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LotjaGi6g1v0241000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0241000
Transcript ID LotjaGi6g1v0241000.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like kinase; TAIR: AT1G34300.1 lectin protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9XID3|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300; TrEMBL-Plants: tr|K7LBZ3|K7LBZ3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0241000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:55255088..55281396) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GATTGCAGTTGGGACAGCAAGAGGCATGGCTTACTTGCATGAAGAATGCCAGCAAAGGATAATCCACTATGACATAAAGC CAGGAAACATTCTCTTGGACAAGAACTTCAATCCTAAAGTTGCTGATTTTGGTTTAGCCAAGCTTTGCAACAGGGACAAT ACTCACATCACCATGACCGGAGGAAGGGGGACTCCAGGTTACGCTGCTCCTGAGCTTTGGATGCCCTTTTCTGTAACTCA TAAGTGCGATGTTTATAGCTTTGGTATGCTGTTATTTGAAATTATAGGTAGGAGAAGAAACCATGATGCTAAACTTTCTG AGAGCCAGGAGTGGTTTCCAATGTGGGCTTGGAAAAAATTTGATGCTGGAGAACTTGGGGAGTTAATGATAGTGTATGGG ATTGAGGAGCAAAATAAGGAGATAGCAGAAAGAATGGTTAAGCTAGCTCTGTTGTGTGTTCAATATAGGCCAGAATCAAG GCCTATACTGAGTGTTGTGGTGAAAATGTTGGAAGGTTCAGATGAAATTCCCAAGCCTTTGAACCCGTTTCAGCACTTGA TGGATGGGACTTTGGCTGCTAATGCAGTTCAAGTGTCACCATTTCATACAACAACCGTTTCTTCCAGCTCTTCTGTTTTG GCAAGTGACACCAGCATCATATTCGCTACTCCTGTTATGAGGAAGTATGAGATTGAATTAGCCACTAGCAGGTGATGGAA GGTTTCATTAGGGTTCTATAAGTTGGAAAATATAGTCCCTGTACTAGTCTTCTATTTATAATATAGTAATTGAGAAGCGC GCAACCTAACGCCGCCACGTCAGCGATTTTACTTCTAACAAAAGTACCTACATCAGCAATTTTGATGACGTGTCACGTTG TAGCTTCTAAAGCATAGAAAACCCAACTAGAGACCCATCCCAGCCACAGAATAGAACGACATCACGGATTCAGCAAAAGA 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TGTCATGTGTTCAGTATAGGCCAGAAGTAAGGCCTATGATGAGTGTTGTGGTGAAAATGTTAGAAGGTTCAGATGAAATT CCAAAGCCTTTGAATCCATTTCAGTACTTGATGAATGGGGGGAGTTTGGGTGCTCATCCAGTCCAAGTGTCACAGACTTA TACAACAACTATTTCTTCAGGGTCTTCTGTTTTGGTAAGCGACACCAACATCCTATGCGCTACTCCTGTTATGAGCAAGT ATGAGATTGAATTAGCTACTAGCAAGTGATGGAAGGTTGCCATTTAGGTTCAATAAGTTGTAAAATATTTTCCGTGGTAC TAGTTTGATTTTATATGCCTGTAAATGTTCGTATATACCACCTATTTGCTGCTCTTTTGGCTCTAAACACATTATGCAGA GTATAAAGTTTATAAACCTAAAGTGGATCTCATGGTTCCTATAAATTATAATAAGCAAGAGTTGGTAAAGACAGTTAATC TGGGTCCTCTTCCTCTCAAGCCTTTTGGGGATGAGGGATCTTACTTAGCATAACAAACGATAATGGATGGCCTATAAAAG AGAGGAGGACTACTAACACTCACTTTGAAGCTCTTATTCTAAAAAAAAAATTAATTGGTTAAAGTTCATGTAGGTCTCAC CACATTAAGTGGACACATATTATTTAGTGAACCCTACATGAATTTCAACCACTAAAATAAAAAAGAGCGTTGAAAAGAGA GTGTCAAATGAGTTTTGCTAGTATTTTTCAAATTTTAGATGTGACAAACATAGTAGTCTTTCACCAGAGAAAAACATATT AGTCACAATTCTTGAACTGTTTATGCGATATATAGTCATAATCATGAATCAAATTTAATTTATATAAATATATACAATGT AACAGAATTGTAAAGTTAGTTAAGCTAATTGTTAAGCTGTTACAACAGCTTAACCGCTTACCGGACCTATCTCTTGTATA 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AGGAGGTTTTGGAGCAGTTTACAAGGGTGTTTTTAGCAATGGGATCACGGTAGCTGTGAAGGTTTTACGTGGGAGTTCAG AAGACAAGAATGTTGAGGAGCAGTTCATGGCAGAAGTGGGTACAATTGGTCGAGTTCATCATTTCAACCTTGTTCGGCTA TATGGATTTTGCTTTGAAAGAAACTTGATAGCACTGGTTTATGAGTACATGGAAAATGGCTCTCTTGACAGGTTTCTGTT TCAGGAAAATACGATCTTAGGATATGAAAAGCTTCATGAGATTGCAGTTGGGACAGCAAGAGGAATTGCTTACTTGCATG AAGAGTGCCAGCAAAGGATAATCCACTATGACATAAAGCCAGCAAACATTCTCTTGGACAAGAACTTCAATCCTAAAATT GCTGATTTTGGTTTGGCCAAGCTTTGCAACAAGGAAAATACTCACATAACCATGACTGGTGGGAGGGGTACTCCTGGTTA TGCTGCACCTGAGCTTTGGGTGCCATTTTCTGTAACTCACAAGTGTGATGTTTATAGTTTTGGCATGTTGTTATTTGAAA TCATAGGTACGAGAAGAAACATTGATGTGAACCTTTGTGAAAGGCAGGAGTGGTTTCCAATGTGGGCTTGGAAAAAATTT GATGCTGGACAAGTGGGGGAGTTAATGATTGTGTGTGGGATAGAGGAGAAAAATAAGGAGATAGCAGAAAGAATGGTTAA GGTAGCTCTGTTGTGTGTTCAATATAGGCCAGAAGCAAGGCCTATAATGAGCGTTGTGGTCAAAATGTTGGAAGGTTCAG ATGAAATTCCAAATCCTTTGAACCCATTTCTGCCCTTTATGGATGGAACTTTGGCTGCTCATTCAGTCCAAGTGTCACAG ACTTATACAACAACTATGTCTTCAGAGTCTTTGGTAAGTGACACCAGCATCCTCTGTGCTACTCCTGTTATGAAGAAGTA TGAGGTTTAATTAGCCTCTAGCAGGTGATGGAAGGTTTCAATTTGTGTTCAACAAGTTGTAAAATATTATCCCTTTGTAC TAGTTTGATTTTATATGCCTGTGAATGTTGGAATATACCACCCATTTGCTGCTGTTTTGGCTCTAACCACATTATGCAGA CTATAAACCTGAAGTTGATATCTCTTGGTTCTTATAAATTATAAAAAGCAAGAGTTGTTTTTTTCGTTGATATGTTAATG TTAATTGTCAGTAATGTTAGTAAATTAGTCTCTCCTCAGGGTTCGAACCCTGGACCCTTCACCCTTCATCCCACCCAACC TTTATGTCCTCTAGCTCTGACCACTTGATCTAACCCTCGGGGACAAAAGCAAGTTGGTAACTCACAGGCATATTGGGGAT GAGGGACCTTAGTTTTATACTGTTAGTATATAACAAATTCAAAATGTGCAGAATATCAGGTTGAAGTGAAAAATCAAGCA CAAGTGTTGTAAGTAACAAATTCAACTACTCCAAAAATGGGTCCTAAAAAATAGAGATATTCACTACTTTAAACAGCTAC CATGGTCAACAAAAAGCACCTCTTCTACATGCAACAAAATATCAAAATATTCTACTATGATCTTTTAACATTAATATAGA AAATTCAGTGATCTAGTTCAGCTGTACCAACACATAAAATGCAATTGACAATAGTTACTACCAAAACAATAGAAGCACAT TCGAATCCAATGAAACAAAACATGAGCAAAAACACACTCCAAAAACACACACATATGTGAGATTCGGAAATAGTAAGGTT ACCTTAATTACCTCTTGTGTGCCTGAACGAATTTCAGCTTCTTAGCCTCTTCCTCTGCCAAAGAAATGAGTAAGAGTGTG AGAGAGCAAGCAAGCATGGGAGAAGACGAAGGGTGTATTGCAGAGTTTGCATGTTACCAGTGGTTGAGGAGGGTTTCGGC GATTTGGGAGTGCACGGAAGAATTCCCGGTGTAAAAGAGAGTTTTTGTGTTTAGTTATTAAAACCGCCGCGAAATGTAAG CAAACTGCTGCGGCTGTAAACTTAGCTCCGTTGAAGGGTTGAGTGGTTCGTCCGTCATCTTGCATAAGGTGCTTTGCCAT ACTCCATCATCACGTCGACAGTCCTCTGACGTCACATCAATGTTCTCAGTTATCCTCTATCATGTATAACTTGGCAAGGT AACGTTAGGGGAAATTGTGCGTACCGATGAATAGTGTTATGAACTATTTATAGAGTGATGCTGATTGTCGTTCACCGTCA TGTAGCGGTGGCTCAACGTAGGGCATGAGGGGTCGTTGGACTTAAGTAGTAACTAATTTTTTTAAGTATTATAGTTATTA TATGTCTATTTTATGTTTTTGATTTAATTACACTTTTATTTCATATATTAACAGCTCATATTTTTTTTTATCTCCTTAGT ATATTTTTAGCAAATTTAGTCACTCAATTTTTTTAATAGTTACAACTAAGTCACCTTAATTAATTTTATTCTACTTAAAA TTCATAAATTCTTAAAATCTTCACAAATTGAATTGATTAACCGAGAGCATGGCGGATCTCCCAAGAAAGAGGGGGAGAAC CACCCTTTTGCAGCGGTGACAAGGTCTTCTCCACGGTGCTGAAAGGTGGATGAAGGAGGAAGCTTGATGAGGAAGAGTGG AGGCGTAGAGTCACAACACAGGTTATAATCAAACTTGAATTCATGTTTATTAAACATGCCAATCCAATCTGTTTGAATAA ACTGTTGAAATCCTCTCTGGAAATGACAACTTCATTGATGTATATGAAAATACAAGTATTTTTTTGTTATGTAGTTGATA CATAAATGCTTTGGCATTAAGAAATGCACTTCAAACTAGAATAATTTTACTTTACCTGAAAATTCAAGCAATGGTAGCAA GAGTCATGGCACAGTGGTCAGAGTGAGGTGAGAGGGAAGAGAGTATTTGAAAATCTGATTCTAAATTCAAAATCAATTCT AGAAATAAGCTTATGCGAGTAACTTCGGAGTATAGATTAATTATGAAGAAATAGAAGTTAGTTCAAAGTTCAAACATGCT AATCAAGAATGAGATAGCAGATAAGGACATAGGGTGTGTTCACTTGTCCTGTAGGAGGTGGATTTTAGTTCACCATGTCA TTGTTTAACATGTTTGTTTACTTCAAGTAGCAAAATAGCTGATTTTTTAAAAAATAAGGGACAAAATGAGAAAGACTAAA ATAAAAAATTTACTTATAAGGATAAAAAAATTCTTCATATATTATCGGTGTATTCGAGACGCCACGATATTCATGTTTAA AAATTGATGTTAGGAATGGAACCAGAAACACCCCCTCTTGAGACCATAGATGACCTGTAAACTATAGAGTGATTGCATTT CCTCTTATATTGAGCTTCAGATCATGTAGAAATGATTACTTTGTACTTTAGATTTTGCTCATAAATTTCACAACTCTGCC TCTTCCTTCACTTTGTTCCCCTATATCACTATTATATATTGAATTCTTATCTACCATGTCATTGTCAGGTGCTGATGGAG TAAAAATTTTCATCATTCTAGGTAGGATTAATTAAACTTATCATATGTTGCTGTTTTCTTCTTGTTCTATGTTGATTTTT CATTGGTGGTTTTGTCACAATAATTCTAATTGCATTCAAACATATTGCAGCATCGTTGATGATTTTCATTCTTCTGATTT TGTATTGCATTAAAGGAGCTAATCTGAAAGACAGCAGTTCAGAGCAAAAAATTCTGACCCTCACCATGGATAAATTTCTG AACGAAATGGAAAGAGAGAAACCAATCAGGTTTACCAGTGAGCAGCTAAGGACTGCAACTGGTAACTACTCAAACTTTCT GGGGTCAGGAGGGTTTGGAGAAGTATATAAAGGAAATCTTATAGATGAAACCACTTTGGCTGTGAAGGTTCTACGTGGGA GTTCTGACAAGAAAATTGAGCAGCAGTTTATGGCGGAAGTGAGCACAATTGGTAGAACTCATCATATCAATCTAGTTCGC CTCTATGGATTTTGTTTCGAAAATAGCTTGGTGGCACTGGTTTATGAGTACATGGTGAATGGCTCTCTTGATAGGTTTCT GTTTCAGGAAAACATGACCTTAGGATATGATAAGCTCCATGAGATTGCTGTTGGGACAGCAAGGGGCATTGCTTACTTGC ATGAAGAGTGCCAACAGAGGATAATCCACTATGATATAAAACCAGGAAACATTCTCTTGGACAGGAACTTCAATCCTAAA GTTGCTGATTTTGGTTTGGCCAAGCTTTGTAACAGGGAAAATACTCACATAACCATGACTGGAGGAAGAGGTACTCCTGG TTATGCTGCTCCTGAACTTTGGATGCCATTTCCTGTTACTCACAAGTGTGATGTTTACAGTTTTGGCATTCTGTTATTTG AAATTATAGGTAGGAGAAGAAACCTTGATGTTAAACTGTCTGAGAGCCAGGAGTGGTTTCCAATCTGGGCTTGGAAAAAA TTTGATGCTGGACAACTTGGGGAGCTAATGATAGCGTGTGGGATAGAAGAGAAAAATAAGGAGATAGCAGAAAGAATCGT TAAGGTAGCTCTGTCATGTGTTCAATATAGGCCAGAAGCAAGGCCTATAATGAGTGTTGTGGTGAAAATGTTGGAAGGTT CCGATGAAATTCCCAAGCCTTTGAACCCATTTCAGCACTTTATGGATGGGACTTTGTCTGCTAATGCTTTCCAAGTGTCA CAGACTCATGCAACAACTGTTTCTTCCAGCTCTTCTGTTTTGGTAAGTGACACCAACATCCTATGTGCTACTCCTGTTAT GAGGAAGTGCGAGATTGATTTATCCTCTAGTAGGTGAAGGAAATTGGAAGGTTTCCATTTGGGTTCAATAAGTTGTAGAA TATTTTCCCTTGTACTAGTTTGATTTTATATGCACCTGTGGATGTTCGTATAAACCACCCATTTTCTGCTATTTTGGCTC TAAACACAATATGAAGACTATAAACCTAAAGTTGATATATCTTGGTTCTTATAAATTATAGTAAGCAAGAGTTGGTATAC ACTGTTAATCTCGGTCCTCTCAAGCATATTGGGGATGAGTGACTCTAGTTATCTAGGAATAAATATTCATTCACCCTTAA ATCTCAATCACACCAAGTGAGAGATAGAAAAGAGAGAGAAATGAGAGATCTGATAATTGATTTGATATG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0241000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATTATTTTCTTTATCAATGACAAGAAAATTTTGCATATAAGTTTAACTACTTTGCCTCTTCCTTCACTTTGTTCCTC ACTTTCACAGTTTCACTATAGAAATTTGCTTTCTTATCTTTGTCTAATGTCAGACTCGTCAAACTCGGGTGCTGTTGCAG CAGCAGTTGTATTCATCATTGTCGGGGTGGCGGCAAAGGTAGCTATTTTAATTTGTGTGTGCAGGAAAAGACATCAGAGT GGTGGTGGTGGAACAGTTATTCCAGACTCACAATTTCTGACCCTCACTATGGATAAATTTCTGAATGACATGGAAAGGGA GAAGCCAATCAGGTTCAGCGGTCAGCAACTAAGGATTGCAACTGATAACTACTCCAACTTGTTGGGTTCAGGAGGTTTTG GAGCAGTTTACAAGGGGATTTTCAGCAACGGGACCATAGTAGCGGTGAAGGTTCTCCGTGGAAGCTCTGCAGACAAGAGA ATTGAGGAGCAATTCATGGCAGAAGTGGGAACAATTGGAAGAGTTCATCATTTCAACCTAGTTCGCCTCTATGGATTTTG CTTTGAAAGAAACTTGATAGCACTGGTTTATGAGTACATGGGGAATGGCTCTCTTGACAGGTTTCTGTTTCAGGAAAACA AGAGCAAAATAAGTGTGATTAACTTGCTTCATGAGATTGCAGTTGGGACAGCAAGGGGCATTGCTTACTTGCATGAAGAG TGCCAGCAGAGGATAATCCACTATGACATAAAACCAGGAAACATTCTCTTGGACAGGAACTTCAATCCTAAAGTTGCTGA TTTTGGTTTGGCCAAGCTTTGCAACAGGGACAATACTCACATCACCATGACCGGAGGAAGGGGGACTCCAGGTTACGCTG CTCCTGAGCTTTGGGCGCCATTTTCTGTAACTCACAAGTGTGATGTTTACAGCTTCGGCATGCTGTTATTTGAAATTATA GGTAGGAGAAGAAACCATGATGCTAAACTTTCTGAGAGCCAGGAGTGGTTTCCAATGTGGGCTTGGAAAAAATTTGATGC TGGAGAACTTGGGGAGTTAATGATAGTGTGTGGGATAGAGGAGCAAAATAAGGATATAGCAGAAAGAATGGTTAAGGTAG CTCTGTCATGTGTTCAGTATAGGCCAGAAGTAAGGCCTATGATGAGTGTTGTGGTGAAAATGTTAGAAGGTTCAGATGAA ATTCCAAAGCCTTTGAATCCATTTCAGTACTTGATGAATGGGGGGAGTTTGGGTGCTCATCCAGTCCAAGTGTCACAGAC TTATACAACAACTATTTCTTCAGGGTCTTCTGTTTTGGTAAGCGACACCAACATCCTATGCGCTACTCCTGTTATGAGCA AGTATGAGATTGAATTAGCTACTAGCAAGTGA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0241000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MIIFFINDKKILHISLTTLPLPSLCSSLSQFHYRNLLSYLCLMSDSSNSGAVAAAVVFIIVGVAAKVAILICVCRKRHQS GGGGTVIPDSQFLTLTMDKFLNDMEREKPIRFSGQQLRIATDNYSNLLGSGGFGAVYKGIFSNGTIVAVKVLRGSSADKR IEEQFMAEVGTIGRVHHFNLVRLYGFCFERNLIALVYEYMGNGSLDRFLFQENKSKISVINLLHEIAVGTARGIAYLHEE CQQRIIHYDIKPGNILLDRNFNPKVADFGLAKLCNRDNTHITMTGGRGTPGYAAPELWAPFSVTHKCDVYSFGMLLFEII GRRRNHDAKLSESQEWFPMWAWKKFDAGELGELMIVCGIEEQNKDIAERMVKVALSCVQYRPEVRPMMSVVVKMLEGSDE IPKPLNPFQYLMNGGSLGAHPVQVSQTYTTTISSGSSVLVSDTNILCATPVMSKYEIELATSK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 10 10 -
Phobius 1 27 27 -
Phobius 11 19 9 -
TMHMM 12 31 20 -
Phobius 20 27 8 -
Phobius 28 50 23 -
Phobius 51 73 23 -
TMHMM 51 73 23 -
PANTHER 54 440 387 4.8E-189
PANTHER 54 440 387 4.8E-189
Phobius 74 463 390 -
Gene3D 96 199 104 8.8E-28
SUPERFAMILY 105 396 292 1.29E-76
SMART 122 395 274 6.7E-32
ProSiteProfiles 122 409 288 36.075
Pfam 126 395 270 2.0E-46
TMHMM 127 149 23 -
ProSitePatterns 128 150 23 -
Gene3D 200 403 204 1.8E-52
ProSitePatterns 245 257 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0241000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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