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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0018100 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0018100.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | p-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein, putative; TAIR: AT1G65810.3 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O15050|TRNK1_HUMAN TPR and ankyrin repeat-containing protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2R102|A0A0B2R102_GLYSO TPR and ankyrin repeat-containing protein 1; Found in the gene: LotjaGi4g1v0018100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:2285970..2300700) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAAAGACAAGCACTTTAATGAGTGTGACATTGGCTTCGGGTTCGAGGCGTGTAAACGAAGGAAATGAAACGACCTCAGT CCTCATCTTTTCTCTCTATTTTAGATGAAAAAAATCCATTCAGTCTTTACCTTTACCAAAATGGCACAACTCTTTCTACT TCACTTGTTCTAAATTTTTAATCAAGCATTCACTCATCACTTCACTAGTGAAAGCTAGATCCTTGGAAACACTATGAGTG ACTTAAGAGAGATCATACTTTCTTGGTCTCTTCAAGACATTTTCAACGAAGATCTTTACAAAGACAAGGTATGTAGTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTGCTCTCGTAATTCCGACACGAGTGTAGTGAATGCTAAAGGTTTCCCCTAGTTTGC CGCTTCTAGGAATGAAACTCTCGACCTAGGGTTCAAACAGTCATTTTTTACCACTGCGACATTTCGCAAGTTAGAAAGTG TAGCTTGAACTAACTGTACATTTGCTTCACTAACCATTTCAAAATACTGTTTGTATTTTGCAGGTGAAATTTATTGATCG ATCATTCAAGTCTGTTGATCATTATTTCGGCTCCTATGTGTATCCATTGCTGGAAGAAACTCGAGCACAACTGTGTTCGA GTATGGAAATCTTACAAAGTTCGCCTTTTGCTAAAGTAATTTCCCTTAAGGTGGCACCTAGTAGGAATGAGATGCTTTGC AATGTTAGAACTGACAGCTGGAGAAACAGGTTTTCTGGTCATGGAAAAGAGATGTACAAAACATTGATTGGGGATGTTTT TATTTTGGCCGATTTTATGCCCGAAGCGGTCAACGATTTACAAAGGGTGGGAAAGATGTGGACTTTTGTAGTGTCAGCTG GGGTTGTAGAGGAGGAGATGAAGGATGATAATGCTGAACTTATGTCTTCTTTCAAGATTCTTCCATCTAAAGATATTGAC 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0018100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTGACTTAAGAGAGATCATACTTTCTTGGTCTCTTCAAGACATTTTCAACGAAGATCTTTACAAAGACAAGGTGAA ATTTATTGATCGATCATTCAAGTCTGTTGATCATTATTTCGGCTCCTATGTGTATCCATTGCTGGAAGAAACTCGAGCAC AACTGTGTTCGAGTATGGAAATCTTACAAAGTTCGCCTTTTGCTAAAGTAATTTCCCTTAAGGTGGCACCTAGTAGGAAT GAGATGCTTTGCAATGTTAGAACTGACAGCTGGAGAAACAGGTTTTCTGGTCATGGAAAAGAGATGTACAAAACATTGAT TGGGGATGTTTTTATTTTGGCCGATTTTATGCCCGAAGCGGTCAACGATTTACAAAGGGTGGGAAAGATGTGGACTTTTG TAGTGTCAGCTGGGGTTGTAGAGGAGGAGATGAAGGATGATAATGCTGAACTTATGTCTTCTTTCAAGATTCTTCCATCT AAAGATATTGACCTGGATGAAGTTGAGCAAAAGTCTAGCTTTATAATATTTTTGACAAATATAACCCCCAATAGAAGAAT ATGGAAAGCCCTTCACATGCAGCGAAATTCAAAGTTAATCAAGAAAATTTCATGTGCTGGTGATGTGGTTGAGGAAAGTT GTGATTACTGCCATCTGCAGACTGATGCTTTGAGGGATGACCCAACATATCAAAGGTTATCATCTGATTTAAATGAGTCC CAGTACAAGGCAATTTCTGCTTGCCTTTCTTCTGCTCAATGCAATCATCAGTCCACTGTGGATCTTATTTGGGGTCCCCC GGGAACCGGCAAAACCAAAACTCTGGGCACACTGCTTTTTGCCCTACTGAAGATGAACTATAGGACTCTTGTTTGTGCCC CAACTAATGTTGCCATTAAAGAAGTCGCATCACGTGTCTTAAGCATTGTGAGATCATCCGTTGATGGAAATTCTGATGAT TTGTTCTTTCCATTAGGAGACCTTCTTTTATTTGGGAATCATGAGCGGCTCAAAGTTGGGGAGGATATTGAAGACATTTA TTTGGACCATCGTGTCAAGCAGCTTTCAATGTGCTTTAGACCTCCAACTGGCTGGAGATATTGTTTTGGTTCGATGATTG ATCTTCTTGAAAATTGTGTTTCCCATTATCATATATTCATTGAGAATGAGTTGATAAAGAAACAAGAGCAAACTGATGAT AGTGATACTAATGTGACAAAAGACGATAACCCATCAGATTGTAGTGAGAGCATGTGCAAATCTTTTCTTGAGTTTATGAG AGAAAGGTTTCTTGAATTAGCATCACCACTCAGAACCTGTATTTCTATCTTATGTACCCATATAGCCAAAAGTTATATTA GGGAACATAATTTTGAAGGTATGGTCTGCCTTATTCAGTCCCTAGATTGCTTTGAAACTTTGTTGCTCCAAACTAATGTT GTTTGCGAAGTTTTGGAAGAACTATTTTCTCCTCCCCAAAGCCAGCATAGTTCTTTTGAGTCTTCTGAGGGTGCTGAGTA CTTATTGAACAAGAAGAGAACTGAATGTCTGTCTTTTTTAATAACCCTGAAGCGTTCACTTGGTGATCTTAACTGGCCAG AGTTTATGCCATCAAAGTTGCACTTATTTGAAGAATCAATAAGAGTGTTCTGTTTTCAAACATCCTCTTTAATATTTGCC ACTGCTTCTAGTTCCTTCAAGTTGCACTTTGTTTCCATGGAACCACTGAATGTTTTGGTGGTTGATGAAGCTGCCCAGTT GAAGGAATGTGAATCAATCATACCTTTACTACTTCGTGACATAGACCATGCCATTCTGGTTGGAGATGAACGCCAGCTAC CAGCTATGGTGGAAAGTAATGTTTCATTTGAAGTTGGTTTTGGAAGAAGCTTATTTGAAAGGCTAAACTCATTGTCCTAT 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TACACTCAAGTCTTGAGGATATGGGATATCCTGCCTCCAGAGGATATCCCTAAAATAGTGAAGCGTCTTGACAACATCTT TGCAAGCTACAGTGACGATTATATAAGACGCTGCAGTGAGCAATTTTTTGAGGGGAAAATTGAGTCCCCCATGAGTTGGG AAGGATCAATAGATGTCCTCAAATTTAAGAATATTGATAATCATGGAGATGAAGCTGAGACGAGTGGTTGTGATGAAAGA ATTTATGTTGAGAATTCAAAGGTTGAGGAGAGCTTGTTATTGATGAAATTCTACTCCTTATCACCAGTTGTCGTCAGCCA CTTGCTTTCTGATCGTAACAGCAATGAGTTGGATCTTCCATTTGAAGTATCAGATGAAGAACGTGAGATAATTCTCTTTT CTAAAAGTACATTTGTATTGGGCCGCTCTGGTACTGGAAAAACAACTGTTTTGACCATGAAGTTATTTCAAAAGGAGAAC TTGCACCATATGGCTCTTGAAGCAACCTATGGAATTAAGAGTGGTGCATTTCCTTGTTTGAATCATGATAAAGAGCATGA AGAAATCTCTAATGAGAATGACAGGCCTGTCTTACGCCAATTATTTGTAACAGTGAGCCCTAAACTATGTCAAGCGGTCA AACATCATGTTGTTAGATTGAAAAGATCCATATGTGGTAGCAATATCTCCACTAAAAGTAGTCCTATTGAGGAAGATGTT GTTGATGTTGATACATCAATTCAGTTTAAGAATATACCAGATTCTTTTACTAATCTTCCAGCCAACTCATACCCACTTGT GATAACATTTCAGAAGTTTCTGATGATGCTTGATGGGACTGTGGGGAATTCATATTTTGAAAGATTTAGTGACATATTTT CTTATAGTCAAAACATGGGTGTAAAATCTGTTGCTTTAGAAACCTTTATAAGGAAGAAGCAGGTGACTTATGACAGGTTT GATTCATTATATTGGCCTCATTTCAATTGCCAATATACTAAGACTCTAGATCCATCTCGAGTCTTCACTGAAATCATATC TCATATAAAAGGGGGTATGCAAGCAATGGAGCATGGTGAGGGTAGGCTAAGTCGGGAGAATTATCTTTCCTTATCTGAAA ATCGAGCATCAAGTTTGAGCAAACAGAAAAGAGAGGTGATATATGATATTTATCAAAGTTATGAAAAAATGAAGATGGAC AGAGGGGATTTTGATTTGGCTGATATTGTAGCTGATCTTCATCTTAGACTTAGAATTAAAGGATATGATGGCGATGAGAT GCACTTTGTGTATATTGATGAGGTGCAAGACCTAACCATGAGTCAAATTGCTTTGTTTAAATATGTTTGCCCAAATGTGG AAGAGGGTTTTGTTTTTTGTGGGGATACAGCACAAACAATAGCAAGGGGAATTGATTTTAGGTTCCAGGATATAAAATCT CTCTTTTACAAGAAGTTTGTTATGGAATCCAAGAGAAGATCATATTATCAGGGAAAGGATAAAGGGCTAATTTCAGATAT TTTTTTATTGAATCAAAACTTTCGGACTCATGCTGGAGTTTTGAAATTGTCCCAGAGCATCATTGAGCTTCTTTTTCGGT TTTTTCCTCATTCTATTGATGCTCTGAAGCCTGAGACCAGCTTGATTTATGGGGAAGCTCCAGTTGTTCTTGAATGTGGA AATAGTAAAAATGCAATAGTAACTATTTTTGGCAATAGTGGGCAAGGTGGGAAAATTGTTGGCTTTGGAGCAGAGCAAGT AATTTTGGTACGAGATGATTCAGCTCGGAAGGAAATTTTAGACTATGTAGGGAAACAAGCTCTTGTTCTAACCATCTTAG AGTGCAAAGGTCTTGAGTTTCAGGATGTGTTGCTGTACAACTTTTTTGGCTCTTCTTCATCTTTGAAAATCCGGTGGAGG GTGATTTATGAGTATATGAATGAACAAAATATGCTGGAACCTGCAGAATCAAAGTCTTATCCAAGTTTCATTGATTCCAA AGACAATATTTTGTGTTCTGAACTGAAGCAACTTTATGTTTCTATAACTCGTACAAGACAAAGATTGTGGATATGTGAGA AGACAGAGGAGTTCTCTATTCCTATGTTTCACTATTGGAAAAAGAAGGGTCTTGTACAATTCAAAGAACTGGATGATTCT CTTGCTCAGGCAATGAAAGTTGCAAGCAGTCCAGAAGAATGGAAGTCACGTGGCAAAAAGCTATATTATCAAAATAACTT TGAGATGGCAACAATGTGTTTTGAAAGAGCCGGAGACCCTTATTGGGAGAAAAAATCTAAAGCTGCTGGTCTTAGGGCAA CTGCAAACCGTTTGCATGATATTAATCCTGAGGATGCAAATGCAATCCTTAGAGAAGCTGCTGAAATTTTTGAAGCCATT GGAATGACGGATTCTGCTGCCCAGTGTTTTTCTGATTTAGGAAACTATGAAAGAGCTGGGAAACTTTATTTGCAAAAATG TGAAGACCCTGATTTGAAAAGAGCAGGGGATTGCTTCTGTTTAGCTGGATGTTATGAAATCGCAGCTGAAGTGTATGCTA GAGGCAGTTTCTTCTCAGATTGTTTGACTGTTTGTGCAAAAGGAAGATTGTTTGACATTGGCTTCTCTTACATTCAACAC TGGAAGCAAAATGAAAATGTTGACCATAGTTTGGTTAAAACTCATGATCTGTACATAATAGAACAAAATTTCCTGGAAAG TTGTGCTCGTAATTATTTTGGTCATAATGATGTCAGATCCATGATGAAATTTGTTAGAGCTTTTCATTCAATGGATTTGA AGCGTGACTTCTTACAATCATTGGATTTACTGGATCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGGAGTCAGGAAACTTTTCGGAGGCA GTTAACATTGCTATGATGATGGGTGAGGTTCTACGTGAGGCTGATCTTCTTGGAAAAGCTGGTAGATTCAAGGAAGCTTT TGATCTTTTGCTTTACTATGTACTTGCGAATTCTCTTTGGTCTTCAGGAAGCCAAGGGTGGCCCTTAAAGCAATTTGCAC AGAAGGTTGAGCTTTTGGAAAGAGCATTGTCATTTGCAAAGGAAGAGTCAGGCAGCTTTTACGAGCTTGCATCTACGGAA GTTGAAATATTATCAAATGATCATAGTCAGATTTCTGGAATAATGATTCATTTGCAATCTTCCCGCATACATGAGAGTAT CAGAGGTGAAATATTATGTTTGTGGCAACTTTTGAATTCTCATTTTCATCTGAACTCCTCTAAATTTGTTTGGCGGGACT ATGTGATTAATGATGCTGTTGAAGAAATGATTTTGGAGAATCAACTTTCTGTGGAGACATTGTTTTATTGTTGGACATGT TGGAAGGATAACATTGTTCATATATTGGAATGTCTTCCTAGTTTCAAATCGCAGGACATTGACCAGCATAGCAGTTATGG AAAATTTGCATTGAATTATATGGGTGTTCGGAAGCTAACATGTAATCTAAATGAGATTTACTCTTTGCTTGTTCCTGATG CTAATTGGGTGATAAAATTGGGCGATAGGTTTCTGAAGAAGAATGGAAGGCTGGTTTCTGTTGATATTCATTCTTTAGTT TCTTCTCTTCAGAGCTATTGGAGTTCAGAACTGCTTTCTGTTGGCATCACAGTTTTGCGCAACCTTGAGGCACTATACAA GTTTTCAGTTAGTAAAGATCTTTCTGATTTTTGTCAGTTCCAGTCTTTATTGCACATCTATGAAGTCTCGAAGTTTCTTC TTGGATCCAAATGTTTTAGCCACACCCATGGTAACTTGAAGACATTGGAGAAATTTCGCAGACTCCCAATTGACTGTTTA CTTCGCTTCATTGTTCCCCTAGACTGGAAGAAATCACTGACAAGAGACTTTGTCTTTCTAAGGACAACTGAGGCTTGTAA GAATTTGGTGAAAGAGGCCATCTATGAGAACATTAGGCTGAAAGATAGGCTAACGTATGGTCAAATTGGAAAGATGGCTG TTATGATTCTTGGTACAGCTAATCTGATTAATGAACTGTATGTGGAAATTATGACCATATTTGAACATAACTTACCCTGG AAAGAATTCTTTCAGTGTTTGCAGTTGAGTTCAGCTCAAGATATTTCAAAAAGAAATTATTCATTTGCAGAGCGGAATTG TGCGATTAGTCTTTATGAAGCTTTGGAGTATACTTACCATCTGAATTGGATAAAGGAAATTGATTATATATCTCCTAGTT GTTTTATGTATTTGGTTGAACGGCTTCTGCTCTTGGCATCATGCAGGAAGGGGTTAAACATGTTTGCTACTAAGTCATCT TTCATTGAATGGCTTAATTACCAAGATGAAAATTCTCTTGCAAATTTGAGTTTAACTCCGGGTATGATATATGTGCATGA TTTTATTGCGCATGTCGTCCTTGAGTTAATTTGTAATAATCAAAATGGTACCGTAAATTGGATCAGGAAGTCGAACTTAG ATGTGAAGAGTTACTTACCATTGTTTTTCCTGAGATTGGTTGTATTAATGTGTTTGCTTCACCTCAACTTTGGGAGTTAT ATAGAACCACTTCGCAATTTGTTGGGAAAAAGTCATGTAACCTCTAAACTGCCGTTGGAATTTTGTGATGTTCTTAAGAA AGGAAGGAATCACCTGGGTTTGAAAGTCTTTGCTGAGGCATTTAAAGTGATAGACAATCCCTTGGTTATTGTCAAGTTAG GGAATAATTCTTCTGAAATTGTGTGTCCAGATGCTGTGTTTGTAGATTTAATGGTATGCCCGCAAAGAGAGCTTATATTG CAGATGTTGTTTCCAAATAGAGTCGACAGCACGGGTGGGGAAAATGCAGCAGTTATTGTTGAATCTTCTGACTCACTGTC TAAGGAGTTTCCTTCAACAAACTGTTCCGGTCTTCCAAATAAAGGTTGTGCTTCTGTTTCTAATCAGATAACGGACGGTG GGATTAAAGATGAAATTAACATATCTAAGAAAGTTGTCGACTGCTTCTGGGGTCGTCTGGAAAACCTACTGGATGCAATT GATATGTTACGTGTTGATGGGGTTAAAATGGAAAAGGCTCTTATTCGTCCATTATATCTTAAGGAATTGGTGGATCATTT CATTAAAATTTTGACTTCAATGTGTGGAAGCTTGCCAGAAATCCCTGTTTACCTTGAAAACAAAAATGAAATGGGGGAGG TAGTGAGCTTGCTTGATGTAACTAAGCAACTTTGTTCAGCATTAAATGTAAGTGATTCAATGTTTGAGATAGACATTGTA CTTGAACTCTCGATGAAAATCCTCGCAAGACGACAAAGAGTTGAGCCCATTTTGAATGAGCTGTTGTTGCGGAAGAATGC GAATGTTGAGGATGAGCCTTCTCAAGCCAGCACTGCAGCAGGGAATGATGAGCTATTGCAAAATGTCTTGGAGGGATCAA AAGATAGCATGTCCAAGAATTCCCAAGGTGCTAGCAGCTCAGGACATGGAAACAACATGGAAAACAACAAAGGGAGGAAA AACAAATCCAAGAAAAACAAGGGAAGGAAAAAGGGTAAGAAGTGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0018100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSDLREIILSWSLQDIFNEDLYKDKVKFIDRSFKSVDHYFGSYVYPLLEETRAQLCSSMEILQSSPFAKVISLKVAPSRN EMLCNVRTDSWRNRFSGHGKEMYKTLIGDVFILADFMPEAVNDLQRVGKMWTFVVSAGVVEEEMKDDNAELMSSFKILPS KDIDLDEVEQKSSFIIFLTNITPNRRIWKALHMQRNSKLIKKISCAGDVVEESCDYCHLQTDALRDDPTYQRLSSDLNES QYKAISACLSSAQCNHQSTVDLIWGPPGTGKTKTLGTLLFALLKMNYRTLVCAPTNVAIKEVASRVLSIVRSSVDGNSDD LFFPLGDLLLFGNHERLKVGEDIEDIYLDHRVKQLSMCFRPPTGWRYCFGSMIDLLENCVSHYHIFIENELIKKQEQTDD SDTNVTKDDNPSDCSESMCKSFLEFMRERFLELASPLRTCISILCTHIAKSYIREHNFEGMVCLIQSLDCFETLLLQTNV VCEVLEELFSPPQSQHSSFESSEGAEYLLNKKRTECLSFLITLKRSLGDLNWPEFMPSKLHLFEESIRVFCFQTSSLIFA TASSSFKLHFVSMEPLNVLVVDEAAQLKECESIIPLLLRDIDHAILVGDERQLPAMVESNVSFEVGFGRSLFERLNSLSY PNHFLNIQYRMHPAISSFPNSHFYLNQILDAPNVIRKNYRKKYLPAPMFGPYSFINIVGGREEFDDAGRSRKNMVEVAVA MKIIRKCFKVWVDSKEKLGIGVVSPYAAQVAAIQDVLGQKYDRYDGFDVKVKTIDGFQGGEQDIIILSTVRTNGSASLKF ISSHQRTNVALTRARHSLWILGNERTLVSQENVWKDLVLDAKKRQCFFNADEDNDLAKGIWDAKKELDQLDDLLNTDSVL FRNSVWKVLFSDNFLKSFKKLRSEKKKKSVIGLLLKLSSGWRPKRIKVDLLCGPSSQILKQFKVEGLFIVCSKDIVKEAR YTQVLRIWDILPPEDIPKIVKRLDNIFASYSDDYIRRCSEQFFEGKIESPMSWEGSIDVLKFKNIDNHGDEAETSGCDER IYVENSKVEESLLLMKFYSLSPVVVSHLLSDRNSNELDLPFEVSDEEREIILFSKSTFVLGRSGTGKTTVLTMKLFQKEN LHHMALEATYGIKSGAFPCLNHDKEHEEISNENDRPVLRQLFVTVSPKLCQAVKHHVVRLKRSICGSNISTKSSPIEEDV VDVDTSIQFKNIPDSFTNLPANSYPLVITFQKFLMMLDGTVGNSYFERFSDIFSYSQNMGVKSVALETFIRKKQVTYDRF DSLYWPHFNCQYTKTLDPSRVFTEIISHIKGGMQAMEHGEGRLSRENYLSLSENRASSLSKQKREVIYDIYQSYEKMKMD RGDFDLADIVADLHLRLRIKGYDGDEMHFVYIDEVQDLTMSQIALFKYVCPNVEEGFVFCGDTAQTIARGIDFRFQDIKS LFYKKFVMESKRRSYYQGKDKGLISDIFLLNQNFRTHAGVLKLSQSIIELLFRFFPHSIDALKPETSLIYGEAPVVLECG NSKNAIVTIFGNSGQGGKIVGFGAEQVILVRDDSARKEILDYVGKQALVLTILECKGLEFQDVLLYNFFGSSSSLKIRWR VIYEYMNEQNMLEPAESKSYPSFIDSKDNILCSELKQLYVSITRTRQRLWICEKTEEFSIPMFHYWKKKGLVQFKELDDS LAQAMKVASSPEEWKSRGKKLYYQNNFEMATMCFERAGDPYWEKKSKAAGLRATANRLHDINPEDANAILREAAEIFEAI GMTDSAAQCFSDLGNYERAGKLYLQKCEDPDLKRAGDCFCLAGCYEIAAEVYARGSFFSDCLTVCAKGRLFDIGFSYIQH WKQNENVDHSLVKTHDLYIIEQNFLESCARNYFGHNDVRSMMKFVRAFHSMDLKRDFLQSLDLLDQLLVVEEESGNFSEA VNIAMMMGEVLREADLLGKAGRFKEAFDLLLYYVLANSLWSSGSQGWPLKQFAQKVELLERALSFAKEESGSFYELASTE VEILSNDHSQISGIMIHLQSSRIHESIRGEILCLWQLLNSHFHLNSSKFVWRDYVINDAVEEMILENQLSVETLFYCWTC WKDNIVHILECLPSFKSQDIDQHSSYGKFALNYMGVRKLTCNLNEIYSLLVPDANWVIKLGDRFLKKNGRLVSVDIHSLV SSLQSYWSSELLSVGITVLRNLEALYKFSVSKDLSDFCQFQSLLHIYEVSKFLLGSKCFSHTHGNLKTLEKFRRLPIDCL LRFIVPLDWKKSLTRDFVFLRTTEACKNLVKEAIYENIRLKDRLTYGQIGKMAVMILGTANLINELYVEIMTIFEHNLPW KEFFQCLQLSSAQDISKRNYSFAERNCAISLYEALEYTYHLNWIKEIDYISPSCFMYLVERLLLLASCRKGLNMFATKSS FIEWLNYQDENSLANLSLTPGMIYVHDFIAHVVLELICNNQNGTVNWIRKSNLDVKSYLPLFFLRLVVLMCLLHLNFGSY IEPLRNLLGKSHVTSKLPLEFCDVLKKGRNHLGLKVFAEAFKVIDNPLVIVKLGNNSSEIVCPDAVFVDLMVCPQRELIL QMLFPNRVDSTGGENAAVIVESSDSLSKEFPSTNCSGLPNKGCASVSNQITDGGIKDEINISKKVVDCFWGRLENLLDAI DMLRVDGVKMEKALIRPLYLKELVDHFIKILTSMCGSLPEIPVYLENKNEMGEVVSLLDVTKQLCSALNVSDSMFEIDIV LELSMKILARRQRVEPILNELLLRKNANVEDEPSQASTAAGNDELLQNVLEGSKDSMSKNSQGASSSGHGNNMENNKGRK NKSKKNKGRKKGKK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 2457 | 2457 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 233 | 841 | 609 | 3.94E-53 | ||
| Pfam | 237 | 619 | 383 | 5.9E-31 | ||
| CDD | 240 | 302 | 63 | 2.619E-14 | – | |
| PANTHER | 446 | 2569 | 2124 | 0.0 | ||
| CDD | 545 | 650 | 106 | 7.39712E-24 | – | |
| Pfam | 628 | 824 | 197 | 1.7E-53 | ||
| Gene3D | 649 | 860 | 212 | 1.1E-54 | – | |
| CDD | 651 | 842 | 192 | 9.34016E-53 | ||
| ProSiteProfiles | 1080 | 1477 | 398 | 15.68 | ||
| SUPERFAMILY | 1082 | 1653 | 572 | 1.64E-34 | ||
| Pfam | 1328 | 1427 | 100 | 1.4E-6 | ||
| Gene3D | 1471 | 1683 | 213 | 7.3E-10 | – | |
| Coils | 1969 | 1989 | 21 | - | – | |
| Phobius | 2458 | 2477 | 20 | - | – | |
| Phobius | 2478 | 2814 | 337 | - | – | |
| MobiDBLite | 2749 | 2814 | 66 | - | – | |
| MobiDBLite | 2750 | 2794 | 45 | - | – | |
| MobiDBLite | 2800 | 2814 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0018100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…