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LotjaGi5g1v0261000.5

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0261000
Transcript ID LotjaGi5g1v0261000.5
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT4G03080.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 1; Swiss-Prot: sp|Q8L7U5|BSL1_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL1; TrEMBL-Plants: tr|I1JFE9|I1JFE9_SOYBN Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0261000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56964341..56980263) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGGGTCGAAACCGTGGCTGCATCCTGCTCCTCCTTACCGACCACTTGAATCGCACTGGGACACCGATGAAGACGATCC TGGTCCTCGCTGTGGTCACACGCTCACTGCTGTAGCCGCCACCAAGTCGCGCGGTCCGCGCTTAATCCTCTTCGGCGGCG CCACCGCCATTGAAGGAGGATCTACTTCAGCTCCCGGCATTCGTACTTGCCTCTTCTCTCTCCCTTGAAATTCTCTCATT TTCTGTCAGTTTTCAACTGAAAGTCTCTTCTTCTGGTTTGCAGGATTGGCTGGAGTAACGAATTCCGTGCATTCTTATGA TGTTCAAACGAAGAAATGGACTCGGTTAGTTGATTTAAGCTTGCCCAGTTGTTGAATGTTTCTAATTTAGTTGATTTATG GTTCATTGTTGTAGAAAAGTTAAATTGAGTCTGTTGGGTGATTGAATTGCTACTCAAGTAATGATCTTTGGTTTATGGTT GTTTGTTCAGTCTTAAACCGGCCGGAGAGCCGCCGTCTCCTCGGGCTGCCCATGCTGCCGCGGCAGTTGGTACCATGGTC GTTTTTCAGGTGATTTTGGGTTAGGACTGAGATTTCATTTGATTGGGTTGATGGTGTAAGAGTTAGGACTTGACATTTGT TTTATTTTGTTTCGCTTGGCTAGGGTGGGATTGGTCCTGCTGGACATTCGACTGATGATATCTATGTGCTGGACTTGACC AATGACAAATACAAATGGCACAGGTGAGCTTGGTTGCAATTGACCAAGCTATTTTACTTTTTCCTACCAATTGCAATTTG ACAAAATTATGGGGTTAGTCAATGTTGCAATTAATTCGATTGTAGAGTCGTTGTACAAGGGATAGGACCGGGGCCTCGCT ACGGACATGTAATGGACTTGGTTGCTCAGAGATATCTCGTCACTGTCAGTGGAAATGATGGTGAGAGAAATTTATTTCCT 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ATTTGGTATGTTATTTAGGAACTGCAAACAATGCGGGAGCTATACTGGTAATTGGTAGGGGTTTGGTTGTGGTTCCAAAG TTGATTCATCCTATACCACCTCCCCTTCAGTCACCTGAAACATCTCCAGAGCGTGTGATGGATGAGACATGGATGCAGGT GAGCTTAATATTTTGTTTGTTCTGACTTAATAGCATGTTTGGATCAGCTTGTTTTTCCGCGGAATCAATTTGGTTGCTCA AAAGCTTCAGTGTTTGTAAATTCTTCTAGAATTGATTTTGGGAGAAGTTTCTGGGTGACATTATTGATTTTGAGGAAAAA GAAGCTAATCTAAACATGCTATGCTTTTCCCCAAAATTGATTTTGGCTTTAGAACCAACCGTAAAATGATTTCCAATCAT GCACTTATTCTAGGAGCTTAATGTTTTGCTGGTTATTATTCTAGGAGCATAATATTTTGTTTGTTCTTACTTATTATAGG AACTTAATATTCAGAGGCCGCCAACTCCTACTAGGGGTCGACCACAGCCTGACCTTGATCGTGGCTCTCTAGCATATATA TGA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0261000.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGTCGAAACCGTGGCTGCATCCTGCTCCTCCTTACCGACCACTTGAATCGCACTGGGACACCGATGAAGACGATCC TGGTCCTCGCTGTGGTCACACGCTCACTGCTGTAGCCGCCACCAAGTCGCGCGGTCCGCGCTTAATCCTCTTCGGCGGCG CCACCGCCATTGAAGGAGGATCTACTTCAGCTCCCGGCATTCGATTGGCTGGAGTAACGAATTCCGTGCATTCTTATGAT GTTCAAACGAAGAAATGGACTCGTCTTAAACCGGCCGGAGAGCCGCCGTCTCCTCGGGCTGCCCATGCTGCCGCGGCAGT TGGTACCATGGTCGTTTTTCAGGGTGGGATTGGTCCTGCTGGACATTCGACTGATGATATCTATGTGCTGGACTTGACCA ATGACAAATACAAATGGCACAGAGTCGTTGTACAAGGGATAGGACCGGGGCCTCGCTACGGACATGTAATGGACTTGGTT GCTCAGAGATATCTCGTCACTGTCAGTGGAAATGATGGAAAACGAGTTGTATCTGATGCTTGGGCTTTAGATACTGCTCA AAAACCTTACGCGTGGCAGAGGCTGAACCCAGAGGGTGATAGACCTTCTGCTAGAATGTACGCAACTGCTAGTGCCCGCT CAGATGGGATGTTTTTACTATGTGGTGGAAGAGACGCTTCGGGAACTCCACTAGCAGATGCCTATGGACTACTCATGCAT AGGAACGGGCAGTGGGAATGGACCCTTGCACCTGGAGTTTCCCCTTCACCGAGATATCAGCATGCCTCGGTTTTTGTTGG TGCACGATTACATGTTACAGGAGGTGTTCTCAGGGGTGGGCGATCTGTGGAAGGAGAAGCATCTGTTGCAGTATTGGACA CTGCTGCTGGGGTTTGGTTGGACAGAAATGGCATTGTGTCCTCCTCCCGCTCAAACAAAGGTCATGATCATGACCCTGCT TTGGAGCTTATGCGTCGTTGCCGCCATGCAGCAGCAGCTGTTGGTGTTCAAATCTATATCCACGGCGGTCTTAGAGGAGA TACACTACTAGATGATTTCTTAGTGGCTGAAAATTCGCCATTTCAGCCTGACAATTCTCATGCGTTAACAGCTGAGAGAA CATCACCTCTTACAAGTCCCAAATACAATCAGTCTAACTTCAGCTTGGATGGTACACAAGACGGACCCTCGTCTGGCGGC TCAGGGATGGACAAACATTCGATGGAGAAACTGAGGGAGGCATCAGCTGCTGAAGCTGAGGCAGCGAGTGCGGTCTGGCA AGCTGTGCAAGCTATATCTGCGGAAGAAACTTCTGTGTCAGATGACAACTCACAAGCTGCAGAAACCGTTTCAGATGGAA GCGATACAGAGGGAGATGTTCACCTTCATCCTAGAGCTGTTGTAGTTGCGAAAGAAACTGTAGGTAACCTAGGTGGAATG GTGAGACAATTGTCTCTGGATCAATTTGAAAATGAAAGCAGACGCATGGTTCCCATGAATAATGATTCGCCTTATCCTAC GAAAAAATTCACCAGGCAGAAATCCCCTCAGGGTTTGCATAAAAAGATAATTTCGACTTTGCTCAGGCCTCGCAACTGGA AAGCTCCTGTTAACAGACGGTTCTTCTTGGATTCGTATGAAGTGGGTGAGCTTTGCTATGCTGCTGAGCAAATATTTATG CAGGAACAAACTGTTCTTCAGCTAAAAGCTCCAGTCAAAGTATTTGGTGATCTTCATGGTCAGTTTGGTGATTTGATGCG GCTATTTGATGAATATGGATTTCCTTCAACTGCTGGAGACATCACGTATATTGATTACTTGTTTTTGGGAGATTATGTTG ATCGAGGACAGCACAGCTTGGAAACCATTACCTTGCTACTTGCTCTTAAGATCGAATATCCTGAGAATGTTCATTTGATA CGTGGAAACCATGAAGCTGCTGACATAAATGCACTATTTGGTTTTCGCATAGAGTGCATTGAGAGAATGGGAGAAAATGA TGGAATATGGGCATGGACGCGATTCAATCAACTTTTTAACTTTCTTCCACTAGCTGCTCTTATTGAAAAGAAAATTATCT GTATGCATGGTGGGATTGGAAGATCTATCAATTCGGTAGAACAGATAGAGAAGCTTGAGAGGCCCATAACAATGGATGCA GGATCCATCATTTTAATGGACCTTTTGTGGTCTGATCCCACAGAAAATGATAGTGTAGAGGGTTTGAGACCAAATGCTAG AGGGCCAGGGCTTGTCACTTTTGGGCCTGATCGTGTCACAGACTTCTGTAAGAGAAATAAATTACAGCTCATAATAAGGG CCCATGAATGCGTCATGGATGGTTTTGAGCGATTTGCCCAGGGACAATTAATCACCCTTTTTTCCGCAACTAACTATTGC GGAACTGCAAACAATGCGGGAGCTATACTGGTAATTGGTAGGGGTTTGGTTGTGGTTCCAAAGTTGATTCATCCTATACC ACCTCCCCTTCAGTCACCTGAAACATCTCCAGAGCGTGTGATGGATGAGACATGGATGCAGGAACTTAATATTCAGAGGC CGCCAACTCCTACTAGGGGTCGACCACAGCCTGACCTTGATCGTGGCTCTCTAGCATATATATGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0261000.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGSKPWLHPAPPYRPLESHWDTDEDDPGPRCGHTLTAVAATKSRGPRLILFGGATAIEGGSTSAPGIRLAGVTNSVHSYD VQTKKWTRLKPAGEPPSPRAAHAAAAVGTMVVFQGGIGPAGHSTDDIYVLDLTNDKYKWHRVVVQGIGPGPRYGHVMDLV AQRYLVTVSGNDGKRVVSDAWALDTAQKPYAWQRLNPEGDRPSARMYATASARSDGMFLLCGGRDASGTPLADAYGLLMH RNGQWEWTLAPGVSPSPRYQHASVFVGARLHVTGGVLRGGRSVEGEASVAVLDTAAGVWLDRNGIVSSSRSNKGHDHDPA LELMRRCRHAAAAVGVQIYIHGGLRGDTLLDDFLVAENSPFQPDNSHALTAERTSPLTSPKYNQSNFSLDGTQDGPSSGG SGMDKHSMEKLREASAAEAEAASAVWQAVQAISAEETSVSDDNSQAAETVSDGSDTEGDVHLHPRAVVVAKETVGNLGGM VRQLSLDQFENESRRMVPMNNDSPYPTKKFTRQKSPQGLHKKIISTLLRPRNWKAPVNRRFFLDSYEVGELCYAAEQIFM QEQTVLQLKAPVKVFGDLHGQFGDLMRLFDEYGFPSTAGDITYIDYLFLGDYVDRGQHSLETITLLLALKIEYPENVHLI RGNHEAADINALFGFRIECIERMGENDGIWAWTRFNQLFNFLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINSVEQIEKLERPITMDA GSIILMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVTDFCKRNKLQLIIRAHECVMDGFERFAQGQLITLFSATNYC GTANNAGAILVIGRGLVVVPKLIHPIPPPLQSPETSPERVMDETWMQELNIQRPPTPTRGRPQPDLDRGSLAYI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PIRSF 1 874 874 0.0
MobiDBLite 1 29 29 -
PANTHER 1 874 874 0.0
PANTHER 1 874 874 0.0
Gene3D 12 154 143 6.5E-13
Pfam 29 95 67 1.5E-7
SUPERFAMILY 70 356 287 1.7E-36
Pfam 96 134 39 2.2E-6
Gene3D 155 392 238 7.4E-15
MobiDBLite 361 416 56 -
MobiDBLite 361 400 40 -
MobiDBLite 435 452 18 -
MobiDBLite 435 461 27 -
Gene3D 496 849 354 1.3E-110
CDD 523 825 303 0.0
SUPERFAMILY 524 835 312 1.81E-96
SMART 543 827 285 5.5E-111
Pfam 571 778 208 1.1E-33
PRINTS 571 598 28 1.4E-61
PRINTS 606 633 28 1.4E-61
PRINTS 639 663 25 1.4E-61
ProSitePatterns 640 645 6 -
PRINTS 677 703 27 1.4E-61
PRINTS 707 734 28 1.4E-61
PRINTS 767 787 21 1.4E-61
PRINTS 789 805 17 1.4E-61
MobiDBLite 849 874 26 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphoprotein phosphatase activity Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Brassinosteroid mediated signaling pathway A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid.
Molecular function Hydrolase activity Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0261000.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…