Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message

LotjaGi5g1v0362200.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0362200
Transcript ID LotjaGi5g1v0362200.1
Related isoforms 5
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Callose synthase; TAIR: AT5G13000.1 glucan synthase-like 12; Swiss-Prot: sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RX23|A0A151RX23_CAJCA Callose synthase 3; Found in the gene: LotjaGi5g1v0362200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:67602820..67616745) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACTCACTAGGGCTTCTGTTTTGCTCTCTCTACCTCCACGCAAACCGCATTGTAGCCGGCGGTGACTCAGTCATTCTGCCG GAGAATGTCGTCGGAGCCGCAGCCACCGCCGCAGAGGCGGATAACGCGGACGCAGACGACAGGGAACCTCGGAGAGGCGA TATTCGACAGTGAGGTTGTGCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCGCCCATTCTCCGCGTGGCTAATGAGGTTGAGAAGACG CATCCAAGAGTTGCTTATCTCTGTGAGTTCATCTTACTTATCCTCCATGCAACCGCATTGCACAATGTGTTTCTATTTTG AGAGGGTTTGTGTTTCTCTTGCTCTTGCAGGTCGGTTCTACGCGTTCGAGAAAGCTCATAAGCTCGACCCGACTTCCAGT GGTCGCGGTGTTCGGCAATTTAAGACCGCGCTTCTTCAACGTCTTGAAAGAGTAAGCATTTTGATCCATAGCTTCTAAGA ATGCAAACTGTCAAATCTTCTTATTTAGTAACCTCTAGCTGTTATGTAATGATTGGAATCAATGTTGTCCCATTTTTGTT AGGAAAATGATCCAACATTGAAAGGAAGGGTAAAGAAGAGTGATGCTCGTGAGATGCAGAGTTTTTATCAGCATTACTAC AAAAAATATATTCAAGCTTTGCAAAATGCTGCTGATAAAGCTGATCGGTACATTGTCTGGATAATGTGTAATATGATAAA TATGTTCTGTGCCTGTTGTGTGACTAGAGTGTGTTTGTATTATTACTTTCAGTGCACAGCTTACCAAGGCATATCAGACT GCTAATGTTCTTTTTGAGGTTTTGAAGGCTGTTAACTTGACACAGTCTATGGAAGTTGACCGTGAGGTAGTTTTTTCCTC ACTTCCAAGTTCTCATCTTTCTATTTGGTTTCCTCTTTTTATGTGTACCTTTAACCATATTTGAAATTAGTTGATTATAA TAGAGTTCACTTTAAAATTTTGACCTTCACCTGTTACCGACTCATGGTTGGTTTTCTGTTCCCACTGTAACAGATTTTAG AGACTCAAGATAAGGTTGCTGAGAAGACTGAGATCTTAGTTCCTTATAATATTCTTCCTCTTGATCCTGATAGTGCAAAC CAGGCAATAATGAGATTTCCTGAGGTACAATCTCGATTTTCATACATGTATTCCAAAAGTTCTGGTCACCCTCATCTTTT TTCTTCTACTTTCAATGAAAATAATTATTCACCTCTCTTAATAGATTCAAGCGGCTGTATTTGCTCTGCGTAACACTAGA GGCCTTGCTTGGCCTAAGGACTACAAGAAAAAAAAAGATGAAGACATCCTGGATTGGCTTGGGGCAATGTTTGGGTTTCA GGTAAATTACAAACTTGAACTGGTAACTCTTTTATGTATTCTTTTAGTTGAACATCACTTATTTGTTACTAACAATCCAA TTGGACTTGTTTGCCACCCTTTGTACAAATTATAGAAGCACAATGTGGTAAATCAGAGAGAGCATTTGATCTTACTGCTT GCAAATGTGCACATTAGACAATTTCCCAAGCCGGATCAACAGCCAAAGGTCAGGGTTTTACTTGGATAGTTGATACTTTG CTTTTTAACTCTCATTTTCATTTTTAATTTCTGTACTGAACATTGTGTTTTTCGTCTATTTTTTTAGTATTGAAGGTGCT TCCTTTCTAGTTTGTTAATTGTGATGTAGCAAGTAAAGCCTGTAATGTGTTTTTTAGGGTTTCACTATTATATTGAAGGA GGGTTCTGGAGAGGGGTGGATTAACACTTGATGATTTGATTTCTTGTGTTAAAATTGATCTATGATTGGTGATAAGATAC CATACAGAAAGTTGTTTGTCTTTGGTTTCTGCTATAAATGGTTTCCATGCTGCAATTCATTTGTTAACGGACTTGAATGT TGTGCACCAGACATATATGGTTCTGTATATTCCCTTTTAATAGTAATATATCTTAACCAAGGAACCATAGTCAACAATTA ATATTTTTTCTTTTCGTGTTATTTGCGTTAATCTAAGACTTATACTATTGTTTTCTAGTTGGATGAACGTGCACTGACAG AAGTGATGAAGAAACTTTTCAAGAATTACAAAAAATGGTGCAAGTATTTGGGTCGGAAGAGTAGCCTTTGGTGAGAGTTT CTTCTCTCATAATGTCCAACAGATATTGTAACTGCTTTCTTGCTAACTAGGATATCTTTGTTTAGCTCATATGGAGACTA AAAACATTTTAAACTTGTTTTCTATTTTAGTTCTACAGTTTATTCTATAAATTTAAATCATTATATGATCTCTAAATTTA ACAATGACTTCCAATTTTGAACCTGGATTCTCATCTGCAGCTTGTTTTAACTCTTGTTATCTAGCTAGCTTTCCTGAGAA GTATATGCATATTTTAGCTTTTCATACAACATACCTTGTGGATGCATATTGCAGGTTGCCAACCATACAACAAGAAGTGC AGCAGCGTAAATTACTATACATGGGTCTATATCTTCTAATATGGGGTGAAGCTGCTAACATAAGATTCATGCCAGAATGC CTGTGCTATATTTATCACCATGTAAGCTTTGCAATTTAAAGCAACCTGCGATTAAGGATGGCTGTTGGACTTTGACCTAA TGGGTATCTAAAATATTAGGGAGTTTTAAGTCTTAACCTGATCAAACAGGTCTGTGATTAGGCTTATGTAATGACCTAAA AAATTTATAGGGTGGACATTGTGTTCACTCGCCTCATGCTCATAAAATATGTTTTCTGTTTTATAATTAGGATCAGGATT TGATTTTTTTAGATATTTGTTAATTGATTTATATTTTGCATCTTTAATCATCAATGCTTTTTTTGTTAAAAAAAGAAATT AAACTGAAAGCATATTCCATTTAACTAAACACTGGTAATGGATCCAGGTTTGGATATAGACAACCATGTAAAAGTGGGAC TTCTTAGTGCTAACCATTTTAGGAATGTTTTTATATCTCTATCTCAATTATATACTTGTATTTGTCCTTATGGCTTGTTC ATATGTTGACATTGTTGATACTGAATTGAAGTTTTTGAAAGGAACCTACTGCTTTGTTGAATATTGACATAGTGATATTT TTGACGGTGCATCTTGTAGATGGCTTTTGAATTGTATGGTATGCTTGCTGGTAATGTTAGTCCAATGACGGGAGAGAATG TCAAACCCGCCTATGGAGGTGAAGAGGAGGCCTTCCTAAGGAAAGTTGTAACTCCTATATATAATGTGATTGCTAAGGTG CTTGCTTCTGTCATTGTTTTTTTCTTCTTTTATGTTTGTTAGCTCACACGAGACACTTGTATGTTATACACTATATTGAT AATTGATGATCAATCTATACGACTACGAGACATCTGTATCTCATAAAATATTGATGTTCGCTTTGCTCAAAAGGAAGCTG AACGAAGCAAAAAGGGGAGGTCAAAGCATTCAGAATGGAGGAACTATGATGATTTAGATGAATATTTCTGGTATAATTTT CTGATTCTCTATTTACGTTTTGTCTTTTCTGTTTCATTGTTAATTTGTTATACATGTCTGATATTATATCTTAATGAATA TTCAGGTCAGCTGATTGTTTTCGGCTTGGTTGGCCAATGCGTGCAGATGCTGATTTCTTTTGCCTGCCAGTTGAGCAGCT AAATTTTGATAAATCTAACGTAAGCATTGATTATGGCAGAGAACTTCTTTGACTTTGTTTACTATTATAAGATTTTTTTC TTCTCAATATTGGCTCGTGTTGATTCGAGGGATTATATATTATGGCAGGATAACAAGCCAGCTAACAGGGACAAATGGGT TGGAAAGGTCAATTTTGTTGAGATCAGGTCATTTTGGCATATTTTTCGAAGTTTTGATCGCATGTGGGGTTTTTTCATTC TGTGCTTACAGGTAATGAATATTTTCTATTTTGTGTTGCCCTTATCCCTCCACTTGAGTGATTTTTCCCTTTAATGCCTT GCAAAATAAGATGCATTTCTGAAAGAGCCAATTTGTCACTAGGCAATGATTATTGTTGCTTGGAATGGATCTGGGGATCC AGGTGCAATCTTTTATGGTGATGTTTTCAAGAAGGTGCTTAGCGTATTTATAACAGCGGCTATATTAAAGCTTGGGCAAG GTATGTAGCATCCAATTTTACATTGGCGTAGTGTGATCCATATAGCCGGTCTCACTTAGTGGGATAAGATTTTTGCTGTT CTTGTTGTTGGATTCATCATCCAATGCATTTGTACATTCCTTTAGATGAATACGATTATCTTGTTAATGTGACTGCATTA TGCTGTAACTGAAATGTCCCACAATTATCTGCAAATTTCTTTGGCATTATATGAAGTGCAGGTTGCTTATGTTATCTTTG CTTATTTTATGTTCACGTGAGCAGCTATTCTGGATGTGATCCTCAGTTGGAAAGCACAACGGAGTATGTCAATGCATGTT AAGTTAAGATACATTCTGAAAGTTGTTTCAGCTGCAGCATGGGTGATTGTTCTATCAGTTACTTTTGCATATACTTGGGA CAATCCTCCTGGCTTTGCTCAAACCATCCAAAGTTGGTTTGGAAGCAATTCAAGTTCGCCTTCAATGTTTATTATGGCTG TTATTGTATACCTGTCACCAAATATGCTAGCTGCCGTGTTGTTTCTCTTCCCACTCATCCGTCGTTTTCTTGAGAGGTCG AACTATAGGATTGTGATGCTAATGATGTGGTGGTCACAGGTAGGTGACACGGCAACCCTGTTTTCTATATCTTTTAGTTT GGTCTACCAAACAAAAGATTCTGTGCCATTCTAACTGATTTACAAAATTTAACTTGGTGATTTTGATGCTTTATTTGTAA TTGGCAGCCTCGCCTTTACATTGGTAGGGGGATGCATGAGAGCGCATTTTCCCTTTTCAAGTATGAATCTTGAGTTTAAA AAGTTTCTCCTTGTTGTGAATAGTGTTATTTTCCTCGGAATCTGATCTCTCAACATTTTTTATTTATTTATAATCCAGGT ACACAATGTTTTGGGTTCTCCTTATAATTACAAAGTTAGCATTCAGTTACTATATAGAGGTGATTCATTTTCATTCATGA CTTTTGGATAAGTCTGTAACCACTGCCTTTTCATATTCACTTCCAAAATTTCCCACAATTGTCAGATTGAATATCTGCAA CTTTTTAAAATAATCAATTAACATAACTTCTTACTACAGATAAAACCTTTGGTGGGACCTACAAAAGCTATCATGAGTGT AAAAATCTCAACTTTCCAGTGGCATGAATTCTTTCCCCATGGTAGTAAGCTTGAACACATTAGATTTTCAAATTATTCCA TTCTTTCACAGATGAATTAATAAGTTATGTGCTTTGCAGCTCGAAATAATCTTGGTGTTGTAGTTGCACTTTGGGCTCCG ATTATTCTGGTATGTGTTTAGATTATATCTTCTCCTTTTACTCTATATCTCACATTATGACCCATGTGCTTTTTCCCTTT TTAGGTATATTTCATGGATACCCAGATTTGGTATGCCATATTCTCTACTTTATTTGGTGGTATTTATGGGGCATTCCGTC GCCTTGGTGAGGTTAGCGAATCTCTTTTTTATTGATTTATTTTGGATCTATAGTTTTTGTTGCTTATATATTATTAGCAT GTTATGAACGGACTTTGGTGGGAAGTCTAAAGTTGCAGGAATGTATTTTTTCATGCTAAAAGTTCTTATTCTTTTACTCC TTTCCTCTGTACCCCTTCTTCTCCGAATGTTGGGCAGTTCTTCAAGTTCAAACAATATAGTGACCGTATTCTTTCCTAAA CGTTTCTATTTCAAGTTATATTTATCAACTGTATTGAATTGTTGTAAAAGCAATTTAAGTTTCCTTCCTACGGCTCTAAG TAAGTGATCATGGTTGTCATTGGTTTTTGAATTATTATGCTTATATGCTGTGCATTTGAGAACTTCGTGGAGTGGCTTGT ATATTTATTCTCAAAATTGTATATAATGAAGTTCATTTTGCTTCACAATTCTGATTGAAATACGTAGCATCTTTAGTGTG TTCCTGATATTGGTCCCTTGTTGCCTGCTTTTTAATATCAGGTATTCTTTTTCAAACCCTGGTAATTATTTTATTGTCTA CTGATTCCAGATAAGGACCCTAGGAATGCTTAGATCTCGTTTTGAATCATTACCTGGTGCCTTTAATGCCTGTTTGATCC CAGAAGAAACGAGTGAGCCAAGGAAAAAAGGATTCAAAGCCACTTTGTCTCGTAGATTTGATCAGGTTAATTAATTTACA ATCACAATCTTGAGCTGGTGATTAGAAGTTGGAGCATTTTTACTTCAAATTTATGTTAGCTTGTTGTTACAGATCCCATC TAACAAAGGAAAAGAAGCTGCAAGATTTGCTCAACTGTGGAACCAAATAATCACTAGTTTTAGAGAGGAAGATCTGATCA GTGATAGGTGATCTGCAGGATACATTTGTGTTTGTGGGTCTTATTCTTTTCTCTTAGATATAATTTTTTACTGTGGTGTG CTGAGGTGCTTTTATTGTTCAGGGAAATGAACCTTTTGCTTGTCCCTTATTGGGCTGATCGTGAGCTGGACATGATACAG TGGCCACCATTTCTACTTGCTAGCAAGGTTTACTTATTTGAGTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTTATCTACCTTTACTTTC GCTTAACAATCCTGTATCTGCTTTTGTAGATTCCAATTGCATTGGATATGGCTAAGGATAGCAACGGAAAGGATAGAGAT CTGAAAAAAAGAATTGAGGCTGACAGCTATATGTCTTGTGCTGTTCGGGAATGCTATGCTTCATTTAAAAGCATTGTTAA GTACTTGGTTCAAGGGGATCGCGAGAAACAGTATGTTTCCCAGAGCATATAATGCAATTGTTTATGTGTGTAGGAGTACT TTCTGAGTGACCTTCCTTGTTTGCTATGTTGATCCAAATAATACCACATCATAAATGTTCTGAATTCTAAGCTGTTCATT TATCTAAAATCTGTGTGAAAATTTGTTGGCACCTTTCATTTCAGGGTTATAGAATACATTTTCTCTGAGGTAGACAATCA TATTGAAGCTGGTGACCTAATAAGTGAATTCAGGCTGAGTGCACTTCCTAGCCTCTATGAGCAATTTGTTGAGCTAATCA AATATTTGGTAATGTTTAAACAATTTTATGAAATTAACATTTCTGTTTGTAATTTTTAACATGTCAAAATCTTATCCAGC TTTTTATTTATTGCAGTTAGACAATAAGCCTGAATACAGGGACCAAGTTGTGATTCTGTTCCAAGACATGCTGGAGGTGG TGACAAGAGATATAATGATGGAGGATCATATATTCAGGTAATGATACATAAGTCCAAATGTCTATACAGTCTACATCTTC AAAGGGTCTTCTTCCTTCTGTGATTATGATTGTATATCATACTATCATTTTGCTTGATAGCTTGGTAGATTCTATCCATG GTGGACCTGGGCATGATGGGATGCTTCTTCTTGAGCAACAGCACCAGTTATTTGCATCTGAAGGGGCTATCAGGTTTCCG ATTGAACCAGTCACAGAAGCTTGGACGGAGAAGGTTTGCTACTAATTAAGTCGTTCTGATGAGAATTTGAGTAGTGAACT CTATATCTGATGGCCTGTTTATATTTTCCTTTTAAATTGTAGATAAAACGGCTTTACTTGCTGCTTACTACAAAAGAATC AGCAATGGATGTACCATCTAACTTGGAAGCCAAAAGGCGCATTTCTTTTTTCTCAAATTCACTGTTTATGGATATGCCTA CAGCACCCAAAGTTCGCAATATGCTTTCATTTTCGTAAGCTTTCTTTTAGTCCTATATTTTTCCATGCTTTTCACATGAA ACTTGTGAACCAGTTAAGTTAAAATTAGCAGTGACTACTTACAAAATGTAATATGCATTATCTTAATATATTCCTTTTAG TGGAGTAATTTTATTTTTTCTCTATGGATTTTGTAGGGTTTTAACACCATACTACACAGAAGAGGTTCTATTTTCCTTGC GCGAGCTGGAATCACCCAATGAAGATGGTGTTTCAATACTCTTCTACTTGCAGAAGATCTTTCCAGGTGTTTATCCTTTC CCATCAATCACTTTGTTGAATAAATGTCAAAGTTCAAGTGGTGGGTATCAATGCATGCCTTGGTACTTTTTGGTTATCAG ATGAATGGAACAACTTTCTTCAGCGAGTAAATTGTTTGAGTGAGGAGGAACTTAAAGGGAATGAATCTGACGAGTTAGAA GAAGAACTTCGTCAGTGGGCATCATACCGCGGCCAAACTTTGACCCGAACTGGTTCCACCCCTTCCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTATATATATATATATATATATTATATACATATATATATATATATATCTTAATGCTCACAAACACTTATTTATGT GCAAACTCGAGTGCTTAAGTTCCTGTACAATTATGTCCTATCCTCAGAAAATCAGCTGTGTATTACACTATTACTTATCA CTGATTGATTGAAGTATTGGTACTGATGCAGTGAGAGGAATGATGTACTACAGAAAAGCTTTGGAGCTCCAGGCTTTTCT TGATATGGCCAAAGATGAAGGTGACTGTTCCTTCTTTGGGAATGATTAAATATAATTTATTAGCTGTTTCTCATTTGATT GTGAATTTAATAATCGATCAAACTTGTTGCTTTTTTTTTGATAGGCAAATGTTAGTTGTTAGAAATGTTAGTAAATTAAT CCCTCCTCCGGGTTCGAACCCGGGACCCTTCACCCTTTACCCCACCCAACCCTTATGTCCCTAGCTCTTACCACTTGAGC TATCCTTCGGGGACGATCAAACTTGTTGCTTGAAACTTTTTTTATTGAGTTTTTCTGAATTAAATGAAATGAATGTGCAG ATTTGATGGAAGGCTACAAAGCCATAGAAAATTCAGACGATAACTCAAGGGGTGAAAGGTCATTGTGGTCACAATGTCAA GCAGTAGCTGATATGAAATTCTCATATGTGGTGTCATGCCAGCAATATGGGATTGACAAGCGATCTGGCGCTGCTCGTGC ACAAGACATACTGAGGCTTATGACAAGGTTATTGGCCAAGATTAATAGTACGGGCCATTATGTTTGCTACCTACTAATTA GTTTGTACCTTTTCACTTGGCAGATATCCTTCACTTCGAGTTGCCTATATTGATGAGGTAGAGGAACCTAGCAAAGAGAG GCCGAAAAAAATCAACAAGGTTTATTACTCTTGCTTGGTGAAGGCTGTGCCAAAATCCAGTAGTCCTTCTGAGACAGAGC CTACACAATATTTGGACCAAGTATGTGGATTTTGATAAATGAAGGATGTAAATAATTCTTACTTTCTTTTTGCTTCTAGT AATTTGTTTGATAGACCAATGTTTTAGGGTTTGACTAGGGCTAGCAAACCTTGTGTGTGTGCACACACACACACACACAT ATTTGTACTACTAATCCATTCACGTATCTTCACTCAACGGCGTAAGCTTTTAGGCTAGTTGGTTCATGAGATGGTATCCA TACATCTACCATGTAGTCTAGAGTTCCATTGTTGCTACTCTCATTCTTCTAATAAAATGTTTAAGCCCAAGTTAGGTGGG TGTGTGCATTGTCCACATTTTAAGGCTGAAGGGATTTGCGAGAGGTGATGTGTTAGAATTATAATATAAAATTATTCATG TGTCTTCACTCAACAACTTGAGCTTTTCGGGTCATTGGTTCATGACAAGCTATATTATTGCCATCAAATTAAATAGACTT AATGACGTGAACTGCTTCTTAAGCCCACCTTCTTTCCACCCTTCATAATATTTCATTTATCATTCATCTACAATGCGGTG GCTCATACTCTGTGTTTGATTTTCTTAATCAGGTCATATATAAAATAAAGCTTCCTGGGCCAGCTATATTGGGTGAGGGT AAACCTGAGAATCAGAACCATGCTATTATTTTCACACGTGGAGAAGGCTTGCAAACAATAGATATGAATCAGGTATAATA CTTTCATGACTGGAACACAAATTGTAAGGTCTGATATTATTCCATGTGATTAAGTTGCCTCTTTTATAGGATAACTACAT GGAAGAAGCTTTAAAAATGAGAAATTTGTTGCAAGAATTTCTGAAGAAGCATGACGGTGTGAGATTCCCCAGTATTCTTG GACTTAGGGAGCATATATTCACTGGAAGGTAAAGGCTTTTTGTTCTATCTTTGATTTTGTACCACTTCAAGAAAATAAAT TATTTTGCAACTAACGTTCATAATTTATGTTCCTGACTATTGTTTTGCTCTGAGGTTTCAGTGTTTCTTCTCTTGCATGG TTTATGTCTAATCAAGAGACAAGTTTTGTGACAATTGGTCAGAGATTGTTGGCTAATCCACTGAGGTAAGTTCTCATTCT TGTTCTTGTCTCTATGTTTCGTTTTTGGTAGTTAAAAGAGGCCTATGGCTTAGAAGAGGAGTGGGAGAAATAAGGGTCTG TCTGAGGGAGAGAAAAAAGTGTGTGGCTTGTCAACTGGTCCTGGTCCTGGTGGGCTTTGAGTGCAGGACCATATAAAACC TGAAGTCTAATGACATGGGTAGTGACCGGTGAACAAAAGTCTTAATCATGCTCCTAGGATAACTTATATATGTTTGAGCA ACTTAGTACACACAAAATATTACTCTTTAACACACCCCTCAACCATGGATGTTAATTGTGGATAGCTTCTGTCAAATATA ATCTACGTTTTTTGACAAAGTACTTCAGTAAATAGATCTTCTTGCTACTGTTGTTGGATCCCGGTACACATTATATAGAA AAACCATAAAATAAGTAAGTCCCTGCTGAAGCTATACACCAACATAGAGACACTGAATATGCAAAATAAAGGAAAACGTA GTACTAACTGATCAGTGCCTTTAAATAATCTTTGATAACCAAGTTGGTATACTTAGTTCTATGTTTCTTGGGCTTCATGA AACTAATTTTCTCCATTTGTGCTTTCATTGATGATTATTGAAATGTTTAATCTGCTTTCGTCTTATATGCTTATGTAGAG TTCGCTTCCACTATGGTCACCCTGATGTTTTTGATCGGCTTTTTCACCTCACAAGAGGGGGTGTCAGCAAAGCCTCCAAG GTTATAAACTTGAGCGAAGATATCTTTGCTGGTAAAGTGATGTCCAATTCTTATTTGCCTTTGGTTGATACGTATCTTAA TTGGCATTTTTTTGGGGTGGTACTATCTTCATTTGAATTTTATCATGTTATTTGCAGGCTTCAACTCTACACTTCGTGAA GGAAATGTTACTCATCATGAGTACATACAAGTTGGGAAAGGGAGAGATGTGGGTCTCAACCAGATTTCTATGTTTGAAGC AAAGATAGCTAATGGCAACGGAGAGCAAACACTGAGTCGAGATGTGTACCGACTTGGGCACCGTTTTGACTTCTTCAGAA TGTTGTCCTGTTATTTCACCACAATTGGGTTTTACTTCAGTACACTTGTATGTTTCCACCAAAGTTAATTCTTATTTAAT TCTTTTTTCACAGGCTTCTCTGAACCGTTTTCTTGTACTCTTTTATGCTTGAGCAGGTAACTGTTCTGACTGTATATGTA TTCCTCTATGGTCGCCTTTATCTCGTCCTTAGTGGGCTTGAAGAAGGTTTGAGTACACAAAAAGCCATTCGAGACAATAA GCCTCTTCAAGTGGCTCTTGCCTCTCAGTCCTTTGTTCAAATTGGGTTTTTGATGGCTTTGCCTATGTTGATGGAAATTG GCTTGGAAAGGGGTTTCCGAACTGCACTTAGTGAGTTCATATTAATGCAGTTGCAGCTTGCACCAGTTTTCTTCACATTT TCACTTGGGACAAAGACTCATTATTATGGTAGGACATTGCTTCATGGAGGTGCAAAATATAGAGCTACGGGTCGGGGGTT TGTGGTTTTCCATGCTAAATTTGCTGACAACTATAGACTATACTCCCGTAGCCACTTTGTCAAGGGTATTGAGCTCATGG TTTTGCTTATTGTATACCAAATTTTTGGTCATACTTATAGAAGTGGGGTTGCATATCTTTTGATTACAATATCGATGTGG TTTATGGTTGGGACCTGGCTTTATGCTCCCTTCTTGTTCAATCCTTCTGGGTTTGAGTGGCAAAAGATTGTTGATGATTG GACCGATTGGAATAAATGGATTAGCGTCCGAGGTGGTATAGGTGTACCATCTGAAAAAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAG AGGAACAAGAGCATCTCCAATATTCAGGAATGCGCGGAATCATAGCTGAGATATTGTTATCTTTGCGGTTTTTTATCTAT CAGTATGGTCTTGTTTATCACTTGAACTTTACGAAAAAAACACAAAAAAGTTTTCTGGTAAGTGTTTACCTGTTTTTCCC TTTTTCCAACTATATATCTCACTTTTATTATTTGGCATAATGAACGGATATCTTTTTCTTGGTGACAGATCTATGGCATA TCATGGTTGGTGATCTTTCTAATACTATTTGTAATGAAGGTTAGTAGCAAGTTATTTTGTTCATAACGCATTCTTAAGAC AAACATTATGGGCTGAAACTTAGTGCCCTGCTCATTGGCTGCACATGTGGTAGGGTGTCACATATTATTTAGCAATGGAA GAAATCGATTGTTCTCTTTCTTGCCCGTGCAGATCATGTTAAAATCCTTAAATACGTCAACATTACTTTCTTATTAACCA AATTTCTGCTATCTTATTTTCTTTTTCCATGTCTCAGACGGTGTCTGTTGGGAGACGAAAATTCAGTGCAGATTTTCAAC TTGTCTTCCGGTTAATCAAGGGAATGATATTCGTGGCTTTTGTCTCGATTCTAGTCACCATGATTGCCCTTCCTCACATG ACAATGCAGGACATAATTGTTTGCATTCTTGCGTTCATGCCTACTGGTTGGGGGATGCTACAGGTGAATGCTCTTTTTCC TTTTATAGTCATTTAGTAAAAGTTTGTTATTTTGGAATGAGATGCTATAATGTCTTCGTTTTCCTTTTGCAGATTGCACA AGCATTAAAGCCTCTAGTACGCCGAGCTGGATTTTGGGGATCAGTAAAAACTCTGGCCCGTGGTTATGAGGTTGTGATGG GTTTGCTTTTGTTCACTCCAGTTGCCTTCCTGGCTTGGTTTCCTTTTGTTTCAGAATTTCAGACCCGCATGCTGTTCAAC CAAGCTTTCAGCCGAGGTTTGCAAATTTCTCGTATCCTTGGAGGCCAAAGGAAGGGACGCTCTTCTCGCAACAAGGAATA GTTTGTCTCCACACCAAAACATATGCACTTGAATCTCATTTCCTTTGTTTGCTGTAATAGCTAGAGCTATGTTTATGTTA TAGTTGTAAGTAGTAGTTGTAACTTAGAATTGGATAGATGCATAACTATATGGCCATTGTTAGTCAGAGCTAGAGAGAGC TAGGCTTTAATTTTTGTTAGTCATTGCGATCGTCAATGACTGCAATTTTTATTCAATTAAAATATGGCCATACCGAAAAG CCAAACCCGCAGATACGAATGCAACTAATTGTCCCATCTGTAAAGTTGTTTTTCACCCTTTTTAATTCCATATTATTTAT GCCCAAATCGCCGCTTTTGAATTCTTATTCCCCCCTTCTGCTATGATTTCCAGAGAGCAAGTAAGGACTTAGAGTGATGA AGACAGTAAATTAGAGAAAAAAAATTGAAATAATTTGTGGCCGAACCTAATAAGGTATTGGTTTAGTGGAGACAAGTTGG ACTTCTTTTTTTGTTACAAGACAAGTTGGACTTTTATAGAAGTAATAGACACCCTCAAATTTCAACCCGGCATTTTACAG TGAAGC 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0362200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCGTCGGAGCCGCAGCCACCGCCGCAGAGGCGGATAACGCGGACGCAGACGACAGGGAACCTCGGAGAGGCGATATT CGACAGTGAGGTTGTGCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCGCCCATTCTCCGCGTGGCTAATGAGGTTGAGAAGACGCATC CAAGAGTTGCTTATCTCTGTCGGTTCTACGCGTTCGAGAAAGCTCATAAGCTCGACCCGACTTCCAGTGGTCGCGGTGTT CGGCAATTTAAGACCGCGCTTCTTCAACGTCTTGAAAGAGAAAATGATCCAACATTGAAAGGAAGGGTAAAGAAGAGTGA TGCTCGTGAGATGCAGAGTTTTTATCAGCATTACTACAAAAAATATATTCAAGCTTTGCAAAATGCTGCTGATAAAGCTG ATCGTGCACAGCTTACCAAGGCATATCAGACTGCTAATGTTCTTTTTGAGGTTTTGAAGGCTGTTAACTTGACACAGTCT ATGGAAGTTGACCGTGAGATTTTAGAGACTCAAGATAAGGTTGCTGAGAAGACTGAGATCTTAGTTCCTTATAATATTCT TCCTCTTGATCCTGATAGTGCAAACCAGGCAATAATGAGATTTCCTGAGATTCAAGCGGCTGTATTTGCTCTGCGTAACA CTAGAGGCCTTGCTTGGCCTAAGGACTACAAGAAAAAAAAAGATGAAGACATCCTGGATTGGCTTGGGGCAATGTTTGGG TTTCAGAAGCACAATGTGGTAAATCAGAGAGAGCATTTGATCTTACTGCTTGCAAATGTGCACATTAGACAATTTCCCAA GCCGGATCAACAGCCAAAGTTGGATGAACGTGCACTGACAGAAGTGATGAAGAAACTTTTCAAGAATTACAAAAAATGGT GCAAGTATTTGGGTCGGAAGAGTAGCCTTTGGTTGCCAACCATACAACAAGAAGTGCAGCAGCGTAAATTACTATACATG GGTCTATATCTTCTAATATGGGGTGAAGCTGCTAACATAAGATTCATGCCAGAATGCCTGTGCTATATTTATCACCATAT GGCTTTTGAATTGTATGGTATGCTTGCTGGTAATGTTAGTCCAATGACGGGAGAGAATGTCAAACCCGCCTATGGAGGTG AAGAGGAGGCCTTCCTAAGGAAAGTTGTAACTCCTATATATAATGTGATTGCTAAGGAAGCTGAACGAAGCAAAAAGGGG AGGTCAAAGCATTCAGAATGGAGGAACTATGATGATTTAGATGAATATTTCTGGTCAGCTGATTGTTTTCGGCTTGGTTG GCCAATGCGTGCAGATGCTGATTTCTTTTGCCTGCCAGTTGAGCAGCTAAATTTTGATAAATCTAACGATAACAAGCCAG CTAACAGGGACAAATGGGTTGGAAAGGTCAATTTTGTTGAGATCAGGTCATTTTGGCATATTTTTCGAAGTTTTGATCGC ATGTGGGGTTTTTTCATTCTGTGCTTACAGGCAATGATTATTGTTGCTTGGAATGGATCTGGGGATCCAGGTGCAATCTT TTATGGTGATGTTTTCAAGAAGGTGCTTAGCGTATTTATAACAGCGGCTATATTAAAGCTTGGGCAAGCTATTCTGGATG TGATCCTCAGTTGGAAAGCACAACGGAGTATGTCAATGCATGTTAAGTTAAGATACATTCTGAAAGTTGTTTCAGCTGCA GCATGGGTGATTGTTCTATCAGTTACTTTTGCATATACTTGGGACAATCCTCCTGGCTTTGCTCAAACCATCCAAAGTTG GTTTGGAAGCAATTCAAGTTCGCCTTCAATGTTTATTATGGCTGTTATTGTATACCTGTCACCAAATATGCTAGCTGCCG TGTTGTTTCTCTTCCCACTCATCCGTCGTTTTCTTGAGAGGTCGAACTATAGGATTGTGATGCTAATGATGTGGTGGTCA CAGCCTCGCCTTTACATTGGTAGGGGGATGCATGAGAGCGCATTTTCCCTTTTCAAGTACACAATGTTTTGGGTTCTCCT TATAATTACAAAGTTAGCATTCAGTTACTATATAGAGATAAAACCTTTGGTGGGACCTACAAAAGCTATCATGAGTGTAA AAATCTCAACTTTCCAGTGGCATGAATTCTTTCCCCATGCTCGAAATAATCTTGGTGTTGTAGTTGCACTTTGGGCTCCG ATTATTCTGGTATATTTCATGGATACCCAGATTTGGTATGCCATATTCTCTACTTTATTTGGTGGTATTTATGGGGCATT CCGTCGCCTTGGTGAGATAAGGACCCTAGGAATGCTTAGATCTCGTTTTGAATCATTACCTGGTGCCTTTAATGCCTGTT TGATCCCAGAAGAAACGAGTGAGCCAAGGAAAAAAGGATTCAAAGCCACTTTGTCTCGTAGATTTGATCAGATCCCATCT AACAAAGGAAAAGAAGCTGCAAGATTTGCTCAACTGTGGAACCAAATAATCACTAGTTTTAGAGAGGAAGATCTGATCAG TGATAGGGAAATGAACCTTTTGCTTGTCCCTTATTGGGCTGATCGTGAGCTGGACATGATACAGTGGCCACCATTTCTAC TTGCTAGCAAGATTCCAATTGCATTGGATATGGCTAAGGATAGCAACGGAAAGGATAGAGATCTGAAAAAAAGAATTGAG GCTGACAGCTATATGTCTTGTGCTGTTCGGGAATGCTATGCTTCATTTAAAAGCATTGTTAAGTACTTGGTTCAAGGGGA TCGCGAGAAACAGGTTATAGAATACATTTTCTCTGAGGTAGACAATCATATTGAAGCTGGTGACCTAATAAGTGAATTCA GGCTGAGTGCACTTCCTAGCCTCTATGAGCAATTTGTTGAGCTAATCAAATATTTGTTAGACAATAAGCCTGAATACAGG GACCAAGTTGTGATTCTGTTCCAAGACATGCTGGAGGTGGTGACAAGAGATATAATGATGGAGGATCATATATTCAGCTT GGTAGATTCTATCCATGGTGGACCTGGGCATGATGGGATGCTTCTTCTTGAGCAACAGCACCAGTTATTTGCATCTGAAG GGGCTATCAGGTTTCCGATTGAACCAGTCACAGAAGCTTGGACGGAGAAGATAAAACGGCTTTACTTGCTGCTTACTACA AAAGAATCAGCAATGGATGTACCATCTAACTTGGAAGCCAAAAGGCGCATTTCTTTTTTCTCAAATTCACTGTTTATGGA TATGCCTACAGCACCCAAAGTTCGCAATATGCTTTCATTTTCGGTTTTAACACCATACTACACAGAAGAGGTTCTATTTT CCTTGCGCGAGCTGGAATCACCCAATGAAGATGGTGTTTCAATACTCTTCTACTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAATGG AACAACTTTCTTCAGCGAGTAAATTGTTTGAGTGAGGAGGAACTTAAAGGGAATGAATCTGACGAGTTAGAAGAAGAACT TCGTCAGTGGGCATCATACCGCGGCCAAACTTTGACCCGAACTGTGAGAGGAATGATGTACTACAGAAAAGCTTTGGAGC TCCAGGCTTTTCTTGATATGGCCAAAGATGAAGATTTGATGGAAGGCTACAAAGCCATAGAAAATTCAGACGATAACTCA AGGGGTGAAAGGTCATTGTGGTCACAATGTCAAGCAGTAGCTGATATGAAATTCTCATATGTGGTGTCATGCCAGCAATA TGGGATTGACAAGCGATCTGGCGCTGCTCGTGCACAAGACATACTGAGGCTTATGACAAGATATCCTTCACTTCGAGTTG CCTATATTGATGAGGTAGAGGAACCTAGCAAAGAGAGGCCGAAAAAAATCAACAAGGTTTATTACTCTTGCTTGGTGAAG GCTGTGCCAAAATCCAGTAGTCCTTCTGAGACAGAGCCTACACAATATTTGGACCAAGTCATATATAAAATAAAGCTTCC TGGGCCAGCTATATTGGGTGAGGGTAAACCTGAGAATCAGAACCATGCTATTATTTTCACACGTGGAGAAGGCTTGCAAA CAATAGATATGAATCAGGATAACTACATGGAAGAAGCTTTAAAAATGAGAAATTTGTTGCAAGAATTTCTGAAGAAGCAT GACGGTGTGAGATTCCCCAGTATTCTTGGACTTAGGGAGCATATATTCACTGGAAGTGTTTCTTCTCTTGCATGGTTTAT GTCTAATCAAGAGACAAGTTTTGTGACAATTGGTCAGAGATTGTTGGCTAATCCACTGAGAGTTCGCTTCCACTATGGTC ACCCTGATGTTTTTGATCGGCTTTTTCACCTCACAAGAGGGGGTGTCAGCAAAGCCTCCAAGGTTATAAACTTGAGCGAA GATATCTTTGCTGGCTTCAACTCTACACTTCGTGAAGGAAATGTTACTCATCATGAGTACATACAAGTTGGGAAAGGGAG AGATGTGGGTCTCAACCAGATTTCTATGTTTGAAGCAAAGATAGCTAATGGCAACGGAGAGCAAACACTGAGTCGAGATG TGTACCGACTTGGGCACCGTTTTGACTTCTTCAGAATGTTGTCCTGTTATTTCACCACAATTGGGTTTTACTTCAGTACA CTTGTAACTGTTCTGACTGTATATGTATTCCTCTATGGTCGCCTTTATCTCGTCCTTAGTGGGCTTGAAGAAGGTTTGAG TACACAAAAAGCCATTCGAGACAATAAGCCTCTTCAAGTGGCTCTTGCCTCTCAGTCCTTTGTTCAAATTGGGTTTTTGA TGGCTTTGCCTATGTTGATGGAAATTGGCTTGGAAAGGGGTTTCCGAACTGCACTTAGTGAGTTCATATTAATGCAGTTG CAGCTTGCACCAGTTTTCTTCACATTTTCACTTGGGACAAAGACTCATTATTATGGTAGGACATTGCTTCATGGAGGTGC AAAATATAGAGCTACGGGTCGGGGGTTTGTGGTTTTCCATGCTAAATTTGCTGACAACTATAGACTATACTCCCGTAGCC ACTTTGTCAAGGGTATTGAGCTCATGGTTTTGCTTATTGTATACCAAATTTTTGGTCATACTTATAGAAGTGGGGTTGCA TATCTTTTGATTACAATATCGATGTGGTTTATGGTTGGGACCTGGCTTTATGCTCCCTTCTTGTTCAATCCTTCTGGGTT TGAGTGGCAAAAGATTGTTGATGATTGGACCGATTGGAATAAATGGATTAGCGTCCGAGGTGGTATAGGTGTACCATCTG AAAAAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAGAGGAACAAGAGCATCTCCAATATTCAGGAATGCGCGGAATCATAGCTGAGATA TTGTTATCTTTGCGGTTTTTTATCTATCAGTATGGTCTTGTTTATCACTTGAACTTTACGAAAAAAACACAAAAAAGTTT TCTGATCTATGGCATATCATGGTTGGTGATCTTTCTAATACTATTTGTAATGAAGACGGTGTCTGTTGGGAGACGAAAAT TCAGTGCAGATTTTCAACTTGTCTTCCGGTTAATCAAGGGAATGATATTCGTGGCTTTTGTCTCGATTCTAGTCACCATG ATTGCCCTTCCTCACATGACAATGCAGGACATAATTGTTTGCATTCTTGCGTTCATGCCTACTGGTTGGGGGATGCTACA GATTGCACAAGCATTAAAGCCTCTAGTACGCCGAGCTGGATTTTGGGGATCAGTAAAAACTCTGGCCCGTGGTTATGAGG TTGTGATGGGTTTGCTTTTGTTCACTCCAGTTGCCTTCCTGGCTTGGTTTCCTTTTGTTTCAGAATTTCAGACCCGCATG CTGTTCAACCAAGCTTTCAGCCGAGGTTTGCAAATTTCTCGTATCCTTGGAGGCCAAAGGAAGGGACGCTCTTCTCGCAA CAAGGAATAG 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0362200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSSEPQPPPQRRITRTQTTGNLGEAIFDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEKTHPRVAYLCRFYAFEKAHKLDPTSSGRGV RQFKTALLQRLERENDPTLKGRVKKSDAREMQSFYQHYYKKYIQALQNAADKADRAQLTKAYQTANVLFEVLKAVNLTQS MEVDREILETQDKVAEKTEILVPYNILPLDPDSANQAIMRFPEIQAAVFALRNTRGLAWPKDYKKKKDEDILDWLGAMFG FQKHNVVNQREHLILLLANVHIRQFPKPDQQPKLDERALTEVMKKLFKNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEVQQRKLLYM GLYLLIWGEAANIRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGNVSPMTGENVKPAYGGEEEAFLRKVVTPIYNVIAKEAERSKKG RSKHSEWRNYDDLDEYFWSADCFRLGWPMRADADFFCLPVEQLNFDKSNDNKPANRDKWVGKVNFVEIRSFWHIFRSFDR MWGFFILCLQAMIIVAWNGSGDPGAIFYGDVFKKVLSVFITAAILKLGQAILDVILSWKAQRSMSMHVKLRYILKVVSAA AWVIVLSVTFAYTWDNPPGFAQTIQSWFGSNSSSPSMFIMAVIVYLSPNMLAAVLFLFPLIRRFLERSNYRIVMLMMWWS QPRLYIGRGMHESAFSLFKYTMFWVLLIITKLAFSYYIEIKPLVGPTKAIMSVKISTFQWHEFFPHARNNLGVVVALWAP IILVYFMDTQIWYAIFSTLFGGIYGAFRRLGEIRTLGMLRSRFESLPGAFNACLIPEETSEPRKKGFKATLSRRFDQIPS NKGKEAARFAQLWNQIITSFREEDLISDREMNLLLVPYWADRELDMIQWPPFLLASKIPIALDMAKDSNGKDRDLKKRIE ADSYMSCAVRECYASFKSIVKYLVQGDREKQVIEYIFSEVDNHIEAGDLISEFRLSALPSLYEQFVELIKYLLDNKPEYR DQVVILFQDMLEVVTRDIMMEDHIFSLVDSIHGGPGHDGMLLLEQQHQLFASEGAIRFPIEPVTEAWTEKIKRLYLLLTT KESAMDVPSNLEAKRRISFFSNSLFMDMPTAPKVRNMLSFSVLTPYYTEEVLFSLRELESPNEDGVSILFYLQKIFPDEW NNFLQRVNCLSEEELKGNESDELEEELRQWASYRGQTLTRTVRGMMYYRKALELQAFLDMAKDEDLMEGYKAIENSDDNS RGERSLWSQCQAVADMKFSYVVSCQQYGIDKRSGAARAQDILRLMTRYPSLRVAYIDEVEEPSKERPKKINKVYYSCLVK AVPKSSSPSETEPTQYLDQVIYKIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEALKMRNLLQEFLKKH DGVRFPSILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTIGQRLLANPLRVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVINLSE DIFAGFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTLSRDVYRLGHRFDFFRMLSCYFTTIGFYFST LVTVLTVYVFLYGRLYLVLSGLEEGLSTQKAIRDNKPLQVALASQSFVQIGFLMALPMLMEIGLERGFRTALSEFILMQL QLAPVFFTFSLGTKTHYYGRTLLHGGAKYRATGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELMVLLIVYQIFGHTYRSGVA YLLITISMWFMVGTWLYAPFLFNPSGFEWQKIVDDWTDWNKWISVRGGIGVPSEKSWESWWEEEQEHLQYSGMRGIIAEI LLSLRFFIYQYGLVYHLNFTKKTQKSFLIYGISWLVIFLILFVMKTVSVGRRKFSADFQLVFRLIKGMIFVAFVSILVTM IALPHMTMQDIIVCILAFMPTGWGMLQIAQALKPLVRRAGFWGSVKTLARGYEVVMGLLLFTPVAFLAWFPFVSEFQTRM LFNQAFSRGLQISRILGGQRKGRSSRNKE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 480 480 -
MobiDBLite 1 20 20 -
PANTHER 6 1945 1940 0.0
PANTHER 6 1945 1940 0.0
Gene3D 24 177 154 3.7E-19
Pfam 39 167 129 4.6E-22
Coils 119 139 21 -
SMART 314 430 117 8.0E-72
Pfam 316 428 113 6.4E-37
Phobius 481 498 18 -
TMHMM 482 501 20 -
Phobius 499 517 19 -
TMHMM 516 538 23 -
Phobius 518 540 23 -
Phobius 541 551 11 -
TMHMM 550 572 23 -
Phobius 552 574 23 -
Phobius 575 593 19 -
Phobius 594 618 25 -
TMHMM 599 621 23 -
Phobius 619 629 11 -
Phobius 630 646 17 -
Phobius 647 657 11 -
TMHMM 656 678 23 -
Phobius 658 678 21 -
Phobius 679 708 30 -
TMHMM 704 726 23 -
Phobius 709 726 18 -
Phobius 727 731 5 -
TMHMM 731 748 18 -
Phobius 732 751 20 -
Phobius 752 1508 757 -
Pfam 1047 1761 715 8.6E-242
Phobius 1509 1531 23 -
TMHMM 1510 1532 23 -
Phobius 1532 1559 28 -
TMHMM 1558 1580 23 -
Phobius 1560 1579 20 -
Phobius 1580 1590 11 -
Phobius 1591 1612 22 -
TMHMM 1595 1612 18 -
Phobius 1613 1653 41 -
TMHMM 1653 1675 23 -
Phobius 1654 1671 18 -
Phobius 1672 1677 6 -
Phobius 1678 1698 21 -
TMHMM 1679 1701 23 -
Phobius 1699 1755 57 -
TMHMM 1755 1777 23 -
Phobius 1756 1775 20 -
Phobius 1776 1786 11 -
Phobius 1787 1804 18 -
TMHMM 1787 1809 23 -
Phobius 1805 1823 19 -
TMHMM 1821 1843 23 -
Phobius 1824 1844 21 -
Phobius 1845 1850 6 -
TMHMM 1848 1870 23 -
Phobius 1851 1872 22 -
Phobius 1873 1891 19 -
TMHMM 1891 1913 23 -
Phobius 1892 1913 22 -
Phobius 1914 1949 36 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component 1,3-beta-D-glucan synthase complex A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain.
Molecular function 1,3-beta-D-glucan synthase activity Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1).
Biological process (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0362200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…