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LotjaGi4g1v0138200.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0138200
Transcript ID LotjaGi4g1v0138200.1
Related isoforms 5
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description DIS3-like exonuclease 2; TAIR: AT2G17510.1 ribonuclease II family protein; Swiss-Prot: sp|Q9SHL7|RP44A_ARATH Exosome complex exonuclease RRP44 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2R0N8|A0A0B2R0N8_GLYSO Exosome complex exonuclease RRP44; Found in the gene: LotjaGi4g1v0138200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:20529003..20555632) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGATATTCTTTTTTTATTTTAGGTTTATAAATTAAGAAAAAAATTCTTAATTTAAAAACCTAATTAAACATTTGCCCCCA TTCTGAGCTCCGACTCACGCCTGTCACAACTAGCAAAGCTTGCCCAACGCCGTCACTTTGCTCTCTATTATCCTGCCGCC GTCCATTCCCGCCGCCGCCAACGGTGGTTCTAAACACATACGCTTCCGCCACCGCCACCGCCACCGCCCTAGCCCCTATT CCTCCGCCACGTCGAAGCTCGCCCAGGTTTGTTCGTACGCATTAACTCACACCTCGAAATCAATGGCAAGTGCATTCATA TCTGTATTCTTAGCTTGCTATGGTGTTGAAAAAGTGTTATCTAGTTGAATCAATCACTGTTCTGTATCCATAACTTCAAA CTTGAATACACTATTTAGAAAAAATGAGAGTAACTTTTTTCTTCCAATTTGAAGGTTTGTGGAAAAATCATCATCTGAAG TAGAAAGCTAATTAGGCTGAGTTGATTCTGCTCACTGAAAAGCTTCATTTTGCACTCGATTGAATCAACAACATGCTTCA CAACAAGTCCTTTGTTAAGAAAACCAAAGGTGGCAAAGTTTTGAAGGTGCACTGTTCTATCTCTTAAACCAAACCCTAAT TCAACTACATCTTTCTTTTCACTTTATTTAATAGTTTGTTTAATTTTTTTTTTTAATGTTTGGGAGCAGCAAGTAAGGGA GCACTATTTGCGAGATGATATATACTGCGGTGCTCCGTTTTGCACGGCTTGTGATTCCTCTGGTGCTCGCCTCGGTGCTT CGGCTTCCACGATTCTTGTTCTCGACACCAATGTTGTTCTCAACCAGGTTTGGTTTTTTTTTTTGCATTGGTTTTTGATT TGGATTGGTTATCTGTGCGGCAATGAAGTAGTGTTTATTTGAGTTGGAATACATGCTGTTATCATGGCAGATTGATTTGC 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AGATGGGTTCCGTACACAGATTCAAGGCCGCTGTACACGCATTGAGGTGAGCATTGCAGAAGCAGGGTATAATTTCAGTT GCAGTCCACATTTGTTTGACCTTGGAGGCCCAGATATTGTGTTAGGCATCGAATGGTTGAAAACACTTGGTGATACCATT GTCAATTGGCAGACTCAACACATGAGTTTTTGGAGTGAACAAAAGTGGGTAAAGCTTCAGGGCTTCCGAGCAGAGCACGA GCCATATGGAGCTTTGCAGAGCCTTTTTCAATCGGCGGGGGAAAAGGGGCAGAGAGTATTGCGGGAGTTGGAACAACCAA GGATCCCAGATGACAAGATGGGGCACCTTACGAGTGAACAACAAAGGGACCTGGCACAACTATTACAGGAATTTGCACAC GTCTTTCAGGAGACAATGGGCTTACCTCCAGGAAGGGGGAGGGAGCATCAAATCCCCATTATGCAGGGACAAGGACCTGT CAATGTTCGTCCATATCGATATCCGCATGTTCAGAAAGCTGAAATTGAGAAGCAAGTGCGTGACATGCTAGCAGCAGGAA TCATACGACCAAGTACCAGTTCCTATTCAAGTCCGGTGATCTTAGTTAAGAAGAAAGATCAAACGTGGCGTATGTGTGTG GACTATCGTGCACTCAATAAGGTAACAATCCCTGATAAGTTTCCTATTCCAGTAATTGAAGAATTGTTGGATGAATTACA TGGCTCCCGATACTTCTCTAAGCTTGATCTTAAATTCGGGTACCATCAAGTGCGCATGAGGGCTGAGGACATCCACAAAA CCGCTTTCAGAACGCACGAAGGACACTACGAGTACTTGGTCATGCCATTTGGATTGATGAACGCTCCCTCAACTTTTCAA AGCCTCATGAATGACGTGTTTCGTCCAATGTTACGCAGGGGAGTGCTAGTATTTTTTGATGACATCCTCGTTTACAGCAA GGATTGGACTTCTCATCTGACACAATTAAAGCTGGTGTTGCAACAATTAGCACTGCAGAGTCTCACTGCCAATTTAAAAA AGTGCAGCTTTGGTCAGACCACAGTGGAATACCTAGGCCACCTTATCTCTGAAACAGGTGTAGCAGTGGATCCTAATAAG GTTGTGAGAGTGCAGCGGTGGCCAACACCTAGAAACGTCAAGGGAGTGCGTTGGTTTTTGGGTTTAACCGGATACTACCG CAAGTTTATCAGGAATTATGGTAAAATTGCGAAACCTCTCACTGACCTCACGAAGAAGGATGCTTTCATGTGGGGACCAG AGGCACAGGAAGCTTTCGACACCCTCAAAGTTCAGCTGACTCAAGCCCCTGTTCTTGCACTACCAGACTTTAATAAGGAG TTCCTTCTGGAATGTGACGCATCAGGGCTGGGAATTGGGGCAATCCTATTACAAGACAAGCACCCCATAGCATACTTTAG CAAAGCATTGAGTCCCCGGAATTTAACAAAATCAGCTTATGAAAAAGAGCTGATGGCAGTGGTTTTGGCAATCCAGCATT GGAGGCCATATTTGCTGGGAAGGAAGTTCATTGTGTCCACGGATCAGAAGAGCTTAAAGGAATTGTTGCACCAAACCGTG GTGACATGTGGCCAACAGAATTGGGCTGCCAAATTGCTGGGGTATAATTTTGAAATTGTGTACAAGCCCGGGAAACTAAA TAGAGGGGCAGATGCACTATCACGAGTAGAGGAAGACAAGGGGGAATTGCAGGCCATAACTACCTACCCACAGTGGGCAG AACAAACACTCATTGCAGCAGAAATTGCAGCTGATGCACAACTCACCAAGGTTATCAAAGATCTGCAGCAGGGAACAGGG GATCACCCTGGGTACAAAGTTCATCAGGGAATCTTGCTTTATCAGGATCGACTGGTTTTACCAAAGTCCTCTACACTCAT ACCCAAGATGCTGCACGAGTTCCACACCACCCCGCACGGTGGCCACTCGGGGTTTCTCCGCACTTATCGACGCTTGGCAG CCAATTTGTACTGGAAGGGAATGAAAAATGACATACAGGAATTTGTGCGCGCGTGTGACACCTGCCAACGTAACAAGTAT ATGGCAACAGCACCTGCGGGTCTCTTACAACCGTTACCAATTCCAGAAAAGGTGTGGGAAGACATTTCCCTTGACTTCAT CACAGGGCTACCAAGGTCAAAAGGATTCGAGGCTATCTTGGTGGTGGTTGATCGACTGTCAAAGTATTCACATTTCATTC CTTTGAAACACCCATATACGGCTCGAAGCATCGCTGAATTGTTTGCCAAGGAGATCGTGCGTCTACATGGTATTCCCGCC TCAATTGTGAGCGACCGCGATCCGCTGTTCATGAGCAATTTCTGGAAGGAGATTTTCCGACTGCAGGGAACACAATTGAG GATGAGCTCGGCGTATCACCCTGAGTCTGATGGACAAACGGAGGTGGTAAATCGTTGTCTGGAAACGTACTTACGGTGTT TCTCCGCCGATCAGCCAAAAGCATGGGCCACCTGGCTCCATTGGGCTGAGTACTGGTTCAACACCACGTTTCATTCAGCA ACTCAACAAACCCCTTTCGAGGTGGTCTATGGACGAAAGCCACCAGTTCTAGTACGATGGGCTCTTGGGGAAACGCGTGT GGAGGCTGTGCAAAAAGAATTAGCAGACCGAGATGAAGCATTACGCCAATTGAAGGTTCACTTGGCCAAGGCTCAAGATA GAATGCAAACCCAGGCGAATACCAAGAGGGTGGATAAATCGTTTACTATCGGGGAGTGGGTGTTTGTCAAACTCCGAGCA CGCCGACAGAATTCTGTGGTCACACGAGTGCAACCCAAGTTGGCTGCGCGCTATTATGGGCCTTATCCTATAGAAGCCAG AATTGGAGCAGTAGCTTATCGCTTGAAGCTTCCACCGGCTTCGCGGGTGCACCCTGTTTTCCATATCTCGGTGCTTAAGA AAGCAATTGGCAACTATGAAGTGGAGCCTGAATTACCTGATCACTTGGAAGGAGAGACTCAACCCGTGGTCCACCCTGAA GCAGTGTTGGCTACTCGTTTGATTTCAAAGCATGGGGTGGAGGTTCCGCAGGTGCTCATCAAATGGGAGCAGGGCAAGAC AGAGGAAGCCACATGGGAAGACGTTCTGACAATTCAAAGCCAATTTCCAGAATTTCACCTTGAGGGCAAGGATGCAGAAT CAGAAGGGGGCATTGTTAGGACTGGTTCTGCAAATGGGCCAGAGGATGCATTGATTCATTATGGACCAAGTGGGCCAAGG GTTTGGAGAGTTTATTCTAGAAGGGGTAGGAAGGGAATAGCAGGGTAGATGGTTAACAGAATGGAGAGAGAGTGAGAAAG GTTGCAACGTCATACTATAAGGAGAATAGAGAGAGGTTGAGAGGTTATCGAATCTTTTGAGCTAATTTGAGTCATGGAAA GGAAGCTGTAGCTTCCTTAGGAGCAGTGCTCTGGTCAGGATTGGAATACCATTCCTTCTCTGTAATTTTCCCTTTCACAC ATTAATAAGCCATCTACGTTGAGTCCTTTGGTGTTTTTCCTGACTGTTTACTTGTTGGGATTTAGCATCCTAACAGACAA CAATACGTGTATACGTCTCACAGACGTTTATAACTACCTATCTGGTTATGCTCTATGCCATTTCTTTTTTAAATTGAGTA CTGGATCATTGAAAGAGCATTTCGATTTAATTTTTATGATACATAAGACCATAACTTAATAGCTTCAAGCGGATCTACAA CCCATTTATTATTTACCATGTTGAATCCTGTTCATGCTTAGTTTGACCTACTAGTCTGTTCAAGTGTTGGTACTGCCTTG GTCCCCAGACCCTAGAGTGTTGGCGTCTCTCCTATCTTCTAAGATGCACAATGCAGAAAGTTCATATGCATTTCTATTGG TTATTTGTTATTCTTCCTTTATTCATATGATATCTATTCTGTCTTTAACAATGTGATTAGAATATTCTCTTCGCATAATT GCTCTTGAACTTCTTACATATGTTCAGGAAATGACACCAGAAGCAGACATTATTTCCAGCAGATACACAAAAAGTGTCAT AAAATCCTGTGCAGCACTGTCTTATGTTGAAGCACAAGCGAGGATGGATGATAGGTGGGCTTTTATTTCTCCTTGGATGC TTTATGTTGATATGAATTGACTTGTCTTTAATTTTGTAATATTATTTAAAGCTAGGACTGAAGAAAAAAAAGTAGGTAAC GTGACATATGTTTCTCTTCTGGGATTGTGGTATCCCAGCGTATATTCCTGCTACAATTGCTAGTGAAATAGCTGTACTGA CCCAATTGATTTTTGCAAAATAAACAAAAAGGTAAGACAGAGGATTGTATTCTGACAGCTATCAAACAAAAACCCACGCT AAATGACTGGGCACATGTTTATGCCAACAATTCGAACTGATTGTTGAAATATCACCTATGCTTTCTTGTTCAACTTTTTG TGTTAACATGATAATTTATTTTGTTGCCCCTAGGGGTTAGGCATCGTGTTGAAATGACTAATTGTTTCTTCTAGTCTATT AATGTATGCAATTTCTGTTTGGTGAAGATGTTTGGTCACTGTATTGTGTGTTCTCTTTGTACAGTCGATTGATGGATCCG GTAACTACAGATTTGAGGAATATGAATAGTTTAGCCAAGGTATGGATTTTTGGATGCACATTTATTATTTACTGAGATAA TTATAACTATGGTTTTATTTACATGCTCTTTAATGAAATTGTCTGAAAAGTAAATCTCTGTTTATGATCCATCAGAAAAT GAGATTAAGACGTATTGACAACGGAGCTTTGACACTTGCATCTGCTGAAGTTAAATTTCAAATTGACACAGAGACTCATG ACCCCCTTGATATTGGTATAATTTTCTTAACTCTTAATGTCATTTGGTATTTCTTTTTGAGGTCGTGGAAGATGGGATTT TTTTTGTTATTCATCATTTCACTATTGAAATGTATGTCTTTTTTTCCTTTCAATCTTGTCAAATAGCCAATTATCCCAAA AACTCAAGCTGTTGGGTACGGGTCAAATGAATGGCTTTATATCATAGTCTAACAAATCCAATCCCTAAAATTTCAGTAGT AATTTATTTGCTTTCTCTTAAGTATGTTTCCTATATTTAAATTGGGAACTTTTTTGGAGAGAGATTGAGGTTAATGATAT ACATTTTTAATTGCTTTTAGCTATTCATTCATGAAAGGAGAAGGGAAAGTCAGTTCCTCCTTTTTTTAAAAATTAATTAT TTTGTTTGCTTTTATTTGCAGGCATGTACCAAATCCGAGAAGCCAACCAAATGGTGGAGGAGTTTATGCTTGCTGCTAAT GTTTCTGTTGCACAACAAATTCTTAGAAGTTTTCCTTTGTGCTCATTATTAAGGTTATTTTCTTATCTGGAACTTTAACT TTTATCATTATAATGGTGTTTTACTAGGATGAGGGAAACAGTATTGATCATATGAAGAGTTATTTTCATAAATTTTATGT AAGGACATGAGTCTGTGAACTTTGGTAGATAGACTTAACATTAGAGAGAAGGATAAAAAATTACTCCTACTCCCAAAATA TGAGAATCTGATGTAAAATAAGCATTGAAGAGTATGACTATTGACATAACATGGACAATGCACAGACCCACCTACCATGT GCTGAAATTCAACTTTTTTTTATTAGAGGAATTGGGCGGCAAGGATCGAAATCTAGACCGCTTGGTCATAGAGGCTTTAA TACCATGTCAAGAACCAATTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAAAGGACTCCGAATGGTTTATATTATATTTCTAAC AGCTATTTTGGTAATTGTTTGTTGGATCTTGTGTAGGCGTCATCCAATTCCAACTAGAGAGATGCTTGAACCCTTTCTAA GAATTGCTACTGCGGTTGGCCTGCACTTGGATGTTTCATCATCGAAAGCATTGGCTGATTCCCTTGACCATGCTGTGGTA AATATTTTTGTATTGTTTTCCATTGACAATATAATGATTTATGGATAGTGTTATTATATATAAATAATGATGTAATGGGA TCTGTATATTGTGGACCAAAAATAATTGAGCAAATTGCTAACCTCCCCTGATGTTTATCATCATTGTACTGACCTCCCCT GTTGTTTATCATTATTGCCCTGACCTCTCCCATCTATGATTTAACCAGATACTAACTGCCATTATTTTATTGGGGACATT GCACTTACCTCTCTCGAGGTTTATCTTTATTACACTGACCTCCCTTAAGATTTATTATTAGAACAATCAACATCCCTCTA TCATTCTAAATGGTCTATAAGGAAGGGGGGTCAGTGAAATTTGTAAAATAGAGGAGAGATTAATGCAATGATGATAAACC TCAGGGGTGGTCAGTGCAATTTGCCCAAAATAATTTGGTCCATGGGTGCACCAAGGGTATAACTGGTAATGCATACACAA TTATTACACATGCTTCAAACCGCCTTCCCTCCGTGCTCTGTCCCCCCCCCCCCCCCGACCACAATGCCGTCCTCTGTTGG CCATGGACCCGTTTTGCCCTTTACCACATTTTTCCTTCTCATTCCTCAGTGGGTGCTACAGGGCTCCATGACCGCAGCTG TAACAAACGACATTGGTTTGTCAGCCAGATGTCTTCATCACCATTTGTCAGCAATAAAACCCCCTTTTCCCATGCTCACC ACACTCTTTCTTGAGTACCACCGCTAGCCATCGCGTCATCGTTTTTTTTCCCACTGCACACGATCACAAACTGCTGATCA TTCCATTGCGAGCTTCCATGGCTGTGTTTCTATATGCCTTGCCATTCATTCAAGTCACTGCAGTACAACAGATCTTGACC CCCGTGTTTTCTGGAATGCAGCGCCAACCTTAACGATGCCTACGCCTACCCACCGACTTCTACTTCGAACTGACAACAAA TATTCTGTTACCTTCGCTGCTGTCGACTTTCACCTTCGAGAAATTATTCCTGGAATCTTGATCCCAGTGTTAAAATCATG AGCCTACCTCATTAGTGTACTGGCAGACCAAATTATTTTTGGTCCACCCTTGATATAATAGCTTATGTTGCAACATCTTT AATGATTGACTTTTAATACCTTACACATTGCTAGCTCAAACATTAGGTTTTGAAGGCCTTCATTTCTTTTCAATTTCTGT TTCTCTTATGCCATGTACTTTTTCAGGGTGATGATCCATACTTCAACAAGTTAATCCGTATTATGGCAACTAGATGCATG ACTCAGGTAATTGAATTTGAATGAGAACCCAGATTTACAGTTTATAAGCGAATATTAATTTTTTGTTTTGCTTTTTAGGC AGTTTATTTCTGTAGTGGGGATCTTAGCCCTCCAGAATATCATCATTATGGACTTGCAGCTCCTTTGTACACCCATTTCA CTTCACCTATAAGAAGATATGCGGGTAGGCATGTTATGATTTAATGTTTACTTGGTCAATTGTGCACGATAATATGTTTT AGTTTTTTTTTTTTTCCTTGTAGATGTCATTGTGCACAGGCTACTTGCTGCTTCTTTAGGAATATCCAAGTTACCATCTG TATTTCAGGACAGGCTCCAGCTGACTAGTATTGCAGACAGTATGAAATCTCTTTCATGATCTATTAGAACTTGGTCTTTT TTTCTTTTCCTTATGGAAGTTTTCTCGTGGTTAACTATATTCATCATGAATAAATTAGTACATTTTTCTTCACTGGTCTT ATTCATTGGATGTGAAATATTTAAAATCATAATAACGCTTTTCACTCAATGTGGTTTAGATTTAAATTATCGGCACAGGA ATGCTCAAATGGCTGGGAGGGCCTCTATAGAGCTGCACACACTTATTTATTTCCGTAAAAGGTTTGCGACATAACTTCCC CTCCCTGTTACTGTTAATGTTTTCTATCTATATGCACTTTGCAGCTTATTCTGGAGGTTGTTTATCTTCATTCATGCAGG CCAACAGATACGGAGGCAAGGATAGTGAAAATAAGATCTAATGGATTTTTTGTGTTTGTTCCCAAGTAATGTATCTTATC CTTTTTCTTTTTCCTTTTTTAGTTTGGTTTTTCATATGACCAATGAAAAGGTGAATAAGGATGACAAACAATAAAGAAAA AAAAAAGAATGTTTTGATTTATTCTAGCTAGTAGATGGTTATCTTGGAAAAATTCAATCGTTTAAGCAGCTATTAGATGT CTTTCTACTTTGACTGAGGTTGTCATTTATAGCTTGTGCGTGAACATTTTTTTCTGCCCACAGATACGGCATAGAAGGAC CTGTATATTTGACAACACGAGCTGAAAAGGGAAATGGAGACTGGTATGTTGATGAGCAAGAGCAGAAGATTAAAAAGATG GATGGAAGCGTTTCATATAGCATTTTGCAGTCAGTCCAAATTCACATGGAGGTTGTGGAGCCCCAGCCTAACAGGCCAAA ACTTCAGCTTACTCTCATCTAGAGGTATAAGAAGAACAACATGCGTGCCGGGAAATATAGCTTCTATTTAGGTTCTCGGC CCTTAAAGAAGGATTACAACATTGGAATTTGCCAGCAAGAACAAGTTGTAGGAAGTAATGTAAACATGTAAGTTGGAGTG TGTCGTTGCTTGGAGAAACTTTGGCTGTATGTAACTCATGATTTGTGGTTGATGAGGCATTTTTAACTAATACAGCACAG CTATTGGACAGTAGGACGTGATTTTTTTTACTGCATATGATGCTATAAGCAAGTGTGTAGAGCTTAGTCAAAATGATTCG CGTTGGCTTAAATGTGTCATCAAGTATTTTAGAGAATATGGAATTTCACGATAACCCAGTTTGTTCGATATCACTATAGT TGGATTACCCCGTTTGCGTGCTATATTTTCTTTTATAATTGAGTTCAGAAATTGTGGTTGTTAATTTTGGTATAAACATT CGGTACCCGGTCACCCTTTGGATGCCGCCAGATTCGAGATTTAGTCACAGTTAAGGCTCCTCATCCATCTCCCAGAGTGT ATTGTGGTGAGAAATCGTTGTTGTTTAGATTGCACAAATTCAAATGCATATTTTGAGAATTATATGCTCTGGGATCCTAG TAGCTAAGTGTATGTTTGAGTACTTTGCCCAAGTTACAGGATATTTTTCTGAAACACTAGTAAAAAAATGGGAAAGAAGA GTGTTGCATTAATTGTTTGATATTCATTTGGGTCTCATTTTTAATGGACCTCACTTGAGTTTTTAAACATTTAATAAGAG TGTTGCAAAGAAAGTGTTGCTAGTATTTTTCAACGGAAAATATTAAGACACTTCATTATTTATATAATTG 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0138200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTTCACAACAAGTCCTTTGTTAAGAAAACCAAAGGTGGCAAAGTTTTGAAGCAAGTAAGGGAGCACTATTTGCGAGA TGATATATACTGCGGTGCTCCGTTTTGCACGGCTTGTGATTCCTCTGGTGCTCGCCTCGGTGCTTCGGCTTCCACGATTC TTGTTCTCGACACCAATGTTGTTCTCAACCAGATTGATTTGCTGGAGAATCCAGCCATTGATGATGTTGTTGTGTTGTCT ATTGTGCTGGAAGAGGTTAAGAACAAGAATATGTCTGTGTATAACCGGTTAAGAGCTATCTGTAGCAATTCCATGAGGAA ATTCTTTGTTTTTTCCAATGAATACCACAGGGATACGTATGTTAAGGAAATGAGTGGGGAGACTAAAAATGATAGGAATG ATAGAGCTATCCGGGTGGCTACTCAGTGGTATCAGAATCATCTTGGTGGTGCAGTGAAGGTTTTGCTTATAACTAATGAT AGAGAGAACAAACGGAAAGCTAGTGAAGAGGGGATTTGTGCAGAAACAGTTGAGTCATATGTCAAATCTTTGGACCGAAC CGATCTACTTGACTTACTGGTGCGGCCTACGTCTGAAGATGTAGACATGGAAGAGGTTGAAGATCTCAGACCATCCAAGA GGAAAGTAATCTATTCGGAGCATAAGCCGATGTCAGAAATTACTTCCGGTTTGCATCGTGGAATCTATCATCAAGGGAAA CTTCGTGTAAACCGTTACAATCCATTTGAAGCATATGTTGGCAGTGAGAGCATTGGTGATGAAATAATCATTTATGGGCG CTCAAATATGAATCGAGCTTTTGATGGTGATATTGTGGCAGTTGAACTTCTGCCACAGGACCAGTGGCATGAAGAAAAGT CTCTATCTATTCGCGGTGAAGAAGATGAGGATGACGACGAAGATGTTCATCTAGCTCCAAATAGTGCTGATGATGCACCG AGAACTATTCCCCAACAAGGTTCTACTGGAGGAATCAATGCAGTGTGCAATCGGCCATCTGGTGTTGTAGTGGGCATTAT AAAGAGAAACTGGCATTCGTATTGTGGATCTCTGGAGCCAATGCCTCTGCCTGCAGGGAGTGGTGGTGTTGCTTATGCCT TGTTTGTTTCCAAAGATCGTAGAATTCCCAAAATTCGACTCCAAACCCGCCAACTTGAAAACCTGTTGGATAAGAGGATT ATTGTGGCAGTTGATTCTTGGGATCGCCAATCTCGTTATCCATCAGGCCATTATGTGCGAACTATAGGAGATATCGGTGA TAGAGATACTGAGAGCGAGGTGGTATTGATAGAAAATGATATCAACACAAGACCGTTCTCTTCACAAGTGCTAGCATGCT TGCCACCATTGCCATGGTCTGTCTCTTCTGAGGATTTCTCCAAACCAATTAGGCAGGATTTGCGTCATCTACGTGTCTTC AGTGTGGACCCTCCAGGCTGCACGGATATTGATGATGCACTCCACTGTTATGCTCTTCCAAATGGAAACTTTGAAGTTGG AGTTCATATTGCTGATGTGACAAATTTTGTACATCCTGGAACTCCTCTTGATGATGAAGCTTCTCAGAGGGGAACATCGG TCTACCTTGTTGAGCGACGGATAGACATGCTTCCGAAACCTCTTACAGAGGACATATGTTCTCTTCGGTCTGATGTGGAA AGGCTAGCATTCTCTGTCATATGGGAAATGACACCAGAAGCAGACATTATTTCCAGCAGATACACAAAAAGTGTCATAAA ATCCTGTGCAGCACTGTCTTATGTTGAAGCACAAGCGAGGATGGATGATAGTCGATTGATGGATCCGGTAACTACAGATT TGAGGAATATGAATAGTTTAGCCAAGAAAATGAGATTAAGACGTATTGACAACGGAGCTTTGACACTTGCATCTGCTGAA GTTAAATTTCAAATTGACACAGAGACTCATGACCCCCTTGATATTGGCATGTACCAAATCCGAGAAGCCAACCAAATGGT GGAGGAGTTTATGCTTGCTGCTAATGTTTCTGTTGCACAACAAATTCTTAGAAGTTTTCCTTTGTGCTCATTATTAAGGC GTCATCCAATTCCAACTAGAGAGATGCTTGAACCCTTTCTAAGAATTGCTACTGCGGTTGGCCTGCACTTGGATGTTTCA TCATCGAAAGCATTGGCTGATTCCCTTGACCATGCTGTGGGTGATGATCCATACTTCAACAAGTTAATCCGTATTATGGC AACTAGATGCATGACTCAGGCAGTTTATTTCTGTAGTGGGGATCTTAGCCCTCCAGAATATCATCATTATGGACTTGCAG CTCCTTTGTACACCCATTTCACTTCACCTATAAGAAGATATGCGGATGTCATTGTGCACAGGCTACTTGCTGCTTCTTTA GGAATATCCAAGTTACCATCTGTATTTCAGGACAGGCTCCAGCTGACTAGTATTGCAGACAATTTAAATTATCGGCACAG GAATGCTCAAATGGCTGGGAGGGCCTCTATAGAGCTGCACACACTTATTTATTTCCGTAAAAGGCCAACAGATACGGAGG CAAGGATAGTGAAAATAAGATCTAATGGATTTTTTGTGTTTGTTCCCAAATACGGCATAGAAGGACCTGTATATTTGACA ACACGAGCTGAAAAGGGAAATGGAGACTGGTATGTTGATGAGCAAGAGCAGAAGATTAAAAAGATGGATGGAAGCGTTTC ATATAGCATTTTGCAGTCAGTCCAAATTCACATGGAGGTTGTGGAGCCCCAGCCTAACAGGCCAAAACTTCAGCTTACTC TCATCTAG 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0138200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLHNKSFVKKTKGGKVLKQVREHYLRDDIYCGAPFCTACDSSGARLGASASTILVLDTNVVLNQIDLLENPAIDDVVVLS IVLEEVKNKNMSVYNRLRAICSNSMRKFFVFSNEYHRDTYVKEMSGETKNDRNDRAIRVATQWYQNHLGGAVKVLLITND RENKRKASEEGICAETVESYVKSLDRTDLLDLLVRPTSEDVDMEEVEDLRPSKRKVIYSEHKPMSEITSGLHRGIYHQGK LRVNRYNPFEAYVGSESIGDEIIIYGRSNMNRAFDGDIVAVELLPQDQWHEEKSLSIRGEEDEDDDEDVHLAPNSADDAP RTIPQQGSTGGINAVCNRPSGVVVGIIKRNWHSYCGSLEPMPLPAGSGGVAYALFVSKDRRIPKIRLQTRQLENLLDKRI IVAVDSWDRQSRYPSGHYVRTIGDIGDRDTESEVVLIENDINTRPFSSQVLACLPPLPWSVSSEDFSKPIRQDLRHLRVF SVDPPGCTDIDDALHCYALPNGNFEVGVHIADVTNFVHPGTPLDDEASQRGTSVYLVERRIDMLPKPLTEDICSLRSDVE RLAFSVIWEMTPEADIISSRYTKSVIKSCAALSYVEAQARMDDSRLMDPVTTDLRNMNSLAKKMRLRRIDNGALTLASAE VKFQIDTETHDPLDIGMYQIREANQMVEEFMLAANVSVAQQILRSFPLCSLLRRHPIPTREMLEPFLRIATAVGLHLDVS SSKALADSLDHAVGDDPYFNKLIRIMATRCMTQAVYFCSGDLSPPEYHHYGLAAPLYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAASL GISKLPSVFQDRLQLTSIADNLNYRHRNAQMAGRASIELHTLIYFRKRPTDTEARIVKIRSNGFFVFVPKYGIEGPVYLT TRAEKGNGDWYVDEQEQKIKKMDGSVSYSILQSVQIHMEVVEPQPNRPKLQLTLI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 6 934 929 0.0
PANTHER 6 934 929 0.0
CDD 9 180 172 5.1244E-85
Gene3D 9 192 184 1.7E-68
SMART 52 165 114 2.9E-20
SUPERFAMILY 53 186 134 3.73E-13
Pfam 54 177 124 5.1E-15
Gene3D 206 314 109 9.3E-31
SUPERFAMILY 215 423 209 8.57E-42
Pfam 219 310 92 1.6E-13
MobiDBLite 296 331 36 -
Gene3D 351 426 76 2.3E-28
Pfam 372 440 69 2.5E-18
SUPERFAMILY 429 847 419 4.45E-130
SMART 471 802 332 9.7E-138
Pfam 471 800 330 1.6E-95
ProSitePatterns 769 793 25 -
SUPERFAMILY 851 931 81 3.94E-12
Pfam 851 921 71 2.5E-8
Gene3D 851 935 85 1.3E-7

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function RNA binding Interacting selectively and non-covalently with an RNA molecule or a portion thereof.
Molecular function Ribonuclease activity Catalysis of the hydrolysis of phosphodiester bonds in chains of RNA.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0138200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…