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LotjaGi6g1v0360500.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0360500
Transcript ID LotjaGi6g1v0360500.1
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like kinase; TAIR: AT1G11050.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O04086|Y1105_ARATH Probable receptor-like protein kinase At1g11050; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3S1R0|A0A0S3S1R0_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0360500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:67204698..67263474) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTATGTGTTGAGTGCCTGTTATAGAAATGATATACACATATCAGAAGTGTTCAGAAAAACACAATCTTCTTAATTCATTA AGTGGTTGGTTCAATTAATACATACCACATTCTCATCTCATGTTTGAGTTCGTATTATTACAAGAGTTTTTCCTACCGAA TATGAATGATCCAACTCGAACATGATTGATGATCGTCGAGTAAAATATTAAAATAAAGTTAGTCTTCTCCAACTCTATCT CGCGCGTTGTGTGCACTCTCCTCAACTGAAAACTCAGTTAAACAAACGCACACACCTACCTTTGCCACCAGCCGCCAGAA AATGAAAGCAAATACGAATCCTTTTTTCCAAAGATGTCCTTCCCTTCTAATCCATCTCCCCTGAACGCAGCTTAATCATG ATGATTAATTGATTATGATTCACAAAATCAGCATCTCTATTTCTAGATTCTTCATTCTCTTCCCACTCACCCTTTCTCAT CTCACAGACTCAATCAACCTCAAAAACTAAGCCAGTCCCAGATTCATATATACAAACAAAAAAAGACCAAGCTAGCTTGT AGCAGATTACGATGAAGATTGTGGCGGTGTTTCTTCTCTTTCTGCTGTTTCTTTGCAAAAACTCAGCTGCACCTTCCCCT TCTCCTTCTTCATCTGCATGCCCTGTTGACCTTAACTATGTTCGGAGAATCCCATGGAACTCCTCTGCTTGCCAAAACTT CAAATCTTTGTCATCCAAAAGTGAAGCAAGCTCCAACAATTGTTGCATCTCACTGTTATCTCTCTTTGGCATAGGACTAG CTCAGCACCTCAAAGAAACTTCCAATTTCAACCTCCCCAATCTCCAAACCTCAAATTCATGCATTCAAGATTTCCAAGCC AAGCTCAGTGCTCTGTCACTCCCCAATAACCTTGCTAGTTCCTGCTTTGACCCTCTTCAGTTTGTTATCTCCCCCAACAT 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AGCCTCTAATATGATTTCTCATGCTGCAGCCATGACCTAGATAACATTCTGCTTGAGAACCTTGGCGACACAAGAACACT GCAAGCGGTTTTTGACCTTGAAGCTCTTGTCCTCACAGGTAAAGTTGCATTTTGTATATTTAAAAATATAGGCTGATAAT TCTCTTGATGTTGTCATTTGTAAATAAATAGCATTAATTATCAAGTAATACTTTTTACTAAACAATTGTCCATCTAATCA GGTCATTGCTCTGAGAAAGATCATGATCCTCCTCGAGGCCTTCAGTTGATTCTTGGAACCCAAATTTCACCCCATCTAGT TGATACCCTTGTGATGGCCAATCTTGGTTATTGGCAAATGAAAGTCTCTCCTGGTGTTTGGTTCTTGCAACTTGCTCCTG GTAGGAGTTCTGAGCTCTATATTTTAAAGGAGGAGGATGATGGAAGTCAGAATAAACAATCATCAAAACTCATCACTATT AATAGTTTACGGGGTAAAGTAGTTCATATGGAAGTAGTGAAAAGAAAGGGCAAGGAACATGAGAAATTGCTGATTCCTGA TGATGGTGAAAATGTGCAAGATCAGAAGAGAGTGAGTGCTTTTTCTTTAATTTTTTTCTTTTGAAAATTTAGTGTCAACA AAAGAAAAAACATTATTATTTTAATGTAAAAGCTTAGCAGTAGCAGCTGTCAATCCTCACAGATATCTTTGATTTTTTTT TTTTTTCTGTAGGGAAGTACCTGGAATTCCAACTTACTAAAGTGGGCTTCTGGTTTCATTGGTAACAATGAACAATCTAA AAAAGCTGAAAGCAATTCACCTGTGAGTTTTTTTTTCTTTTTCGGTTTCTTCATCCTGTCCCTTTTGCACGAATTCATTT GCCCTTGTTAGATTTCCATGAAAATCTTGTATAAGGGCTAGTAACAAACTATAACCAAACTTGGTATTGTTTTATAATTT TTTTTATCTGGATGTTTTGGTCTTTATGCTTCAATACTTTGAATTATGTAATGCCTTGCTTGAGATTGAAGTAGTAATTT TGGTTCATGATAAGACTGCCATTGTTATATAGTCTTTCTGATTTGTCCAAATACATGGTATACTTTGAAATATTGTTCCC ACCTTCTGCACCATTTAAACTTTCCTCTCTCATCTTATGAACCTTCACGATATTTTCTTAGAGTTGTAACAGACTGGACC TTTTTTTCATAATAGGAGAAAGCAAGGGGGGGACGCCATGGAAAAACAATTAATATCTTTTCAATTGCTTCGGGTCATCT GTAAGTGGTTCTCTTGTTTTAACTTGATATTACAGTTTGCTGTTAATTATGGCCACAAGACACTTTTTTGTCTCAGGTAT TTGCGTTTTGTCTCACTTGTCTGGGTTGATGTATTTTTACCAGATATGAACGCTTTTTGAAGATTATGATTCTAAGTGTT CTAAAGAATACTCCTCGTCCAGTGAAATTCTGGTTCATAAAAAACTACCTTTCTCCTCGTTTTAAGGTGATATACCCACC AACTCAATGCTTAAATATTTATTGATTTGTATATTGGAACTTTAAAACAGAAATTAATGTATCTGCTTGACACACTTGGA CTATTTGTTGTCATCTGAATACCCAGGATCTGATTCCCCGCATGGCCCAAGAGTATGGTTTTGAATATGAACTAATCACA TACAAATGGCCTACTTGGTTGCACAAGCAGAAAGAAAAGCAGCGAATAATTTGGGCGTATAAAATTTTATTCCTGGATGT CATCTTTCCCCTTTCCCTGGAGAAGGTATCTTGTCTTTCTTCTTCTGCATCCAACTCCATGTTTTCCTTCCTTTTGTTCT CCTCTGCATTCTAAATTTCAGTGTCACCGCTCATGCATCTCATGTGACATTAACAAGGAATGAAAAGAAAGATCCTCTGC AAACTTGTCTTTAATTTAAGTCTATTGTTTTTGCAGGTCATTTTTGTAGATGCTGATCAGGTTGTCAGGGCTGACATGGG AGAACTATATGACATGGATTTAAAAGGAAAACCTCTGGCATATACTCCATTTTGTGACAACAATAAGGAGATGGATGGAT ACCGGTTTTGGAGACAAGTAAATGCCACTGTTGAACTTAAATTTATATCATTTATTGTTTTATTTTGTTGTACATACATG TTTTCTTGGTTGTCATCATACTGATGCAATTATTTGTAGTTTCAGCATTGAATGTCAGCATTGAATGCTAATTTCTGTTC ATGTTACTCTTATGCCATAGGGTTTCTGGAAGGATCATTTGCGGGGAAAACCATATCATATTAGGTTAATAACTGGTTTC TTGATCCTCTTGCCAAAAAAGGGTTGGAGTATATAAAATGTCATTTATCTAATTTGTTTTTTTCCTTGCAGTGCTTTGTA TGTTGTTGATCTGAAGAAGTTCCGAGAGACTGCAGCTGGAGATAATCTCAGAGTTTTCTATGAAACCCTTAGCAAGGATC CAAATAGTCTATCCAACTTGGATCAGGTAAGAGGTTAAGTCAATAGCTTTTTTACTATTATTTATTTTGTTGTGAAAGAA TCACTTAAAAGATTCATTTTTCCAACAAAAGCTGATTTTACTTTCAGTGAGACCGTACCAGAAGTACTCCAAAAGATGCT AAAAGCAAAACTGGGCAGTGTTATCCTGTTATATCACGTAGCTCCCCTATGAAACACGCCTTGAATTTATGACATCTAAC ACTCCACTCTCATGAGTCAATCCAACCATACATACATCAAAACTCCCTAACACATTACACATTAGAAGTGTAAACAAGCA ACTAGATCAGAACACCTGTTTAAGAAAGAATGAATAAATCACTTAAAAAGATTTAGAGCTTGTTTGTATTACTGGTAGCA CTTCTCAAACGTAAGTTTTACCACAGACTAACATCTGTCTTTGAGGAGACTTGGATTTGGGCGCCTGGTGAAGGCAAACT ATGCTTTTCACGTCGGCAAACTGGTTTCCAAAATCCAAACATACTCCAAGTTGTTAAAGAAGATTGGATGGTTCCTATAA GTCCAATATGCCTGAACATATGGAATGAAATCCAAATACACAGTAGATGGCTGCTTTATATTGAAGCAAAATATTGCTTT GAAGTGAACCTTTATAAGTGGTAGAAATATAATATAAAATCATTTTTTGTCTCCGCTCACTAATTTAAACTTTTGGTATA ATTGGTTCCTTATATGGTATCAGAGCCTCTATGATTATCGGGTTTGCAGTCCCCCATTATTCTAACAAAAAGTTGAATTT TAGCAAAAGATATGAGAACTTGTGCATTGTCCGCACTTCAAGCCCAATGAGCTTTTGCGTTAGGGGGCATGCTATATAAA ATCATTTGTGTTTTCACCTAATAACTTTAACTTCTGAGATAGTTGGGTTATGATTAAGATATGATTCGATGCTATGTGAA TAAACTATTAGGCCCTTTCTGATCATATGATTAAGATATAAGTCATTGATTCTTTTATAAAGTTGAAATCTTTTTCATTT ACTTCCAATGTATCTACTGTTATACTTTGTGCAACTTTTTTGAGGGACCTTTTTGGCTTGCTAAAGTTTGCTCTCAATGG TTCAGGATCTTCCTAATTATGCTCAGCATAATGTGCCCATTTTTTCCTTGCCACAAGAATGGCTATGGTGTGAGTCATGG TGTGGTAATGCTACAAAATCCAAGGCAAAAACAATTGATCTCTGCAACAATCCCATGACAAAAGAACCCAAACTTCAGGT GAATATTTGCTGTTTCAAGTGTTTTGTGTTCGTGGAAACTCCATCGCATCACTTCCTGATGTTTTAGTAGCCCCAATTGT CTCTGCAAAAATTTAACTTATCTCCACTTTGGTCTTCAGGGTGCTAGACGAATAGTATCTGAGTGGCCAGACCTTGATTC GGAGGCAAGTAGATTCACTGCACGAATCTTGGGTGATGATCAAGAGCCAACACAATCACCTGACCGGTCTAAGGATTTGA CAAGTGAAGATTCATTGAAAGAAGACTTGGAATCCAAAGCCGAGTTGTGAACACAACAGACAGAAGTGTTCTGAAAGGAT CTGTGATCTATGATGCAGTTGGCAGTGGCACCACATTAGCATCATGGTACATTTATTACCAAGGAGCGCCTGGCTGATAT CTTGGCATGCCGCCAAACACAATAACAACAGTTAAACGCATTGAAGATTTGCCTTCTCTGTTGCCATTTCCAGGTTCAAA AAGAATATTTTGGTTAGAGTGAAATGTTAGTATATTCTGATATTGACTTACGCCCATTTTCAGACTGGTATCCATGCCAT CTAATCTCATGAATGTGATACCTCGGCCAACCTACGCCCATTTTTGTTCTTTTCAAGAATAACCGAATACAATAGGGAGG AGTACTGGAGTTTAGCAATGCCAAATATATATGAGTGATAGTGTAATTTTATTTCATATTAAGCTGAAAAAAGAGTTGAT CTAAACATGCTATAAGGAGGAAAGACTCCTTTGTTTGATTTGTTTTCCTCCCCATCTAACCTCCTTGTTTAACTCCTTTA CAAATCAAAGCATGTCCTTTTATAAAAAAAATTGAGAACTAAATGTCAGTTAGATCATTTTAGAGAAAATATTACATACA AAGTGAAATTATTATATTAACATCTCAAAATGTTTTGCATTTGTCAAAATTATTTTCGGGGATGGTGAATGTATGAAAAT GTATCAAACTATTTATGATCACAGCTCCAACAGAATCTTGCATGAGATTATGTGTTTGAGCAGCTTTTCTTTCAGTAGAA GCATACCTGTGAGACAGTTGATAAAATTTCTATATAATACTACATTGCCAGTTCTCATAATCACCCTAACTAAATCAATG GCCTAACCATAAAACATTATTTCTGTATAAACATGACTGCTTGTGAGACACCTTTAGGCAAAATGAGTAGCACACCGGTA GATTGTTGACAATCAGTTATTTCTGAATTTTTAAAATGATTTATCTATAAATTAAAT 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0360500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAGATTGTGGCGGTGTTTCTTCTCTTTCTGCTGTTTCTTTGCAAAAACTCAGCTGCACCTTCCCCTTCTCCTTCTTC ATCTGCATGCCCTGTTGACCTTAACTATGTTCGGAGAATCCCATGGAACTCCTCTGCTTGCCAAAACTTCAAATCTTTGT CATCCAAAAGTGAAGCAAGCTCCAACAATTGTTGCATCTCACTGTTATCTCTCTTTGGCATAGGACTAGCTCAGCACCTC AAAGAAACTTCCAATTTCAACCTCCCCAATCTCCAAACCTCAAATTCATGCATTCAAGATTTCCAAGCCAAGCTCAGTGC TCTGTCACTCCCCAATAACCTTGCTAGTTCCTGCTTTGACCCTCTTCAGTTTGTTATCTCCCCCAACATCTGTGCAGGTG TGGAGAATATTTCAGATTGGACCAGCAAGCTTGGTCAGAGCACACCACTCAACACTGCTTGTAGATCAGATCTCTCTGAT ACTTCCCTCTGTGATTTGTGCCTTAATGCTGGCTTACAGGTGAAGCAGACTCTTGTTTCCATTGATGGTAATGCTAACCA CTCCTTGGAATGTTTTTACTTTGCTATTCTTTATGCTGCTGGGATTGTGAATGAGTTTGGACCTGAAAGCAATGGTGCTG TCACATGCATATTTAGTCTTCCTGTTTATTCCCAAGAGGGGTCTGGGGGAAAGGGTCACCGGACTCTTGTGTTTGGGTTG ACAGGAGCTGGGGTTGCTTTGTTTGTCATGTCTTGTTTGTTGGCACTGTATGTCTGGCATGACAGGAAGCGTAGGCTGAG AAAGCTTGATAGTTTACCGTTCGATTTTGACCCTGAGGAACAAGGGTCTAAGCGTAGAATGAGACCGAATACCGGGTCGA TTTGGTTCAAAATTGCGGAGCTTGAGAAGGCTACTGATAATTTTTCAACTAAGAACTTCATAGGGCGAGGCGGGTTTGGG TTGGTTTTCAAGGGAACCTTGCCTGATGGGACAGTGGTTGCTGTTAAGAAGATTTTAGAATCTGATTTTCAAGGGGATGC TGAGTTTTGTAATGAAGTGGAGATTATTAGCAATCTGAAGCACCGGAATCTGCTGCCGCTTAGGGGCTGCTGTGTTGTTG ATGAGAATGAGAAGAATTATGCTGACAAGGGAAGCCAAAGATATCTTGTTTATGATTACATGCCAAATGGTAACCTTGAA GACAATCTCTTTATATCTCAGAAAGAGAAGAAACCACTGACTTGGCCTCAAAGAAAAAACATAATCTTGGATGTGGCAAA GGGATTGGTTTACTTGCACTATGGTGTTAAACCTGCAATTTTTCACAGGGATATCAAAGCCACCAATATACTTCTTGATG AAGACATGAGGGCAAGAGTTGCAGATTTCGGGCTTGCTAAACAAAGCAGGGAGGGCCAGTCTCATCTCACTACAAGAGTA GCTGGAACTCATGGATATCTAGCACCGGAATATGCACTATATGGTCAACTGACTGAGAAGAGTGATGTCTATAGCTTTGG TGTGGTTGTTTTGGAGATATTGTGTGGAAGGAAAGCTCTTGACTTGTCTTCATCAGGGTCACCAAGGGCATTCTTGATCA CAGATTGGGCTTGGTCATTGGTGAAATCTGGGAACATAGATGAGGCGTTGGATTCTTCCTTGTTAAAAGACGAAAGCTCT TTTACTTCAAATCCTAAGAGCATAATGGAAAGGTATTTGCTGGTGGGAATTCTATGTTCCCATGTAATGGTTGCTTTGAG ACCAACAATTACTGATGCTTTGAAGATGTTAGAAGGGGATATTGAGGTTCCTCAAATTCCAGATAGGCCTATGCCTCTTG GACACCCTTCATTTTACAATGATGGCAACACTTTTAGCATATCTCCGGCCCTTAGCGGCCCCAAATTGCAAGCTGGAGAC ATGCTCAGGTAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0360500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKIVAVFLLFLLFLCKNSAAPSPSPSSSACPVDLNYVRRIPWNSSACQNFKSLSSKSEASSNNCCISLLSLFGIGLAQHL KETSNFNLPNLQTSNSCIQDFQAKLSALSLPNNLASSCFDPLQFVISPNICAGVENISDWTSKLGQSTPLNTACRSDLSD TSLCDLCLNAGLQVKQTLVSIDGNANHSLECFYFAILYAAGIVNEFGPESNGAVTCIFSLPVYSQEGSGGKGHRTLVFGL TGAGVALFVMSCLLALYVWHDRKRRLRKLDSLPFDFDPEEQGSKRRMRPNTGSIWFKIAELEKATDNFSTKNFIGRGGFG LVFKGTLPDGTVVAVKKILESDFQGDAEFCNEVEIISNLKHRNLLPLRGCCVVDENEKNYADKGSQRYLVYDYMPNGNLE DNLFISQKEKKPLTWPQRKNIILDVAKGLVYLHYGVKPAIFHRDIKATNILLDEDMRARVADFGLAKQSREGQSHLTTRV AGTHGYLAPEYALYGQLTEKSDVYSFGVVVLEILCGRKALDLSSSGSPRAFLITDWAWSLVKSGNIDEALDSSLLKDESS FTSNPKSIMERYLLVGILCSHVMVALRPTITDALKMLEGDIEVPQIPDRPMPLGHPSFYNDGNTFSISPALSGPKLQAGD MLR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SignalP_GRAM_POSITIVE 1 19 19 -
SignalP_EUK 1 19 19 -
Phobius 1 2 2 -
ProSiteProfiles 1 30 30 5.0
Phobius 1 19 19 -
SignalP_GRAM_NEGATIVE 1 19 19 -
Phobius 3 14 12 -
PANTHER 9 620 612 2.0E-226
PANTHER 9 620 612 2.0E-226
Phobius 15 19 5 -
Phobius 20 235 216 -
Phobius 236 259 24 -
TMHMM 237 259 23 -
Phobius 260 571 312 -
Gene3D 278 393 116 1.3E-30
SUPERFAMILY 287 598 312 7.82E-75
ProSiteProfiles 308 573 266 35.312
SMART 308 597 290 1.9E-30
Pfam 309 522 214 2.3E-42
CDD 314 599 286 6.07934E-90
ProSitePatterns 314 337 24 -
Gene3D 394 605 212 5.6E-56
ProSitePatterns 440 452 13 -
Phobius 572 590 19 -
Phobius 591 643 53 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0360500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…