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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0104700 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0104700.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase-like protein; TAIR: AT1G06840.1 Leucine-rich repeat protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|C0LGD7|Y1684_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RLC2|A0A151RLC2_CAJCA Putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase family; Found in the gene: LotjaGi1g1v0104700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:16127516..16139967) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGAAATTTTTGAACTGGTCATAGACTCATAGCCCACGTGTTGTTACTTGTTCTCTTAGCCAATTACTTGTTCTCTTATAA TATATGCTTGGCAACATCATATAACCTTTCTAGTGTTTTGACTTTTCTTGTGTTCTTCCATCAAGTGGGGATTCTTTAAT TTTTTCCCTTACTATCAAAATCTTCAGGTTTATAATATTTCAGTTTTCTGAAAAAAAAATTCAAAATCTTCAGGTTAGAA TATAGAAATTAAGGGTATATATATCTTTGCTATTCTTGTATACAGTTTGATTATGCAGGACATTTTAGCTAGCTAGCACT TGCGTGGACTTGCTTTTGAAAGGGGTATTCCATTTTGATTGCTGCTAGGCTTTAATTTGGAGTTAGAAGCATAGCATAAG TTCAGGAGAGATATTTAATTAAGATGTCAGGTCGTTTCTGCTTTGGGATCATGTATCTTCCAAAGAGCTGCACATCATGT GAAGTTGTTCTCTGCCTTTTGTTATGCTGTTATTTCCTGTTAGTTGCTGCTCAGACTCAGACTGATCCCACCGAAGGTAT TTCTCTCTGCGACATATATTTTCAGTCACTCATCATTTAGACATATCACTTTGTGAAGTCTAGTGTTTTATACAAAACCT TCAAGTAGTATAGTGTAATTTACTTATAAATTAATTTCTCAATTATAACATGTACTTAACTATTTTTATGCATTAATTGT AATAATCCAAGCCGTGATCTACAAACCACTTAATTGGGTTGGTCCTTTAACTAGAAGGGGGCATATGATGTGTAATAATA TTTTCATAAGTTATGATGATTTCATTCACATTCACAATGACATGCATGCAGTTGACGCATTGAGAACCATAAAGGAAGGT TTGATTGATATCAATGGAAATTTGAGCAGCTGGAATCATGGAGACCCATGTACATCGAACTGGGCAGGGGTTTGGTGCTC 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TCGACAAAAAAAAATGTAGTCTATGTGGGATTTTAACAAGATTTGCTACCTAAATGTTGTCACTATTGCCTTGGTTCTAC CAGGAGCCTTAGAAAATGCAATTTGAAAGGACCAATTCCTAATTTAAGCAGGATACCACACCTTGGCTATCTGTAAGTTC AATTACCTTATGTCTTATTAACTTAATTTTTGTATTGATTTATTAGATTGCTTATCAAGATAAGTGGTTGCACCTAAGAA ATTGTTGTTGCATACCTACACTATTGAAGTATAGTCTAAGATTGCTTGTAACTTTTTTTACTGACTATTATTTCTATATA TTCCAGCGACCTCAGTTTCAATGAATTGAATGAATCAATTCCTACCGATAAGCTTTCTGAAAATATCACAACAATGTAAG AACCTTTAATTTATTTTTCAGATATGATTTATTGGTGTTGCATGCATTCAAATATTAAAATTTCCTATGTGGATATTTTC CTTTGCTCAAAATATAATAATTTTGATGGAATTCGTAAAATTTTATCATTTAACCTTTGGAATGTTCACAGAGATTTATC AAACAACAAGCTTACTGGAAAGATTCCATCAAACTTTTCTAGTCTTCCTCTTCTTCAAAAGCTGTGAGTTGTCTTTTATT TCATGTTTTCTTCTTCTTTGTGAAGTTGTACTTATTAAGTTTAATAAATGTCAAACACCTTGTTTTTCTTACTTAATGTT TTATTATTTCTTTATTTTACAAATCATGACAGGTCGATTGCAAATAATTCATTGAGCGGCAATGTTCCTTCAAACATTTG GCAAAACAAGACTTTAAATGGAACAGAAGTACTTCACTTGTAAGACAAAAAATGATACTCACATAATTTGTCTCATGTGG ACTTTAAACGTATCATATTTTCATATGGTTGCTGAACAAGGTGCATTAAATGATAGTATGTGTCACACTCTGCAAATGGT CAATTTATTCTTTTAATCATCTTGTATTCTATGTGTTTTATTATACCTATTTTTGTATTTCCTTATGAATATATGCTGTA ATAGAATTCTGTTTTGATTTACTTAGTTTGAGTTTATAATTTTGCAGGGACATGGAAAATAATCAATTTACAAGCATATC AAGTACAAATCTTCCTCCAAATGTCACACTCTTGTATGCTCCTAAACTCATTTTGTTGTTTACATTGCAATCATGGTTGT CGGATTAGAGAGTTCCACCTTTTTCTCTATGTTATTATGCTTATGACATAGATCAAAACTTGTTCATCATTGCCTTCAAC ATAAGTTTCTCTTTTATGGATAACTTGTAACATTATCTTTTGAAAATAACCATTTTCAGGCTTAAGGGAAATCCTTTATG CTCAAACAACAACACCTTAGTTGAGTTTTGTGGATCTGGAAATGACAATAACATTAATGGTAACTTCAATGTTGTCTGTC CCAGCCAACCATGTCCTCCTCCTTATGAATACAATGCAGAGTGTGTTTGTGCAGTCCCATTGCTTGTTGAATATCGATTG AAAAGTCCAGGGTTTTCAGATTTTCGTACATATGTGGAACCATTCAAGAGCTTATTGACAGATAGTCTTAATATACAAAA TGACCAGTTGTACATCCATAGTTTCACATGGGAAAAAGGGCCTCGATTGAGAATACACTTGAAGCTCTTTCCTGCAAATG ATGCTGGTAATGGAAGCTCTTATCTTTTTAATACAAGTGAGGTCATTCGGATCAGAAACATGTTCAGAGAATGGAGAATG CATGAGAGTGACCTTTTTGGGCCTTATGAACTTCTAGAGTTCATCCTCTTGGATCCTTACAATGATGGTAAGTCCCACAA ACATACAATATGCTAGAATGTTTGGTTAAAGTTACAAAGTGTTAAGGATATATCATGAGCTAGCTTAGCTTTTGGGATAA 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TTTTTCTTAGTTTTTTCTTTCCAATTTAAAGTGAAAAGAAACTTTCTATATTAACTCTTTTGAATGTATACTTGATGTTT TATGACAGCTTATTCAAAAGAACCTCTTAGTTTTGCACTGAGATTGAAGATTGCTTTAGGGTCAGCTAAAGGTCTTGTTT ATCTACACACAGAAGCTGATCCTCCAATATTCCACAGAGATGTGAAGGCCACCAATATATTATTGAATTCTAAATTCATA GCTAAAGTTGCTGATTTTGGACTTTCAAGACTTGCCCCAGTTCCAGATATTGAAGGCAATTTGCCTAGCCATGTATCTAC AGTGGTAAAAGGGACCCCGGTAAGGCTTTGCTAAATGGATTTATAGTTTAAGCTTATTTTTTCTCGAAATTATTTTACTC AATTGTACAAGGATTTTCAAACATGCTATTAATTTTGAAAACTGAGCATGTTTGCACTAAGGATAAGATCTGAAAAAATG CATTACACTTCTTATTTCAAATATATAAACAATTTAATGGAACTTAATATTTTATGATGACAAAGTTCATTTGCCTATTC AATTATTAGATCTCTTTATGGTTTGTTCACTATTTTGATAAAACAGGGCTACCTTGATCCAGAGTACTTCTTAACTCATA AGTTGACCGATAAGAGTGATGTTTATAGTCTTGGTGTTGTATTTTTGGAACTTATGACTGGGAGGCAACCAATCATCCAT GGTGAAAATATTATTAGACAGGTAAGTATTGGTTTCTCTTCCTAAAAATGTTAGTGATACTTCACCATTCTCTAAGATAT GAATACAATACATTGCTTGACACTTTTTTAGGTTAACATGGCACACCAATCTGGTCGAATATTTGCAGTCATTGATGAAC GTATGGGATCATATCCTATTGAGTATGTGGAGAAGTTTTTTATGTTGGCCTTAAATTGTTGCAAAGATGCCCCAAATGAT CGACCTAACATGGTAGAAGTGGTTAGAGAGCTCGAAAAAATTTGGTGTATGATGCCTGAGTCTAATGGGAAGGAAGTTGA ATACCCTACAAGTGATTTCGAAACAATATGCAGTTCACAACCTTCATCTTCTGTAAAGTACTCTTCTTTCATTTCAGATG TATCAGGTAGTGACCTTGTTAGCGGAGCTATACCAATCAACAAACCAAGATAAAAGTTGAAGATTAGACTTAGCAGACAT ATTTGATCTAATATGAGAATGCTAGTGCCTGCAGTTAAATTGAATAATGAATTAGTATTGGTAATTTTCATTTGTTTTTA TGATTGATTCTTTTTATACTACCTGTTGTAGTTAAATGGCAGAGCATTGACTTATAATACATCGATTTTGTACATCATCG CAATGTAGATTTCTTTTTCATTTCTTTCTGAGAAGATTAAGTTTTCTTAGCTGGTTTGACTTCATTGTGAATGCTACTTT CTAGCAGGGAATCTTGAGAATTCTCTGATTCATTAGTTCCATGCATGATGGCATGTTTTGGCTTCTTTGCCTTGTGTGAT TCTTCTGATTCATTAAGTCTTTTGGCTGCACATGTTTTTCCTTCTCCCTTCAAAGTATTCTGATTCGCTGATTCCTTAGT TTCATGTACAATGGCCTGTTTCGGTTTCTTTGACTTGTTTGATTCTGATTTGGCATTACTTTACTTGCAGCTTTTTTCCC TTTTGTTGCTTTAGTTGCTCTCGTTGCTCCTTCTTCTTCCAAAGTATCCTCCTCTTTATCTTCAACTGATTGTGGAAATG CTCTACAAATATAAATCTAGAGTAAAACCATGTTAGATTCAATGTTATTGCTAATATATTGTCCATAAAAACACATGGAA CTTATTAGAAAACCACCCATTAACAATATCATCCTAGTTCTTCTATCAACCTAAAGTTGAGCGTGATTGGAGATCTTTTG AGCAGGCAAGTTAATTAAATTAACATGATTGTGAAACTAACATGTTTTTTCAAATTATAATATAGATTTATTCAAAGAAA TGTGTAGACTCAAGCATAAAACACTGCAAGATACGGTAAACATTAAGTATAACCAAACTCTTAACCACCTGACATGATGT GATTGTTCCCATTCTACTTGATAATATTGATGGAAGCAATAAGTGGTTAATTGATTTTGTCTTTGTTGATTTCGCCTAGT GTATGTTTGAGAGGCTTTGGTCTAAACTACTTTAGTTTGGCTAGTGTGATCCTTCTTATTCATCTACGTACGTACTGCCC CACTACAGTATTCATTAACATCCTTGTTTATGTTGATGTCAAAATAGTAATAGGGAGCTCATCATCTCTAGTTCCATCAA GTCATTTAACAATGGAGTCCTGTCATTTTCCTCAAGCAATTTGGCACCCTTGACTACTTCCTCTGAATTGAAGTCAAAAA CTTCTCTAATGGTCACTTCTCCTAATTCAAAGCAAATATATTGGATCTTCTCTCTGCAAGACACATATGGGACTACAGGC CCCTCTCCTCGCCTATGGTCACTAATCCTAAGCTCACTAAATCTGTTGGCTCTCCATTTATTGATCCATCTATACAGATG TATTGTTAGTGCTTTACAATACTTCACTATTTCCATACTAGAGCTTAGTAACTCTAGGGGTCCCAATCGTTGAATGAAAT GATATGCTAATAATGCAGGGGTGCCTAATCCACCTGAAGCAACAATTTGAAGCCACCTCAACCAACACTTGGACATGAAA GGAAAGAAGGAAGGGAAATTACAGTTGGCCATGGAAGCAATTGAATCATTAGTACCAAATGATATATAGATTGTAAATCT TGGGTGGAGATGGTCTGTCTCTGTGACTCTCACTCATTGCATTGCTGACAAC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0104700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCAGGTCGTTTCTGCTTTGGGATCATGTATCTTCCAAAGAGCTGCACATCATGTGAAGTTGTTCTCTGCCTTTTGTT ATGCTGTTATTTCCTGTTAGTTGCTGCTCAGACTCAGACTGATCCCACCGAAGTTGACGCATTGAGAACCATAAAGGAAG GTTTGATTGATATCAATGGAAATTTGAGCAGCTGGAATCATGGAGACCCATGTACATCGAACTGGGCAGGGGTTTGGTGC TCCAATACAACATTATCTGATGGCTATCTACATGTTCAAAAATTGCAACTATCGAATATGAATTTATCCGGAACTTTGGC ACCAGATATTGGTAGCTTATCTCGTCTCGAAATATTGAGCTTTATGTGGAACAATGTAAGTGGGAGTATACCCAAGGAAA TTGGCAATATCAAAACTTTAAAACTCTTGCTCTTGAATGGAAACAAATTGACAGGTCAGTTGCCAGAAGAGCTTGGATAT CTTCCAGCCCTGGACCGAATACAAATCGATCAAAATAATATCACAGGATCTATACCTTTATCATTTGCAAACTTGACCAA CTCACAACACTTTCACATGAATAACAATTCACTTAGTGGGCAAATCCCACCACAACTTTCTCGCTTAGGAAGCCTTCTTC ACCTTCTTCTTGACAATAACAATTTTACAGGATATCTCCCCTCTGAGCTCTCTGAGATGCCGAGCTTAAAAATACTCCAA CTTGATAACAATAACTTTGGTGGAAATGGAATTCCAGATTCTTATGGGAACATGTCAAAATTATTAAAACTGAGCCTTAG AAAATGCAATTTGAAAGGACCAATTCCTAATTTAAGCAGGATACCACACCTTGGCTATCTCGACCTCAGTTTCAATGAAT TGAATGAATCAATTCCTACCGATAAGCTTTCTGAAAATATCACAACAATAGATTTATCAAACAACAAGCTTACTGGAAAG ATTCCATCAAACTTTTCTAGTCTTCCTCTTCTTCAAAAGCTGTCGATTGCAAATAATTCATTGAGCGGCAATGTTCCTTC AAACATTTGGCAAAACAAGACTTTAAATGGAACAGAAGTACTTCACTTGGACATGGAAAATAATCAATTTACAAGCATAT CAAGTACAAATCTTCCTCCAAATGTCACACTCTTGCTTAAGGGAAATCCTTTATGCTCAAACAACAACACCTTAGTTGAG TTTTGTGGATCTGGAAATGACAATAACATTAATGGTAACTTCAATGTTGTCTGTCCCAGCCAACCATGTCCTCCTCCTTA TGAATACAATGCAGAGTGTGTTTGTGCAGTCCCATTGCTTGTTGAATATCGATTGAAAAGTCCAGGGTTTTCAGATTTTC GTACATATGTGGAACCATTCAAGAGCTTATTGACAGATAGTCTTAATATACAAAATGACCAGTTGTACATCCATAGTTTC ACATGGGAAAAAGGGCCTCGATTGAGAATACACTTGAAGCTCTTTCCTGCAAATGATGCTGGTAATGGAAGCTCTTATCT TTTTAATACAAGTGAGGTCATTCGGATCAGAAACATGTTCAGAGAATGGAGAATGCATGAGAGTGACCTTTTTGGGCCTT ATGAACTTCTAGAGTTCATCCTCTTGGATCCTTACAATGATGTGACTACCACATCATCAAGTTCTGGTATAAGCAAAGGT GCACTAGCTGGAATAGTCTTGGGTGCAATTGCTTGTTCAGTTATAGTATCCTCAATTGTTACCATTCTGATATTAAGAAT ACGCTTGAAAGACAATAACACATTTTCCAGAAGGCGTAATGCATCAAGGATTTCAATACAAATTAATGGTGTAAGATCAT TCACTTATAAAGAGATGGCCTTGGCTACCAACACTTTCAGCAAAACTAATGAAATTGGAGAAGGAGGATATGGGAAAGTT TATAAAGGTGTTCTTCATGATGGAATTGTGGTTGCCATAAAACGAGCACAAGAAGGTTCATTACAAGGTGAAAGGGAGTT CCTTACGGAAATAAAAATCCTATCAAGGCTACATCATCGGAACCTTGTGTCCTTGATTGGATACTGTGATGAAAATGGTG AACAGATGCTAGTATATGAATTTATGCCAAATGGAACTTTAAGGGATCACCTTTCTGCTTATTCAAAAGAACCTCTTAGT TTTGCACTGAGATTGAAGATTGCTTTAGGGTCAGCTAAAGGTCTTGTTTATCTACACACAGAAGCTGATCCTCCAATATT CCACAGAGATGTGAAGGCCACCAATATATTATTGAATTCTAAATTCATAGCTAAAGTTGCTGATTTTGGACTTTCAAGAC TTGCCCCAGTTCCAGATATTGAAGGCAATTTGCCTAGCCATGTATCTACAGTGGTAAAAGGGACCCCGGGCTACCTTGAT CCAGAGTACTTCTTAACTCATAAGTTGACCGATAAGAGTGATGTTTATAGTCTTGGTGTTGTATTTTTGGAACTTATGAC TGGGAGGCAACCAATCATCCATGGTGAAAATATTATTAGACAGGTTAACATGGCACACCAATCTGGTCGAATATTTGCAG TCATTGATGAACGTATGGGATCATATCCTATTGAGTATGTGGAGAAGTTTTTTATGTTGGCCTTAAATTGTTGCAAAGAT GCCCCAAATGATCGACCTAACATGGTAGAAGTGGTTAGAGAGCTCGAAAAAATTTGGTGTATGATGCCTGAGTCTAATGG GAAGGAAGTTGAATACCCTACAAGTGATTTCGAAACAATATGCAGTTCACAACCTTCATCTTCTGTAAAGTACTCTTCTT TCATTTCAGATGTATCAGGTAGTGACCTTGTTAGCGGAGCTATACCAATCAACAAACCAAGATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0104700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSGRFCFGIMYLPKSCTSCEVVLCLLLCCYFLLVAAQTQTDPTEVDALRTIKEGLIDINGNLSSWNHGDPCTSNWAGVWC SNTTLSDGYLHVQKLQLSNMNLSGTLAPDIGSLSRLEILSFMWNNVSGSIPKEIGNIKTLKLLLLNGNKLTGQLPEELGY LPALDRIQIDQNNITGSIPLSFANLTNSQHFHMNNNSLSGQIPPQLSRLGSLLHLLLDNNNFTGYLPSELSEMPSLKILQ LDNNNFGGNGIPDSYGNMSKLLKLSLRKCNLKGPIPNLSRIPHLGYLDLSFNELNESIPTDKLSENITTIDLSNNKLTGK IPSNFSSLPLLQKLSIANNSLSGNVPSNIWQNKTLNGTEVLHLDMENNQFTSISSTNLPPNVTLLLKGNPLCSNNNTLVE FCGSGNDNNINGNFNVVCPSQPCPPPYEYNAECVCAVPLLVEYRLKSPGFSDFRTYVEPFKSLLTDSLNIQNDQLYIHSF TWEKGPRLRIHLKLFPANDAGNGSSYLFNTSEVIRIRNMFREWRMHESDLFGPYELLEFILLDPYNDVTTTSSSSGISKG ALAGIVLGAIACSVIVSSIVTILILRIRLKDNNTFSRRRNASRISIQINGVRSFTYKEMALATNTFSKTNEIGEGGYGKV YKGVLHDGIVVAIKRAQEGSLQGEREFLTEIKILSRLHHRNLVSLIGYCDENGEQMLVYEFMPNGTLRDHLSAYSKEPLS FALRLKIALGSAKGLVYLHTEADPPIFHRDVKATNILLNSKFIAKVADFGLSRLAPVPDIEGNLPSHVSTVVKGTPGYLD PEYFLTHKLTDKSDVYSLGVVFLELMTGRQPIIHGENIIRQVNMAHQSGRIFAVIDERMGSYPIEYVEKFFMLALNCCKD APNDRPNMVEVVRELEKIWCMMPESNGKEVEYPTSDFETICSSQPSSSVKYSSFISDVSGSDLVSGAIPINKPR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 36 | 36 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 35 | 35 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 36 | 36 | - | – | |
| Phobius | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| Phobius | 21 | 32 | 12 | - | – | |
| PANTHER | 27 | 935 | 909 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 27 | 935 | 909 | 0.0 | – | |
| Phobius | 33 | 36 | 4 | - | – | |
| Phobius | 37 | 560 | 524 | - | – | |
| Gene3D | 42 | 196 | 155 | 3.7E-38 | ||
| Pfam | 42 | 81 | 40 | 3.1E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 56 | 399 | 344 | 9.69E-50 | – | |
| Gene3D | 197 | 303 | 107 | 4.2E-25 | ||
| Gene3D | 304 | 386 | 83 | 1.8E-11 | ||
| Phobius | 561 | 589 | 29 | - | – | |
| TMHMM | 565 | 587 | 23 | - | – | |
| Phobius | 590 | 954 | 365 | - | – | |
| Gene3D | 596 | 701 | 106 | 2.8E-36 | – | |
| SUPERFAMILY | 611 | 929 | 319 | 1.2E-79 | ||
| SMART | 626 | 900 | 275 | 1.2E-39 | ||
| ProSiteProfiles | 626 | 898 | 273 | 38.393 | ||
| Pfam | 629 | 895 | 267 | 1.1E-46 | ||
| ProSitePatterns | 632 | 654 | 23 | - | ||
| CDD | 632 | 898 | 267 | 1.13539E-96 | – | |
| Gene3D | 702 | 912 | 211 | 1.2E-55 | – | |
| ProSitePatterns | 746 | 758 | 13 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0104700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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