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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0748400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0748400.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | NHL repeat-containing protein 2; TAIR: AT1G56500.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein; Swiss-Prot: sp|A4IF69|NHLC2_BOVIN NHL repeat-containing protein 2; TrEMBL-Plants: tr|I1NBR0|I1NBR0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0748400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:132085084..132104635) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCCGGCTCAATTCAAATAACTAATATCTTAAGTGATTCAAATGACCAGTTCAGTTCTAAAAATACCGAAAAACAGATAAA CTCAAAAGGAAAAATGGAAATTAAGAAAGAAAAAAAAAATGATGTGGTCATGAAGTAGATAAGGTTCCCTCGAAAATTCT CTTTCCACCTTGCAGTTCCCTCCTCAGTCCTCACCATACCATCCAAGCTTGAAATTCAAAAGATCACACACAAATTGCAT GACTTTGGTAACCATATAAAAACAAAATAAAATATCCCCGCCACTGTAGCAACAGAACCAGTGGAGTGGTGGTCATGGCA TTTCAAACAACTCACTCTCGTCTATCATCCCCAACCACCGCAACCAACTTCTTCTTCTCCGCCTCCTCCCCCTCCCCCAA TCTCAGATCACTGAAACCTACTTCGCTTCCATCTCGATTCTTCCATTGCCGATCGAAACGCCTCGTTTTCACGCCGAGAC TTATCACGAGAGCTTGCGCGGTGAAGGTCGAGGAGAAGGACGTTGCTGGAAAATCAGGAGAATGGGGGAGGGTTTCTGCT GTGTTGTTTGACATGGATGGTGTGCTCTGCAACAGTGAAGAGCCTTCTAGAAGAGCCGGTGTCGATGTTTTCGCTGAGAT TGGCGTCCAGGTCACCGTCGATGATTTTGTGCCGTTCATGGGAACTGGTATGGTGCTTCTCTTCATTTCTCAACTCCTTG GTTTACTTCAATTTCTATCTCTGCATTAATTTCCGAACATGCTTTTCTGTTTTCCTTGATCTGCATTTGATTATTCCAAA CTTCACTTGTGTTGAGCTATGCTTTTGCTAGAACTAAACATTTGCTTAATTTGGAGTGTGAATACACTTTGCAACCTGTT AATTCGTCTGTAAGACTAGTGGTTATCATTATCATTATGGCGTGGGAACAATAGTAGTGTATAATCTCGCATTGGTCGAA 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ACTCTCACAAGTCAATTTTGGGTTTCTTGATTAGATTTGAAGGGAAGCTGTGAGATGGTAGTCAATATTGCAATATGTTG CTCTATATACTGTAGAATGCAAGCAAAGCTTAATATGGAAACTAAAGCTTGCAACGAGTTAATGTGGATGAAGAAATTTT CATCCAGAGCTTTTTTATCATTTCATTTAGACACGTTATATATTGTATCATAACAGCCAAAGTGTATTCAACTAGGTGAA AATCTACCTTTCATGCGAGGTTGAAAGTTGATACATATTGGTGATAGTTATCACTGAACACGTGATTCATTAAATGTCAA GTTGCTCAACCTTTAAGAAGATTTGTACATGTGAGGATGGCCAAGTTCTATTCCCATATGAGCGCATATTTACCTTGATT AAAAAACAAAAGTGGCTTAAATGGGTTGAAGTCCATTCGATAAAAAGGGAACATTCACAAGTTCAAAGCTTATTTCTCTT CCATCTTATTTCCAGTTATTTTCTCTTTCTATATCTCTCATATTTATCGTTTGTTATATGCATTTTTTTCTCAAGTCTAT TCACATCTCTTTCATTGGTGTGAGTGGAATGGGAGTTGATTAAGAGTAATTCTTGTGTGGGCACAAATCCAACACATCAA ATTTGGACACAGCCAATCATATAATTATACATAAATTAAAATAAAGGCGCTGTAAAATTGAAAAGAAAAAAGCCACTTCT CCTGTTCATCTTCATTCTTTTGATCTTTTCTCCATTCCTGGCTACCTCCTTCAACCTATTAGTCTCTCTCTCTACCAAAT AATTCATTCTACGGAGGCATAACTTCCCCTTTACACTCTTGAAATGCAACTATCGATTCTAGATCAAAAAGTCCCCTATG TCCACTAATGTTGCTGCTGTACATTGTTGGAGCTCACTCACCAAGGAACAAGGTGCTCTTTGATTTCTGAACAATGAACC ACCCCCCTAGAGGAGGCCGCAAAGGTGATTTAGAGGTGGTTAGGGACGGCGTCACTCATTGTAGAGGTGGTGGCAAACAC AACGCCAGATTCCAAGATGAAGAGCCACCCACAAGGTGGTACTTTTCGGGGAAGAGGAAATTGTTGGTGGATTAAGGTCC CGTTTGGATAAACAGCTTAATTAAGCGCTTATGGTCATAAGCGCTTATGGTCATAAGCGCTTATGACATAAGTGCTTATT CATAAGCTATTTTTAAAAATTTATTGAAATAAATTAAAAATAAGCTGTGTATAAGCATAAGCTTTTTTTCATAAGCTATC CTGAGTAGCTTATGAAAATAAGCTGAAAATAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0748400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATTTCAAACAACTCACTCTCGTCTATCATCCCCAACCACCGCAACCAACTTCTTCTTCTCCGCCTCCTCCCCCTC CCCCAATCTCAGATCACTGAAACCTACTTCGCTTCCATCTCGATTCTTCCATTGCCGATCGAAACGCCTCGTTTTCACGC CGAGACTTATCACGAGAGCTTGCGCGGTGAAGGTCGAGGAGAAGGACGTTGCTGGAAAATCAGGAGAATGGGGGAGGGTT TCTGCTGTGTTGTTTGACATGGATGGTGTGCTCTGCAACAGTGAAGAGCCTTCTAGAAGAGCCGGTGTCGATGTTTTCGC TGAGATTGGCGTCCAGGTCACCGTCGATGATTTTGTGCCGTTCATGGGAACTGGAGAAGCGAACTTTTTGGGAGGTGTAG CCTCTGTTAAGGGAGTTAAAGGATTTGATCCTGAAGCTGCAAAAAAGAGGTTCTTTGAAATATATTTAGAGAAGTATGCA AAACCAGATTCTGGAATAGGATTTCCAGGTGCCCTTGAACTCATCTCTCAGTGTAAAAGCAAAGGACTTAAAGTTGCTGT TGCATCTAGTGCTGATCGTATCAAGGTTGATGCAAATCTAGCTGCTGCTGGTTTGCCATTGTCATTGTTTGATGCGATTG TGTCTGCAGATGCTTTTGAGAATTTGAAACCTGCTCCTGATATTTTCTTAGCTGCATCAAGAATATTGAATGTGCCTCCT AGTGAGTGTATCGTTATAGAAGACGCACTAGCTGGAGTTCAAGCTGCCAAAGCTGCACAAATGAGATGTATAGCTGTAAG GACTACATTATCAGATGAGGCTTTGGAACCTGCTGGTCCAACTTTTATCCGAGATGACATAGGAAGTGTTTCTCTTGATG AAATTCTTAATGGTGGCTCTGATGGATATAATAAGAGGATGCAGGGCTCACAAAGTCTAAATAATTTTGCACAAACTTCA ACTACTATGCTTGCGGGAAAAACAGATGATGGAGTTGAAAAATCTTCCAATGGTACTGATGAGGGAATTTTCACAACTAC AGGGTTGCAGGGTTCGCGGCGAGATATACTGAGATTTGGAAGTCTGGGCATCGCTATCTCTTGCCTTGTCTTCACCGTAA GTAACTGGAAGGCAATGCAATACACTTCCCCTAAAGCGGTTTGGAATCTCTTGTTTGGTGTTACCCAGCCACCCTTGGGA CAGAAAGAAGGTAACTCACGATCTGATAGGATCCAGCAATTTGTGAACTACATAGCTGATCTAGAAAGCAGGGGAAACAC TCAGGTTGTTCCAGAATTTCCATCTAAACTTGATTGGCTAAATACAGCCCCGCTCCAGTTTCGTAGGGACCTGAAAGGAA AAGTTGTTCTGCTTGATTTCTGGACTTATTGTTGTATAAACTGTATGCATGTCTTACCAGACCTAGATTTTCTGGAGAAA AAGTACAAAAATATGCCGTTCCTTGTTGTGGGTGTTCATTCTGCCAAGTTTGATAATGAGAAAGATTCTGAAGCGATTCG CAATGCAGTTCTGCGCTATGATATCACTCACCCTGTTGTCAATGATGGAGACATGTACCTTTGGCAGAAGTTGGGCATAA GTTCATGGCCAACATTTGCTATCATTGGCCCCAATGGTAAGCTCCTTGCACAACTTGCAGGAGAAGGTCGCAAAAAGGAT CTTGATGATTTTGTGGAAGCAGCACTTCTGTTTTATGGAAAGCAGAACATGTTGGACGATACACCAATTACATTAAGTTT AGAGAAAGATAATGATCCTCGCCTATTAACATCTCCATTGAAGTTTCCTGGAAAGTTAGCAATTGATGTCCTCAACAACA GGCTTTTTATTTCTGACAGCAACCATAACCGCATAGTTGTTACTGACCTAAATGGGAATTTTATTGTACAAATTGGGAGC AGTGGGGAGGAAGGTCTGCAGGACGGTTCCTTTGATGATGCCACCTTCAACCGCCCTCAGGGCCTTGCTTATAATGCAAA GAAAAATATTCTCTATGTTGCAGACACCGAAAACCATGCTTTGAGGGAAATTGATTTTGTTAATGATAAAGTGCGCACTC TTGCTGGAAATGGGACCAAGGGCTCTGATTATATTGGAGGAGGAAAAGGAGACACTCAGCTCCTCAATTCCCCTTGGGAT GTCTGCTTTCATCCACTTGAAGAGAAGATTTATATTGCCATGGCTGGCCAACACCAGATTTGGGAGCACAATATATTGAA TGGAATTACAAGAGCATTTAGTGGTGATGGCTATGAAAGAAATTTAAATGGATCAAGTTCTACAAGCACATCATTTGCAC AACCTTCTGGTCTTTCATTGTCTCGAGATCTAACGGAGATCTACGTCGCTGATAGTGAGAGTAGTTCAATTCGAGCTGTT GATCTAAAAACAGGAGGATCACGGTTGTTAGCTGGTGGTGACCCTGTCTTCTCAGACAATTTGTTTAAGTTTGGCGATCA AGATGGAATAGGCTCTGAAGTACTTCTTCAACATCCGCTGGGGGTTTTATGTGGAAAGGATGGTGAAATTTACATCACAG ATAGCTACAATCACAAGATCAAGAAGTTTGATCCAACTAGTAAAAGAGTTAGCACCATTGCAGGGACAGGAAAAGCTGGT TTCAGGGATGGAACAGCTGTAACAGCTCAGCTTTCTGAACCATCAGGCATTATTGAAGGGAACAGCGGGAGACTATTCAT AGCTGATACAAACAACAGCATAATTCGATATCTAGATTTGAATACTGATGAATTTGAACTCCATACCTTGGAGCTTAAAG GATTTCAGCCTCCTAAACCAAAATCAAGATCTTTTAAACGTCTCAGGAGACGTCCCTCAGCCGACACTGTGCCAATCACC ATTGATGCCATTTCATCAGAGGAGGGAAACTTGTCTATAGACATATCATTGCCAAATGAGTATCATTTCTCAAAGGAAGC ACGCAGTAGATTCAGTGTTGATATTGAATCTGAAGGCTCTGTTGATATTGATCCCCTGGATGGACTCCTTAGTCCAGAAG GATCTGCAACCCTTCACTTTAAGAGATCCTCCACCTCTGCTGCTGTTGGAAGAATTAATTGCAAGATTTACTATTGCAAG GAAGATGCGGTTTGTTTGTACCAATCCTTGCTGTTTGAGGTCCCCTTCAGAGAGGGAGTTTCTGACTCTACTAGAGCAAA CGTCACTCTTGCTCATCTTGTCAAGCCCAAAACTTCAGCCAGCAGCTTACTGCAACCAGTTTCCCCGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0748400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFQTTHSRLSSPTTATNFFFSASSPSPNLRSLKPTSLPSRFFHCRSKRLVFTPRLITRACAVKVEEKDVAGKSGEWGRV SAVLFDMDGVLCNSEEPSRRAGVDVFAEIGVQVTVDDFVPFMGTGEANFLGGVASVKGVKGFDPEAAKKRFFEIYLEKYA KPDSGIGFPGALELISQCKSKGLKVAVASSADRIKVDANLAAAGLPLSLFDAIVSADAFENLKPAPDIFLAASRILNVPP SECIVIEDALAGVQAAKAAQMRCIAVRTTLSDEALEPAGPTFIRDDIGSVSLDEILNGGSDGYNKRMQGSQSLNNFAQTS TTMLAGKTDDGVEKSSNGTDEGIFTTTGLQGSRRDILRFGSLGIAISCLVFTVSNWKAMQYTSPKAVWNLLFGVTQPPLG QKEGNSRSDRIQQFVNYIADLESRGNTQVVPEFPSKLDWLNTAPLQFRRDLKGKVVLLDFWTYCCINCMHVLPDLDFLEK KYKNMPFLVVGVHSAKFDNEKDSEAIRNAVLRYDITHPVVNDGDMYLWQKLGISSWPTFAIIGPNGKLLAQLAGEGRKKD LDDFVEAALLFYGKQNMLDDTPITLSLEKDNDPRLLTSPLKFPGKLAIDVLNNRLFISDSNHNRIVVTDLNGNFIVQIGS SGEEGLQDGSFDDATFNRPQGLAYNAKKNILYVADTENHALREIDFVNDKVRTLAGNGTKGSDYIGGGKGDTQLLNSPWD VCFHPLEEKIYIAMAGQHQIWEHNILNGITRAFSGDGYERNLNGSSSTSTSFAQPSGLSLSRDLTEIYVADSESSSIRAV DLKTGGSRLLAGGDPVFSDNLFKFGDQDGIGSEVLLQHPLGVLCGKDGEIYITDSYNHKIKKFDPTSKRVSTIAGTGKAG FRDGTAVTAQLSEPSGIIEGNSGRLFIADTNNSIIRYLDLNTDEFELHTLELKGFQPPKPKSRSFKRLRRRPSADTVPIT IDAISSEEGNLSIDISLPNEYHFSKEARSRFSVDIESEGSVDIDPLDGLLSPEGSATLHFKRSSTSAAVGRINCKIYYCK EDAVCLYQSLLFEVPFREGVSDSTRANVTLAHLVKPKTSASSLLQPVSP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 355 | 355 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 78 | 292 | 215 | 5.28E-45 | ||
| PRINTS | 80 | 91 | 12 | 1.7E-8 | ||
| SFLD | 80 | 289 | 210 | 1.7E-41 | – | |
| SFLD | 80 | 289 | 210 | 1.7E-41 | – | |
| CDD | 82 | 268 | 187 | 4.20215E-42 | – | |
| Gene3D | 82 | 282 | 201 | 5.4E-49 | ||
| Pfam | 83 | 266 | 184 | 7.3E-26 | ||
| Gene3D | 95 | 165 | 71 | 5.4E-49 | ||
| PRINTS | 178 | 191 | 14 | 1.7E-8 | ||
| PANTHER | 203 | 1082 | 880 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 203 | 1082 | 880 | 0.0 | – | |
| TIGRFAM | 207 | 266 | 60 | 8.0E-13 | ||
| PRINTS | 210 | 226 | 17 | 1.7E-8 | ||
| PRINTS | 228 | 248 | 21 | 1.7E-8 | ||
| Phobius | 356 | 376 | 21 | - | – | |
| Phobius | 377 | 1089 | 713 | - | – | |
| Gene3D | 402 | 573 | 172 | 1.5E-33 | ||
| ProSiteProfiles | 424 | 570 | 147 | 10.946 | ||
| SUPERFAMILY | 428 | 566 | 139 | 7.81E-27 | ||
| Pfam | 453 | 547 | 95 | 1.8E-11 | ||
| Gene3D | 577 | 743 | 167 | 1.5E-32 | ||
| SMART | 593 | 635 | 43 | 0.0058 | ||
| SUPERFAMILY | 594 | 923 | 330 | 1.1E-40 | – | |
| ProSiteProfiles | 599 | 631 | 33 | 5.818 | ||
| CDD | 638 | 979 | 342 | 7.18846E-177 | – | |
| ProSiteProfiles | 651 | 681 | 31 | 6.846 | ||
| Pfam | 656 | 681 | 26 | 8.0E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 707 | 741 | 35 | 5.017 | ||
| SMART | 765 | 807 | 43 | 130.0 | ||
| ProSiteProfiles | 772 | 803 | 32 | 5.366 | ||
| Gene3D | 817 | 919 | 103 | 4.9E-25 | ||
| ProSiteProfiles | 836 | 866 | 31 | 10.691 | ||
| Pfam | 837 | 863 | 27 | 4.3E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 890 | 921 | 32 | 4.277 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. | ||
| Biological process | Cell redox homeostasis | Any process that maintains the redox environment of a cell or compartment within a cell. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0748400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…