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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0265500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0265500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Nipped-B-like protein; TAIR: AT5G15540.1 PHD finger family protein; Swiss-Prot: sp|F5HSE3|NIPLA_DANRE Nipped-B-like protein A; TrEMBL-Plants: tr|K7LXL8|K7LXL8_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0265500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:73483522..73504530) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGCACATATCATCTTCGTTTTGCACACTGCCCTCCAATCTTTCCTACAAGTACAATGAACTCTGGCTTCTACAACAAGCT AGGCACAGTGTCAGGGCGTTTCCGTAATCTCATAACTGGACTCAGTTTCAAACTCCTCACACCAATAAAAACCAAATCCA CTCACATTTCGTAAACCCTGTTGCAATTCGAGAATCCCAAATCATTTTCCCAAACGCACTTTTCCCCGCCATTCACTTCC CCAATTTTCTTCCCAATCTATCCCTCTAGGGCTCACTCTCCACCTTCCACCGCTTCACCTGAACCCTAATTCCCCTTCAA TTCTTCACTTCATGCTCTTCCCGTGACCAATCATGAATTTTCCACCTCCTTCCGGCGCCAACGCCGCCGCCGCGATGCCG TCCTCCGGCATCCGCGGCATAAGCTTGTCCAACACTGTCCACTCCGAAGTCGCCTCCTGCTTGCCGCTGCCGTCGCTTCC GGTCTTCTGCGGCGCATCCGATCAGGACCTCCGACTCTTCGACGCGCCGATGACGTTCAACCGCCGCGACGTCCTCGCTC AGTCCAGCAAGATCGCCGAGCTTCTCCAGCACACCGATGTGTCGTATTTGTAAGCATCTCTTCTTTTATCTGCTCGTCAT TTTCCGCGCGCGTTGAATTTTGATTTATCGATAGGAAATTGAATTGGCAGGGAAGTGTAAAATTAGGTTCCGGTTTCGCT GTGAATTATTGTTTTTGTGCAATTGAATTAGACGCATTGGAATTTGCATGTGTTTTACTGTAGATGTGGCTTTTGGTGCT GATTTGAATTTCTTGACTTGCGTAGTTGACTTCTCAGTGCTTACTTGTTTAGCTGTAGTTTCTCTGTGTTTTTTTTGTTA ATTACTTGATTCATTTTAATCTCTGTGGCCTGTTCATGTGAAGCTTTGAAGGTTTAGTTTACAAGCAGATTAGTGTTTGG 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GAGTCAATTTCCTACTTTTTCCTATCATTTGTCTCCCAATCATTCAAATTCCTTTTAAAATGAGATTTTGAGAGACTTTT TGAACCCTGGATTGAATGTTTTATGAATTACTTGTAAAGAAAACAAATAATGTGTATAATATCATATATAGTTATCTAAC AACTTAAGCTTTAGGAATAGTTAGTTCTTTACAAATTTTATGACATACACACACACACACACACACACACACACACACAC ACACACACATATAGATAGATAGCTAGATATATTAAAAATTCTGTTTTCCTGCTTTTTGCAGCTTGTCGGACGATCTCTGT TTTGTATTGGTTTGCTTGTTCGCTATGGCAACTGTTTGTTAGCAAGCTCCAGTAATCAACATAGTGACGTCAAAAGGAGC CTCAACTTGTGTATGAAGTATCTTGTTGTGGAGGATTTAGGTCTTAAGGCTAGATCATTGCAGGTAAGAGTTACTCAGTC AACTTGGCCGTTATCTTGGTTTAATCTTGGAAGTTTGTTAATGCTTTATTGTAACTCTTGTAGGCCCTAGGGTTCGTTCT AATAGCAAGGCCTGAATATATGTTGGAAAAAGATATTGGAAAGATACTGGAGCGATCATTATCTTCTACTGCTGATACTT GCCTTAAGGTAATATATTTCATCTCTGTGTGTGTGTGTATTGCTTCTCTGTGGATACTAAATCATTCTCATAATCAGATT CAAGCATTGCAAACCATGTTCGAGTATCTTCTTGATGCTGAAAGCCAAATGACAACAGATAAAACTGATGGTAATGTAGC TGATTACTCAGTTGGAGCTGGGCAGAGTGTTCCTGTTGCTGCTGGTGCTGGGGATACAAACATGTGCGGGGGTATAGTTC AGTTGTACTGGGATAATATTTTGGGCACATGTTTGGATTTCAGTGAACCTGTTCGCCAATCAGCCTTGAAGGTCAGAACC TAGCTTCTTTGAATACTTGTTGAATCTTTTTTCGTTTTTTGAGCTAAAAAAGCAGTGTAAACTGACTGTGTGTCTCCGTG TATTTTCTATCATTGGTAGTTCTATCCATTCAAATCTTTTGGATTAATGGGTTGACCGAAAGGGGATGGGAAATTAGTTA GATTTTTTTGCCAAGCAGTTTGAAGGGTAATCTTGCTGTTGCTTGTTATGTTTGAATGGGGATTAAATGGTCTTTCTTTC ACTAGCTTATTTTCCTTCGAAACTTGAGCATTCCTGTTACAGTAGTTAAGTTCTCTTTTGCTCTTATATATTTAGTCTAA GAGATCGGCTAATAATGCAGATTGTCGAAGTTGTGCTGCGCCAAGGTCTTGTTCATCCCATCACCTGTGTGCCACACCTT ATAGCACTAGAAACAGATCCTCTGGAGTCAAATTCCAAGTTGGCTCATCATCTCTTAATGAATATGAATGAGAAGTAATC TCCTTATATTCTTTTGGATAACGTAAATCATGTCAATTTGATTGTAATAACTAATTAAAGCATCTTTTCAGGTACCCTGC GTTTTTTGAAACCCGCTTGGGCGATGGACTTCAAATGTCATTTATGTTCATCCAATCCATTTGCGGTAGTTCTGAAAATG TTAACCATAAAAACCAATCTCGGATCCCTGTTTCTGGGAAGGGCAAACCTGAGGCTGGCTCACTCACTCAAGCAAGAGTT GGGGTTTCTCGAATATACAAGCTCATCCGGGGTAACCGGATATCAAGGAACAAATTTATGTCCTCAATTGTGCGAAAATT TGATAATCCTAGATGGAACAAATTAGTAATACCTTTCTTAAGGTAAGCACTACCTTTGGTTTTTCTTTATTAATTTTGTG AGTTCTTAAGTGACCTTTTACTCGGTTTCTTTTCACAGATATTGCACAGAGGTTCTTGCCTTGCTGCCATTCACTTCACC TGATGAGCCACTTTATTTAATCTATGCTATCAATCGAGTAGTTCAGCTGAGGGCTGGGCCATTAGAGGCGAACTTTAAAT CCTGGAATTCAAGCTTGTTACGAAGTGAGGGTCATAGTACACCTTATGAAAATGGAACATGTCGATGGGGGCCAGATGAG CCTATTCTTGCAACCCCAGTGATGTCAATGGACTTGAATGAAACATTTCAGCAAAATCTACATGCTCAGCCTATTTTTGA TGACATGAAATCAGTGGATTTAAATAGAACTAATCACCAATTGCCAGATCATCCTTTATCACATAATGGGAACTTGGAAG CTAAGCCGCAAGCTGCAAGCTTCATGGATTCTTGTACCTTCTCCAAAGATGATACGGAGGAAGTTCAGGTATCTTGAAAT CTGCAGTGATTATTTGTCAATAATGTTGATTTGTTTGTGAGAAAGAATGTGATAAATTGTGCTAATTGAGTTTCTTTCTA TAAGCAAGTACGTGAGATATTTTCCTAGTACAGCCTCAACAGTATAAAATGTGCACATTTGAATTAATATTTATTTTATC ATTATTTATTCGGGTCATGTGACCAGCCATTTTGTTCTCGATTCTTATGCAGGCTGGCTGTTTATCCGCCATTGCATTGC AACTTCTTTTAAAGCTAAAGAGACATCTAAAAATCATGTATAGTCTGGATGATGCCCGATGTCAGGTAAAATTTTATTAT ATATTTTATCTTCACCTATCTGCAGTTAAATGCTCTGTATCATTTTGACTAGGATGGGATGAGATCGGAACCTAACTGTC CTCTCTCTTTGGGATGTGTCCATTTTTGTTCAGGCTTATTCTCCAAGTGAACCACCAAAACCTGGAGAAGTTTTGTCTAA ACAGAGTATTGCGTTGAATATCAGTGAATATCAGTTTAGTTTGCCTACAACTCCGCAAGAATTAACACAAAGATACCAGG TATTGTTGTTTGAGTAAATACATTTTTCTTACGCTTACGAGTTTTTTGCACCTGAGTTGAGAGTTTATGTAGCCCTTATT TCTTATTTGTTACACCAGGAATTTAAGAATGCATTGAAGGAAGACACAATGGATTATTCGCTTTACACTGCAAATATAAG ACGGAAGCGACCCTCAATTACGCCCAGAAAAGTTCGGAAATCTGTACACACAGCTCGTGGTGGTTTCGAGGAAGAAGAAG ATGATGATGCGGATTGGGCTGGTGGCATGCGCCAGATAAATGTTAGTGGGCGCAGGGCTAACCTTAGAAGCTCTAGACAA CATTGATTGATGTAAGTACGTGGTAGATAGACTAACAACTTGTACATTAAATAGGAAAAAAAGGAAAATACAGAATAGGA TGAAAGCCAATAGAATAGGGGTTTTAAGGAAACAGAATACAGGAAAGCACGGGCCTGGAATATTTCTTGCCTTAGTTGAC TGTATATTTTGTCTGTTTCCGTTTGTAATTTCGAATTGCGTTATAGTGGCTGCATTCTTTTGTTGACCGAAAATCAGCGT ACCCAGCCAAATATCAAATTTGATTATTTTCTTTTGGTGTTGTTCCATGTTCGCACAAGTCGTTGTTTACTCTTTTTTGT TTGTTCAAAAAGAGTAGATTGATTAATGATAGGCACGATCCTTACGTCTATTAAGAGAGCAATACAACAATGCAAGCTAG GATTTGAGAAGCCCTCTTCTTTAGACAAAAAATCCATTACATTGTCTATTTAAGAAAGCTTGGTTTGCTGAGATAGGAGT CCTCCTATAAATAAACTCGGAAATCATTGCCTCCTAAGGTTCAAATTTT
CDS sequence (LotjaGi2g1v0265500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAATTTTCCACCTCCTTCCGGCGCCAACGCCGCCGCCGCGATGCCGTCCTCCGGCATCCGCGGCATAAGCTTGTCCAA CACTGTCCACTCCGAAGTCGCCTCCTGCTTGCCGCTGCCGTCGCTTCCGGTCTTCTGCGGCGCATCCGATCAGGACCTCC GACTCTTCGACGCGCCGATGACGTTCAACCGCCGCGACGTCCTCGCTCAGTCCAGCAAGATCGCCGAGCTTCTCCAGCAC ACCGATGTGTCGTATTTGAATTTAAGAGATGATGCTAAGGGTGTTCGGCATAACTATGGTGAGCCTTTAGAGCTCCATGA TGAAGTTCTCAGGTGCAATCCTGAAGCATTTGAATGCAGTGCTGCAGGTCCTTTCAAGGAGCAGTTCTCTGGCGGGGCAT TAATTGAAAAAAAGCCTGTTGAATCAAATTGTTCTGTCCCGAGTCAGACTCACAAAGACTACAATGCAACCCAAAGCCGT CAGCTCGATAGTTTTTCGACAAATGACATATCTATGTTGTGTTCTAAAAAATCTAAAGTCAAGAAGAAAGGGGGTGATGG AGCATCTGTTGCACTCGATCCTGCTGAGCTTCCAGATGCCAGCATTGGAAGGTTTCATGAATATTTGGAGGACTTATGTA GCAAAGCCGAATTTAATAGTGACGATCGAGATGAAGCAGAATGGTTACCGTTGCCTCTTTCAGATCTTAGATTGCTTGTT AATGAAATAGTGTCTATACGTGAGAAGAAACTTCTTCACTTGGTTCCTGTAGAAATACTTGTTAGATTACTAAAAGTTCT AGATCATCAGATACATAGAGCAGAAGGCCTGTCAATTGTGGATTGTGATAATTCCAATTCAGAACTAGTTTCTTCTCTTT TAATTGCGTTGGAGTCCATTCATGCTGCCCTGGCAGTGATGTCCCATGCTGAGATGCCGAAGCAACTTTATAAAGAAGAG GTTATTGAGAGAATTCTGGAGTTCTCCAGGCATCAGATAATGGATGTGATGTGTGCATGTGATCCATCGTACCGTGCATT ACATAGGCCTAATGAAAACACTGCATTTGAAGTTGATGATTTTGATGAGGATGATGCTGAATTTGGTTCAGCAAGCAAAA AGCGGCGCCCTAGCAAGTCTTTGAAGTTGAAGAAACCAGCATCAAGCAGGGTCTCTACTGCTGTGAATACCATTCTTCAG AAGTTGTGTACTATTCTCGGACTACTCAAGGATTTGTTGTTAATAGAAAGGTTATCAGATAGTTGCATTTTACAACTTGT AAGAACAAGCATCACAACATTTTTAGTTGATAACATCCAGCTTTTGCAGTTGAAGACAATTGGTTTAGTCAGTGCGATAT TCTATTTGTACACACAACATCGCACTTATGTGATAGATGAAATGATTCAGCTTCTTTTGAAATTACCGCATTCAAAGCGA GCTTTAAGAACATATTACATACGTGATGAAGAGCAAAAGCAGATCCAGATGGTTACTGCTTTGTTGATTCAGTTAATTCA ATGCAGTGCGAACATTCCTGATGCTTTAAGACAAGCATCAAGTGGTAATGCTGTATTAGAAGTCTCAGTCGATGCTAATT ATCCAACTAAATGTCTTGAGGCAGCAACAGAAGCCGGTTGTTTATTTTGGAGCCGTGTACTTCAGCGTTTTGCCAGTGTA AAGACTCAAGATGCTTCTGAGCTGAAATCCATAATGGAGAATCTTGTTACAGATTTGCTGACAACTCTGAATTTACCTGA ATATCCTGCTTCAGCTCCTTTTCTAGAGGTTCTCTGTGTCCTACTACTTCAGAATGCTGGGCTCAAATCCAAGGATATCT CTGCACGTTCCATGGCAATTGATATTCTTGGTACAATTGCTGCAAGGTTGAAGCGCGATGCTATGATTTGTAGTCAAGAG AAGTTCTGGATATTTCAGGGTTTACTTAGTCAGGATGCTGATTCTCAGCATTATCCAAAGGATACCTGTTGTGTCTGTTT GGGTGGAAGGGCAGAAAATTTGTACACATGTCACGACTGCCAGAGACTTTTTCATGCTGATTGCCTAGACATTAAAGAGC ATGATGTTTCCAACCAGAACTGGTACTGTCACACATGCATCTGCTCTAAGCAACTGCTTGTATTACAATCATATTGCACC TCCCAGCGCAAGGATGGTGTAAAAAAGAATCACAATTCGTCAACAGATGATTCTGAAGTTCCTATGCATGAAGTTGTTCA ACAGTTGCTTTTGAATTACCTTCAAGATGTCGCCTCTGCTGATGAACTGCATCTTTTTAGTTGCTGGTTTTATCTATGCA TGTGGTATAAAGACGAACCAAAATTTCAGCAGAATTCTGTTTACTACATTGCTAGAATGAAATCAAGAATCATAGTGCGG GATTCTGGTACTGTGTCTTCTAAGTTGACAAGGGATTTAATCAAGAAAATTACTTTAGCTTTAGGCCAAAACAGTTCATT TTGTCGAGGGTTTGATACAATTCTTCACTTGCTTCTGGCAAGTTTGAGGGAGAACTCTCCAGTTATTAGGGCTAAGGCTT TACGAGCAGTTAGTATCATTGTAGAGGCTGATCCAGAGGTACTGGGGGATAAGCGGGTCCAGTTAGCAGTTGAAGGCAGA TTTTGTGACTCTGCAATTTCTGTTAGAGAAGCAGCTTTGGAACTTGTTGGCAGGCATATTGCTTCGCATCCAGATGTTGG TTTTAAGTATTTTGAGAAGATTGCAGAGAGAATCAAAGATACTGGGTTGAGTGTTCGGAAACGAGCTATAAAAATTATTC GAGATATGTGTACTTCAAATGCCAATTTCTCTGGGTTTACCAGAGCTTGCACAGAGATAATGTCACGTATTAGTGATGAT GAATCGAGCGTCCAGGATCTGGTTTGCAAAACTTTTTATGAGTTCTGGTTTGAGGAACCTTCTGCTTCAGAAACTCAGGT CTTTGGTGATGGTAGTACTGTTTCACTTGAGGTAGCTAAGAAAACAGAGCAAATTGTTGAAATGTCAAGGGGGGGAATGC CCAATCAACAACTTGTAACCGTCAATCCACTTCTTGTAACTGTAATAAAGCGCAACTTGACACTTGATTTTTTACCACAA TCTGCAAAAGCCATTGGGGTCAACCCAGTGTCTCTTGCAACAGTGCGTAAGCGATGTGAGTTGATGTGCAAATGCTTGCT GGAGAAAATGTTACAGGTTGAGGAAATGAACAGTAATGAAGTGGCTGTAGGAGCACTTCCATATGTGCTAGTCTTGCATG CATTTTGTCTTGTGGACCCAACTCTCTGCGCACCAGCTTCTAACCCTTCCCAATTTGTTGTTACATTGCAGCCATATCTG AAGACCCAGGTTGACAAGCGTGAGGCTGCGCAATTACTTGAGAGTATAATATTTATAATTGATGCTGTATTGCCCTTGCT TCGGAAGTTACCCCCGTGTATTGTGGAAGAACTTCAGCTAGATTTGAAACAGATGATTATCCGGAATTCTTTCTTGACAG TTGTCCATGCTTGCATCAAGTGCCTCTGCTCTGTGAGTAAGATGGCAGGAAAAGGGGCTGCTGTAGTTGAGCATCTTATT CAAGTCTTCTTCAAATATTTGGATAAAGAGGCAGTTGATAGTAAACAGCTTGTCGGACGATCTCTGTTTTGTATTGGTTT GCTTGTTCGCTATGGCAACTGTTTGTTAGCAAGCTCCAGTAATCAACATAGTGACGTCAAAAGGAGCCTCAACTTGTGTA TGAAGTATCTTGTTGTGGAGGATTTAGGTCTTAAGGCTAGATCATTGCAGGCCCTAGGGTTCGTTCTAATAGCAAGGCCT GAATATATGTTGGAAAAAGATATTGGAAAGATACTGGAGCGATCATTATCTTCTACTGCTGATACTTGCCTTAAGATTCA AGCATTGCAAACCATGTTCGAGTATCTTCTTGATGCTGAAAGCCAAATGACAACAGATAAAACTGATGGTAATGTAGCTG ATTACTCAGTTGGAGCTGGGCAGAGTGTTCCTGTTGCTGCTGGTGCTGGGGATACAAACATGTGCGGGGGTATAGTTCAG TTGTACTGGGATAATATTTTGGGCACATGTTTGGATTTCAGTGAACCTGTTCGCCAATCAGCCTTGAAGATTGTCGAAGT TGTGCTGCGCCAAGGTCTTGTTCATCCCATCACCTGTGTGCCACACCTTATAGCACTAGAAACAGATCCTCTGGAGTCAA ATTCCAAGTTGGCTCATCATCTCTTAATGAATATGAATGAGAAGTACCCTGCGTTTTTTGAAACCCGCTTGGGCGATGGA CTTCAAATGTCATTTATGTTCATCCAATCCATTTGCGGTAGTTCTGAAAATGTTAACCATAAAAACCAATCTCGGATCCC TGTTTCTGGGAAGGGCAAACCTGAGGCTGGCTCACTCACTCAAGCAAGAGTTGGGGTTTCTCGAATATACAAGCTCATCC GGGGTAACCGGATATCAAGGAACAAATTTATGTCCTCAATTGTGCGAAAATTTGATAATCCTAGATGGAACAAATTAGTA ATACCTTTCTTAAGATATTGCACAGAGGTTCTTGCCTTGCTGCCATTCACTTCACCTGATGAGCCACTTTATTTAATCTA TGCTATCAATCGAGTAGTTCAGCTGAGGGCTGGGCCATTAGAGGCGAACTTTAAATCCTGGAATTCAAGCTTGTTACGAA GTGAGGGTCATAGTACACCTTATGAAAATGGAACATGTCGATGGGGGCCAGATGAGCCTATTCTTGCAACCCCAGTGATG TCAATGGACTTGAATGAAACATTTCAGCAAAATCTACATGCTCAGCCTATTTTTGATGACATGAAATCAGTGGATTTAAA TAGAACTAATCACCAATTGCCAGATCATCCTTTATCACATAATGGGAACTTGGAAGCTAAGCCGCAAGCTGCAAGCTTCA TGGATTCTTGTACCTTCTCCAAAGATGATACGGAGGAAGTTCAGGCTGGCTGTTTATCCGCCATTGCATTGCAACTTCTT TTAAAGCTAAAGAGACATCTAAAAATCATGTATAGTCTGGATGATGCCCGATGTCAGGCTTATTCTCCAAGTGAACCACC AAAACCTGGAGAAGTTTTGTCTAAACAGAGTATTGCGTTGAATATCAGTGAATATCAGTTTAGTTTGCCTACAACTCCGC AAGAATTAACACAAAGATACCAGGAATTTAAGAATGCATTGAAGGAAGACACAATGGATTATTCGCTTTACACTGCAAAT ATAAGACGGAAGCGACCCTCAATTACGCCCAGAAAAGTTCGGAAATCTGTACACACAGCTCGTGGTGGTTTCGAGGAAGA AGAAGATGATGATGCGGATTGGGCTGGTGGCATGCGCCAGATAAATGTTAGTGGGCGCAGGGCTAACCTTAGAAGCTCTA GACAACATTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0265500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MNFPPPSGANAAAAMPSSGIRGISLSNTVHSEVASCLPLPSLPVFCGASDQDLRLFDAPMTFNRRDVLAQSSKIAELLQH TDVSYLNLRDDAKGVRHNYGEPLELHDEVLRCNPEAFECSAAGPFKEQFSGGALIEKKPVESNCSVPSQTHKDYNATQSR QLDSFSTNDISMLCSKKSKVKKKGGDGASVALDPAELPDASIGRFHEYLEDLCSKAEFNSDDRDEAEWLPLPLSDLRLLV NEIVSIREKKLLHLVPVEILVRLLKVLDHQIHRAEGLSIVDCDNSNSELVSSLLIALESIHAALAVMSHAEMPKQLYKEE VIERILEFSRHQIMDVMCACDPSYRALHRPNENTAFEVDDFDEDDAEFGSASKKRRPSKSLKLKKPASSRVSTAVNTILQ KLCTILGLLKDLLLIERLSDSCILQLVRTSITTFLVDNIQLLQLKTIGLVSAIFYLYTQHRTYVIDEMIQLLLKLPHSKR ALRTYYIRDEEQKQIQMVTALLIQLIQCSANIPDALRQASSGNAVLEVSVDANYPTKCLEAATEAGCLFWSRVLQRFASV KTQDASELKSIMENLVTDLLTTLNLPEYPASAPFLEVLCVLLLQNAGLKSKDISARSMAIDILGTIAARLKRDAMICSQE KFWIFQGLLSQDADSQHYPKDTCCVCLGGRAENLYTCHDCQRLFHADCLDIKEHDVSNQNWYCHTCICSKQLLVLQSYCT SQRKDGVKKNHNSSTDDSEVPMHEVVQQLLLNYLQDVASADELHLFSCWFYLCMWYKDEPKFQQNSVYYIARMKSRIIVR DSGTVSSKLTRDLIKKITLALGQNSSFCRGFDTILHLLLASLRENSPVIRAKALRAVSIIVEADPEVLGDKRVQLAVEGR FCDSAISVREAALELVGRHIASHPDVGFKYFEKIAERIKDTGLSVRKRAIKIIRDMCTSNANFSGFTRACTEIMSRISDD ESSVQDLVCKTFYEFWFEEPSASETQVFGDGSTVSLEVAKKTEQIVEMSRGGMPNQQLVTVNPLLVTVIKRNLTLDFLPQ SAKAIGVNPVSLATVRKRCELMCKCLLEKMLQVEEMNSNEVAVGALPYVLVLHAFCLVDPTLCAPASNPSQFVVTLQPYL KTQVDKREAAQLLESIIFIIDAVLPLLRKLPPCIVEELQLDLKQMIIRNSFLTVVHACIKCLCSVSKMAGKGAAVVEHLI QVFFKYLDKEAVDSKQLVGRSLFCIGLLVRYGNCLLASSSNQHSDVKRSLNLCMKYLVVEDLGLKARSLQALGFVLIARP EYMLEKDIGKILERSLSSTADTCLKIQALQTMFEYLLDAESQMTTDKTDGNVADYSVGAGQSVPVAAGAGDTNMCGGIVQ LYWDNILGTCLDFSEPVRQSALKIVEVVLRQGLVHPITCVPHLIALETDPLESNSKLAHHLLMNMNEKYPAFFETRLGDG LQMSFMFIQSICGSSENVNHKNQSRIPVSGKGKPEAGSLTQARVGVSRIYKLIRGNRISRNKFMSSIVRKFDNPRWNKLV IPFLRYCTEVLALLPFTSPDEPLYLIYAINRVVQLRAGPLEANFKSWNSSLLRSEGHSTPYENGTCRWGPDEPILATPVM SMDLNETFQQNLHAQPIFDDMKSVDLNRTNHQLPDHPLSHNGNLEAKPQAASFMDSCTFSKDDTEEVQAGCLSAIALQLL LKLKRHLKIMYSLDDARCQAYSPSEPPKPGEVLSKQSIALNISEYQFSLPTTPQELTQRYQEFKNALKEDTMDYSLYTAN IRRKRPSITPRKVRKSVHTARGGFEEEEDDDADWAGGMRQINVSGRRANLRSSRQH
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 24 | 1801 | 1778 | 0.0 | ||
| PANTHER | 24 | 1801 | 1778 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 646 | 714 | 69 | 2.4E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 654 | 715 | 62 | 5.96E-9 | ||
| ProSiteProfiles | 660 | 709 | 50 | 9.0 | ||
| SMART | 662 | 707 | 46 | 1.9E-5 | ||
| CDD | 662 | 706 | 45 | 9.02296E-7 | – | |
| Gene3D | 826 | 978 | 153 | 6.7E-6 | ||
| SUPERFAMILY | 833 | 1554 | 722 | 1.47E-28 | ||
| Pfam | 855 | 896 | 42 | 3.0E-12 | ||
| Pfam | 1355 | 1552 | 198 | 2.0E-54 | ||
| MobiDBLite | 1770 | 1796 | 27 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Chromatin binding | Interacting selectively and non-covalently with chromatin, the network of fibers of DNA, protein, and sometimes RNA, that make up the chromosomes of the eukaryotic nucleus during interphase. | ||
| Biological process | Regulation of gene expression | Any process that modulates the frequency, rate or extent of gene expression. Gene expression is the process in which a gene's coding sequence is converted into a mature gene product or products (proteins or RNA). This includes the production of an RNA transcript as well as any processing to produce a mature RNA product or an mRNA or circRNA (for protein-coding genes) and the translation of that mRNA or circRNA into protein. Protein maturation is included when required to form an active form of a product from an inactive precursor form. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0265500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…