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LotjaGi5g1v0261000.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0261000
Transcript ID LotjaGi5g1v0261000.3
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT4G03080.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 1; Swiss-Prot: sp|Q8L7U5|BSL1_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL1; TrEMBL-Plants: tr|I1JFE9|I1JFE9_SOYBN Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0261000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56964341..56980263) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGGGTCGAAACCGTGGCTGCATCCTGCTCCTCCTTACCGACCACTTGAATCGCACTGGGACACCGATGAAGACGATCC TGGTCCTCGCTGTGGTCACACGCTCACTGCTGTAGCCGCCACCAAGTCGCGCGGTCCGCGCTTAATCCTCTTCGGCGGCG CCACCGCCATTGAAGGAGGATCTACTTCAGCTCCCGGCATTCGTACTTGCCTCTTCTCTCTCCCTTGAAATTCTCTCATT TTCTGTCAGTTTTCAACTGAAAGTCTCTTCTTCTGGTTTGCAGGATTGGCTGGAGTAACGAATTCCGTGCATTCTTATGA TGTTCAAACGAAGAAATGGACTCGGTTAGTTGATTTAAGCTTGCCCAGTTGTTGAATGTTTCTAATTTAGTTGATTTATG GTTCATTGTTGTAGAAAAGTTAAATTGAGTCTGTTGGGTGATTGAATTGCTACTCAAGTAATGATCTTTGGTTTATGGTT GTTTGTTCAGTCTTAAACCGGCCGGAGAGCCGCCGTCTCCTCGGGCTGCCCATGCTGCCGCGGCAGTTGGTACCATGGTC GTTTTTCAGGTGATTTTGGGTTAGGACTGAGATTTCATTTGATTGGGTTGATGGTGTAAGAGTTAGGACTTGACATTTGT TTTATTTTGTTTCGCTTGGCTAGGGTGGGATTGGTCCTGCTGGACATTCGACTGATGATATCTATGTGCTGGACTTGACC AATGACAAATACAAATGGCACAGGTGAGCTTGGTTGCAATTGACCAAGCTATTTTACTTTTTCCTACCAATTGCAATTTG ACAAAATTATGGGGTTAGTCAATGTTGCAATTAATTCGATTGTAGAGTCGTTGTACAAGGGATAGGACCGGGGCCTCGCT ACGGACATGTAATGGACTTGGTTGCTCAGAGATATCTCGTCACTGTCAGTGGAAATGATGGTGAGAGAAATTTATTTCCT 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ATTTGGTATGTTATTTAGGAACTGCAAACAATGCGGGAGCTATACTGGTAATTGGTAGGGGTTTGGTTGTGGTTCCAAAG TTGATTCATCCTATACCACCTCCCCTTCAGTCACCTGAAACATCTCCAGAGCGTGTGATGGATGAGACATGGATGCAGGT GAGCTTAATATTTTGTTTGTTCTGACTTAATAGCATGTTTGGATCAGCTTGTTTTTCCGCGGAATCAATTTGGTTGCTCA AAAGCTTCAGTGTTTGTAAATTCTTCTAGAATTGATTTTGGGAGAAGTTTCTGGGTGACATTATTGATTTTGAGGAAAAA GAAGCTAATCTAAACATGCTATGCTTTTCCCCAAAATTGATTTTGGCTTTAGAACCAACCGTAAAATGATTTCCAATCAT GCACTTATTCTAGGAGCTTAATGTTTTGCTGGTTATTATTCTAGGAGCATAATATTTTGTTTGTTCTTACTTATTATAGG AACTTAATATTCAGAGGCCGCCAACTCCTACTAGGGGTCGACCACAGCCTGACCTTGATCGTGGCTCTCTAGCATATATA TGA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0261000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGTCGAAACCGTGGCTGCATCCTGCTCCTCCTTACCGACCACTTGAATCGCACTGGGACACCGATGAAGACGATCC TGGTCCTCGCTGTGGTCACACGCTCACTGCTGTAGCCGCCACCAAGTCGCGCGGTCCGCGCTTAATCCTCTTCGGCGGCG CCACCGCCATTGAAGGAGGATCTACTTCAGCTCCCGGCATTCGATTGGCTGGAGTAACGAATTCCGTGCATTCTTATGAT GTTCAAACGAAGAAATGGACTCGTCTTAAACCGGCCGGAGAGCCGCCGTCTCCTCGGGCTGCCCATGCTGCCGCGGCAGT TGGTACCATGGTCGTTTTTCAGGGTGGGATTGGTCCTGCTGGACATTCGACTGATGATATCTATGTGCTGGACTTGACCA ATGACAAATACAAATGGCACAGAGTCGTTGTACAAGGGATAGGACCGGGGCCTCGCTACGGACATGTAATGGACTTGGTT GCTCAGAGATATCTCGTCACTGTCAGTGGAAATGATGGAAAACGAGTTGTATCTGATGCTTGGGCTTTAGATACTGCTCA AAAACCTTACGCGTGGCAGAGGCTGAACCCAGAGGGTGATAGACCTTCTGCTAGAATGTACGCAACTGCTAGTGCCCGCT CAGATGGGATGTTTTTACTATGTGGTGGAAGAGACGCTTCGGGAACTCCACTAGCAGATGCCTATGGACTACTCATGCAT AGGAACGGGCAGTGGGAATGGACCCTTGCACCTGGAGTTTCCCCTTCACCGAGATATCAGCATGCCTCGGTTTTTGTTGG TGCACGATTACATGTTACAGGAGGTGTTCTCAGGGGTGGGCGATCTGTGGAAGGAGAAGCATCTGTTGCAGTATTGGACA CTGCTGCTGGGGTTTGGTTGGACAGAAATGGCATTGTGTCCTCCTCCCGCTCAAACAAAGGTCATGATCATGACCCTGCT TTGGAGCTTATGCGTCGTTGCCGCCATGCAGCAGCAGCTGTTGGTGTTCAAATCTATATCCACGGCGGTCTTAGAGGAGA TACACTACTAGATGATTTCTTAGTGGCTGAAAATTCGCCATTTCAGCCTGACAATTCTCATGCGTTAACAGCTGAGAGAA CATCACCTCTTACAAGTCCCAAATACAATCAGTCTAACTTCAGCTTGGATGGTACACAAGACGGACCCTCGTCTGGCGGC TCAGGTTTGATATGTGTTCATTTTACCAGGATGGACAAACATTCGATGGAGAAACTGAGGGAGGCATCAGCTGCTGAAGC TGAGGCAGCGAGTGCGGTCTGGCAAGCTGTGCAAGCTATATCTGCGGAAGAAACTTCTGTGTCAGATGACAACTCACAAG CTGCAGAAACCGTTTCAGATGGAAGCGATACAGAGGGAGATGTTCACCTTCATCCTAGAGCTGTTGTAGTTGCGAAAGAA ACTGTAGGTAACCTAGGTGGAATGGTGAGACAATTGTCTCTGGATCAATTTGAAAATGAAAGCAGACGCATGGTTCCCAT AATTTCGACTTTGCTCAGGCCTCGCAACTGGAAAGCTCCTGTTAACAGACGGTTCTTCTTGGATTCGTATGAAGTGGGTG AGCTTTGCTATGCTGCTGAGCAAATATTTATGCAGGAACAAACTGTTCTTCAGCTAAAAGCTCCAGTCAAAGTATTTGGT GATCTTCATGGTCAGTTTGGTGATTTGATGCGGCTATTTGATGAATATGGATTTCCTTCAACTGCTGGAGACATCACGTA TATTGATTACTTGTTTTTGGGAGATTATGTTGATCGAGGACAGCACAGCTTGGAAACCATTACCTTGCTACTTGCTCTTA AGATCGAATATCCTGAGAATGTTCATTTGATACGTGGAAACCATGAAGCTGCTGACATAAATGCACTATTTGGTTTTCGC ATAGAGTGCATTGAGAGAATGGGAGAAAATGATGGAATATGGGCATGGACGCGATTCAATCAACTTTTTAACTTTCTTCC ACTAGCTGCTCTTATTGAAAAGAAAATTATCTGTATGCATGGTGGGATTGGAAGATCTATCAATTCGGTAGAACAGATAG AGAAGCTTGAGAGGCCCATAACAATGGATGCAGGATCCATCATTTTAATGGACCTTTTGTGGTCTGATCCCACAGAAAAT GATAGTGTAGAGGGTTTGAGACCAAATGCTAGAGGGCCAGGGCTTGTCACTTTTGGGCCTGATCGTGTCACAGACTTCTG TAAGAGAAATAAATTACAGCTCATAATAAGGGCCCATGAATGCGTCATGGATGGTTTTGAGCGATTTGCCCAGGGACAAT TAATCACCCTTTTTTCCGCAACTAACTATTGCGGAACTGCAAACAATGCGGGAGCTATACTGGTAATTGGTAGGGGTTTG GTTGTGGTTCCAAAGTTGATTCATCCTATACCACCTCCCCTTCAGTCACCTGAAACATCTCCAGAGCGTGAACTTAATAT TCAGAGGCCGCCAACTCCTACTAGGGGTCGACCACAGCCTGACCTTGATCGTGGCTCTCTAGCATATATATGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0261000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGSKPWLHPAPPYRPLESHWDTDEDDPGPRCGHTLTAVAATKSRGPRLILFGGATAIEGGSTSAPGIRLAGVTNSVHSYD VQTKKWTRLKPAGEPPSPRAAHAAAAVGTMVVFQGGIGPAGHSTDDIYVLDLTNDKYKWHRVVVQGIGPGPRYGHVMDLV AQRYLVTVSGNDGKRVVSDAWALDTAQKPYAWQRLNPEGDRPSARMYATASARSDGMFLLCGGRDASGTPLADAYGLLMH RNGQWEWTLAPGVSPSPRYQHASVFVGARLHVTGGVLRGGRSVEGEASVAVLDTAAGVWLDRNGIVSSSRSNKGHDHDPA LELMRRCRHAAAAVGVQIYIHGGLRGDTLLDDFLVAENSPFQPDNSHALTAERTSPLTSPKYNQSNFSLDGTQDGPSSGG SGLICVHFTRMDKHSMEKLREASAAEAEAASAVWQAVQAISAEETSVSDDNSQAAETVSDGSDTEGDVHLHPRAVVVAKE TVGNLGGMVRQLSLDQFENESRRMVPIISTLLRPRNWKAPVNRRFFLDSYEVGELCYAAEQIFMQEQTVLQLKAPVKVFG DLHGQFGDLMRLFDEYGFPSTAGDITYIDYLFLGDYVDRGQHSLETITLLLALKIEYPENVHLIRGNHEAADINALFGFR IECIERMGENDGIWAWTRFNQLFNFLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINSVEQIEKLERPITMDAGSIILMDLLWSDPTEN DSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVTDFCKRNKLQLIIRAHECVMDGFERFAQGQLITLFSATNYCGTANNAGAILVIGRGL VVVPKLIHPIPPPLQSPETSPERELNIQRPPTPTRGRPQPDLDRGSLAYI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PIRSF 1 850 850 0.0
PANTHER 1 850 850 0.0
MobiDBLite 1 29 29 -
PANTHER 1 850 850 0.0
Gene3D 12 154 143 6.1E-13
Pfam 29 95 67 1.5E-7
SUPERFAMILY 71 357 287 2.09E-36
Pfam 96 134 39 2.2E-6
Gene3D 155 392 238 5.6E-15
MobiDBLite 361 398 38 -
MobiDBLite 444 460 17 -
MobiDBLite 444 469 26 -
Gene3D 488 822 335 1.4E-110
SUPERFAMILY 505 819 315 1.61E-96
CDD 507 809 303 0.0
SMART 527 811 285 5.5E-111
PRINTS 555 582 28 1.2E-61
Pfam 555 762 208 1.0E-33
PRINTS 590 617 28 1.2E-61
PRINTS 623 647 25 1.2E-61
ProSitePatterns 624 629 6 -
PRINTS 661 687 27 1.2E-61
PRINTS 691 718 28 1.2E-61
PRINTS 751 771 21 1.2E-61
PRINTS 773 789 17 1.2E-61
MobiDBLite 812 850 39 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphoprotein phosphatase activity Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Brassinosteroid mediated signaling pathway A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid.
Molecular function Hydrolase activity Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0261000.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…