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LotjaGi4g1v0334900.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0334900
Transcript ID LotjaGi4g1v0334900.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Calcium-dependent lipid-binding family protein isoform protein; TAIR: AT1G48090.4 calcium-dependent lipid-binding family protein; Swiss-Prot: sp|Q54LB8|VP13A_DICDI Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13A; TrEMBL-Plants: tr|A0A072V2R4|A0A072V2R4_MEDTR Calcium-dependent lipid-binding-like protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0334900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:71424511..71491444) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAAAGGCTGGGTGTCCGTACCAGGTTCTAACAGCACGTCCCCACTAATAAACTTGCAAGATACCGGGACCTATATAAATA TCTCTCAAGCAACCATTCACATCAATTTCTCGTTTCTTCATTTCCATTTCATCTCCCTCTCTCTTTCATTCTCTTCTTCA CGCAATTTCATTTCTTCATCCCAAACACTCCGCATCTCAGACTCACCGTTTTCCAGAACCAAACCCTAACTCCATTTCTT CATCGCACTCTTCCAATCGCTGATTTCGCCATGGATCTTCTCCGATTCGCGCCTTGATCGCACCGTGTTTCCTCCGATTC TTCACCATGTTCGAAGCTCACGTAAGATTCCTCTCTTCTTCTTTCATGCAAACTTCAATTTCGATTTCTTCTGTCAATTT GCGTTTGCAATTTTCCTTTGTTTCTCGATCGGACTGCATTCGCTAGTGGATGGTGGTGGCAGTTACTAAGTAGTGAATAC TATGCTTCTCTGTGTCATGAATAGTTGTTGCATTTCTAAGTCTTGCTGTATTTGATTGATGCATGTAAACTGTGATTCTC AGTGGACAAAGGAGATAGTAATGTTGCTTTTGTTGACAGGTTTTGCATTTGCTTCGGAAATATTTGGGTGAATATGTACA TGGACTCTCTACGGAGGCGTTGAGAATCAGTGTCTGGAAAGGTTTGTATTCTACTATTTTCTTTCTTTGGAGTGCCGGTG CTGAATTTGGTATTGTTCCATTACCTTTTTCCTTTGGTTGTATACAATCTACAATCTGAATGCATGTTAGGTAAAATCAA AATGGAACCTACTTACCAATTCCGTCAAATGTTACTAGTTCTCAAGTTGACCGATATAGAATTTTTCTTTATGCTTCTCT CGAAGTCATTAAACGGAGCAAACTTCTTGCATTGATTGTCCTAGTTCGGCTTCAGCGCTCTTTTTCTTTTCCTCTTAGTT 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0334900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

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GCTGCTCCCTTCAATGTTCTCAATACCACAACTTCAAAACCAGCTGACATTGTTATAAATGGCGCATTGGTGGAATTCAA GCTGTTTATATATGGAAAGGCCGGAGACAGCATTGATGGAGAACTTGATGAGACTCTCCTTCTTGAAGTTGTTGCGGATG GGGGAAAGGTGCATGTAATTCTTGCAGGTGGTGATCTAACAGTGAAGATGAAGTTGCATTCTTTAAAAATTAAGGATGAA CTTCAGGGGCGACTATCTGTAGCTCCAAGTTATCTTGCAGTTTCAGTCTTGAAGAATGAAACTTTATCTTCTTCCTCTGG CTCATTTGATTCCCATGGGAAAGACATGTCTCTTGGACTTCCTGATGATGATGATAGCTTTATGGATGCATTATCTGAGT TCATGTCTCAAACAGATGTAGGATATTTACATAATATGGATTTAGATCAGCAAGGACTGATGGGGATTGCTTCTGATTTT GAGTCTTTAGAAAACTTAATTCATGAAAAGGAAATTGAAAAGGGAAAGGGTACACCTCGTGAGGTATATTATGAGGCAGA GGGAAGTGATACTTCAAATTTTGTATCCCTCTCCTTTTCAACAAGGAGTTCTGGCTCACCTGATTACAATGGTATAGACA CCCAGATGTGTGTTCGGATGTCCAAGCTAGAATTTTTCTGCAACCGGCCCACTATTGTTGCTTTGATAAGCTTTGGCCTG GATATAAGCTCTGGAAATAAGATGACAAGTCATACTTCGGAAACTTCTCCTGAGAGACCATCGGTGAAGGAGAGGACTGA TGAAAAGGGCCGCGTTAAAGGATTATTAGGATTTGGTAAAGAACGTGTAGTATTTTATTTAAACATGAATGTGGACAGTG TAACAATTTTTCTTAACAAGGAGGATGATTCTCAACTTGCCAAGTTAGTGCAAGAAAGTTTCTTAATGGATCTTAAGGTT CACCCAAGTTCTCTCTCCATTGATGGGACATTAGGCAATTTTAGGCTCTGTGATACATCCCTTGGAACCGATCAATGTTG GGATTGGCTTTGTGACATACGCAATCCTGGTGTTGACTCCCTTATTAAGTTCAAATTTAATTCTTATAGTGCTGAAGATG ATGACTATGAAGGGTACGACTATAGCTTGCAAGGTCAACTTTCAGCTGTTCGCATTGTTTTCCTCTATAGATTTGTGCAA GAGATAATGGTGTACTTTATGGAATTGGCCTCCCCTCATACTGAAGAAGCAATCAAACTTGTTGATAAGGTTGGAGGATT TGAATGGTTGATTCAAAAATATGAAATAGATGGAGCTACATCACTCAAGCTTGATCTTGCTCTAGAAACTCCAATTATCG TAGTTCCAAGGAATTCGATGAGCAAAGATTTTATACAACTTGATCTGGGAAAGCTACAGATTAAAAATGAATTCAGTTGG TATGGATCCCGGGAAGAAGATCCGTCAGCTGTGCATATTGATCTTCTTCATGCTCAGATTTTGGGTATTAACATGTCTGT CGGCATTGATGGTTTTCTTGGAAAACCGATGATACGGGAAGGTCAAGGTCTTGATATTTTTGTTCGTCGAAGCTTGAGGG ATGTTTTCCGGAAAGTCCCAACTTTTTCACTTGAAGTGAAGGTGGATCTATTGCATGGTATAATCTCTGATAAAGAATAT AAGGTGATTTTGGACTGCACATACATGAATTTATCAGAAGAACCAAGGCTTCCTGCAAGTTTTCGTGGCGGAAAATCTGG TTCAAGAGATACTATTAGGCTTCTGGTTGATAAGGTTAACTTAAACAGTCAAAATCTGTTGTCACAAACAGTTACAATTG TAACTGTTGTGGTGAACCATGCCTTGCTGGAGCTTTGTAATGGCACTGACGGGGAGTCTCCATTGGCTCATATTGCCCTG 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AAGTTGGACATGAGCTTCATGTATGCCTCCAAGGAGAAGGACACTTGGATTAGAGCCCTGTTGAAGGATTTTACAGTTGA GGCTGGTTCTGGTCTTGTCATTCTTGATCCTGTGGATATATCAGGGGGATATACTTCTGTGAAAGACAAAACAAGTATAT CTTTGATATCAACGGATATCTGTATTCATCTCTCACTTAGTGCTGCTTCTCTCATTCTAAATCTGCAAAGCCAAGCATCT GCTGCCTTAAATTTTGGAAATGCAAATCCACTTGTTCAGTGTACCAACTTCGACCGAATTTGGGTATCTGAAAAAGAGTC TGGTTCCAATAACAATATTACCTTTTGGAGGCCTCAAGCTCCTGCAAATTATGTCATATTAGGAGATTGTGTGACATCAA GGCCAATTCCTCCTTCACAGGCAGTAATGGCTGTAAGCAATACATACGGCCGTGTAAGGAAGCCAGTTGATTTCCATCTT ATTGGATCATTCCTGAATATCCAAGGGCATGGCGGAAATGAAGGTCAATCTATTACTGACAATGATTGTTCTCTTTGGAT GCCCATTGCGCCCCCAGGGTACACAGCTCTAGGCTGTGTAGCCCATGTTGGGAGCCAACCGCCCCCAAATCATGTTGTTC ATTGCTTACGTTCTGATCTTGTAACATCAGCAAAATATTCAGACTGCTTATTTAATATCACATCAAATAATCAATTTACT TCTGGATTTAGCATATGGCGCCTTGACAATGCTGTTGGCTCTTTTTTTGCACATTCTTCAATCGGTTTCCCTCTCAAAAA CAAATGCTATGACTTGAATCATCTGCTTGTCTGGAGTTCAAATCGCGGTCCTCTGATAAGTCCAATATCAGATTTTAATT CCGATCGTGAAAATAATAATCAGCAGACAAGCGCAAATGTAAATACATCTGGATGGGAGATTCTCAAGTCCATTTCGAAA 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AACGACTCAGATGTTATGTTGAATATTTTGACATGTCACACATCTCATGGCCATGATCCCTCACTTGGAGCAAATGGTTC TAATACTGCAGTTGAAGAAGTCTTTCAAAATCAGTATTATCATCCGTCATCTGGTTGGGGTAGCAATGGGTCAGCTATGC ACCATGATAATCCTGGACACTGGAGCACAAGGGACTTTTCACATTCATCTAAGGACTTCTTTGAACCTCCACTTCCTCCT GGGTGGAAATGGGCTTCAGGTTGGTCCATAGATAAGTTTCAGTATGTTGACAAGGAAGGCTGGGCATATGGGCCTGACAT TAAAAATTTTAGATGGCCTCCTACTTCATCAAAGTTTTCAACAAAATCAGCCTCTGATGTTGTGCGTCGACGGCGTTGGA TTCGTACTAGACAAACCGTTTCTGAGCAAGGTATGGAATGCTTGCATAGTGGAGCAAGTACTGTGCAGCCTGGAGCTTCT GCTGTTTTATCTTGGAGAAGTACATTCAAGGGCTCTGACCAATGTTTGCAAGTTCAACCTAATTTTCATAATTCTCAGCT CAAATACTCATGGGGTCAGGTGGTTGCTGTTGGTTCAAGTTATATATATAGCAAAGATCAGTTATTAGATCAAAGTTCTA GACAAACTTCTGTGACACCCAATCGTTTTTTGAAGCTAAATGAACTTGAGAAAAAGGATATACTTCTACGCTGCAATCCT AGTAGTGGAAGTAAACAGTTTTGGTTTAGTGTGGGTACAGATGCTGCAGTTCTTAATACTGAACTAAATATACCTGTATA TGATTGGAGAATATCAATTAATTCTCCTATGAAATTGGAGAACCGGCTTCCTTGTCCTGCTGAATTTTCAATATCGGAGA AAACAAAGGGAGGAAATTGTGTTGAGCGGCATCATGGCGTCATGTCTTCTCGTCAGAGTGTGCATATCTATTCAGCTGAT ATTCAAAAACCTTTGTATCTTACTTTATTTGTGCAGGGTGGCTGGATTATGGAAAAGGACCCAATTCTTATACTGGATCC TTCTTTCTCAAATCACGTCTCATCCTTCTGGATGGTTCACCGGCAAAGTAAAAGGAAACTGCGTGTGAGCATTGAACATG ATGTGGGCGGGACAAGTGCTGCACCAAAAACCTGTAGACTCTTTGTCCCTTATTGGATTGTCAATGATTCTTCTCTAGCA TTGGCATATCGTTTAGTGGAAGTGGAACCTTCGGAAAATGCAGAGGTGGATTCTGTCCCTCTCTCTAGGGCAGTGAAGTC TGCCAAGACAGCTTTGAAAAGTCCCATTAGCTCAATGGATAGAAGGCGTTCTAGTTCAAGGAAAAACCTACAAGTGCTTG AAGTTATTGAAGATAACAGCCCTTTTCCTAGCATGCTTTCTCCACAAGATTATGCCGGTCGTAGTGGAGTTACAATGTTC CAATCTCAGAAAGATACATTCTTCTCTCCTAGGCTTGGCATTTCTGTTTCTATGCGCCAATCTGAAGTTTATAGCTCTGG AATTTCTCTGCATGAACTGGAAAACAAGGAACGTATTGATGTCAAGGCTTTCAATTCTGATGGATCTTATTACAAGCTTT CAGCAGTGTTGAACATGACTTCAGACAGAACAAAGGTGGTCCATTTCCAGCCACACACAATGTTCGTCAATAGGGTTGGA TGTAGTCTCTGCCTACAGCAATGTGATACTCAGTCTTCTGTGTGGATCCAACCCACTGATCCTCCAAAACCCTTTGGGTG GCAGTCATCAGCTAAAGTTGAACTTTTGAAGTTGCGTATTGATGGATACAAATGGAGTACACCATTTAGCGTAAGCTATG AAGGTGTAATGCGCCTTATGCTGAAAAAAGATAGTGGAGATGAACCAATGCTATTAAGGGTAGCAGTAAGAAGTGGTGCC AAGAGATCACGCTTTGAAGTTATTTTTCGTCCAGATTCATTGTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAATCGCTCCATGTTCTT GCCCGTTCGCTTTCGTCAAGTTGATGGTATCGGTGATTCTTGGCAGCTGCTTCTTCCGAATTCTGCTGCTTCATTTCTAT GGGAAGATCTTGGTAGAAGACGTATATTGGAACTCTTTGTAGATGGAACTGACCCGGTGAAATCACTCAAGTATGATATT GATGAAATTTCTGATCACCAGCCCATTCATGTAGCAGATGGGCCAACCAGAGCCTTGCGTGTTACTATTGTAAAGGAAGA GAGAGCCAATGTTGTGAAGATCAGTGATTGGATGCCTGAAACTGAACCTACCGGTGTTCTGAGCCGAAGACAATCATCAC CAATTGTTCACTCTCAAAAGCAACAATTGATGTCAATTACAGATTGTGAATTCCACATCAATTTTGATCTTGCTGAGCTT GGGATATCTATTACTGATCATACACCTGAGGAAATTTTGTACCTGTCTGTTCAGAATCTTGTTCTGGCGTATTCAACTGG TTTGGGCTCCGGAATCAGTAGATTTAAACTTAGAATGTCTGGGCTACAAGTGGACAATCAACTGCCATTAACTCCTATGC CAGTTCTCTTCAGGCCTCAGAGAGTGTCAGAAACTGATTATATCCTGAAATGTTCTGTTACAATGCAGTCAAATGGATCA CTGGATCTTTGTGTCTATCCATATATTGGTCTTCATGGGCCAGAAAATTCCACTGCCTTTTTGATAAACATTCATGAACC TATTATTTGGCACCTTCATGAAATGATCCAGAAGGTGAAGCTCAGTAGGCTGTATGATTCTCAAACAACTGCTGCATCAG TTGATCCAATCATTCAAATTGGTGTCCTTAATATTTCGGAAGTTCGATTCAAAGTGTCAATGGCGATGTCACCAAGTCAA AGACCAAGGGGTGTGCTTGGGTTCTGGGCATCCTTAATGACTGCATTGGGTAACACAGAAAATATGCCAGTTAGGATAAA CCAGAGGTTTAATGAGAACATATGCATGAGGCAGAGTTCTATGATTAGCATGGCTATCTCAAATATCCGAAGGGATCTTC TAGGCCAACCACTTCAGCTGCTCTCAGGTGTTGATATATTGGGTAATGCAAGTAGTGCACTTGGACATATGAGTAAAGGT GTAGCTGCATTGTCTATGGATAAGAAGTTCATTCAAAGTCGGCAAAGACAGGAAAGCAAAGGTGTGGAGGATTTTGGTGA TGTTATAAGAGAGGGAGGGGGAGCATTTGCTAAAGGTTTATTCAGAGGGGTAACTGGCATTTTGACAAAGCCTCTTGAAG GAGCTAAAACGTCTGGTGTTGAGGGTTTTGTTCAGGGTGTTGGGAAGGGTATTATTGGTGCAGCTGCACAACCAGTGAGT GGAGTTCTAGATCTTCTGTCAAAAACGACTGAAGGCGCTAATGCTATGAGAATGAAAATAGCATCTGCTATAACATCTGA AGAACAACTTCTCCGGAGGAGGCTACCTCGTGTTATAAGTGGTGACAATTTGCTTCAACTATATGATGAGTACAAAGCCC AAGGACAGGTCATACTACAGTTGGCAGAATCAGGTTCATTTTTTGGCCAGGTTGATCTATTCAAAGTTCGTGGAAAGTTT GCCTTATCAGATGCTTATGAAGATCACTTCATGCTTCCAAAGGGGAAAATCCTCATGGTCACGCATAGAAGAGTCATTCT ATTGCAACAACCATCCAATATTATTGCTCAAAGGAAGTTCAGCCCTGCAAGAGATCCATGTTCAATACTGTGGGATATAC TGTGGGATGACTTTGGTACAATGGAACTGACACATGGAAAAAAAGAGAACCCAAAAGCTCCCCCTTCGCGGCTCATTTTA TATTCGCAGTCTAGATCATTGGATGTGAAAGAAAACACTCGCATCATAAAATGTAGCCCTGAAACACATCAAGCTCTTAA AGTTTACTCTGCAATTGACCACGCAGTGAACACTTATGGCCCTGGCGCATCAAAGGGAATACTAAAAAATAAAGTGACAA AGCCATATTCACCACTTGTTGATGGCCGTAATGATGATTTAACACTGAACGAAGATGTTTGCTCCTGGTCCTCCCAACTT ATGCCTGGATCAGCTCCTCTCCCTTCAAGTTTTGGAAGCAGTGCTGACCATTAG
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Protein sequence (LotjaGi4g1v0334900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MFEAHVLHLLRKYLGEYVHGLSTEALRISVWKGDVVLKDLKLKAEALNALKLPVTVKAGFVGTITLKVPWKSLGKEPVIV LIDRVFVLAHPAPDSRTMKDEDREKLFQDKLQHIEEAESATLDAISKSKLGSSSSGNSWLSSLISTIIGNLKISISNVHI RYEDSVSNPGHPFSSGLTLAKLAAVTMDEQGNETFDTSGALDRLRKSVHLERLAFYHDSNRLPWEIDKRWEDISPHEWIE IFEDGINEPTGDHKLVSKWAMNRTYLVYPINAVLQYHRLGNQERTDPEIPFEKASLVLTDVSLTLTEAQYYDWIKLLEAV SRYKTYMEVSHLRPTVPISKAPYLWWQYAAQASLQQQKMCYRLSWDQIRNLCQLRRRYIQLYVASLQHSSDNNHTELREI EKDLDSKVILLWRLLAHAKVESVKSKVAAEERKIKKKSWFSFRWHADTEETSLDDVSEEQQVTEERLTKEEWHAINKLLS YQPAEELMLRSAKDMQNMFQFLVTVSIGQAALRIISVNQVEIVCGRFEQLHVSTKFKHRSVYCDVLLKFYGLSAPEGSLT QSVYSEQKVNALVASFVHLPIGENIDWRLSATIAPCHVTVLMESINRVLEFLKRSKAVSPTVALETATALQLKFEEVTRR AQEQFQMVLEEQSRFAFDIDLDAPKVRVPLRTSGSERCDSHFLLDFGHFTLHTAESQSDDQRQNLYSRFYISGRDIAAFF TDCGSDSGSCSLVEPNYDGQIMNSPITKEDENVYSLIDRCGMAVLVNQIKVPHPNYPSTLISIQVPNLWIHFSPERYFRI MELLNILYETMETCSQPTADSCQSKLAPWSPADLATDGRILVWKGIGNSVATWHPCFLVLSGSYLYMFESAKSQSYQRYL SMAGRQILDVPPTNIGGSPFCIAVSTRGMDIQKALESSTTWILDFRDDEEKCSWFKGLIQATYQASTLLSVDVLGNSEGD AAPFNVLNTTTSKPADIVINGALVEFKLFIYGKAGDSIDGELDETLLLEVVADGGKVHVILAGGDLTVKMKLHSLKIKDE LQGRLSVAPSYLAVSVLKNETLSSSSGSFDSHGKDMSLGLPDDDDSFMDALSEFMSQTDVGYLHNMDLDQQGLMGIASDF ESLENLIHEKEIEKGKGTPREVYYEAEGSDTSNFVSLSFSTRSSGSPDYNGIDTQMCVRMSKLEFFCNRPTIVALISFGL DISSGNKMTSHTSETSPERPSVKERTDEKGRVKGLLGFGKERVVFYLNMNVDSVTIFLNKEDDSQLAKLVQESFLMDLKV HPSSLSIDGTLGNFRLCDTSLGTDQCWDWLCDIRNPGVDSLIKFKFNSYSAEDDDYEGYDYSLQGQLSAVRIVFLYRFVQ EIMVYFMELASPHTEEAIKLVDKVGGFEWLIQKYEIDGATSLKLDLALETPIIVVPRNSMSKDFIQLDLGKLQIKNEFSW YGSREEDPSAVHIDLLHAQILGINMSVGIDGFLGKPMIREGQGLDIFVRRSLRDVFRKVPTFSLEVKVDLLHGIISDKEY KVILDCTYMNLSEEPRLPASFRGGKSGSRDTIRLLVDKVNLNSQNLLSQTVTIVTVVVNHALLELCNGTDGESPLAHIAL EGLWVSYRMTSLSETDLFVTIPKFSILDVRPDTKPEMRLMLGSSTDASKQAVTGKVPFSFNPGSFRRTTSEAGIDDMPIS TMFLMDYRWRMSSQSFVIRLQQPRVLVVPDFLLAVTEFFVPALGALTGREETMDPKNDPINRNVSIVLMESVYKQKDDVM HLSPSRQLVADCVGIDEYTYDGCGKVICLSVETDAKEVRGTRFRPIIVIGRGKRLRFVNVKIENGSLLRKYTYLNNDSSY SITIEDGVEIVAPCNLTSGDEKSLDNLNQTSGTTIYSQYESNGTQSFTLETQVVSSEFTFYDGSKSFLDDSSYGEKLVRA KLDMSFMYASKEKDTWIRALLKDFTVEAGSGLVILDPVDISGGYTSVKDKTSISLISTDICIHLSLSAASLILNLQSQAS AALNFGNANPLVQCTNFDRIWVSEKESGSNNNITFWRPQAPANYVILGDCVTSRPIPPSQAVMAVSNTYGRVRKPVDFHL IGSFLNIQGHGGNEGQSITDNDCSLWMPIAPPGYTALGCVAHVGSQPPPNHVVHCLRSDLVTSAKYSDCLFNITSNNQFT SGFSIWRLDNAVGSFFAHSSIGFPLKNKCYDLNHLLVWSSNRGPLISPISDFNSDRENNNQQTSANVNTSGWEILKSISK ATNFYMSTPNFERIWWDKGSDLRRPVSIWRPIARRGYAVLGDCITEGLEPPALGIIFKNDNPDISSKPVQFTKVSHIVGK GVEEVFFWFPIAPPGYVSLGCVVSRTDEAPHADLFCCPRMDLVSQGNIHEVPLSRSSSSRAPQSWSIWKVENQACTFLAR SDLKKPSSRLAYIIGDSVKPKTRENINAELKLRYFSLTMLDSLCGMMRPLFDTTITNIKLATHGGLDGMNAVLISSIVAS TFNAQLEAWEPLVEPFDGIFKFETFDTNEQSPLGLGKRIRISATSILNVNISAANLESSVGSILSWRRQLELEQKASKLN AEGCGQQITGENTTFSALDEDDLQTVIVENRLGCDVFVKKVEHDIDTVDKLHHGDCASVWIPPPRFSNRLNVAHESREAR YYVAVQILEAKGLPIIDDGNSHNFFCALRLVVDSQASEQQKLFPQSARTKCVKPVISRINSLDEGRVKWNELFIFEVPRK APSKLEIEVTNLAAKAGKGDVVGALSFSVGHGANILKKVASVRMFHQPYDNQSIRSYPLSRMTQQSNVEAMHDGCLIIST SYFERNTIANLQKDMESDNVGDRDIGLWVGLGPECEWESIRSLLPLSVVPISLQNEYIGMEVVMKNGKKHVIFRGLVTVV NDSDVMLNILTCHTSHGHDPSLGANGSNTAVEEVFQNQYYHPSSGWGSNGSAMHHDNPGHWSTRDFSHSSKDFFEPPLPP GWKWASGWSIDKFQYVDKEGWAYGPDIKNFRWPPTSSKFSTKSASDVVRRRRWIRTRQTVSEQGMECLHSGASTVQPGAS AVLSWRSTFKGSDQCLQVQPNFHNSQLKYSWGQVVAVGSSYIYSKDQLLDQSSRQTSVTPNRFLKLNELEKKDILLRCNP SSGSKQFWFSVGTDAAVLNTELNIPVYDWRISINSPMKLENRLPCPAEFSISEKTKGGNCVERHHGVMSSRQSVHIYSAD IQKPLYLTLFVQGGWIMEKDPILILDPSFSNHVSSFWMVHRQSKRKLRVSIEHDVGGTSAAPKTCRLFVPYWIVNDSSLA LAYRLVEVEPSENAEVDSVPLSRAVKSAKTALKSPISSMDRRRSSSRKNLQVLEVIEDNSPFPSMLSPQDYAGRSGVTMF QSQKDTFFSPRLGISVSMRQSEVYSSGISLHELENKERIDVKAFNSDGSYYKLSAVLNMTSDRTKVVHFQPHTMFVNRVG CSLCLQQCDTQSSVWIQPTDPPKPFGWQSSAKVELLKLRIDGYKWSTPFSVSYEGVMRLMLKKDSGDEPMLLRVAVRSGA KRSRFEVIFRPDSLSSPYRIENRSMFLPVRFRQVDGIGDSWQLLLPNSAASFLWEDLGRRRILELFVDGTDPVKSLKYDI DEISDHQPIHVADGPTRALRVTIVKEERANVVKISDWMPETEPTGVLSRRQSSPIVHSQKQQLMSITDCEFHINFDLAEL GISITDHTPEEILYLSVQNLVLAYSTGLGSGISRFKLRMSGLQVDNQLPLTPMPVLFRPQRVSETDYILKCSVTMQSNGS LDLCVYPYIGLHGPENSTAFLINIHEPIIWHLHEMIQKVKLSRLYDSQTTAASVDPIIQIGVLNISEVRFKVSMAMSPSQ RPRGVLGFWASLMTALGNTENMPVRINQRFNENICMRQSSMISMAISNIRRDLLGQPLQLLSGVDILGNASSALGHMSKG VAALSMDKKFIQSRQRQESKGVEDFGDVIREGGGAFAKGLFRGVTGILTKPLEGAKTSGVEGFVQGVGKGIIGAAAQPVS GVLDLLSKTTEGANAMRMKIASAITSEEQLLRRRLPRVISGDNLLQLYDEYKAQGQVILQLAESGSFFGQVDLFKVRGKF ALSDAYEDHFMLPKGKILMVTHRRVILLQQPSNIIAQRKFSPARDPCSILWDILWDDFGTMELTHGKKENPKAPPSRLIL YSQSRSLDVKENTRIIKCSPETHQALKVYSAIDHAVNTYGPGASKGILKNKVTKPYSPLVDGRNDDLTLNEDVCSWSSQL MPGSAPLPSSFGSSADH
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Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Pfam
PF12624
2 114 113 1.3E-31
IPR026854
Pfam
PF16908
139 383 245 7.4E-67
IPR031646
Pfam
PF16910
578 805 228 1.6E-38
IPR031642
PANTHER
PTHR45523
652 2054 1403 0.0 –
ProSiteProfiles
PS50003
833 943 111 8.92
IPR001849
SMART
SM00233
834 945 112 7.5E-6
IPR001849
CDD
cd00821
837 938 102 0.0015053 –
Gene3D
G3DSA:2.30.29.30
840 946 107 5.0E-7
IPR011993
SUPERFAMILY
SSF50729
847 945 99 3.76E-9 –
Pfam
PF00169
849 942 94 4.8E-6
IPR001849
MobiDBLite
mobidb-lite
1207 1228 22 - –
Pfam
PF06101
1998 2168 171 2.5E-16
IPR009291
Pfam
PF06101
2251 2391 141 2.3E-8
IPR009291
SUPERFAMILY
SSF49562
2624 2750 127 1.87E-6 –
Gene3D
G3DSA:2.60.40.150
2626 2767 142 2.9E-7
IPR035892
ProSiteProfiles
PS50004
2643 2746 104 9.776
IPR000008
CDD
cd00030
2645 2749 105 1.19042E-6 –
Pfam
PF06650
3267 3557 291 1.4E-14
IPR009543
Pfam
PF16909
3821 3924 104 5.8E-7
IPR031645

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0334900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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