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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0103400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0103400.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ABC transporter B family-like protein; TAIR: AT5G58270.1 ABC transporter of the mitochondrion 3; Swiss-Prot: sp|Q9LVM1|AB25B_ARATH ABC transporter B family member 25, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|K7M8A3|K7M8A3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0103400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:15888368..15911573) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTAGTACAAAATTCCGTTATCTTTTCACTTTTCAGTTCCCATCTAGTTGGGGTTACACATGAATCTATGCAAGTCTCCA TAACTCAATTTGATAAGTGTGTGCAAAATTTAAGCACGTGAATGAACATGCCTGATAGAAAGGGAAAAGGGGAAAGAAAC CCATACCTCTTCTATCTACTTGTTCTCTTCTATTCACTCTCAATTCAATCCATCCTCTAAAATTTGTTTAGGGTTTTGTT CTTAAATTCCCCAATTCCATCAAACCTAAGAAAAATTCTTCATCAATTCACACTGAAAAAGTCAAAGCTGCAAACTTTGG GTCACAATTCCATTGAATCTACGAAAAATTCTTCGATTCACAGATACCCATTTGCAGAATTCCACTGAAAAAACTCAAAG TTGCAAACTTTGGGTCTTTCAGCAATGCTTGCCGCTGCAGCTTCTGCTTCTAGGCACCTTCTTCAACGCGATGCCAGACC CAACAATCGAGTTCGATCGCTTCTAAGTGCTTCTGGCATCACCACCACCAGCTGCTACCAATTTCGCAGTGCAAGAGGTT ACAGTTATGGAACCAGTTTGAGTAACCGCCAATCCAGAACATGCCCAAGTTTGCTTTTTACTGTAAAGGGGTTTCTCTCT GATTCTCCATCTTCTTCTGGAAGAGTAACTAGGCCTTACTTACTACAATCTGTGAGTTCAAATGCTTAACTTGGTTTTTT CTTTTTTTTTTTGAATTTTGTTTGGGATGATTGTTTCCATGTTTTGTTTGTGATTGGTTTTAATTCAATGGTTTTGATGC TGATTGTGTTTGTTTGGGAATTGTGTGGAGCAGAGTTCGACGGTAGACGGGCGAGGATTTTTCTCAACTTCTTCAAGTAA ACCTGATGATGGAAGCCAGAGCCAAAAGAAGGCTGATTCAGCTGTTGTTAAATCACCTCCAGGGGGACAAATTTCGGATG 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AACCTTGAAAAATTACTAGTGTTCAGGAGCTTTACAAACTGATTATAGCTGTTATGAATTTTACTTCTTTCTTGTCAAAG ATTGAATCTGGCATACCCATTATGATGATTGAATCACATTTCATCGGGAAAACAAGTTGCCAATATAAATGTGTATGTCC AGTTCAATATTTCTCTAATTAAGGGGTTAATTTAGGCAGTTATAACTGTAATTGATATTGTACAAGGATAAACACATGCA TGTGTACACTGATTAGTTACAGAGTTCCAGCTATTTTTTTCTATTTAGAAGATGACATCAGAGCCAGGATGACCAAATAG TTAAGAATTGATCCTTTCCCCATTTTTCATAAACAATTTAACCTTCATCTCAATGTGAAGTAGGCATATCACATGTGTGT TAAAGGTCTCTTGTGTGAGGGGGTATGCTGGTCTGTTAGATATATATACTCGTCCCTTGGCATTGCACTAGTTTGTTGCA TTTTCTTGGAGCCAAAAGCTCTGCATTTTTATCGTAGTTCATTTTTCACTGAACTTACCTTGGAATGGGATTATGTAATT TTTGGTTTTATAGCTGTTGAATATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTG TTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGAT AGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATG AAATACACAATAATTATTTTATCAAATTCAAGTTGGTATCAGAGCGAGTTTCGATCCTACCGCTGTGAGGGGGCTCCTCC CCCGTGAGCCCCCTCATGGTGACCTTCCAAATCTCTTTGGATTATTTTCACTCGTCCTGTGCTTCCGCGCTTGTTCGTTC TAGCCTTTTCTTACGGCCTCGTTTCTTTCTGATTATGGTCCCCTTTGTCTTGGAACCCTATTGACCCTTGTTTCTTAATA CTTAAAACAACCGCGCCTTCTTCTTCGGCGCGTGAAGGTAACGCACAAACCTGAACTCGACGCGACGACCACATACATGT TCGTCCGTTGTAGTATAGTTGGTCAGGATATTTGGCTCTCCCTCCTGGTTCTGTTCCAGATGTTGTTTTCTCCAGATTTT CCTTCCTTTAATGCAGTTGCGTGATTGGAAGAAATTGTGGGAATTGATTCAACAATTGTTTACTCAAGAATTCTTGATTG GAATGACATAATAATTCTTCACTGCCAGCGAGAGTATTGGTTACATGAAGTGGAAATATGGAATGCCAATGCGTTGGGAT GGTGATATTGGAAGTTTCTGATGATGCCAGAATGAAGCAGTACCATGTGGCTCTTTGGTCCAATCCAGTTCTCAATTAGT GTGTTGGGTTGTTCTAGTTTCTTGTTTTTGGTTTCTTGGTTTTGGTTGGCACAGTGTGGTTTTGGAGTTGGAAAAGATTT TTGCTCTCTATTAAAGTGGAGAATTGGTTTTGCATTGTGTGGTTTGTTGGTGTATAAATTTTGGACTATTTTTGGGAATA TCTCTCTCCGGCAGCAGCTGCTTCTCAAGTTAATTATATTTGTTAAAAGCTATGCATATGACATATATGCGCTAGCTTGA GGGGAAGATCTGAATATTGTTAAATCTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCATATGACATATATGCTATAGTTTGAAGG GAAGTGTTGGATATTGCTAAATATCCTAATAGAGACCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTT GGTGGAGGGTGTATTCAAGAAGTGTTTGGTTGGATCTAATTGTATTGCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTT TCGGCCAGGTTTGGTTTTTAAGGTCCTCTATTTGACGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCTGGTCTTCCTCTT CCAGTTTGGTTTGTGGGTCTGCTGTGTTTTCTCATCTGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGTTCTTAGTTTGCGTCTCATGG TTCGTGATGCTCTTATTATATTGATCTTGGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTTGTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTTCGTT TGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTTTTCTGGTTTTAGGGCTTCAGCTGCAAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAGTT ATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCTAGCTGCGAGTTGCGCTGGCTCGCTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTTTGTGTCAAAGTT GACACCATTGTTTGTTTTAGAAGCCATCAATCGATCGACCTCAAGTATGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGAGT TGTTGCTTCAGCCTTGTTTTGTTTTCGGGCGTATTGTTGCTGGTTTTTCGCCCTTGTTTGCTGACTCAGCTACCCTACGA CACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTCTTGCATCAATTTCAGCCAGATCAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGG ATTTAGCAGAAGTTCGAAAGATTATTCAATTTGAAGTATGAGAAGTTGGCTTTTATCGCCATGGATTTACTAGAAGTTTG AAAGGTTATTCAATTCAGAAATTCGCCAAGACTGTCATTATTAAGGGATATCTATTAAGATAATTTTTTTCTTGGGTTCG ATTTGTTACAAGCTTAAAGCTAAGTAAGCTTTAGCTTGAGGGGGAGTGTTGAATATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTA GTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATT TAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTTGTTAGTCTATATA TATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCAAATTCAAGTATAGCGTTCAACTAA TGTCTGTTTGAAACGACCACTTTTATCAACATGTCCCATTTTATTAGCACACGGGTTTATGCAAGTATTTTGGAGAACTT TTGTAAATAGCTTATGACTAGGGTCAGATTTGTTTATGAATAAGAGCTTATGCTTACCCAAACGCGCCCTAAATATTTCT GGTGTTTCAATATTGTAATTTCTTGCCCGTCTTTGTTCTGTCTTCTCTTAGGTTGTGTGATGAAGCTACAAGTGCCCTTG ACAGCACTACAGAAGCAGAGATTTTAAGCGCATTAAAGTCACTAGCTAATGATCGAACTTCCATATTCGTTGCTCACAGG CTTACCACTGCAATGCAGTGTGATGAGGTAACCTTTCTCTATCTAGGTTCATGTCCTTCAACATTAAACAATACTGAGTT TCCTGTATTTTATATATATGTCTAGCTATAGTTTACATATTTATGATACTTATTACAAAATTTACATGAAGTTTGCATAA ATTGGTCCAGAATCCAGTTAACTGATTTTGTCTCCAGTAGTAATCTCTATATGTCAGGACAACACATCATCACTGTAAAC CAATACACTATGTATAAGTCTCATTTCATAACAGTAGATTTACGATTAACTATTGTAGTTGGTTCAAAAATCCTTGTAAT TAACGTTTTGTGATACTTATATGAAGAGTTTTTTTTTGTCAATGTTCAGATCATTGTTTTGGAAAATGGAAAAGTTGTTG AGCAAGGACCACATGAAGAGCTCTTAGCAAATGCGGGAAGATATTCACAACTTTGGGGCCAGCAAAATAACACAGTCGAT GCAATTGACACAGCCATCAAAGTGGGAGCATAAAATAATAAATCTTTCCCTTTCTCTTCGTAAGGGTAAGAAATGCATAA TACAATGTTAATAGCACATGTATTTAATGACAATTTTGATATTCCAGCTATAAGTTCTCTCTAGCCTCTTGATCCATTTT ATATTGTTTACTAGAGTAATTAATGCACATAGATCATATTTTGGGTCAAGCAGCAGGGAGCATCAATTTGTTAACTTTTC TCTGCTCCAGGGAAAATGTGTTATTGGTTTTCCAATGGACATACCAGTTTGAGATGAATGAGCTTATGTATCAACAAGAG TTTGTATTATTGGAACTGGATTATTTGTTGAAGGCGTGTACTATTTGCATAAGTTAAAGCACTTTTATTTAAATAACTAA AAGTGCTTTCTTGTATATGATGCTTAAGCCGGTAACAGTAATTACTTTTATTATGGCTGATTTTTTAATTATTGAAGAAA GGCATAGTTCAGTAATTTAATTCCAGGACTAAGCAGATTGTTTTCTTACCTCGTGATTCAGGAGGAGCTGAATTTGACAT AGTAATATGTCTCAATTTCTGTACTGTTGTTTCTATCATCTACTATTAGTTAGTTTAAGGCTCATTTAACAAGCTTTTTT CTGAATTTGGAAATCTATGTTCTGTCAAATGAGCTTAGGATTGACAGGGTTCTTCCAAATCCAAGTGACTTGTCTTCTTC ATCTTGACTTTTCTTTACATTTTAACATGCACTTCTAAATATTTTTAGGATTAGGTGTAATTGACATTTGTTCTTGATTT TGCAACGATGTAATTCTATTTTTTTTAGATTGATTGTTGTGTTGAGATTGAAATTGTCTATTATTATTGCTAGTTTGTGT TTGAGCAACATTAAACTTGATCTTAGCATGTGACAGGGATAGGTCATGTTTAACTTAAACATGAGTTTTTTCTACGTTAA TTGAGGAAGACTCCAGGGATAAGAGATCACGATTAAATTATGCAAAATTATGCCATGTCATACCACGAGTGCAACCACAA ATTCTAGGGAATTGTTGTCACTCCATACGTATATTCATGTCACCCTTAAATTCGTAAAATCTAAAAATACCCTTACTATT GTTTCT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0103400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTTGCCGCTGCAGCTTCTGCTTCTAGGCACCTTCTTCAACGCGATGCCAGACCCAACAATCGAGTTCGATCGCTTCT AAGTGCTTCTGGCATCACCACCACCAGCTGCTACCAATTTCGCAGTGCAAGAGGTTACAGTTATGGAACCAGTTTGAGTA ACCGCCAATCCAGAACATGCCCAAGTTTGCTTTTTACTGTAAAGGGGTTTCTCTCTGATTCTCCATCTTCTTCTGGAAGA GTAACTAGGCCTTACTTACTACAATCTAGTTCGACGGTAGACGGGCGAGGATTTTTCTCAACTTCTTCAAGTAAACCTGA TGATGGAAGCCAGAGCCAAAAGAAGGCTGATTCAGCTGTTGTTAAATCACCTCCAGGGGGACAAATTTCGGATGCGAAGA TCATTCGTACGCTTGCCAGTTACCTTTGGATGAAAGATAACCCGGAATTTCGGTTTCGGGTTGTTGCTGCATTGTTTTTA CTTGTTGGGGCTAAGGTTTTGAATGTTCAGGTCCCTTTCCTATTCAAGCTTGCAGTTGATTGGTTGACGGCTGCCACGGG CAATGCTGGTGCTATTGCTTCAAATTCGGCCGCGGTGGCTCTTTTTGCAACCCCTGCGGCGGTGTTAATTGGATATGGGA TTGCACGATCAGGAGCTTCTGCTTTCAACGAACTGCGGAATGCATTATTTTCTAAGGTAGCACTCCGAACAATTCGATTG GTATCAAGAAAGGTCTTCTCACATTTGCATGAGCTTGACCTTCGGTATCATCTAAGTCGAGAAACTGGTGGATTAAGTCG AATAATTGATCGTGGTAGCCGTGCAATAAATTTCATTCTCTCCTCTATGGTGTTCAATGTAGCACCCACCATATTAGAGA TATCTATGGTATCAGGTATACTGGCTTACAATTTCGGAGCTCCTTTTGCTTGGATTACTTCCCTATCAGTTGCTGCTTAT ATTATTTTTACACTGACTATCACTCAGTGGAGGACTAAATTCAGGAAAGCCATGAATAAAGCTGATAATGATGCCACTAC AAGGGTTGTTGATTCACTTATTAATTATGAGACTGTCAAATATTTCAATAATGAAGTTTATGAAGCTGATAAGTATGACA AGTACCTAGAGAGGTATGAGGATGCTGCTCTGAAAACCCAACGCAGTCTTGCTTTGTTGAACTTTGGTCAAAATATTATA TTTAGTACTGCTCTTTCAACAGCAATGGTGCTGTGTTCTCATGGGATCATGAATGGCACGATGACTGTTGGTGATTTGGT GATGGTGAATGGGCTGCTCTTCCAACTATCTCTTCCTCTCAATTTTCTTGGTAGTGTTTATCGCGAGACTATACAGAGTT TAGTTGACATGAAATCCATGTTTCAGTTACTTGAGGAAAGAGCCGACATCAGGGACAAAGACAACGCAGAGCCTCTGAGA TATAATGGGGGGAGGATCCAATTTGAGAATGTACATTTTAGTTATCTCACAGAAAGAAAGATACTAGATGGAATATCACT TGTTGTGCCAGCTGGTAAAAGTGTTGCAATTGTTGGGACTAGTGGAAGTGGAAAATCAACCATTCTTAGATTGATATTCA GGTTTTTTGATCCTCATTCTGGAAATATAAAGATTGATGGTCAAGATATTCGGGAGATAACCCTTGAAAGTCTGCGGAAG TCTATTGGTGTTGTTCCACAAGATACTGTACTTTTCAATGATACAATTTTTCACAATATTCATTACGGTCGTCTGTCAGC AACAAAAGAGGAGGTCTATGAAGCTGCTCGGCAAGCTTCCATTCATGATACAATCATGAGTTTTCCTCAGCAATATTCAA CAGTCGTGGGAGAACGAGGGCTCAAGTTAAGTGGTGGTGAGAAACAACGGGTTGCCCTAGCTCGTGCATTCTTAAAGTCG CCTGCAATATTGTTGTGTGATGAAGCTACAAGTGCCCTTGACAGCACTACAGAAGCAGAGATTTTAAGCGCATTAAAGTC ACTAGCTAATGATCGAACTTCCATATTCGTTGCTCACAGGCTTACCACTGCAATGCAGTGTGATGAGATCATTGTTTTGG AAAATGGAAAAGTTGTTGAGCAAGGACCACATGAAGAGCTCTTAGCAAATGCGGGAAGATATTCACAACTTTGGGGCCAG CAAAATAACACAGTCGATGCAATTGACACAGCCATCAAAGTGGGAGCATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0103400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLAAAASASRHLLQRDARPNNRVRSLLSASGITTTSCYQFRSARGYSYGTSLSNRQSRTCPSLLFTVKGFLSDSPSSSGR VTRPYLLQSSSTVDGRGFFSTSSSKPDDGSQSQKKADSAVVKSPPGGQISDAKIIRTLASYLWMKDNPEFRFRVVAALFL LVGAKVLNVQVPFLFKLAVDWLTAATGNAGAIASNSAAVALFATPAAVLIGYGIARSGASAFNELRNALFSKVALRTIRL VSRKVFSHLHELDLRYHLSRETGGLSRIIDRGSRAINFILSSMVFNVAPTILEISMVSGILAYNFGAPFAWITSLSVAAY IIFTLTITQWRTKFRKAMNKADNDATTRVVDSLINYETVKYFNNEVYEADKYDKYLERYEDAALKTQRSLALLNFGQNII FSTALSTAMVLCSHGIMNGTMTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGSVYRETIQSLVDMKSMFQLLEERADIRDKDNAEPLR YNGGRIQFENVHFSYLTERKILDGISLVVPAGKSVAIVGTSGSGKSTILRLIFRFFDPHSGNIKIDGQDIREITLESLRK SIGVVPQDTVLFNDTIFHNIHYGRLSATKEEVYEAARQASIHDTIMSFPQQYSTVVGERGLKLSGGEKQRVALARAFLKS PAILLCDEATSALDSTTEAEILSALKSLANDRTSIFVAHRLTTAMQCDEIIVLENGKVVEQGPHEELLANAGRYSQLWGQ QNNTVDAIDTAIKVGA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 153 | 153 | - | – | |
| PANTHER | 37 | 724 | 688 | 0.0 | ||
| PANTHER | 37 | 724 | 688 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 98 | 118 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 98 | 125 | 28 | - | – | |
| Gene3D | 141 | 476 | 336 | 3.8E-140 | ||
| SUPERFAMILY | 149 | 465 | 317 | 2.09E-56 | ||
| TMHMM | 152 | 174 | 23 | - | – | |
| Phobius | 154 | 175 | 22 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 155 | 452 | 298 | 40.443 | ||
| Pfam | 155 | 439 | 285 | 1.9E-37 | ||
| CDD | 157 | 460 | 304 | 1.43094E-163 | – | |
| Phobius | 176 | 194 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 189 | 211 | 23 | - | – | |
| Phobius | 195 | 215 | 21 | - | – | |
| Phobius | 216 | 274 | 59 | - | – | |
| Phobius | 275 | 303 | 29 | - | – | |
| TMHMM | 275 | 297 | 23 | - | – | |
| Phobius | 304 | 308 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 307 | 329 | 23 | - | – | |
| Phobius | 309 | 330 | 22 | - | – | |
| Phobius | 331 | 394 | 64 | - | – | |
| TMHMM | 389 | 411 | 23 | - | – | |
| Phobius | 395 | 416 | 22 | - | – | |
| Phobius | 417 | 427 | 11 | - | – | |
| Phobius | 428 | 447 | 20 | - | – | |
| Phobius | 448 | 736 | 289 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 475 | 721 | 247 | 1.04E-89 | ||
| Gene3D | 477 | 732 | 256 | 1.4E-94 | – | |
| ProSiteProfiles | 486 | 720 | 235 | 24.49 | ||
| CDD | 486 | 721 | 236 | 2.90616E-152 | – | |
| Pfam | 502 | 651 | 150 | 1.4E-35 | ||
| SMART | 511 | 697 | 187 | 7.9E-16 | ||
| ProSitePatterns | 623 | 637 | 15 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Molecular function | ATPase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction. | ||
| Molecular function | ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, to directly drive the active transport of a substance across a membrane. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0103400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…