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LotjaGi5g1v0244300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0244300
Transcript ID LotjaGi5g1v0244300.1
Related isoforms 8
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Histone-lysine N-methyltransferase; TAIR: AT4G02020.2 SET domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9ZSM8|EZA1_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase EZA1; TrEMBL-Plants: tr|K7LGU3|K7LGU3_SOYBN Histone-lysine N-methyltransferase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0244300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:55266538..55281091) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTCCTGCTTTGTCAGTCTTCTCGTACGAGATGTCATTATTACAGGAAAGTCTCCTCAAGTGAGAAGTTCTCATGTGAAAG TCAATCTCATCAAAGAGAGAACAACTCCATAATTGCAATGTCTCACTTTTTCCACCTTGATAGATTAGCACATCCAAGTT TGTCAAATTCTTTTGTAGAACAAGAACATAACATGCATCAATTGTTTGAAGTATTTAATGAGAGATTAAAAGACACAAAA AAGATAAAGATGTGACATGAAGAGGGTGCTTTTCAAAAAAGATAAATTGGAAGGAATAAGAAATGGTGGCCGTAGATAGT GGCGGAAAAGAACAACACGGACACAGCAGCTGAAATTACGTTCCGATGTAGTAGGCCATGTCAGATATTTACCAACAAAA ACCACCATTTACAGAGCGAGTGTGCGTTTTTCTCTCTCGTTCTTCTTCTTCCTCCTTTGATCAATTGACTCACTCTGATC CCTTCCATTTCCATGGTGTCCAAACCTACGGACTCTGCTCTCAAACTTCCTCGAGTTAGTCTCTCTCCCTCTTTCTTCCT CGAGTTTGATTATTACCTTTCTAGATTATTGAATTGAATCAGATAGTTCAGAATTCTCTGTAATGTTCTCTACTTGAAAC ACTACAACAGCTATTCAATTCACTAGTAGTAGGGCTTTTCGATCACCCTTTATCTTCAATTTCAACCTGTGTTTCGTTCA TGCTAATTCCTTTTCAAAAAGATACACTGTCAATATATAGTGCCAAGTGATTATTTGTTTTTTAAATGTATGTAACTCTG TGTTTTCTATGATAATATGATATTGACAGAAACAGCATGAAGAGCCAGAAAATTATGCTGTTGGTGTTGGGAACAACTTG TACACCAAGATAAATCAGCTGAAAAAGCAAATCCAGGAAGAGAGAATTGTATACGTTAAAGTAAGTTTGTAATTGGGTGT 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AAGATATTTACTTCTCGTGGTCGTATGTTGGTTTGTTTGTATTAGTGTGTGGAATCTAAGCACATATGATGAAGTCCAAT GAGATTGATCCGGATAGACGATCAAATAGGGTTTTACTTGATTAGCTAAGCTTCCGAACTCAAAAACAAGAAATGATCAT TCATTTCTAAATGACAAGAAATATGTAACTTACTATCTGTTAATATTTTGTTATTTCTTCAAAACATTTTTCCAAGTTTG GCAAAGCTCCTATAAAATGTATTTTCAAGTTAACTTGTGAACTGTTCTGTAGAATCATGTAACATCATTGTTGACAAATT GTGATTTAAATAATAATTTCTTATACCTGCAGTTGTTCAAAGAGCTGCAAAAACCGGTTCAGAGGATGCCATTGTGCCAA GAGTCAATGCAGAAGCCGACAATGTCCATGCTTTGCTGCTGGACGTGAATGTGACCCAGATGTCTGTCGAAATTGCTGGG TTAGGTAATGTGCCAAATATTTTCACTGTGAACTTGATTTTATGCCTGTAGACTTTTTTGGATTTACATTTCTCAACTAA ACCTTTCACAATTCCTGCACTGACCACAGAAACCTAAGTTACAACTTTGTGATAATATTATTTATGTATGGTTTTTTTTA ACTGATTTATTTATGGTTTATACAAGTATTATTGTTTCAGCAAATATTCACCGGTCCATATGACAGCTTCATGCATCAAA AGTTCAGCACACTATTTAAATATTAATATTTAGCAGCTATGCTTCAGAAAATTTATCAATTAAATAAATGCTTCAATGCG AGATGGTTGAAGATGACCTTTGGGTACTTTATTGTTATACCCCATTCCCATTAAGAATGAAAGAGGGATTAAACATGTAG GGTGCATTTGGCTGTGGTTCACATATGAGAAATGACAAACGGTGACCTTGTGCAATATCCATCTTGTCTGATATCAGTGT 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TTGCTATTTGCTAATAGTGAAAATAAGGAGTGCTATATATACATATACATGCACAATTACAGTTTCCTGGGACTTAAATT CAAGACAATTTCAAAATGAAATATGCTAGTAAGACTCACTTTAGCACTACTTTCCCAACACTTTCTTATTGATTGATTGA AATTTATGTAAGGTTCACTAAAAAACAAGTGAGTTAATGGGAAACCATTGAGGACAAGAAGTGCTTCAAAACCATACATT ATAAGCAGGCTAAGGCACACCAAAATCCAGACAAATGCAGCTTATATTTGAGGAAAGTATCAAGATCATGCTACAAGACC GAAATTAAAGAGAAGGTTACAACAGATTTCAATCAAACGCAGTTCAGATTTCTGCAAAGTATCAATTAGAAAACAGCCTC AACAATAGCATGCTTCTTTTTGGGGTATCCCATTCCAAGCATGTGGTTCAAGTACACCTTGCCATCTTTCACAGTTGCTG CTGTGGCCAAACGGTGCTTAGGCCCTGAGAATGTTGCCACAACAGAAGCTGTGTCCCACCCATCTGCACTCTCCACTAAT CTCCCTGAAGGGCTCCCAGCAACTACAAGCTTATTAGGAGACAACAGTTCTAAACCATCACCAAAATAAAGAGGCCCTCC TTCTACCTTTATTATCTTCACTTCCTCTCCTTTGGCTAAATCAATCTTGAACAAATTGCCGCTGAAAGTGTGGATCACTA TCAAAAACCCATCTGGGTGGTAAACGATGCCGTTTAGCCCAAAAAAGGTCTTGTACCACTCTTTTGGGGTGAAAAGTGGG TTTCTAATGATGGATAGAAGCTCTCCATCCACCCCAACTTTCCATATTTTACTGCCTTTTACATCAGTGACATAGGCATT GCCTTCTGCATCTACTGCAACATCGTCAGCAAAGGACTTCTCATCACCTGCAGGCGACGGAAAACCGACATTAATGAAAC 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TAATATTGCTTCACCAAGTTAGATATTTTTTATGAGATTAATTTCTATGCACCGACGGTGTAAAAAGTTTTACATCATTA TTCAATCACAACCTTTCATTTTTTATTTTAGATAGTATTAAATTCAAAATCAATTGTGAGCTAACAAAATGGAG 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0244300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTGTCCAAACCTACGGACTCTGCTCTCAAACTTCCTCGAAAACAGCATGAAGAGCCAGAAAATTATGCTGTTGGTGT TGGGAACAACTTGTACACCAAGATAAATCAGCTGAAAAAGCAAATCCAGGAAGAGAGAATTGTATACGTTAAAGAAAAAC TTCAAAAGAATGAGAAGATGCTAGAATGTCATATTTCAAGAGTCGTGTCAGCAATATCAACCAGGGACTCTTCACAGACG GAGGAAAATAGGACACATTCACTTCTTTCCTCCAGGATCGGCCATCCTTTATGTAAACTTAATGGTTTCTCTCAGGCTTC AGGGGACAAAGACTATAACAATCAAGATGTATCATCTGCTACAAGCATCAAGATTCCACATATTGAAAGATTACCACCAT ATACATCTTGGATATTTTTGGACAAAAATCAGAGAATGGCTGAAGATCAGTCAGTTGTTGGAAGAAGACGTATCTACTAT GATCAACATGGAAGTGAAGCACTGATATGTAGTGACAGTGAGGAAGAGTTAACAGAACCTGAGGAAGAAAAACATGAATT TTCTGAGGCTGAAGACCGTGCTATATGGATGGCATTTGAGGAACATGGAATAAATGAGGAGGTATTGAATATTGTTAGCA AGTTTGTTGGGGGCACCAGTTTAGAAATTCAGGAGAGGTACAAAAGTATCAAGGAAAATAACAATGGTAGGTTAGGCCGT CATTCAGAAGGCTCAGGAGAATACAAATCTCATATTGGCATATGTCCAGAGAAAAGTTTGAGTGCTGCATTAGATTCTTT CGATAACCTTTTCTGTCGCCGGTGCCTGATTTTTGACTGTCGCCTGCATGGATGTTCTCAACCTTTAATATATCCTACAG TTTTGCCTGGGCCTGAAGGTGACAGGAAACCATGCAGTGATCAGTGTTACCTTCAGTTAAAGGTTATCAAAAGTGTGTCG GGAGATTCAACTCGTGAGTCTTTTCAGGATAAAAAAACTACAATTATAGAAGAGGCTGACGGGATATTGGCACCCTCCAG TGCAGGGGAACTTGGTAATCAGGGTGCTACACTTCCGACAGAAATGGCTGGTCATGAAAATCTCAATTTGAATGTTCCTG TCTCAGAAAATTTGGGGAAACGGAAGGTCACAAATCAATCAGATACAGCACTATGTGACTCCTCTATATTACCTCCTGAT GATTCTCACAATTCTTGTAAAAAGCTGAAGAGAATCTCCGATGATACAGTCACTGCAATAAGTGATAATAACGAGAACCT TAATTTGGACGCATGTGGTGAAAGTAAACATGGAGTTTCGGGAAAATCTGTAGAACATCCTTCAAATAAATTAATATTTT CTTCTAGCACTTGCCATGGTGAGCATGATGAGAGTGTCAAGGATGGACCAAAAGATGTCACAAATGAGACAGAATTTAAT AAGTTGTTCAATTCAATGGGAGGGCAAGTTGATGGGATGCTAAGTCTCTCGGACTGGAAACCTCTGGAGAAAGACTTATA CTTGAAGGGAGTAGAAATGTTCGGAAGAAACAGTTGTCTCATAGCAAGGAACTTGCTTTCTGGTTTGAAGACTTGTATGG AAATAGCTAGTTACATGCATGCTGGAGGAGTGTTGATGCCCTACGGGTCTTTTGCTGCATCTAGTTCAATCATGGACGAC AAGGGAAAATTTGATGCAGAGTGCCAAGACCAAGACATATCATCTAGGTCACGGACGCTGCTGAGAAAGAGGGGCAAAAC AAGAAAGTTTAAATATTCTTGGAAGTCTGCTGGCCATCCATCAATATGGAAAAGGATTGCTGATGGAAAGAACCAATCTT GCCAGCAGTATACACCATGTGGATGTCAGTCAATGTGTGGAAAGGATTGTTCTTGTATGAATGGTGGAACTTGCTGCGAA AAATATTGTGGTTGTTCAAAGAGCTGCAAAAACCGGTTCAGAGGATGCCATTGTGCCAAGAGTCAATGCAGAAGCCGACA ATGTCCATGCTTTGCTGCTGGACGTGAATGTGACCCAGATGTCTGTCGAAATTGCTGGGTTAGCTGCGGGGATGGTTCGC TAGGGGAGCCACCTCGGCATGGAGAAGGTCAATGCGGCAATATGAGGCTTCTGTTAAGGCAACAACAGAGGATTCTCTTG GCAAAGTCTGATATTGCTGGATGGGGAGCCTTCTTGAAGAACCCTGTTAACAAAAATGATTACCTAGGAGAGTACACTGG TGAACTGATCTCCCACCGAGAAGCTGATAAACGTGGGAAAATATATGATCGTGCGAATTCATCTTTCCTTTTTGACTTAA ATGATCAGGCATGTGTCTCATTGTCTCAGCATGGTCTACTTTTACTTTTTTCTCTTAACATCGGCTACTCTGGCTTTTCT CAAATTGCTGTGAGCTTCCTTGTAATTTATAAGTGTGTCATCATATATTGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0244300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVSKPTDSALKLPRKQHEEPENYAVGVGNNLYTKINQLKKQIQEERIVYVKEKLQKNEKMLECHISRVVSAISTRDSSQT EENRTHSLLSSRIGHPLCKLNGFSQASGDKDYNNQDVSSATSIKIPHIERLPPYTSWIFLDKNQRMAEDQSVVGRRRIYY DQHGSEALICSDSEEELTEPEEEKHEFSEAEDRAIWMAFEEHGINEEVLNIVSKFVGGTSLEIQERYKSIKENNNGRLGR HSEGSGEYKSHIGICPEKSLSAALDSFDNLFCRRCLIFDCRLHGCSQPLIYPTVLPGPEGDRKPCSDQCYLQLKVIKSVS GDSTRESFQDKKTTIIEEADGILAPSSAGELGNQGATLPTEMAGHENLNLNVPVSENLGKRKVTNQSDTALCDSSILPPD DSHNSCKKLKRISDDTVTAISDNNENLNLDACGESKHGVSGKSVEHPSNKLIFSSSTCHGEHDESVKDGPKDVTNETEFN KLFNSMGGQVDGMLSLSDWKPLEKDLYLKGVEMFGRNSCLIARNLLSGLKTCMEIASYMHAGGVLMPYGSFAASSSIMDD KGKFDAECQDQDISSRSRTLLRKRGKTRKFKYSWKSAGHPSIWKRIADGKNQSCQQYTPCGCQSMCGKDCSCMNGGTCCE KYCGCSKSCKNRFRGCHCAKSQCRSRQCPCFAAGRECDPDVCRNCWVSCGDGSLGEPPRHGEGQCGNMRLLLRQQQRILL AKSDIAGWGAFLKNPVNKNDYLGEYTGELISHREADKRGKIYDRANSSFLFDLNDQACVSLSQHGLLLLFSLNIGYSGFS QIAVSFLVIYKCVIIY 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 785 785 -
ProSiteProfiles 1 798 798 207.466
MobiDBLite 1 20 20 -
PANTHER 33 777 745 9.4E-224
PANTHER 33 777 745 9.4E-224
Coils 35 55 21 -
MobiDBLite 454 473 20 -
SUPERFAMILY 587 780 194 2.45E-28
ProSiteProfiles 603 702 100 21.924
Gene3D 617 791 175 7.8E-40
SMART 651 688 38 2.5E-11
Pfam 655 686 32 1.7E-9
Phobius 786 810 25 -
TMHMM 788 810 23 -
Phobius 811 816 6 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component PcG protein complex A chromatin-associated multiprotein complex containing Polycomb Group proteins. In Drosophila, Polycomb group proteins are involved in the long-term maintenance of gene repression, and PcG protein complexes associate with Polycomb group response elements (PREs) in target genes to regulate higher-order chromatin structure.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0244300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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