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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0344900 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0344900.3 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | BEACH domain-containing protein lvsC; TAIR: AT1G58230.2 binding protein; Swiss-Prot: sp|F4I9T0|BCHB_ARATH BEACH domain-containing protein B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0K6C6|A0A0R0K6C6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0344900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:81120859..81157025) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAATATTGTTAAGGGTGTCGCTGACCTTATCCGGAGAACTTCCTCTGGCCATACCGGCGAATCCCCAGGTTTCCAAGC TCAGAAGTTCTCTCCTCCTGGGCCCAAGATTCGCTTCAGGTAAAATTATATATCGAATAATAAAGCTTCTTGGTTGCGTT AATTGCAACAATTTGAACAATATTGTTATGAAATCATGTCATTTGATGTTCTCAGAGTGCAGAAGTTGCGTTTTTTCGTA ATTGAGTAGAGCATTAGGAAGGGAGTTTTATGGTTAATATAATGTTTCATTGTGTTTTGATTCATAGAGAATACATTGTG TTTGGCAATCTCTTAGGTACTCTTGATCAGGGTTGTTAATGGCGGATAGCGTAGTGTAGCGGCAAGCCCATAAAACGCTA TTTCGAGCGCTATTGCGGTAGCGGCAAATAGCGGTGAATAGTGGAGTAGCGGTGAACCCCCAGGGCGCTACGCTATAGGC TATTGCGCCGCTATAGCGTGCTATTAACAAGCCTGCTCTTGATACAATAGGACTAATAGGGATTGTATTGCAAATATCAC CCCTCTTGAGATTGGGAGTGACTGGTTGACATTAAGTGTGCTTGTTTTTATGGAATTATATTTCTTTGACCAATGGAAAA GATGTGAATTTTGCTTTATTCAGGGTATTTTCTTTTACCGCTTTAGGAAAATAAATAAAAAAAGGCAAATAAATGAAGAA TATAATGCTTAAATCTTGTTAAGTTTGTGCCAGAGAAAGAAACTCATGTAATGATTATTGTCGATCAACACTACTTGCGA CTATCATTCCTCTTGGACTTTCTTGAATCCTCTCTCTCGATGACCCTTGATCTGATTGGGGAAGACACCGATAAGAAATG CACTATTTTTCATGCTATTATGAAGGGTTTCATCTTAGAGCTTCAAACCACATTTATTTTGTAAGCTTTTTTCACCAACT 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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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|---|---|---|---|---|---|---|
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| SMART | 3117 | 3155 | 39 | 23.0 | ||
| SMART | 3158 | 3196 | 39 | 1.4 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0344900.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…