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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0036300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0036300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | LRR receptor-like kinase, putative; TAIR: AT1G56130.2 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase; Swiss-Prot: sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130; TrEMBL-Plants: tr|A0A072U125|A0A072U125_MEDTR LRR receptor-like kinase, putative; Found in the gene: LotjaGi3g1v0036300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:3936326..3957425) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGGCCTTTGAAAATTTGTTGAGCAGTTGGCTATTCTAAACCCCGGTCTTAAGAGGGAAATAGCTTATGGAAATTCTAATG CCTTTTCTTTAATGATAGTCACATTCACCATCAATGAGCAATTAATTAACTAAGCGCAGCCAATAGTAGATGAGGCTGCA ATGACAAAATGTCTCCCCAACAAAGAGTCAGGTGGCTTTCAAAGAAGGGACCCTCATCCAAGTGACTATATACGTCCGTA CGCATACCTCGTCCATCTAGTGTGCCAATTAGAATAGTCGTAAAGCCTTATCTAGTTACTTGGAGGACCCTCATCCAAGT ATTATATCACACTTGCCAAGTCTAGCTCTGTCCATTTAATATACTGCAAAATCACAGTGTGTCCAATTTCTCTGTAACTT AGTTGCTTCACAAGTTTGTAAATTGGGGTTTAATCAGAACTTCATCATGGGACGGTGGTGTCTACCACAGTTTTTCACTC TCACACTTGTTGTTGCTATTTGTGTTAACGTTGCGCAAGCTCAAGATGAAAACGCTACTACAGATCCTTATGAAGGTGAG TGCTTTCTCTATTAATTAATTCATCTGTTTCTTCGTTTTGGATAATCATTAATGGAGCGAGTACGAGTGTTGAAGTATTC ATACCCATGGATACTCCAGATTAAAACATTAAGTCATGTGAGTTTTTAAGAAAGTTACATGACTTTTTTAAGTGATAATT TGAGCATTAAATTGTTTTAATCTGGACCGTTCATGACTTGATCTAACAGTCATGATTTATTCTCATTTTCTCACGTAAGA ACATCTTTCTCATATGATACATCCCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCAATAGATGTATATT GAGTTTAATTTCTAATGACTTTTTGTCTTGAGCCTTGGACTGTGGTTCTCTTTCAAGTAAACTTGTACAACGGTCAGGGC 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TTAATGGGAGTGGTAAATTTATTCCATTCCATCATAAAATGTTCAAACAATGAAAAAGGTACTTTTATTTCATTCAGTTC CATTCCGCTCCATTATGTTCCACTAATCCAAACATATCCTTAGGATTTCAGCTTGTAATTTTATGGATAAATATAATTCC ATCTCACAAAATACAATTGTAGAAGTTTTCAAAAAAATTAATGATGATAGTTGATTACTGTTTATCTTTGATTTTTATAT GTCATAATGTACTTAATTAGTAAATTATATAATTTAATGACTTGCTAGTGGTTCTTCTTACAACCTCTGCCAGTGCTAGT AGTTTTATTTTGTTGATGAAATTGGCTAGGTTTCATTCTAATATGCAATGTTTGAGCCTAAGACTAGAACTAAATCCATT CTTCAAAAGAATGTAATTTTTCCGTTTTGTTCTTGCAGGGGATACTCAATGATGGAACAGTTATTGCTGTGAAACAACTA TCAGTAGGATCCCATCAAGGAAAGAGTCAGTTCATAGCTGAGATTGCGACTATATCTGCTGTACAACATCGTAATCTTGT CAAATTATATGGATGTTGCATTGAAGGGAGTAAAAGGCTTCTTGTCTACGAGTATCTAGAAAATAAGAGTCTTGATCAAG CATTATTTGGTATGAGAACATGATAATTTCAAGTGTGTGTATGTGTGTGCATATATGTATGCCTGCTTACTTTCTTTCTC ATTACTCTTTTTAATAATTAAGTACATGTGTTGGCTCATTTGGACAGGAAAAGTTTTATCCCTCAACTGGTCCACGCGCT ACGATATATGCTTGGGTGTTGCACGAGGTTTAACTTATTTACATGAAGAGTCACGACTCCGTATTGTACACCGTGATGTG AAGGCTAGCAATATTCTGCTTGATCATGAGCTGGTCCCGAAAATATCTGATTTTGGTTTGGCCAAATTATATGATGATAA AAAGACCCACATAAGCACTCGTGTGGCTGGGACAATGTGAGTCATCATCTACACTTGACCATCTTGGATTAGTTTCATGA TCTTATCTATACTTTTATCTGTTTATGGTTTGGTTTCATTTCTTTTATAACACTAAATTTTCAATATACTCTAAACCTCA TGATGTAGTGGATATCTTGCACCGGAGTATGCCATGCGTGGACACCTTACAGAGAAAGCAGATGTTTTTTCCTTTGGGGT TATGGCTCTAGAGTTAGTTAGTGGGAGGCCAAATTCTGATGCAAGTTTGGAAGGAGAGAAGATATATCTTCTGGAATGGG TAAGCAAAGCTGCTTCTGCTTCCTATGAATATTTTTCGAAAAACTGAATGAACACTGATCAAAGTTAGTTCATGTTCTCT GCGGCTCTCTGCTGCAAAATCTTGACCATTGATTTTTATATTTAATGGTTCAGATTGATTCATAAAAGGTTAAATTGGTC AAAACTTTTATGCACTTGCCTGTTTGCTGTTGCACAGGCTGCAAGGGCAGCAGAGGATCCGAATTCGTATCCCTAGCATT TATCTTAATTATAGATATATTATACATTTTTATAGACAAATGTTAGTTGTTGGTAATGTTACACATATCTTTCAAAAAAT GTTATGCATAAAAAACCTTGCTTATTGTTATTAGTATTTTCGTGTCATAGGCTTGGCAGCTTCATGAAAAAAACAGCGTA ACTGATCTGGTAGATCCTGGACTCTCCGAATTCAACAAGGAAGAAGCAAGACGCGTTGTGGGAATAGCACTTTTGTGCAC TCAAACATCGCCATCTTTGCGGCCATCAATGTCGCGTGTGGTGGCAATGCTTTCAGGAGATATTGAAGTGAGTACTGTAA CTTCAAGGCCAGGATACTTGACTGACTGGAAATTTGATGATGTGTCCAGCTTTATGACCGACATTACGACCAAAGCAACA GATGGAAGTTATTACAATTCAACAGCAAGTACCAGCATGGTTGGTGGTGCAGACCATTCACCAATAGATCCTTCTACAGC TATACTTCATGATCTGAATGATGGTAGGTGAGAATTGCGTGTATTCTTTAGTGTTCTTGACAGAGTGTACAATATGATGA GTGCTTCAAATATTTTCGTTTCCTTTTTACTTTTAATTTTCCATCTTCTTTTGACCTTTGTTGCATTCTAAATGCCACCT GATTTTGTAATGTAAGTAAATATCTCTATTACTTTTCATTTTAATTTATAAGGTTGCATGGATTGTTACCATCAAATTGT GTTTAACTAACATACATATATGTGCACTGTAACAATGGTGTGTACCGCAAGCACTAGCCCGTATGGATATCCGTTAGAAA GTATGAAAACAGAAAAATAACACATTTTGAAGCACTTTTTGTTCAAGCACACATCCCCCGAGTAATACAAAAGTTCCCTG AGATGTGTTACTTCCGTTTTCATACTTTCTGATCGGTATCCAAACAGTCAAATAAAGTTATATGTGGTATATGAGGCATT TGCAATGTTAAAAAGCAACTGCTTCTTTTCTTTTTCATCAACAAGCTTGGGAGCTTGTCAAAGCATCCTCTCTTTTCAGA ATGATACTCTGGAGAATCAGGTCCTTGATTTTCTTTTTCCAGAGTATGTCAATGTGTCCAACTGAAGCTAGGATCACTAG GTATTTATTAAGAGGGATTTGAGAATTTACACAACCAATTGTCATTTGGGAGCAAATGAGTAGATCATTTTTTAGTTTAT TTAATCACGTGTGATAGGTAATCTAGTTAGAGCATATTTGGATAGGTGGTGAAAACCACGCTGAAGTTAAAATTACGGTG GATAGACAAAAGCAACTTCTCTTAGCTTTTGTGGCTGTCCATCGTGATTTTTCACCGAAT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0036300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGACGGTGGTGTCTACCACAGTTTTTCACTCTCACACTTGTTGTTGCTATTTGTGTTAACGTTGCGCAAGCTCAAGA TGAAAACGCTACTACAGATCCTTATGAAGCAAGAGTTTTGAATTCAATCTTCAGCAAATGGAGCATTTCAGCAAACCAAG ATCAGTGGAATATAAGCGGTGAACTATGCAGTGGAAGTGCCATTGATAGCACCACCACCATCGATGACAGCGCTTACAAC CCATTCATAAAATGCGATTGTTCCTACGACAACAAAACCACTTGCCACATAACAGCACTGAAAGTTTATGCAGTGGACGT GGTTGGAGAAATTCCTGAAGAGCTATGGACTCTTACTTACCTCACCAATTTGAATCTTGCCCAGAATTACTTGACAGGTT CTCTACCTCCAGCCATTGGAAATCTGACTCGCATGGAATACATGACCTTTGGCATCAATGCTTTATCAGGGGAGCTTCCC AAGGAATTGGGATATCTTACCGACTTAAGATCATTGAGTTATGGATCAAACAACTTCTCAGGATCTTTTCCATCTGAACT GGGGGATCTGGTAAAATTAGAACAACTCTACGCTGCTAGTTCGGGAATTAGTGGTCCAATTCCTCCCACATTTGCAAAGC TTAAGAATTTGTTGATAGTATGGGCTTCAGACATGGAACTCACAGACAATATACCTGATTTCATAGGGAGTTGGTCTAAG CTTCAGACCTTGAGGTTTCAGGGTAATTCTTTTGAAGGTCGAATACCGTCATCATTTTCCAATTTGACTTCTTTAACAGA GTTGAGAATAAGTGGTTTATCTAATGGGAGCTCCTCACTGGAATTCTTACGGAATATGAAGTCTTTAACTATCTTAGAAC TGCGGAATAACAATATTTCTGGTTCCATTCCATCCACCATTGGTGAATTACAAAATTTGACCCAGTTGGATTTAAGTTTC AATAACTTCTCAGGACAAATTCCCGGATCAATTTTCAACTTGAGTTCGCTCTCTTTCTTGTTTCTTGGAAATAACAAACT TAATGGCATAGTCCCTACGCAGAAAAGTTCATCTCTTCTCAATATAGACTTGTCATACAATGATCTAACAGGGAGCTTCC CCTCTTGGGTAAATGAACAAAATTTACAGCTGAACTTAGTGGCCAACAACTTCACAATTGAAAATTCAAATAGCAGTGGT TTGCCTACTGGGCTTAACTGTCTCCAGAAAAATTTTCCTTGCAATAGTGGTGCTGGAAGATATTCTGATTTTACCATCAA GTGTGGTGGTCCCCAAATTACATCCGTAGATGGAACTGTGTATCAAATGGATAATGACACACTTGGTCCTGCTAAATACT TTGTTACTGATACAAATAGATGGGCCGTTAGTAATGTTGGGTTATTTACTGGGAACAATAATCCTCTATACAAAAGTTTT GTGTCTAATCAGTTCACCGGTACTTTGGACACAGAGCTCTTCCAAACAGCCCGACTCTCTGCATCATCACTAAGATATTA TGGCCTGGGGCTGGAAAATGGCTTTTACAACATCACCCTCCAATTTGCAGAAACAGCTATTCTGGATTCTACCACGTCCA CATGGAAAAGCCGTGGGAGACGGGTTTTTGATATTTATATCCAGGGTACTCGTGTTTTGAAGGATTTTAACATACAAAAG GAAGCTGGGGGCGTCTCTTACAGAGCTGTCCTCAAACGATTCAGGTTTGAAGTGAAAGAAAACTATCTGGAGATTCATCT CTTTTGGGCTGGGAAAGGGACTTGCTGCATACCTGCTCAAGGTACATATGGGCCCTTGATTCAAGCCATCAGTGCTATCC CAGATTTCATCCCAACTGTCAGTAACAAACCTCCAAGCAGTGGAAATAGTAAAACTGGTCTAATCATTGGTATTGTTGTG GGTGTTGGAGTTGTAAGCTTTCTGTCAATTTTTGCTGTTTTCTATTTCATTCAGAGAAGAAAGCGCCTTCTTGATGATGA AGATCTTTTAGGTATGGATACAAAGCCATACACTTTTAGCTATTCTGAGTTAAAGAATGCTACAAATGACTTCAATATTG ACAACAAGCTTGGAGAAGGAGGTTTTGGACCTGTTTATAAGGGGATACTCAATGATGGAACAGTTATTGCTGTGAAACAA CTATCAGTAGGATCCCATCAAGGAAAGAGTCAGTTCATAGCTGAGATTGCGACTATATCTGCTGTACAACATCGTAATCT TGTCAAATTATATGGATGTTGCATTGAAGGGAGTAAAAGGCTTCTTGTCTACGAGTATCTAGAAAATAAGAGTCTTGATC AAGCATTATTTGGAAAAGTTTTATCCCTCAACTGGTCCACGCGCTACGATATATGCTTGGGTGTTGCACGAGGTTTAACT TATTTACATGAAGAGTCACGACTCCGTATTGTACACCGTGATGTGAAGGCTAGCAATATTCTGCTTGATCATGAGCTGGT CCCGAAAATATCTGATTTTGGTTTGGCCAAATTATATGATGATAAAAAGACCCACATAAGCACTCGTGTGGCTGGGACAA TTGGATATCTTGCACCGGAGTATGCCATGCGTGGACACCTTACAGAGAAAGCAGATGTTTTTTCCTTTGGGGTTATGGCT CTAGAGTTAGTTAGTGGGAGGCCAAATTCTGATGCAAGTTTGGAAGGAGAGAAGATATATCTTCTGGAATGGGCTTGGCA GCTTCATGAAAAAAACAGCGTAACTGATCTGGTAGATCCTGGACTCTCCGAATTCAACAAGGAAGAAGCAAGACGCGTTG TGGGAATAGCACTTTTGTGCACTCAAACATCGCCATCTTTGCGGCCATCAATGTCGCGTGTGGTGGCAATGCTTTCAGGA GATATTGAAGTGAGTACTGTAACTTCAAGGCCAGGATACTTGACTGACTGGAAATTTGATGATGTGTCCAGCTTTATGAC CGACATTACGACCAAAGCAACAGATGGAAGTTATTACAATTCAACAGCAAGTACCAGCATGGTTGGTGGTGCAGACCATT CACCAATAGATCCTTCTACAGCTATACTTCATGATCTGAATGATGGTAGGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0036300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGRWCLPQFFTLTLVVAICVNVAQAQDENATTDPYEARVLNSIFSKWSISANQDQWNISGELCSGSAIDSTTTIDDSAYN PFIKCDCSYDNKTTCHITALKVYAVDVVGEIPEELWTLTYLTNLNLAQNYLTGSLPPAIGNLTRMEYMTFGINALSGELP KELGYLTDLRSLSYGSNNFSGSFPSELGDLVKLEQLYAASSGISGPIPPTFAKLKNLLIVWASDMELTDNIPDFIGSWSK LQTLRFQGNSFEGRIPSSFSNLTSLTELRISGLSNGSSSLEFLRNMKSLTILELRNNNISGSIPSTIGELQNLTQLDLSF NNFSGQIPGSIFNLSSLSFLFLGNNKLNGIVPTQKSSSLLNIDLSYNDLTGSFPSWVNEQNLQLNLVANNFTIENSNSSG LPTGLNCLQKNFPCNSGAGRYSDFTIKCGGPQITSVDGTVYQMDNDTLGPAKYFVTDTNRWAVSNVGLFTGNNNPLYKSF VSNQFTGTLDTELFQTARLSASSLRYYGLGLENGFYNITLQFAETAILDSTTSTWKSRGRRVFDIYIQGTRVLKDFNIQK EAGGVSYRAVLKRFRFEVKENYLEIHLFWAGKGTCCIPAQGTYGPLIQAISAIPDFIPTVSNKPPSSGNSKTGLIIGIVV GVGVVSFLSIFAVFYFIQRRKRLLDDEDLLGMDTKPYTFSYSELKNATNDFNIDNKLGEGGFGPVYKGILNDGTVIAVKQ LSVGSHQGKSQFIAEIATISAVQHRNLVKLYGCCIEGSKRLLVYEYLENKSLDQALFGKVLSLNWSTRYDICLGVARGLT YLHEESRLRIVHRDVKASNILLDHELVPKISDFGLAKLYDDKKTHISTRVAGTIGYLAPEYAMRGHLTEKADVFSFGVMA LELVSGRPNSDASLEGEKIYLLEWAWQLHEKNSVTDLVDPGLSEFNKEEARRVVGIALLCTQTSPSLRPSMSRVVAMLSG DIEVSTVTSRPGYLTDWKFDDVSSFMTDITTKATDGSYYNSTASTSMVGGADHSPIDPSTAILHDLNDGR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| Phobius | 1 | 8 | 8 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| Phobius | 9 | 20 | 12 | - | – | |
| Phobius | 21 | 25 | 5 | - | – | |
| Phobius | 26 | 633 | 608 | - | – | |
| Gene3D | 33 | 276 | 244 | 4.5E-46 | ||
| PANTHER | 44 | 1002 | 959 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 44 | 1002 | 959 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 91 | 394 | 304 | 1.77E-51 | – | |
| Gene3D | 277 | 400 | 124 | 3.6E-25 | ||
| Pfam | 288 | 347 | 60 | 4.2E-8 | ||
| Gene3D | 423 | 597 | 175 | 3.2E-19 | – | |
| Pfam | 424 | 610 | 187 | 4.1E-42 | ||
| Phobius | 634 | 657 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 635 | 657 | 23 | - | – | |
| Gene3D | 655 | 766 | 112 | 5.9E-37 | – | |
| Phobius | 658 | 1030 | 373 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 674 | 978 | 305 | 1.37E-81 | ||
| SMART | 691 | 958 | 268 | 3.7E-34 | ||
| ProSiteProfiles | 691 | 964 | 274 | 37.389 | ||
| Pfam | 692 | 958 | 267 | 4.2E-47 | ||
| CDD | 697 | 958 | 262 | 7.45938E-98 | – | |
| Gene3D | 767 | 969 | 203 | 7.6E-61 | – | |
| ProSitePatterns | 810 | 822 | 13 | - | ||
| MobiDBLite | 1007 | 1030 | 24 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0036300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…