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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0449000 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0449000.1 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exportin-1; TAIR: AT5G17020.1 exportin 1A; Swiss-Prot: sp|Q9SMV6|XPO1A_ARATH Protein EXPORTIN 1A; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SEC4|A0A0S3SEC4_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0449000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:94269514..94284180) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGGTGAGAAAAAAAATTAAAATTAATAAATAATTAAAGTCTGCTTCAAATTCAAGCTGTCTCTCCCTATATAAACACC ATACAAAGTCCAAAAGAGCCTCTTCCTCCCTCCCTTTTCTCCCTCAAATCTCTATTCTCTTCTCTCCCGCTCTGTGGTTT CCAGGGTTTATCACTCTCCCTCCGCCATGGCCGCCGAGAAGCTCCGAGACTTGTCCCAACCCATCGATGTCCCGTTACTC GACGCCACTGTCGCTGCCTTCTACGGCACCGGATCTAAAGAACAGGTCACACTCCCTCACTCTCCGCTCATCCTTCGTTA CTTTTCGCTGTTCCTGAATGCTTCGAAACAGTGAAACAATTCAAAACTGATTCAGTTCCGTGTTTGGATTTTCGTTTAAC TTAATGCCGATTCATGCTAGAGTCAACTTGGTAGAGTTGAAGCAGCATCGATAATGTAGAAAGAAATAGTGATGTTTGTT TGGTTAACGATTGCTTTCATTTTCCACAATGCAGAGAACTGCTGCTGACCAGATTTTGCGCGATTTGCAAAACAATCCAG ATATGTGGCTTCAAGTCATGCATATTCTACAGAACACTCAGAATCTCAATACCAAGTTCTTTGCTCTGCAGGTTAGTTTG TTCAACGATCCATTGGTCATGTAATACAAGAGTCGAAATCGTTCCCACAAGGATTAGCTAGTAGCTACTAACTAATGGAT TAACAAACTCTATAGTTATATTGATAATCAGAATGAGATGAATTATTCCATCTAATTAAAAGTGAACAATAACAAATTGA AGAGAGTTCTGTGCAACACAAGAGGAATTTTGTATGGAAATACTCAGGGCTGTCCAGTTCGGGTTTTACTTGAATCCAAT TGTTTAATTCACTAATTAACAATTAGTCTAATAAGCCCTTTGTGTTTTCAAGTTCTATTAGCAATTAGTGGTCATGATTT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0449000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCCGCCGAGAAGCTCCGAGACTTGTCCCAACCCATCGATGTCCCGTTACTCGACGCCACTGTCGCTGCCTTCTACGG CACCGGATCTAAAGAACAGAGAACTGCTGCTGACCAGATTTTGCGCGATTTGCAAAACAATCCAGATATGTGGCTTCAAG TCATGCATATTCTACAGAACACTCAGAATCTCAATACCAAGTTCTTTGCTCTGCAGGTGCTAGAAGGTGTAATTAAATAT AGATGGAACGCATTACCACTTGAGCAGCGAGATGGAATGAAAAATTTCATCTCTGATATTATTGTGCAGCTTTCTGGCAA TGAGGCCTCATTTCGAATGGAGCGGTTGTATGTCAATAAGCTCAATATTATATTAGTTCAGATTTTGAAGCATGAGTGGC CCCTGAGATGGCGAAGTTTTATTCCCGACCTTGTTTCTGCAGCTAAAACTAGTGAAACAATTTGTGAGAATTGTATGGCA ATATTGAAGCTCTTGAGTGAAGAGGTTTTTGATTTTTCAAGAGGAGAGATGACTCAGCAGAAGATTAAAGAGCTTAAACA ATCCTTGAATAGTGAATTTCAGCTCATACATGAGTTATGCTTATATGTGTTGTCAGCATCCCAACGGGCCGAACTTATAC GTGCAACTCTGTCTACATTGCATGCCTTCTTATCATGGATCCCCTTGGGTTATATATTTGAATCACCGTTGCTTGAGACC CTGCTAAAGTTTTTCCCTCTTCCAGTATATCGAAACCTTACACTGAAATGCTTAATTGAGGTGGCAGCCCTTCAATTTGG CGATTACTATGATACACAGTATACTAAGATGTATAACATATTCATGGTTCAGTTGCAGACAATACTCCTACCTACTACAA ATATACCTGAGGCATATGCACAGGGTTCTAGTGAGGAACAAACATTCATACAGAACTTGGCACTGTTCTTTACCTCATTT TACAAGGTTCACATTCGAATTTTGGAATCCACTCAAGAGAATATCGCTGCTTTGCTATCTGGTCTTGAATATCTTATCAA CATCTCATATGTCGATGATACTGAGGTTTTTAAGGTTTGTCTGGACTACTGGAATATCTTGGTTTCGGAACTGTTTGAGC CACATCGTAGCTTGGAGAACCCTGCAGCTGCAGCTACAAACATGTTAGGAAATCAGGCGCCACTGATGCCTCCTGGTATG GTTGATGGCCTTGGTTCACAGCTTCTTCAACGCCGGCAGCTTTATGCCGGTCCGATGTCAAAGTTGAGAACGCTTATGAT CTGCCGTATGGCTAAACCAGAAGAGGTTCTCATCATTGAAGATGAAAATGGCAATATTGTCCGCGAAACCCTCAAAGACA ATGATGTTCTTGTTCAATATAAGATTATGAGGGAGACTCTTATTTACTTGTCGCATCTTGACCATGATGATACAGAAAGA CAGATGCTTAGAAAATTAAGTAAACAACTTGGTGGTGAGGATTGGACATGGAACAATTTGAACACACTATGCTGGGCCAT AGGATCTATATCTGGTTCCATGATGGAAGATCAGGAAAACAGATTTTTAGTGATGGTCATTCGTGATTTATTGAATCTAT GTGAATTCACAAAGGGAAAGGACAACAAAGCTGTTATTGCAAGTAATATCATGTATGTCGTGGGGCAGTATCCGCGGTTC TTGAGAGCTCATTGGAAGTTTCTAAAAACTGTTGTGAATAAGTTATTTGAGTTTATGCATGAGTCACATCCTGGAGTTCA GGATATGGCATGTGACACTTTTTTGAAAATAGTCCAGAAGTGTAAGCGTAAATTTGTAATCACCCAGCTTGGCGAAAATG AGCCATTTGTATCTGAACTTCTTTCTGGTCTTTCAACTACGATTGTAGATCTTGAACCCCATCAAATACACACTTTCTAC GAATCTGTCGGCAGTATGGTTCAAGCTGAGTCTGATTCACAGAAGAGAGATGAATACCTCCAGCGGTTGATGCATCTCCC CAATCAGAAATGGCTGGAAATTATAGGGCAGGCACGTCAGAATGTTGATTTTCTTAAGGATCATGATGTTATCCGAACTG TGCTTAACATATTGCAGACAAATACAAGCGTTGCATCTTCTTTAGGAACATATTTCCTTCCTCAAATCTCATTGATCTTT TTGGACATGTTGAACGTTTACAGAATGTATAGTGAGCTTATATCAAAAAGTATTGCTGAAGGGGGTCCATATGCATCCAG GACATCGTTTGTAAAACTTCTGCGATCGGTTAAGAGAGAGACACTTAAACTAATTGAGACATTTTTGGACAAAGCTGAAG ATCAACCACAAATTGGAAAACAATTTGTGCCACCAATGATGGATCCTGTTCTCGGAGATTATGCCAGGAACGTGCCTGAT GCAAGGGAATCAGAGGTTTTGTCACTTTTTGCCACAATTGTAAATAAATATAAAGCTGCAATGGTTGAAGATGTCCCCCG CATATTTGAAGCTGTTTTCCAGTGTACACTAGAGATGATTACCAAAAATTTCGAAGATTACCCAGAGCATCGGCTAAAGT TCTTCTCTTTACTTTGTGCTATAGCTACTCATTGTTTCCATGCATTAATCTGCTTGTCGAGTCAGCAACTGAAGTTTGTC ATGGATTCAATCATATGGGCATTTCGGCATACAGAAAGAAACATAGCTGAAACTGGGCTGAACCTGTTGTTGGAGATGCT AAAGAAGTTTCAGGCCACGGAGTTCTGTAATCAGTTTTATCGTACATATTTTTTGACAATAGAGCAAGAGATATTTGCTG TCTTGACGGACACTTTTCATAAGCCTGGGTTCAAATTACATGTCTTGGTGCTTCAACATTTGTTTTGTCTGGCAGAAACT GGTGCCCTGACTGAGCCTCTTTGGGATGCTGCTACAAATCCTTATCCGTACCCAAGTAATGCAGCTTTTGTACTTGAGTA CACAATAAAACTTTTAAGCACTTCATTTCCCAACATGACTGCTGCAGAGGTTACCCAATTTGTTAATGGACTCTTTGAGT CCACAAATGACCTCTCCACATTTAAAAATCACATACGAGATTTTCTTGTACAGTCAAAAGAATTTTCAGCTCAGGATAAC AAAGATCTTTATGCTGAAGAGGCGGCAGCACAGAGAGAGCGAGAACGACAAAGAATGCTTTCTGTTCCAGGTCTTATAGC CCCAAGCGAGTTGCAAGATGAAATGTTGGACTCATAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0449000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAAEKLRDLSQPIDVPLLDATVAAFYGTGSKEQRTAADQILRDLQNNPDMWLQVMHILQNTQNLNTKFFALQVLEGVIKY RWNALPLEQRDGMKNFISDIIVQLSGNEASFRMERLYVNKLNIILVQILKHEWPLRWRSFIPDLVSAAKTSETICENCMA ILKLLSEEVFDFSRGEMTQQKIKELKQSLNSEFQLIHELCLYVLSASQRAELIRATLSTLHAFLSWIPLGYIFESPLLET LLKFFPLPVYRNLTLKCLIEVAALQFGDYYDTQYTKMYNIFMVQLQTILLPTTNIPEAYAQGSSEEQTFIQNLALFFTSF YKVHIRILESTQENIAALLSGLEYLINISYVDDTEVFKVCLDYWNILVSELFEPHRSLENPAAAATNMLGNQAPLMPPGM VDGLGSQLLQRRQLYAGPMSKLRTLMICRMAKPEEVLIIEDENGNIVRETLKDNDVLVQYKIMRETLIYLSHLDHDDTER QMLRKLSKQLGGEDWTWNNLNTLCWAIGSISGSMMEDQENRFLVMVIRDLLNLCEFTKGKDNKAVIASNIMYVVGQYPRF LRAHWKFLKTVVNKLFEFMHESHPGVQDMACDTFLKIVQKCKRKFVITQLGENEPFVSELLSGLSTTIVDLEPHQIHTFY ESVGSMVQAESDSQKRDEYLQRLMHLPNQKWLEIIGQARQNVDFLKDHDVIRTVLNILQTNTSVASSLGTYFLPQISLIF LDMLNVYRMYSELISKSIAEGGPYASRTSFVKLLRSVKRETLKLIETFLDKAEDQPQIGKQFVPPMMDPVLGDYARNVPD ARESEVLSLFATIVNKYKAAMVEDVPRIFEAVFQCTLEMITKNFEDYPEHRLKFFSLLCAIATHCFHALICLSSQQLKFV MDSIIWAFRHTERNIAETGLNLLLEMLKKFQATEFCNQFYRTYFLTIEQEIFAVLTDTFHKPGFKLHVLVLQHLFCLAET GALTEPLWDAATNPYPYPSNAAFVLEYTIKLLSTSFPNMTAAEVTQFVNGLFESTNDLSTFKNHIRDFLVQSKEFSAQDN KDLYAEEAAAQRERERQRMLSVPGLIAPSELQDEMLDS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 1061 | 1061 | 0.0 | ||
| Phobius | 1 | 707 | 707 | - | – | |
| PANTHER | 2 | 1077 | 1076 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 1077 | 1076 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 22 | 1027 | 1006 | 2.15E-116 | ||
| ProSiteProfiles | 37 | 103 | 67 | 15.253 | ||
| Pfam | 37 | 103 | 67 | 8.5E-14 | ||
| SMART | 37 | 103 | 67 | 3.8E-10 | ||
| Pfam | 115 | 258 | 144 | 5.6E-40 | ||
| Pfam | 337 | 372 | 36 | 9.9E-19 | ||
| Pfam | 411 | 478 | 68 | 2.3E-29 | ||
| Pfam | 492 | 541 | 50 | 3.8E-27 | ||
| Phobius | 708 | 727 | 20 | - | – | |
| SMART | 715 | 1037 | 323 | 2.4E-187 | ||
| Pfam | 715 | 1036 | 322 | 6.9E-127 | ||
| Phobius | 728 | 851 | 124 | - | – | |
| Phobius | 852 | 870 | 19 | - | – | |
| Phobius | 871 | 1078 | 208 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nuclear export signal receptor activity | Combining with a nuclear export signal (NES) on a cargo to be transported, to mediate transport of a the cargo through the nuclear pore, from the nuclear lumen to the cytoplasm. The cargo can be either a RNA or a protein. | ||
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. | ||
| Molecular function | Ran GTPase binding | Interacting selectively and non-covalently with Ran, a conserved Ras-like GTP-binding protein, implicated in nucleocytoplasmic transport, cell cycle progression, spindle assembly, nuclear organization and nuclear envelope (NE) assembly. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0449000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…