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LotjaGi2g1v0449000.6

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0449000
Transcript ID LotjaGi2g1v0449000.6
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Exportin-1; TAIR: AT5G17020.2 exportin 1A; Swiss-Prot: sp|Q9SMV6|XPO1A_ARATH Protein EXPORTIN 1A; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9V7V7|A0A0L9V7V7_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0449000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:94270342..94283994) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGCCGCCGAGAAGCTCCGAGACTTGTCCCAACCCATCGATGTCCCGTTACTCGACGCCACTGTCGCTGCCTTCTACGG CACCGGATCTAAAGAACAGGTCACACTCCCTCACTCTCCGCTCATCCTTCGTTACTTTTCGCTGTTCCTGAATGCTTCGA AACAGTGAAACAATTCAAAACTGATTCAGTTCCGTGTTTGGATTTTCGTTTAACTTAATGCCGATTCATGCTAGAGTCAA CTTGGTAGAGTTGAAGCAGCATCGATAATGTAGAAAGAAATAGTGATGTTTGTTTGGTTAACGATTGCTTTCATTTTCCA CAATGCAGAGAACTGCTGCTGACCAGATTTTGCGCGATTTGCAAAACAATCCAGATATGTGGCTTCAAGTCATGCATATT CTACAGAACACTCAGAATCTCAATACCAAGTTCTTTGCTCTGCAGGTTAGTTTGTTCAACGATCCATTGGTCATGTAATA CAAGAGTCGAAATCGTTCCCACAAGGATTAGCTAGTAGCTACTAACTAATGGATTAACAAACTCTATAGTTATATTGATA ATCAGAATGAGATGAATTATTCCATCTAATTAAAAGTGAACAATAACAAATTGAAGAGAGTTCTGTGCAACACAAGAGGA ATTTTGTATGGAAATACTCAGGGCTGTCCAGTTCGGGTTTTACTTGAATCCAATTGTTTAATTCACTAATTAACAATTAG TCTAATAAGCCCTTTGTGTTTTCAAGTTCTATTAGCAATTAGTGGTCATGATTTTACTGATATTATGATCTCTAGCTAAG CCCTATACTTGGTCCATAAGAAATGAATTGAGCGGGAAAAAATTAAGAACAAAATTCTAATTAATCCTATCAGTTAATTC AATCAATGAACAAGAACTAAAATTTGTCATTGAATAATTCTTAACCTGGTTTTAATATACGGCTAGTTTCTGGTGCTTTT TGGGCTTGTTTTTTTATTTCTTTAATGAAAAGGGTCAGGGATACCAGACTAGTATCCTTCCAAAATACCCTCGTCACATT CTTAGAGAAATCAAACCCTACTTTGGTCGTTACTAACCACTACCATTGATTTATGTGACATTTATGACTCTCCAATGAAA CATGTCTCCTTTCTTATCGTTTCTAGTTTTTTTTTATCGTTTCTGGTCCCCATTGGTCCCCCTTTTCTCGACACTTCTCT CCATCTACTCCCATGTTTCCTAATGTGATATTTGTTTATTGTTGTGCTCTTTTTTGTTATTGTTGTGGGATAGTTAGATT ATGATTATTAACTAGGATTTAAGTATAGGTAATAGGAAAGAAGTTTGCAGTTTGTCATCGTATTGATATTTACTGGAGGG GTTGAAGACTTGAACTTAAGGTTTTTTATGGCTTATTTTGATTTATGGCTTAGATCTTTGATTATTTTAAGGTTTTTTAT ATGATATATTGGGTCATGTTTCAACTTATGACATTCTTTTTTTGTGTCATGTATCTTACGATACATAAAAATATTTGATT CATGATTCGAAAAAATAGGTTCTCCAATTCAGGTTTTGAATCTCGACTCAATAATCATAATGAAGAATACCACAAAATTT ATTGAAGTTTCAAATATTAACAATACAACATCAGATGGGCTAGATTACATTTGCTATATTTGTTGAAATCTTAACCTGTA TAGTTCAGTTGTCTAGAGGGCTTGTGGAAAGTCATATTTTCACATCACTTTGTTGGATAGAGCCATTGACTTGTTTACTT GTGTATTATGTTTTCTTTGACATGTTTACATGGGTGGTCTTTTGGTCCCCCTTCCATTTTTACTTCTGCTTCTAGCTTGT TGTTAGTTAAGTGTGTTTGGAAGAAACTATTATCAGGTGTCAAACAAGTGCTCTACGTTGTTGCGATAATTTCACTCTAA 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AAATATATGTCTAAAACAGGTGTCATGTACTGTTAGAATCCTTGCTATTGATTGAGGAATGTGGTGACCAACCCTAGAAT GCTATAGCAGGGGATGGCTGCTATACCCGAGATTGTAGATTTAAGATAATTTATAACCAAAATTCATAGTTTAAACACAA TATCCCAATCAATCATAGGCATTGGTATTGGGGCTGCAAAGAGCAATGATAAAAACAGGAATGGAGTATAAAAGAAAAAG AAACATGGTGGAGTTGAAGGAAAATAATAGACCATATTAGATAAAAATTAGGAGATTGTGAACTGTGCGGTGTGGAGGAA TAAGAAAGGGAAAAAACAGAGGCCTGTCTAGTGTGGCGACTGGCGAACGAAGAAAGAGACATGCAAGCAGTGGGTCAGTG GTTTAAACTTTAAAGTGTTATGGTTGACTGGAAATGACACCAGTGAACACTGGTTTATGGTGTGTCAGGTTTTCAGATGA TAGATTTGTCAAGGATCAGGTTTATTTTACTTGAATTATTGAGGAAGGTTTGAAACATTATTTTATTTTATCCAACAAAT GCATGAGATATCAGATGGCTCCAGTTCAGCGTAGTGACCTTGGAAGCCACTATATCCTGCTACAGCAGTCACGATTTCTG GTGTGAAGGTCGCATCATGAAAAAGCTCCCATAGCAACCACCTACTGTGACATGAAGTAATAGAGCTAAGTCACGCGTAC CACATACGATTCATAACTGGTTGGAATTTGCCATAAACAGTTTTCTTAATTCTACCCTTGACTGACAAAATATATTAGCG ATAGCTAGGTGATACAGAAGTGGTCTGAATCAATGACACTACTGTCACATACGATTCATTAATGGTTGGAGTTTGACATG AGCAGTTTTCGTCTGCAAAAATATATTAGTGATAACTAGGTGGTACAGAAACAGTCTGAATCAGTTTGGCTGCTACTAGA 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TCCATCCTTCCAGTTCCAGAGGATGTGAATCTTTTCCATACATGTTCTCTACTTGGTATTTGATAAATGACAGCAACAAT TGTGATCATTATTTCAGCTTGGCGAAAATGAGCCATTTGTATCTGAACTTCTTTCTGGTCTTTCAACTACGATTGTAGAT CTTGAACCCCATCAAATACACACTTTCTACGAATCTGTATGCAATTTCTCTCTTTTATCTAATGTTCATTTGTTATGATT TTTATCCTATATTTTATCTTTAGTATGCACCTGTTCAAGTAATATTATCCGATTGTAGGTCGGCAGTATGGTTCAAGCTG AGTCTGATTCACAGAAGAGAGATGAATACCTCCAGCGGTTGATGCATCTCCCCAATCAGGTACTCTGCATGCTTGAGAAG CCATATTATTTCTTAAATCTCTTGTACAAACTCACTTCATTGTTTGCTTAAGCCACGTGCTATAACAATTTCTGAGGTCC TTCTCATTTCTTCTACAGAAATGGCTGGAAATTATAGGGCAGGCACGTCAGAATGTTGATTTTCTTAAGGATCATGATGT TATCCGAACTGTGCTTAACATATTGCAGGTATAACTTTGTAGTAATTTTTATGTGATTCTGCTCTGTTTAATATTTGAAT ATGAATCTGCATGGAATTTTTTGGTCATCTGTAGTAAGTTCAATTTATTGTTTGATCTTTACTCTGCAAAATTCTTACAC TCTAGTCTTGTCAGTGGGGGAATCATTTATCTGTTTTTCCTTCAAGTACTAGTAAACCCTAATCCCAAAATCTTTCAAGC ACTTGTAGATGAACAGAATAAAAATGAGTCGTCTACATTTCTCTTCCTGTGTGTACTTGATGCAGTGCAACATACGGTCT TCGGTTTTAATCCTGCTAGTGGATCTTGGAACAGGCAACCCCCTTCCTGCTAAGCTTTAGTTGTTAAGAAAGATTAGTCA AATTACTTGTTTACTGAACTTTAGAATTGGAATCGGTATTAAATGATTGAACTGTGCTAGTTCTTTGATCATAAGGGCCA TGGTTTGGTCACTTTTCCTTTTGTTAGGTTTCTACTAACCTTAGATGTGTGATTGTTACATGAGCCAATAATTTTTAAAG CTTAAGTTGTTTGTTGAAGACTCAACTTGTTTTATATTACATCTCTAAAACGCCCTTTCATGTAAGGAGCAACTTGAGGT TTGGACAATGCATAAGATCATTTATTGTTTGCTGAAATTTAAGAGTTTATTAGAATAATACCGGTGGCAAGAGCTGAACT CTGTAAAGATCCCATCACGTAGAGATGGCTAAAGTAGTGCTTGTGAAGTCTTGGGCTATCCTCATCTATGAACTGACTTT TGGGGTTGAGTTAGGCTCAGTATAAATTTAAGATGATGTTAAAGCCTATTTCAGATTCTACATTGGGCCACTCTGCTAAA AAATCTACCTGGCCTTGTGGATTTCCCATTGCAATCTATCTGGCCTTGCAGATTTCCCATTGCAATCTATCTAGCCTTGC GGATTTTCGAGTGCTAAATTTCCAGTTCTGGGCATGGGAGGGATTTGTTAAGATCCCAAATTGACAAGAAATATGGCCAA ATAGAGCTACAAAGACTTTTTTTTGTCGAAGGCTCACGAGCTAGCTTTTGGGGGTTAGCGTTAGACCTTGTTTATAAAGG ATCAAGTCCCATGTCATGACCATCTATTCCATTTTCAAGCTGTTTTGTGAAGACATGACTGGTTGTATATTAGATCTCTA ACTGTTATTATCCGTAGTCAATTCTAAGGTCTGCAGTTCTTGTTGGTTTTATCCCCTAATTTATGACAATACTTTTGTGC TATGGTCACTCCAATTGCAGACAAATACAAGCGTTGCATCTTCTTTAGGAACATATTTCCTTCCTCAAATCTCATTGATC 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CCATACAATGTAGCAAGATGTATTGCAACTTATTATATTTTAACAGTATTTCAGTCCTGAGGTTTATTAATTGTTCCCTC TCCACTGCAGGATAACAAAGATCTTTATGCTGAAGAGGCGGCAGCACAGAGAGAGCGAGAACGACAAAGAATGCTTTCTG TTCCAGGTCTTATAGCCCCAAGCGAGTTGCAAGATGAAATGTTGGACTCATAG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0449000.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCCGCCGAGAAGCTCCGAGACTTGTCCCAACCCATCGATGTCCCGTTACTCGACGCCACTGTCGCTGCCTTCTACGG CACCGGATCTAAAGAACAGAGAACTGCTGCTGACCAGATTTTGCGCGATTTGCAAAACAATCCAGATATGTGGCTTCAAG TCATGCATATTCTACAGAACACTCAGAATCTCAATACCAAGTTCTTTGCTCTGCAGGTGCTAGAAGGTGTAATTAAATAT AGATGGAACGCATTACCACTTGAGCAGCGAGATGGAATGAAAAATTTCATCTCTGATATTATTGTGCAGCTTTCTGGCAA TGAGGCCTCATTTCGAATGGAGCGGTTGTATGTCAATAAGCTCAATATTATATTAGTTCAGATTTTGAAGCATGAGTGGC CCCTGAGATGGCGAAGTTTTATTCCCGACCTTGTTTCTGCAGCTAAAACTAGTGAAACAATTTGTGAGAATTGTATGGCA ATATTGAAGCTCTTGAGTGAAGAGGTTTTTGATTTTTCAAGAGGAGAGATGACTCAGCAGAAGATTAAAGAGCTTAAACA ATCCTTGAATAGTGAATTTCAGCTCATACATGAGTTATGCTTATATGTGTTGTCAGCATCCCAACGGGCCGAACTTATAC GTGCAACTCTGTCTACATTGCATGCCTTCTTATCATGGATCCCCTTGGGTTATATATTTGAATCACCGTTGCTTGAGACC CTGCTAAAGTTTTTCCCTCTTCCAGTATATCGAAACCTTACACTGAAATGCTTAATTGAGGTGGCAGCCCTTCAATTTGG CGATTACTATGATACACAGTATACTAAGATGTATAACATATTCATGGTTCAGTTGCAGACAATACTCCTACCTACTACAA ATATACCTGAGGCATATGCACAGGGTTCTAGTGAGGAACAAGTTCACATTCGAATTTTGGAATCCACTCAAGAGAATATC GCTGCTTTGCTATCTGGTCTTGAATATCTTATCAACATCTCATATGTCGATGATACTGAGGTTTTTAAGGTTTGTCTGGA CTACTGGAATATCTTGGTTTCGGAACTGTTTGAGCCACATCGTAGCTTGGAGAACCCTGCAGCTGCAGCTACAAACATGT TAGGAAATCAGCAGGCGCCACTGATGCCTCCTGGTATGGTTGATGGCCTTGGTTCACAGCTTCTTCAACGCCGGCAGCTT TATGCCGGTCCGATGTCAAAGTTGAGAACGCTTATGATCTGCCGTATGGCTAAACCAGAAGAGGTTCTCATCATTGAAGA TGAAAATGGCAATATTGTCCGCGAAACCCTCAAAGACAATGATGTTCTTGTTCAATATAAGATTATGAGGGAGACTCTTA TTTACTTGTCGCATCTTGACCATGATGATACAGAAAGACAGATGCTTAGAAAATTAAGTAAACAACTTGGTGGTGAGGAT TGGACATGGAACAATTTGAACACACTATGCTGGGCCATAGGATCTATATCTGGTTCCATGATGGAAGATCAGGAAAACAG ATTTTTAGTGATGGTCATTCGTGATTTATTGAATCTATGTGAATTCACAAAGGGAAAGGACAACAAAGCTGTTATTGCAA GTAATATCATGTATGTCGTGGGGCAGTATCCGCGGTTCTTGAGAGCTCATTGGAAGTTTCTAAAAACTGTTGTGAATAAG TTATTTGAGTTTATGCATGAGTCACATCCTGGAGTTCAGGATATGGCATGTGACACTTTTTTGAAAATAGTCCAGAAGTG TAAGCGTAAATTTGTAATCACCCAGCTTGGCGAAAATGAGCCATTTGTATCTGAACTTCTTTCTGGTCTTTCAACTACGA TTGTAGATCTTGAACCCCATCAAATACACACTTTCTACGAATCTGTCGGCAGTATGGTTCAAGCTGAGTCTGATTCACAG AAGAGAGATGAATACCTCCAGCGGTTGATGCATCTCCCCAATCAGAAATGGCTGGAAATTATAGGGCAGGCACGTCAGAA TGTTGATTTTCTTAAGGATCATGATGTTATCCGAACTGTGCTTAACATATTGCAGACAAATACAAGCGTTGCATCTTCTT TAGGAACATATTTCCTTCCTCAAATCTCATTGATCTTTTTGGACATGTTGAACGTTTACAGAATGTATAGTGAGCTTATA TCAAAAAGTATTGCTGAAGGGGGTCCATATGCATCCAGGACATCGTTTGTAAAACTTCTGCGATCGGTTAAGAGAGAGAC ACTTAAACTAATTGAGACATTTTTGGACAAAGCTGAAGATCAACCACAAATTGGAAAACAATTTGTGCCACCAATGATGG ATCCTGTTCTCGGAGATTATGCCAGGAACGTGCCTGATGCAAGGGAATCAGAGGTTTTGTCACTTTTTGCCACAATTGTA AATAAATATAAAGCTGCAATGGTTGAAGATGTCCCCCGCATATTTGAAGCTGTTTTCCAGTGTACACTAGAGATGATTAC CAAAAATTTCGAAGATTACCCAGAGCATCGGCTAAAGTTCTTCTCTTTACTTTGTGCTATAGCTACTCATTGTTTCCATG CATTAATCTGCTTGTCGAGTCAGCAACTGAAGTTTGTCATGGATTCAATCATATGGGCATTTCGGCATACAGAAAGAAAC ATAGCTGAAACTGGGCTGAACCTGTTGTTGGAGATGCTAAAGAAGTTTCAGGCCACGGAGTTCTGTAATCAGTTTTATCG TACATATTTTTTGACAATAGAGCAAGAGATATTTGCTGTCTTGACGGACACTTTTCATAAGCCTGGGTTCAAATTACATG TCTTGGTGCTTCAACATTTGTTTTGTCTGGCAGAAACTGGTGCCCTGACTGAGCCTCTTTGGGATGCTGCTACAAATCCT TATCCGTACCCAAGTAATGCAGCTTTTGTACTTGAGTACACAATAAAACTTTTAAGCACTTCATTTCCCAACATGACTGC TGCAGAGGTTACCCAATTTGTTAATGGACTCTTTGAGTCCACAAATGACCTCTCCACATTTAAAAATCACATACGAGATT TTCTTGTACAGTCAAAAGAATTTTCAGCTCAGGATAACAAAGATCTTTATGCTGAAGAGGCGGCAGCACAGAGAGAGCGA GAACGACAAAGAATGCTTTCTGTTCCAGGTCTTATAGCCCCAAGCGAGTTGCAAGATGAAATGTTGGACTCATAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0449000.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAAEKLRDLSQPIDVPLLDATVAAFYGTGSKEQRTAADQILRDLQNNPDMWLQVMHILQNTQNLNTKFFALQVLEGVIKY RWNALPLEQRDGMKNFISDIIVQLSGNEASFRMERLYVNKLNIILVQILKHEWPLRWRSFIPDLVSAAKTSETICENCMA ILKLLSEEVFDFSRGEMTQQKIKELKQSLNSEFQLIHELCLYVLSASQRAELIRATLSTLHAFLSWIPLGYIFESPLLET LLKFFPLPVYRNLTLKCLIEVAALQFGDYYDTQYTKMYNIFMVQLQTILLPTTNIPEAYAQGSSEEQVHIRILESTQENI AALLSGLEYLINISYVDDTEVFKVCLDYWNILVSELFEPHRSLENPAAAATNMLGNQQAPLMPPGMVDGLGSQLLQRRQL YAGPMSKLRTLMICRMAKPEEVLIIEDENGNIVRETLKDNDVLVQYKIMRETLIYLSHLDHDDTERQMLRKLSKQLGGED WTWNNLNTLCWAIGSISGSMMEDQENRFLVMVIRDLLNLCEFTKGKDNKAVIASNIMYVVGQYPRFLRAHWKFLKTVVNK LFEFMHESHPGVQDMACDTFLKIVQKCKRKFVITQLGENEPFVSELLSGLSTTIVDLEPHQIHTFYESVGSMVQAESDSQ KRDEYLQRLMHLPNQKWLEIIGQARQNVDFLKDHDVIRTVLNILQTNTSVASSLGTYFLPQISLIFLDMLNVYRMYSELI SKSIAEGGPYASRTSFVKLLRSVKRETLKLIETFLDKAEDQPQIGKQFVPPMMDPVLGDYARNVPDARESEVLSLFATIV NKYKAAMVEDVPRIFEAVFQCTLEMITKNFEDYPEHRLKFFSLLCAIATHCFHALICLSSQQLKFVMDSIIWAFRHTERN IAETGLNLLLEMLKKFQATEFCNQFYRTYFLTIEQEIFAVLTDTFHKPGFKLHVLVLQHLFCLAETGALTEPLWDAATNP YPYPSNAAFVLEYTIKLLSTSFPNMTAAEVTQFVNGLFESTNDLSTFKNHIRDFLVQSKEFSAQDNKDLYAEEAAAQRER ERQRMLSVPGLIAPSELQDEMLDS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

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Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 1047 1047 0.0
Phobius 1 693 693 -
PANTHER 2 1063 1062 0.0
PANTHER 2 1063 1062 0.0
SUPERFAMILY 22 1013 992 7.4E-117
SMART 37 103 67 3.8E-10
ProSiteProfiles 37 103 67 15.253
Pfam 37 103 67 8.4E-14
Pfam 115 258 144 5.5E-40
Pfam 322 357 36 9.8E-19
Pfam 397 464 68 2.3E-29
Pfam 478 527 50 3.7E-27
Phobius 694 713 20 -
SMART 701 1023 323 2.4E-187
Pfam 701 1022 322 6.8E-127
Phobius 714 837 124 -
Phobius 838 856 19 -
Phobius 857 1064 208 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nuclear export signal receptor activity Combining with a nuclear export signal (NES) on a cargo to be transported, to mediate transport of a the cargo through the nuclear pore, from the nuclear lumen to the cytoplasm. The cargo can be either a RNA or a protein.
Biological process Intracellular protein transport The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell.
Molecular function Ran GTPase binding Interacting selectively and non-covalently with Ran, a conserved Ras-like GTP-binding protein, implicated in nucleocytoplasmic transport, cell cycle progression, spindle assembly, nuclear organization and nuclear envelope (NE) assembly.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0449000.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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