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LotjaGi5g1v0062500.12

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0062500
Transcript ID LotjaGi5g1v0062500.12
Related isoforms 12
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Transcriptional corepressor LEUNIG; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RNX1|A0A0S3RNX1_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10514331..10534060) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGT GTCCTCGGACCCTGTTGGTTAGTTACCTAGAAACAAAGAAGTTGGATTTGATGTTTCTGTTTTGGCCATTTTATTGATTT GGTTTCTTTTGTGTGATGGTAATGAGGGATTGCAGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTGAGTGGTGGTCAGTTT TCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAGGTTGGTTCGGAAAAA TTTGCATTGTTTTTCATTTTTAGCTTCCTACTGGCGTACTAGATCTGATTTGTATGATTGTGCTGGAAGTTAGCATAAAA ATGGCGACATTCTGACAGTTGATTAACTTTTGATGTATGTGTTCATGTATTCAAGAAGGAACCTTATACATTTGACCATA TATTACTTCCAAATTTTGCTCCCTAAGTCGCTAACCAATAAATGATTTGGCTGGTAATTGCTTTCCATAAGTAGTTGAAG GGAAAGTTGGTATCTTTTCTCTAAATCTAGCTTTTCTTAAATAAGATTGCAGAAAGATATTTGTTTTTAATTTCCAAGAT TCTGACTAGGTTGCTAGCAGTATGATTTTAAAAAATATATTGTTTGAGCAAGTGATTATCTGTCTAATGGTGATTATGAT TGTTTGATATTTTAATTTTCCCTAACATGCAATCATAAAACTGTTTCCATGTAAATTTGTGGTGGCAAATTGAAGGTTTT GGTTTGTGAAACTCTCTTTGCAGACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA CAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCA 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CTCCTAGGCATTGATCAGGAAAATTTATATTGGCTCAGTAGAAAACATGCAACTGATTACATCATACTTGTTTCTTGAGT TTGAAAAAATGCGAATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTATAC TGATCCTTTATGAAGATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTTAT AAGAAGAAACACTAATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGTAC TTCAACTGTAATGGTATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCATG ATTGTAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACT CTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCAC TCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTC ATTTCCATTTTGAGCATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTTGG TCTTGATTGGATTCAAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGATT TAGTTATTTAATTGACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCAAA ACAAAATGATTTCGTTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTGTA TTGAATGAGAACTGATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTGGT GCCATAATGCCTTCTTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGCGT CCTTTGAAATGCTTCACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATTTA TGACGAGCTGTTAGGGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATAAA AATACTGAATCTATTATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGCAA TGAGGAGAAGAGTTGGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATATT GCTGCAGCAAGAGGAGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGTAT AATATGCTGAATATCAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCATG AGTGCAAGATTAAGCAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGTGA GTAGGAAATCATAGAATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTCCT TAAAATTGTGGGGTCAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTAGT TGCTGTAGGAAAAAACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAGAT CTAAATCATGACACCTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTAAA ATCTTTGTAAATATGGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTAGG GGATCTAAGTCCTATCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCTGT ATCAATTGTAATTGTTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAGTA ATTAAATGTTATCCTTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTCTG GGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATG GTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.12) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTGAGTGGTGGTCAGTTTTCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCA GAGGTTGCTGCATCTTACATTGAGGTTTTGGTTTGTGAAACTCTCTTTGCAGACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAAC AACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAG TCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCACATGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAG GCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACAGGGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATG GTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAACAAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTG CCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGCAGAGATTTGGAGACCAACTCTTGGACCCAAATCATGCCAC AATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCATGGTGCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAG TTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTGAGATTAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCA GCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGCAACAATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACT CACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTTTATACAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAAC TTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAAATTTAGCATCACCATCTGCCAATGATGAC AATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAGGATGGTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGT AGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCGTGGCGATACAGATATGTTAATGAAGTTGA AACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGCAGCAACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAAT CCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCGGGAGGCAATGTCAATGTCGATGGTAGCAT GTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAGAAAGAGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTG GTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTTCAGCACCCTCAACGCCCTCAACGCATACA GCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCAAAGCCATTAATGATGTTTGGCACTGATGG CACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGGCTGATGTGGACCGTTTTGTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATG TGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATACAGACCCTAGAGATAATGTTGGTCGTTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCA TTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAAGTACAAACAAAGTTGTCTGTTGCCATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGC AAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTTTTATGGTACACAGATTCTCTGAAGCAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCAT CTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCCAAGCATGCCTCGTCTCGCAACATCTTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGG GATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTCGTACCTTTACAGGACATTCTGCATCTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAA TAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGATTTTGATGGCGAGATACGATATTGGAGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAG TGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAGATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTT TCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCATGCCGATATTCACTAAAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGA TCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAAT GCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATT GGTTGTTACCAGGCAAGTCTCAACTGCGGCAATCAAATCATTGGAACTCTGGGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTC TGTCTGCTCATGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.12) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MPREDFCLSGGQFSGTYLLPGLMRSIQRLLHLTLRFWFVKLSLQTQLVKAREQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQPQQ SQHQQQQHQQQQQQQQHMQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQGRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKL PLQRDSLEDAAMKQRFGDQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLHGAAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRA AGPEGSLIAIPGSNQGSNNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPFIQSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDD NRRLRMLLNNRNMGVSKDGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPRGDTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSN PQSQTSNLNMHQQDKVAGGNVNVDGSMSNTFRGNDQVTKNQTGRKRKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHT AGDVMSMPALPHNGSSSKPLMMFGTDGTGTLTSPSNQLADVDRFVEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFS FSEVNSVRASTNKVVCCHFSSDGKLLASGGHDKKAVLWYTDSLKQKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVW DVDNPGYSLRTFTGHSASVMSLDFHPNKDDLICSCDFDGEIRYWSINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVV SIFDVETQACRYSLKGHTNSIHSVCWDPSGEFLASVSEDSVRVWTLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLVI GCYQASLNCGNQIIGTLGHDREQDNDSVCS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Coils 40 75 36 -
MobiDBLite 74 142 69 -
PANTHER 100 805 706 0.0
PANTHER 100 805 706 0.0
MobiDBLite 378 515 138 -
MobiDBLite 378 416 39 -
MobiDBLite 422 482 61 -
MobiDBLite 490 515 26 -
Gene3D 543 700 158 7.2E-39
SMART 560 599 40 2.7E-5
SUPERFAMILY 561 807 247 4.68E-57
CDD 563 802 240 1.64172E-51
ProSiteProfiles 567 608 42 9.673
ProSiteProfiles 567 774 208 34.223
Pfam 567 598 32 0.0035
SMART 602 641 40 1.2E-9
Pfam 606 641 36 1.2E-6
ProSiteProfiles 609 644 36 15.254
ProSitePatterns 628 642 15 -
SMART 645 685 41 5.5E-8
Pfam 648 685 38 5.5E-5
ProSiteProfiles 652 694 43 13.082
SMART 688 724 37 170.0
Gene3D 701 813 113 8.7E-19
SMART 727 765 39 3.0E-9
Pfam 730 764 35 7.5E-7
ProSiteProfiles 734 766 33 9.907
SMART 771 811 41 8.6

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.12, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…