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LotjaGi2g1v0067700.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0067700
Transcript ID LotjaGi2g1v0067700.2
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like protein kinase; TAIR: AT3G47570.1 Leucine-rich repeat protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|C0LGP4|Y3475_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7H6H3|A0A1J7H6H3_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0067700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:15917742..15937774) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTTGCAAAGAGACCCACGTTTACAGAATTGTAACCCTAAAAGGCATGGACGAGCGAGATCGATGGAGGAGCACTTTCCTT TACTCCGCCGCCGTCAGATTCGCCGTGTTCTCGCCGGAGCAGAACGGTGGGAGTTTCATGGCGTCCAATGGCTCATTTTT TCATCGCCGGCGGTCATTGAGTCGGAGGAGAGGTTCGCCCCGTGCGACTGGCGAAGGTAAGACACCGTCGGTCATTGTTG TTATCTTTACCTGTGAGTTTTCCATGATGATGATGATGCTTGTGGTGATGCAGGTAGAACGCGGTTGGTTGGATTGGAAG TGAGGTAAATGGCTGATGAGTATAGAGTTGAGTTTTGATGGAAGAGTGATGTTAATGTTGAGATTTGAGAACACCAAAGC TTCTGACAGAGAGAAATCGTGAAATCGAGAAGGTAATTTCAATTGCATAGTTTAACATTTTTTTTAATTGAGTGCATTGA GAGTTTCAATGGCGATTTATGTGATACTACAACAATAATAACAAAAGCCTTATCCCACTAAGTGAAGTCCGTTATATGAA TCACACTAAGCTCGATCAAAAACTAAATTATGTGTGATACTATTGATTTGTGTGATACTGCTAGATCCAATTTTAGGGCT TAAGGCAATCCTACAAAAGGAGTGGTACTATTTATGAGAAAAGGAGCAAGATTCCGATAAATAAATGCAATAGATCAACT ATATTGATCAGAATGTTAAATTATCTTCCTATATGTACAGGGAGATAGGAACAATCTGAATGGGAAGCTTTAAATTTGAT GTCAAAACTTGCAGTTAAGAAGATATATATTGTGTAAATCAGAGCATAAGTAGTGTAAGAGTGATTGGCAGAAATATATT AAGATTGTATTGCTATGTGCACCAGGATGTAAGCATCTGTTTTAAGTAGAACACAATTGTAAGCATCTGATCACCCTTGA 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TTGTGAAAAACATCACTAACTTCTTAAATGTTCATCACTAGTTAAATTTAGTTACCTTGTTGTGTATATGGATGATTTTT TCATTACAGTTGATGATTAAAAAGGGATTGATTAGTTGAAACAACACTTGTTCAAGTATTTACAAACTAAAGATTTGGGC TAATTACGAAACTTTCTCGTGATTGATGTAGCTCAAAGACGTGTGTTTCTATATCTCAAAGGAGATTTGTTCTTGATATT CTAGAAGAAGCTAGAATGCTTGATTGTATAGCTGTTGACACACCTATAGACCACAATTTGAAACTTCTTCCTAATCAGGG GTATCTTGATCTAGGGAGGTACACAAGGTTAGTGGGGTTGTTGAATTATCTTAGGATGACTAGACCTAACATAGCCTTTT CAGTCAGTGCTGTGAGTCAGTTTCTTAACTCACCTTGTGATAGTAATTGGAATGCAGTCATCCGGATCCCAAGATACTTA AAAGGATCACCCGAAAAAGAACTTGTTTACACGGATAAGGGTCATAATGATGTCCTTGGAATATGCTGATGCATATTGGG TAGGTGATGTTACTTAATACTAGGAGGATCACTACTGATTATTGTTTTCTTTTTGAGAAAAACCTAATATGTTTTCCTTT GTGCATACTAAGGATCAACTTGCAGATATGTTAACAAAGTCTTTATGGGGTCCAAGGATAACATATAGATGTCACAAGTT TTGATAGATCCGATATATATACTCCAGCATCAAGAGAAGTGTTGAATATTTGTTATTAAATTTGTTATTTAGATTAGCAT AATCCTATAAAATTAGGAATTGAGTTTGTTACATAGTTTTTCTATTTAGATTAGTAATATCCCATTAAATTAGGGGTAGA ATTATATTTGACTTAAGAATATCCTCTTTTATGTATTTATAAATTGCAAAAGTCATATGATGAAATATACACAGAAAATA TATTAATCGCAATATCTTTCACACTTTTTATTTATTAAATGTGATCTAACAGTAATGTATTTTGTTTTCATATTTTATCT TTAAAAAAAATAGTGATATAAGAGTAATATAATATTTTTTTTTGCATGTAATAGAAAGTTATGTAAAGAGCGAAGATGAT GATACTTGCATTTGCATACAGTAACAAGGACACCAAATTTTACTCTCTAAATGTTTTGCATAAAAACTAAAGTGTAGGAA GAGGATGTCACAGACACACACTGACACATGTGTACATATATATATGTATGAATAACCACTAGCTTTGTGTTGCAGAATTT GGATCGGAAGGCATTGTGTCCATTAAAGGAGATGTTTACAGCTTCGGTATTATGCTTATGGAACTATTTACAACAAAGAG ACCAACAGATCAAATGTTTGTAGGGGGAATAAGTTTAAGGTCATGGATCCAAGAGTCAATGCCAAATAAGATTATTCAAG TTATAGACCCGAATCTGATGGAGGGAGAGGAACAATTTATTTCTGCCAAGGAAGCAGCTATATCAAATATCATGTTGTTG GCTTTGAATTGCTCTGCAGACTCCCTTGATGAGAGGATGAGTATGGATGAAGTCTTACGTCGCTTGATCAAAATCAAAAC CACATTTCAGCAAGGAAATTCAAGTTAGGAAAAACCATAAAGTCATATTGTATTGTCATAAAAGGCTTTTGTTGTAATAA TCTATTTGTTGAAAATTCTCACACTACACAAAAAATGACCTTTATTGCACCTACTTTTAACAATTTTATGTGAAAGTACT AAATAACAATTTTATAGAAGTTAAAGAATTATG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0067700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTGTCAGCATGCCAAGTCCCTCCAACAAATTTCTATCTTAAATAACAAAGTTGGGGGAATCATTCCAAGGTCTATTAA CAACTGCACCTCCCTCAAACGCTTATTTTTGGGAGGAAATTTTTTTACAGGTACCATACCTCATGAGATTGGTGACTACC TAAGAAACCTTGAAAAATTGCATTTGCAAGGTAACAGACTGAGAGGGTCTATTCCAACAAGCATCTTCAACATCTCAGGG CTAATTAGTTTGTCACTATCAAATAACCAACTGTCAGGCAACATTCCAATTAAAGCACATCATAGCATGTCCAACCTCCA GTTCTTGTACCTTTCAGCTAACAATCTCAGTGGAGAAATTCCCAGTGGCCTTTTCAATGCTACAGAGCTTCTTGAACTAG TACTTGCCAACAATACATTAACAGGAATCATACCTGAATCAGTTGGGAATTTAAGAAATCTCCAACTCTTTTATCTGATA GGGAACCAATTGACTAGTGATCCAGCCTCTTCAGAAATGGGTTTCCTAACTTCATTGACCAATTGTAGACAATTGGAAAA AATTCTGCTATCATTCAATCCTCTTAACGGAACACTTCCAAATTCTATTGGAAACTTTTCAAACACTCTACAAACTTTGG ATGCCTGGAGGTGTAATATCAAGGGTGAAATCCCTTCACAGATCGGCAATTTAAAGAACTTGTTTGACATCAATCTAAAC GAAAACCAACTTACAGGTCATGTTCCTAGTACAATTGGCACTTTGCAGCTTCTCCAACGTTTGGATCTTTCATTCAACAA ACTAAATGGTTTAATCCCAGATCAGATTTGCCATTTGCTTAAACTGAATGAGTTGCGCCTTAGCGAAAATCAGATTTCTG GGCCAGTTCCAGAATGCTTAAGGTTTCTTACTTCTCTAAGAAACCTTTACTTGGATTCCAATTACTTGAACGCTACAATA CCCTCTTCCCTTTGGAGCCTCACAGATATCTTGGAGGTGAACTTATCCTCTAATGGTTTTGTAGGGTCACTGCCAGATGA GTTAAGTGCCATGTTTGCTCTGATAAAATTGGACATATCAAACAATTACCTTTCAGGGGAACTTCCAATTGGTATTGGTG GCTTGCAAAAGATAATGAACTTGTCGTTAGCTAATAATATGTTACAAGGGCGTATTCCTGATTCAGTTGGAAACATGTTA AGCTTGGAATTTTTGGACCTTTCTCATAACCTTTTATCAGGCATCATCCCCAAGTCAATTGAGAAACTTCTTTATCTCAA ATCCATCAACTTGTCTTATAATAAACTAGAAGGTGAAATTCCTTCTGGTGGCAGTTTCATAAATTTCACAGCTCAATCCT TCAACATGAACTCAGCACTTTGTGGGAAACCTGAGCTAGAAGTACCACCATGTCCAAGTCATAGTGCGAAACATAACAGG ACAAGAAACAAACTTTTACTGAAATTGATTATACCATTAATTTTTGCTGGCATGTTTCTTGTTTTTGCAATTCTTCTGAT ATACCGGAAACAATGCAACAGAGGTTCAAATAACTTGGATTTTCCAACACTTCTAACTACAAGTAGAATTCCCTACCATG AGCTTGTGGAGGCAACACATAAATTTGACGACAGCAATCTTGTTGGAAGAGGAAGTTTTGGTTCTGTGTACAAGGGTAAG CTTTCAAATGGACTAATGGTTGCAATTAAAGTATTCCATTTTGAGAATGAGCAAGAAACATCAAGGAGTTTTGATAAGGA ATGTGAAGCATTGTGCAATCTTCGCCATCGTAATCTAGTTAAAGTCATCACTAGTTGTTCCAATGCCTTTGATTTCAAGG CCCTGGTAATGGAATTTGTGCCTAACGGGGACTTGGAGAAGTGGTTGTATTCTCATAACTATTTCCTAAGTTTCATGCAA AGACTAAACATAGTGATAGATATTGCATCTGCCTTGGAGTATCTCCATCATGATAACCCCAACTCTGTTGTGCACTGTGA CCTGAAGCCAAGCAATGTTTTGTTGGATGAAGATATGGTAGCTCATGTGTGTGATTTTGGCATATCTAAACTCTTGGAAG AAGGGCAACTTCAAGTGCATACAAACACTCTTGCAACTCCTGGTTATATTGCACCAGAATTTGGATCGGAAGGCATTGTG TCCATTAAAGGAGATGTTTACAGCTTCGGTATTATGCTTATGGAACTATTTACAACAAAGAGACCAACAGATCAAATGTT TGTAGGGGGAATAAGTTTAAGGTCATGGATCCAAGAGTCAATGCCAAATAAGATTATTCAAGTTATAGACCCGAATCTGA TGGAGGGAGAGGAACAATTTATTTCTGCCAAGGAAGCAGCTATATCAAATATCATGTTGTTGGCTTTGAATTGCTCTGCA GACTCCCTTGATGAGAGGATGAGTATGGATGAAGTCTTACGTCGCTTGATCAAAATCAAAACCACATTTCAGCAAGGAAA TTCAAGTTAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0067700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MCQHAKSLQQISILNNKVGGIIPRSINNCTSLKRLFLGGNFFTGTIPHEIGDYLRNLEKLHLQGNRLRGSIPTSIFNISG LISLSLSNNQLSGNIPIKAHHSMSNLQFLYLSANNLSGEIPSGLFNATELLELVLANNTLTGIIPESVGNLRNLQLFYLI GNQLTSDPASSEMGFLTSLTNCRQLEKILLSFNPLNGTLPNSIGNFSNTLQTLDAWRCNIKGEIPSQIGNLKNLFDINLN ENQLTGHVPSTIGTLQLLQRLDLSFNKLNGLIPDQICHLLKLNELRLSENQISGPVPECLRFLTSLRNLYLDSNYLNATI PSSLWSLTDILEVNLSSNGFVGSLPDELSAMFALIKLDISNNYLSGELPIGIGGLQKIMNLSLANNMLQGRIPDSVGNML SLEFLDLSHNLLSGIIPKSIEKLLYLKSINLSYNKLEGEIPSGGSFINFTAQSFNMNSALCGKPELEVPPCPSHSAKHNR TRNKLLLKLIIPLIFAGMFLVFAILLIYRKQCNRGSNNLDFPTLLTTSRIPYHELVEATHKFDDSNLVGRGSFGSVYKGK LSNGLMVAIKVFHFENEQETSRSFDKECEALCNLRHRNLVKVITSCSNAFDFKALVMEFVPNGDLEKWLYSHNYFLSFMQ RLNIVIDIASALEYLHHDNPNSVVHCDLKPSNVLLDEDMVAHVCDFGISKLLEEGQLQVHTNTLATPGYIAPEFGSEGIV SIKGDVYSFGIMLMELFTTKRPTDQMFVGGISLRSWIQESMPNKIIQVIDPNLMEGEEQFISAKEAAISNIMLLALNCSA DSLDERMSMDEVLRRLIKIKTTFQQGNSS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 173 173 3.5E-42
Phobius 1 484 484 -
SUPERFAMILY 4 126 123 2.49E-23
PANTHER 5 161 157 9.7E-266
PANTHER 5 161 157 9.7E-266
SMART 54 78 25 6.1
Pfam 55 116 62 6.5E-8
ProSiteProfiles 56 78 23 6.418
ProSiteProfiles 80 102 23 5.918
PANTHER 102 802 701 9.7E-266
SUPERFAMILY 102 442 341 1.8E-62
PANTHER 102 802 701 9.7E-266
SMART 103 127 25 1.3
ProSiteProfiles 105 127 23 6.349
ProSiteProfiles 129 150 22 5.001
SMART 151 174 24 86.0
ProSiteProfiles 153 174 22 5.494
Gene3D 174 480 307 1.9E-87
SMART 255 278 24 43.0
ProSiteProfiles 257 278 22 5.956
PRINTS 258 271 14 4.3E-5
Pfam 258 316 59 2.1E-9
SMART 279 302 24 180.0
ProSiteProfiles 281 301 21 5.587
SMART 303 327 25 8.6
ProSiteProfiles 305 328 24 5.502
ProSiteProfiles 353 376 24 4.801
Pfam 377 436 60 6.4E-7
PRINTS 399 412 14 4.3E-5
SMART 399 422 24 25.0
ProSiteProfiles 401 422 22 7.165
ProSiteProfiles 425 447 23 5.363
Phobius 485 508 24 -
TMHMM 485 507 23 -
Phobius 509 829 321 -
Gene3D 516 619 104 2.2E-24
SUPERFAMILY 517 821 305 1.34E-71
ProSiteProfiles 542 823 282 37.29
SMART 542 823 282 2.7E-36
Pfam 547 815 269 1.2E-43
ProSitePatterns 548 570 23 -
Gene3D 620 828 209 2.3E-55
ProSitePatterns 663 675 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0067700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…