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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0386800 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0386800.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Calpain, putative; TAIR: AT1G55350.1 calpain-type cysteine protease family; Swiss-Prot: sp|Q8RVL2|DEK1_ARATH Calpain-type cysteine protease DEK1; TrEMBL-Plants: tr|V7CN28|V7CN28_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0386800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:76527587..76557375) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGAAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAGGGTTTTTAATCTTGTTTACAATAATAATTCTTACCCACTCAACTCTGCAACA ATCTCAGAGAGACTGACTTTCAGTAACAGATTCATACCCAATTCCACACAACATACAAACAAACAATTTCACTCTCTGCT TTTTCCTAACCCTAGCTACCTCACCTCTTAGCTTAGCTTAGCTTAGCTTAGCTTCACTCTCAAACCCTAACTAGCTTCAC CCATTTCAGCTCAATTCACCATCATCATCATCATCATGCTGCCATTTCATTCCGCAACAATGAAGTAGCTGCATCCTGCA TCGCCCTTTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACATGCATCATCATCATCATCACTGTAGGTGCATGCGCTTCTTCGTTTGA GAGAACAGCAACATGGAAGAAGAAGGGGGTGACCATGGGGTTCTCCTGGCTTCTGCGATTTGCGGGACCCTCTTCTCGGG TTTGGCTGCGGCTTCTTTCTCCATACTCTGGGCTGTCAATTGGAGACCCTGGCGAATTTATAGGTAAAACTAAAACCCCT TTCCATTATTTTCTCAATTTCTGTTTATAATTCAGCTATGTTGTGTAGTTTTAAGGTTTAATTATCATGATACACTGCAA ATGCTGTTGAATTGTTTGTTATGATTGGTAATTAAATTCATACTTGTTTTGAAATTAAATGAAATTTACTGGCATTGGCT GCTTTAGGGTACTCCTGTTGTTAGTGACAATTTAATTTGGGAAATAACTTAAATTGTCAGGGGGGACTCTCTGGATTTTT GGATATTCTATGGATTATAACTGTTTGGCTCCGGTCTTGAATTATGAGCAGTTTGATTTTTGATAACTTGAAAGAGATTC TATACACTGGTATTTACGGTCGTATCGCGATCTTGATCTTTATAATCTCGAGTGTTTTTCATTTTTGCTTCTTTTTAAAT 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0386800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGAAGAAGGGGGTGACCATGGGGTTCTCCTGGCTTCTGCGATTTGCGGGACCCTCTTCTCGGGTTTGGCTGCGGC TTCTTTCTCCATACTCTGGGCTGTCAATTGGAGACCCTGGCGAATTTATAGTTGGATCTTTGCTCGGAAATGGCCAAATA TCTTGCATGGTCCTCAACTCCATTTGCTCTGTGGTTTCCTGAATCTTTCTGCATGGTTTGTTGTTGTTTCTCCAATTATG GTGCTTATCATTTGGGGCTCCTGGTTGATTGTAATATTGAATCGAGACCTGATCGGTTTGGCTGTAATAATGGCCGGCAC TGCTCTTCTATTGGCATTTTATTCTATTATGTTGTGGTGGAGAACACAATGGCAAAGCTCTAGGGCTGTTGCAATCCTGC TTCTTCTGGCGGTTGCTCTACTTTGTGCATATGAACTTTGTGCAGTATATGTTACAACTGGATCACGAGCATCTGATCGT TATTCTCCTTCTGGTTTCTTTTTTGGAGTTTCAGCAATTGCTCTGGCGATCAACATGCTATTTATTTGCCGAATGATATT TAATGGGAATGGTTTGGATGTGGATGAATATGTGCGAAGAGCGTACAAATTTGCTTATTCCGATTGCATTGAAGTGGGTC CTGTGGCTTGTTTACCTGAACCACCAGACCCGAACGAGTTATATCCTCGGCAATCTAGAAGGGCTTCCCATCTTGTACTT CTTTATCTTGGCTCGGTATTTGTTCTGGTGGTATACTCCATCTTGTATGGTCTAACTGCAAAGGAGAAAAATTGGCTTGG AGCAATCACATCAGTTGCTGTTATTGTTCTTGACTGGAATATGGGAGCATGCCTTTATGGTTTTCAACTTCTTAACAAAC GTGTTACAGTACTATTTATTGCTGGAACATCTCGGGTGTTTCTTATCTGTTTTGGAGTACAATACTGGTACCTGGGGCAC 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CATTACTGGGCCTCAAACAATTTTTATTTGAGCCGGAAACAGATGGTCTTCGTTTGCTTGCTTGCCTTTCTTTTGGCTTT GGCAGCATTTCTTGTTGGGTGGTTTGAAGATAAACCATTCTTTGGAGCATCCGTTGGTTACTTTATATTTCTTTTTCTTC TTGCTGGGCGGGCATTGACAGTTTTGCTTTCAAACCCTATTGTGGTATATTCTCCCCGTGTTTTGCCAGTGTATGTGTAT GATGCTCATGCAGATTGTGGAAAGAATGTCAGTGTGTCCTTTCTCATGCTATATGGGATTGCCCTGGCTACTGAAGGCTG GGGGGTGGTTGCCAGTTTAAAGATTTATCCACCTTTTGCTGGTGCAGCTGTATCAGCAATAACACTTGTTGTTTCATTTG GTTTTGCTGTCTCCCGTCCTTGCCTAACTCTTAAGATGATGGAAGATGCTGTTCATTTTCTCAGCAAGGAAACTGTTGTT CAAACAATCGCTAGATCAGCGACGAAGACCAGAAATGCATTATCTGGAACTTACTCAGCACCACAGAGATCAGCTAGTTC GGCAGCACTTTTGATTGGAGACCCTACTGCTATGCTTGATAGGGCAGGGAATTTTGTGCTTCCCAGAGCTGACGTCATGA AATTGAGAGACCGTTTGAGAAATGAAGAATTGGTTGCAGGTTCATTCTTTAGTAGATTAAGGTATGGAAGGACATTTCGC CATGATCCGACCAGTGATGTAGATCACAGAAGAGTGATGTGTGCTCATGCGCGGATTCTAGCACTAGAAGAGGCCATTGA TACTGAGTGGGTGTACATGTGGGACAAGTTTGGTGGTTACTTGCTTCTGTTGCTTGGTTTGACGTCCAAGGCAGAACAAG CACAGGATGAAGTTCGTTTGAGACTCTTTCTTGATAGCATTGGATTTTCTGACTTAAGTGCTAAGAAAATAAAGAAGTGG ATGCCAGAAGATCGCAGGCAATTTGAAATCATTCAGGAGAGTTACATAAGAGAAAAGGAGATGGAAGAGGAAATCTTAAT GCAAAGGCGTGAAGAGGAGGGGAGAGGGAAAGAGAGGAGGAAGGTCCTCCTTGAAAAAGAGGAGCGCAAATGGAAGGAGA TAGAAGCTTCTCTGCTCTCCTCCATTCCTAATGCTAGCAGCAGAGAGGCTGCAGCCATGGCAGCCGCAGTGCGTGCAGTA GGTGGTGATTCTGTTTTAGATGATTCTTTTGCTCGTGAGAGGGTTTCAAGCATTGCACGTAGGATACGTGCTTCACAGTT AGCTCGCCGTGCCCTTCAGACAGGAGTGACTGGAGCAATATGTGTTCTTGATGATGAGCCAACGGCAAGTGGCAGGCATT GCGGTCCAATTGACTCCAGTCTATGTCAAAGTCAAAAGATTAGCTTCTCCATTGCATTGATGATTCAGCCTGAGTCTGGT CCTATTTGCCTTTTGGGCACGGAGTTTCAGAAGAAGGTTTGCTGGGAAATTCTCGTGGCTGGTTCTGAACAAGGTATTGA GGCTGGACAAGTTGGGCTTAGATTGATTACTAAAGGTGATAGACATACAACTGTTGCAAAGGAGTGGAGCATTGGTGCAA CAAGTATTGCAGATGGAAGGTGGCATATTGTAACAATGACAATTGATGCTGATATAGGTGAAGCAACATGTTATTTAGAT GGTGGATTTGACGGCTACCAAAATGGATTGCCATTGTGTGTGGGTAGCAGCATTTGGGAACAGGGGACAGAAGTGTGGAT TGGAGCTAGACCGCCAACAGATATTGATGCATTTGGTAGGTCAGATAGTGAAGGGGTTGAATCCAAGATGCATATTATGG ATGCTTTTCTCTGGGGAAGGTGTTTAACAGATGATGAGGTTTCTGCTCTCTATACCTCAGTGGCTTCAGCGGACATCAGT GCACTTGACTTCCCTGAAGATAATTGGCAGTGGGCTGAATCACCTTCTAGGGCTGATGGTTATGACAGTGATCCTGCCGA TGTAGATTTATATGACAGAGATGATGTAGATTGGGATGGACAGTATTCTAGTGGGAGGAAAAGAAGATCAGAACGTGATG GCGTGGTGTTGGATGTGGATTCCTTTTCCAGGAAGTATAGAAAACCTAGAATTGAAACGCAGGAAGAGATTAATCAACGG ATGCTATCAGTAGAATTGGCTGTCAAAGAAGCTCTCTTGGCTAGAGGAGAGATATGTTTTACAGATCAGGAATTTCCTCC AAATGATCACTCTTTGTTTTTGGACCCTGAAAACCCCCCCGCAAAGTTACAGGTTGTTTCTAAGTGGTTGAGACCAGGTG AAATTGCTAGACAGAACAATCTAGACTGCCATCCCTGCTTATTTTCAGGATCTCCAAATCCTTCTGATGTTTGTCAGGGT CGGTTAGGTGATTGTTGGTTCTTGAGCGCTGTTGCTGTTCTAACAGAGGTTTCACGTATATCGGAGGTGATCATCACTCC AGAATATAATGAGGAGGGAATATACACCGTTCGCTTTTGTGTTCAGGGTGACTGGATCCCGGTTGTGGTTGATGATTGGA TTCCATGTGAATCACCGGGTAAACCTGCATTTGCAACTAGTAAGAAAGGTTATGAACTTTGGGTTTCCATATTGGAGAAG GCATATGCCAAGTTGCATGGTTCTTATGAAGCACTAGAAGGTGGGCTTGTTCAGGATGCTTTGGTTGATCTAACTGGGGG TGCTGGGGAGGAAATTGACATGAGAAGTGGTGAAGCCCAGATTGACCTTGCAAGTGGTAGATTGTGGTCTCAATTGTTAC GCTTCAAGCAAGAAGGTTTTCTGCTAGGTGCAGGAAGTCCTTCAGGTTCAGATGTGCACATATCTTCTAGTGGCATTGTG CAAGGACATGCATACTCAATACTGCAGGTAAGAGAGGTAGATGGTCACAAACTTGTTCAGATCCGAAATCCATGGGCCAA TGAAGTTGAGTGGAATGGTCCCTGGTCTGACTCATCACCTGAATGGACAGATAGGATAAAGCACAAGCTGAAGCATGTTT CTCAGTCAAAAGATGGTATATTCTGGATGTCCTGGCAAGATTTTCAAATTCATTTTCGATCGATATATATTTGCCGAATC TATCCATCCGAGATGCGTCATTCTGTTCATGGTCAATGGCGTGGCTATAGTGCTGGGGGTTGTCAGGATTATGACACATG GAATCAAAATCCACAGTTCAGACTGACTGCAACTGGTCAAGATGCATCACATCCAATTCATGTATTCATTACATTAACTC AGGGTGTGGGATTTTCAAGAACTACTGCTGGTTTCAGAAACTACCAATCCAGTCACGACTCACTGATGTTCTACATTGGA ATGAGGATACTCAAAACACGTGGCCGGCGTGCTGCGTACAATATATACCTACATGAATCAGTTGGTGGGACAGACTATGT TAACTCTCGAGAAATATCCTGTGAAATGGTTCTGGAACCTGAGCCTAAGGGATACACTATAGTCCCTACTACTATACACC CTGGGGAAGAAGCACCCTTTGTACTTTCTGTTTTCACCAAGGCATCAATAAATCTGGAAGCTTTGTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0386800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEEEGGDHGVLLASAICGTLFSGLAAASFSILWAVNWRPWRIYSWIFARKWPNILHGPQLHLLCGFLNLSAWFVVVSPIM VLIIWGSWLIVILNRDLIGLAVIMAGTALLLAFYSIMLWWRTQWQSSRAVAILLLLAVALLCAYELCAVYVTTGSRASDR YSPSGFFFGVSAIALAINMLFICRMIFNGNGLDVDEYVRRAYKFAYSDCIEVGPVACLPEPPDPNELYPRQSRRASHLVL LYLGSVFVLVVYSILYGLTAKEKNWLGAITSVAVIVLDWNMGACLYGFQLLNKRVTVLFIAGTSRVFLICFGVQYWYLGH CISYAVMASVLLGAAVSRHLSVTNPLAARRDALQSTVVRLREGFRKKEQNSSSSFSEGCGSSLKRSSSVEAGNLGNGTET ARGMTAGDGSNGNNAMSQTANLPDGINSDKSIDSGRSSLALHSSSCRSAVHEPEVATSSNDRNLDHNNSLVVCSSSGIDS QGNDSSASNSANQQTLDFNLALAFQERLKDPKIATMLKRRTRHGDIELSSLLQDKGLDPNFAMMLKEKSLELDPTILALL QRSSLDADRDHQQNTDNTSVDNAIPHQISLSEELRLHGLEKWLQLCRLVLHHITGTPERAWVLFSFIFVLETVTVAIFRP KTIKIINATHQQFEFGLAVLLLSPVICSIMAFLRSLTAEETTMTSRPRKYGFIAWLLSTCVGLLLSFLSKSSVLLGLSLT VPLMVACLSVAVPIWICNGYQFWVPRVNCTGSAGNDRIPRTKGIVLIFCMSVFVGSVLALGAIVSAKPLDDLRYKGWNGD QKSLVSPYTSSVFLGWAMASAIGLVVTSALPIISWFATYRFSLSSAILVGISAVILVAFCGVSYLEVIKSREDQVPTKGD FLAALLPLICIPAVLSLCCGLLKWKDDDWKLSRGVYIFVIIGLMLLLSAISALIVVVKPWTIGVAFLLVLLLMVLAIGAI HYWASNNFYLSRKQMVFVCLLAFLLALAAFLVGWFEDKPFFGASVGYFIFLFLLAGRALTVLLSNPIVVYSPRVLPVYVY DAHADCGKNVSVSFLMLYGIALATEGWGVVASLKIYPPFAGAAVSAITLVVSFGFAVSRPCLTLKMMEDAVHFLSKETVV QTIARSATKTRNALSGTYSAPQRSASSAALLIGDPTAMLDRAGNFVLPRADVMKLRDRLRNEELVAGSFFSRLRYGRTFR HDPTSDVDHRRVMCAHARILALEEAIDTEWVYMWDKFGGYLLLLLGLTSKAEQAQDEVRLRLFLDSIGFSDLSAKKIKKW MPEDRRQFEIIQESYIREKEMEEEILMQRREEEGRGKERRKVLLEKEERKWKEIEASLLSSIPNASSREAAAMAAAVRAV GGDSVLDDSFARERVSSIARRIRASQLARRALQTGVTGAICVLDDEPTASGRHCGPIDSSLCQSQKISFSIALMIQPESG PICLLGTEFQKKVCWEILVAGSEQGIEAGQVGLRLITKGDRHTTVAKEWSIGATSIADGRWHIVTMTIDADIGEATCYLD GGFDGYQNGLPLCVGSSIWEQGTEVWIGARPPTDIDAFGRSDSEGVESKMHIMDAFLWGRCLTDDEVSALYTSVASADIS ALDFPEDNWQWAESPSRADGYDSDPADVDLYDRDDVDWDGQYSSGRKRRSERDGVVLDVDSFSRKYRKPRIETQEEINQR MLSVELAVKEALLARGEICFTDQEFPPNDHSLFLDPENPPAKLQVVSKWLRPGEIARQNNLDCHPCLFSGSPNPSDVCQG RLGDCWFLSAVAVLTEVSRISEVIITPEYNEEGIYTVRFCVQGDWIPVVVDDWIPCESPGKPAFATSKKGYELWVSILEK AYAKLHGSYEALEGGLVQDALVDLTGGAGEEIDMRSGEAQIDLASGRLWSQLLRFKQEGFLLGAGSPSGSDVHISSSGIV QGHAYSILQVREVDGHKLVQIRNPWANEVEWNGPWSDSSPEWTDRIKHKLKHVSQSKDGIFWMSWQDFQIHFRSIYICRI YPSEMRHSVHGQWRGYSAGGCQDYDTWNQNPQFRLTATGQDASHPIHVFITLTQGVGFSRTTAGFRNYQSSHDSLMFYIG MRILKTRGRRAAYNIYLHESVGGTDYVNSREISCEMVLEPEPKGYTIVPTTIHPGEEAPFVLSVFTKASINLEAL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 10 | 32 | 23 | - | – | |
| Phobius | 12 | 35 | 24 | - | – | |
| Phobius | 36 | 59 | 24 | - | – | |
| Phobius | 60 | 85 | 26 | - | – | |
| TMHMM | 70 | 92 | 23 | - | – | |
| Phobius | 86 | 96 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 97 | 119 | 23 | - | – | |
| Phobius | 97 | 120 | 24 | - | – | |
| Phobius | 121 | 131 | 11 | - | – | |
| Phobius | 132 | 153 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 132 | 154 | 23 | - | – | |
| Phobius | 154 | 164 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 164 | 183 | 20 | - | – | |
| Phobius | 165 | 187 | 23 | - | – | |
| Phobius | 188 | 238 | 51 | - | – | |
| TMHMM | 238 | 260 | 23 | - | – | |
| Phobius | 239 | 259 | 21 | - | – | |
| Phobius | 260 | 264 | 5 | - | – | |
| Phobius | 265 | 288 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 266 | 288 | 23 | - | – | |
| Phobius | 289 | 294 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 295 | 317 | 23 | - | – | |
| Phobius | 295 | 316 | 22 | - | – | |
| Phobius | 317 | 321 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 322 | 341 | 20 | - | – | |
| Phobius | 322 | 340 | 19 | - | – | |
| Phobius | 341 | 619 | 279 | - | – | |
| MobiDBLite | 369 | 438 | 70 | - | – | |
| Phobius | 620 | 638 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 621 | 640 | 20 | - | – | |
| Phobius | 639 | 657 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 655 | 677 | 23 | - | – | |
| Phobius | 658 | 678 | 21 | - | – | |
| Phobius | 679 | 689 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 690 | 707 | 18 | - | – | |
| Phobius | 690 | 708 | 19 | - | – | |
| Phobius | 709 | 713 | 5 | - | – | |
| Phobius | 714 | 736 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 722 | 744 | 23 | - | – | |
| Phobius | 737 | 763 | 27 | - | – | |
| TMHMM | 764 | 786 | 23 | - | – | |
| Phobius | 764 | 784 | 21 | - | – | |
| Phobius | 785 | 812 | 28 | - | – | |
| Phobius | 813 | 836 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 814 | 836 | 23 | - | – | |
| Phobius | 837 | 842 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 843 | 865 | 23 | - | – | |
| Phobius | 843 | 865 | 23 | - | – | |
| Phobius | 866 | 880 | 15 | - | – | |
| TMHMM | 880 | 902 | 23 | - | – | |
| Phobius | 881 | 902 | 22 | - | – | |
| Phobius | 903 | 913 | 11 | - | – | |
| Phobius | 914 | 936 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 915 | 937 | 23 | - | – | |
| Phobius | 937 | 941 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 942 | 964 | 23 | - | – | |
| Phobius | 942 | 963 | 22 | - | – | |
| Phobius | 964 | 974 | 11 | - | – | |
| Phobius | 975 | 995 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 976 | 995 | 20 | - | – | |
| Phobius | 996 | 1006 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 999 | 1021 | 23 | - | – | |
| PANTHER | 1000 | 2151 | 1152 | 4.6E-215 | – | |
| PANTHER | 1000 | 2151 | 1152 | 4.6E-215 | – | |
| Phobius | 1007 | 1029 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1030 | 1049 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1050 | 1069 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1070 | 1074 | 5 | - | – | |
| Phobius | 1075 | 1097 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 1075 | 1097 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1098 | 2155 | 1058 | - | – | |
| Gene3D | 1418 | 1598 | 181 | 1.0E-10 | – | |
| SUPERFAMILY | 1428 | 1593 | 166 | 3.8E-13 | ||
| SMART | 1684 | 2007 | 324 | 4.5E-89 | ||
| SUPERFAMILY | 1692 | 2008 | 317 | 1.32E-104 | ||
| ProSiteProfiles | 1699 | 2001 | 303 | 62.494 | ||
| CDD | 1700 | 1999 | 300 | 9.21867E-113 | ||
| Pfam | 1700 | 1999 | 300 | 1.0E-86 | ||
| ProSitePatterns | 1759 | 1770 | 12 | - | ||
| PRINTS | 1759 | 1775 | 17 | 9.6E-35 | ||
| PRINTS | 1822 | 1845 | 24 | 9.6E-35 | ||
| PRINTS | 1847 | 1874 | 28 | 9.6E-35 | ||
| Gene3D | 1878 | 2007 | 130 | 1.3E-35 | – | |
| PRINTS | 1977 | 1998 | 22 | 9.6E-35 | ||
| SMART | 2003 | 2153 | 151 | 4.4E-40 | ||
| CDD | 2005 | 2155 | 151 | 9.66224E-37 | ||
| SUPERFAMILY | 2007 | 2153 | 147 | 7.19E-29 | ||
| Gene3D | 2008 | 2155 | 148 | 1.9E-29 | – | |
| Pfam | 2011 | 2148 | 138 | 3.9E-18 | ||
| PRINTS | 2119 | 2147 | 29 | 9.6E-35 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of nonterminal peptide bonds in a polypeptide chain by a mechanism using a cysteine residue at the enzyme active center, and requiring the presence of calcium. | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0386800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…