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LotjaGi4g1v0080700.4

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0080700
Transcript ID LotjaGi4g1v0080700.4
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Uridine kinase; TAIR: AT2G01460.3 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q54R62|UCKC_DICDI Uridine-cytidine kinase C; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PKG2|A0A0B2PKG2_GLYSO Uridine-cytidine kinase C; Found in the gene: LotjaGi4g1v0080700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:10515499..10538082) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGATGATGAAGTTGTTCAGCGCGTTTTCCATGAAGGAGGACGCGATTACTTCCAGCAACAACCTTCAACTTCATCGTC TTCTTCCTCCTCCATCCTCCAATCTCTCCCTCTCCATGTGGTATGCATTTTCTTCTTCAACTTCAATTTTTAGGGCTTCA AGCTTAATTTCATGTTTTCTGTCTTGATTTTGATAATTAAGCATATCGATGAGCACGCCAAATAGCTGAGTAGTAAAATT GATTTCGTTTTGATAATTTAATTGTGTATTTGTTTGTTTGTGAGTGAGTGAGAGAGATTTTCTGATTATTTTGAATGTTG TTGATGTTCATGTGAATTGAAATTCTTTGTGGTTTAATTCTCATGATCCATGAAATTTTTGTGGAAAGGATTACTAAAAT GTGGGTGAAAATTGTGCAGTCTTTTGATCATGGATATTATTTGTTGGTAAAATCGATCCAAGAACTTCGAGAGAAAAAGG ATGGTCTTGTTACAGTTGGCATTGGTGGTCCAAGTGGTTCTGGTAAAACAAGGTAAGGTGTTATTTATATTGTGGTCAAT GTATTGTTTAGAATGTGTGGTTTATGGCTTAATGTGTTTTCAATTTCATGTTTCGTGAAGCTTAACGGAAAAGGTGGCAT CTGTTATTGGTTGTACTGTTATATCAATGGAGAATTATTGTGATGGAGTTGATGAAAGGAATGATCTGGATTCTATAGAT TTTGATACCCTGATCAAGAATCTTGAGGTGTGCATTTGCTTTTCTCTCATTTTACAACGTCTAAGATGCTGTACTGGCCT TTTCTTGAGTTTTATGGTTGAATTGGCTTTGATGGGTTAGCATGGCTGATATTACAAACCCCTTAGATTTTACACCTTCA CTTTGTTACCTTCTCAAGCTTTTTATGTTTATATTGGCAAAATGCAACTTCCTGAGATATTTGTCCTTGATTACTCTTTA 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CTCCGGCAGCAGCAGCTTCTCAAGTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCATATGACAAATATGCTCTAGCTTGAGGGGT AGATCTGGATATTGTTAAATCTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCATATGACATATATGCTATAGTTTGAAGGGAAGT GTTGGATATTGCTAAATATCCTAATAGAGACCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGG AGGGTGTATTCAAGAAGTGTTTGGTTGGATCTAATTGTATTGCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTTTCGGC CAGGTTTGGTTTTTAAGGTCCTCTATTTGACGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCCGGTCTTCCTCTTCCAGT TTGGTTTGTGGGTCTTCTGTGTTTTCTCATCTGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGTTCTTAGTTTGCGTGTCATGGTTCGT GATGCTCTTATTATATTGATCTTGGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTTGTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTGTCACCTTCG TTTGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTTTTCTGGTTTTAGGGCTTCAACTGCAAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAG TTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCTAGCTGCGAGTTGCGCTGGCCCGCTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAG TTGACACCATTGTTTGTCTTAGAAGCCATCAATCGATCGACCTCAAGTATGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGA GTTGTTGCTTCAGCCTTGTTCAGTCCTGGACGTGAGGGGGTGTGTTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATAGAGCATAGA TAGCCTTTATATATGGTTGTGCAAACCTTAACTCTTGAGCTAGCTTTTGTGGTTGAGTATAGGCCTCCCAATTTCTAATA ATATGCACCAAACTTGTTACATATTTAACTAATTCTAGGACCTCTCAAGGACTTAGTAAAGACATATGCCAATTGATCGT TTGATTTCCATTAGCAGTTGATTGTTAGATATATAAATAACTAATTCTAGTGCCTATGTTTCATTCTGTTAGCCATTGTG AATTTTCAAGAGGTCCAACATTCACCCAACACTTAACATATCATGTTGACTTCATGCTTTAGGCAAGGGAAACCAGGGTA TAGATTTGAGTTTTACCAAGTTCCAGAACTTAGATTGTGTCAGCCTGCTGTTCCTATTGCATTTGAATTAAGAATCTGGG TTTTCCAAGGTACTCAGATCAATTGGATAAGGTGGGGGCATGAACAGATTTGGAGGTATTTCCTTCTCAGTTTCAAAGAT TGGGCGATTCTTAGGTTGCAAGTTTGCAAATCATGGTCATTAGAGAAGACATCCAATCAGAAATCTATTACTGATTTGCA TGGACTATTTGAGGTGTGATAAGAAGCATTGGTTGGGAGTAGTACGAGCTGAAGAAGAAAGATTTGGTAACTCTACAGCA AAAACAGCCTCTTTTGCTTCTAATCTTAGCAGGGAATGAACTACCAGTACAGCCTGGACAAGTGTTGACAGCAACTCTAG GTTCTCCAGTTGAATTACAAGGATTGGTTACAGGCATAATCTGCTGGAACAAGATGGTTTGGCTGTTGGCTCAAAGGGAA ATTGTGGTCTCTCATTTTCCCTCTGCTTGTCATGTTTTAAATAGTGGGATCGTGGTGGTATTTTGTTTATAGTTATCAGT ATTTTATTATAAGTACAACATGTATCTTGATACCATACAAATTCTTGAAGCAGCGATACGTATCGCAGTATGAATCTAAA ATGAACTTGCATCTCATTTTGTATCTCTGAGTCGGAGCTGAATCTTACGATTCACGGTTCACTGTTGAATCTTACGATTC AAAGTTGTGTACAGGTTGCACTCCAGTCAAGTCAGGTTGTGTGACTCGTATGTGAAGATAAGAGATACAGAGAGAAAACA AAAATAACAGAAAATAGAAATTGAATGTAACTTGTATTCAAATTCTGAAGTCATTACAAAGAGTAGACTTATATAGCATA CTATTACTAACTGTAAGTACATGTGCAAACCACATGTTAACTAGCTAGTGCACATGCACAGCATAGCTGGCACTTATAGG TGTGGGTATCGATACGGCCATATATGTACTTAGCACCTATGAGATTAAAGTTGCTACTTACAGAGGTAAAGGAATGAGTA TGGTTATTTTAAATTACCGGTTTGGGGATGAGTACGATAATACCCTACCCAAACCTTGCCCGTTATCACCCCTAACTTAT ATTTGTCAAAATGATAGATACCTCTTGCAGATTTCTTTCTTAAACTTGTCTACAGTTGGTGTGTTTAGGTATTATTATTG ATTGGAAGCACGTTTGTGTCAGGTACCATGCAGTTGCGTACATTGAAGCATCCGCATTCATCTATCAGGATGGAAAGGTC ACATGATTTATATTATCTCTTGCATTTGGGTTAAAATGAATAATAATTAGTTGATAGAAGTTGCAAGGCCAAAATGAACT TGTTCGTGTTTCTCTAGCTCCCTGCTTCCTTAAACCTAAACTTGGCTGATTGAGAACCATGATAATTCAAGTCGTTTTCA ACTTTTGAATTTTATAGTGAATTGTGTTCATCAGAACTCATGTTCAGATTTATGATGATGAATTCTTGAACTGTTGGCCA AAAATAAATAGTGAATTGTGTTCATCAGAACTCATGTTCAGATTTTATAATGAATTCTTGGACTGTTTGGTGTAAGTATT GTGAATTTCAATGATGCAACTGAAGATTCCATGATTATTATCTGTAAAGTATACTTGAACATCACACTTTTATAATAGAA CCGGGATTTGAAATAAGTTATACTGTTGAAGGATAAAGTATCTTTGAAGTGAGTTTGTCTCTAAAGTGGACAAGAAGGTA TATCCACCATTGTTTAATCTGTAATCTTAACTCATAAAATCTAGGGGTTCATACACACTCTTAAATTGTGTTAAGCCTAA CTCAACCCTATATGCTAGCTCATGAAATGAGAATTATTCAAGCCTTTATAAGCACTACTGGGGCTGTATTTCTTGTTCAT ATGAGATCTTTGCCACACTCACCCCACATTGAGAACCGGTCAAATGGAGCATGGAGATTATAGGACTTACCGGTTAAGCT GAAGGACTGGGTTCATTGCAGTGGGAAAGTCGTCGGGCCAGGTGGACTTTTAAACAACGGTGGGTGACCCAATGTCGGAT CTTTTGATCCAAGTCTAGTTCAATCCCAAAATTTAGCTTGTGCAATTAGGATTTCCCAAGTCTTTAAAAGCTCTAGTTTG ACCATACCTCTAGTCAACATGGAATCTTAAGGCACCCTTTTTCTTAATAGACACCCTTCTTTTTCTTAATAGACAACCTC ACTTTAGAGGAGTTTTTCCATTATGAAAAACAAAAAAGAGATGCAAGATATGTTGAATATTCTTTTAATAATTACATAGA ATGGTTACTTATGACCGTTAGATATGCTTTGATCGGACAATGTCCCTTCTTTTTTGGCGTACTTCAAATAACTAATTGCT TTCTAAGTTTCCTAATCGGTCCAGTGTAATACTATATTATGCAATTTGGGATGATTATTAAGAATTTATTGATTGACCAT GTCTTACTAATAATAGGTGAATGGTGAGTACTTGTGGATTTTGATGTAAAATTTCATGTTTAGTTTGTGATCAAGAATTC TGATTGGGTCTTACTGATATTTGCAATGCATCACTTTTTGTTTGATGATTGATAGCTCAGTTTTGCAGCTACAAAGATTA CCTTTTGTACCACTTCTTCAATTTCCTTTTGAGCCACCACTCAAATTTGTTGCATATGCACATTGGAATAATTAAGTTAT GATATTCTATTGTGTGGGGGAGGGGGCGGGGGGGGTCACTTCTAGGCTTATCTATGATTAATTTGCTTCTGAGTTGCCGC TGATTTTTTTTTTTCTTTCTATTTTCTTGTGTAGATTCTGATTGAGGTTGATCATCTACAAGATGTCTCTGGCCCATACA TCCAGATAAAGGGTGTCAATAAAGATGCTGTGGCAGCAGCTGGTTCAATGCTTAAATTGGATGGTTCATATACTACTAAG GTATTGACTTTCTTCCTTTATTATAGTTCCCTTTTTGTGTCTGGTGCATAATTCAGGCGCTTAATCAATCTAGTCTGTCA TGTCTTGATGGTGCTTAACTTATTGTTCTTGTTCATTTTTTTGGTAGAGTTATCTTGAAATAGTCTTGGAAAGACTACCA GCAATAGAGAGAAACTCTGGTGGGATTCACTCTCAGCAATCAGCAAAGTTGCAAGAGATTGTTGAATTTATTCAATCTCA GGTAGCATTTATTATTTGGACAGATTTTAGTCTATTTTTTCGGGGCTTCATCAAATATTAGCCATCTAAGTATTTGACTC TATTGAAATTATATTGGTTTAGTTAAAGGAGGAAAAGATAGATAAAAGAATTTGCGGATATTTTGATGCATCATATCTTT TTATACAATAGTGAAGCCAAGAACATGCAAACATCCTACGGGGTATAGCCGCATGACCTGATTGATCCTAAACTCTTTGG GTTTTGATTTATTCACACTTCATTTTCTCTTCCATTCCATCTTCACCAACTTTCTGTTTCTATCTTTTCATATCACATCA CCTATCATATCATTCATTTCTCTCCCTTCCTTCTCTTCCTTCATCTCTCTAGGTGTTGGTGAATTTTTTTGTGTGAATGA AGTTCTATCCATACTCTATAGTACCTAGGGATCTACTCCTTTTTAGTCTACACATCTTGCGTCATGCTAATGCTAAGCAA ACCTACACTGCACTGGACTCCTGGATTGGTCCAAAGCTACTGCATTCCTGAATGTAGCGAACCTTTTTTGCATTTGTGAA GCATTTAATGTAATTTTTTAGGCATAATCATTTAGTGGAAATATGTTGGAACAAACAGGGAGGTAGCTCTTCTTCAGAAT CCTCACCAAGTACGGGAGTCTCTCCAATTGAAGGTGTTATTGAAGAGATGCAATCAAGGATTAGAAGGCTTGAAAAGTGG CTTGCTATAAATACGGTACTCCCAAAGCCTTACCCTATTCTCAAAGTGCTTGCTTTCTTCGAATTCACTTTAACTGTTGC ATGATTTTATTAATTTGTTTATTTGAAACTGTGCGCAGGTTCTATGGACATTTCTGATGTCTGCCCTTGTTGGTTATTCA CTGTATCAAAGGAGGCGTCAATGA 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0080700.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATGATGAAGTTGTTCAGCGCGTTTTCCATGAAGGAGGACGCGATTACTTCCAGCAACAACCTTCAACTTCATCGTC TTCTTCCTCCTCCATCCTCCAATCTCTCCCTCTCCATGTGTCTTTTGATCATGGATATTATTTGTTGGTAAAATCGATCC AAGAACTTCGAGAGAAAAAGGATGGTCTTGTTACAGTTGGCATTGGTGGTCCAAGTGGTTCTGGTAAAACAAGCTTAACG GAAAAGGTGGCATCTGTTATTGGTTGTACTGTTATATCAATGGAGAATTATTGTGATGGAGTTGATGAAAGGAATGATCT GGATTCTATAGATTTTGATACCCTGATCAAGAATCTTGAGGATTTGACAACAGGTGATGATACATTAATTCCAGAGTTTG ACTATCAGCAAAAGAGATGTATTGGCTTTAAAGCAATAAAGAGTACTTCATCTGGGGTGGTAATTGTTGATGGTACATAT GCATTACATGCAAAACTAAGGTCTTTACTGGATATTCGAGTTGCTGTGGTTGGTGGTGTTCATTTTAGTCTTCTTTCTAA AGTCCGCTATGACATTGGAGATTCTTGTTCTCTGGATTACCTTATAGATAGCATTTTCCCGTTGTTTAGAAAACACATTG AGCCAGATCTTCATCATGCACAGATCAGAATTAATAATAGCTTTGTCTCATCGTTTAGAGAGGCAATCTACAAGGTTAAA TGCCGAAGCGAGTCTTCAGAGGGGCATTCAGATTCTGTCTTTCAAGGAAATGAAACCCAAACAGATAATTTTATTGAAAT GTACCTTAGACCACCTTCAGCTAGTGAAGAAGCAAGAATAAACGACTGGATCAAAGTGCGGCAGTCTGGAATTAGGTATT ACTTATCACTTGGGGACCAGAGGATTGTTGACAAAAATTTCATAATCAGGCCTAAAGCAGAGTTTGAGGTTGGACGAATG ACATTGGGTGGATTGCTGGCTCTTGGGTACAATGTTGTGGTTAGTTATAAACGGGCATCCACAACTGTCAATTATGGCAA GGTTTCAATGTCTTATGAAACCATTGATGCTCTTGGTGAGACATTCTCAGTGATGAGAGGAACTAATAGGAAGACTGTTG GAACAGAAGCTTTGAGGATGGGTATCAATGGACCTTGGATTACTAAATCCTACCTGGAACTGATTCTTGAGAGAAAAGGC GTACCCCGTCTTAGTACACCGCCACTTGTGTCTAATACAACTGTGATTGGTAGTCAAGAAACCGCAATCGTTGCACCAAA GCCAATTCGTCTTACTCCTAACCTTGTTACTGGGCTTGAGGATGTATCTCAGCCGTGGACTCGATCCCCAACTAAATCGA AAATAGAACCTGTTATGGCTGCATGGCATTTCATATCTTCTGAATCTTCCCAGCCTGACAACTCAGTACTAGACTTCTCT CATGAAGCAACCGCAGATCCATCTTTCAGGGACAACATTAGGCTTGCTCCAATGCCTGATTCATATGACTTGGATAGGGG ATTGCTTTTGGCTGTTCAAGCAATACAAGCTTTGTTGGAGAATAAAGGTGTCCCAGTCATAGTCGGAATTGGAGGTCCTA GTGGGTCTGGAAAGACTAGTTTGGCTCATAAAATGGCAAATATCATTGGTTGTGAAGTAGTTTCTCTGGAAAGCTATTAT AAACAAATAAAGGATTTTAAATATGAAGACTTCAGCTCCCTTGATTTATCTTTGCTTACAAAGAATATTGATGACATACG AAATGGTCGAATAACAAAAGTACCTATATTTGACTTGGAAAGTGGTGCTCGGATTGGCTTCAAGGAACTAGAAGTTTCTA AAGATTGCGGAGTGATTATATTTGAAGGCGTGTATGCTTTGCATCCTGATATCCGAATATCACTCGACTTGTGGATTGCT GTTGTAGGAGGTGTTCATTCACATTTGATTTCAAGAGTTCAAAGGGATAAGAGTAGAGTGGGATGTTTTATTTCCCAAAA TGAGATCATGATGAGAGTTTTTCCTATGTTCCAGCAGCTTATTGAGCCTCATCTTGTTCATGCACACCTTAAAATTCGAA ATGACTTTGACCCTGTGCTTTCTCCTGAGAGTTCATTGTTTGTACTAAAGAGTAATAAAAAAGTAGCTTATCAAGATATT CTAGCAATTCTTGATCCAGCAAAGTTTTGCAGTTCTGTTCAGAAATTTATTGATATATATATACGGCTTCCTGGAATTCC TTCTAATGGAAAGTTGTCAGACAGTGATTGTATTCGAGTCAGAATATGTGAAGGCAGATTTGCATTACTTATACGTGAGC CTATCAGAGAAGGAAACTTCATAATTCAGCCTAAAGTGGATTTTGATATTGGCATTAGTACGGTTGCTGGTCTTCTTAAC CTTGGGTACCATGCAGTTGCGTACATTGAAGCATCCGCATTCATCTATCAGGATGGAAAGATTCTGATTGAGGTTGATCA TCTACAAGATGTCTCTGGCCCATACATCCAGATAAAGGGTGTCAATAAAGATGCTGTGGCAGCAGCTGGTTCAATGCTTA AATTGGATGGTTCATATACTACTAAGAGTTATCTTGAAATAGTCTTGGAAAGACTACCAGCAATAGAGAGAAACTCTGGT GGGATTCACTCTCAGCAATCAGCAAAGTTGCAAGAGATTGTTGAATTTATTCAATCTCAGGGAGGTAGCTCTTCTTCAGA ATCCTCACCAAGTACGGGAGTCTCTCCAATTGAAGGTGTTATTGAAGAGATGCAATCAAGGATTAGAAGGCTTGAAAAGT GGCTTGCTATAAATACGGTTCTATGGACATTTCTGATGTCTGCCCTTGTTGGTTATTCACTGTATCAAAGGAGGCGTCAA TGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0080700.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDDEVVQRVFHEGGRDYFQQQPSTSSSSSSSILQSLPLHVSFDHGYYLLVKSIQELREKKDGLVTVGIGGPSGSGKTSLT EKVASVIGCTVISMENYCDGVDERNDLDSIDFDTLIKNLEDLTTGDDTLIPEFDYQQKRCIGFKAIKSTSSGVVIVDGTY ALHAKLRSLLDIRVAVVGGVHFSLLSKVRYDIGDSCSLDYLIDSIFPLFRKHIEPDLHHAQIRINNSFVSSFREAIYKVK CRSESSEGHSDSVFQGNETQTDNFIEMYLRPPSASEEARINDWIKVRQSGIRYYLSLGDQRIVDKNFIIRPKAEFEVGRM TLGGLLALGYNVVVSYKRASTTVNYGKVSMSYETIDALGETFSVMRGTNRKTVGTEALRMGINGPWITKSYLELILERKG VPRLSTPPLVSNTTVIGSQETAIVAPKPIRLTPNLVTGLEDVSQPWTRSPTKSKIEPVMAAWHFISSESSQPDNSVLDFS HEATADPSFRDNIRLAPMPDSYDLDRGLLLAVQAIQALLENKGVPVIVGIGGPSGSGKTSLAHKMANIIGCEVVSLESYY KQIKDFKYEDFSSLDLSLLTKNIDDIRNGRITKVPIFDLESGARIGFKELEVSKDCGVIIFEGVYALHPDIRISLDLWIA VVGGVHSHLISRVQRDKSRVGCFISQNEIMMRVFPMFQQLIEPHLVHAHLKIRNDFDPVLSPESSLFVLKSNKKVAYQDI LAILDPAKFCSSVQKFIDIYIRLPGIPSNGKLSDSDCIRVRICEGRFALLIREPIREGNFIIQPKVDFDIGISTVAGLLN LGYHAVAYIEASAFIYQDGKILIEVDHLQDVSGPYIQIKGVNKDAVAAAGSMLKLDGSYTTKSYLEIVLERLPAIERNSG GIHSQQSAKLQEIVEFIQSQGGSSSSESSPSTGVSPIEGVIEEMQSRIRRLEKWLAINTVLWTFLMSALVGYSLYQRRRQ 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 933 933 -
PANTHER 2 244 243 2.3E-265
PANTHER 2 244 243 2.3E-265
SMART 62 212 151 0.33
SUPERFAMILY 64 177 114 1.2E-12
Gene3D 64 239 176 2.9E-26
CDD 65 227 163 2.09276E-52
PANTHER 505 564 60 2.3E-265
PANTHER 505 564 60 2.3E-265
SUPERFAMILY 512 695 184 1.41E-16
SMART 524 668 145 1.6E-4
Gene3D 524 700 177 7.9E-32
PRINTS 525 542 18 2.8E-9
CDD 527 695 169 3.13232E-49
Pfam 527 692 166 3.0E-13
PRINTS 552 563 12 2.8E-9
PANTHER 571 959 389 2.3E-265
PANTHER 571 959 389 2.3E-265
PRINTS 646 656 11 2.8E-9
SUPERFAMILY 733 867 135 4.9E-7
TMHMM 934 956 23 -
Phobius 934 955 22 -
Phobius 956 960 5 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0080700.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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