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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0062500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0062500.10 |
| Related isoforms 12 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcriptional corepressor leunig-like protein; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0FPP1|A0A0R0FPP1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10514331..10534060) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGT GTCCTCGGACCCTGTTGGTTAGTTACCTAGAAACAAAGAAGTTGGATTTGATGTTTCTGTTTTGGCCATTTTATTGATTT GGTTTCTTTTGTGTGATGGTAATGAGGGATTGCAGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTGAGTGGTGGTCAGTTT TCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAGGTTGGTTCGGAAAAA TTTGCATTGTTTTTCATTTTTAGCTTCCTACTGGCGTACTAGATCTGATTTGTATGATTGTGCTGGAAGTTAGCATAAAA ATGGCGACATTCTGACAGTTGATTAACTTTTGATGTATGTGTTCATGTATTCAAGAAGGAACCTTATACATTTGACCATA TATTACTTCCAAATTTTGCTCCCTAAGTCGCTAACCAATAAATGATTTGGCTGGTAATTGCTTTCCATAAGTAGTTGAAG GGAAAGTTGGTATCTTTTCTCTAAATCTAGCTTTTCTTAAATAAGATTGCAGAAAGATATTTGTTTTTAATTTCCAAGAT TCTGACTAGGTTGCTAGCAGTATGATTTTAAAAAATATATTGTTTGAGCAAGTGATTATCTGTCTAATGGTGATTATGAT TGTTTGATATTTTAATTTTCCCTAACATGCAATCATAAAACTGTTTCCATGTAAATTTGTGGTGGCAAATTGAAGGTTTT GGTTTGTGAAACTCTCTTTGCAGACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA CAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCA 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CTCCTAGGCATTGATCAGGAAAATTTATATTGGCTCAGTAGAAAACATGCAACTGATTACATCATACTTGTTTCTTGAGT TTGAAAAAATGCGAATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTATAC TGATCCTTTATGAAGATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTTAT AAGAAGAAACACTAATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGTAC TTCAACTGTAATGGTATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCATG ATTGTAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACT CTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCAC TCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTC ATTTCCATTTTGAGCATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTTGG TCTTGATTGGATTCAAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGATT TAGTTATTTAATTGACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCAAA ACAAAATGATTTCGTTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTGTA TTGAATGAGAACTGATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTGGT GCCATAATGCCTTCTTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGCGT CCTTTGAAATGCTTCACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATTTA TGACGAGCTGTTAGGGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATAAA AATACTGAATCTATTATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGCAA TGAGGAGAAGAGTTGGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATATT GCTGCAGCAAGAGGAGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGTAT AATATGCTGAATATCAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCATG AGTGCAAGATTAAGCAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGTGA GTAGGAAATCATAGAATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTCCT TAAAATTGTGGGGTCAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTAGT TGCTGTAGGAAAAAACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAGAT CTAAATCATGACACCTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTAAA ATCTTTGTAAATATGGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTAGG GGATCTAAGTCCTATCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCTGT ATCAATTGTAATTGTTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAGTA ATTAAATGTTATCCTTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTCTG GGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATG GTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.10) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACA GGGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAA CAAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGCAGAGATTTGGA GACCAACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCA TGGTGCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTG AGATTAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGC AACAATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTT TATACAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAA ATTTAGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAG GATGGTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCG TGGCGATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGC AGCAACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCG GGAGGCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAG AAAGAGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTT CAGCACCCTCAACGCCCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCA AAGCCATTAATGATGTTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGTGGGATGATAAAGATCT TGAATTGCAGGCTGATGTGGACCGTTTTGTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATG ATACAGACCCTAGAGATAATGTTGGTCGTTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGC GCAAGTACAAACAAAGTTGTCTGTTGCCATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGC TGTTTTATGGTACACAGATTCTCTGAAGCAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCA GTCCAAGCATGCCTCGTCTCGCAACATCTTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCG CTTCGTACCTTTACAGGACATTCTGCATCTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTG TGATTTTGATGGCGAGATACGATATTGGAGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGA TGAGATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAA GCATGCCGATATTCACTAAAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATC TGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATG GCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGTCATTGGAACTC TGGGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAA TGGTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.10) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQGRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKLPLQRDSLEDAAMKQRFG DQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLHGAAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRAAGPEGSLIAIPGSNQGS NNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPFIQSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDDNRRLRMLLNNRNMGVSK DGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPRGDTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSNPQSQTSNLNMHQQDKVA GGNVNVDGSMSNTFRGNDQVTKNQTGRKRKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHTAGDVMSMPALPHNGSSS KPLMMFGTDGTGTLTSPSNQLWDDKDLELQADVDRFVEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFSFSEVNSVR ASTNKVVCCHFSSDGKLLASGGHDKKAVLWYTDSLKQKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVWDVDNPGYS LRTFTGHSASVMSLDFHPNKDDLICSCDFDGEIRYWSINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVVSIFDVETQ ACRYSLKGHTNSIHSVCWDPSGEFLASVSEDSVRVWTLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLVIGCYQSLEL WDMTENKTMTLSAHEGLIAALAVSTVNGLVASASHDKFVKLWK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 45 | 45 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 763 | 761 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 3 | 763 | 761 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 281 | 421 | 141 | - | – | |
| MobiDBLite | 281 | 319 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 325 | 385 | 61 | - | – | |
| MobiDBLite | 393 | 421 | 29 | - | – | |
| Gene3D | 455 | 613 | 159 | 5.9E-39 | ||
| SMART | 472 | 511 | 40 | 2.7E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 473 | 763 | 291 | 9.68E-66 | ||
| CDD | 475 | 763 | 289 | 1.04276E-64 | – | |
| ProSiteProfiles | 479 | 763 | 285 | 39.443 | ||
| Pfam | 479 | 510 | 32 | 0.0032 | ||
| ProSiteProfiles | 479 | 520 | 42 | 9.673 | ||
| SMART | 514 | 553 | 40 | 1.2E-9 | ||
| Pfam | 518 | 553 | 36 | 1.0E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 521 | 556 | 36 | 15.254 | ||
| ProSitePatterns | 540 | 554 | 15 | - | ||
| SMART | 557 | 597 | 41 | 5.5E-8 | ||
| Pfam | 560 | 597 | 38 | 4.9E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 564 | 606 | 43 | 13.082 | ||
| SMART | 600 | 636 | 37 | 170.0 | ||
| Gene3D | 614 | 763 | 150 | 2.9E-28 | ||
| SMART | 639 | 677 | 39 | 3.0E-9 | ||
| Pfam | 642 | 676 | 35 | 6.7E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 646 | 678 | 33 | 9.907 | ||
| SMART | 683 | 722 | 40 | 0.39 | ||
| SMART | 724 | 763 | 40 | 3.4E-5 | ||
| Pfam | 726 | 763 | 38 | 0.065 | ||
| ProSiteProfiles | 731 | 763 | 33 | 12.48 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.10, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…