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LotjaGi3g1v0036800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0036800
Transcript ID LotjaGi3g1v0036800.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description LRR receptor-like kinase, putative; TAIR: AT1G56130.2 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase; Swiss-Prot: sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130; TrEMBL-Plants: tr|A0A072U125|A0A072U125_MEDTR LRR receptor-like kinase, putative; Found in the gene: LotjaGi3g1v0036800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:3984520..4000204) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACGTACGCTCTATATATATTAGAAGTAGGTAGGCCTAACTCAACCCAAAAGCTAGCTCAAGAGTTGAGGTTTGCACAACC CTTATAAAGGCTATCTATGCTCTATCTCTAGCAAATGTGGGACTTCTAACAATATATACTTGGTCCATCTAGTGTGCCAA TTTAGAATAGACATAAACCTTCACTGTGCATTATAAAATCAGCATATCATCATCACACATTCACACTTAACTTATATAAT TACCTACTGATTTTGGTCAGAGACGCCAACTCTGGCTCTCCGTTTAATATTCTGCAAAATCACAGGGTCCAATTTTCTGT GTAACTTTGTTGCTTCACAAGTTTGTAAGCTGGGGTTGGTTTAATCAGAACTTCAGAACTTCATCATGCAACGGTGTTGT CTACCACAGATTTTCACTCTCGCACTTGTTGCTGCTCTTTGTGTTAACGTTGCACAAGCTCAAGATGGAAACGCTACTAC AGATCCTTCAGAAGGTGAGTGGTTTCTCTATTAATTAATTCCTCTGTTTCTGTGTTTCTTCGTTTTGGATAATCATTACT CTGTCTGTCTTCTAGATCAGTGTGATCAATCTTGTTAATTTGTGGATTATTATGTTTTCATATTCTGGGAATTTTCTTTA GTTTTTTGGGGAATATCCGAATTATTCGTTAGAGACATATTTTAAAAGGTGGTAAAGATTAGTCATACTTGTTTCTGATA CCTTTTTTTATTTTTGATTAATGAAATAGAGCCCCTTCTTGTCCTTTCTCTTTTTGTCATTTGCTGACTGCATGATTTTT AAAAGAGGTTGTAGAATTTTATTAAATGAGTGAAAGTCTAAGGATCGGATAATTTAGTACATAGAACAAGAAAATAGCCC AACAATTCTTGAATGTATATTGTCGGTTAAGTTAGTTTTTACAATCAGATAAAACATTGATTATGAACTAATTTGACAGA 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AATGAGTGGATATTTTTGTAGTTTACCCAATCATGTGTATAAAGTGACGAGATAGGAAATTTAGTTAGAGCAATAGATTG CGGAAAATGAAGGAGAAGCTAGAATCATGGCGGATAGATAGAAGCAATTTCTCTTAGCTTTTGTGACTGTCCACCATGAT TTTGATCTCACTATGGGTTTTCACATATATCCAAGCATGCACTTAACATGTATCGAGTGCTCTACATCTGCAAAATTATG AATACTTGGTGACAAGTGTGTTTGGATTAGCTTTTTTATCTGTTAACTTCTGTTGAGTCACATGTACCTAACATTTAAAA TCGTG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0036800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCAACGGTGTTGTCTACCACAGATTTTCACTCTCGCACTTGTTGCTGCTCTTTGTGTTAACGTTGCACAAGCTCAAGA TGGAAACGCTACTACAGATCCTTCAGAAGCAAGAGTTTTGAATTCAATCTTCAGCAAATGGAGCATTTCAGCAAACCAAG ATCAGTGGAATATAAGCGGTGAACTATGCAGTGGAAATGCCATTGATAGCTCCACCAAAATCGATGACACCGCTTACAAC CCCTTCATCAAATGCGATTGTTCCTACGACAACAAAACCACTTGCCACATAACAGCACTGAAAGTTTATGCAGTGGACGT GGTTGGAGAAATTCCTGAAGAGCTATGGACTCTTACTTACCTCACCAATTTGAATCTTGGCCAGAATTACTTGACAGGTT CTCTACCTCCAGCTATTGGAAATCTGACTCGCATGCAATACATGACCTTTGGCATCAATGCTTTATCAGGGGAGCTTCCC AAGGAATTGGGAAATCTTGCAGACTTAAGATTATTCGCTTGTGGATCAAACAACTTATCAGGATCTTTTCCATCTGAACT GGGGGATCTGGTAAAATTAGAACAAATCTACGCTGATAGTTCAGGAATTAGTGGTCCAATTCCTCCCTCATTTGCAAAGC TTAAAAATATGCAGCAATTTGCGGCTTCAGACACGGAACTCACAGGCAATATACCTGACTTCATAGGGAATTGGTCTAAG CTTCAAACCTTGAGGTTTCAGGGTAATTCTTTTGAAGGTCGAATACCGTCATCATTTTCCAATTTGACTTCTTTAACAGA GTTGAGAATAAGTGGTTTATCTAATGGGAGCTCCTCACTGGAATTCTTACGGAATATGAAGTCTTTAACTATCTTAGATC TGAGGAATAACAATATTTCTGGTTCAATTCCATCCACCATTGGTGAATTACGAAATTTGACCCAGCTGGATCTAAGCTTC AATAACATATCAGGACAAATTCCTGGATCAATTTTCAACTTGAGTTCGCTCTCTTACTTGTTTCTTGGAAATAACAAACT TAATGGCACAGTCCCTACGCAGAAAAGCTCATCTCTTCGCAATATAGACTTGTCATACAATGACCTAGCAGGGAGCTTCC CCTCTTGGGTAAACGAACAAAATTTACAGCTGAACTTAGTGGCAAACAACTTCACAATTGAAAATTCAAATAGCAGCGGT TTGCCTACTGGGCTTAACTGTCTCCAGAAAAATTTTCCTTGCAATAGTGGTGCCGGAAGATATTCCGATTTCGCCATCAA GTGTGGTGGTCCCCAAATTACATCCGTAGATGGAACTGTGTATCAAATGGATAATGATACACTTGGTCCTGCTAAATATT TTGTTACTGATACAGATAGATGGGCCGTTAGTAATGTTGGGTTATTTACTGGGAGCAATAATCCTCTATACAAAAGTTTT GTGTCTAATCAGTTCACCGGTACTTTGGACTCAGAGCTCTTCCAAACTGCTCGGCTCTCTGCATCATCACTAAGATATTA TGGCATGGGGCTGGAAAATGGATTTTACAATGTCACCCTCCAATTTGCAGAAACAGCTATTCTGGATTCTACCACGTCCA CATGGAAAAGCCTTGGGAGACGAGTTTTTGATATTTATATCCAGGGTACTCGTGTTTTGAAGGATTTTGACATACAAAAG GAAGCTGGGGGCGTCTCGTACAGAGCTGTCCTCAAGCAATTCAGGTCTGAAGTGAAAGAAAACTATCTTGAGATCCATCT CTTTTGGGCTGGAAAAGGGACTTGCTGCATACCTGGTCAAGGTACATATGGGCCCTTGATTCAAGCCATCAGTGCTATCC CAGATTTCATCCCAACTGTCAGTAACAAACCTCCAAGCAGTGGAAATAGTAAAACTGGTCTAATCGTTGGTATTGTTGTG GGTGTTGGAGTTGTAAGCTTTCTGTCAGTTTTTGCTGTTTTCTATTTCATTCAGAGAAGAAAGCGCCTTCTTGATGATGA AGATCTTTTAGGTATGGATACAAAGCCATACACTTTTAGCTATTCTGAGTTAAAGAATGCTACAAATGACTTCAATATTG ACAACAAGCTTGGAGAAGGAGGTTTTGGACCTGTTTATAAGGGGATACTCAATGATGGAACAGTTATTGCTGTGAAACAA CTATCACTAGGATCCCATCAAGGAAAGAGTCAGTTCATAGCTGAGATTGCGACAATATCTGCTGTACAACATCGTAATCT TGTCAAATTATATGGATGTTGCATTGAAGGGAGTAAAAGACTTCTTGTCTACGAGTATCTAGAAAATAAGAGTCTTGATC AAGCATTATTTGGAAAAGCATTATCCCTCAACTGGTCCACGCGCTACGATATCTGCTTGGGTGTTGCACGAGGTTTAACT TATTTACATGAAGAGTCACGACTCCGTATTGTACACCGTGATGTGAAGGCTAGCAATATTCTTCTTGATCATGAGCTGGT CCCGAAATTATCTGATTTTGGTTTGGCCAAATTATATGATGATAAAAAGACTCATATAAGCACTCGTGTGGCTGGGACAA TTGGATATCTTGCGCCGGAGTATGCCATGCGTGGACACCTTACCGAGAAAGCAGATGTTTTTTCCTTCGGGGTTATGGCT CTAGAGTTAGTTAGTGGGAGGCCAAATTCTGATGCAAGTTTGGAAGGAGAGAAGATGTATCTTCTGGAATGGGCTTGGAA GCTTCATGAAAACAACAACGTAACTGATCTGGTAGATCCTGGACTCTCCGAATTCAACAAGGAAGAAGCAAGACGCGTTG TGGGAATAGCACTTTTGTGCACTCAAACATCGCCAACTTTGCGGCCATCAATGTCGCGTGTGGTGGCAATGCTTTCAGGA GATATTGAAGTGAGCGCTGTAACTTCAAGGCCTGGATACCTGACCGACTGGAAATTCGATGATGTGTCCAGTTTTATGAC TGACATTGCAACCAAAGGAACAGATGCAAGTTATTACAATTCAACAGCAAGTACCAGCGTGGTTGGTGGTGCAGGCTTTT CACCAATAGATCCTTCTACATCTATGCTTCATGATTTGAATGAGGGTAGGTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0036800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MQRCCLPQIFTLALVAALCVNVAQAQDGNATTDPSEARVLNSIFSKWSISANQDQWNISGELCSGNAIDSSTKIDDTAYN PFIKCDCSYDNKTTCHITALKVYAVDVVGEIPEELWTLTYLTNLNLGQNYLTGSLPPAIGNLTRMQYMTFGINALSGELP KELGNLADLRLFACGSNNLSGSFPSELGDLVKLEQIYADSSGISGPIPPSFAKLKNMQQFAASDTELTGNIPDFIGNWSK LQTLRFQGNSFEGRIPSSFSNLTSLTELRISGLSNGSSSLEFLRNMKSLTILDLRNNNISGSIPSTIGELRNLTQLDLSF NNISGQIPGSIFNLSSLSYLFLGNNKLNGTVPTQKSSSLRNIDLSYNDLAGSFPSWVNEQNLQLNLVANNFTIENSNSSG LPTGLNCLQKNFPCNSGAGRYSDFAIKCGGPQITSVDGTVYQMDNDTLGPAKYFVTDTDRWAVSNVGLFTGSNNPLYKSF VSNQFTGTLDSELFQTARLSASSLRYYGMGLENGFYNVTLQFAETAILDSTTSTWKSLGRRVFDIYIQGTRVLKDFDIQK EAGGVSYRAVLKQFRSEVKENYLEIHLFWAGKGTCCIPGQGTYGPLIQAISAIPDFIPTVSNKPPSSGNSKTGLIVGIVV GVGVVSFLSVFAVFYFIQRRKRLLDDEDLLGMDTKPYTFSYSELKNATNDFNIDNKLGEGGFGPVYKGILNDGTVIAVKQ LSLGSHQGKSQFIAEIATISAVQHRNLVKLYGCCIEGSKRLLVYEYLENKSLDQALFGKALSLNWSTRYDICLGVARGLT YLHEESRLRIVHRDVKASNILLDHELVPKLSDFGLAKLYDDKKTHISTRVAGTIGYLAPEYAMRGHLTEKADVFSFGVMA LELVSGRPNSDASLEGEKMYLLEWAWKLHENNNVTDLVDPGLSEFNKEEARRVVGIALLCTQTSPTLRPSMSRVVAMLSG DIEVSAVTSRPGYLTDWKFDDVSSFMTDIATKGTDASYYNSTASTSVVGGAGFSPIDPSTSMLHDLNEGR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 25 25 -
SignalP_EUK 1 25 25 -
Phobius 1 8 8 -
SignalP_GRAM_NEGATIVE 1 25 25 -
SignalP_GRAM_POSITIVE 1 25 25 -
Phobius 9 20 12 -
Phobius 21 25 5 -
Phobius 26 633 608 -
Gene3D 33 274 242 1.3E-46
PANTHER 52 998 947 0.0
PANTHER 52 998 947 0.0
SUPERFAMILY 93 382 290 1.87E-52
ProSiteProfiles 120 142 23 5.271
Pfam 240 262 23 1.5
Gene3D 275 400 126 1.2E-27
Pfam 287 328 42 7.2E-7
ProSiteProfiles 288 310 23 7.027
ProSiteProfiles 312 334 23 7.442
ProSiteProfiles 336 357 22 4.932
ProSiteProfiles 358 380 23 5.294
Gene3D 422 594 173 1.9E-20
Pfam 423 610 188 2.3E-42
Phobius 634 657 24 -
TMHMM 635 657 23 -
Gene3D 655 766 112 6.8E-37
Phobius 658 1030 373 -
SUPERFAMILY 674 976 303 1.13E-81
ProSiteProfiles 691 964 274 37.545
SMART 691 958 268 3.7E-33
Pfam 692 958 267 1.2E-46
CDD 697 958 262 2.9702E-97
Gene3D 767 969 203 2.6E-61
ProSitePatterns 810 822 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0036800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…