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LotjaGi5g1v0362200.5

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0362200
Transcript ID LotjaGi5g1v0362200.5
Related isoforms 5
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Callose synthase; TAIR: AT5G13000.1 glucan synthase-like 12; Swiss-Prot: sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RX23|A0A151RX23_CAJCA Callose synthase 3; Found in the gene: LotjaGi5g1v0362200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:67602892..67616180) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTCTGCCGGAGAATGTCGTCGGAGCCGCAGCCACCGCCGCAGAGGCGGATAACGCGGACGCAGACGACAGGGAACCTCGG AGAGGCGATATTCGACAGTGAGGTTGTGCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCGCCCATTCTCCGCGTGGCTAATGAGGTTG AGAAGACGCATCCAAGAGTTGCTTATCTCTGTGAGTTCATCTTACTTATCCTCCATGCAACCGCATTGCACAATGTGTTT CTATTTTGAGAGGGTTTGTGTTTCTCTTGCTCTTGCAGGTCGGTTCTACGCGTTCGAGAAAGCTCATAAGCTCGACCCGA CTTCCAGTGGTCGCGGTGTTCGGCAATTTAAGACCGCGCTTCTTCAACGTCTTGAAAGAGTAAGCATTTTGATCCATAGC TTCTAAGAATGCAAACTGTCAAATCTTCTTATTTAGTAACCTCTAGCTGTTATGTAATGATTGGAATCAATGTTGTCCCA TTTTTGTTAGGAAAATGATCCAACATTGAAAGGAAGGGTAAAGAAGAGTGATGCTCGTGAGATGCAGAGTTTTTATCAGC ATTACTACAAAAAATATATTCAAGCTTTGCAAAATGCTGCTGATAAAGCTGATCGGTACATTGTCTGGATAATGTGTAAT ATGATAAATATGTTCTGTGCCTGTTGTGTGACTAGAGTGTGTTTGTATTATTACTTTCAGTGCACAGCTTACCAAGGCAT ATCAGACTGCTAATGTTCTTTTTGAGGTTTTGAAGGCTGTTAACTTGACACAGTCTATGGAAGTTGACCGTGAGGTAGTT TTTTCCTCACTTCCAAGTTCTCATCTTTCTATTTGGTTTCCTCTTTTTATGTGTACCTTTAACCATATTTGAAATTAGTT GATTATAATAGAGTTCACTTTAAAATTTTGACCTTCACCTGTTACCGACTCATGGTTGGTTTTCTGTTCCCACTGTAACA 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0362200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCGTCGGAGCCGCAGCCACCGCCGCAGAGGCGGATAACGCGGACGCAGACGACAGGGAACCTCGGAGAGGCGATATT CGACAGTGAGGTTGTGCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCGCCCATTCTCCGCGTGGCTAATGAGGTTGAGAAGACGCATC CAAGAGTTGCTTATCTCTGTCGGTTCTACGCGTTCGAGAAAGCTCATAAGCTCGACCCGACTTCCAGTGGTCGCGGTGTT CGGCAATTTAAGACCGCGCTTCTTCAACGTCTTGAAAGAGAAAATGATCCAACATTGAAAGGAAGGGTAAAGAAGAGTGA TGCTCGTGAGATGCAGAGTTTTTATCAGCATTACTACAAAAAATATATTCAAGCTTTGCAAAATGCTGCTGATAAAGCTG ATCGTGCACAGCTTACCAAGGCATATCAGACTGCTAATGTTCTTTTTGAGGTTTTGAAGGCTGTTAACTTGACACAGTCT ATGGAAGTTGACCGTGAGATTTTAGAGACTCAAGATAAGGTTGCTGAGAAGACTGAGATCTTAGTTCCTTATAATATTCT TCCTCTTGATCCTGATAGTGCAAACCAGGCAATAATGAGATTTCCTGAGATTCAAGCGGCTGTATTTGCTCTGCGTAACA CTAGAGGCCTTGCTTGGCCTAAGGACTACAAGAAAAAAAAAGATGAAGACATCCTGGATTGGCTTGGGGCAATGTTTGGG TTTCAGAAGCACAATGTGGTAAATCAGAGAGAGCATTTGATCTTACTGCTTGCAAATGTGCACATTAGACAATTTCCCAA GCCGGATCAACAGCCAAAGTTGGATGAACGTGCACTGACAGAAGTGATGAAGAAACTTTTCAAGAATTACAAAAAATGGT GCAAGTATTTGGGTCGGAAGAGTAGCCTTTGGTTGCCAACCATACAACAAGAAGTGCAGCAGCGTAAATTACTATACATG 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GTGAAGGCTGTGCCAAAATCCAGTAGTCCTTCTGAGACAGAGCCTACACAATATTTGGACCAAGTCATATATAAAATAAA GCTTCCTGGGCCAGCTATATTGGGTGAGGGTAAACCTGAGAATCAGAACCATGCTATTATTTTCACACGTGGAGAAGGCT TGCAAACAATAGATATGAATCAGGATAACTACATGGAAGAAGCTTTAAAAATGAGAAATTTGTTGCAAGAATTTCTGAAG AAGCATGACGGTGTGAGATTCCCCAGTATTCTTGGACTTAGGGAGCATATATTCACTGGAAGTGTTTCTTCTCTTGCATG GTTTATGTCTAATCAAGAGACAAGTTTTGTGACAATTGGTCAGAGATTGTTGGCTAATCCACTGAGAGTTCGCTTCCACT ATGGTCACCCTGATGTTTTTGATCGGCTTTTTCACCTCACAAGAGGGGGTGTCAGCAAAGCCTCCAAGGTTATAAACTTG AGCGAAGATATCTTTGCTGGCTTCAACTCTACACTTCGTGAAGGAAATGTTACTCATCATGAGTACATACAAGTTGGGAA AGGGAGAGATGTGGGTCTCAACCAGATTTCTATGTTTGAAGCAAAGATAGCTAATGGCAACGGAGAGCAAACACTGAGTC GAGATGTGTACCGACTTGGGCACCGTTTTGACTTCTTCAGAATGTTGTCCTGTTATTTCACCACAATTGGGTTTTACTTC AGTACACTTGTAACTGTTCTGACTGTATATGTATTCCTCTATGGTCGCCTTTATCTCGTCCTTAGTGGGCTTGAAGAAGG TTTGAGTACACAAAAAGCCATTCGAGACAATAAGCCTCTTCAAGTGGCTCTTGCCTCTCAGTCCTTTGTTCAAATTGGGT TTTTGATGGCTTTGCCTATGTTGATGGAAATTGGCTTGGAAAGGGGTTTCCGAACTGCACTTAGTGAGTTCATATTAATG CAGTTGCAGCTTGCACCAGTTTTCTTCACATTTTCACTTGGGACAAAGACTCATTATTATGGTAGGACATTGCTTCATGG AGGTGCAAAATATAGAGCTACGGGTCGGGGGTTTGTGGTTTTCCATGCTAAATTTGCTGACAACTATAGACTATACTCCC GTAGCCACTTTGTCAAGGGTATTGAGCTCATGGTTTTGCTTATTGTATACCAAATTTTTGGTCATACTTATAGAAGTGGG GTTGCATATCTTTTGATTACAATATCGATGTGGTTTATGGTTGGGACCTGGCTTTATGCTCCCTTCTTGTTCAATCCTTC TGGGTTTGAGTGGCAAAAGATTGTTGATGATTGGACCGATTGGAATAAATGGATTAGCGTCCGAGGTGGTATAGGTGTAC CATCTGAAAAAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAGAGGAACAAGAGCATCTCCAATATTCAGGAATGCGCGGAATCATAGCT GAGATATTGTTATCTTTGCGGTTTTTTATCTATCAGTATGGTCTTGTTTATCACTTGAACTTTACGAAAAAAACACAAAA AAGTTTTCTGATCTATGGCATATCATGGTTGGTGATCTTTCTAATACTATTTGTAATGAAGAACCAAATTTCTGCTATCT TATTTTCTTTTTCCATGTCTCAGACGGTGTCTGTTGGGAGACGAAAATTCAGTGCAGATTTTCAACTTGTCTTCCGGTTA ATCAAGGGAATGATATTCGTGGCTTTTGTCTCGATTCTAGTCACCATGATTGCCCTTCCTCACATGACAATGCAGGACAT AATTGTTTGCATTCTTGCGTTCATGCCTACTGGTTGGGGGATGCTACAGATTGCACAAGCATTAAAGCCTCTAGTACGCC GAGCTGGATTTTGGGGATCAGTAAAAACTCTGGCCCGTGGTTATGAGGTTGTGATGGGTTTGCTTTTGTTCACTCCAGTT GCCTTCCTGGCTTGGTTTCCTTTTGTTTCAGAATTTCAGACCCGCATGCTGTTCAACCAAGCTTTCAGCCGAGGTTTGCA AATTTCTCGTATCCTTGGAGGCCAAAGGAAGGGACGCTCTTCTCGCAACAAGGAATAG 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0362200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSSEPQPPPQRRITRTQTTGNLGEAIFDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEKTHPRVAYLCRFYAFEKAHKLDPTSSGRGV RQFKTALLQRLERENDPTLKGRVKKSDAREMQSFYQHYYKKYIQALQNAADKADRAQLTKAYQTANVLFEVLKAVNLTQS MEVDREILETQDKVAEKTEILVPYNILPLDPDSANQAIMRFPEIQAAVFALRNTRGLAWPKDYKKKKDEDILDWLGAMFG FQKHNVVNQREHLILLLANVHIRQFPKPDQQPKLDERALTEVMKKLFKNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEVQQRKLLYM GLYLLIWGEAANIRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGNVSPMTGENVKPAYGGEEEAFLRKVVTPIYNVIAKEAERSKKG RSKHSEWRNYDDLDEYFWSADCFRLGWPMRADADFFCLPVEQLNFDKSNDNKPANRDKWVGKVNFVEIRSFWHIFRSFDR MWGFFILCLQAMIIVAWNGSGDPGAIFYGDVFKKVLSVFITAAILKLGQAILDVILSWKAQRSMSMHVKLRYILKVVSAA AWVIVLSVTFAYTWDNPPGFAQTIQSWFGSNSSSPSMFIMAVIVYLSPNMLAAVLFLFPLIRRFLERSNYRIVMLMMWWS QPRLYIGRGMHESAFSLFKYTMFWVLLIITKLAFSYYIEIKPLVGPTKAIMSVKISTFQWHEFFPHGTRNNLGVVVALWA PIILVYFMDTQIWYAIFSTLFGGIYGAFRRLGEIRTLGMLRSRFESLPGAFNACLIPEETSEPRKKGFKATLSRRFDQIP SNKGKEAARFAQLWNQIITSFREEDLISDRWEMNLLLVPYWADRELDMIQWPPFLLASKIPIALDMAKDSNGKDRDLKKR IEADSYMSCAVRECYASFKSIVKYLVQGDREKQVIEYIFSEVDNHIEAGDLISEFRLSALPSLYEQFVELIKYLLDNKPE YRDQVVILFQDMLEVVTRDIMMEDHIFSLVDSIHGGPGHDGMLLLEQQHQLFASEGAIRFPIEPVTEAWTEKIKRLYLLL TTKESAMDVPSNLEAKRRISFFSNSLFMDMPTAPKVRNMLSFSVLTPYYTEEVLFSLRELESPNEDGVSILFYLQKIFPD EWNNFLQRVNCLSEEELKGNESDELEEELRQWASYRGQTLTRTVRGMMYYRKALELQAFLDMAKDEDLMEGYKAIENSDD NSRGERSLWSQCQAVADMKFSYVVSCQQYGIDKRSGAARAQDILRLMTRYPSLRVAYIDEVEEPSKERPKKINKVYYSCL VKAVPKSSSPSETEPTQYLDQVIYKIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEALKMRNLLQEFLK KHDGVRFPSILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTIGQRLLANPLRVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVINL SEDIFAGFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTLSRDVYRLGHRFDFFRMLSCYFTTIGFYF STLVTVLTVYVFLYGRLYLVLSGLEEGLSTQKAIRDNKPLQVALASQSFVQIGFLMALPMLMEIGLERGFRTALSEFILM QLQLAPVFFTFSLGTKTHYYGRTLLHGGAKYRATGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELMVLLIVYQIFGHTYRSG VAYLLITISMWFMVGTWLYAPFLFNPSGFEWQKIVDDWTDWNKWISVRGGIGVPSEKSWESWWEEEQEHLQYSGMRGIIA EILLSLRFFIYQYGLVYHLNFTKKTQKSFLIYGISWLVIFLILFVMKNQISAILFSFSMSQTVSVGRRKFSADFQLVFRL IKGMIFVAFVSILVTMIALPHMTMQDIIVCILAFMPTGWGMLQIAQALKPLVRRAGFWGSVKTLARGYEVVMGLLLFTPV AFLAWFPFVSEFQTRMLFNQAFSRGLQISRILGGQRKGRSSRNKE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 20 20 -
Phobius 1 480 480 -
PANTHER 6 1961 1956 0.0
PANTHER 6 1961 1956 0.0
Gene3D 24 177 154 3.7E-19
Pfam 39 166 128 4.7E-22
Coils 119 139 21 -
SMART 314 430 117 8.0E-72
Pfam 316 428 113 6.5E-37
Phobius 481 498 18 -
TMHMM 482 501 20 -
Phobius 499 517 19 -
TMHMM 516 538 23 -
Phobius 518 540 23 -
Phobius 541 551 11 -
TMHMM 550 572 23 -
Phobius 552 574 23 -
Phobius 575 593 19 -
Phobius 594 618 25 -
TMHMM 599 621 23 -
Phobius 619 629 11 -
Phobius 630 646 17 -
Phobius 647 657 11 -
TMHMM 656 678 23 -
Phobius 658 678 21 -
Phobius 679 709 31 -
TMHMM 710 727 18 -
Phobius 710 727 18 -
Phobius 728 732 5 -
TMHMM 732 749 18 -
Phobius 733 752 20 -
Phobius 753 1510 758 -
Pfam 1049 1760 712 2.1E-241
Phobius 1511 1533 23 -
TMHMM 1512 1534 23 -
Phobius 1534 1561 28 -
TMHMM 1560 1582 23 -
Phobius 1562 1581 20 -
Phobius 1582 1592 11 -
Phobius 1593 1614 22 -
TMHMM 1597 1614 18 -
Phobius 1615 1655 41 -
Phobius 1656 1673 18 -
Phobius 1674 1679 6 -
Phobius 1680 1700 21 -
TMHMM 1681 1703 23 -
Phobius 1701 1757 57 -
Phobius 1758 1777 20 -
TMHMM 1759 1781 23 -
Phobius 1778 1788 11 -
TMHMM 1788 1810 23 -
Phobius 1789 1817 29 -
Phobius 1818 1836 19 -
Phobius 1837 1860 24 -
TMHMM 1838 1860 23 -
Phobius 1861 1866 6 -
TMHMM 1867 1887 21 -
Phobius 1867 1888 22 -
Phobius 1889 1907 19 -
TMHMM 1907 1929 23 -
Phobius 1908 1929 22 -
Phobius 1930 1965 36 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component 1,3-beta-D-glucan synthase complex A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain.
Molecular function 1,3-beta-D-glucan synthase activity Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1).
Biological process (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0362200.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…