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LotjaGi4g1v0080700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0080700
Transcript ID LotjaGi4g1v0080700.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Uridine kinase; TAIR: AT2G01460.3 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q54R62|UCKC_DICDI Uridine-cytidine kinase C; TrEMBL-Plants: tr|I1KM57|I1KM57_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0080700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:10515202..10539267) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTAATTTTGACATAAATAAAATGCAAGAGAAAAAGCGTGCGTATATGAGCAAAGACGTGCAGAAGAAGGTGGGGAAGACG GGCACGCAGCACGCTCTCCCTCTCACGAAATCTAAAATTCCTAAATATACGTTTACCACACACACACAATAAAAAAAGCA ACTATATATATACTATTTTCCATTTTCTCGAGAAACTCCATCACATATTCACATCACACACACACTCATCATAAGATTCT TCTGTCACAACTCACAAGCATCGAGGAATCACTTCGCTCACGGTGATCGGAGAAACCATGGATGATGAAGTTGTTCAGCG CGTTTTCCATGAAGGAGGACGCGATTACTTCCAGCAACAACCTTCAACTTCATCGTCTTCTTCCTCCTCCATCCTCCAAT CTCTCCCTCTCCATGTGGTATGCATTTTCTTCTTCAACTTCAATTTTTAGGGCTTCAAGCTTAATTTCATGTTTTCTGTC TTGATTTTGATAATTAAGCATATCGATGAGCACGCCAAATAGCTGAGTAGTAAAATTGATTTCGTTTTGATAATTTAATT GTGTATTTGTTTGTTTGTGAGTGAGTGAGAGAGATTTTCTGATTATTTTGAATGTTGTTGATGTTCATGTGAATTGAAAT TCTTTGTGGTTTAATTCTCATGATCCATGAAATTTTTGTGGAAAGGATTACTAAAATGTGGGTGAAAATTGTGCAGTCTT TTGATCATGGATATTATTTGTTGGTAAAATCGATCCAAGAACTTCGAGAGAAAAAGGATGGTCTTGTTACAGTTGGCATT GGTGGTCCAAGTGGTTCTGGTAAAACAAGGTAAGGTGTTATTTATATTGTGGTCAATGTATTGTTTAGAATGTGTGGTTT ATGGCTTAATGTGTTTTCAATTTCATGTTTCGTGAAGCTTAACGGAAAAGGTGGCATCTGTTATTGGTTGTACTGTTATA 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GCTTCCTTAAACCTAAACTTGGCTGATTGAGAACCATGATAATTCAAGTCGTTTTCAACTTTTGAATTTTATAGTGAATT GTGTTCATCAGAACTCATGTTCAGATTTATGATGATGAATTCTTGAACTGTTGGCCAAAAATAAATAGTGAATTGTGTTC ATCAGAACTCATGTTCAGATTTTATAATGAATTCTTGGACTGTTTGGTGTAAGTATTGTGAATTTCAATGATGCAACTGA AGATTCCATGATTATTATCTGTAAAGTATACTTGAACATCACACTTTTATAATAGAACCGGGATTTGAAATAAGTTATAC TGTTGAAGGATAAAGTATCTTTGAAGTGAGTTTGTCTCTAAAGTGGACAAGAAGGTATATCCACCATTGTTTAATCTGTA ATCTTAACTCATAAAATCTAGGGGTTCATACACACTCTTAAATTGTGTTAAGCCTAACTCAACCCTATATGCTAGCTCAT GAAATGAGAATTATTCAAGCCTTTATAAGCACTACTGGGGCTGTATTTCTTGTTCATATGAGATCTTTGCCACACTCACC CCACATTGAGAACCGGTCAAATGGAGCATGGAGATTATAGGACTTACCGGTTAAGCTGAAGGACTGGGTTCATTGCAGTG GGAAAGTCGTCGGGCCAGGTGGACTTTTAAACAACGGTGGGTGACCCAATGTCGGATCTTTTGATCCAAGTCTAGTTCAA TCCCAAAATTTAGCTTGTGCAATTAGGATTTCCCAAGTCTTTAAAAGCTCTAGTTTGACCATACCTCTAGTCAACATGGA ATCTTAAGGCACCCTTTTTCTTAATAGACACCCTTCTTTTTCTTAATAGACAACCTCACTTTAGAGGAGTTTTTCCATTA TGAAAAACAAAAAAGAGATGCAAGATATGTTGAATATTCTTTTAATAATTACATAGAATGGTTACTTATGACCGTTAGAT ATGCTTTGATCGGACAATGTCCCTTCTTTTTTGGCGTACTTCAAATAACTAATTGCTTTCTAAGTTTCCTAATCGGTCCA GTGTAATACTATATTATGCAATTTGGGATGATTATTAAGAATTTATTGATTGACCATGTCTTACTAATAATAGGTGAATG GTGAGTACTTGTGGATTTTGATGTAAAATTTCATGTTTAGTTTGTGATCAAGAATTCTGATTGGGTCTTACTGATATTTG CAATGCATCACTTTTTGTTTGATGATTGATAGCTCAGTTTTGCAGCTACAAAGATTACCTTTTGTACCACTTCTTCAATT TCCTTTTGAGCCACCACTCAAATTTGTTGCATATGCACATTGGAATAATTAAGTTATGATATTCTATTGTGTGGGGGAGG GGGCGGGGGGGGTCACTTCTAGGCTTATCTATGATTAATTTGCTTCTGAGTTGCCGCTGATTTTTTTTTTTCTTTCTATT TTCTTGTGTAGATTCTGATTGAGGTTGATCATCTACAAGATGTCTCTGGCCCATACATCCAGATAAAGGGTGTCAATAAA GATGCTGTGGCAGCAGCTGGTTCAATGCTTAAATTGGATGGTTCATATACTACTAAGGTATTGACTTTCTTCCTTTATTA TAGTTCCCTTTTTGTGTCTGGTGCATAATTCAGGCGCTTAATCAATCTAGTCTGTCATGTCTTGATGGTGCTTAACTTAT TGTTCTTGTTCATTTTTTTGGTAGAGTTATCTTGAAATAGTCTTGGAAAGACTACCAGCAATAGAGAGAAACTCTGGTGG GATTCACTCTCAGCAATCAGCAAAGTTGCAAGAGATTGTTGAATTTATTCAATCTCAGGTAGCATTTATTATTTGGACAG ATTTTAGTCTATTTTTTCGGGGCTTCATCAAATATTAGCCATCTAAGTATTTGACTCTATTGAAATTATATTGGTTTAGT TAAAGGAGGAAAAGATAGATAAAAGAATTTGCGGATATTTTGATGCATCATATCTTTTTATACAATAGTGAAGCCAAGAA CATGCAAACATCCTACGGGGTATAGCCGCATGACCTGATTGATCCTAAACTCTTTGGGTTTTGATTTATTCACACTTCAT TTTCTCTTCCATTCCATCTTCACCAACTTTCTGTTTCTATCTTTTCATATCACATCACCTATCATATCATTCATTTCTCT CCCTTCCTTCTCTTCCTTCATCTCTCTAGGTGTTGGTGAATTTTTTTGTGTGAATGAAGTTCTATCCATACTCTATAGTA CCTAGGGATCTACTCCTTTTTAGTCTACACATCTTGCGTCATGCTAATGCTAAGCAAACCTACACTGCACTGGACTCCTG GATTGGTCCAAAGCTACTGCATTCCTGAATGTAGCGAACCTTTTTTGCATTTGTGAAGCATTTAATGTAATTTTTTAGGC ATAATCATTTAGTGGAAATATGTTGGAACAAACAGGGAGGTAGCTCTTCTTCAGAATCCTCACCAAGTACGGGAGTCTCT CCAATTGAAGGTGTTATTGAAGAGATGCAATCAAGGATTAGAAGGCTTGAAAAGTGGCTTGCTATAAATACGGTACTCCC AAAGCCTTACCCTATTCTCAAAGTGCTTGCTTTCTTCGAATTCACTTTAACTGTTGCATGATTTTATTAATTTGTTTATT TGAAACTGTGCGCAGGTTCTATGGACATTTCTGATGTCTGCCCTTGTTGGTTATTCACTGTATCAAAGGAGGCGTCAATG ATGGTCTTGGAAGTTTTCAGGATCATGCATTGGCATTCTTGTATAGTTACAACACCAGGCTCCATTTTTTAAGTGGCGAG CCCATAAAAAGCTAATTACAATGACAAATCCCTTGAGTGTAGGTTCGATTCAGAATGTGCATTGTGGTTCATCAATTTCA ATTTTCAAAGATAAATTCAACTAGAATATTGCTAAGAGATTAGGAAATGTAATTCTTTCTTTTTTTGTACAGGATATGTA ATTCTAAGTATATCAAGTATAGTAATAATAATATTGTAATTGTTGTCATAATAAATGAGATGATCTATAATTTGTATGGT TTTTTTATCATCTAACTTATGCTTGTCTTTAAATTGTATTCATAATGGAATTTATATGTACTATAGTGGAAGGGGAAAGA TCTCCAAGCTCTCCAACCTGACAACTAAGTTAAATGGATGATATGGTGAAACAAAGGGCATATGGTAATGTTGATTGATC CATACAGTCAATAACTTGGAGAAAATGAGGTCCAGTGCATGTTTGGTTGCATGTCTGTCATTCACGTTTAGACGCTGAGA TTACATTCATTCATGAGCTACAAAATTTTGTTAAAAGTGCTTCGGAGTGTATGTGTTGTCCAACACATCTAAAAATGCAA TTATTTTACAGAGCCTCTCAATTCCCGCTATAAAATTTAGGCTTAAATATGTTTAGTTTTTGATTTATATAGATGAATTG AATTGGGTCCTTGAAAATTACTAATTATTTGTAATTGATCCCTGAATATTTTTTTTAATTAAACTAAGTCAATATCCATT TGTGTCTACGTGTCATCAATTTAACATAGTCACTAGACTCAAGTGGCTTTCACTTATCCTATGTGTATTTTTTATCCTAT GTGTCATTTAATTTTACTTTTTCCACCATCTTCCCCCTTCATCATCTTCCTCTTCCCCTTCATCTTCTTCCTCTTCCTCT TCCTGCTTCCATCCACACCACTCCCACCCACCACCACCACCACCACCACCACCATCCTCTTTCTCAATCTACTCCCACCT CCCCCTCATGCTTCCCTTCCCCTCTCTTCCCCTACCTCTACTACCCCTTCCATTCCACCTTCCGCCAAACCAGTGGCTCT TGTAACAGATGTTGTAGTTGTCAATGTTGGAGATGCAATAGAGGTACTAGAGAATATATAGTTTTC 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0080700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATGATGAAGTTGTTCAGCGCGTTTTCCATGAAGGAGGACGCGATTACTTCCAGCAACAACCTTCAACTTCATCGTC TTCTTCCTCCTCCATCCTCCAATCTCTCCCTCTCCATGTGTCTTTTGATCATGGATATTATTTGTTGGTAAAATCGATCC AAGAACTTCGAGAGAAAAAGGATGGTCTTGTTACAGTTGGCATTGGTGGTCCAAGTGGTTCTGGTAAAACAAGCTTAACG GAAAAGGTGGCATCTGTTATTGGTTGTACTGTTATATCAATGGAGAATTATTGTGATGGAGTTGATGAAAGGAATGATCT GGATTCTATAGATTTTGATACCCTGATCAAGAATCTTGAGGATTTGACAACAGGTGATGATACATTAATTCCAGAGTTTG ACTATCAGCAAAAGAGATGTATTGGCTTTAAAGCAATAAAGAGTACTTCATCTGGGGTGGTAATTGTTGATGGTACATAT GCATTACATGCAAAACTAAGGTCTTTACTGGATATTCGAGTTGCTGTGGTTGGTGGTGTTCATTTTAGTCTTCTTTCTAA AGTCCGCTATGACATTGGAGATTCTTGTTCTCTGGATTACCTTATAGATAGCATTTTCCCGTTGTTTAGAAAACACATTG AGCCAGATCTTCATCATGCACAGATCAGAATTAATAATAGCTTTGTCTCATCGTTTAGAGAGGCAATCTACAAGGTTAAA TGCCGAAGCGAGTCTTCAGAGGGGCATTCAGATTCTGTCTTTCAAGGAAATGAAACCCAAACAGATAATTTTATTGAAAT GTACCTTAGACCACCTTCAGCTAGTGAAGAAGCAAGAATAAACGACTGGATCAAAGTGCGGCAGTCTGGAATTAGGTATT ACTTATCACTTGGGGACCAGAGGATTGTTGACAAAAATTTCATAATCAGGCCTAAAGCAGAGTTTGAGGTTGGACGAATG ACATTGGGTGGATTGCTGGCTCTTGGGTACAATGTTGTGGTTAGTTATAAACGGGCATCCACAACTGTCAATTATGGCAA GGTTTCAATGTCTTATGAAACCATTGATGCTCTTGGTGAGACATTCTCAGTGATGAGAGGAACTAATAGGAAGACTGTTG GAACAGAAGCTTTGAGGATGGGTATCAATGGACCTTGGATTACTAAATCCTACCTGGAACTGATTCTTGAGAGAAAAGGC GTACCCCGTCTTAGTACACCGCCACTTGTGTCTAATACAACTGTGATTGGTAGTCAAGAAACCGCAATCGTTGCACCAAA GCCAATTCGTCTTACTCCTAACCTTGTTACTGGGCTTGAGGATGTATCTCAGCCGTGGACTCGATCCCCAACTAAATCGA AAATAGAACCTGTTATGGCTGCATGGCATTTCATATCTTCTGAATCTTCCCAGCCTGACAACTCAGTACTAGATCCATCT TTCAGGGACAACATTAGGCTTGCTCCAATGCCTGATTCATATGACTTGGATAGGGGATTGCTTTTGGCTGTTCAAGCAAT ACAAGCTTTGTTGGAGAATAAAGGTGTCCCAGTCATAGTCGGAATTGGAGGTCCTAGTGGGTCTGGAAAGACTAGTTTGG CTCATAAAATGGCAAATATCATTGGTTGTGAAGTAGTTTCTCTGGAAAGCTATTATAAACAAATAAAGGATTTTAAATAT GAAGACTTCAGCTCCCTTGATTTATCTTTGCTTACAAAGAATATTGATGACATACGAAATGGTCGAATAACAAAAGTACC TATATTTGACTTGGAAAGTGGTGCTCGGATTGGCTTCAAGGAACTAGAAGTTTCTAAAGATTGCGGAGTGATTATATTTG AAGGCGTGTATGCTTTGCATCCTGATATCCGAATATCACTCGACTTGTGGATTGCTGTTGTAGGAGGTGTTCATTCACAT TTGATTTCAAGAGTTCAAAGGGATAAGAGTAGAGTGGGATGTTTTATTTCCCAAAATGAGATCATGATGAGAGTTTTTCC TATGTTCCAGCAGCTTATTGAGCCTCATCTTGTTCATGCACACCTTAAAATTCGAAATGACTTTGACCCTGTGCTTTCTC CTGAGAGTTCATTGTTTGTACTAAAGAGTAATAAAAAAGTAGCTTATCAAGATATTCTAGCAATTCTTGATCCAGCAAAG TTTTGCAGTTCTGTTCAGAAATTTATTGATATATATATACGGCTTCCTGGAATTCCTTCTAATGGAAAGTTGTCAGACAG TGATTGTATTCGAGTCAGAATATGTGAAGGCAGATTTGCATTACTTATACGTGAGCCTATCAGAGAAGGAAACTTCATAA TTCAGCCTAAAGTGGATTTTGATATTGGCATTAGTACGGTTGCTGGTCTTCTTAACCTTGGGTACCATGCAGTTGCGTAC ATTGAAGCATCCGCATTCATCTATCAGGATGGAAAGATTCTGATTGAGGTTGATCATCTACAAGATGTCTCTGGCCCATA CATCCAGATAAAGGGTGTCAATAAAGATGCTGTGGCAGCAGCTGGTTCAATGCTTAAATTGGATGGTTCATATACTACTA AGAGTTATCTTGAAATAGTCTTGGAAAGACTACCAGCAATAGAGAGAAACTCTGGTGGGATTCACTCTCAGCAATCAGCA AAGTTGCAAGAGATTGTTGAATTTATTCAATCTCAGGGAGGTAGCTCTTCTTCAGAATCCTCACCAAGTACGGGAGTCTC TCCAATTGAAGGTGTTATTGAAGAGATGCAATCAAGGATTAGAAGGCTTGAAAAGTGGCTTGCTATAAATACGGTTCTAT GGACATTTCTGATGTCTGCCCTTGTTGGTTATTCACTGTATCAAAGGAGGCGTCAATGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0080700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDDEVVQRVFHEGGRDYFQQQPSTSSSSSSSILQSLPLHVSFDHGYYLLVKSIQELREKKDGLVTVGIGGPSGSGKTSLT EKVASVIGCTVISMENYCDGVDERNDLDSIDFDTLIKNLEDLTTGDDTLIPEFDYQQKRCIGFKAIKSTSSGVVIVDGTY ALHAKLRSLLDIRVAVVGGVHFSLLSKVRYDIGDSCSLDYLIDSIFPLFRKHIEPDLHHAQIRINNSFVSSFREAIYKVK CRSESSEGHSDSVFQGNETQTDNFIEMYLRPPSASEEARINDWIKVRQSGIRYYLSLGDQRIVDKNFIIRPKAEFEVGRM TLGGLLALGYNVVVSYKRASTTVNYGKVSMSYETIDALGETFSVMRGTNRKTVGTEALRMGINGPWITKSYLELILERKG VPRLSTPPLVSNTTVIGSQETAIVAPKPIRLTPNLVTGLEDVSQPWTRSPTKSKIEPVMAAWHFISSESSQPDNSVLDPS FRDNIRLAPMPDSYDLDRGLLLAVQAIQALLENKGVPVIVGIGGPSGSGKTSLAHKMANIIGCEVVSLESYYKQIKDFKY EDFSSLDLSLLTKNIDDIRNGRITKVPIFDLESGARIGFKELEVSKDCGVIIFEGVYALHPDIRISLDLWIAVVGGVHSH LISRVQRDKSRVGCFISQNEIMMRVFPMFQQLIEPHLVHAHLKIRNDFDPVLSPESSLFVLKSNKKVAYQDILAILDPAK FCSSVQKFIDIYIRLPGIPSNGKLSDSDCIRVRICEGRFALLIREPIREGNFIIQPKVDFDIGISTVAGLLNLGYHAVAY IEASAFIYQDGKILIEVDHLQDVSGPYIQIKGVNKDAVAAAGSMLKLDGSYTTKSYLEIVLERLPAIERNSGGIHSQQSA KLQEIVEFIQSQGGSSSSESSPSTGVSPIEGVIEEMQSRIRRLEKWLAINTVLWTFLMSALVGYSLYQRRRQ 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 925 925 -
PANTHER 2 244 243 2.2E-265
PANTHER 2 244 243 2.2E-265
SMART 62 212 151 0.33
SUPERFAMILY 64 177 114 1.2E-12
Gene3D 64 239 176 2.9E-26
CDD 65 227 163 2.43425E-52
PANTHER 497 556 60 2.2E-265
PANTHER 497 556 60 2.2E-265
SUPERFAMILY 504 687 184 1.45E-16
Gene3D 516 692 177 7.8E-32
SMART 516 660 145 1.6E-4
PRINTS 517 534 18 2.8E-9
Pfam 519 684 166 3.0E-13
CDD 519 687 169 3.69854E-49
PRINTS 544 555 12 2.8E-9
PANTHER 563 951 389 2.2E-265
PANTHER 563 951 389 2.2E-265
PRINTS 638 648 11 2.8E-9
SUPERFAMILY 725 859 135 4.58E-7
TMHMM 926 948 23 -
Phobius 926 947 22 -
Phobius 948 952 5 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0080700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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