAAATGGTTCCTAGTGTTAAGTCTAAGTGGCCAAGTGCAAGAGAACTGAATCTTTTGAAGCGCAAAGCAAAAATA AACTCAAAAGACCAAACTAAAAGCTGGTGTGAAGATGGAAGTACAGAGGCATCAGGTGCTCAAAATTTGACTTCAAAAGG CATATGTGCGGATACAGTAAATTATGGCAAGGCATTCGTGGATGCTAATCATGATGATGACGGCTTGGATCATGATGGGG ATGGACAATGGCCTTTCAATACTTTTGTTGAACAACTTATTATAGATATGTTTGATCCTGTTTGGGAGATACGGCATGGT AGTGTGATGGCATTGAGAGAGATTTTAACACATCAAGGTGCTTCTGCTGGAGTATTTAAACATGATTCACGGTTCGGTGG GACCTTGTTTGTTGAATTAGAGGACAAAAGTATACCAAAAATATTGAAGAGAGAGAGGGAAATTGATTTGAATATGCAAG TTTCAGCGGATGAGTCTGTATCAAACTTGAAGAAGCCAAAACTTGAAGATTTATCATCATCAACTTCTTTGGATAGTGTG ATGACTAGCAGCAATGAAGGTGATATTGAAATCAGCATTTGTTCTGAAACCCATGGAAGCGATATACCTTTGGACAATGT GAATGGGAAATTTAATGGTAATTCTGTTGCCATGGATCTGGAATCTCCCTCTGACTCTTTACATGATGCATACAACGAAT CTGCTAATTTAGCAGAGCAGAAGGGTTATTCTGATGACAGTAATATTCCTTCTGGAAACCCTAATGTGCTGAGAAATCTT CCTCAGAATTGTGAGCTGATGAACCTGGTTAAAGTGGCTAGGAGTTCCTGGCTTCGAAATTGTGAATTTCTTCAAGATTG CGTGATACGCTTTTTGTGTGTTTTGTCACTTGATCGCTTTGGAGATTATGTATCTGATCAGGTTGTTGCTCCTGTGCGTG AAACCTGTGCACAGGCATTAGGTGCTACGTTTAAGTATATGCATCCAGCACTAGTAAATGAAACACTGAACATATTATTG AAAATGCAGTGTAGGCCAGAATGGGAGATTCGTCATGGCAGTCTTCTTGGTATCAAATATTTGGTTGCTGTGAGGCAGGA GATGCTTTCTGATTTGCTTGGACGTGTTCTTCCTGCATGTAAATCTGGGCTGGAGGACCCAGATGATGATGTTCGAGCAG TTGCTGCTGATGCTTTAGTCCCAGCTGCAGCTGCAGTTGTTGCTTTACAGGGTCAAACATTGCATTCAATTGTGATGCTG TTGTGGGATATATTGCTTGATTTGGATGATTTAAGTCCATCCACCAGCAGTGTGATGAATCTTCTGGCAGAAATTTATTC TCAAGAAGAGATGATCCCTAAGATGTATAAAGTTTTTAAATTGGGAGACAATGAAATAGAAAACGCAGATGGTGGTTGTG GTGATGATGACGGAGAAGAAAATCCTTATGTGCTTTCAACTTTGGCACCGCGCTTGTGGCCTTTTATGAGGCATAGCATC ACATCTGTCCGTTATTCAGCAATACGGACTCTGGAGAGGCTACTTGAAGCTGGATATAAGAGAAACATGTCTGAGCCATC TAGTGCTTCATTTTGGCCCTCTTCTATATTTGGAGATACCCTTCAAATCGTCTTCCAGAATCAGCTATTGGAAACAAATG AGGATATTTTGCAATGTTCTGAGAGAGTTTGGAGTCTCCTTGTTCAGTGTTCTGTGGAGGACTTGGAGGCAGCTGCGAGG TCTTACATGTCTTCTTGGATTGAACTTGCATCTACACCATTTGGTTCAGCTTTAGATTCCTCAAAGATGTATTGGCCTGT GGCCTTCCCAAGAAAAAGTCAACTTAGAGCAGCAGCTAAAATGAGAGCTGTGAAAATTGGAAATGAATATGGTGGCGATC CTGGCCTTGATTCGACAAAATTAACTATTCTACAAGATAAAAATAGAGATGTTGCTTTGAATTCTGTTAAGATAGTTGTT GGTGCTGATATGGACACTTCTGTAACTCATACTCGGGTAGTTACAGCAACTGCTTTGGGAATTTTTGCTTCCAAGTTACC TGAGGGTTCTCTAAAGTATGTGATTGATCCACTGTGGAGCTCTCTAACCTCTTTGTCTGGTGTCCAACGGCAGGTTGCAT CCATGATACTTATTTCTTGGTTCAAGGAGATTAAGAACATGAGTTTGTCTAAAATCCCTGATGGTATTCCAGCTGCCCTC AGAGATTGGTTGCTGGACTTATTAGCTTGCTCTGATCCAGCTTTCCCCACTAAAGGTTCACATCTTCCTTATGCTGAGCT TTCAAGAACTTATTCAAAGATGCGTGGTGAGGCTGGTCAATTGCTTAATGCTGTCAAGTCTTCTGGTATGTTTAATGAGT TATTGGAAACTACCAAAATTGAGTTGGATAGCGTAAGTGTGGATGATGCTATTGGTTTTGCATCAAAGATTCCAGCATTT TGTAATGATAGTTCTACAAACGAATCATTGGGAAAGAACACAATGGATGATATTGAATCCTCAAAACAGAGGCTCTTGAC AACTGCTAGCTATTTGAAATGTGTACAGAGTAATCTGCATGTTACAGTCACATCTGCTGTTGCTGCAGCTGTTGTTTGGA TGGCTCAATTTCCTACACGACTCACCCCTATCATTTTGCCTTTGATGGCTTCAGTCAAACGAGAGCAGGAGGAAATAATT CAAGTGAAGTCAGCTGAGGCCCTTGCTGAGCTAATGTATCACTGTGTTACTCGTAGACCTTGCCCCAATGATAAATTAAT TAAAAATATATGTAGTTTAACTTGCATGGATCCCTCTGAGACTCCTCAAGCTAAATCCATCTGTTCCATTGAGAGTATTG ATGACCAAGGTTTGCTATCGTTTAAAACTCCCGTGAGCAAACAGAAGTCTAAGGTCCATGTTCTAGCTGGTGAAGATCGA TCGAAGGTCGAGGGATTTATAAGTAGACGTGGATCTGAGCTATCCTTGAGGCTTCTATGTGAGAAGTTTGGTGCTTTGTT ATTTGATAAGCTTCCTAAGCTGTGGGATTGCCTTACTGAGGTTCTTAAGCCAAGCTCCTCTGAGTCCCTACTTGCCACTA ATGAAAAGCAAGTTACTGCTGCTATTGAGTCTATCTGTGATCCTCAAACCTTGATTAACAATATCCAGGTGGTGCGGTCT GTTGCTCCCATGTTAAATGAGGAGTTGAAACCAAAACTTTTGACACTTCTCCCATGTATTTTCAAATGTGTTCAGCATTC ACATGTTGCAGTTAGATTAGCTGCTTCACGCTGCATTACTTCAATGGCCCACTCAATGAAAGTGAAAGTTATGGGAGCTG TGGTTGAAAATGCTATCCCTATGTTGGAAGATGCATCATCAGTTCATGCTCGGCAAGGAGCTGGCATGTTGATTAATTTT CTTGTTCAGGGTCTGGGTGTAGAGTTAGTCCCTTATGCTCCTCTATTGGTGGTTCCACTTCTAAGATGCATGAGTGATTG TGATCAGTCTGTCAGAAAGAGTGTGACCCATAGTTTTGCTGCTCTTGTACCTTTACTTCCTTTAGCGCGAGGTCTTCCCC AACCAATTGGATTAGGGGAAGGTGTATCTAGAAATGCAGAAGACTTACATTTTCTGGAGCAACTCCTTGACAACTCTCAT ATTGAAGATTATGAGTTGTGCACTGAATTGAAAGTAACATTGAGAAGATATCAACAGGAAGGCATAAATTGGTTAGCTTT TCTAAAGCGTTTCAAGCTTCATGGAATTTTATGTGATGATATGGGGCTTGGAAAAACACTTCAAGCATCAGCCATTGTAG CCTCTGATATAGCAGAGCATCGAACTCCAATTGGGAATGATGATCTTCTGCCATCTTTAATTATTTGCCCATCAACACTA GTTGGGCACTGGGCCTTTGAGATAGAGAAGTATATTGATGTTTCAGTGATATCTAGTCTTCAGTATGTTGGTTCTGCTCC TGACCGAATGCTTCTCCGTGATAATTTTTGCAAGCATAATGTCATTATAACATCATATGATGTTGTCCGTAAAGATATTG ATTATTTGGGACAGCTGTTCTGGAATTACTGTATTTTAGACGAAGGACATATAATCAAGAATGCTAAGTCTAAGGTTACA CTTGCTGTAAAGCAGTTGAAAGCCCAGCACCGTTTAATATTGAGTGGGACACCAATCCAGAATAACATAATGGACTTGTG GTCTCTTTTTGATTTTCTGATGCCTGGATTTCTTGGAACAGAGAGACAGTTCCAAGGAACATACGGAAAACCACTTTTAG CTTCTAGAGATCCAAAGTGCTCTGCTAAGGATGCTGAAGCAGGAGCACTTGCTATGGAGGCATTGCATAAGCAGGTCATG CCTTTCCTCCTTCGAAGGACTAAGGATGAAGTCTTGTCTGATTTGCCGGAGAAGATAATTCAAGACAGATACTGTGATTT GAGCCCTGTACAACTTAAACTTTATGAACAGTTTTCTGGTTCTCGTGCAAAGCAAGAAATGTCATCTGTTGTAACGACAA ATGAACCTGCTGCAGCAGAAGGAAGTAGCCGTAATACTAAAGCGGCTTCACATGTTTTCCAGGCACTCCAATACTTGCTA AAACTCTGCAGTCATCCATTGCTTGTCTCTGGTGGGAAGATTCCAGATTCATTCTCTGCCATATTCTCGGAACTGTTTCC TGCTGGCTCTGATGTCATTTCGGAACTTCACAAACTCCATCACTCCCCAAAATTAGTCGCTCTTCATGAGATTCTTGAAG AGTGTGGAATTGGAGTTGATGCTTCAGGTTCTGAGGGTACAGTCAGCATTGGGCAGCACAGGGTCTTGATATTTGCTCAA CATAAGGCTTTCCTTGATATAATTGAAAGAGATTTGTTTCAGACACACATGAAGAATGTCACATATTTGAGGCTGGATGG ATCAGTTGAGCCAGAAAAGCGTTTTGAAATCGTCAAAGCTTTCAATTCAGACCCTACCATTGACGTCTTGCTGCTTACAA CACATGTTGGGGGGCTTGGTCTGAACTTGACATCTGCAGACACCCTTGTTTTTGTGGAGCATGACTGGAATCCTATGCGT GATCATCAGGCTATGGATAGAGCACACAGGCTTGGCCAGAAAAAAGTAGTTAATGTCCACCGTCTAATAATGCGTGGTAC TTTGGAAGAGAAAGTTATGAGCCTACAAAGGTTCAAATTGTCGGTGGCCAATGCTGTCATTAATTCAGAAAATGCCAGTA TGAAAACAATGAATACAGATCAGTTGCTTGATTTATTTGCATCTGCAGAAATCTCCAAGAAGGGGGCTTCTGTCGTGAAA AGTTCAGAGGACAACTCTGACGGAGACACTAAATTAGTAGGCAGTGGGAAGGGGTTGAAAGCAATACTTGGGGGATTGGA GGATCTATGGGACCAATCACAATATACAGAGGAGTACAATCTGAATCAATTCTTGGCAAAGCTTAATGGCTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0555700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAQQSSRLQRLLTLLDTGSTQATRLTAARQIGDIAKSHPQDLSSLLKKVSQYLRSKNWDTRVAAAHAIGSIAENVKHISL NELITSVVSKISEYGKSCSVEDLCAWPYLQSKISGSSFRSFDMNKVLEFGALLASGGQEYDIGNDNSKNPKERLVRQKQN LRRRLGLDVCEQFMDINDVIRDEDLMAPKFESQINGIDHRVFTSCSVHNIQKMVAKMVPSVKSKWPSARELNLLKRKAKI NSKDQTKSWCEDGSTEASGAQNLTSKGICADTVNYGKAFVDANHDDDGLDHDGDGQWPFNTFVEQLIIDMFDPVWEIRHG SVMALREILTHQGASAGVFKHDSRFGGTLFVELEDKSIPKILKREREIDLNMQVSADESVSNLKKPKLEDLSSSTSLDSV MTSSNEGDIEISICSETHGSDIPLDNVNGKFNGNSVAMDLESPSDSLHDAYNESANLAEQKGYSDDSNIPSGNPNVLRNL PQNCELMNLVKVARSSWLRNCEFLQDCVIRFLCVLSLDRFGDYVSDQVVAPVRETCAQALGATFKYMHPALVNETLNILL KMQCRPEWEIRHGSLLGIKYLVAVRQEMLSDLLGRVLPACKSGLEDPDDDVRAVAADALVPAAAAVVALQGQTLHSIVML LWDILLDLDDLSPSTSSVMNLLAEIYSQEEMIPKMYKVFKLGDNEIENADGGCGDDDGEENPYVLSTLAPRLWPFMRHSI TSVRYSAIRTLERLLEAGYKRNMSEPSSASFWPSSIFGDTLQIVFQNQLLETNEDILQCSERVWSLLVQCSVEDLEAAAR SYMSSWIELASTPFGSALDSSKMYWPVAFPRKSQLRAAAKMRAVKIGNEYGGDPGLDSTKLTILQDKNRDVALNSVKIVV GADMDTSVTHTRVVTATALGIFASKLPEGSLKYVIDPLWSSLTSLSGVQRQVASMILISWFKEIKNMSLSKIPDGIPAAL RDWLLDLLACSDPAFPTKGSHLPYAELSRTYSKMRGEAGQLLNAVKSSGMFNELLETTKIELDSVSVDDAIGFASKIPAF CNDSSTNESLGKNTMDDIESSKQRLLTTASYLKCVQSNLHVTVTSAVAAAVVWMAQFPTRLTPIILPLMASVKREQEEII QVKSAEALAELMYHCVTRRPCPNDKLIKNICSLTCMDPSETPQAKSICSIESIDDQGLLSFKTPVSKQKSKVHVLAGEDR SKVEGFISRRGSELSLRLLCEKFGALLFDKLPKLWDCLTEVLKPSSSESLLATNEKQVTAAIESICDPQTLINNIQVVRS VAPMLNEELKPKLLTLLPCIFKCVQHSHVAVRLAASRCITSMAHSMKVKVMGAVVENAIPMLEDASSVHARQGAGMLINF LVQGLGVELVPYAPLLVVPLLRCMSDCDQSVRKSVTHSFAALVPLLPLARGLPQPIGLGEGVSRNAEDLHFLEQLLDNSH IEDYELCTELKVTLRRYQQEGINWLAFLKRFKLHGILCDDMGLGKTLQASAIVASDIAEHRTPIGNDDLLPSLIICPSTL VGHWAFEIEKYIDVSVISSLQYVGSAPDRMLLRDNFCKHNVIITSYDVVRKDIDYLGQLFWNYCILDEGHIIKNAKSKVT LAVKQLKAQHRLILSGTPIQNNIMDLWSLFDFLMPGFLGTERQFQGTYGKPLLASRDPKCSAKDAEAGALAMEALHKQVM PFLLRRTKDEVLSDLPEKIIQDRYCDLSPVQLKLYEQFSGSRAKQEMSSVVTTNEPAAAEGSSRNTKAASHVFQALQYLL KLCSHPLLVSGGKIPDSFSAIFSELFPAGSDVISELHKLHHSPKLVALHEILEECGIGVDASGSEGTVSIGQHRVLIFAQ HKAFLDIIERDLFQTHMKNVTYLRLDGSVEPEKRFEIVKAFNSDPTIDVLLLTTHVGGLGLNLTSADTLVFVEHDWNPMR DHQAMDRAHRLGQKKVVNVHRLIMRGTLEEKVMSLQRFKLSVANAVINSENASMKTMNTDQLLDLFASAEISKKGASVVK SSEDNSDGDTKLVGSGKGLKAILGGLEDLWDQSQYTEEYNLNQFLAKLNG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 4 | 95 | 92 | 2.7E-7 | ||
| PANTHER | 4 | 1982 | 1979 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 6 | 1493 | 1488 | 2.69E-70 | ||
| Gene3D | 502 | 663 | 162 | 9.7E-7 | ||
| Pfam | 783 | 1237 | 455 | 3.6E-103 | ||
| Gene3D | 1236 | 1409 | 174 | 6.2E-9 | ||
| Gene3D | 1426 | 1685 | 260 | 1.6E-69 | ||
| SUPERFAMILY | 1433 | 1686 | 254 | 4.83E-56 | ||
| SMART | 1450 | 1646 | 197 | 1.1E-27 | ||
| CDD | 1454 | 1686 | 233 | 1.02072E-138 | – | |
| ProSiteProfiles | 1466 | 1636 | 171 | 20.468 | ||
| Pfam | 1472 | 1768 | 297 | 5.0E-60 | ||
| SUPERFAMILY | 1687 | 1988 | 302 | 1.47E-58 | ||
| Gene3D | 1696 | 2012 | 317 | 4.0E-75 | – | |
| CDD | 1801 | 1943 | 143 | 1.04272E-53 | – | |
| ProSiteProfiles | 1804 | 1978 | 175 | 13.691 | ||
| Pfam | 1832 | 1932 | 101 | 1.4E-13 | ||
| SMART | 1846 | 1932 | 87 | 2.7E-16 | ||
| Coils | 2045 | 2050 | 6 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0555700.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…