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LotjaGi3g1v0183500.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0183500
Transcript ID LotjaGi3g1v0183500.3
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT1G08420.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 2; Swiss-Prot: sp|Q9SJF0|BSL2_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0H3J2|A0A0R0H3J2_SOYBN Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0183500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:25705832..25720536) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATCCAGCTACAGAGAATCACGCCGCGGCTGAGGAAGACGG AGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCGGCGCAGCCACAGAGCTCGGTGGTTGGGCCGAGGCTGG CGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGAGGACGGGCCGGGGTCGAGGTGCGGCCACACGTTGACG GCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTGGTCCGAGGCTGATTTTGTTCGGTGGTGCCACTGCGCT TGAAGGCAATTCTGCGGCTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAATGCTGGCATACGTAAGTATATATAGTTATGAAATT GTCTCAGCTTTGTTTTCGGCAGCATGTGTTAGCAGTTAGCTTATTTTCCTCCGGGTATTGTGGTGGCTGAGTGCTTTTGA GTTTTGGTAACTTATGACTACGCCATTTGCATGCTTAATTTATATTCAAGTTGAATTGAAATTGTGGCTCCACACGCTGG TTTCTTTTTGTCAATGTCTAGATATTAGTTAGTACAACTGTATAAATGCAAAGAATCCCAGTTGCATTGCCAGATACGAC ATTGAAGTGGTGATTTCTTGGCAGTGTTTGTCATCTTTTAGTGTGTTTGGACTTATCATCTTTTAGGGTGTATTTGGCTT TTGGTTGGATTCACCGCTGATATCCGTTGATTTGGCAAAATCTTGCTTCTTCGTTTGTTCATTAGGATGCGTCTAGGCAA ACGGGAAACCAAACACACTTAGTCTTTGGTGCTTATGAACTTGATGTTTCCTGTCATGGGAACTAGGGCTTTAAACCAAA AATTTGTCAGTTCCTTTTATGGAGTAAAATCTGGCTTTAATGGTCACAAATGCTCCCCAGTGGTTCACTTGGATGGATGA 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GAATAGGCAAACTGCCAAAGGAGTTGAGTATCTGGTTGAAGCATCTGCAGCAGAAGCTGAAGCTATCAGTGCCGCACTGG CTGCTGCAAAGGCACGACAAGAGAATGGACTCAATGGAGAAGTTGAATTGCCTGACAGAGACCGTGGGGCGGAGGCTACC CCAAGTGGGAAACACACATCTTCCTTGATTAAGCCTGATTCTGTTGGGTCAAATAACATTGCTTCTGGTGGAGTTCGGCT GCATCACAGAGCTGTGAGTAACATATTTTAATTACCAAAGAAAAACTATGGTATCTATAAATTTCCATAAAATATTTAGG CTTAAATGCTCAATTGGCCCCTGTAATTGTAAAGGGAATCAACCCTGGTCCCTGTAAAATTTTCGCATCAAATTGAGTCC CAAATATTTTTTTTTAATCCAATTAAGGACAAAGGGTGCCAGACGGTGATGTGGCTTGATTTTTAGCCTACTCAGCTTTT CCACGTGGCATTTTAATTTTTTTTAATTGAATAATTCCAAAACTTAATTTTGTAATTCCAAGTCATAAATTAAAAATAAA ATAAAATCTTAATACAAAACCTAAACTAATTCCATTCCATAAAACAATCAAACACTGATCATCAAACGAACACTAATCAA TAATCATCAAATAATAGGTTCCAAAATGAAAAGTACCAATTTTTTCCTATCATCTAGGAAAAATAAGATCGACCTCAAGA AAGAAAAAAAATCAACGTAAACGAATGAATTGGGGCACAAAATTACAACTTTTTTCACCTTCATCGATAATAAATTAACC TCAACAGAGATTCTAATAGCATAAGCATATTTTTGAGTTTGAGAACTGAATCCCTCCCGTTTTAAAACCCACGAGAACCT CCATTAACAGGTGCTACAGAGAGAGTGAGAGAGTGGCGATGCTGAAGGAGACAGCGAAGGAGGAGGTTCCGCTCTTCCAC 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AGTTTGTATTGCCTATATTTTTGAGCAATTAAAGATATGTACCGAGGATTATGACCTATGTGAAAACATACGGAAGATTT TTGGCAACTTTTAGCCCTTGTAATTCTTACTTACTTTTGGCAACATAAGTGATTAAGAATGAATGCATTTGAGAGGAAGT TAGGGTATTGCCTATTTGGAACAGATATTAGATCTCTCCTTAGGTGGGCTAGGCTTGTATAAGGAAGTTGCATTAAGGGT AATCCAGTAGTTACAAATAGAGACCATAAAAAACTTTTGGTCAAACAATTTAGAAGAATTTAGATTTAAATGGTCGGTGC CTTGGTGGTCATTAGACATGATTGATGATAGGATATTATGGTGTCATTGATCCAAGTAACTGACCACACCCTTGGTGATG ATGCACTTCAACTATTAGATTTTCTTGCATTTTGTTGAAGTTTGATATATTGAAAGGTAGGCTAAACTGTGTAGATTCTT ATTTATCACTGTGCCCTATGCTGATGTTATTACCAATGCATGAGTGTGGGCACATCATTTAAATTTAAATTTTGTCGTCA TGACGGGTGTTATTTGAATTATAAATCATAGGCATAGTTGCCTTGTTGGATGGTGTGTGCTCTTTATGTGCTCCTCGTGC TCATTTTAACGGGGTTTGGTATTTCAGCCTGATCGGGTTGTGGAATTTTGCAACAACAATGATCTTCAGCTAATTGTTCG TGCACATGAATGTGTGATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCCCAGGGACATCTTATCACGCTTTTCTCAGCTACAAATTATT GTGGTATATGTTGCTGACTTCTGCATTGCATTTTCATCCTTAAATCATGTTATCTTATATATTTTGGCGCTTGTTCAAAT AGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTTGGGCAGAGACCTTGTTGTGGTTCCTAAGCTGATTCATCCATTAC CACCTGCAATTTCTTCACCAGAAACGTCACCTGAACGTCATATTGAAGATACATGGATGCAGGTATTCCAAATATTTTCC ATTAAATCATGGTGCTGTGTTATATAATGTGTTACAGCCATCAAATGTACAGGAGCACATCTGTGTGAAGTTATAGCTGA TTTCATTTCAAAGCATTATGGTGCTTTTATTTAAAAATAAACACTGTTATTATATGTGCAGGAGTTGAATGCTAACAGAC CGGCGACACCAACTAGAGGCCGTCCCCAAGTAACAAATGACCGAGGCTCGCTCGCTTGGATGTAG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0183500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATCCAGCTACAGAGAATCACGCCGCGGCTGAGGAAGACGG AGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCGGCGCAGCCACAGAGCTCGGTGGTTGGGCCGAGGCTGG CGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGAGGACGGGCCGGGGTCGAGGTGCGGCCACACGTTGACG GCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTGGTCCGAGGCTGATTTTGTTCGGTGGTGCCACTGCGCT TGAAGGCAATTCTGCGGCTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAATGCTGGCATACGTTTGGCTGGTGCCACGGCTGATG TCCACTGTTATGATGTCTTGACTAATAAATGGTCTAGGTTAACTCCCTATGGAGAACCTCCAACACCAAGGGCTGCACAT GTGGCAACTGCTGTTGGTACCATGGTTGTTATTCAGGGTGGCATTGGTCCTGCTGGTTTGTCAGCAGAGGACCTTCATGT TCTTGATCTCACGCAACAATGGCCCCGCTGGCATAGAGTATCTGTTCAGGGCCCTGGACCAGGGCCACGCTATGGACATG TAATGGCTTTGGTGGGGCAGAGGTATCTTATGGCAATTGGAGGCAATGATGGAAAAAGACCTTTGGCTGATGTGTGGGCC TTGGACACAGCTGCCAAGCCTTATGAGTGGCGCAAGTTAGAGCCTGAAGGAGAGGGACCACCTCCATGCATGTATGCAAC TGCAAGTGCACGCTCGGATGGGCTTCTTCTGCTTTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGTGTTCCATTGGCTAGTGCATATG GACTTGCTAAGCATAGAGATGGTCGTTGGGAATGGGCTATTGCTCCAGGTGTCTCACCATCTCCAAGATATCAACATGCA GCGGTATTTGTGAATGCAAGACTCCATGTGTCTGGTGGGGCTCTTGGTGGAGGACGGATGGTCGAGGACTCATCAAGTGT TGCAGTATTGGACACTGCTGCTGGTGTTTGGTGTGATGCAAAATCTGTTGTAACCAGTCCAAGGACTGGTAGATACAGCG CTGATGCAGCTGGAGGAGACGCTGCAGTTGAGTTGACTCGGCGTTGTAGGCATGCTGCGGCTGCTGTTGGTGATCTAATT TTTATTTATGGTGGTTTACGTGGGGGAATCTTGCTTGATGACCTACTTGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCTGAAACAAC ATCTGCTGCTTCACATGCTGCTGCTGCAGCAGCTGCATCTAATGTACAAGCAGGACACTTGCCTGGACGAAATGGCTTTG TTGATGATAGAACGAGACAAGCGATGCCTGAAGCGGCTGCTGATGGTTCTGTTGTATTAGGCAATCCAGTTGCTCCCCCA ATGAATGGTGACATTTATACGGATATCAGCACTGAAAATGCCATGCTTCAGGGACCTCGTTTGAATAGGCAAACTGCCAA AGGAGTTGAGTATCTGGTTGAAGCATCTGCAGCAGAAGCTGAAGCTATCAGTGCCGCACTGGCTGCTGCAAAGGCACGAC AAGAGAATGGACTCAATGGAGAAGTTGAATTGCCTGACAGAGACCGTGGGGCGGAGGCTACCCCAAGTGGGAAACACACA TCTTCCTTGATTAAGCCTGATTCTGTTGGGTCAAATAACATTGCTTCTGGTGGAGTTCGGCTGCATCACAGAGCTGTAGT TGTTGCTGCCGAGACTGGTGGAGCCTTAGGTGGTATGGTTAGACAACTTTCAATTGATCAATTTGAAAATGAAGGCAGGC GTGTCAGTTATGGGACTCCGGAAAATGCAACTGCTGCTAGAAAATTGTTAGATCGGCAGATGTCAATCAATAGTGTGCCC AAAAAGGTCATAGCACACCTCTTAAAGCCTCGTGGATGGAAACCACCAGTACGCCGACAGTTTTTCTTAGATTGTAATGA AATTGCTGATCTCTGTGATAGTGCTGAGCGGATATTTTCAACAGAACCAAGTGTCTTACAACTTAGTGCTCCGATTAAAA TATTTGGTGATTTACATGGGCAGTTTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGACGAGTATGGTGCACCGTCCACTGCCGGTGAT ATTGCATATATCGATTATCTATTCCTAGGAGATTATGTTGATAGGGGACAGCACAGCCTGGAAACTATATCCCTTCTTCT TTCTCTGAAGGTTGAGTATCCCAACAATGTACATTTAATACGTGGAAATCATGAAGCTGCAGATATTAATGCTCTTTTTG GTTTTCGAATTGAGTGCATTGAGAGGATGGGTGAGAGAGATGGAATTTGGACATGGCATCGAATGAACCGGTTATTTAAT TGGCTTCCTCTGGCGGCTTTAATTGAAAAAAAAATTATTTGCATGCATGGTGGGATCGGTCGTTCAATAAGTCATGTGGA GCAGATTGAGAATATTCAGCGTCCAATTCCGATGGAAGCAGGGTCAATTGTGCTCATGGATCTATTATGGTCTGATCCTA CAGAGAATGACAGTGTGGAAGGACTGCGGCCAAATGCTAGAGGTCCTGGATTAGTTACTTTTGGTCCTGATCGGGTTGTG GAATTTTGCAACAACAATGATCTTCAGCTAATTGTTCGTGCACATGAATGTGTGATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCCCA GGGACATCTTATCACGCTTTTCTCAGCTACAAATTATTGTGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTTGGGCA GAGACCTTGTTGTGGTTCCTAAGCTGATTCATCCATTACCACCTGCAATTTCTTCACCAGAAACGTCACCTGAACGTCAT ATTGAAGATACATGGATGCAGGAGTTGAATGCTAACAGACCGGCGACACCAACTAGAGGCCGTCCCCAAGTAACAAATGA CCGAGGCTCGCTCGCTTGGATGTAG 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0183500.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDVDSSMVPDADHDPATENHAAAEEDGEKLPEPPSSEGGSPAQPQSSVVGPRLAPTYTVVNAVMDKKEDGPGSRCGHTLT AVAAVGEEGTPGYIGPRLILFGGATALEGNSAASGTPSSAGNAGIRLAGATADVHCYDVLTNKWSRLTPYGEPPTPRAAH VATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQWPRWHRVSVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGNDGKRPLADVWA LDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLASAYGLAKHRDGRWEWAIAPGVSPSPRYQHA AVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSVAVLDTAAGVWCDAKSVVTSPRTGRYSADAAGGDAAVELTRRCRHAAAAVGDLI FIYGGLRGGILLDDLLVAEDLAAAETTSAASHAAAAAAASNVQAGHLPGRNGFVDDRTRQAMPEAAADGSVVLGNPVAPP MNGDIYTDISTENAMLQGPRLNRQTAKGVEYLVEASAAEAEAISAALAAAKARQENGLNGEVELPDRDRGAEATPSGKHT SSLIKPDSVGSNNIASGGVRLHHRAVVVAAETGGALGGMVRQLSIDQFENEGRRVSYGTPENATAARKLLDRQMSINSVP KKVIAHLLKPRGWKPPVRRQFFLDCNEIADLCDSAERIFSTEPSVLQLSAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGAPSTAGD IAYIDYLFLGDYVDRGQHSLETISLLLSLKVEYPNNVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGERDGIWTWHRMNRLFN WLPLAALIEKKIICMHGGIGRSISHVEQIENIQRPIPMEAGSIVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVV EFCNNNDLQLIVRAHECVMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPAISSPETSPERH IEDTWMQELNANRPATPTRGRPQVTNDRGSLAWM 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 994 994 0.0
PANTHER 1 994 994 0.0
MobiDBLite 1 32 32 -
MobiDBLite 1 52 52 -
PIRSF 27 994 968 0.0
Gene3D 92 252 161 2.9E-15
SUPERFAMILY 128 418 291 4.97E-40
Pfam 226 270 45 1.0E-4
Gene3D 253 444 192 7.5E-12
Pfam 315 360 46 2.8E-5
MobiDBLite 538 569 32 -
MobiDBLite 540 554 15 -
MobiDBLite 555 569 15 -
Gene3D 624 969 346 2.6E-109
CDD 643 945 303 0.0
SUPERFAMILY 648 954 307 1.5E-94
SMART 663 947 285 2.0E-104
Pfam 691 898 208 8.1E-33
PRINTS 691 718 28 2.0E-59
PRINTS 726 753 28 2.0E-59
PRINTS 759 783 25 2.0E-59
ProSitePatterns 760 765 6 -
PRINTS 797 823 27 2.0E-59
PRINTS 887 907 21 2.0E-59
PRINTS 909 925 17 2.0E-59
MobiDBLite 971 994 24 -
MobiDBLite 971 985 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphoprotein phosphatase activity Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Brassinosteroid mediated signaling pathway A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid.
Molecular function Hydrolase activity Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0183500.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…