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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0062500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0062500.9 |
| Related isoforms 12 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcriptional corepressor LEUNIG; TAIR: AT4G32551.1 transcriptional corepressor LEUNIG; Swiss-Prot: sp|Q9FUY2|LEUNG_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG; TrEMBL-Plants: tr|I1M9M2|I1M9M2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0062500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10514331..10534060) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTAGATGTTTACATCTATGATTACCTAGTGAAGAGGGATTTGAAGGCTTCGGCTCAAGCTTTTCAAGCTGAAGGGAAAGT GTCCTCGGACCCTGTTGGTTAGTTACCTAGAAACAAAGAAGTTGGATTTGATGTTTCTGTTTTGGCCATTTTATTGATTT GGTTTCTTTTGTGTGATGGTAATGAGGGATTGCAGCTATTGATGCCCCGGGAGGATTTCTGTTTGAGTGGTGGTCAGTTT TCTGGGACATATTTATTGCCAGGACTAATGAGAAGCATTCAGAGGTTGCTGCATCTTACATTGAGGTTGGTTCGGAAAAA TTTGCATTGTTTTTCATTTTTAGCTTCCTACTGGCGTACTAGATCTGATTTGTATGATTGTGCTGGAAGTTAGCATAAAA ATGGCGACATTCTGACAGTTGATTAACTTTTGATGTATGTGTTCATGTATTCAAGAAGGAACCTTATACATTTGACCATA TATTACTTCCAAATTTTGCTCCCTAAGTCGCTAACCAATAAATGATTTGGCTGGTAATTGCTTTCCATAAGTAGTTGAAG GGAAAGTTGGTATCTTTTCTCTAAATCTAGCTTTTCTTAAATAAGATTGCAGAAAGATATTTGTTTTTAATTTCCAAGAT TCTGACTAGGTTGCTAGCAGTATGATTTTAAAAAATATATTGTTTGAGCAAGTGATTATCTGTCTAATGGTGATTATGAT TGTTTGATATTTTAATTTTCCCTAACATGCAATCATAAAACTGTTTCCATGTAAATTTGTGGTGGCAAATTGAAGGTTTT GGTTTGTGAAACTCTCTTTGCAGACACAACTAGTTAAGGCTAGGGAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA CAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACCACAACCTCAGCAGTCACAACATCAGCAACAACAACATCAGCA 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CTCCTAGGCATTGATCAGGAAAATTTATATTGGCTCAGTAGAAAACATGCAACTGATTACATCATACTTGTTTCTTGAGT TTGAAAAAATGCGAATTGTAAGCTATCGGTTACTCGAATATGTCTAGCCAAGATATATTATCATGGTGAAAGATTTATAC TGATCCTTTATGAAGATTGCATTTGCTGTTGCACAAAGCAAATAGGCAACGTGGTTGTTTCTACTGGAGAGAGGTCTTAT AAGAAGAAACACTAATTATACTTTCAATAAGAATAAAATACTTCTGACACTCCTGTATATATTTCCAAACAATTTTGTAC TTCAACTGTAATGGTATATACTCTATTAATTTCTCTACATAAAGCATTGCTGATTTTACTGTTTTGAATGTGGCACCATG ATTGTAGGGTCATACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACT CTGTCAGGGTCTGGACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCAC TCATGTGTTTTCCACCCAACGTATCCTTCAATGCTGGTCATTGGTTGTTACCAGGCAAGTCTATATCCATTCTTAGTTTC ATTTCCATTTTGAGCATTGATAGAATCGCAAATTTTTGAAATTGATTTCTTTATTTGCAAAATTAGAGGAATTGGTTTGG TCTTGATTGGATTCAAGTCATGTATTTACAGTTTAGAAATGTGCATGATTTTGTTGGGTTTGAGTGCATTTGATTTGATT TAGTTATTTAATTGACAATTTAACCTTTATCAGTGCACCCACCTCATCTGTTCTAAGTTGGGAACAGTAAAATCTTCAAA ACAAAATGATTTCGTTTCACCTTCTTGGTGTTCCAAATATGGTGATTGTTTTGCAAATCAATTGATTTCATACTTTTGTA TTGAATGAGAACTGATTTCTAGCAACTGCGGCAATCAAAGCCTTTCCCATAGGTGAAATCGGCTACATGGAATAACTGGT GCCATAATGCCTTCTTATGAATCCAGTTCAACCCTTTGCAATCCCTATAAATTCTTCGTCACTAGCACCCTTGGCTGCGT CCTTTGAAATGCTTCACCATCTTGATTATTCTTATTCTTCAAGTATCCCTGGAATTCTTTTCCGAACACTTGGACATTTA TGACGAGCTGTTAGGGTTAGATTAACCCAAACAGCCAACCAACAAAAGAATAGGGATAAAAGGGTAATTGTCTGAATAAA AATACTGAATCTATTATTAAAATAGAAACCCAAGGGGCTCGAGTTGAAGAAATGAACATGGTCTAAAAGAACTAAGGCAA TGAGGAGAAGAGTTGGTTGAATGATGTGTGTTCATGGAAGCTCGAATGCGGAGCCAAGAGACTGCAGTGCAAGAGATATT GCTGCAGCAAGAGGAGCTTCAACGAGAATACGAAAACAGGGACTGAAGTAAGTGGGAGAAGCATAAATTTCCGCAGGTAT AATATGCTGAATATCAGGAAAGGAGGAAGAAGGGCTTATGTTTTAAATGTGATGAGTTCTCACTTAGGCATGACTGCATG AGTGCAAGATTAAGCAGTTAAGGGTCATACATGGTATTAGAGGAAGATCTTGTAGACCAAAGAGATGAATTGGAGGGTGA GTAGGAAATCATAGAATAGGGAGTGATACCAGCTCAACTCGATTTGCATAGTATAGCATGGCTGACCAGTAAAAATTCCT TAAAATTGTGGGGTCAATTGTGTGATCCGAAGGATGCCTCACATAACTTATTTTTCATAAGCTAGTTGAGAATCTGTAGT TGCTGTAGGAAAAAACCTCTCAGTATTTGGTTAAGGTTGGCGATGGCTATAATGTGAATGCAAATGGGGTTTTTAGAGAT CTAAATCATGACACCTTGATATATTTGGATCACAATCTTCAGTTACTACGCAGAAATCTCACCCATCAAAATAATTTAAA ATCTTTGTAAATATGGTTTAGGTTGATGTGAGCCATCGGATTACAACTTCATCACCCTGCAGTTATTTAATTACTCTAGG GGATCTAAGTCCTATCTATTTTATTCTCTGGTGTTTCATTTAAATACACGCTAATTCATTCAATGTCTTTCTTTTGCTGT ATCAATTGTAATTGTTATTTTGATGCGGCTTCTCTTTAGAATTCTGATCTTCTGATTATATTTTTTACCGAATAATAGTA ATTAAATGTTATCCTTGATATTGATGTAATTTTGACCTGTTTCAATTTGTTGTACCATTATTGCAGTCATTGGAACTCTG GGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAAGGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATG GTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTGGAAGTAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0062500.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCAGATGCAGCAGATGATGTTACAAAGGCATGCTCAGCAGCAACAGCCGCAACATCAACAGCCACCACCTCAACAACA GGGTAGGGATAGGTCTCATCTCTTAAATGGTGGTACTAATGGGTTAGTTGGAAACGCTAGCACTGCAAGTGCATTAGCAA CAAAGATGTATGAGGAAAGGTTAAAACTGCCCCTTCAAAGGGATTCTTTGGAAGATGCAGCAATGAAGCAGAGATTTGGA GACCAACTCTTGGACCCAAATCATGCCACAATATTGAAGACATCTGGAGCTACTGGCCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCA TGGTGCTGCTGGTGCGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAATTACCTGGGTCTACTCTGGATATAAAAAGTG AGATTAATCCTGTTTTAAATCCCAGAGCAGCGGGTCCTGAAGGATCATTGATAGCAATTCCTGGATCTAACCAAGGTAGC AACAATTTGACTTTGAAAGGGTGGCCACTCACAGGGTTGGAACAACTACGTTCTGGTATGCTTCAGCAACAAAAACCTTT TATACAGTCTCCTCAACCTTTTCATCAACTTCCGATGTTGACGCCACAACATCAACAACAGCTTATACTAGCACAACAAA ATTTAGCATCACCATCTGCCAATGATGACAATAGAAGACTCCGAATGCTACTAAATAATAGGAATATGGGTGTAAGTAAG GATGGTCTTTCAAATCCTGTGGGTGATGTAGTATCAAATGTTGGATCACCTCTTCAAGCAGGTGGCCCTCCTTTTCCTCG TGGCGATACAGATATGTTAATGAAGTTGAAACTGGCTCAGTTTCACCAACATCAGCAGCAGAACGCCAATTCACAGCAGC AGCAACTTCAACAGCATGCTCTTTCAAATCCGCAATCTCAGACTTCAAATCTTAACATGCATCAGCAGGATAAAGTAGCG GGAGGCAATGTCAATGTCGATGGTAGCATGTCAAACACCTTTAGAGGAAATGATCAGGTTACCAAAAACCAGACTGGTAG AAAGAGAAAACAGCCCGTATCTTCCTCTGGTCCTGCCAATAGCTCAGGAACAGCAAATACGGCAGGCCCATCTCCAAGTT CAGCACCCTCAACGCCCTCAACGCATACAGCTGGTGATGTGATGTCAATGCCTGCTCTACCTCATAATGGTAGCTCATCA AAGCCATTAATGATGTTTGGCACTGATGGCACCGGAACTCTTACCTCACCTTCCAATCAATTGGCTGATGTGGACCGTTT TGTTGAGGATGGATCTCTTGATGACAATGTGGAGTCTTTTTTATCCCATGATGATACAGACCCTAGAGATAATGTTGGTC GTTGTATGGATGTAAGCAAAGGATTCTCATTTTCGGAAGTAAATTCTGTACGCGCAAGTACAAACAAAGTTGTCTGTTGC CATTTCTCATCTGATGGGAAATTGCTTGCAAGTGGTGGTCATGATAAAAAGGCTGTTTTATGGTACACAGATTCTCTGAA GCAGAAGGCTACTCTTGAAGAGCATTCATCTTTAATCACCGATGTCCGTTTCAGTCCAAGCATGCCTCGTCTCGCAACAT CTTCATATGACAAAACTGTTAGGGTTTGGGATGTTGACAATCCTGGCTATTCGCTTCGTACCTTTACAGGACATTCTGCA TCTGTTATGTCACTAGATTTTCACCCTAATAAGGACGACCTTATCTGCTCTTGTGATTTTGATGGCGAGATACGATATTG GAGCATTAATAATGGCAGTTGTGCTAGAGTGTCCAAGGGTGGTACTGCACAGATGAGATTTCAACCTCGTCTAGGGAGGT ACCTTGCTGCAGCTGCAGAGAACGTTGTTTCTATATTTGATGTGGAGACACAAGCATGCCGATATTCACTAAAGGGTCAT ACAAACTCTATACATTCTGTGTGTTGGGATCCTTCTGGGGAGTTTCTGGCATCTGTCAGTGAAGACTCTGTCAGGGTCTG GACTCTTGGAACAGGGGGTGAAGGGGAATGCGTTCATGAGCTTAGCTGTAATGGCAATAAATTTCACTCATGTGTTTTCC ACCCAACGTATCCTTCAATGCTGTCATTGGAACTCTGGGACATGACCGAGAACAAGACAATGACTCTGTCTGCTCATGAA GGTCTAATTGCTGCATTGGCAGTTTCAACTGTAAATGGTTTGGTTGCTTCAGCCAGTCATGACAAGTTTGTCAAGCTCTG GAAGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0062500.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MQMQQMMLQRHAQQQQPQHQQPPPQQQGRDRSHLLNGGTNGLVGNASTASALATKMYEERLKLPLQRDSLEDAAMKQRFG DQLLDPNHATILKTSGATGQPSGQVLHGAAGAMSPQVQARSQQLPGSTLDIKSEINPVLNPRAAGPEGSLIAIPGSNQGS NNLTLKGWPLTGLEQLRSGMLQQQKPFIQSPQPFHQLPMLTPQHQQQLILAQQNLASPSANDDNRRLRMLLNNRNMGVSK DGLSNPVGDVVSNVGSPLQAGGPPFPRGDTDMLMKLKLAQFHQHQQQNANSQQQQLQQHALSNPQSQTSNLNMHQQDKVA GGNVNVDGSMSNTFRGNDQVTKNQTGRKRKQPVSSSGPANSSGTANTAGPSPSSAPSTPSTHTAGDVMSMPALPHNGSSS KPLMMFGTDGTGTLTSPSNQLADVDRFVEDGSLDDNVESFLSHDDTDPRDNVGRCMDVSKGFSFSEVNSVRASTNKVVCC HFSSDGKLLASGGHDKKAVLWYTDSLKQKATLEEHSSLITDVRFSPSMPRLATSSYDKTVRVWDVDNPGYSLRTFTGHSA SVMSLDFHPNKDDLICSCDFDGEIRYWSINNGSCARVSKGGTAQMRFQPRLGRYLAAAAENVVSIFDVETQACRYSLKGH TNSIHSVCWDPSGEFLASVSEDSVRVWTLGTGGEGECVHELSCNGNKFHSCVFHPTYPSMLSLELWDMTENKTMTLSAHE GLIAALAVSTVNGLVASASHDKFVKLWK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 45 | 45 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 748 | 746 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 3 | 748 | 746 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 281 | 319 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 281 | 418 | 138 | - | – | |
| MobiDBLite | 325 | 385 | 61 | - | – | |
| MobiDBLite | 393 | 418 | 26 | - | – | |
| Gene3D | 446 | 603 | 158 | 6.0E-39 | ||
| SMART | 463 | 502 | 40 | 2.7E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 464 | 748 | 285 | 7.1E-64 | ||
| CDD | 466 | 748 | 283 | 1.37541E-62 | – | |
| ProSiteProfiles | 470 | 748 | 279 | 34.697 | ||
| ProSiteProfiles | 470 | 511 | 42 | 9.673 | ||
| Pfam | 470 | 501 | 32 | 0.0031 | ||
| SMART | 505 | 544 | 40 | 1.2E-9 | ||
| Pfam | 509 | 544 | 36 | 1.0E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 512 | 547 | 36 | 15.254 | ||
| ProSitePatterns | 531 | 545 | 15 | - | ||
| SMART | 548 | 588 | 41 | 5.5E-8 | ||
| Pfam | 551 | 588 | 38 | 4.8E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 555 | 597 | 43 | 13.082 | ||
| SMART | 591 | 627 | 37 | 170.0 | ||
| Gene3D | 604 | 748 | 145 | 2.1E-26 | ||
| SMART | 630 | 668 | 39 | 3.0E-9 | ||
| Pfam | 633 | 667 | 35 | 6.6E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 637 | 669 | 33 | 9.907 | ||
| SMART | 674 | 707 | 34 | 220.0 | ||
| SMART | 709 | 748 | 40 | 3.4E-5 | ||
| Pfam | 711 | 748 | 38 | 0.063 | ||
| ProSiteProfiles | 716 | 748 | 33 | 12.48 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0062500.9, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…