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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0334900 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0334900.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Calcium-dependent lipid-binding family protein isoform protein; TAIR: AT1G48090.4 calcium-dependent lipid-binding family protein; Swiss-Prot: sp|Q54LB8|VP13A_DICDI Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13A; TrEMBL-Plants: tr|A0A072V2R4|A0A072V2R4_MEDTR Calcium-dependent lipid-binding-like protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0334900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:71425799..71491118) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGTTCGAAGCTCACGTAAGATTCCTCTCTTCTTCTTTCATGCAAACTTCAATTTCGATTTCTTCTGTCAATTTGCGTTT GCAATTTTCCTTTGTTTCTCGATCGGACTGCATTCGCTAGTGGATGGTGGTGGCAGTTACTAAGTAGTGAATACTATGCT TCTCTGTGTCATGAATAGTTGTTGCATTTCTAAGTCTTGCTGTATTTGATTGATGCATGTAAACTGTGATTCTCAGTGGA CAAAGGAGATAGTAATGTTGCTTTTGTTGACAGGTTTTGCATTTGCTTCGGAAATATTTGGGTGAATATGTACATGGACT CTCTACGGAGGCGTTGAGAATCAGTGTCTGGAAAGGTTTGTATTCTACTATTTTCTTTCTTTGGAGTGCCGGTGCTGAAT TTGGTATTGTTCCATTACCTTTTTCCTTTGGTTGTATACAATCTACAATCTGAATGCATGTTAGGTAAAATCAAAATGGA ACCTACTTACCAATTCCGTCAAATGTTACTAGTTCTCAAGTTGACCGATATAGAATTTTTCTTTATGCTTCTCTCGAAGT CATTAAACGGAGCAAACTTCTTGCATTGATTGTCCTAGTTCGGCTTCAGCGCTCTTTTTCTTTTCCTCTTAGTTTTATGA TATGCTTTAGAGATTTTGTAAGTAGAAGGGAGAGTAAGCTAGGCTAGAATCCTGCTCTTTTAGCTGGACTGCTTACGGTC CAATTGGCTGGAACGCAACTCTAGAGGCTTTAGATAGATGTTTTGGGTGTCTCAATTTTTTTGGGATTGGCTTGTTTTTC TATACGTTTCTGTAGCTTTGATGTCATCATTTTCCTTAAGGTTTCTCATTTGTTATGCAAAGGGGTTGTCTTGCTACTTG AAGTGATTTATTTACTATGGTGATTAAGCATGTGCCCTCTATATTATAGTTGTAGTTTCATATACATGTTTATATTTACA 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0334900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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CACCCAAGTTCTCTCTCCATTGATGGGACATTAGGCAATTTTAGGCTCTGTGATACATCCCTTGGAACCGATCAATGTTG GGATTGGCTTTGTGACATACGCAATCCTGGTGTTGACTCCCTTATTAAGTTCAAATTTAATTCTTATAGTGCTGAAGATG ATGACTATGAAGGGTACGACTATAGCTTGCAAGGTCAACTTTCAGCTGTTCGCATTGTTTTCCTCTATAGATTTGTGCAA GAGATAATGGTGTACTTTATGGAATTGGCCTCCCCTCATACTGAAGAAGCAATCAAACTTGTTGATAAGGTTGGAGGATT TGAATGGTTGATTCAAAAATATGAAATAGATGGAGCTACATCACTCAAGCTTGATCTTGCTCTAGAAACTCCAATTATCG TAGTTCCAAGGAATTCGATGAGCAAAGATTTTATACAACTTGATCTGGGAAAGCTACAGATTAAAAATGAATTCAGTTGG TATGGATCCCGGGAAGAAGATCCGTCAGCTGTGCATATTGATCTTCTTCATGCTCAGATTTTGGGTATTAACATGTCTGT CGGCATTGATGGTTTTCTTGGAAAACCGATGATACGGGAAGGTCAAGGTCTTGATATTTTTGTTCGTCGAAGCTTGAGGG ATGTTTTCCGGAAAGTCCCAACTTTTTCACTTGAAGTGAAGGTGGATCTATTGCATGGTATAATCTCTGATAAAGAATAT AAGGTGATTTTGGACTGCACATACATGAATTTATCAGAAGAACCAAGGCTTCCTGCAAGTTTTCGTGGCGGAAAATCTGG TTCAAGAGATACTATTAGGCTTCTGGTTGATAAGGTTAACTTAAACAGTCAAAATCTGTTGTCACAAACAGTTACAATTG TAACTGTTGTGGTGAACCATGCCTTGCTGGAGCTTTGTAATGGCACTGACGGGGAGTCTCCATTGGCTCATATTGCCGTG AGTCTGGAAGGTCTTTGGGTTTCATATCGTATGACTTCTTTATCAGAGACAGACCTCTTTGTGACAATACCCAAATTTTC TATACTTGATGTTCGCCCTGATACAAAACCTGAAATGCGTCTGATGCTTGGATCATCTACTGATGCTTCAAAACAAGCAG TTACTGGAAAAGTTCCCTTTTCATTTAACCCGGGTAGCTTTAGAAGGACAACTAGTGAAGCTGGAATTGATGATATGCCC ATTTCAACTATGTTCTTGATGGACTACAGGTGGAGGATGTCATCCCAATCATTTGTGATTCGTTTGCAGCAACCTCGAGT TCTTGTGGTACCAGATTTTCTTCTTGCAGTAACTGAGTTTTTTGTCCCTGCTCTGGGAGCACTAACTGGAAGAGAGGAAA CAATGGATCCAAAGAATGATCCTATTAACAGAAACGTTAGCATAGTGCTGATGGAATCAGTTTACAAGCAGAAAGATGAT GTGATGCACCTTTCCCCATCTAGGCAGCTAGTTGCAGATTGTGTAGGCATTGACGAATATACATATGACGGTTGTGGAAA GGTTATTTGTTTATCTGTTGAAACAGATGCAAAAGAAGTCCGCGGCACAAGGTTTAGACCAATAATAGTCATTGGACGTG GCAAAAGATTGCGATTTGTTAATGTTAAAATTGAGAATGGCTCTCTTCTAAGGAAGTATACGTACCTGAATAATGATAGC AGTTACTCAATCACTATTGAGGATGGTGTTGAAATTGTGGCTCCATGCAATCTGACATCTGGTGATGAAAAAAGCCTTGA CAACTTGAATCAAACATCGGGAACTACTATATATTCTCAATATGAATCAAATGGAACTCAAAGTTTTACCCTTGAAACCC AGGTTGTTTCTTCTGAATTCACCTTCTATGATGGTTCTAAGTCATTTCTCGACGATTCATCTTATGGCGAGAAGCTTGTT CGTGCGAAGTTGGACATGAGCTTCATGTATGCCTCCAAGGAGAAGGACACTTGGATTAGAGCCCTGTTGAAGGATTTTAC AGTTGAGGCTGGTTCTGGTCTTGTCATTCTTGATCCTGTGGATATATCAGGGGGATATACTTCTGTGAAAGACAAAACAA GTATATCTTTGATATCAACGGATATCTGTATTCATCTCTCACTTAGTGCTGCTTCTCTCATTCTAAATCTGCAAAGCCAA GCATCTGCTGCCTTAAATTTTGGAAATGCAAATCCACTTGTTCAGTGTACCAACTTCGACCGAATTTGGGTATCTGAAAA AGAGTCTGGTTCCAATAACAATATTACCTTTTGGAGGCCTCAAGCTCCTGCAAATTATGTCATATTAGGAGATTGTGTGA CATCAAGGCCAATTCCTCCTTCACAGGCAGTAATGGCTGTAAGCAATACATACGGCCGTGTAAGGAAGCCAGTTGATTTC CATCTTATTGGATCATTCCTGAATATCCAAGGGCATGGCGGAAATGAAGGTCAATCTATTACTGACAATGATTGTTCTCT TTGGATGCCCATTGCGCCCCCAGGGTACACAGCTCTAGGCTGTGTAGCCCATGTTGGGAGCCAACCGCCCCCAAATCATG TTGTTCATTGCTTACGTTCTGATCTTGTAACATCAGCAAAATATTCAGACTGCTTATTTAATATCACATCAAATAATCAA TTTACTTCTGGATTTAGCATATGGCGCCTTGACAATGCTGTTGGCTCTTTTTTTGCACATTCTTCAATCGGTTTCCCTCT CAAAAACAAATGCTATGACTTGAATCATCTGCTTGTCTGGAGTTCAAATCGCGGTCCTCTGATAAGTCCAATATCAGATT TTAATTCCGATCGTGAAAATAATAATCAGCAGACAAGCGCAAATGTAAATACATCTGGATGGGAGATTCTCAAGTCCATT TCGAAAGCAACTAACTTCTACATGTCTACACCAAACTTTGAAAGGATTTGGTGGGACAAAGGCAGCGACCTCCGGCGTCC AGTCTCCATTTGGCGACCCATTGCGCGTCGTGGTTATGCTGTCTTGGGTGATTGCATTACTGAAGGCCTTGAACCACCTG CACTGGGAATAATCTTCAAGAATGACAATCCTGATATCTCTTCAAAACCTGTTCAGTTTACCAAAGTTTCCCATATTGTG GGGAAAGGAGTTGAAGAAGTTTTCTTCTGGTTTCCTATAGCTCCTCCTGGTTATGTTTCTCTAGGATGTGTTGTCTCCAG AACAGATGAAGCACCACATGCAGATTTGTTTTGCTGCCCAAGGATGGATCTTGTTAGCCAAGGTAACATTCATGAGGTGC CTCTTTCAAGATCTTCAAGCTCAAGGGCTCCTCAATCCTGGAGTATATGGAAAGTAGAAAATCAGGCATGCACCTTTCTG GCTCGTTCTGACCTTAAAAAGCCATCTAGTCGGTTGGCTTACATAATTGGTGATTCAGTGAAGCCCAAGACTCGGGAAAA CATAAATGCTGAGCTGAAGCTGCGATATTTTTCCCTAACTATGTTGGACAGCTTATGTGGAATGATGAGACCCTTGTTTG ACACTACAATTACCAATATTAAGCTTGCAACTCATGGTGGACTAGATGGGATGAATGCTGTACTTATTTCCTCAATTGTT GCATCAACCTTCAATGCACAATTAGAGGCATGGGAGCCCCTTGTGGAGCCATTTGATGGAATATTTAAGTTTGAAACTTT TGATACCAATGAACAATCGCCATTAGGACTTGGGAAGAGAATTCGAATTTCAGCAACTAGCATCTTGAATGTCAATATCA GCGCAGCAAATCTTGAATCCTCTGTGGGAAGCATCCTTTCGTGGAGAAGACAGTTGGAGCTTGAACAGAAAGCATCCAAG CTAAATGCGGAGGGTTGTGGTCAACAAATCACAGGAGAAAATACAACTTTTTCTGCACTAGATGAGGATGACTTGCAGAC TGTTATAGTAGAAAATAGACTTGGATGCGATGTTTTTGTTAAAAAAGTTGAGCATGATATAGATACTGTTGACAAGCTAC ACCATGGTGATTGTGCTTCTGTGTGGATTCCACCTCCAAGATTTTCAAATAGGTTAAATGTTGCTCATGAATCTAGGGAA GCTCGTTATTATGTGGCTGTACAGATACTTGAAGCCAAGGGTCTTCCCATCATTGATGATGGTAACAGCCATAACTTCTT CTGTGCTTTGCGCCTTGTTGTTGACAGTCAGGCATCAGAGCAGCAAAAACTTTTTCCCCAGAGTGCAAGAACAAAGTGTG TGAAACCTGTAATATCAAGAATTAATAGTTTGGATGAAGGCAGAGTAAAGTGGAATGAACTTTTCATATTTGAAGTTCCC AGAAAGGCCCCTTCTAAATTGGAAATAGAGGTTACAAATCTTGCTGCAAAAGCTGGAAAAGGGGATGTTGTGGGTGCACT TTCATTTTCTGTTGGACATGGTGCAAATATTCTTAAGAAGGTTGCTTCAGTGAGAATGTTTCATCAACCTTATGATAATC AGAGTATTAGATCGTATCCACTAAGTAGAATGACTCAACAAAGCAATGTTGAAGCCATGCATGATGGATGCCTCATTATT TCAACTTCTTATTTTGAAAGAAACACAATTGCTAACCTTCAAAAAGATATGGAAAGTGATAATGTTGGTGATCGAGATAT AGGTTTGTGGGTGGGGCTTGGTCCAGAGTGTGAATGGGAGAGTATTCGATCTTTGCTCCCACTTTCTGTTGTTCCAATAT CATTACAGAATGAATATATTGGTATGGAAGTTGTGATGAAAAATGGAAAGAAGCATGTAATTTTCAGGGGTCTTGTTACA GTTGTGAACGACTCAGATGTTATGTTGAATATTTTGACATGTCACACATCTCATGGCCATGATCCCTCACTTGGAGCAAA TGGTTCTAATACTGCAGTTGAAGAAGTCTTTCAAAATCAGTATTATCATCCGTCATCTGGTTGGGGTAGCAATGGGTCAG CTATGCACCATGATAATCCTGGACACTGGAGCACAAGGGACTTTTCACATTCATCTAAGGACTTCTTTGAACCTCCACTT CCTCCTGGGTGGAAATGGGCTTCAGGTTGGTCCATAGATAAGTTTCAGTATGTTGACAAGGAAGGCTGGGCATATGGGCC TGACATTAAAAATTTTAGATGGCCTCCTACTTCATCAAAGTTTTCAACAAAATCAGCCTCTGATGTTGTGCGTCGACGGC GTTGGATTCGTACTAGACAAACCGTTTCTGAGCAAGGTATGGAATGCTTGCATAGTGGAGCAAGTACTGTGCAGCCTGGA GCTTCTGCTGTTTTATCTTGGAGAAGTACATTCAAGGGCTCTGACCAATGTTTGCAAGTTCAACCTAATTTTCATAATTC TCAGCTCAAATACTCATGGGGTCAGGTGGTTGCTGTTGGTTCAAGTTATATATATAGCAAAGATCAGTTATTAGATCAAA GTTCTAGACAAACTTCTGTGACACCCAATCGTTTTTTGAAGCTAAATGAACTTGAGAAAAAGGATATACTTCTACGCTGC AATCCTAGTAGTGGAAGTAAACAGTTTTGGTTTAGTGTGGGTACAGATGCTGCAGTTCTTAATACTGAACTAAATATACC TGTATATGATTGGAGAATATCAATTAATTCTCCTATGAAATTGGAGAACCGGCTTCCTTGTCCTGCTGAATTTTCAATAT CGGAGAAAACAAAGGGAGGAAATTGTGTTGAGCGGCATCATGGCGTCATGTCTTCTCGTCAGAGTGTGCATATCTATTCA GCTGATATTCAAAAACCTTTGTATCTTACTTTATTTGTGCAGGGTGGCTGGATTATGGAAAAGGACCCAATTCTTATACT GGATCCTTCTTTCTCAAATCACGTCTCATCCTTCTGGATGGTTCACCGGCAAAGTAAAAGGAAACTGCGTGTGAGCATTG AACATGATGTGGGCGGGACAAGTGCTGCACCAAAAACCTGTAGACTCTTTGTCCCTTATTGGATTGTCAATGATTCTTCT CTAGCATTGGCATATCGTTTAGTGGAAGTGGAACCTTCGGAAAATGCAGAGGTGGATTCTGTCCCTCTCTCTAGGGCAGT GAAGTCTGCCAAGACAGCTTTGAAAAGTCCCATTAGCTCAATGGATAGAAGGCGTTCTAGTTCAAGGAAAAACCTACAAG TGCTTGAAGTTATTGAAGATAACAGCCCTTTTCCTAGCATGCTTTCTCCACAAGATTATGCCGGTCGTAGTGGAGTTACA ATGTTCCAATCTCAGAAAGATACATTCTTCTCTCCTAGGCTTGGCATTTCTGTTTCTATGCGCCAATCTGAAGTTTATAG CTCTGGAATTTCTCTGCATGAACTGGAAAACAAGGAACGTATTGATGTCAAGGCTTTCAATTCTGATGGATCTTATTACA AGCTTTCAGCAGTGTTGAACATGACTTCAGACAGAACAAAGGTGGTCCATTTCCAGCCACACACAATGTTCGTCAATAGG GTTGGATGTAGTCTCTGCCTACAGCAATGTGATACTCAGTCTTCTGTGTGGATCCAACCCACTGATCCTCCAAAACCCTT TGGGTGGCAGTCATCAGCTAAAGTTGAACTTTTGAAGTTGCGTATTGATGGATACAAATGGAGTACACCATTTAGCGTAA GCTATGAAGGTGTAATGCGCCTTATGCTGAAAAAAGATAGTGGAGATGAACCAATGCTATTAAGGGTAGCAGTAAGAAGT GGTGCCAAGAGATCACGCTTTGAAGTTATTTTTCGTCCAGATTCATTGTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAATCGCTCCAT GTTCTTGCCCGTTCGCTTTCGTCAAGTTGATGGTATCGGTGATTCTTGGCAGCTGCTTCTTCCGAATTCTGCTGCTTCAT TTCTATGGGAAGATCTTGGTAGAAGACGTATATTGGAACTCTTTGTAGATGGAACTGACCCGGTGAAATCACTCAAGTAT GATATTGATGAAATTTCTGATCACCAGCCCATTCATGTAGCAGATGGGCCAACCAGAGCCTTGCGTGTTACTATTGTAAA GGAAGAGAGAGCCAATGTTGTGAAGATCAGTGATTGGATGCCTGAAACTGAACCTACCGGTGTTCTGAGCCGAAGACAAT CATCACCAATTGTTCACTCTCAAAAGCAACAATTGATGTCAATTACAGATTGTGAATTCCACATCAATTTTGATCTTGCT GAGCTTGGGATATCTATTACTGATCATACACCTGAGGAAATTTTGTACCTGTCTGTTCAGAATCTTGTTCTGGCGTATTC AACTGGTTTGGGCTCCGGAATCAGTAGATTTAAACTTAGAATGTCTGGGCTACAAGTGGACAATCAACTGCCATTAACTC CTATGCCAGTTCTCTTCAGGCCTCAGAGAGTGTCAGAAACTGATTATATCCTGAAATGTTCTGTTACAATGCAGTCAAAT GGATCACTGGATCTTTGTGTCTATCCATATATTGGTCTTCATGGGCCAGAAAATTCCACTGCCTTTTTGATAAACATTCA TGAACCTATTATTTGGCACCTTCATGAAATGATCCAGAAGGTGAAGCTCAGTAGGCTGTATGATTCTCAAACAACTGCTG CATCAGTTGATCCAATCATTCAAATTGGTGTCCTTAATATTTCGGAAGTTCGATTCAAAGTGTCAATGGCGATGTCACCA AGTCAAAGACCAAGGGGTGTGCTTGGGTTCTGGGCATCCTTAATGACTGCATTGGGTAACACAGAAAATATGCCAGTTAG GATAAACCAGAGGTTTAATGAGAACATATGCATGAGGCAGAGTTCTATGATTAGCATGGCTATCTCAAATATCCGAAGGG ATCTTCTAGGCCAACCACTTCAGCTGCTCTCAGGTGTTGATATATTGGGTAATGCAAGTAGTGCACTTGGACATATGAGT AAAGGTGTAGCTGCATTGTCTATGGATAAGAAGTTCATTCAAAGTCGGCAAAGACAGGAAAGCAAAGGTGTGGAGGATTT TGGTGATGTTATAAGAGAGGGAGGGGGAGCATTTGCTAAAGGTTTATTCAGAGGGGTAACTGGCATTTTGACAAAGCCTC TTGAAGGAGCTAAAACGTCTGGTGTTGAGGGTTTTGTTCAGGGTGTTGGGAAGGGTATTATTGGTGCAGCTGCACAACCA GTGAGTGGAGTTCTAGATCTTCTGTCAAAAACGACTGAAGGCGCTAATGCTATGAGAATGAAAATAGCATCTGCTATAAC ATCTGAAGAACAACTTCTCCGGAGGAGGCTACCTCGTGTTATAAGTGGTGACAATTTGCTTCAACTATATGATGAGTACA AAGCCCAAGGACAGGTCATACTACAGTTGGCAGAATCAGGTTCATTTTTTGGCCAGGTTGATCTATTCAAAGTTCGTGGA AAGTTTGCCTTATCAGATGCTTATGAAGATCACTTCATGCTTCCAAAGGGGAAAATCCTCATGGTCACGCATAGAAGAGT CATTCTATTGCAACAACCATCCAATATTATTGCTCAAAGGAAGTTCAGCCCTGCAAGAGATCCATGTTCAATACTGTGGG ATATACTGTGGGATGACTTTGGTACAATGGAACTGACACATGGAAAAAAAGAGAACCCAAAAGCTCCCCCTTCGCGGCTC ATTTTATATTCGCAGTCTAGATCATTGGATGTGAAAGAAAACACTCGCATCATAAAATGTAGCCCTGAAACACATCAAGC TCTTAAAGTTTACTCTGCAATTGACCACGCAGTGAACACTTATGGCCCTGGCGCATCAAAGTCTCTAATTTATTAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0334900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFEAHVLHLLRKYLGEYVHGLSTEALRISVWKGDVVLKDLKLKAEALNALKLPVTVKAGFVGTITLKVPWKSLGKEPVIV LIDRVFVLAHPAPDSRTMKDEDREKLFQDKLQHIEEAESATLDAISKSKLGSSSSGNSWLSSLISTIIGNLKISISNVHI RYEDSVSNPGHPFSSGLTLAKLAAVTMDEQGNETFDTSGALDRLRKSVHLERLAFYHDSNRLPWEIDKRWEDISPHEWIE IFEDGINEPTGDHKLVSKWAMNRTYLVYPINAVLQYHRLGNQERTDPEIPFEKASLVLTDVSLTLTEAQYYDWIKLLEAV SRYKTYMEVSHLRPTVPISKAPYLWWQYAAQASLQQQKMCYRLSWDQIRNLCQLRRRYIQLYVASLQHSSDNNHTELREI EKDLDSKVILLWRLLAHAKVESVKSKVAAEERKIKKKSWFSFRWHADTEETSLDDVSEEQQVTEERLTKEEWHAINKLLS YQPAEELMLRSAKDMQNMFQFLVTVSIGQAALRIISVNQVEIVCGRFEQLHVSTKFKHRSVYCDVLLKFYGLSAPEGSLT QSVYSEQKVNALVASFVHLPIGENIDWRLSATIAPCHVTVLMESINRVLEFLKRSKAVSPTVALETATALQLKFEEVTRR AQEQFQMVLEEQSRFAFDIDLDAPKVRVPLRTSGSERCDSHFLLDFGHFTLHTAESQSDDQRQNLYSRFYISGRDIAAFF TDCGSDSGSCSLVEPNYDGQIMNSPITKEDENVYSLIDRCGMAVLVNQIKVPHPNYPSTLISIQVPNLWIHFSPERYFRI MELLNILYETMETCSQPTADSCQSKLAPWSPADLATDGRILVWKGIGNSVATWHPCFLVLSGSYLYMFESAKSQSYQRYL SMAGRQILDVPPTNIGGSPFCIAVSTRGMDIQKALESSTTWILDFRDDEEKCSWFKGLIQATYQASTLLSVDVLGNSEGD AAPFNVLNTTTSKPADIVINGALVEFKLFIYGKAGDSIDGELDETLLLEVVADGGKVHVILAGGDLTVKMKLHSLKIKDE LQGRLSVAPSYLAVSVLKNETLSSSSGSFDSHGKDMSLGLPDDDDSFMDALSEFMSQTDVGYLHNMDLDQQGLMGIASDF ESLENLIHEKEIEKGKGTPREVYYEAEGSDTSNFVSLSFSTRSSGSPDYNGIDTQMCVRMSKLEFFCNRPTIVALISFGL DISSGNKMTSHTSETSPERPSVKERTDEKGRVKGLLGFGKERVVFYLNMNVDSVTIFLNKEDDSQLAKLVQESFLMDLKV HPSSLSIDGTLGNFRLCDTSLGTDQCWDWLCDIRNPGVDSLIKFKFNSYSAEDDDYEGYDYSLQGQLSAVRIVFLYRFVQ EIMVYFMELASPHTEEAIKLVDKVGGFEWLIQKYEIDGATSLKLDLALETPIIVVPRNSMSKDFIQLDLGKLQIKNEFSW YGSREEDPSAVHIDLLHAQILGINMSVGIDGFLGKPMIREGQGLDIFVRRSLRDVFRKVPTFSLEVKVDLLHGIISDKEY KVILDCTYMNLSEEPRLPASFRGGKSGSRDTIRLLVDKVNLNSQNLLSQTVTIVTVVVNHALLELCNGTDGESPLAHIAV SLEGLWVSYRMTSLSETDLFVTIPKFSILDVRPDTKPEMRLMLGSSTDASKQAVTGKVPFSFNPGSFRRTTSEAGIDDMP ISTMFLMDYRWRMSSQSFVIRLQQPRVLVVPDFLLAVTEFFVPALGALTGREETMDPKNDPINRNVSIVLMESVYKQKDD VMHLSPSRQLVADCVGIDEYTYDGCGKVICLSVETDAKEVRGTRFRPIIVIGRGKRLRFVNVKIENGSLLRKYTYLNNDS SYSITIEDGVEIVAPCNLTSGDEKSLDNLNQTSGTTIYSQYESNGTQSFTLETQVVSSEFTFYDGSKSFLDDSSYGEKLV RAKLDMSFMYASKEKDTWIRALLKDFTVEAGSGLVILDPVDISGGYTSVKDKTSISLISTDICIHLSLSAASLILNLQSQ ASAALNFGNANPLVQCTNFDRIWVSEKESGSNNNITFWRPQAPANYVILGDCVTSRPIPPSQAVMAVSNTYGRVRKPVDF HLIGSFLNIQGHGGNEGQSITDNDCSLWMPIAPPGYTALGCVAHVGSQPPPNHVVHCLRSDLVTSAKYSDCLFNITSNNQ FTSGFSIWRLDNAVGSFFAHSSIGFPLKNKCYDLNHLLVWSSNRGPLISPISDFNSDRENNNQQTSANVNTSGWEILKSI SKATNFYMSTPNFERIWWDKGSDLRRPVSIWRPIARRGYAVLGDCITEGLEPPALGIIFKNDNPDISSKPVQFTKVSHIV GKGVEEVFFWFPIAPPGYVSLGCVVSRTDEAPHADLFCCPRMDLVSQGNIHEVPLSRSSSSRAPQSWSIWKVENQACTFL ARSDLKKPSSRLAYIIGDSVKPKTRENINAELKLRYFSLTMLDSLCGMMRPLFDTTITNIKLATHGGLDGMNAVLISSIV ASTFNAQLEAWEPLVEPFDGIFKFETFDTNEQSPLGLGKRIRISATSILNVNISAANLESSVGSILSWRRQLELEQKASK LNAEGCGQQITGENTTFSALDEDDLQTVIVENRLGCDVFVKKVEHDIDTVDKLHHGDCASVWIPPPRFSNRLNVAHESRE ARYYVAVQILEAKGLPIIDDGNSHNFFCALRLVVDSQASEQQKLFPQSARTKCVKPVISRINSLDEGRVKWNELFIFEVP RKAPSKLEIEVTNLAAKAGKGDVVGALSFSVGHGANILKKVASVRMFHQPYDNQSIRSYPLSRMTQQSNVEAMHDGCLII STSYFERNTIANLQKDMESDNVGDRDIGLWVGLGPECEWESIRSLLPLSVVPISLQNEYIGMEVVMKNGKKHVIFRGLVT VVNDSDVMLNILTCHTSHGHDPSLGANGSNTAVEEVFQNQYYHPSSGWGSNGSAMHHDNPGHWSTRDFSHSSKDFFEPPL PPGWKWASGWSIDKFQYVDKEGWAYGPDIKNFRWPPTSSKFSTKSASDVVRRRRWIRTRQTVSEQGMECLHSGASTVQPG ASAVLSWRSTFKGSDQCLQVQPNFHNSQLKYSWGQVVAVGSSYIYSKDQLLDQSSRQTSVTPNRFLKLNELEKKDILLRC NPSSGSKQFWFSVGTDAAVLNTELNIPVYDWRISINSPMKLENRLPCPAEFSISEKTKGGNCVERHHGVMSSRQSVHIYS ADIQKPLYLTLFVQGGWIMEKDPILILDPSFSNHVSSFWMVHRQSKRKLRVSIEHDVGGTSAAPKTCRLFVPYWIVNDSS LALAYRLVEVEPSENAEVDSVPLSRAVKSAKTALKSPISSMDRRRSSSRKNLQVLEVIEDNSPFPSMLSPQDYAGRSGVT MFQSQKDTFFSPRLGISVSMRQSEVYSSGISLHELENKERIDVKAFNSDGSYYKLSAVLNMTSDRTKVVHFQPHTMFVNR VGCSLCLQQCDTQSSVWIQPTDPPKPFGWQSSAKVELLKLRIDGYKWSTPFSVSYEGVMRLMLKKDSGDEPMLLRVAVRS GAKRSRFEVIFRPDSLSSPYRIENRSMFLPVRFRQVDGIGDSWQLLLPNSAASFLWEDLGRRRILELFVDGTDPVKSLKY DIDEISDHQPIHVADGPTRALRVTIVKEERANVVKISDWMPETEPTGVLSRRQSSPIVHSQKQQLMSITDCEFHINFDLA ELGISITDHTPEEILYLSVQNLVLAYSTGLGSGISRFKLRMSGLQVDNQLPLTPMPVLFRPQRVSETDYILKCSVTMQSN GSLDLCVYPYIGLHGPENSTAFLINIHEPIIWHLHEMIQKVKLSRLYDSQTTAASVDPIIQIGVLNISEVRFKVSMAMSP SQRPRGVLGFWASLMTALGNTENMPVRINQRFNENICMRQSSMISMAISNIRRDLLGQPLQLLSGVDILGNASSALGHMS KGVAALSMDKKFIQSRQRQESKGVEDFGDVIREGGGAFAKGLFRGVTGILTKPLEGAKTSGVEGFVQGVGKGIIGAAAQP VSGVLDLLSKTTEGANAMRMKIASAITSEEQLLRRRLPRVISGDNLLQLYDEYKAQGQVILQLAESGSFFGQVDLFKVRG KFALSDAYEDHFMLPKGKILMVTHRRVILLQQPSNIIAQRKFSPARDPCSILWDILWDDFGTMELTHGKKENPKAPPSRL ILYSQSRSLDVKENTRIIKCSPETHQALKVYSAIDHAVNTYGPGASKSLIY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Pfam | 2 | 114 | 113 | 1.3E-31 | ||
| Pfam | 139 | 383 | 245 | 7.3E-67 | ||
| Pfam | 578 | 805 | 228 | 1.6E-38 | ||
| PANTHER | 652 | 2056 | 1405 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 833 | 943 | 111 | 8.92 | ||
| SMART | 834 | 945 | 112 | 7.5E-6 | ||
| CDD | 837 | 938 | 102 | 0.00157873 | – | |
| Gene3D | 840 | 946 | 107 | 4.9E-7 | ||
| SUPERFAMILY | 847 | 945 | 99 | 3.76E-9 | – | |
| Pfam | 849 | 942 | 94 | 4.8E-6 | ||
| MobiDBLite | 1207 | 1228 | 22 | - | – | |
| Pfam | 2000 | 2170 | 171 | 2.5E-16 | ||
| Pfam | 2253 | 2393 | 141 | 2.3E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 2626 | 2752 | 127 | 1.87E-6 | – | |
| Gene3D | 2628 | 2769 | 142 | 2.8E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 2645 | 2748 | 104 | 9.776 | ||
| CDD | 2647 | 2751 | 105 | 1.166E-6 | – | |
| Pfam | 3269 | 3559 | 291 | 1.4E-14 | ||
| Pfam | 3823 | 3926 | 104 | 5.7E-7 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0334900.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…