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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0062500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0062500.2 |
| Related isoforms 12 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcriptional corepressor LEUNIG; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|A0A151QVX3|A0A151QVX3_CAJCA Transcriptional corepressor LEUNIG; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10513449..10535207) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCTTCAATATTTCTTCCCAAATTCTCTGCTTTTCCCTTGAAGTCGTGTTCCTCTGGCTTCGCTTTCTACCGTTCCCTTT TCTCATGCTTCTTTGTCTTTCTGCTACGAGATAAACTCTTGTGTTTGCCGATTGTTACTGCTCAGTTTCCTAGACTTTGA AACCTTCACAACCTCGTTCATTCCCTCACCACCGTTCAAGCTCGTTGTGTCAGAATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGA TAAGATGTAAGTGTTTTTTGCTTTGTGTTTATTTTTTTTTATATTTTCTATTGAATCTTGGTGTTTTAATCAGTTTTGGA ACATGGGTTTTTGTTCTTACTCAGAATCTTTGCTTTCTTTTGTTGATTTGGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCGTTTAATG GTGTTTTAGGTTGGTTTATTTTCCTGGGTTTGGTTTTATATGTGTTAGGTTTTCATGAAAATTTTGATGTGTGTTAGGGT TTTTGAGGCTATGCTAGTATAAGGGGTTGCTTTGCATTGAATGAAAATTTCACTTTTAATTGCTGAACTCTTGGTTCCTG CATTTTTTGTTGATTTGGGTTCTGGGTTTGTGGTTTTTCATTTAATGGTGTTTTAGGTTGGTTTATTTTCTTGGGTTTGG TTTTCATGTATATTTGAGAATATTTTGATGAGTGTGTTAGGGTTTTTTAGGCTATGCAAGTATAAGGAGTTTCTTTGCAT TGAATGAAAATTTCACTTTTAATTGTTGAACTCTTGGTTCCTGCATTTGGGTTTGCTGATATTTATGGTCACGAGATATA CTCAGTGTAAAGATCTAAACTTTGATTCTAACAGTTCAATTGCTTATGCAACCTGTGTTTGCTTGTGCTATGGGATTTCA GGTTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAA 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GTTTGAAAAAATGCGAATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTAT ACTGATCCTTTATGAAGATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTT ATAAGAAGAAACACTAATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGT ACTTCAACTGTAATGGTATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCA TGATTGTAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGA CTCTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTC ACTCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTT TCATTTCCATTTTGAGCATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTT GGTCTTGATTGGATTCAAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGA TTTAGTTATTTAATTGACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCA AAACAAAATGATTTCGTTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTG TATTGAATGAGAACTGATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTG GTGCCATAATGCCTTCTTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGC GTCCTTTGAAATGCTTCACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATT TATGACGAGCTGTTAGGGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATA AAAATACTGAATCTATTATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGC AATGAGGAGAAGAGTTGGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATA TTGCTGCAGCAAGAGGAGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGT ATAATATGCTGAATATCAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCA TGAGTGCAAGATTAAGCAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGT GAGTAGGAAATCATAGAATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTC CTTAAAATTGTGGGGTCAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTA GTTGCTGTAGGAAAAAACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAG ATCTAAATCATGACACCTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTA AAATCTTTGTAAATATGGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTA GGGGATCTAAGTCCTATCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCT GTATCAATTGTAATTGTTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAG TAATTAAATGTTATCCTTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTC TGGGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAA TGGTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAACCTGTCTGCCTCTGCAAAACAGGTAGTT TTATCAGTGTTGATCGCAGATTTGGATTTCCTGCTGTAAAAAAATCCCTAAAGCCGCTGTAGTCATGGCTTCATAGCCAT CCGATCTTTAATTAGACGGTTTAAATTTATAAAGACCAATTGTGTATGATTGTCATTTTAAATCCCAACGATTCGATCTT GATTCGACGACTACCAAAATGACTTCAGAAAGTTTTGACTGCATGGAATCCGGATCTGTTGATCACATGACCTTTTATGT TGTATGGTAAATTAACCTATAGAGATCTCTGTTTCATTATTGTTTACTTAGAGATCTCTGTTCTTGTATCATCTACATTG GCTATTTATAATACCATTCGGTGAGTGCTGATCCAGTTTCAGGCAGAACCCATGTCTGCAGCGACAACCTAAAAGTGGGA AAATTCAAACGTGCAAACGTATTTATTTATTACTATATCTTTTTATTTGTGTTGTCGTTTTAGATGTAAATAATGGTTCT CTGAAAGATGAATCAGTACTTATTAACCAGAATAATGTTTGGTTGACACTCCAAACACTTGCACCAAGTAAGATAAATGT GAGATGTGATAAATGATGTAATAAGAATAAAAGAGAAAGATAAGAAGAGTCAGTGAGTAGAAATGAGATAGAAGATAATG TGAAAGTGCGAATCAATCAATACTCTCGAGTTTGATCAGTGTAACTCATCATCAAGTTTGCATAGACCACAAACATAAGC TTAACATTTGATAATAATATTCCAATGTCTTGCACCTAGGATCGACTAAACTGAGACCTATAAGAGTCGGCCTATATGAC CGATACTATTTTTAAGAATTCACGTCGGCCGAAGTGCGAAGTGAGTTACGTCGCCTTAGAGTACCAATGCTAGACTTTGT GTTTGCCACAACTTCATTTCGTCTAATGTCATCCATGACACAAACAATAAATTAGATTTAAAATCGGTTTTTACCTTATT AGTATTTACTTTTGACCGACCTTAATAACTGTTTTTCTTGTAGTTTCGTCAAAACTACAAAGTAAAAGTTGAGGTGACTA GTTGAAACATAACTCTTGCGTAATTAGTGGGGAAGGATCATTTCTTTAACAAATTGCACATCTCGATATTGTTTCACAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTCAGACTAACTGGGAAGCTGATAAGATGTTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGC TTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGTGTCCTCGGACCCTGTTGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTG AGTGGTGGTCAGTTTTCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAG ACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCACA TGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACAG GGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAAC AAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGAGATTTGGAGACC AACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCATGGT GCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTGAGAT TAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGCAACA ATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTTTATA CAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAAATTT AGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAGGATG GTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCGTGGC GATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGCAGCA ACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCGGGAG GCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAGAAAG AGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTTCAGC ACCCTCAACGCCCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCAAAGC CATTAATGATGTTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGTGGGATGATAAAGATCTTGAA TTGCAGGCTGATGTGGACCGTTTTGTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATAC AGACCCTAGAGATAATGTTGGTCGTTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAA GTACAAACAAAGTTGTCTGTTGCCATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTT TTATGGTACACAGATTCTCTGAAGCAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCC AAGCATGCCTCGTCTCGCAACATCTTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTC GTACCTTTACAGGACATTCTGCATCTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGAT TTTGATGGCGAGATACGATATTGGAGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAG ATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGTACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCAT GCCGATATTCACTAAAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTC AGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAA TAAATTTCACTCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCAT TCTTAGTTTCATTTCCATTTTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 97 | 96 | 0.0 | – | |
| SMART | 8 | 40 | 33 | 5.1E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 8 | 40 | 33 | 9.642 | ||
| Pfam | 10 | 36 | 27 | 6.3E-7 | ||
| Coils | 83 | 111 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 110 | 178 | 69 | - | – | |
| PANTHER | 135 | 849 | 715 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 135 | 849 | 715 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 224 | 254 | 31 | - | – | |
| MobiDBLite | 413 | 553 | 141 | - | – | |
| MobiDBLite | 413 | 451 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 457 | 517 | 61 | - | – | |
| MobiDBLite | 525 | 553 | 29 | - | – | |
| Gene3D | 587 | 746 | 160 | 7.3E-39 | ||
| SMART | 604 | 643 | 40 | 2.7E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 605 | 851 | 247 | 3.26E-57 | ||
| CDD | 607 | 846 | 240 | 3.24534E-51 | – | |
| ProSiteProfiles | 611 | 652 | 42 | 9.673 | ||
| Pfam | 611 | 642 | 32 | 0.0037 | ||
| ProSiteProfiles | 611 | 818 | 208 | 34.223 | ||
| SMART | 646 | 685 | 40 | 1.2E-9 | ||
| Pfam | 650 | 685 | 36 | 1.2E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 653 | 688 | 36 | 15.254 | ||
| ProSitePatterns | 672 | 686 | 15 | - | ||
| SMART | 689 | 729 | 41 | 5.5E-8 | ||
| Pfam | 692 | 729 | 38 | 5.7E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 696 | 738 | 43 | 13.082 | ||
| SMART | 732 | 768 | 37 | 170.0 | ||
| Gene3D | 747 | 852 | 106 | 5.4E-18 | ||
| SMART | 771 | 809 | 39 | 3.0E-9 | ||
| Pfam | 774 | 808 | 35 | 7.8E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 778 | 810 | 33 | 9.907 | ||
| SMART | 815 | 853 | 39 | 37.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…