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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0005000 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0005000.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | C2 and GRAM domain-containing protein; TAIR: AT1G03370.1 C2 calcium/lipid-binding and GRAM domain containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9ZVT9|C2GR1_ARATH C2 and GRAM domain-containing protein At1g03370; TrEMBL-Plants: tr|I1KNM4|I1KNM4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0005000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:829550..842552) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAAGATATGAGGCAACATAGTAGATTGATAATTGCAACGTGAAATAGTCCTATGTCAACGGTGGCCACCACCACCACCT GGTCCTTCTACTTCTACAAAATGGAAAAGAAAAGAAAATCACACACAACACAAAACACCTGAGAGAGACGCACACAGTTA TTTCCTCTCTTTCCATTTTCCATTCATTAATTTTTAATTTCCAAACCACAATTAATTTGGGTCTTTTTAGGGTTTGTTTA TTCATCCTTAATAATACAATTTTATGCAGTTTTCTTATAATGAATGATGAATTCATAACAAAAACTATGTAAATCTATTT GTTTTTGGGTTTTATGCATTCAATTTTCCCCATTTCATGTTCCTGGGTTGTTCCGTGATTAGAAAAGTGACATATTTTTT GCCTAAGATTTTGGTTATACAATGAAGCTCATGGTTCGTGTGATTGAAGCAAATAACTTGGCAGCCATGGATTCCAATGG GGTAAGTCATTTCTACGTGCGGGTACAGTTGGGAAAGCACAAGTTCAGGACCAAAGTGATTAAGAACGATTTGAAACCAA AGTGGGATGAACAGTTTAGTTTTTGGGTTGATGACCTCAAAGATTCACTTGTTATCTCTGTCATGGATGAAGATAAGTTC TTCAATAATGACTTGGTGGGGCGCCTTAAAATTCCAGTCTCACAAGTTTTCGAGGAGGATATTAAATCTCTTGGCAATGC TTGGTATTCTCTCAAATCCAAAATAAAGAAGTCCAAGATCAAGGAATGTGGTATATTCTACATTTCTACTCTGCTCAACT AAACTATCCTCAATCTTATCTAATACTTTATTTCATTTCTTCCACATTGTCTTGTTCTTTTTAGTAGAATTAGTCTGCAT TCAAACAGGCTAGCTAGTTTGCTTATTTCTTTTTAGCTAGTCTGCACTAAAGTCGACAGGGGTAAGTTGGTGGCCCACCG TGGGATTCTCTTCTCCCTCGACATCTAGGTGATCGGGGACGGGAGAAGAGTGATGAGGGGAAGGCAGAGGCGACGACAGA ATGGCAGGAACCTGATCCCCATCATTGCAATCCATTGAACGAGCGGGGAGGCCCGAGGTGAGCTCGCCTCAACTCGTTGA GTCGAATGATCAGATACAAGGACTGATTGAGGGGCGACGGTAGTAGAGCCCTCGAGCGCAGGTTGGCTGGTGATGGTCTC CTCGGGGGCGGACTGTGCATTCGTATTTCCTTCTGGATTGGAGTCGCTCCCAGCAGCCGGGTCATGGCGAGAGACGGCAG TCTCGCCAAATTTGGGCTTTTTGAATTTTTTGCTTCTCTATTTCGATGGGAGGGCGACGGTCCGATCCTCTCCAACCAAT GCCGGTTCGCCATATTCGACTTCTTTGGATTTTCGGGGTTTTTTCTTCGGCAGGGGGAGGACAGCCTCGTCGGCGGCGCT CGACGCCGGCTCACCAGATTCAGGAGGGGAAGTCTCACCGGCAGTGTTTGGCGCTGGCCCCCAGATAAAACTTCTTCGGA CCTTTTGATTTGCTTTTTCGGTAAGTGGGCGACGGGCACGTCGACTGCGTCCGAAGCGGCGGCGCGTCTTCTCTTGCCCC CATCAGTGTTGAAAACGGGAGGGAATTTAACCACCTTGGAGGCGAGGGCACTCTCCAATTCAACCTTGGTGAACTTCATT TCCTCTGAGAATAAAAGGAGATATGCACAACAAGTGTTAGCAAGAGATTCAGTTAAAATAATAATAATAATAATAATAAT AATAATGGTGCGATATGAAGAGGGAGTAGGCAGGGTTTCAACCTTAGAGTGGACCAAGGGTGTTTCCCCGAGCGGCCACC AGCAGTTGCGAGCACTCGAGAATGGGAAGCTTAGAGAAGAAGCTGCGTATGATCTTGTCTTCACCGCTCAGCGACGCGTC 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GTTATGGATAATTCCTTTGAATGACATTGATTTCATTATTATTCATACAATATTTTTATTCACTTTCTTGCTGAAAAATC AGAACCGCACCTTAAGATGTTGCTAGAAAAGTCTTGTTTTTTTGAACTTAACTAGCATTGCTGGTCTATCGATAGCGATA CGGCTATTTCCAGCGCTATCTATATATATCCCAATATCTTTGCAAGTTGAGGCATTGGCATCACCACAAAAAACAAGCTT GTAACCCAAATTAGCATAAGAAATTCGGAAAGTCCCGTTCTTAATCTGTCGACCCGGGTAATTGATAGGGTTGCCAGCGC TAAAAAACCACACTTTGGCCAACTCATCATAGATAAGAACCCAAGGAAAAATATTTTTATCTTTGCTCAGAACAAAACTG ACCATTACGATGTCGTCTCTTTCGATGACCTTTGATGATGCAGTGACGTTTGAGAAGCTCACTGGCAAGCCAGCAAAGGT CTTAGACCTATCGAGAACAAGAGAAACTGTTCCATCGGGAGCAACAACTCTATCCGAAATTCCACCAAGTGTTTTACCCC AATCCAAGGGTAAGATGTTGTAGTAGCTTGCAGCATTCAAATGGTTACCATCTGTGTCTAGCAACGCACCAGCAGAAAAC TTGAGTTCTATCGTCAAGGTAATGTAAAGGAAAAAGACGATAAGTAATCGAGAATTTGTTGTCATTGCTATAGGAGTGTT TGTTTGTGTTTTGGGATGAGAAAATAGTGCTTTAGGATCATCTATTTATACATAGTTAAATTCAAACCAAATCACGAAGA AAAACATGGATATATGGATCCAACGGTGGTGAAGGATCCGTTTATATTTTACACCAACCAATTAGAAATTAGTAATGGTA ATAAAGTTGAAATAATTTATTTAGCCAATTGTGGTAATATATTATTATAAATTTGATGCTTATATGCACATATTAGTAAA 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CTAATGCATGCTTTCCTACAAAGGGAGAGGGAGGATCTAGGATGAGTTATTTTATGGAGATATTGTTGGAGTCATCTTTC AATACTTGACTTCCATCATAGCTTGTATAACTAGTATTTTCTCTATTTCTCACGATGTTCTTTGTTTCTGTAATTTGATT TTATTTTGGGTTTGTCTTGAATATGGGCCACTTAGGTTTGGTATTTGACTTATATGGCTTGTCTTTCGGCCCAAATATGA TTTAGAATTGAGTTTTACGTTTTTTTTTTCCAAATAGGTTAGTATACGAGTGATAGTGAGTATATGAGGGGTAGAATAAG ATTTGAGCCACTTGGGCTTGTATTTAGTTGCATTTGCATTAATTTAGGTGTTTTGGGTTTATTTATTTAATCTTTTTATT AGTTTTTTTAGTTTTAGTTAGAGATTAATCTACTTTTATACAATTCTAATTATGGATTTTCTTTGTTTGGAGTTCTTCTC CATGCTTAAGGCTTCTTTTGGTCAATTGGTGTTATAAGAGCTTTAATGATTCATAAACATATTGAAAGATTGATATGGAT TGTTGTATGCTTAGTTCATAGAAATTGGAGAGACACCTATGTCTTAGGTTTGTTAATTTTCTTTGTGCATGACAATTGGA AAGTTTGTGTCAGTTTTGTGAATGAAAGGAACCGCCTTTTGCATCAGTCATCCGACGAAATGTTTATATTTGGTTTCAAA TCTGGAGAGGTCAAACGTGGATCCATATATCCAAAAGCAACTATTTCTTGCTTCTGTAAACGTGGATCGGGGCCAAACGT GGATCCTGAATGGGTTTTCCAAACACACACTAACCCTTAGGTAATAATATTATGAGTTGGGAATGAGGTCTGAACCGAGT GACAGTCGGGATACTCACCATTAAGATATGATTATCTAGTTAGGAGCTGAAAGAATCTTATGAGTGACAATGTTATATTT TATCCACCTAAACATGAACTTCTTTGAATAAGAATAAAGCTTTGGGTATGTCTCATCGAGTAGGTTTAGATTATAATGCT CCTTTTGTGATTACTTGGACTTGAGGAATTAAGGCTAGCATTTCAACGGGTAGGTTTACCTAGCTAAGGAATTAGTATAT GATTAGCTCTTATCGGCGTATTGAATGTTAAATTTATCTTATAAGAGTATAATGATTGAGAACAAGTTGTGGATCAAGTG AAATCACCTCCTAGAATTATAATTATATTTTTGGTTTAACAGGTTGGACCAATGACTCGCCAGTTAAACGTTTGACTCAT TAATTCAGTGTCTCAACCGAATCAATCACGAAATTGAGTTTAATAACATCGGTTAGTGCAGTGCACAAAAATTATTCTCC TAATATTTTGGGGTAAATTCTTATCATTGTATGAAAGAGTGTATGATATATGATTTGTATAAATAGTAAAGTTGGATAGA AAAACGAAATGATGGAAGGGACAAAGATATGAGGCAACATAGTAGATTGATAATTGCAACGTGAAATAGTCCTATGTCAA CGGTGGCCACCACCACCACCTGGTCCTTCTACTTCTACAAAATGGAAAAGAAAAGAAAATCACACACAACACAAAACACC TGAGAGAGACGCACACAGTTATTTCCTCTCTTTCCATTTTCCATTCATTAATTTTTAATTTCCAAACCACAATTAATTTG GGTCTTTTTAGGGTTTGTTTATTCATCCTTAATAATACAATTTTATGCAGTTTTCTTATAATGAATGATGAATTCATAAC AAAAACTATGTAAATCTATTTGTTTTTGGGTTTTATGCATTCAATTTTCCCCATTTCATGTTCCTGGGTTGTTCCGTGAT TAGAAAAGTGACATATTTTTTGCCTAAGATTTTGGTTATACAATGAAGCTCATGGTTCGTGTGATTGAAGCAAATAACTT GGCAGCCATGGATTCCAATGGGGTAAGTCATTTCTACGTGCGGGTACAGTTGGGAAAGCACAAGTTCAGGACCAAAGTGA TTAAGAACGATTTGAAACCAAAGTGGGATGAACAGTTTAGTTTTTGGGTTGATGACCTCAAAGATTCACTTGTTATCTCT GTCATGGATGAAGATAAGTTCTTCAATAATGACTTGGTGGGGCGCCTTAAAATTCCAGTCTCACAAGTTTTCGAGGAGGA TATTAAATCTCTTGGCAATGCTTGGTATTCTCTCAAATCCAAAAAAAAGAAGTCCAAGATCAAGGAATGTGGTATATTCT ACATTTCTACTCTGCTCAACTAAACTATCCTCAGTCTTATCTAATACTTTATTTCATTTCTTCCACATTGTCTTGTTCTT TTTAGTAGAATTAGTCTGCATTCAAACAGGCTAGCTAGTTTGCTTATTTCTTTATTTTATGGTGTGAAATTAACCCTATT TATGACTGATTATGTCCAATTTGAGACTTTGGAGTTTACATCTTAAAGGGCCATTTGCATCAAGTCCTTTTGGAAAATAA TATGCTGACTAACTATGAATGTTCTGCTTGTATGGATCATGCCGTTGAACTTAAATTGTGATATTTCTTTTTTGTTCTTC TGGATAGGTGAGATTTATCTGAGTATATCCCTTTGCCAAAATAATACATCTCCAGAGTCAAATGGTATTGGTGATCAGAT GCTCCACCCAAGAAAATGTGTTGATGCAACTCCTGATTTTTCTACGAAATCTTCCTTTGGCCGTTCAAACTCATCTTCTC CTGCAAGGGAAGAAATAACATCTACTAAGGATGAAAAATCGTGTTCACAAAAATCACTTGCTGGTAGACTTGCTCAAATA TTTAATAAAAGTTCTGATATGTCTTCAATTTCACCCAGTACAAGCATGGATTTAGACTTATCAGACACAGATAAAACTGA AGTTTGCGAGCCAAAGACTGAGGATCCATCCTCTAATGACACTTTTGAAGAACTTGTCAGAAAAGTGCAGTCTGCAGATC AAGGAAGTGAAATTCCTAGCAACTTATCTGGAGGGGTGCTTATAGATCAATTATACATTATTGCACCAGAAGAATTGAAT GTATTATTGTTTTCACCCGATTCTAATTTTCCCAAGTCATTGGCAGATGTACAGGGTACCACAGAACTGCAAATAGGTCT TTGGAAGTTAGAGAATGACGGAGAAAGCTTGAAAAGATCCCTTACTTACATCAAAGCTGCCAGTAAATTAATCAAGGCAG TAAAAGGCTATGAGGAACAAACTTATTTGAAAATTGATGGGAAGAACTTTGCAGTTCTGGCAAGTGTCAGCACTCCGGAT GTTATGTATGGAAGCACGTTTAGGGCAGAATTACTTTATGTGATCACACCAGGACCAGAGTTGCCATCTGGAGAACAGTG TTCGCGTCTCGTGATATCATGGCGAATGAATTTTTTGCAAAGCACCATGATGAAAGGGGTGATAGAAAATGGAGCTCGGC AAGGTATGAAGGAAAGCTTTGTTCAGTATGCCATTTTGTTATGCCAAACTGTTAAGCCTGTTGACTCCAAGGACCTTGGT TCCGGCAAGGAACAAGCTTTGGCATCATTACAGGCAGAGCCCCAGACAGATTGGAAGATAGCACTGCAATATTTTGCTAA CTTCACATTTGTCTCAACTTTCTTAATGGGGTTGTACCTTCTTGTCCATATTTGGTTGGCTACACCTGACACAATTCAAG GGCTTGAGTTTATTGGGCTTGACTTGCCCGATTCAATTGGTGAATTTGTTGTTTCTGCTATCTTGGTACTTCAAGGTGAA CGAATGCTGGGTTTAATCTCACGTTTCATGAAGGCTAGAGCACGAAAAGGTAATCCTGTAGTTGCCTTTATTTTCTACAA TAATCTTTTCATGTGAGAATTTGATTGAATTTAAAATCTCATTCGACTAGATAAGTACTAGAGCAAATGAAAATTTTGTA TTTTCTATTACTCAAAGAATAATACGCCAAGACAGAAAAAGAAGTACAAAGGTGGAAACAATAAATCCTTTTGAGAAAAA TAGAATAAAAGGGAAGTCAACCAGCAACAAAGAGAAAAACATGTACTAAAGCGCGTAAGGAAACTTATATCATAAAAGAT GATAAACCAATAAGTCACTGTATAAGTTACTATGTTTGCACTCCATCCAAATACATGATTGATGCATACAAATTTGAATT CCGTATAGCATTATAATGCTAATTAGCAAATAGCTCTCTTAACAAGAAGAGGTATACCCAGTGCTAGTAGACATGATAAG AAGAAGTTCATGTCTTATTCAGATATTATCCTCTGAATTTTATTTAGTTAAGAGAGATTGTTTTACAATATTTTACAGTT GCACAAATAATAAAAATTAATGTTACAAATACAACAGCTCATTTATATGTCAAACCCTTAATATCTTTTTGGGATAAATT ATATCTGGAACATCCTCCTTTTCATCAAAATTAGTAAAAGGTTCATGCCAAAATTTCCAGGCTATACCTTAAAATGGACT AGTCTTGAACTCTATAAATACATCACACAAACATTAGGTAATAAAACTTAACGCAGTTTCATGCTTGGAAAAAAATGTTA ATTCTACTGATCATAATAGACCTAATTGTAAAGGTTTCCAAGGACTATTACCTTCCCAAAAGAACTTCCATCACGATATA CATTTGCAAGTATAGTAACATTGTACATGGGTGAATGGAATTACCTTTTGTGATTGTAAGATCCTTTTGTATGCATGGCG GAAGTAATATGAGCCTAATAAATGGCAAGGTAGTCTGGGTGAAAATTTCACCCAATTACTTGTTTGAAATAATAGATTTG GCTTTCTTATATCTCCAGAATTGTTATTGCTTTTTACTGGGTTGACAATGAATTTGTTTCTCCCTCGGTGTTATTATTTA CCCCTTATTTCTTTTATTGGTACCTATGTGTTTCCTTATATGGTCTTTTTTATGGGGGTACTTCAATATTAGGTAGTGAC CATGGAATTAAAGCACAAGGAGATGGATGGTTGCTAACTGTGGCCTTAATTGAAGGAAGCAATTTAGCTGCTGTTCATTC TAGTGGGTTTTGTGATCCTTATGTGGTGTTTACTTGCAATGGGAAAACAAGAACAAGCTCGATCAAGTTCAAGAAATCTG ATCCTTTGTGGAATGGTGAATATCATATCATGGATCATTTGGTCATTCTTATATTATAACTCAAATTTGAAACCCTGAAA GGCTGAAACAACAGCAGTATATCAAATCAGTCTAGTTTTTTTCCTATATGTGGTTTAGACTTTTGTAAGATAAAGTATTA TTTATTAAGAAAATTGTCTATCTGTGCAGAAATATTTGAATTTGATGCGATGGATGACCCTCCTTCTGTACTAGATATGG AAATTTATGATTTTGATGGACCCTTTGATGAAGTTGCATCTCTAGGACATGCTAAAATCAATTTCCTCAAAACGAACATC TCAGATCTTGCTGATATTTGGGTTTCTCTTGAAGGAAAGTTGGCTTTGGCATGTCAATCTAAGTTGCATTTAAGAATTTT CTTGAACAACACTAGGGGTGGGAATGTTGTAAAACACTATATAAGTAAAATGGAGAAAGAAGTGGGTAAAAAGGTATGAA TCCATCCATGTTACCATCATTTAGTTGTAATTTCTTTTTTGTTTGTACTCTTGGATCATTACAATTTTTTGACTTACTTT CTCCTTATTTACAAACTTGTAGATTAATTTGCGGTCTCCTCAAACAAATTCAGCCTTTCAGAAACTCTTTGGGCTCCCAC CTGAGGAATTCTTGATCAATGACTTCACTTGTCATTTGAAAAGGAAAATGCCCCTGCAGGTATGGCTGGTTTGTTGCGAG CTGTTGAAAGCGGTGGTTAATTTCTATTTTGGTTTTAACTAGTACATGTTTCTTTTGTATAATCTCATCAAGTTGTCAGT GCTTCTCTACAGGGCCGCCTATTCGTCTCAGCAAGAATAATTGGGTTTCATGCAAATTTGTTTGGACACAAGACAAAATT CTTTTTGCTTTGGGAAGACATTGAAGACATCCAAGTCATTCCTCCTACATTTTCATCAATGGGTAGTCCAATAATAGTCA TAACTCTTAGGCATGGTAGAGGTGCGGATGCAAGGCATGGTGCAAAAACACAGGATGAACAAGGCCGACTTAAGTTCCGT CTCCAGTCCTTTGTGTCTTTCAATGTAGCACACAGGTAGACTGGACTTATTTAATGTTACCATACAAGCTTGATTTTTCT ACATACTAGCCTTTTCATATGCAAAAAATGCAACTTGTATAAAAATATTCTGTTATCTGTTTTACTTATTTTTGCTTCAC CCTTGTAGTTTAGGGTATATAACAACACCAAAATATGTTCATTTTGGTTGCTGTTTTTTCTTATGTGTTTTCAGTATAGT CCTTGAGCTCATTTTGTTTCATGTCGGCCAAAGTTTGGTTTGACAATTGTTTGTGAAGTTTGAGAATTGCGAATTATGAA TGCTTTCATACATGAAATCTATGATAATGTTTTCTTCCAACTTTATTTGATTATCATTTTCTGAGATAAAAATCGTTTAG CTACCAAAACTCTCCAGCTAGATTTTTATGTGAAATTTTGAATTCACCCAAGTAAATTCCATTGCTTTGGAAGCATATCT TGGTTATCAAACTGCTCATAATGATGCTTTTAAAGAATTATCTATGAAATTAGTACTGATACACTATATTGTAAAATATC ATATCTCTCTAAGCTGAAAACTATTCGAGTGCCGATATAGGACTATCATGGCTCTCTGGAAGGCCAGATCCTTGAGTCCT GAACAGAAGGTCCAATTAGTTGAAGACGACTGTGAAACAAAGAGCACTAACAGTGAAGAGAGTGGGTCATTCATTGGCCT TGATGAAGTTAGCATGTCTGAGGTTCATTCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTGTAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGCAAA ATATTGGTTCCATATTTGATTTCTTTAATATCTTGGCCAATATTTGTGTTTGATTATAGTTGTTTTCCTTTATCAATTTA GGTCAGTTTCTTTATAGAGCTATTCAATGGGGGTGAGTTGGACCGTGGGGTCATGGAAAAATCTGGTTGTGTTAATTATT CTTACACCCCTTGGGTATCTGAGTATAGTGATGTCTATGAGAGGGCGATATATTACAAGTTTGAGAAGCGTATTTCACAT TATAGAGTTGAAGTAACTAGTACTCAACAAAAATCTATTTTGGATGAAAAGAGTTGGCTATTGGAAGAGGTCATGAACTT CCATGGAGTCCCTCTTGGAGATTATTTCAATGTAAGCCAAATTTAACTTGCTCCTTAACTTTCTGTGACCATATGTTAAT ATCTTTATTTTCGAGGATTTTCTTATTTTAATCATAATCTTTTTGTTTGTTTTCATGTTATGTACCAATGACTAAGGTTT TATAATAACATTCCACAGCTGCACCTTCGCTATCAAATCGATGATTCACCCGGGGAAGCACAGGGATGTAAAGTAAAAGT ATTTTTTGGAATTGAATGGCTGAAAAGTACAAAACATCAGAAAAGGATTACAAAGAACATCCTGAAAAATCTACAGGAAC GTTTAAAGTTGACCTTCAGTCTAGTAGAGAAGGAGTTTTTGGCAAAATAGTGAATGAGTTATGCTGAATTTGACCTTGCA CAACCAGTCTATAATGAAGATGAAAGTTGCTCAGGTATAACGATGGTGATTTGCAACCAAAACTGTCCTTCAAACCATAG TATTGACTTGTAGCATCTTTGGATTTACCTCTAGTTCTCTTTCAGCAGAATCAATAATGTAACCCAGAAGCTGCCCACAG AAGCTTCTTCCCAGAATGTATTTTGGCTTCAAAATCAATTGTAGAAGGATTTTTCAGCATGCGATCACTTGGAGATATTA CTAACTTTGTAAATTACTAGTCGGTACCTAGCAGAAGATACTCAGATTGTATGAGCAGTTACAAGCAATCCAGCTTCTGG TTTTGTTATCTCCTGTCACCATTTAGATGATAAGTTCTCTGGTTAACAATGGTCCAGTATCTTGTATCATAGCTAGTTTT GTCTTTTGCTTTCAAAAGTATAGATACTGTTAAAGAGAAGTTTTGATCAATGTGCTTGTTGTAAACAAATTTTTGAGCTC AAGTGCAATGGAAGTCATCAGCATATGTGTGTCTTCTTTATCA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0005000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGCTCATGGTTCGTGTGATTGAAGCAAATAACTTGGCAGCCATGGATTCCAATGGGGTAAGTCATTTCTACGTGCG GGTACAGTTGGGAAAGCACAAGTTCAGGACCAAAGTGATTAAGAACGATTTGAAACCAAAGTGGGATGAACAGTTTAGTT TTTGGGTTGATGACCTCAAAGATTCACTTGTTATCTCTGTCATGGATGAAGATAAGTTCTTCAATAATGACTTGGTGGGG CGCCTTAAAATTCCAGTCTCACAAGTTTTCGAGGAGGATATTAAATCTCTTGGCAATGCTTGGTATTCTCTCAAATCCAA AATAAAGAAGTCCAAGATCAAGGAATGTGGTGAGATTTATCTGAGTATATCCCTTTGCCAAAATAATACATCTCCAGAGT CAAATGGTATTGGTGATCAGATGCTCCACCCAAGAAAATGTGTTGATGCAACTCCTGATTTTTCTACGAAATCTTCCTTT GGCCGTTCAAACTCATCTTCTCCTGCAAGGGAAGAAATAACATCTACTAAGGATGAAAAATCGTGTTCACAAAAATCACT TGCTGGTAGACTTGCTCAAATATTTAATAAAAGTTCTGATATGTCTTCAATTTCACCCAGTACAAGCATGGATTTAGACT TATCAGACACAGATAAAACTGAAGTTTGCGAGCCAAAGACTGAGGATCCATCCTCTAATGACACTTTTGAAGAACTTGTC AGAAAAGTGCAGTCTGCAGATCAAGGAAGTGAAATTCCTAGCAACTTATCTGGAGGGGTGCTTATAGATCAATTATACAT TATTGCACCAGAAGAATTGAATGTATTATTGTTTTCACCCGATTCTAATTTTCCCAAGTCATTGGCAGATGTACAGGGTA CCACAGAACTGCAAATAGGTCTTTGGAAGTTAGAGAATGACGGAGAAAGCTTGAAAAGATCCCTTACTTACATCAAAGCT GCCAGTAAATTAATCAAGGCAGTAAAAGGCTATGAGGAACAAACTTATTTGAAAATTGATGGGAAGAACTTTGCAGTTCT GGCAAGTGTCAGCACTCCGGATGTTATGTATGGAAGCACGTTTAGGGCAGAATTACTTTATGTGATCACACCAGGACCAG AGTTGCCATCTGGAGAACAGTGTTCGCGTCTCGTGATATCATGGCGAATGAATTTTTTGCAAAGCACCATGATGAAAGGG GTGATAGAAAATGGAGCTCGGCAAGGTATGAAGGAAAGCTTTGTTCAGTATGCCATTTTGTTATGCCAAACTGTTAAGCC TGTTGACTCCAAGGACCTTGGTTCCGGCAAGGAACAAGCTTTGGCATCATTACAGGCAGAGCCCCAGACAGATTGGAAGA TAGCACTGCAATATTTTGCTAACTTCACATTTGTCTCAACTTTCTTAATGGGGTTGTACCTTCTTGTCCATATTTGGTTG GCTACACCTGACACAATTCAAGGGCTTGAGTTTATTGGGCTTGACTTGCCCGATTCAATTGGTGAATTTGTTGTTTCTGC TATCTTGGTACTTCAAGGTGAACGAATGCTGGGTTTAATCTCACGTTTCATGAAGGCTAGAGCACGAAAAGGTAGTGACC ATGGAATTAAAGCACAAGGAGATGGATGGTTGCTAACTGTGGCCTTAATTGAAGGAAGCAATTTAGCTGCTGTTCATTCT AGTGGGTTTTGTGATCCTTATGTGGTGTTTACTTGCAATGGGAAAACAAGAACAAGCTCGATCAAGTTCAAGAAATCTGA TCCTTTGTGGAATGAAATATTTGAATTTGATGCGATGGATGACCCTCCTTCTGTACTAGATATGGAAATTTATGATTTTG ATGGACCCTTTGATGAAGTTGCATCTCTAGGACATGCTAAAATCAATTTCCTCAAAACGAACATCTCAGATCTTGCTGAT ATTTGGGTTTCTCTTGAAGGAAAGTTGGCTTTGGCATGTCAATCTAAGTTGCATTTAAGAATTTTCTTGAACAACACTAG GGGTGGGAATGTTGTAAAACACTATATAAGTAAAATGGAGAAAGAAGTGGGTAAAAAGATTAATTTGCGGTCTCCTCAAA CAAATTCAGCCTTTCAGAAACTCTTTGGGCTCCCACCTGAGGAATTCTTGATCAATGACTTCACTTGTCATTTGAAAAGG AAAATGCCCCTGCAGGGCCGCCTATTCGTCTCAGCAAGAATAATTGGGTTTCATGCAAATTTGTTTGGACACAAGACAAA ATTCTTTTTGCTTTGGGAAGACATTGAAGACATCCAAGTCATTCCTCCTACATTTTCATCAATGGGTAGTCCAATAATAG TCATAACTCTTAGGCATGGTAGAGGTGCGGATGCAAGGCATGGTGCAAAAACACAGGATGAACAAGGCCGACTTAAGTTC CGTCTCCAGTCCTTTGTGTCTTTCAATGTAGCACACAGGACTATCATGGCTCTCTGGAAGGCCAGATCCTTGAGTCCTGA ACAGAAGGTCCAATTAGTTGAAGACGACTGTGAAACAAAGAGCACTAACAGTGAAGAGAGTGGGTCATTCATTGGCCTTG ATGAAGTTAGCATGTCTGAGGTTCATTCTTGTGCTCTTTCGGTTCCTGTCAGTTTCTTTATAGAGCTATTCAATGGGGGT GAGTTGGACCGTGGGGTCATGGAAAAATCTGGTTGTGTTAATTATTCTTACACCCCTTGGGTATCTGAGTATAGTGATGT CTATGAGAGGGCGATATATTACAAGTTTGAGAAGCGTATTTCACATTATAGAGTTGAAGTAACTAGTACTCAACAAAAAT CTATTTTGGATGAAAAGAGTTGGCTATTGGAAGAGGTCATGAACTTCCATGGAGTCCCTCTTGGAGATTATTTCAATCTG CACCTTCGCTATCAAATCGATGATTCACCCGGGGAAGCACAGGGATGTAAAGTAAAAGTATTTTTTGGAATTGAATGGCT GAAAAGTACAAAACATCAGAAAAGGATTACAAAGAACATCCTGAAAAATCTACAGGAACGTTTAAAGTTGACCTTCAGTC TAGTAGAGAAGGAGTTTTTGGCAAAATAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0005000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKLMVRVIEANNLAAMDSNGVSHFYVRVQLGKHKFRTKVIKNDLKPKWDEQFSFWVDDLKDSLVISVMDEDKFFNNDLVG RLKIPVSQVFEEDIKSLGNAWYSLKSKIKKSKIKECGEIYLSISLCQNNTSPESNGIGDQMLHPRKCVDATPDFSTKSSF GRSNSSSPAREEITSTKDEKSCSQKSLAGRLAQIFNKSSDMSSISPSTSMDLDLSDTDKTEVCEPKTEDPSSNDTFEELV RKVQSADQGSEIPSNLSGGVLIDQLYIIAPEELNVLLFSPDSNFPKSLADVQGTTELQIGLWKLENDGESLKRSLTYIKA ASKLIKAVKGYEEQTYLKIDGKNFAVLASVSTPDVMYGSTFRAELLYVITPGPELPSGEQCSRLVISWRMNFLQSTMMKG VIENGARQGMKESFVQYAILLCQTVKPVDSKDLGSGKEQALASLQAEPQTDWKIALQYFANFTFVSTFLMGLYLLVHIWL ATPDTIQGLEFIGLDLPDSIGEFVVSAILVLQGERMLGLISRFMKARARKGSDHGIKAQGDGWLLTVALIEGSNLAAVHS SGFCDPYVVFTCNGKTRTSSIKFKKSDPLWNEIFEFDAMDDPPSVLDMEIYDFDGPFDEVASLGHAKINFLKTNISDLAD IWVSLEGKLALACQSKLHLRIFLNNTRGGNVVKHYISKMEKEVGKKINLRSPQTNSAFQKLFGLPPEEFLINDFTCHLKR KMPLQGRLFVSARIIGFHANLFGHKTKFFLLWEDIEDIQVIPPTFSSMGSPIIVITLRHGRGADARHGAKTQDEQGRLKF RLQSFVSFNVAHRTIMALWKARSLSPEQKVQLVEDDCETKSTNSEESGSFIGLDEVSMSEVHSCALSVPVSFFIELFNGG ELDRGVMEKSGCVNYSYTPWVSEYSDVYERAIYYKFEKRISHYRVEVTSTQQKSILDEKSWLLEEVMNFHGVPLGDYFNL HLRYQIDDSPGEAQGCKVKVFFGIEWLKSTKHQKRITKNILKNLQERLKLTFSLVEKEFLAK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1021 | 1021 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 457 | 457 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 1 | 83 | 83 | 17.072 | ||
| Gene3D | 1 | 144 | 144 | 5.0E-35 | ||
| PANTHER | 1 | 1021 | 1021 | 0.0 | – | |
| Pfam | 2 | 103 | 102 | 1.2E-25 | ||
| SUPERFAMILY | 2 | 129 | 128 | 1.46E-31 | – | |
| SMART | 2 | 98 | 97 | 1.7E-18 | ||
| CDD | 3 | 104 | 102 | 8.63573E-27 | – | |
| MobiDBLite | 153 | 184 | 32 | - | – | |
| MobiDBLite | 153 | 171 | 19 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 257 | 429 | 173 | 33.943 | ||
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GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0005000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…