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LotjaGi6g1v0032900.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0032900
Transcript ID LotjaGi6g1v0032900.3
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Transcription-associated protein 1; TAIR: AT2G17930.1 Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein with FAT domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9Y4A5|TRRAP_HUMAN Transformation/transcription domain-associated protein; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7GST8|A0A1J7GST8_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0032900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:6153915..6182288) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACCATCATATGGAGCATCACTCATGTACATTCTCCTAGATCTCAGGTAATAAATCATTTGTATAATATATTTTTTGTGGA TTTTCCACCTCCTTCCCTCCTGTATAATATTTGTCATGTATGGAATTTTCACTACACATGAAACATTACAGGTGCTTGTC TCATCTTCATCTAATTTACCACCACCTCAAGCATTGAGAGGCATGAGAGAAGATGAGGTAATATGGATATGCTGAACTCT GACATTGGTGTTTCGAAGCTTAACAGTTTAAGTTGACTTAAGAGTCTTGTGCAGGTCCGCAAAGCCTCCGGCGTTCTAAA AAGTGGGGTTCATTGCTTAACACTGTTTAAGGAGAAAGATGAGGAGAGGGAAATGCTTCATCTCTTCTCAGAGACTTTGG CCATTATGGAACCTCGAGATCTTATGGATATGTTTTCTCAGTGTATGCCCGAGCTTTTTGAGTGCATGATCTCCAGCACT CAACTTGTCTGCATATTTTCTACTCTTCTTGCAGCCCCTAAAGTGTACCGGCCATTTGCTGATGTGCTTGTTAATTTTCT TGTAAGCCGCAAACTTGATGTCTTGAAACAACCAGATTCACCTGCTTCAAAACTCGTTTTGCATCTCTTCCGCTTTATAT TTGGTGCTGTTGTTAAAGCACCTTTAGGTTTTGAACGGATTTTGCAGCCTCACGTGCCTATTATCATGGAATGTTGCATG AAAAATTCCACTGAAGTTGAAAAACCTCTTGGTTACATGGAGTTGCTTCGAACAATGTTCAGGGCACTTACAAGGTGCAA ATTTGAACTTTTGCTACGGGACTTGATTCCCATGTTGCAGCCATGCCTCAATTTCCTGTTGGCTATCCTGGAAGGTCCAA CTGGGGAAGATATGAGAGATCTTTTATTGGAGCTCTGCATGACCTTACCTGCTCATTTGAGCTCTCTGCTACCATACCTT 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CDS sequence (LotjaGi6g1v0032900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

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CCTGAAATTCGGATGAAATTCCTCTCTCTCTATCACGAGTCTCTTAACAAAACTCTTTTTGCCAGGCTTCAATTTATTAT TCAAATTCAAAACTGGGAGGCTTTGAGTGATGTCTTCTGGCTCAAACAAGGTCTTGATCTTCTCTTGGCAATATTAGTCG AGGATAAACCTATTGCTTTAGCTCCAAATTCAGCCAGTGTTCAACCACTTCTGGTTTCAAGCTCTCTTTTGGAATCATCT GGGATGCAGAACAAGGTTCATGATGTGTCTGAAGAAACTAAGGATGCTCCACTAACGTTGGAGACCCTTGTGTTTAAACA TGCCAAGTTTCTTAACAATATGAGCAAACTCCAGGTGGCTGATCTATTAATTCCATTGAGAGAGTTTTCCCATACAGAAG CTAATGTTGCATACCATTTGTGGGTTCTGGTATTTCCATTAGTCTGGGTTACATTAAAAAAAGAAGATCAAGTAACACTT GCTGAACCAATGATTACTCTTCTGTCTAAAGATTACCATAAGAAGCAGCAAGGCAGCAGACCAAATGTAGTGCAAGCATT ATTAGAAGGACTTCAGTTGAGCCATCCTCAACCCAGAATGCCAAGTGAGCTCATTAAATATATTGGGAAAACGTATAATG CATGGCACATTGCACTGGCTTTGCTTGAAAGTTATGTTATGGTGCTCCCTACTGATTCTAAATTCTCTGAGTCTCTGGCT GAGCTCTATCGTTTGCTCAATGAAGAGGATATGAGGTGTGGGCTGTGGAAGAATAAATCAGTCACTGCAGAAACCAGGGC AGGGCTTTCTCTTGTTCAGCATGGTTACTGGCGCCGTGCTCAAAGTTTATTTTATGATGCAATAGTAAAGGCAAGACTAG GAACGTATAACAACACTGTACCTGGGGCTGAGATGCGTTTATGGGAAGAGCAATGGCTATACTGTGCGAGTCAACTTTGT CATTGGGATGCATTGGCAGACTTTGGCAAGAGTACTGAGAATTATGAAATTCTGCTTGACAGTCTTTCGAAATTGCCTGA TTGGACATATATGAAGAAGCATGTCATTCCTAAAGCTCAAGTGGAAGAAACTCCAAAACTTTGTTTGATTCAAGCATACT CTGCTCTTCATGGAAAAAATTCAAATGGTGTGGAGGATGCTCAGAGCATGGTGGGTAAAAGTGTTGATCTTGCTCTAGAA CAATGGTGGCGGCTGCCTGACATGTTTGTTGATTCCAGAATTCCCCTTCTGCAGCAATTCCAACAAATAGTTGAAGTTCA ACAGTCAGCTAAGATTCTAATTGAAATTTCTTCTGGAAATAAACTCTCTGAAAGTTCGGTGGTTGGTGTGCAGGGAAACC TTTATGGCAATCTGAAGGACATCCTAAAGACTTGGACACTCAGAACTCCAAATAAATGGGATCGTATGTCTATTTGGTAT GATTTGCTACAGTGGAGGAATACAATGTATAATTCTGTCATAGAAGCTTTCAAAGATTCTGGTGCCACAGATTCAGAACT TCATCATCTTGGGTACCGCAACAAAGCTTGGAATGTCAACACGCTTGCTCATATTGCTCGTAAGAAAGGACTGTTTGATG CTTGTGTCACCATACTTAAAAAATTATATGGCCATTCAACCATGGACGTGGAGGAGGAATTTGTTAAGTTAACAGAGAAT GCAAAGGCGAATTTGGAAACCAAGGGAGAACTCACAACCGGTCTTAATCTGATAAACAGTGCTAATATAGAGTGTTTCAC TGCCAAGCACAAGGCTGAAATTTTCCGTCTGAAAGGAGATTTCTTGTTAAAAATGAAAGACTCTGAGGGTGCTCATGTTG CTTATTCAAATGCCACTTGTCTTTGTAAAAGCTTGCCTAAGGGATGGATAAGTTGGGGAAACTATTGTGACATGGCATAC AGAGATACTCATCATGAACTTTGGTTAGAATATGCCGTCAGCTGCTTCTTGCAAGGTATAAAGTTTGGTGTGTCCAATTC AAGAAGCCATCTTGCTCATGTTCTTTATCTTCTTAGCTTTGATACTCCTAATGAGCCTGTTGGAAGAGTATTTGATAAGT TATATGAACAAGTACCGCATTGGGTTTGGCTCTCTTGGATCCCACAGCTCTTGCTCTCTCTCCAGAGGACAGAAGCTCCT CATTGTAAACTTGTTCTTCTGAAGATTGCAACCTTTTATCCTCAGGCTCTGTATTATTGGCTGCGCACATACTTGCTGGA ACTGCATGATGTTGCTTATAAATCTGAACTTGGTAGAATAGAAATGACACAGCAAACTGGTACTAGTGGAGGTTCTCCTG GTGGACTTGCAGATGGAAATTCAAGACTGCAAGGTCCAGGTGGGAGTGCCTTATCATCTGATATTCAAGTTCACCAAGGC TTCCAGTCTGCTGGAGGGATTGGATCTCATGATTTTAGGAACTCTCACAGGCATGAATCTGCAGGTGCAGAAAGCAGCAT GCACAATGGGAATGACCAATCATTCCAGCAAGGTTCTGCAAACCTCAATGAAGGTGCTCTGAATACTTTAAGGCATGCTG GTGCTTTAGGTTTTGTACCTTCAGCTGCTAGTGCTTATGATGCTGCAAATGATATAATGGAGGCCCTTAGGGGAAAGCAT GCTAACTTGGCTAGTGAGCTCGAGGTTTTGCGAACAGAAATTGGTGCAAGTTTTTTCACTCTGCCTGAGGAGAGGCTTCT GACAGTGGTGAATGCCTTTCTGCGCCGCTGCTACAAATATCCAACAGCTACAATGGCAGAAGTTCCCCAGTCTCTCAAGA AAGAGCTCTCAGATGTTTGCAGGGCTTTCTTTTCAGCAGATGCTTCAAATAAGCATGTTGATTTTTTGAGGGAGTACAAA CAGGATTTTGAACGTGATCTTGATCCAGAAAACACTGCCACTTTCCCTTCTACCCTCTCTCAACTGACCGAGCGGTTGAA ACAGTGGAAAAATGTTCTGCAAAGTAATGTCGAGGACAGGTTTCCAGCAGTATTGAAACTAGAAGAAGAAAGCAGCGTAT TGCGGGACTTCCATGTTATTGATGTTGAAGTTCCAGGCCAGTATTTCACCAATCAGGAAATTGCACCAGATCATACTGTC AAGTTAGATAGGGTCGCAGCTGATGTTCCAATTGTGCGGAGGAATGGGAGCAGTTATCGGCGTTTGACTCTGATTGGCTC TGATGGTTCCCGACGCCATTTTACTGTCCAGACGTCTTCGACTGTCAATACTATAAGTGATGAGCGCATATTGCAGCTTT TTCGTGTGATGAACCAAATGTTTGAGAAGCACGGGGAATCAAGACGCCGTCACATAGGCTTTCACACTCCAATAATTATT CCTGTTCAGTCCCAGGTTCGCATGGTAGAAGATGATTTGATGTATTGTACGTTCCTTGATGTCTATGAGAATCACTGTAC GAGGAACAATCTTGAGGAAGATCAGCCAATAACCTTTTTCAAGGAAAAGTTGAACCAGGCTATAAATGGACAAATATCAC CAGAAGCTGTTGTCGATCTCCGTCTGCAAGCCTATAATGAAATAACAAAATTTACGGTTGGTGACAACATCTTTTCACAG TATATGCAAAAAACTCTACAAAGTGGCAACAATATGTGGGCTTTCAAGAAGCAATTTGCCATCCAGTTGGCCCTTTCATG TTTTATGTCCTTTATGTTACAAATTGGTGGGAGGTCTCCGAACAAGATTTTGTTTGCAAAGAACACTGGAAAAATATTTC AAACTGATTTTCACCCTGCATATGATGAAAATGGACTGATCGAGTTCAACGAGCCAGTTCCATTCAGGCTAACAAGGAAT ATGCAAGCATTCTTCTCTCATGGAGTAGAAGGTCTTATTGTACCATCAATGTGTGCAGCTGCACAAGCTGTCGCTTCACC TAAGCAAAGTCAACATTTGTGGCATCATCTTGCGATGTTTTTCCGTGATGAGCTACTGTTATGGTCTTCGAAAAGATCGC TTGGGATTCCCATTGTTTCTATGGCTGCTGGTAGCCTTATTGAGTTCAAACAAATGGTTATTTCAAATGTGGAACATGTT GTAGAAAGGGTTAAAGGAATAGCACCACAGAGATTTTCTGAAGAGGAGGAAAATGAGATGGGTCCACCGCAATCGGTGCA AAGGGGTGTTAATGAGTTGGTTGAAGCTGCCTTCAATCCAAGAAACTTGTGCATGATGGATCCAACATGGCATCCGTGGT TCTAG
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Protein sequence (LotjaGi6g1v0032900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MREDEVRKASGVLKSGVHCLTLFKEKDEEREMLHLFSETLAIMEPRDLMDMFSQCMPELFECMISSTQLVCIFSTLLAAP KVYRPFADVLVNFLVSRKLDVLKQPDSPASKLVLHLFRFIFGAVVKAPLGFERILQPHVPIIMECCMKNSTEVEKPLGYM ELLRTMFRALTRCKFELLLRDLIPMLQPCLNFLLAILEGPTGEDMRDLLLELCMTLPAHLSSLLPYLSRLMKPLVLCLKG NDELVSLGLQTLEFWVDSLTLEFLEPSMANNMPAVILALWSHLRPAPYPWGAKALLLLGKLGGRNRRFLKEPLALECKEN TEHGLRLILTFEPAAPFLVPLDRCINLAVKAVMNKNCGMDAFYRKQALKFLHVCLSSLLNLPGTVTDEGCTSKQLSALLV SAVDQSSHRSESTDVKADLGAKTKIQLMAEKSIFKILLMTVIAANADPDLTDPTDDFVIHICRHFAMIFHIDSSSRKASA AVLGGSSLSNNIHVDSRPRMSTCSNLKELDPHIFLDALVDVLADDNRLHAKAALDSLNLFAETVLFLARLKHTDFIMSRG PGTPMIVSSPSINPLYSPPPSIHVPVFEQLLPRLLHCCYGLTWQAQMGGVMGLGALVRKVTVETLCLFQVRIVHGLIYVL KKLPIYAGKEQEETSELLSQVLRVVNNADEANTEARRQSFQGVVNFFAQELFNQDASIIVRKNVQSCLALLASKSGSEVS ELLESLYHLFQPLIMRPLKLKTVDQQVGTVTALNFCLALRPPLLKLTPELVNFLQDALQIAESDENAWVTKSINPIGVAS LTTLRTACIELLCTTMAWADFKTPNHSELRAKIISMFFKSLTCRIPEIAVVAKEGLQKVIINQRLPKELLQCSLRPILVN LAHTKNLSMPLLLGLARLLELLSNWINVTLGEKLLEHLKRLLEPEKLADSQKSWKAGEEPKIAAAIIELFHLLPPAASKF LDELVTLTIDLEGALPPGQVYSEINSPYRLPLTKFLNRYAALAVDYFLARLSEPKYFRRFMYIIYSDAGQPLRDELAKST QKILASAFSEFLPKSEVAMGEDILVVPSTDASNASARAPNATSDAYFQGLELIKTLVKLIPRWLQNNRTVFDTLVLVWKS PGRISRLENEQELNLMQVKESKWLVKCFLNYLRHEKAEVNVLFDILTIFLVRSRIDYTFLKQFYIIEVAEGYLPSLKKNL LSHFLNSFQSKQLGQDHLVILMQMLILPMLAHAFQNDHSSEVVDSAMIRTIVDKLFDPPEEVLAEYDEPLRIELLQLATL LLKYLQTDLFDHRMQLFKFGWNHLKREDTVSKQWAFVNVCHFFEAYEAPENLIVKVFVVLLETSVTFQLENKMFVKQALD TLMPALQRRLPLGDSRMPTWIRCTEKILVEYSHSIPNLIQIFQLIIRHSDLFYSYRAKFIPQLVNSLSHLGLQPNNTTAE IRCLAIELAGLVINWESQRQNEMKLKVVTDSDAPSQINDVFHPSSAESQRSVDGSIFPEDTTKRVKATPGLQSVCVMSPG GPSSIPNIETPGSASQPDEEFKPNAAMEEMIINFLISVALVIDPKDKEESAMYKQALELLSQALEVWPNVYVQFKYLEKL LSSIQPSEAKYPSIALAQGLDVMNKVLEKQPHLFIRNNINQISQILELCFKHKLLDAGKSFCSLLKMIFVAFPQEATSTP PDVKQLYQKLDDLIQKHVTTVMAPQTSSDDNTDSSISFLLLVIKTLTEAQRNFVDPLILVRILQRLQRDWGSSVGSQIRQ GQRTDPDSAVTSSYQDADVGAVLVITNLKSIFKLISDRVMVGPECKRSVSQILNALLSEKGIDASVRLCILDVIKGWSED GNSFTSSAFLTPKEIVSFLQNLSQVDKQNFTPVSREEWDRKYLELLYGTCADSNKYPQSLRDEVFKKVEMQFMHGLRARD PEIRMKFLSLYHESLNKTLFARLQFIIQIQNWEALSDVFWLKQGLDLLLAILVEDKPIALAPNSASVQPLLVSSSLLESS GMQNKVHDVSEETKDAPLTLETLVFKHAKFLNNMSKLQVADLLIPLREFSHTEANVAYHLWVLVFPLVWVTLKKEDQVTL AEPMITLLSKDYHKKQQGSRPNVVQALLEGLQLSHPQPRMPSELIKYIGKTYNAWHIALALLESYVMVLPTDSKFSESLA ELYRLLNEEDMRCGLWKNKSVTAETRAGLSLVQHGYWRRAQSLFYDAIVKARLGTYNNTVPGAEMRLWEEQWLYCASQLC HWDALADFGKSTENYEILLDSLSKLPDWTYMKKHVIPKAQVEETPKLCLIQAYSALHGKNSNGVEDAQSMVGKSVDLALE QWWRLPDMFVDSRIPLLQQFQQIVEVQQSAKILIEISSGNKLSESSVVGVQGNLYGNLKDILKTWTLRTPNKWDRMSIWY DLLQWRNTMYNSVIEAFKDSGATDSELHHLGYRNKAWNVNTLAHIARKKGLFDACVTILKKLYGHSTMDVEEEFVKLTEN AKANLETKGELTTGLNLINSANIECFTAKHKAEIFRLKGDFLLKMKDSEGAHVAYSNATCLCKSLPKGWISWGNYCDMAY RDTHHELWLEYAVSCFLQGIKFGVSNSRSHLAHVLYLLSFDTPNEPVGRVFDKLYEQVPHWVWLSWIPQLLLSLQRTEAP HCKLVLLKIATFYPQALYYWLRTYLLELHDVAYKSELGRIEMTQQTGTSGGSPGGLADGNSRLQGPGGSALSSDIQVHQG FQSAGGIGSHDFRNSHRHESAGAESSMHNGNDQSFQQGSANLNEGALNTLRHAGALGFVPSAASAYDAANDIMEALRGKH ANLASELEVLRTEIGASFFTLPEERLLTVVNAFLRRCYKYPTATMAEVPQSLKKELSDVCRAFFSADASNKHVDFLREYK QDFERDLDPENTATFPSTLSQLTERLKQWKNVLQSNVEDRFPAVLKLEEESSVLRDFHVIDVEVPGQYFTNQEIAPDHTV KLDRVAADVPIVRRNGSSYRRLTLIGSDGSRRHFTVQTSSTVNTISDERILQLFRVMNQMFEKHGESRRRHIGFHTPIII PVQSQVRMVEDDLMYCTFLDVYENHCTRNNLEEDQPITFFKEKLNQAINGQISPEAVVDLRLQAYNEITKFTVGDNIFSQ YMQKTLQSGNNMWAFKKQFAIQLALSCFMSFMLQIGGRSPNKILFAKNTGKIFQTDFHPAYDENGLIEFNEPVPFRLTRN MQAFFSHGVEGLIVPSMCAAAQAVASPKQSQHLWHHLAMFFRDELLLWSSKRSLGIPIVSMAAGSLIEFKQMVISNVEHV VERVKGIAPQRFSEEEENEMGPPQSVQRGVNELVEAAFNPRNLCMMDPTWHPWF
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Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius
NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN
1 3138 3138 - –
PANTHER
PTHR11139:SF105
1 3334 3334 0.0 –
PANTHER
PTHR11139
1 3334 3334 0.0 –
SUPERFAMILY
SSF48371
31 996 966 1.65E-28
IPR016024
SUPERFAMILY
SSF48371
1199 1862 664 3.45E-10
IPR016024
ProSiteProfiles
PS51189
2124 2667 544 18.451
IPR014009
Pfam
PF02259
2265 2595 331 3.5E-33
IPR003151
MobiDBLite
mobidb-lite
2684 2712 29 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2728 2759 32 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2744 2759 16 - –
Coils
Coil
2793 2813 21 - –
SUPERFAMILY
SSF56112
2897 3251 355 2.14E-47
IPR011009
CDD
cd05163
2962 3250 289 7.44662E-106 –
ProSiteProfiles
PS50290
2994 3201 208 11.972
IPR000403
Pfam
PF00454
3007 3250 244 9.8E-26
IPR000403
SMART
SM00146
3007 3302 296 2.2E-9
IPR000403
Gene3D
G3DSA:1.10.1070.11
3094 3254 161 5.0E-9
IPR036940
Phobius
TRANSMEMBRANE
3139 3157 19 - –
Phobius
CYTOPLASMIC_DOMAIN
3158 3334 177 - –
ProSiteProfiles
PS51190
3302 3334 33 14.216
IPR003152
SMART
SM01343
3302 3334 33 5.6E-8
IPR003152
Pfam
PF02260
3303 3334 32 1.9E-7
IPR003152

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
GO:0005515
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Subterm of
GO:0016301
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.
Subterm of

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0032900.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…