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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0111300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0111300.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | E3 ubiquitin-protein ligase listerin-like protein; TAIR: AT5G58410.2 HEAT/U-box domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9FGI1|LTN1_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase listerin; TrEMBL-Plants: tr|K7KAA3|K7KAA3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0111300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:17354419..17378475) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAGTGATTCTGTGTGTTAAGTAAGATTTACAACCAAAATATATATTCGCAGCAAGAAGGAAGGCAGGTGACAAAGTCACG CGCAGACACAACACCGCCTCTGCCACCGCCTCCGCCCGAGTTTCCCGTTCCGACGCCGCATAAGAGAAAGAGGAAGAAGA AACAAACAGCGGAATGGGGAAACAGAAAGGAGAAGGTGCAAGAAGCAAGTCACGCCCTTCAAGCAGCAGGTACCTACACC ACTCTTTTCTCTTCTCTTCTCACCAATCCCTAAATTCAAAACCATCAACATCATCAATCATCTCATCGTTTTTTCTTCCT TATTGCAGTCTCGCCGCGTCGCTATTGCCTTCCAGTTCCGCCGCCGCCGTCGGATTCGGTGGTTTTGTTGGTAGCTCGCG CCTCGATCCTTCTTCTCTTTCAACCGATGATTCTCTCCCTTTTGCTGTATGTATTCCCAATTTGTTGTCTTTTTTTTATT TATTTATTGTAAAATTCTACTCTTTTTGCTTAATTTGTTTACGGAATTCGTGAATTTAATTTTAATTAGGTTCGGTTTTC TGTTCATAATTAACATGCTAGAATAGTGAGCTGGAATTAACCATGTGTTCATGTGTTTCTTTCTTTCTCTGGGGTTGTAT GCCAAGAAACTTTGTTTAGGGCTTTGAATTGAGTTTTTAGAGCTGACTACAATTTTAATATTACTTCAGATAAGGGTTTT CGTGCTTTGAATTGAGTTATAAGAGCTGATTTTAATGTTCATGACTTAATGTGACATTCTGATAAGTGTTTTCTTGCTTT AAATTTAGTCATTAGAGCTGGTTGGAATGTCAAGATTACTTTTTTTTAATCAGTGTTTTCAGCTTTAAATTGAGTTATTA GAGCTCAGCTGACTAAAATGTTAATATTACTTTCATATAAGTGTTTCCGTGCTTTGAATTGAGTTATAACTTATAAGAGC 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GAAAATTGAGAAAATTGTTTTGATTTCAGATCCTTTTCCCATAAAGATTTCTGAAAATGCCCTTTTGTCCTTTTCACTTT TTCTTAAGCATTGTAAACTTCAAAAAAGTGAAGAAAGCGATAATTTAAATACATTGAAAACAGAAAAGTTGGATTCTATT AAAGATCGGATTGTAGAGGGGATCCTTCGTTTACTATTTTGTACTGGCATTTCTGAGGCTATTGCAAATGCATTCTGCAA AGAAGCTGCATCAGTTATTGCATTGTCACGGGTTGAGTATACATATTTTTGGGAATTGGTAGCTTCTGGTGTTGTTGATT CCTCGTCACAGGCTAGAGATAGAGCAGTGAAATCAGTTGAATTCTGGGGACTAAGCAAAGGATCTATTAGCTCATTGTAT GCTATACTTTTTACTTCCAAGCCAATTCCTTTGTTGCAGTTTGCTGCATATTTTGTTCTTTCAAGTGAGCCTGTTTTGAG TATGGCTGTTATTGAAGATAATGCTTGCAACTCAGACATCAATGCTGCTAGTGACCAGGATCTCAGCCGTTTTGACATGT CTATAGAAGATAAAGTCCATTTGAGAGAGGAAATATCTTGCATTGTTGAAAGGGCACCTTATGAGGTTCTTGAACTGGAC TTACTTGCACATCAACGAGTAAGGATTCTTTATATGGGAGCAAAGTTGAATTATCTTTATATATCAAGCGTTTTTTATGT TTATTTACTTTGTCTCTATTTTGGGGTTTTAAGGTCTAAAAAAAATATTGCAGGTAAATCTCTTCCTTGCCTGGTCTCTG TTGATATCACATTTATGGTCATTACCTTCATCATCATCTCTGAGGGAGAGACTGATCCAGTACTTACAAGATTCTGCTAC TCCAATTATTTTAGATTGCCTTTTTCAGCATATTCCTGTAGAGATTTCCATGATTCAGAGTCTGAAGAAGAAAGATGCAG AACTTCCTGGCGGCTTATCAGAAGCTGCAAGTGCTGCTACCCGTGCCACCACTTCTGGTTCACTCTTGTTTTCTGTGGAA TCTCTTTGGCCTCTTGAATTGGAGAAAATGTCATCATTTGCTGGGGGAATATATGGCCTGATGCTTCATGTTCTTCCAGC TTATGTTCGTGGCTGGTTCAGTGACTTGCGTGATCGTAACGCATCAGCTGTCATTGAATCCTTTACAAAGACTTACTGCA GCCCTCCTCTCATTGCAAATGAATTATCCCAGGTATTGTTAGGATTAATTATATTAGGATTTAATTTATGTTAATTTAGG AATCTATCTTTATAGTATCTTTTATATTAGGATGTTATCTCTTATTCTAGTAGTATATCTTCTGTATTTTTTAGGGATTA AGTTATTGATATTAGGATTAGTTATTATAAATAAGAGTGCCCTCCTTAGGTTTGAGTTATGGATTAAATTATTGAGTTGT AAAGGGAACCAGCCTCTTGGTTCTGAAGAGGACCCAGCCTCTTAGTTCCTGTTTATCCTTTTTATTTTAATATCAGTCTT ATATTCAGAAAAATACCAAAAATATTCCCTTTTGTCCTATTTCATCTATCGTTTCTCCACGTTAGGATTTTCGGATCCTA ACAATTGGTCCGATCTGCCGGATCGAAATTCCGCCAGCCACCATTACCCTTCCTCTTGCCTTTACCACACCCGCCGCTGA AAACCCAAACAAACAAAAAAAACCCTTGTTATCCGTGGCACTGTTCATTCCGCGAGTATTGTTCATCGCGCACTGTTCAC ATCTGCATACTTTTCGCTGTTCTGGCCGTTTCTTGCTGTTTTTTTTCCATCATGGAGGAATGGCAGTCTATTGTGCAAAA GTTTCCAAAGTTTGACGGGGTGGATCCACTATCTTGGATTGCTCGGGCCGAGAAAATCTGAGGTTCACAATTTGCAAGAG CAAGCCAAGGTGCAATTGGCTTTCCTTAGCATGGACGGGGAGAAGGCCACTAATTGGTTTTATTGTTGCTGTTATCAAGA TCTCGGTCTCACTTGGAATCGCTTCATCTCCCTCTTGCTTCAACGTTTTGGTTACGGGTATCGTGTTAACGTTTACAAGA GGCTGAACACTCTCCGACAAAGCAGTAATGTTGACGCTTATGTGCGGGAATTTGAAGCTGTGGTGGCCCATGTTCCTTAT CTTTCTGAAGAGCGGTTGTTGGAGTGTTTTCGGTGGGGCCTCAAACTGATGGTTCGTCATAGGTTGCGTTCTTTCCGTCC TACAACTTTGTTGCGTGCCATGGAGATTGGTCAGGAAATTGATGCAGAATTTTGCCTGCTAAAGAACAACCACCGGCTGA TGCAGTTTCTTTTCCTCCTCCTTCTCACATCGAAGGGGAAACCGTTGCTAGTATTTCGGTGGAAGCAGAAAACGAACTCA AGGACTCAAGCTAAGATGTACTCAAGGAGGAATCAAGCAATCAACATGTTGCGCTTACTTCTGAAATTTATAATGAGTCC AAGCAAGACACTGCTTTGCCAATGGAAGGTCTCACAGTCGATGCTGCCGTTATTCCCCACATCTCTAGTATTAAGTCTTT TGGAAGCACAATCTCTATAGAAGATGCTCCGATGTCAATGAATGTGGACGCGCTTCAGAATGAAAAGTTTTTCAAAGTAG GGGCTTCCAACCAATTCAGTACACAATTAATAATGGGCTTTGTGGATGAAGATGGTGACTCGATGCGGAGGGATGAGACC TCAATGCAAATGCAACCATGGGTCCTCAATGTGTTGTCCAAGCGACCTCCTCCAATGCCGCCAGATATGGACACTTGGAC ACTTGCTATTTTGGCGCTTCACTCGGTTTGCCGCCGACAATGGGACCCGAGGGGGGAAGATTGGATCTACTATGCTTCTT CCAACCTTGAGGACAAGGTTGATTTTTGGAGGGGAGTATTGTTAGGATTAATTATATTAGGATTTAATTTAGGATTCTAT CTTTTGTCTTAGGAACTAATATTGTATTTTAGGATGTTATCGTTAGGATATCTTCTTTATTTCTTAGAGGTTAAGTTATC TTATTAGGATTAGGTTATTATAAACAGGAGTACCCTCCTTAGGTTAGAATCATGGATTAAATTATTCAGTTGTAATGGGA ACCAGCCCTATTGAAAAGGAACCAGCCTCTTGGTTCTGAAGAGGAACCAGCCTCTCAGTTCCTGTTTTATCCTTTTTATT TTAATATCAGTCTTATATTCAGAAAAAATACCAAAAATATTCCCTTTTTCTCTATTTTCTCTATCGTTTCCACGTTAGGA TTTTCGGGTTATAACAGTTGGAGCGTCCGGCAGGTCGGACCAATTGTTAGGATCCGAAAATCCTAACGTGGAGAAACGAT AGAGGAAATAGGACAAAAGGGAATATTTTTGGTATTTTTCTGAATATAAGACTGATATTAAAATAAAAAGGATAAACAGG AACTGAGAGGCTGGGTCCTCTTCAGAACCAAGAGGCTGGTTCCTCTAATAGGGTTGGTTCCCTTTACAACTTAATAATTT AATCCATAACTCTAACCTAAGGAGGGCACTCCTATTTATAATAACTAATCCTAATATCAATAACTTAATCCCTAAGAAAT ACAGAAGATATACTACTAGAATAAGAGATAACATCGTAAAATAAAAGATACTATAAAGATAGATTCCTAATATAATAAAT CCTAACAGGTATGGTCTAGTTTCTTGCCTGCATAAAAGTAGTTTGTTGTATTTTTTTTTGTTAGAATCTGATAACTGAGT GAGACCTTTTTAACCTTGAGTTGCATCCTTAAATCAAAACATTATTTGTTTAATGGAATAGGGAAAGGAGTGAAAAAGCA GAAATTAATTGAACGCTTTAGTGCAGTAGTCAGGTTACCTCTGCCATGTCAGTTCATATTGATAAATACAAATCTATGCA TATTCTAAACATGAATAACACATGATTACACGTAGTAGCTACTAGCTCCCTTATGCTACTCTCATACTGATTCTCATTTT GATTTATTACTGAATCCTTTCTTTCCGTGCTCATCTCAAATCTTGTGACTATATTGCCTCGTTTTCATCAAGGATGGCAT TAGCAAGGACTGTAAATAAGGTTAATTATTTGAAGATTCAGTACTTCAGTGCTTGGATATCTGAAATTTGTATATATTCA GCGTTTCACTAAAGTACAACTGTCAACTTGATTTTTGCATGTAACTGTGATAATCAATGTCATAGCTACAGAGGATCTGT TTTTATTTGGATCAGCATCCAGTTAACGTAAAGGACTTAGATCTAAGAGGTCTCTTTGAAGACTTGTTTTTGCTGTAAAA CATTCGACATCATTTAATTCATATAGCTAACCTTATCCAATGAAAAAATGCTTCGGTTGTTTTGAATCATGCTACTAATG AGTTGATAGTCTAATACTGATATTGATATATATCATCTCCAATGCAGATTAAGAAATCCAACTTTCATGATGAGAATTTC TCAGTTAGTGTCAGCAAATCAGCAAATGAAGTGGTTGCTACTTACACTAAAGATGAAACAGGAATGGATCTAGTCATTCG TCTCCCTGTGTCTTATCCACTAAGGCCTGTAGATGTTGATTGCACTAGGAGCCTTGGTATTAGTGAGGTCAAGCAAAGAA AATGGTTGATGTCAATGATGTTATTTGTTCGTAATCAGGTAGTTATTTTTTTATAGTTCACTTTTACATTTTGCTTTTCG ATTCTGCCTACTTTTGCACAATGCTTAGAAGTACACAGGCTTGTGTAGAGGCTAAAATTCATATATGCAAATCACGTGCA TGATTAATTCACATAAAAGTCTGGAGAAAAATTATGTTTCCCGTGAACTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTTT TGAATGCTATACACGGACCTTACCTCCTGAAATGCTCCCTACTAGATATATCGAAACTAGTTTTACATTACCGTACTTGT GAAATATAGTGGACAACAGATCAATGTGAAATTGGTGATTATTAGAGCAGGTTCGCACTAAAATTAACAATTTCGTTTCT GATCCAGCAGAATGGAGCTTTGGCAGAAGCTATAGGAATTTGGAAGCGCAATTTTGATAAAGAATTTGAAGGTGTAGAGG AGTGCCCAATCTGTTACAGTGTCATTCACACCACAAACCACAGCCTTCCTCGTCTTGCTTGCAGGACATGCAAACACAAA TTTCATTCTGCTTGCCTTTATAAATGGTTTTCAACTTCTCACAAATCATCTTGCCCTTTGTGTCAATCTCCGTTCTAAGG TTACACATTCAGTCATGATTTTGTTTACCAATTTTGCTTCCTGGTGATGCCGCCTTGCACTGACAGTAGTAGATGATGAG AATCTGTCGATGTATATGAAAATCAATACCTTGTATGAGAATCAAAGCTGATTAAGGCATTGCTGACTTACACACAACTG GCTTACGTAACTTGCATGATTTCCAGCATCTTTTCTCCATTAATCTTCATGATTCAATTATAGAGGAAGCTGGACAGTGT TTTGCGACACATGGGTATGTCATATTTTCTATAGAGGCAAGAGAAATGTATCTAATTCCTTTTTCATGTAAAATTTCTCC TTTCTCTTTATATACTAAGTGGTAGTATTACGTTGTTTTAATTCTGTTTAGAAGAGGTGAGTTCTGATCATAGGAGGCTG TCTGCACAAGAACAATTTTGTACATCTACATTACTTATATTAACCATTGAATCACTTAAGAGTAAGAATTGCCTGAATAA TAGTAGTAGTTGCACATCTAAGACAATATATTTACCATGAGAACATGGAATAGTTAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0111300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGGAAACAGAAAGGAGAAGGTGCAAGAAGCAAGTCACGCCCTTCAAGCAGCAGTCTCGCCGCGTCGCTATTGCCTTC CAGTTCCGCCGCCGCCGTCGGATTCGGTGGTTTTGTTGGTAGCTCGCGCCTCGATCCTTCTTCTCTTTCAACCGATGATT CTCTCCCTTTTGCTGATGTTGATAGTGAAATTGCGGTGCACTTGAAGAGGCTAGGCAGAAAGGATCCCACTACAAAGCTG AAGGCGTTGTCAGCTTTATCTACGCTGCTGCAACAAAAGTCTGCCAAAGAAATTGTTCTAATTGTTCCTCAATGGGCGTT TGAATATAAAAGGCTGTTGCTGGATTATAACAGGGAAGTTAGACGGGCTACCCATGAGACCATGACCACTCTTGTTACTA ATGTTGGGAGAGATTTAGCTCCACATCTCAAGACTTTGATGGGACCGTGGTGGTTTGCACAATTTGATCCAGTTTCTGAA GTTTCTCAGGCAGCAAAAAGGTCTTTGCAGGCCGCCTTTCCAGCTCAGGAAAAGAGACTTGATGCTTTGATCTTATGCAC AACAGAGATATTTATGTATTTAGAAGAAAACCTAAAGCTCACACCTCAAAATTTGTCTGACAAAGCTACAGCTTTGGATG AACTAGAAGAGATGTACCAGCAGGTGATATCATCAACATTGTTAGCATTGGCCACACTTCTTGATGTTTTAATTTGCCAC CAACAAGAACGACCTGGTTTTGATAGCATAACTGAACCTAAACATGCTTCAAAGGCCAGGGTGGCTGCTGCTTCTTATGC TGAAAAGCTGTTGACAGATCATAAATACTTTCTAGATTTCTTGAAGTCCCAAAGACCTACTATCCGATCTGCTACCTATA CTGTGCTGAAGAGCTTAATAAAAAATATCCCGCAGGCTATTAATGAAGGAAATCTGAAAACTTTTGCTGTTGCAATTCTT GGTGCTTTCAACGAGAAGGATCCAACATGCCACCCCTCAATGTGGGATGTAATGTTACTTTTCTCTAGAAGATTTCCAGG TGGTTGGACTTCCTTAAATGTTCAGAAAAGCATACTGAATCCGTTTTGGAATTTTCTAAGGAGTGGGTGCTTCGGTTCCC AGCAGGTCTCATATCCAGCTTTGATACTATTCTTAGACAGTGTGCCTCCTAAAGCTGTAGCAGGGGCTAAGTTTTTTCTT GAATTTTTCAAGAACTTGTGGGCGGGAAGGAGAACTTCTCTATCTGCAGATAGACTAGCATTTTTCCAGGCATTCAAAGA ATGTCTTCTTTGGTCATTGAAAAATGCTTCTAGATATAATGATGATAGTGACTCGGTCAGTCATTTCCATGTCACTCTTG TCGATAATGTCCTAGTAAAACTTTTATGGAAGGATTTCCTTACAACTGGAAGCTCCAAAGGTTCTGAAATAATCAACTCA GGAAAAGAAGCAGATTCATCTGAGGAAAATGCTTCTCACAGCAAGAAAGTCGATATGCTTAGTACAAAGTCTCCAAAGCC CCATATGCAAGAGTTGGGGAAATGCTTTGTCGAAATCCTTATAGGCATATTTGGGTTAGATAGCAATCTTTTATCTGTTT TCATTGTGGAACTTGAGGATAATTGCATGGCCATTCTTCAGCAAGCAGGTAATGTGGAGTCTGTTGAACGGATCATTTTG TTCATGTTATTGCTGGAGCAACATGCTGTGGTGAAAGGTGCAACTTGGCCCTTGGTCTATATTGTTGGACCGATGTTGGG GAAATCTTTCTCGATCATTAGATCTTCTGATTCACCAGATACTGTGAGACTTTTGACAGTTGCTGTTTCAATATATGGAC CACAGAAGATGGTCCAAGAAGTTTTTAATCAAAACAGAGGGAACTACTCTAGTCAGCTTTCATATGATGGGGATAAAGTA TTGGAAGTTCAAGACTTTATGCAAATCTTCAAGAACATTTTTGTTCCTTGGTGTCTGCAAGTGAATAGTTGCTCAGCCAA AGCTCGATTTGACTTGTTGTTGGCATTGCTGGATGATGAGTATTTCTCAGAACAATGGTCTTTCATTGTCAACTATGTGA TTAGAGAAAGTCATTCTGGATGCCCGCCAGGTTTGCTACATTCTGACCATGCAGCAATGTTGGCATTACTCCTTGAAAAA GCAAGGGATGAGAGTATGAAGAGGAAGGTGGGAGATGAATCCAGCTATAGACCAGGCACTAATTCTGAAGATTGGCATCA TGAATGTCTGGAATCGTCTGCTATTGCTGTTTCCCGATCCCTGCCTCCTTTTAGCACTTCTCATGTGCACTTCATGTGCT CTCTCCTTGGTGGTTCAACAGAAGGAAGATCAATGTCTTTTCTGTCCAGAAATACACTGATCCTCGTCTATGAAGAGATT TTCAGGAAGTTAGTCAGTTTTATTCAGCCTTCATCTTTCATTTGGGTACAGAATGCCGCTTCAATGTTAAGCAATGATGC AAAGATCTGTTTAGAATTTGATAGTTCTCTCGACATTGTTGAGATGGCTCAGTTTTCGCTTAAGATACTTGATGGAAGTT TCTTTTGTCTAAATACAATTGATGTGGAAAGTGGACTTGTATCAGGGATTTTATCTGCAATTTTTGTCATTGAATGGGAG TGTGATTTATGGAAAGGTTTGGTTAAGTCACTTCAGGACAATTCAATGACCGAAACCAAAGCCAGATTAACAATTGGGGA ATATGCGCGTGCTTTACGTAAAAAGATTAATGTTCAATTCTTGAAAAGCCTATGCTTAGATAGCCGCAAAAGATTGTTGA ATATTTTAATTCAGTCAGTGAAGTCTGCCATATTTGTTGAAGACAGACTTGTTGATGATGGAATTGCATCATTAGGCTGT ACATGGGTGCTCGAAGTTCTTGAATGCATTTGTGTAGATGAAAGTGATAAACTAAACCTGCTACATCAGCTTCTGAGCAA AGATGAAATGTGGCCTGTGTTTGTTGTGCCAAATTTCAGCTTAGTGAAGGCTTCAGGACACCAGAAGTTTGTAGCTTTAA TAGACAAGTTAATCCTGAAAATTGGTATTGATAGAGTTATTGCTGGGTGTGCAATGTCTGATCCATCTATGCTTGAAAGT CAAGAGGTTGCATCTTCTGCTTGGCTAGCTGCTGAAATCCTGTGCACATGGAGATGGCCAGGAAACAATGCTGTCTCTTC TTTCTTACCTTCACTGAGTGCATATGCGAAGCGATGTAATTCTCACCAGGAAAGCCTGTTAGATGACATAGTGAGCATCT TGGTTGATGGTTCTCTTGGTTTTGGAGGTGATAGCACAACTAGTTCTGTGAGTATGTGGCCAGTTAGAGCTGATGAAGTG GAAGGAATTGAAGAACCATTTTTAAAAGCACTTGTTTCCTTTCTATCCACTTTGTTCAAAGAGAATATTTGGGGGACAGA GAAGGCGTCAAATCTGATTAAGCTTCTTGTGAATAAACTCTTTCTTGGTGAAACAGTAAATACAAATTGTCTTAAGATTC TTCCTTTGCTTATAAGTGTACTTCTAGAGCCATTGTATGGATGTGTGGAGCCTGAAAGTGTTCCACCTTGTTCTTTGGAA GAAAGCTTCGTGCAAAATACTATGATAGACTGGCTTGAGAGGGCTCTACAGCTCCCACCTTTGGTCACATGGAAAACAGG ACAAGACATGGAAGTTTGGCTCCAGTTAGTTCTTGGCTGCTATCCTTTCTGCGCAATAGGTGGTCTACAAGCATTGAAGC CGGCTAGAATTGTCAACCTTGATGAGAGGAAACTTTTATATAAATTATTCCAGAAGCAGAGGTGCGTTACTGGTGGATCG GCAATGATTAACCAGCTTCCAGTAGTGCAGATGCTGCTGTCAAAACTTATGGTTGTTTCAGTAGGTTATTGCTGGGATGA ATTTAGTGAAGAAGATTGGGACTTTCTGTTGTCTAACCTAAGGTGCTGGATTCAGTCAGCAGCTGTTATAATGGAGGATG TAGCTGAAAATGTAAATGGTCTAGTAGATATTTCATCTGATAATTTAGATTTGATGTGTAAGAAAATTGAGAAAATTGTT TTGATTTCAGATCCTTTTCCCATAAAGATTTCTGAAAATGCCCTTTTGTCCTTTTCACTTTTTCTTAAGCATTGTAAACT TCAAAAAAGTGAAGAAAGCGATAATTTAAATACATTGAAAACAGAAAAGTTGGATTCTATTAAAGATCGGATTGTAGAGG GGATCCTTCGTTTACTATTTTGTACTGGCATTTCTGAGGCTATTGCAAATGCATTCTGCAAAGAAGCTGCATCAGTTATT GCATTGTCACGGGTTGAGTATACATATTTTTGGGAATTGGTAGCTTCTGGTGTTGTTGATTCCTCGTCACAGGCTAGAGA TAGAGCAGTGAAATCAGTTGAATTCTGGGGACTAAGCAAAGGATCTATTAGCTCATTGTATGCTATACTTTTTACTTCCA AGCCAATTCCTTTGTTGCAGTTTGCTGCATATTTTGTTCTTTCAAGTGAGCCTGTTTTGAGTATGGCTGTTATTGAAGAT AATGCTTGCAACTCAGACATCAATGCTGCTAGTGACCAGGATCTCAGCCGTTTTGACATGTCTATAGAAGATAAAGTCCA TTTGAGAGAGGAAATATCTTGCATTGTTGAAAGGGCACCTTATGAGGTTCTTGAACTGGACTTACTTGCACATCAACGAG TAAATCTCTTCCTTGCCTGGTCTCTGTTGATATCACATTTATGGTCATTACCTTCATCATCATCTCTGAGGGAGAGACTG ATCCAGTACTTACAAGATTCTGCTACTCCAATTATTTTAGATTGCCTTTTTCAGCATATTCCTGTAGAGATTTCCATGAT TCAGAGTCTGAAGAAGAAAGATGCAGAACTTCCTGGCGGCTTATCAGAAGCTGCAAGTGCTGCTACCCGTGCCACCACTT CTGGTTCACTCTTGTTTTCTGTGGAATCTCTTTGGCCTCTTGAATTGGAGAAAATGTCATCATTTGCTGGGGGAATATAT GGCCTGATGCTTCATGTTCTTCCAGCTTATGTTCGTGGCTGGTTCAGTGACTTGCGTGATCGTAACGCATCAGCTGTCAT TGAATCCTTTACAAAGACTTACTGCAGCCCTCCTCTCATTGCAAATGAATTATCCCAGATTAAGAAATCCAACTTTCATG ATGAGAATTTCTCAGTTAGTGTCAGCAAATCAGCAAATGAAGTGGTTGCTACTTACACTAAAGATGAAACAGGAATGGAT CTAGTCATTCGTCTCCCTGTGTCTTATCCACTAAGGCCTGTAGATGTTGATTGCACTAGGAGCCTTGGTATTAGTGAGGT CAAGCAAAGAAAATGGTTGATGTCAATGATGTTATTTGTTCGTAATCAGCAGAATGGAGCTTTGGCAGAAGCTATAGGAA TTTGGAAGCGCAATTTTGATAAAGAATTTGAAGGTGTAGAGGAGTGCCCAATCTGTTACAGTGTCATTCACACCACAAAC CACAGCCTTCCTCGTCTTGCTTGCAGGACATGCAAACACAAATTTCATTCTGCTTGCCTTTATAAATGGTTTTCAACTTC TCACAAATCATCTTGCCCTTTGTGTCAATCTCCGTTCTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0111300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGKQKGEGARSKSRPSSSSLAASLLPSSSAAAVGFGGFVGSSRLDPSSLSTDDSLPFADVDSEIAVHLKRLGRKDPTTKL KALSALSTLLQQKSAKEIVLIVPQWAFEYKRLLLDYNREVRRATHETMTTLVTNVGRDLAPHLKTLMGPWWFAQFDPVSE VSQAAKRSLQAAFPAQEKRLDALILCTTEIFMYLEENLKLTPQNLSDKATALDELEEMYQQVISSTLLALATLLDVLICH QQERPGFDSITEPKHASKARVAAASYAEKLLTDHKYFLDFLKSQRPTIRSATYTVLKSLIKNIPQAINEGNLKTFAVAIL GAFNEKDPTCHPSMWDVMLLFSRRFPGGWTSLNVQKSILNPFWNFLRSGCFGSQQVSYPALILFLDSVPPKAVAGAKFFL EFFKNLWAGRRTSLSADRLAFFQAFKECLLWSLKNASRYNDDSDSVSHFHVTLVDNVLVKLLWKDFLTTGSSKGSEIINS GKEADSSEENASHSKKVDMLSTKSPKPHMQELGKCFVEILIGIFGLDSNLLSVFIVELEDNCMAILQQAGNVESVERIIL FMLLLEQHAVVKGATWPLVYIVGPMLGKSFSIIRSSDSPDTVRLLTVAVSIYGPQKMVQEVFNQNRGNYSSQLSYDGDKV LEVQDFMQIFKNIFVPWCLQVNSCSAKARFDLLLALLDDEYFSEQWSFIVNYVIRESHSGCPPGLLHSDHAAMLALLLEK ARDESMKRKVGDESSYRPGTNSEDWHHECLESSAIAVSRSLPPFSTSHVHFMCSLLGGSTEGRSMSFLSRNTLILVYEEI FRKLVSFIQPSSFIWVQNAASMLSNDAKICLEFDSSLDIVEMAQFSLKILDGSFFCLNTIDVESGLVSGILSAIFVIEWE CDLWKGLVKSLQDNSMTETKARLTIGEYARALRKKINVQFLKSLCLDSRKRLLNILIQSVKSAIFVEDRLVDDGIASLGC TWVLEVLECICVDESDKLNLLHQLLSKDEMWPVFVVPNFSLVKASGHQKFVALIDKLILKIGIDRVIAGCAMSDPSMLES QEVASSAWLAAEILCTWRWPGNNAVSSFLPSLSAYAKRCNSHQESLLDDIVSILVDGSLGFGGDSTTSSVSMWPVRADEV EGIEEPFLKALVSFLSTLFKENIWGTEKASNLIKLLVNKLFLGETVNTNCLKILPLLISVLLEPLYGCVEPESVPPCSLE ESFVQNTMIDWLERALQLPPLVTWKTGQDMEVWLQLVLGCYPFCAIGGLQALKPARIVNLDERKLLYKLFQKQRCVTGGS AMINQLPVVQMLLSKLMVVSVGYCWDEFSEEDWDFLLSNLRCWIQSAAVIMEDVAENVNGLVDISSDNLDLMCKKIEKIV LISDPFPIKISENALLSFSLFLKHCKLQKSEESDNLNTLKTEKLDSIKDRIVEGILRLLFCTGISEAIANAFCKEAASVI ALSRVEYTYFWELVASGVVDSSSQARDRAVKSVEFWGLSKGSISSLYAILFTSKPIPLLQFAAYFVLSSEPVLSMAVIED NACNSDINAASDQDLSRFDMSIEDKVHLREEISCIVERAPYEVLELDLLAHQRVNLFLAWSLLISHLWSLPSSSSLRERL IQYLQDSATPIILDCLFQHIPVEISMIQSLKKKDAELPGGLSEAASAATRATTSGSLLFSVESLWPLELEKMSSFAGGIY GLMLHVLPAYVRGWFSDLRDRNASAVIESFTKTYCSPPLIANELSQIKKSNFHDENFSVSVSKSANEVVATYTKDETGMD LVIRLPVSYPLRPVDVDCTRSLGISEVKQRKWLMSMMLFVRNQQNGALAEAIGIWKRNFDKEFEGVEECPICYSVIHTTN HSLPRLACRTCKHKFHSACLYKWFSTSHKSSCPLCQSPF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1879 | 1879 | 0.0 | ||
| MobiDBLite | 1 | 21 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1 | 16 | 16 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 31 | 31 | - | – | |
| Phobius | 1 | 30 | 30 | - | – | |
| Phobius | 17 | 25 | 9 | - | – | |
| Phobius | 26 | 30 | 5 | - | – | |
| Phobius | 31 | 1879 | 1849 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 73 | 431 | 359 | 3.28E-10 | ||
| MobiDBLite | 477 | 505 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 482 | 502 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 1812 | 1879 | 68 | 1.8E-10 | ||
| SUPERFAMILY | 1823 | 1879 | 57 | 1.54E-12 | – | |
| CDD | 1827 | 1876 | 50 | 7.38666E-34 | ||
| SMART | 1828 | 1876 | 49 | 0.0038 | ||
| Pfam | 1828 | 1876 | 49 | 2.4E-7 | ||
| SMART | 1829 | 1875 | 47 | 5.5E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 1829 | 1876 | 48 | 12.297 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. | ||
| Molecular function | Ubiquitin protein ligase activity | Catalysis of the transfer of ubiquitin to a substrate protein via the reaction X-ubiquitin + S -> X + S-ubiquitin, where X is either an E2 or E3 enzyme, the X-ubiquitin linkage is a thioester bond, and the S-ubiquitin linkage is an amide bond: an isopeptide bond between the C-terminal glycine of ubiquitin and the epsilon-amino group of lysine residues in the substrate or, in the linear extension of ubiquitin chains, a peptide bond the between the C-terminal glycine and N-terminal methionine of ubiquitin residues. | ||
| Cellular component | RQC complex | A multiprotein complex that forms a stable complex with 60S ribosomal subunits containing stalled polypeptides and triggers their degradation (ribosomal quality control). In budding yeast, this complex includes Cdc48p, Rkr1p, Tae2p, Rqc1p, Npl4p and Ufd1p proteins. | ||
| Biological process | Ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process | The chemical reactions and pathways resulting in the breakdown of a protein or peptide encoded by an aberrant message and associated with a stalled ribosome. Degradation is initiated by the covalent attachment of a ubiquitin group, or multiple ubiquitin groups, to the ribosome-associated protein. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0111300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…