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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0672100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0672100.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ABC(ATP-binding) family transporter; TAIR: AT2G41700.1 ATP-binding cassette A1; Swiss-Prot: sp|Q84M24|AB1A_ARATH ABC transporter A family member 1; TrEMBL-Plants: tr|G7KTH7|G7KTH7_MEDTR ABC transporter family protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0672100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:123645770..123683726) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAGGAACTGCGTGGAGGCAGTTGAAGATCATGCTCAGGAAGAACTGGCTCCTCAAGATTCGTCACCCTTTCGCCACTGC AGCTGAGGTAATTACTCTCATCTCTTCACTTCATTCATTTCGGTTTTCTGAGGAGTTTCCATTTTAACTGTTGCCTTTTT TAGCTTTGATTTCGTTATTTTTTGCTTTTTATGACGGTTTTAACTGTTATAAAATGCTTCATTAATGTAATTTGTAGATT CTTAGGGTTTTGGTTGTTTCCTTCCAATTGCATTTCAACTTGGTCAATAAGGATTGGAATTCTGATGTATATCACTCAAT TTTCTATGGCAGATTTTGCTTCCTACGGTTGTGTTGTTGCTATTAGTAGCTGTCAGGACACGAGTCGACACCCAAATTCA TCCAGTTCAATCGTAAGTCTTTCTATCCATAGCTTGCTATCAGGTGACCCTTACCCAAACAAACAACTTAAGCTTTTGGG CTAGTTGGTTGTTTGATATGATATCAGAGCCTCTATGATCGAGCGGTCTAGTGTTCGATCCTTGACGACTCTAGTTTTTC TAATAAAAAGTTGAATTTCAGCACATGGTAGGTGAGTTTGTGCATGAATAATTATATCTTCACACCTCATTTTTGACGTG TGGAGAGGTGGAAGAAGAGAGAGATAGGAAGGAAGGAGAGAGAAAATAAAGATGTGATAGGTGATTTGATTGATAAAGAA GGTGGAAAATAGGTGGAGGTGTGTATGAATCATAACTCGTCTGTGCATTGTCCACGCTTCAAGCCGAAACGAGCTTTTAA GGGACGGGCGTGTTAGAAATAGTAATATAAAACCATTCATGTTGCCCTTATCCAATTGCTTAAGCTTTTGGGATAATTGG TTCCTATAAGAGAATATACTATGAAAATAGTTAATTGTAATTAGTCAGTAGTTAGTTAAGATTTACAGATAGCTTCTCCT 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CAAGAGAAGCAGGTTTTCTTTGTGCTTGCTTAAAATCGAACACAAGGTTTATGGTTATAAAAACGAACATTCTCTGTTTC CAGGTAAAACCTACTGAAGTGAGCTCTGCTGACTTACAATCACTCTGCCAAGCCATTCAGGAAATGCTTTTGGATATCCC TTCTCAACCTAGAAGCTTACTTAATGACCTTGAAATATGCATTGGGGGAACTGACTCCACCACAGGAAATACCTCTGTTG CGGAGATTAGCTTGACAAGAGAAATGATAGGTTTAATTGGACGCTGGCTTGGCAATGAAGAGAGAGTGAAGACTCTAATT ACTTGTGCACCAGTCTATGATGGAGCTTCTCAGGAACAGTTATCAGAACAATTATTTCGAGATGGTACGCGAGAACCTTA CTTTTAAGGCTTTGATTCTTCTTCTTCTTTTTTAATAAAAGAACAGTTAATAACCTGACCCTCTTAGTTACTTGTGCACC TGTAAATTTTATTTTTCTGTGTCAGCTTCTTGTTGATAAATAACTGACTTTTGTAATTTTTTCTTTGTGGTGGCACCCCT TCTTTACATGTTTGTCTATCAGTTTCAACCAATTCTTTTATGATCACTCAATTTTTAAATTACTCAGGATGAACTTTTCT TTATATTGTAAGGAAAACTTTTCCCTAATTATTAAAATATTATCTGGTATACATTCATTTTTCTGTTTTAATGTGTCAGT AAACTATGCTGTATACAATTTAGATATAGCTCAAGAAATATTTATAATCCAGCTTTCATGGATACAAGTCTTGGGTTTTT TTCTGTTATAATGTGTCAGCAAACTATCCATTCTTTATATTATTTAGATATAGCTGAAGAAATATTTATAATCCAGCTTT CCAAAATCCAAATACAAACCTATTTTGAGGCGTAAAAAGCCCACTGTTTCCTTGGATATTAGGTTGACAAATTAATGTAA TTACATGATTCTTTTCAAACTTCCATCAGCTTTTGGGACTGCTTGTAAACATCTTGTTTATTGTTCATACTGTATGAGGT TCTTTCTAAAGTGTTCCAGCTTAAATCATTTCTGAACTCAGTATTCAACCACCTCTCCCCCCAAAAACAGGGAGAAAGAT GTACTAGCTACATTTTTCATAAACGGTAGATATAAAACCAATCATTAAGGCTTCACCTGATGGGTTAAGGTTTTTGGAGA GTTGGTGCATGACTATAACATAATGCTCTCTTATATTTTTATTTTAGAAAAAGCATAAATTTCCATTTAGTACTGATGCC CCCTTTTTTTTTTGTGTTGGTAATCTAGGTGGTATTCCATTGCCAGTATTTTCTGAGTGGTGGTTATCCAAACAAAAATT CTCAGAAATTGATTCATTTATTCTGGCTTCATTTCGTGGAGCTAGATGCCAAGGGTGCAATGGTTTGAGTATTAGATACC AGGTATTTTTGAGTTACCACATTACGTTTTTTATGGGAAAATTCTACATTATGATTGAGAAATCCTCGTGTCTGAGTCTA CATGTGTGTAATTTAACCATTGAATTTGAAGTTATAGCTGATTTGTTAGGTTTCTTAGGAAACATACAAATATAGAATTG TAGATTTGAAAATTCCGCTTTATTTTATTTTCTTCCCATTTCTTTGGCAATCAACATCTTAATAATCTTTGGCATAACTA ATATTATTAGTTCATAATCCTCACAATAGGAACTTGGGCTCCCTGACTGGCATGTAACAAGGGTAAACCACTGATTAGCT TAAGCTATGCAAGGCTTCAAACTTGTTAACTGTATAATGTATCATGTCCTAGAAACTTCAGCTAGGTGAATACACATGAT CAGTTTTACATTGCATATTTCTAGCACGCCCCTCACGAGCAGGCAGCCATGGTGCAAGCTTAGTCACCAACTCAATTTGT TTTTGTATAGAGATCATACAAGCCCACCTAATTTATATTTTAATTCAAGTTTGCTATTAGAATAATGGAGGTAACTAGGA TCGAACTCTCGACCACTTGATCATAGAGGCTCTGATTCATCACCTGATGCCTTAATCTTATGGGATTATTGACCTATATC TTGAGTGATATCAAGCATATCTTCAGTTGGTTTACATTCCTCCGTGGACAGAACTTGCATATTTTTGTGCATGCAGTGAG TGGTGTATCCGGATTTATTTTACAGGTCTGATAGTAATTCATGTTTGTTTACTGCAGTTACCATATGATGAAGATTTTTC CCTGGCAGATGTTTTTGGACTTCTTGAAGGAAACAGGTAAACTCGAAGTACCTTTCGTTTATTTTTCACGGTCTTGTTGA ACGAAGTGACTAAATTCTTCCAAAATCATTTGCAGAAATAGATTAGAGATTGCAGAGTACAGCATCAGCCAATCAACTCT TGAGACGATATTTAATCATTTTGCAGCTAATTCATGA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0672100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTCAGGAAGAACTGGCTCCTCAAGATTCGTCACCCTTTCGCCACTGCAGCTGAGATTTTGCTTCCTACGGTTGTGTT GTTGCTATTAGTAGCTGTCAGGACACGAGTCGACACCCAAATTCATCCAGTTCAATCGCACATTCAAAAAGACATGTTTG TTGAAGTGGGAAAAGGTATATCCCCTAACTTCCAACAAGTTTTGGAATCCTTGCTCGATAAGGGAGAGTATTTAGCTTTT GCACCGGATACCGATGAGACAAAGCTGATGATAGATGTAGTGTCGATAAAATTTCCTCTCTTGAAGCTTGTTAGTAGAGT ATACCAAGATGAGGTAGATTTGGAGACCTACATCCGTTCAGATGCTTATGGCACCTGCAATCAAGTCTATCAGAATTGTT CAAATCCCAAAATTAAAGGAGCAGTTGTATTTTACGAACAAGGTCCTCAGTCCTTTGATTATAGTATACGCCTCAATCAT ACATGGGCTTTCTCTGGTTTTCCAGATGTTACAACAATAATGGACACAAATGGACCTTTTCTTAATGACTTGGAACTTGG TGTCAGTGCTGTACCAACGATGCAATACAGCTTCAGTGGATTTTTCACTCTCCAGCAGATGGTCGATTCATTCATAATAT TAATGGCTCAGCAGTCTGACATAAATTCCAGTGCTAAAGATGTAAAGCTCCCTCTACCAGGCTTCTATAATGCTGATTTC TCTTCAAAAATTCCATGGACTCAATATAACCCTGCTCACATACGAATAGCTCCATTTCCCACTCGGGAATACACTGATGA CCAGTTCCAGTCAATCATAAAGGAAGTCATGGGAATATTGTACTTATTAGGGTTTCTCTATCCGATTTCCCGTCTGATAA GTTATTCTGTGTTTGAGAAGGAACAGAAAATTAAAGAAGGACTCTATATGATGGGCCTGAAAGATAGTGTATTTCATCTG TCTTGGTTTATTACATATGCTTTGCAGTTTGCTATTTCTTCTGGGGTCCTTACAGCTTGCACCATGGATAATTTATTCAA GTATAGTGATACGACACTGGTGTTTGTGTACTTTTTTGTTTTTGGGCTTAGTGCGATCATGCTGTCATTTTTTATATCAA CATTTTTCAAACGGGCCAAAACAGCAGTAGCTGTTGGAACTCTGTCTTTTCTCGGTGCCTTTTTACCTTATTACAGTGTC AATGATGAGGGAGTTTCTATGATCTTGAAGGTTGTTGCTTCTTTGCTTTCACCTACGGCCTTTGCTCTGGGTTCGGTCAA CTTTGCTGATTATGAGCGTGCTCATGTTGGACTTCGTTGGAGCAACATATGGCGGGAATCATCTGGAGTAAACTTCTCCG CATGTCTTCTGATGATGATACTTGATACGCTGCTATATTGTGTTATTGGACTGTATTTTGATAAGGTTCTTCCCAGGGAG TATGGACGGCGATATCCATGGAGTTTTATTTTCAAAAAGAACTTCTGGAGGAAGAAAGAAATTGTAAACCATTGTTCCTC CAGTTCCAAAGATAAAAATGTTGGTAACGATTCTGAGTCAGAAAGAGACCTTTTAGGGGATGATGCTTACAAACCTGCTA TAGAAGCAATAAGCTTAGACATGAAACAACAGGAGCTTGATGGCAGGTGCATTCAAATCAGGAATTTGCATAAAATGTAT GATACTAGAAAAGGAGATTGCTGTGCTGTTAACTCATTGCAGTTAACGTTGTATGAAAATCAGATTCTTGCTCTTTTAGG TCATAATGGAGCTGGGAAAAGCACAACAATCTCAATGCTTGTTGGTCTTGTTCCTCCTACTTCAGGGGATGCTTTGGTTT TTGGGAAGAACATCATATCAGATATAGATGAGATACGGAAGGTTTTGGGTGTCTGCCCACAACATGATATACTCTTTCCT GAATTGACTGTGAGAGAGCATTTAGAACTGTTTGCAGCATTAAAGGGTGTGGAGGTAGACTCATTGGAGGGTGTTGTTGC TAACATGGTTGATGAGGTGGGCTTGGCTGATAAAGTTAACAGTGTTGTGAGTTCTCTTTCTGGTGGCATGAAGAGGAAGT TATCTCTTGGGATTGCATTGATTGGAAACAGTAAGGTTATAGTTCTTGATGAACCTACAAGTGGAATGGATCCCTACTCA ATGCGCTTGACTTGGCAGTTGATAAAAAAATTTAAGAAGGGTAGGATAATTTTGCTAACAACACATTCTATGGATGAAGC GGATGAACTAGGGGATCGGATAGCTATCATGGCCAATGGTTCTCTGAAATGCTGTGGAAGCTCCCTTTTCTTGAAGCATC ACTATGGAGTTGGTTATACTCTTACTCTTGTGAAGTCAGCTCCTACTGCTTCTATAGCTGGTGATATAGTGTACCGTCAT GTTCCTTCAGCAACCTGTATAAGCGAGGTCGGAACTGAGATTTCCTTCAGGCTTCCTTTGGCATCCTCATCAGCCTTTGA AAGGATGTTTAGGGAAATCGAAAGTTGCATGAAAATCCCAGTTTTAGACTTGGAAGTAAGTGGCAGTGGTGACAAAGACA GTCATGGTATTGAAAGCTATGGTATATCTGTTACAACTCTGGAGGAGGTATTCTTGAGAGTTGCAGGATCTGACTATGAT GAAGTTGAATCCTTTAAAGAAAATATCCGATCCCATATATCAGATTCTGTGCCTTCTCTTCCTTTTAGTGATCGTCCATC CACAAAAATATGTGACCTTAAAGTTGTTGGAAATTATAAGAAGATTCTTGGTTTCGTGTCTACAATGGTTGGAAGAGCTT TTAATTTAATTTTTGCTACGGTTATTAGTTTCATCAACTTTGTGAGTATGCAGTGTTGTGGCTGTTGTCTCATTACTAGG TCTACATTCTGGAAACATTCTAAAGCTTTATTCATTAAAAGGGCAATATCTGCTCGGAGAGATCACAAAACGCTTGTTTT CCAGTTACTGATTCCTGCTGTCTTCTTGTTTATTGGTCTTCTATTTCTTGAGCTCAAGCCACATCCTGATCAACAGTCAC TGATCCTTTCAACTTCTTATTTTAATCCTCTACTGAGCGGTGGGGGTGGGGGAGGTCCAATTCCATTTAATCTATCTTTG CCAATTGCTGAAAAGGTTGCAAAAAGTGTCGAAGGAGGGTGGATTCAAATGTGCAAGCCAAGCTCTTATAAATTCCCAAA TTCAGAGAAGGCATTATCTGATGCAGTGGAAGCAGCTGGGCCAACACTGGGACCTGCTCTACTTTCAATGAGTGAATATT TGATGTCTAGCTTTAATGAATCCTACCAATCTAGGTATGGAGCAATTGTAATGGATGATCAGAATAATGATGGAAGCTTA GGCTACACTGTATTGCACAACTTTTCTTGTCAACATGCGGCTCCCACCTTTATCAATTTGATGAATTCTGCAATTCTGAG GCTTGCTACTCATAATACGAATATGACAATTCAGACACGCAACCACCCTCTTCCAATGACCAAAAGCCAGCACTTACAAC GTCATGATCTGGATGCCTTCTCTGCTGCTGTCATTGTCAATATTGCCTTCTCTTTTATACCTGCCTCCTTTGCTGTTTCA ATTGTTAAGGAACGTGAAGTGAAAGCTAAGCACCAACAACTAATCAGTGGGGTTTCAGTCTTTTCATATTGGGCTTCTAC ATTTATGTGGGACTTCGTGAGCTTCTTGTTTCCAGCCTCGTTTGCCATAATTCTCTTTTACATCTTTGGTCTGGATCAGT TTGTTGGAGGGGTTTCTTTGTTACCGACGATCCTCATGCTTTTGGAATATGGACTTGCAATTGCGTCGTCAACTTATTGC CTTACATTTTTCTTTTTTGACCATATGGTGGCTCAGAACGTGGTTCTCCTGGTCCACTTCTTTACTGGATTGATACTAAT GGTTATCTCATTCGTTATGGGACTCATCCCATCCACAATAAGTTTCAATTCTTTTCTTAAGAATTTTTTCAGAATATCAC CTGGGTTTTGTTTTGCTGATGGTCTTGCTTCATTAGCTCTTCTGCGGCAAGGAATGAAAGATAAAACAAGTGATGGAGTG TTTGATTGGAATGTAACTGGTGCCTCCATTTGTTATCTTGCTGTTGAGAGCTTTGGTTACTTTTTGTTGACACTCGCACT TGAAATTTTTCCTTCTCCCAAATTGACTTCATTCATGATCAAGAATTGGTGGGGGAAGATTAATATATTTCAGCAAAATG CTACTTATCTGGAACCCCTTTTAGAACCTTCCTCAGAAACTGTTGTGATGGACTTCGAGGAAGATGTAGATGTGAAAACA GAAAGAAATAGGGTACTTTCAGGTTCCCTTGACAATTCCATTATCTACTTGCGCAATCTTCGGAAGGTATACTCCGAAGA GAAGTATCATGGGAAAAAGGTTGCAGTAGATTCATTAACCTTCTCAGTTCAGGAAGGAGAATGTTTTGGCTTTTTAGGGA CAAATGGAGCTGGAAAGACTACAACTCTTTCTATGCTATGTGGGGAGGAAACTCCTTCTGATGGGACTGCTTTTATTTTT GGCAAAGATATATGCTCCCATCCCAAGGCTGCTCGTCAATATATTGGATATTGTCCACAATTCGATGCCCTATTGGAGTT CTTAACTGTCCAAGAGCATCTTGAGCTTTATGCTAGAATAAAAGGTGTTCCAGACTACACATTAGAAAATGTTGTTAATG AAAAGATGGTGCAGTTTGACTTATTGAAGCATGCTAATAAACCATCATTTTCACTTAGTGGAGGGAATAAAAGGAAACTG TCGGTTGCTATTGCAATGATTGGAGATCCTCCTATTGTCATTCTTGATGAGCCATCCACAGGTATGGATCCCATTGCCAA AAGGTTCATGTGGGATGTAATATCTACGATCTCAACGAGAAGAGGAAAGACTGCAGTGATTCTTACTACCCACAGCATGA ATGAAGCCCAAGCCTTATGTACCAGAATTGGGATTATGGTCGGTGGACGACTGAGATGCATTGGAAGTCCACAACATCTA AAATCAAGATTTGGAAATTATCTAGAACTAGAGGTAAAACCTACTGAAGTGAGCTCTGCTGACTTACAATCACTCTGCCA AGCCATTCAGGAAATGCTTTTGGATATCCCTTCTCAACCTAGAAGCTTACTTAATGACCTTGAAATATGCATTGGGGGAA CTGACTCCACCACAGGAAATACCTCTGTTGCGGAGATTAGCTTGACAAGAGAAATGATAGGTTTAATTGGACGCTGGCTT GGCAATGAAGAGAGAGTGAAGACTCTAATTACTTGTGCACCAGTCTATGATGGAGCTTCTCAGGAACAGTTATCAGAACA ATTATTTCGAGATGGTGGTATTCCATTGCCAGTATTTTCTGAGTGGTGGTTATCCAAACAAAAATTCTCAGAAATTGATT CATTTATTCTGGCTTCATTTCGTGGAGCTAGATGCCAAGGGTGCAATGGTTTGAGTATTAGATACCAGTTACCATATGAT GAAGATTTTTCCCTGGCAGATGTTTTTGGACTTCTTGAAGGAAACAGAAATAGATTAGAGATTGCAGAGTACAGCATCAG CCAATCAACTCTTGAGACGATATTTAATCATTTTGCAGCTAATTCATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0672100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLRKNWLLKIRHPFATAAEILLPTVVLLLLVAVRTRVDTQIHPVQSHIQKDMFVEVGKGISPNFQQVLESLLDKGEYLAF APDTDETKLMIDVVSIKFPLLKLVSRVYQDEVDLETYIRSDAYGTCNQVYQNCSNPKIKGAVVFYEQGPQSFDYSIRLNH TWAFSGFPDVTTIMDTNGPFLNDLELGVSAVPTMQYSFSGFFTLQQMVDSFIILMAQQSDINSSAKDVKLPLPGFYNADF SSKIPWTQYNPAHIRIAPFPTREYTDDQFQSIIKEVMGILYLLGFLYPISRLISYSVFEKEQKIKEGLYMMGLKDSVFHL SWFITYALQFAISSGVLTACTMDNLFKYSDTTLVFVYFFVFGLSAIMLSFFISTFFKRAKTAVAVGTLSFLGAFLPYYSV NDEGVSMILKVVASLLSPTAFALGSVNFADYERAHVGLRWSNIWRESSGVNFSACLLMMILDTLLYCVIGLYFDKVLPRE YGRRYPWSFIFKKNFWRKKEIVNHCSSSSKDKNVGNDSESERDLLGDDAYKPAIEAISLDMKQQELDGRCIQIRNLHKMY DTRKGDCCAVNSLQLTLYENQILALLGHNGAGKSTTISMLVGLVPPTSGDALVFGKNIISDIDEIRKVLGVCPQHDILFP ELTVREHLELFAALKGVEVDSLEGVVANMVDEVGLADKVNSVVSSLSGGMKRKLSLGIALIGNSKVIVLDEPTSGMDPYS MRLTWQLIKKFKKGRIILLTTHSMDEADELGDRIAIMANGSLKCCGSSLFLKHHYGVGYTLTLVKSAPTASIAGDIVYRH VPSATCISEVGTEISFRLPLASSSAFERMFREIESCMKIPVLDLEVSGSGDKDSHGIESYGISVTTLEEVFLRVAGSDYD EVESFKENIRSHISDSVPSLPFSDRPSTKICDLKVVGNYKKILGFVSTMVGRAFNLIFATVISFINFVSMQCCGCCLITR STFWKHSKALFIKRAISARRDHKTLVFQLLIPAVFLFIGLLFLELKPHPDQQSLILSTSYFNPLLSGGGGGGPIPFNLSL PIAEKVAKSVEGGWIQMCKPSSYKFPNSEKALSDAVEAAGPTLGPALLSMSEYLMSSFNESYQSRYGAIVMDDQNNDGSL GYTVLHNFSCQHAAPTFINLMNSAILRLATHNTNMTIQTRNHPLPMTKSQHLQRHDLDAFSAAVIVNIAFSFIPASFAVS IVKEREVKAKHQQLISGVSVFSYWASTFMWDFVSFLFPASFAIILFYIFGLDQFVGGVSLLPTILMLLEYGLAIASSTYC LTFFFFDHMVAQNVVLLVHFFTGLILMVISFVMGLIPSTISFNSFLKNFFRISPGFCFADGLASLALLRQGMKDKTSDGV FDWNVTGASICYLAVESFGYFLLTLALEIFPSPKLTSFMIKNWWGKINIFQQNATYLEPLLEPSSETVVMDFEEDVDVKT ERNRVLSGSLDNSIIYLRNLRKVYSEEKYHGKKVAVDSLTFSVQEGECFGFLGTNGAGKTTTLSMLCGEETPSDGTAFIF GKDICSHPKAARQYIGYCPQFDALLEFLTVQEHLELYARIKGVPDYTLENVVNEKMVQFDLLKHANKPSFSLSGGNKRKL SVAIAMIGDPPIVILDEPSTGMDPIAKRFMWDVISTISTRRGKTAVILTTHSMNEAQALCTRIGIMVGGRLRCIGSPQHL KSRFGNYLELEVKPTEVSSADLQSLCQAIQEMLLDIPSQPRSLLNDLEICIGGTDSTTGNTSVAEISLTREMIGLIGRWL GNEERVKTLITCAPVYDGASQEQLSEQLFRDGGIPLPVFSEWWLSKQKFSEIDSFILASFRGARCQGCNGLSIRYQLPYD EDFSLADVFGLLEGNRNRLEIAEYSISQSTLETIFNHFAANS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 35 | 35 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 1874 | 1874 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 19 | 19 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 1874 | 1874 | 0.0 | ||
| TMHMM | 10 | 32 | 23 | - | – | |
| Phobius | 20 | 31 | 12 | - | – | |
| Phobius | 32 | 35 | 4 | - | – | |
| Phobius | 36 | 277 | 242 | - | – | |
| Pfam | 121 | 471 | 351 | 1.3E-25 | – | |
| TMHMM | 276 | 298 | 23 | - | – | |
| Phobius | 278 | 298 | 21 | - | – | |
| Phobius | 299 | 318 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 318 | 340 | 23 | - | – | |
| Phobius | 319 | 342 | 24 | - | – | |
| Phobius | 343 | 353 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 353 | 375 | 23 | - | – | |
| Phobius | 354 | 376 | 23 | - | – | |
| Phobius | 377 | 382 | 6 | - | – | |
| Phobius | 383 | 400 | 18 | - | – | |
| Phobius | 401 | 405 | 5 | - | – | |
| Phobius | 406 | 429 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 407 | 429 | 23 | - | – | |
| Phobius | 430 | 449 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 450 | 472 | 23 | - | – | |
| Phobius | 450 | 473 | 24 | - | – | |
| Phobius | 474 | 935 | 462 | - | – | |
| Gene3D | 538 | 784 | 247 | 3.1E-63 | – | |
| SUPERFAMILY | 548 | 789 | 242 | 1.11E-54 | ||
| CDD | 551 | 772 | 222 | 4.47426E-104 | – | |
| ProSiteProfiles | 551 | 784 | 234 | 19.274 | ||
| Pfam | 571 | 714 | 144 | 5.7E-29 | ||
| SMART | 579 | 761 | 183 | 1.0E-7 | ||
| ProSitePatterns | 686 | 700 | 15 | - | ||
| Phobius | 936 | 963 | 28 | - | – | |
| TMHMM | 936 | 958 | 23 | - | – | |
| Phobius | 964 | 983 | 20 | - | – | |
| Pfam | 983 | 1385 | 403 | 1.1E-36 | – | |
| TMHMM | 984 | 1003 | 20 | - | – | |
| Phobius | 984 | 1003 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1004 | 1178 | 175 | - | – | |
| Phobius | 1179 | 1202 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 1180 | 1202 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1203 | 1222 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1223 | 1249 | 27 | - | – | |
| TMHMM | 1232 | 1249 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1250 | 1260 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1261 | 1286 | 26 | - | – | |
| TMHMM | 1264 | 1286 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1287 | 1292 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 1293 | 1315 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1293 | 1316 | 24 | - | – | |
| Phobius | 1317 | 1327 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1328 | 1348 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 1330 | 1348 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1349 | 1359 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1360 | 1383 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 1368 | 1390 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1384 | 1882 | 499 | - | – | |
| Gene3D | 1447 | 1694 | 248 | 2.0E-60 | – | |
| SUPERFAMILY | 1450 | 1688 | 239 | 9.92E-54 | ||
| ProSiteProfiles | 1455 | 1693 | 239 | 18.741 | ||
| CDD | 1455 | 1681 | 227 | 4.15041E-111 | – | |
| Pfam | 1477 | 1619 | 143 | 1.6E-24 | ||
| SMART | 1485 | 1672 | 188 | 1.2E-6 | ||
| ProSitePatterns | 1592 | 1606 | 15 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Molecular function | ATPase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction. | ||
| Molecular function | ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, to directly drive the active transport of a substance across a membrane. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0672100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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