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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0362200 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0362200.2 |
Related isoforms 5 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Callose synthase; TAIR: AT5G13000.1 glucan synthase-like 12; Swiss-Prot: sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RX23|A0A151RX23_CAJCA Callose synthase 3; Found in the gene: LotjaGi5g1v0362200 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:67602880..67616180) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGACTCAGTCATTCTGCCGGAGAATGTCGTCGGAGCCGCAGCCACCGCCGCAGAGGCGGATAACGCGGACGCAGACGAC AGGGAACCTCGGAGAGGCGATATTCGACAGTGAGGTTGTGCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCGCCCATTCTCCGCGTGG CTAATGAGGTTGAGAAGACGCATCCAAGAGTTGCTTATCTCTGTGAGTTCATCTTACTTATCCTCCATGCAACCGCATTG CACAATGTGTTTCTATTTTGAGAGGGTTTGTGTTTCTCTTGCTCTTGCAGGTCGGTTCTACGCGTTCGAGAAAGCTCATA AGCTCGACCCGACTTCCAGTGGTCGCGGTGTTCGGCAATTTAAGACCGCGCTTCTTCAACGTCTTGAAAGAGTAAGCATT TTGATCCATAGCTTCTAAGAATGCAAACTGTCAAATCTTCTTATTTAGTAACCTCTAGCTGTTATGTAATGATTGGAATC AATGTTGTCCCATTTTTGTTAGGAAAATGATCCAACATTGAAAGGAAGGGTAAAGAAGAGTGATGCTCGTGAGATGCAGA GTTTTTATCAGCATTACTACAAAAAATATATTCAAGCTTTGCAAAATGCTGCTGATAAAGCTGATCGGTACATTGTCTGG ATAATGTGTAATATGATAAATATGTTCTGTGCCTGTTGTGTGACTAGAGTGTGTTTGTATTATTACTTTCAGTGCACAGC TTACCAAGGCATATCAGACTGCTAATGTTCTTTTTGAGGTTTTGAAGGCTGTTAACTTGACACAGTCTATGGAAGTTGAC CGTGAGGTAGTTTTTTCCTCACTTCCAAGTTCTCATCTTTCTATTTGGTTTCCTCTTTTTATGTGTACCTTTAACCATAT TTGAAATTAGTTGATTATAATAGAGTTCACTTTAAAATTTTGACCTTCACCTGTTACCGACTCATGGTTGGTTTTCTGTT 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0362200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCGTCGGAGCCGCAGCCACCGCCGCAGAGGCGGATAACGCGGACGCAGACGACAGGGAACCTCGGAGAGGCGATATT CGACAGTGAGGTTGTGCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCGCCCATTCTCCGCGTGGCTAATGAGGTTGAGAAGACGCATC CAAGAGTTGCTTATCTCTGTCGGTTCTACGCGTTCGAGAAAGCTCATAAGCTCGACCCGACTTCCAGTGGTCGCGGTGTT CGGCAATTTAAGACCGCGCTTCTTCAACGTCTTGAAAGAGAAAATGATCCAACATTGAAAGGAAGGGTAAAGAAGAGTGA TGCTCGTGAGATGCAGAGTTTTTATCAGCATTACTACAAAAAATATATTCAAGCTTTGCAAAATGCTGCTGATAAAGCTG ATCGTGCACAGCTTACCAAGGCATATCAGACTGCTAATGTTCTTTTTGAGGTTTTGAAGGCTGTTAACTTGACACAGTCT ATGGAAGTTGACCGTGAGATTTTAGAGACTCAAGATAAGGTTGCTGAGAAGACTGAGATCTTAGTTCCTTATAATATTCT TCCTCTTGATCCTGATAGTGCAAACCAGGCAATAATGAGATTTCCTGAGATTCAAGCGGCTGTATTTGCTCTGCGTAACA CTAGAGGCCTTGCTTGGCCTAAGGACTACAAGAAAAAAAAAGATGAAGACATCCTGGATTGGCTTGGGGCAATGTTTGGG TTTCAGAAGCACAATGTGGTAAATCAGAGAGAGCATTTGATCTTACTGCTTGCAAATGTGCACATTAGACAATTTCCCAA GCCGGATCAACAGCCAAAGTTGGATGAACGTGCACTGACAGAAGTGATGAAGAAACTTTTCAAGAATTACAAAAAATGGT GCAAGTATTTGGGTCGGAAGAGTAGCCTTTGGTTGCCAACCATACAACAAGAAGTGCAGCAGCGTAAATTACTATACATG 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AGGGACCAAGTTGTGATTCTGTTCCAAGACATGCTGGAGGTGGTGACAAGAGATATAATGATGGAGGATCATATATTCAG CTTGGTAGATTCTATCCATGGTGGACCTGGGCATGATGGGATGCTTCTTCTTGAGCAACAGCACCAGTTATTTGCATCTG AAGGGGCTATCAGGTTTCCGATTGAACCAGTCACAGAAGCTTGGACGGAGAAGATAAAACGGCTTTACTTGCTGCTTACT ACAAAAGAATCAGCAATGGATGTACCATCTAACTTGGAAGCCAAAAGGCGCATTTCTTTTTTCTCAAATTCACTGTTTAT GGATATGCCTACAGCACCCAAAGTTCGCAATATGCTTTCATTTTCGGTTTTAACACCATACTACACAGAAGAGGTTCTAT TTTCCTTGCGCGAGCTGGAATCACCCAATGAAGATGGTGTTTCAATACTCTTCTACTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAA TGGAACAACTTTCTTCAGCGAGTAAATTGTTTGAGTGAGGAGGAACTTAAAGGGAATGAATCTGACGAGTTAGAAGAAGA ACTTCGTCAGTGGGCATCATACCGCGGCCAAACTTTGACCCGAACTGTGAGAGGAATGATGTACTACAGAAAAGCTTTGG AGCTCCAGGCTTTTCTTGATATGGCCAAAGATGAAGATTTGATGGAAGGCTACAAAGCCATAGAAAATTCAGACGATAAC TCAAGGGGTGAAAGGTCATTGTGGTCACAATGTCAAGCAGTAGCTGATATGAAATTCTCATATGTGGTGTCATGCCAGCA ATATGGGATTGACAAGCGATCTGGCGCTGCTCGTGCACAAGACATACTGAGGCTTATGACAAGATATCCTTCACTTCGAG TTGCCTATATTGATGAGGTAGAGGAACCTAGCAAAGAGAGGCCGAAAAAAATCAACAAGGTTTATTACTCTTGCTTGGTG AAGGCTGTGCCAAAATCCAGTAGTCCTTCTGAGACAGAGCCTACACAATATTTGGACCAAGTCATATATAAAATAAAGCT TCCTGGGCCAGCTATATTGGGTGAGGGTAAACCTGAGAATCAGAACCATGCTATTATTTTCACACGTGGAGAAGGCTTGC AAACAATAGATATGAATCAGGATAACTACATGGAAGAAGCTTTAAAAATGAGAAATTTGTTGCAAGAATTTCTGAAGAAG CATGACGGTGTGAGATTCCCCAGTATTCTTGGACTTAGGGAGCATATATTCACTGGAAGTGTTTCTTCTCTTGCATGGTT TATGTCTAATCAAGAGACAAGTTTTGTGACAATTGGTCAGAGATTGTTGGCTAATCCACTGAGAGTTCGCTTCCACTATG GTCACCCTGATGTTTTTGATCGGCTTTTTCACCTCACAAGAGGGGGTGTCAGCAAAGCCTCCAAGGTTATAAACTTGAGC GAAGATATCTTTGCTGGCTTCAACTCTACACTTCGTGAAGGAAATGTTACTCATCATGAGTACATACAAGTTGGGAAAGG GAGAGATGTGGGTCTCAACCAGATTTCTATGTTTGAAGCAAAGATAGCTAATGGCAACGGAGAGCAAACACTGAGTCGAG ATGTGTACCGACTTGGGCACCGTTTTGACTTCTTCAGAATGTTGTCCTGTTATTTCACCACAATTGGGTTTTACTTCAGT ACACTTGTAACTGTTCTGACTGTATATGTATTCCTCTATGGTCGCCTTTATCTCGTCCTTAGTGGGCTTGAAGAAGGTTT GAGTACACAAAAAGCCATTCGAGACAATAAGCCTCTTCAAGTGGCTCTTGCCTCTCAGTCCTTTGTTCAAATTGGGTTTT TGATGGCTTTGCCTATGTTGATGGAAATTGGCTTGGAAAGGGGTTTCCGAACTGCACTTAGTGAGTTCATATTAATGCAG TTGCAGCTTGCACCAGTTTTCTTCACATTTTCACTTGGGACAAAGACTCATTATTATGGTAGGACATTGCTTCATGGAGG TGCAAAATATAGAGCTACGGGTCGGGGGTTTGTGGTTTTCCATGCTAAATTTGCTGACAACTATAGACTATACTCCCGTA GCCACTTTGTCAAGGGTATTGAGCTCATGGTTTTGCTTATTGTATACCAAATTTTTGGTCATACTTATAGAAGTGGGGTT GCATATCTTTTGATTACAATATCGATGTGGTTTATGGTTGGGACCTGGCTTTATGCTCCCTTCTTGTTCAATCCTTCTGG GTTTGAGTGGCAAAAGATTGTTGATGATTGGACCGATTGGAATAAATGGATTAGCGTCCGAGGTGGTATAGGTGTACCAT CTGAAAAAAGTTGGGAATCCTGGTGGGAAGAGGAACAAGAGCATCTCCAATATTCAGGAATGCGCGGAATCATAGCTGAG ATATTGTTATCTTTGCGGTTTTTTATCTATCAGTATGGTCTTGTTTATCACTTGAACTTTACGAAAAAAACACAAAAAAG TTTTCTGATCTATGGCATATCATGGTTGGTGATCTTTCTAATACTATTTGTAATGAAGACGGTGTCTGTTGGGAGACGAA AATTCAGTGCAGATTTTCAACTTGTCTTCCGGTTAATCAAGGGAATGATATTCGTGGCTTTTGTCTCGATTCTAGTCACC ATGATTGCCCTTCCTCACATGACAATGCAGGACATAATTGTTTGCATTCTTGCGTTCATGCCTACTGGTTGGGGGATGCT ACAGATTGCACAAGCATTAAAGCCTCTAGTACGCCGAGCTGGATTTTGGGGATCAGTAAAAACTCTGGCCCGTGGTTATG AGGTTGTGATGGGTTTGCTTTTGTTCACTCCAGTTGCCTTCCTGGCTTGGTTTCCTTTTGTTTCAGAATTTCAGACCCGC ATGCTGTTCAACCAAGCTTTCAGCCGAGGTTTGCAAATTTCTCGTATCCTTGGAGGCCAAAGGAAGGGACGCTCTTCTCG CAACAAGGAATAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0362200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSEPQPPPQRRITRTQTTGNLGEAIFDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEKTHPRVAYLCRFYAFEKAHKLDPTSSGRGV RQFKTALLQRLERENDPTLKGRVKKSDAREMQSFYQHYYKKYIQALQNAADKADRAQLTKAYQTANVLFEVLKAVNLTQS MEVDREILETQDKVAEKTEILVPYNILPLDPDSANQAIMRFPEIQAAVFALRNTRGLAWPKDYKKKKDEDILDWLGAMFG FQKHNVVNQREHLILLLANVHIRQFPKPDQQPKLDERALTEVMKKLFKNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEVQQRKLLYM GLYLLIWGEAANIRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGNVSPMTGENVKPAYGGEEEAFLRKVVTPIYNVIAKEAERSKKG RSKHSEWRNYDDLDEYFWSADCFRLGWPMRADADFFCLPVEQLNFDKSNDNKPANRDKWVGKVNFVEIRSFWHIFRSFDR MWGFFILCLQAMIIVAWNGSGDPGAIFYGDVFKKVLSVFITAAILKLGQAILDVILSWKAQRSMSMHVKLRYILKVVSAA AWVIVLSVTFAYTWDNPPGFAQTIQSWFGSNSSSPSMFIMAVIVYLSPNMLAAVLFLFPLIRRFLERSNYRIVMLMMWWS QPRLYIGRGMHESAFSLFKYTMFWVLLIITKLAFSYYIEIKPLVGPTKAIMSVKISTFQWHEFFPHGTRNNLGVVVALWA PIILVYFMDTQIWYAIFSTLFGGIYGAFRRLGEIRTLGMLRSRFESLPGAFNACLIPEETSEPRKKGFKATLSRRFDQIP SNKGKEAARFAQLWNQIITSFREEDLISDREMNLLLVPYWADRELDMIQWPPFLLASKIPIALDMAKDSNGKDRDLKKRI EADSYMSCAVRECYASFKSIVKYLVQGDREKQVIEYIFSEVDNHIEAGDLISEFRLSALPSLYEQFVELIKYLLDNKPEY RDQVVILFQDMLEVVTRDIMMEDHIFSLVDSIHGGPGHDGMLLLEQQHQLFASEGAIRFPIEPVTEAWTEKIKRLYLLLT TKESAMDVPSNLEAKRRISFFSNSLFMDMPTAPKVRNMLSFSVLTPYYTEEVLFSLRELESPNEDGVSILFYLQKIFPDE WNNFLQRVNCLSEEELKGNESDELEEELRQWASYRGQTLTRTVRGMMYYRKALELQAFLDMAKDEDLMEGYKAIENSDDN SRGERSLWSQCQAVADMKFSYVVSCQQYGIDKRSGAARAQDILRLMTRYPSLRVAYIDEVEEPSKERPKKINKVYYSCLV KAVPKSSSPSETEPTQYLDQVIYKIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEALKMRNLLQEFLKK HDGVRFPSILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTIGQRLLANPLRVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVINLS EDIFAGFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTLSRDVYRLGHRFDFFRMLSCYFTTIGFYFS TLVTVLTVYVFLYGRLYLVLSGLEEGLSTQKAIRDNKPLQVALASQSFVQIGFLMALPMLMEIGLERGFRTALSEFILMQ LQLAPVFFTFSLGTKTHYYGRTLLHGGAKYRATGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELMVLLIVYQIFGHTYRSGV AYLLITISMWFMVGTWLYAPFLFNPSGFEWQKIVDDWTDWNKWISVRGGIGVPSEKSWESWWEEEQEHLQYSGMRGIIAE ILLSLRFFIYQYGLVYHLNFTKKTQKSFLIYGISWLVIFLILFVMKTVSVGRRKFSADFQLVFRLIKGMIFVAFVSILVT MIALPHMTMQDIIVCILAFMPTGWGMLQIAQALKPLVRRAGFWGSVKTLARGYEVVMGLLLFTPVAFLAWFPFVSEFQTR MLFNQAFSRGLQISRILGGQRKGRSSRNKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
MobiDBLite | 1 | 20 | 20 | - | – | |
Phobius | 1 | 480 | 480 | - | – | |
PANTHER | 6 | 1946 | 1941 | 0.0 | ||
PANTHER | 6 | 1946 | 1941 | 0.0 | – | |
Gene3D | 24 | 177 | 154 | 3.7E-19 | ||
Pfam | 39 | 167 | 129 | 4.6E-22 | ||
Coils | 119 | 139 | 21 | - | – | |
SMART | 314 | 430 | 117 | 8.0E-72 | ||
Pfam | 316 | 428 | 113 | 6.4E-37 | ||
Phobius | 481 | 498 | 18 | - | – | |
TMHMM | 482 | 501 | 20 | - | – | |
Phobius | 499 | 517 | 19 | - | – | |
TMHMM | 516 | 538 | 23 | - | – | |
Phobius | 518 | 540 | 23 | - | – | |
Phobius | 541 | 551 | 11 | - | – | |
TMHMM | 550 | 572 | 23 | - | – | |
Phobius | 552 | 574 | 23 | - | – | |
Phobius | 575 | 593 | 19 | - | – | |
Phobius | 594 | 618 | 25 | - | – | |
TMHMM | 599 | 621 | 23 | - | – | |
Phobius | 619 | 629 | 11 | - | – | |
Phobius | 630 | 646 | 17 | - | – | |
Phobius | 647 | 657 | 11 | - | – | |
TMHMM | 656 | 678 | 23 | - | – | |
Phobius | 658 | 678 | 21 | - | – | |
Phobius | 679 | 709 | 31 | - | – | |
TMHMM | 710 | 727 | 18 | - | – | |
Phobius | 710 | 727 | 18 | - | – | |
Phobius | 728 | 732 | 5 | - | – | |
TMHMM | 732 | 749 | 18 | - | – | |
Phobius | 733 | 752 | 20 | - | – | |
Phobius | 753 | 1509 | 757 | - | – | |
Pfam | 1048 | 1762 | 715 | 8.6E-242 | ||
Phobius | 1510 | 1532 | 23 | - | – | |
TMHMM | 1511 | 1533 | 23 | - | – | |
Phobius | 1533 | 1560 | 28 | - | – | |
TMHMM | 1559 | 1581 | 23 | - | – | |
Phobius | 1561 | 1580 | 20 | - | – | |
Phobius | 1581 | 1591 | 11 | - | – | |
Phobius | 1592 | 1613 | 22 | - | – | |
TMHMM | 1596 | 1613 | 18 | - | – | |
Phobius | 1614 | 1654 | 41 | - | – | |
TMHMM | 1654 | 1676 | 23 | - | – | |
Phobius | 1655 | 1672 | 18 | - | – | |
Phobius | 1673 | 1678 | 6 | - | – | |
Phobius | 1679 | 1699 | 21 | - | – | |
TMHMM | 1680 | 1702 | 23 | - | – | |
Phobius | 1700 | 1756 | 57 | - | – | |
TMHMM | 1756 | 1778 | 23 | - | – | |
Phobius | 1757 | 1776 | 20 | - | – | |
Phobius | 1777 | 1787 | 11 | - | – | |
TMHMM | 1788 | 1810 | 23 | - | – | |
Phobius | 1788 | 1805 | 18 | - | – | |
Phobius | 1806 | 1824 | 19 | - | – | |
TMHMM | 1822 | 1844 | 23 | - | – | |
Phobius | 1825 | 1845 | 21 | - | – | |
Phobius | 1846 | 1851 | 6 | - | – | |
TMHMM | 1849 | 1871 | 23 | - | – | |
Phobius | 1852 | 1873 | 22 | - | – | |
Phobius | 1874 | 1892 | 19 | - | – | |
TMHMM | 1892 | 1914 | 23 | - | – | |
Phobius | 1893 | 1914 | 22 | - | – | |
Phobius | 1915 | 1950 | 36 | - | – | |
Coils | 1949 | 1950 | 2 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0362200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…