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LotjaGi5g1v0261000.4

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0261000
Transcript ID LotjaGi5g1v0261000.4
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT4G03080.1 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 1; Swiss-Prot: sp|Q8L7U5|BSL1_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL1; TrEMBL-Plants: tr|I1JFE9|I1JFE9_SOYBN Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0261000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56964341..56980263) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGGGTCGAAACCGTGGCTGCATCCTGCTCCTCCTTACCGACCACTTGAATCGCACTGGGACACCGATGAAGACGATCC TGGTCCTCGCTGTGGTCACACGCTCACTGCTGTAGCCGCCACCAAGTCGCGCGGTCCGCGCTTAATCCTCTTCGGCGGCG CCACCGCCATTGAAGGAGGATCTACTTCAGCTCCCGGCATTCGTACTTGCCTCTTCTCTCTCCCTTGAAATTCTCTCATT TTCTGTCAGTTTTCAACTGAAAGTCTCTTCTTCTGGTTTGCAGGATTGGCTGGAGTAACGAATTCCGTGCATTCTTATGA TGTTCAAACGAAGAAATGGACTCGGTTAGTTGATTTAAGCTTGCCCAGTTGTTGAATGTTTCTAATTTAGTTGATTTATG GTTCATTGTTGTAGAAAAGTTAAATTGAGTCTGTTGGGTGATTGAATTGCTACTCAAGTAATGATCTTTGGTTTATGGTT GTTTGTTCAGTCTTAAACCGGCCGGAGAGCCGCCGTCTCCTCGGGCTGCCCATGCTGCCGCGGCAGTTGGTACCATGGTC GTTTTTCAGGTGATTTTGGGTTAGGACTGAGATTTCATTTGATTGGGTTGATGGTGTAAGAGTTAGGACTTGACATTTGT TTTATTTTGTTTCGCTTGGCTAGGGTGGGATTGGTCCTGCTGGACATTCGACTGATGATATCTATGTGCTGGACTTGACC AATGACAAATACAAATGGCACAGGTGAGCTTGGTTGCAATTGACCAAGCTATTTTACTTTTTCCTACCAATTGCAATTTG ACAAAATTATGGGGTTAGTCAATGTTGCAATTAATTCGATTGTAGAGTCGTTGTACAAGGGATAGGACCGGGGCCTCGCT ACGGACATGTAATGGACTTGGTTGCTCAGAGATATCTCGTCACTGTCAGTGGAAATGATGGTGAGAGAAATTTATTTCCT 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CTACTTTTGTTGCCTGAATCAGTTGGCCCTGCGTTAATCTTAGAGAATCAGTTTGGCTTGCAACAGTCCTAGATAATCAG CTAGGCCCTCATTATTTTTCTATTTCTAAAGGATACATTTTTATTAAGCTTAAACCTAAGTAAGCTTGAGCTTTAGGGGC AGTGTTATGTGTTATAATAGTTTGATCATATCTTAAGTAATTGAGGGCAGTTTAGATTATTCTTTAGTTTTGATTTCTTT ATTTCCTTATTCTATTGATTTAATTCCTTATTAAATTAAGATTAGGATTCTTAATTAGTTTCCCTATTTGAATAAGACTA GGACTCTACCATTAGTATAAAAAAGACTACGTATTTTTTTGTAAGATACCCAATATATTATATCAATACAATTTTATTTT GTGTATTCTTTTTCCTCTTTCTATACCTTGACTAAACTCTGATTTCATCATATATCCTAGAGGTGCTAATTTGACTATTT ACTCTGATTTAAATTAAGATCATTCATGAGAACCTACATAAAGAAATGAATAGAAAAATCAACAGACAGACTTTGGAGAT CTCTACAAATTGAAATTACAATTAAGGCAAACTTAACACGCAATAAAATATCAATAATTATTTCTTAACACAATTCAAAG CTCGTACTTTTTTTTTCACTCTCTTAAGACATTTTATAAATATAATATTTTTCCACAACTAGGCATGCCTTGAAGTTCTT GCTAATTATATGCGAACGTGGCCTAATATTTTTCTAATTTTATGCAGCCTGATCGTGTCACAGACTTCTGTAAGAGAAAT AAATTACAGCTCATAATAAGGGCCCATGAATGCGTCATGGATGGTTTTGAGCGATTTGCCCAGGGACAATTAATCACCCT TTTTTCCGCAACTAACTATTGCGGTAAGCATAATTTCTCACCAGCTTTCTCCTTTGCATGTGATAGCATTTCAATCTCAT 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0261000.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGTCGAAACCGTGGCTGCATCCTGCTCCTCCTTACCGACCACTTGAATCGCACTGGGACACCGATGAAGACGATCC TGGTCCTCGCTGTGGTCACACGCTCACTGCTGTAGCCGCCACCAAGTCGCGCGGTCCGCGCTTAATCCTCTTCGGCGGCG CCACCGCCATTGAAGGAGGATCTACTTCAGCTCCCGGCATTCGATTGGCTGGAGTAACGAATTCCGTGCATTCTTATGAT GTTCAAACGAAGAAATGGACTCGTCTTAAACCGGCCGGAGAGCCGCCGTCTCCTCGGGCTGCCCATGCTGCCGCGGCAGT TGGTACCATGGTCGTTTTTCAGGGTGGGATTGGTCCTGCTGGACATTCGACTGATGATATCTATGTGCTGGACTTGACCA ATGACAAATACAAATGGCACAGAGTCGTTGTACAAGGGATAGGACCGGGGCCTCGCTACGGACATGTAATGGACTTGGTT GCTCAGAGATATCTCGTCACTGTCAGTGGAAATGATGGAAAACGAGTTGTATCTGATGCTTGGGCTTTAGATACTGCTCA AAAACCTTACGCGTGGCAGAGGCTGAACCCAGAGGGTGATAGACCTTCTGCTAGAATGTACGCAACTGCTAGTGCCCGCT CAGATGGGATGTTTTTACTATGTGGTGGAAGAGACGCTTCGGGAACTCCACTAGCAGATGCCTATGGACTACTCATGCAT AGGAACGGGCAGTGGGAATGGACCCTTGCACCTGGAGTTTCCCCTTCACCGAGATATCAGCATGCCTCGGTTTTTGTTGG TGCACGATTACATGTTACAGGAGGTGTTCTCAGGGGTGGGCGATCTGTGGAAGGAGAAGCATCTGTTGCAGTATTGGACA CTGCTGCTGGGGTTTGGTTGGACAGAAATGGCATTGTGTCCTCCTCCCGCTCAAACAAAGGTCATGATCATGACCCTGCT TTGGAGCTTATGCGTCGTTGCCGCCATGCAGCAGCAGCTGTTGGTGTTCAAATCTATATCCACGGCGGTCTTAGAGGAGA TACACTACTAGATGATTTCTTAGTGGCTGAAAATTCGCCATTTCAGCCTGACAATTCTCATGCGTTAACAGCTGAGAGAA CATCACCTCTTACAAGTCCCAAATACAATCAGTCTAACTTCAGCTTGGATGGTACACAAGACGGACCCTCGTCTGGCGGC TCAGGTTTGATATGTGTTCATTTTACCAGGATGGACAAACATTCGATGGAGAAACTGAGGGAGGCATCAGCTGCTGAAGC TGAGGCAGCGAGTGCGGTCTGGCAAGCTGTGCAAGCTATATCTGCGGAAGAAACTTCTGTGTCAGATGACAACTCACAAG CTGCAGAAACCGTTTCAGATGGAAGCGATACAGAGGGAGATGTTCACCTTCATCCTAGAGCTGTTGTAGTTGCGAAAGAA ACTGTAGGTAACCTAGGTGGAATGATAATTTCGACTTTGCTCAGGCCTCGCAACTGGAAAGCTCCTGTTAACAGACGGTT CTTCTTGGATTCGTATGAAGTGGGTGAGCTTTGCTATGCTGCTGAGCAAATATTTATGCAGGAACAAACTGTTCTTCAGC TAAAAGCTCCAGTCAAAGTATTTGGTGATCTTCATGGTCAGTTTGGTGATTTGATGCGGCTATTTGATGAATATGGATTT CCTTCAACTGCTGGAGACATCACGTATATTGATTACTTGTTTTTGGGAGATTATGTTGATCGAGGACAGCACAGCTTGGA AACCATTACCTTGCTACTTGCTCTTAAGATCGAATATCCTGAGAATGTTCATTTGATACGTGGAAACCATGAAGCTGCTG ACATAAATGCACTATTTGGTTTTCGCATAGAGTGCATTGAGAGAATGGGAGAAAATGATGGAATATGGGCATGGACGCGA TTCAATCAACTTTTTAACTTTCTTCCACTAGCTGCTCTTATTGAAAAGAAAATTATCTGTATGCATGGTGGGATTGGAAG ATCTATCAATTCGGTAGAACAGATAGAGAAGCTTGAGAGGCCCATAACAATGGATGCAGGATCCATCATTTTAATGGACC TTTTGTGGTCTGATCCCACAGAAAATGATAGTGTAGAGGGTTTGAGACCAAATGCTAGAGGGCCAGGGCTTGTCACTTTT GGGCCTGATCGTGTCACAGACTTCTGTAAGAGAAATAAATTACAGCTCATAATAAGGGCCCATGAATGCGTCATGGATGG TTTTGAGCGATTTGCCCAGGGACAATTAATCACCCTTTTTTCCGCAACTAACTATTGCGGAACTGCAAACAATGCGGGAG CTATACTGGTAATTGGTAGGGGTTTGGTTGTGGTTCCAAAGTTGATTCATCCTATACCACCTCCCCTTCAGTCACCTGAA ACATCTCCAGAGCGTGAACTTAATATTCAGAGGCCGCCAACTCCTACTAGGGGTCGACCACAGCCTGACCTTGATCGTGG CTCTCTAGCATATATATGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0261000.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGSKPWLHPAPPYRPLESHWDTDEDDPGPRCGHTLTAVAATKSRGPRLILFGGATAIEGGSTSAPGIRLAGVTNSVHSYD VQTKKWTRLKPAGEPPSPRAAHAAAAVGTMVVFQGGIGPAGHSTDDIYVLDLTNDKYKWHRVVVQGIGPGPRYGHVMDLV AQRYLVTVSGNDGKRVVSDAWALDTAQKPYAWQRLNPEGDRPSARMYATASARSDGMFLLCGGRDASGTPLADAYGLLMH RNGQWEWTLAPGVSPSPRYQHASVFVGARLHVTGGVLRGGRSVEGEASVAVLDTAAGVWLDRNGIVSSSRSNKGHDHDPA LELMRRCRHAAAAVGVQIYIHGGLRGDTLLDDFLVAENSPFQPDNSHALTAERTSPLTSPKYNQSNFSLDGTQDGPSSGG SGLICVHFTRMDKHSMEKLREASAAEAEAASAVWQAVQAISAEETSVSDDNSQAAETVSDGSDTEGDVHLHPRAVVVAKE TVGNLGGMIISTLLRPRNWKAPVNRRFFLDSYEVGELCYAAEQIFMQEQTVLQLKAPVKVFGDLHGQFGDLMRLFDEYGF PSTAGDITYIDYLFLGDYVDRGQHSLETITLLLALKIEYPENVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGENDGIWAWTR FNQLFNFLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINSVEQIEKLERPITMDAGSIILMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTF GPDRVTDFCKRNKLQLIIRAHECVMDGFERFAQGQLITLFSATNYCGTANNAGAILVIGRGLVVVPKLIHPIPPPLQSPE TSPERELNIQRPPTPTRGRPQPDLDRGSLAYI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PIRSF 1 490 490 7.2E-192
MobiDBLite 1 29 29 -
PANTHER 1 489 489 0.0
PANTHER 1 489 489 0.0
Gene3D 12 153 142 7.6E-13
Pfam 29 95 67 1.4E-7
SUPERFAMILY 43 357 315 2.75E-34
Pfam 96 134 39 2.1E-6
Gene3D 154 370 217 8.0E-15
MobiDBLite 361 398 38 -
MobiDBLite 444 469 26 -
MobiDBLite 444 460 17 -
Gene3D 480 804 325 2.2E-110
PIRSF 488 832 345 2.2E-215
PANTHER 489 832 344 0.0
CDD 489 791 303 0.0
PANTHER 489 832 344 0.0
SUPERFAMILY 492 801 310 2.71E-96
SMART 509 793 285 5.5E-111
Pfam 537 744 208 9.7E-34
PRINTS 537 564 28 1.1E-61
PRINTS 572 599 28 1.1E-61
PRINTS 605 629 25 1.1E-61
ProSitePatterns 606 611 6 -
PRINTS 643 669 27 1.1E-61
PRINTS 673 700 28 1.1E-61
PRINTS 733 753 21 1.1E-61
PRINTS 755 771 17 1.1E-61
MobiDBLite 794 832 39 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphoprotein phosphatase activity Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Brassinosteroid mediated signaling pathway A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid.
Molecular function Hydrolase activity Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0261000.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…