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LotjaGi3g1v0054800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0054800
Transcript ID LotjaGi3g1v0054800.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Dynamin homolog; TAIR: AT1G59610.1 dynamin-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9LQ55|DRP2B_ARATH Dynamin-2B; TrEMBL-Plants: tr|Q9SDX4|Q9SDX4_ASTSI Dynamin homolog; Found in the gene: LotjaGi3g1v0054800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:5716872..5729123) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAAGGGACCCACCCGTCAACAGAGACAGACGACAACCATTTCAAAACGCGGAAGGAAGAGTGAGAGAGAGATATTAGAGA GAGAGAGAGAGAGAGAGCGTGGAAGTGCTTTTTGAATTTTCCCAATCGCCCTTCAATTCACTCCCAACAGAACCCAAACC CCATTCCTTCAATTCTAGAGAGAGAATCTCCGAGATCTACTCCCTCTCTTCACACAGATCGTACCCTCCGTCTGGGTTTA GGGTTCGGTTTCGATCGATCCCTATTCGAATTCGATTCACCTTCTTCCTCCTCCGTTTTTTGATCCGTTTGGTTGACCTA TGGCGGCGATCGATGACTTGTCGGAGCTCGCTGATTCGATTCGCCAAGCCGCGGCGCTCCTCGCCGACGAAGACGTCGAT GACTCCAACTCCTCATCTTCCAGACGGCCTTCCACTTTCCTCAACGTCGTCGCTCTCGGCGGTGTCGTAAGTCTCCATTT CTTCATCATCATCTTCACCGTAATTTATCAGTTACATACAATTCATTTCCAATTTTGTAGGGAGCTGGTAAATCCGCTGT TCTCAACAGTTTGATTGGACATCCCGTTTTGGTAAGCTAGATTTCAATTTCCATTTCTCTCGATTTTCCATTTTAGGTTC TCAATTCTACTAGTTTTAGTCTTAGAAGTGATAGTTTTAGTGAAAATTGAAGTGAATGTTTGTGATCTTCAGCCTACTGG CGAAAACGGAGCTACTCGGGCTCCTATATGCATTGATCTGCAGCGAGATACTTCGTTGAGCAGCAAATCGATTATCATAC AGATTGACAATAAGTCCCAGCAAGTCTCTGCAAGTCAGTTTCTCTTGTTAACCAAAGTGTCTGATCTATTCCATTCGCGC GTTTTTTCTTTCTCGAACGAAAGTATTCATGTGCTTTGTTTTGTTTTCCGCAGCTGCTTTAAGACATTCGTTGCAGGACA 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CAAGCTGCAGCAGACCAGAAGTCACTAGCTGCAGTTCAAGCACTTCTAATGAATCAAGGTCCTCCAAAAGCATCAGATAT CCCTTGGGTTGCATTGATTGGTCAATCAGTTTCAATAGCTACAGCTCAGTCTGGATCTGCTGGTTCTGAAAGTTCCTTGG AAACTGCATGGAGAGCAGAGAGTGAAAGCCTCAAGTCCATATTGACAGGAGCTCCTCCGAGCAAGCTTGGAAGGATAGCT TTGGTTGATGCCCTGGCACAGCAGATTCAGAATCGTATGAAGCTTCGGGTCCCTAACCTTCTTTCTGGGTAATTTCCATG CTGTGCAATTTGATATTATCTTATTGCTATTATGTATCATTGTTTGCATTTGTGGTCTTGTTTGTGGTGGAAACCTAAGA AGTTTACAATAAATAAATGGTTGGTGTTTCTTGGCATTTATGTGAAATGCTTCAGCTTATTGTTTTTTAACTTTTATATT TTGTTCACCACATGAATAACTATATAAGATTAAATGATTTGTGATATACACAATTGTGTCCTGTTAAAATGCGGTTGTTT TAAAAGGAAAAAATATGTTTTTTTATTGTTGTTTAAAATAGTCTCTTAGTCAATGTGCTCTTTTAATACATCCTTGATTT GATTATCTGAGCTATGTTTTTTCAGATTACTTTTGTTTTCTCACGGGTATTCTTGTTATTTATTAGTTGAATCAGTCTTA TCTGTGAGAAGTCCATATGGAAGTTTAGTAAGTTAAAATAGATAAGGTCAAAACAAACTAGTAGTTAGATCTGTTAGCAT ACAACATTCCAGTGGTTCTTGTAGAAGTTCTGGCTATTTGCTAAAACATTGGCAACTGAATTGCTCTCTATGAAATTTGG CTTTCAGTAAGGATTGCCATTTTAGTAAGTGAATTGTATTAATTTTAACTGATGTGATGTTAAGGTTACAAGGAAAGTCC CAGATAGTTCAGGATGAATTGGCGAGGCTTGGTGAGTCAATGGTCACCACTTCAGAGGGTACACGTGCTATAGCCTTGGA ACTTTGCCGTGAATTTGAGGATAAGTTCCTACAACACATTACCTCTGGCGAGGTATGTTTTCTCAATCATATATTTTAAT CGAACTTGAATTATTTGCAATGATGCTTATCATTGGGGGGGGGGGGGTGCTATTTCTTTTGTATCCAGTATTTATAGCTT CATTCTTTTGCACACTATAGTATATCTAGGGTCTCTGCACATTAGAAAAAACACTGGGCCCAATTTAATTTTAAGAAAGC AAAGCTTTTTAGGTTTGTGGAAATGAGAAAGAGCTTTATTTGATTGTTTTACATTTAAGATATTCATTATTATTGATCTG GTGCTCTGGTTATAAATATTACTGGTCCACATCCAATATCTGTTAGTTGCCATTTTATATAATGTCAACAACCGATGATC CCCTGAGATAATCCTTACTCTTTGCACAACCGATGATCCCCTGTGATAATCCATGCGCTAAACACCAAAGGTACCCTCTT GAAATCATACAAGTCCTTTCACCCCGCGGACTGCAAAGATTTATAGACCATGTATTGCCCCAATGCTCTGCTCTCCTTAT TTTACCATTCATTTGGAAGTGAACATGAAATAAGTGATCAATTGAGGGAGAATAAACCCAGTTTCTTAACATATACTAAA AAAGATTATTCCAATTGTGGCTCAGCTGAACACTAGAGAAATAAATGGGGAAGTTTCGTTTATAAATAATTTGGGAATTA TTTTGAAACTTCAGCATTTAATGATAAATTGGTTTTGACATTGTGTTGATGGACAATTAATGTGTTTGTTGCTTGAGTTT GTTATTGTTTGCTGAATTACTATAATTTTATCTGGCAGGGAGCTGGTTGGAAAATTGTTTCCTGCTTTGAGGGGAGATTT 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AGTTCTATTTTTCTGGTTTCTTACAGAGAATCTCTTTGCCTTATACTCTAGGTACACCGTGTCCTAATAGAAATTGTGTC TTCTGCTGCCAATGCTACTCCTGGTTTAGGAAGATATCCGCCTTTCAAGAGAGAGGTATGGTACTATGTAGTTTATTTAT TTTTTACTTGCTCGCTACCGATTTCTGTATGTTATGTGACATTGGAGTGCAATTTTTAATTGCATATTTTGCTTCCTTCT TCATGAATGTATCCCCCTGGGTGGGAAGTGGACTTTCTCTTTCTTTTTAATAACCTCGTTTAAAAACTTTCAAGGTTGTA GCTATTGCTACTGCTGCACTAGAAGTGTTTAAGAATGAATCGAAGAAAATGGTGGTTGCACTAGTTGATATGGAGCGTGC TTTTGTGCCACCACAACATTTCATTCGCCTGGTACAAAGGAGGTAATTTGGATTTGGACATTTTCTAAATGGATCCTGAT CTTCTTGTTTGGAGAATGATTTGTTCCCTACTCTATCTGTCTCTTTGATAGGAACCATATTTATCAATTCGGGTAGAATC TCTTAGTAGCCAACCCCAAAAGTGCTACAACACATAGTGGGATGGCTGCTGCTATGAATTTTTTTATATAGTTTATACAA TTTATTTATAAGATATACATATGAATGCCCAAAATTTGGACTCTACTAAGCTTACTAATATCTTCTAGTCAAGGCAATTT TGCAGAACTTGGAATCCTAAATAAGTTCTTCCTCTTGGCTTGTAAAACTTTACCGAAGACCCAAATCCATAAACTATTAT TTTCTACTACTAGTTGCTTATACCTACAGTTGTAGGCTTTTGCCTAATTTATATTTATTTAGTTATTCTGTGTTATTTAC TCTAGGATGGAAAGGCAACGTCGAGAGGATGAGCTGAAGGGCCGACCCTCCAGAAAAGGGCAGGATGCAGAGCAATCTAT ACTTAATCGGGTAGGTGTACTTGTACAGTAACAAAGACTGTCTTCAAAAAAAAGTGAAGGACAAAATGTGCATCTGTAAT CTGATTTGTTGATTTGTTTTTTACTCTCATTTTCTGTGACTTGTTTGATTTGTGATCTGCATTTGTCAACTTATTTTAGG CCACCAGTCCCCAAACTGGTGCAAGCATGAAATCAATTAAGGAGGATAAGGATAAGGATAAGGAGAAAGACAAAGACAAA TCAAGCCAGGCAGAGAAAGAAGGGCAAGAAGGCTCTGGTTTAAAGACTGCTGGACCTGAAGGAGAAATTACAGCAGGTCT GTGCCATGCTGTATGCCACTAGATTTTTTTAGATGTTTCAGCCTTCAGGCAGTCTCACTCCCTCCTGTTGCATCTGTCAA GTTTTTCATGGAGGAAATCTTTCTGAAATTGTAGTTGGAATGATGTTCTGTCAATGACCTTGATGGATCTTAATTCTATA AGCTTTGCTAGTTCATTTTCTTGGTTATCTATCCTAGAATGCATGGGAGCAATTTTTAGTTTGAATTGCAGTATTGCATC AATTTGGATTTGGAAGTCGGGATTTCTCAATGTATATATATTTTTTAAACTTACAACTAAACTAGTTTTTTCTTCTTGCA GGATTTTTGTTAAAGAAAAGTGCAAAAACTAATGGTTGGAGCAGGCGATGGTTTGTGCTTAATGAGAAGACAGGAAAGGT TGGTATTATTAACCATTGACCTATGTTGGTATATTATTTACATGTGTTCCATAGGACTTCAGTCTTTTTGAACCTTGGCT ACTTAAACCTGAGTAAAATCCGTATATCATTTCCTGCACCGTCAAAATTATTCTTATTCCCTTTTTTGAACCTTGGCTAC TTGAACCTGGTGTGCATTTTTTGCATGCTATATGACAATTTTTTCCTTGATGCACAACTATACAAGTCTAAGATCGTAAT ATTGCTTTTCATGTGTAAGTAATGTAAAATTGGACACTGCTGGTTCTTATAATTGGCTTTACATATGTGTGAGTAATGTA AAATTGGACACTGCTGGTTCTTATAATTGGCTTTAATGTAATGTAAAATTGCTTGCATAGGCAGCCAAGTAAGACCACTG ACAGAAAAACCTAATATTATAACCTAATTTTCCTGAAATGCATCATAGATGTTTGCACCTTGGAGTATGATTGTTCCTGT AGTTTCCAATTGATAAAAGTTTTTTTTTTTGAATCTGTGTTGCTTTTACATTCATTTAGACTGAGATGTAATTGGCTGCT TTTGGTGCAATTTTGTATATGTAGTGTTGACTTTATACTTTATACTTTCACTTCCACAGCTTGGGTACACCAAAAAGCAA GAGGAAAGGCATTTTCGTGGTGTTATTACATTAGAGGTATGGAGGATTATTATTACTTTTGCACATTCATATTCGTATTT ATAACCTAACAGCTTACTGTCTTCAATATACACATTATGAGGGAATAGATTATGACGTAATTTCCTTCTCAGCAATTAGT GATGCTTATTTAATTAAATTTATTGGTCCTGAACGTGTTTTATTTTTTTGCTTGAATAATTCAATTATTGTTGTCAAAAT TTCCCTTGATTGCGTTTCTCTAATGCAGTATTTAATATTTATGATGTTTTAGGTTTGAAAATAATTCTTTTAAAATTGCA AAGCCTTCAAAATATAAAAATGAAATAGGTGCACAATTGTTGATTTAGTTATTTATTTTAGATATTTGAAAGTTTGAAAC ACACTAATGATGTTCAATTTTTTCCTCCAGAATTTGTTGTTTGTTTGAACTCTTGAAATGAAACAGCGGTGAATATGTTT GTGCAACTGATATGTGGAATAAAATCTTTCACAATAGTTCTATTTTCCCTATAGGTTTAGTCATTTCATTCCAAGTCTGG TTTATTTTTTATGGGAAACTAGTGGATTACTGTCTATGCATTATTTTTCTCTCTCAAAGTTCCTGAGTTCTATTATGCTG GTAGGTTAAATTGATTAAATACCAACTTTTTTTGTTGGACAAGATATAATATCAACTCAAATTCCATAATATGTTTGTTT CTATGCTATGGATTCATGTTACTTCAAGCTTCTTAAATGGCATTTCACATGTCTAGAAAAATTGTCATCCCATGCATGGG TATGGGCTGGGTGCAAACCTTTGTTGGTGCACCAGTAGTCGGGTGGGTGGTTAGCTGACTCGTATATTATATGGATATGG ATATGGAGTAACCTCCAATTCTGTTAGGGTGATAAGTATGGCAAATCTTCCTTTTTGCTGGAAAATGCTTATTTAATCTA AATGTAAGATCATTTCAGTGTTCTACTTGAATTTGGATATTTTGATGTGTTTGTTTGTTATTGTTCCTTCTCTTCTTACT GTTATCTCTGGTGTCATAACTCAACTTTAAAGCTTAGGTTTTAATATGCTTGCCTTTTGCTAACTAGATATTCACTTGTA ATTTTCTGAAGTTTCACATTGTTGCAGTATGTACTGGCTTATGTTTTGACAGTCAGTGGGTTACACTGAAAATAGGGTGC AATTCATAGTCTTGATAAGCATCCAATTTAAATTACTATGCAGGAATGTAACATTGAAGAGGTTTCAGATGAAGGCGATC CTCCACCAAAAAGCTCAAAGGACAAGAAGTCTAATGGACCTGATTCTGGCAAAGTCAACCTTGTATTTAAAATTACTAGC AGAGTTCCTTATAAAACCGTTTTGAAAGGTAACTTATTGACACTGATAGTGCATACGAACTTTTATTTCTTTAGAAACTT CTGAAAAGTGAGAACATTTTAATTACATTGTTTTTCTCTATTGCAGCGCATAGTGCTGTTCTTTTGAAGGCTGAGAGCAC AACTGATAAGGTTGAATGGATTAAGAAGATAAGTAACGTTATACAAGCAAAGGGAGGACAAATAAGGCTTTCATCTGAAG GCTCTACCATGAGACAGAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGGTGAGTTGCTGGCTTAAAGCCACTGTTCGTGCTGTACATTTC GTATGATGTGGTCATTAGGCTTATATAATTAAATTCATGAATTAGTATATTCCTTGATTAACGAAGTTTATTAATCTGGT GATTTTTTGGTTAACCTTTGTGCACTGTAACTAATTTTATATATTTGGCCTTTTTGGGATCTCTCAAATCATTTTTTTAA ATATAAATCAATTTTGTTGAGGTTTTCCATTAGGGTGCTGGTCATGAAATTAAAATCAAAACTACTAAATGAAATCCAGA AAGCATTGAATACTTTATTTTAGTAATTAGGATTATTTAATGAAGGGCAATCATTTCTCAATTAACAAGCCCCTATACTT TATTTAATGGAACTTTGTGTAAGCCTTTGTTGGGAGTTCATTCAGTTAGGTGGAGCACAAACCTGACCAACTCGAAGCAA ACTAGAGGAGGTTGGGTCATGAATTCTCCAAGCCAATTTCCGTCACTTGTAAATTTGAATTTTATTGTGTCAAAATATCT GGGATGTAGAGTGCATTCGCTCAGCAATCGTGAGAACATGTCTAGATTCCATAAGTGTATCCTTAGTTTCATAAGTAGAC ATAATAAAAAAATGAGTTGAAGATAAATTGGTAACCCTGTTGTTTTTCTCTTTGTTGTATCTCAGGACACCATGGCTCGA AGACCTGCTGATCCTGAGGAAGAACTCCGGTGGATGTCCCAAGAAGTTCGTGGCTATGTGGAAGCAGTTTTAAACAGTTT AGCTGCTAATGTACCAAAGGCAAGCTTCTGCTTTTAACTTTTTATTTTCTATAATATTTTTCAGTTTTGTCGATGTTAAT TTTTAATGCTTTTTCTGGTTTATTGTTTGGCAGGCCATTGTCCTTTGCCAAGTTGAAAAATCTAAGGAAGACATGCTGAA TCAATTATATAGCTCTGTCAGGTTCAGAAATTTGAGATTTCCTTTACATTTACTTTTGTTTTCTTGAAAACAAAATTCTG GCATTTTGTTATAGGTTTTTGAAGATGTTCAATTGTTCTTGTCTTAATTAAATCTCTTGGTTGAAATCATCTAAATATAA TTTTTTACAACTTTCCGTTTCCTGATTATTATGTCTCTACTGGGGGGGGGGGGTATCTAGGAATAGGTGAGGGGACATTA CTGGTTTTACGAGAACTTGCATTCACGTGATACACTCCCTCCATGTTTGCGTGTGTGAGAGTAGAGGGAGGGAGGTACTA TTTATGTGTGTGTGAGGGCAGAGGGAGGGAGGTGCTATTTATTATAAAACGAATTACATGTGAATGTGAGAAGAGGTAGA AACAGAAATCATGGGTAGAGAAAAAAGGGAGAGAAATTGAAAATTTTCTCTGCGAAAGCTATGTATTGCTTTACTATCAC TGAACATTGTGTGTGTGTGTGTTGTGTTCTTCAAGGTGCAGTAATTCTGCTTTGTATGTCAATAGGGAAAACTCCGAACT TCACTCATGATCAATCATTCATTTTTATCATGTTGTACAAGTTACATGCTAACTGATCTGGATGCTACAATTTTTACATG TCAAATATTTTCACTGCTTCGATTTAAGTTTTGTTGAACATTTTTCTATCTTCCATAATTAGTGGTCAAAGCACGGCTAA GATTGAGGAGCTGCTTCTAGAAGATCAAAATGTAAAACGCAGAAGAGAGCGTATCCAGAAACAATCCTCGCTTCTTTCTA AATTAACACGCCAATTGAGTATTCATGACAACCGAGCATCTGCTGCCTCTAGTTGGTCAAATGGCAGTGCAGGTGTGTGT AAGCTGCCTTTTTTACTCATTTACATATTTATTAGATCTAATGTATTATAGCATTTAATTTTTGTATATATTGAAAATTG TCATCTTTGATGGCAGAATTTTATCCAGAACTTTGATGCTTTTACTTTCTGATTGTTCTTCTGTATAAAATATACATCGT GGACCTGTTGACTGTTGATTAATATGGTTAGGATAAATTACATGCGTGCAGAGATAACAATCTATGTATGTTTTTGGAAT CAGCTCTTCATTTTTCATTACCAGCTACAATTTGCATTCTACTTTGTAAAGCTTGCCTTGCACTTCAAAGGATTCAAATC GTATATCTCTTATTTATTTTTTAAAATTTTCATTTTTGGGTACTGAAGACACATCGTATTTGTTTTACAGAGAGTAGCCC AAGAAGCAGCAGTGGACCAAGTGATGACTGGAGATCTGCCTTTGATGCAGCTGCCAATGGCCCTGTTAGCCGCAGTGGCT CATCGAGATCTGGATCCAACGGTCATACTCGACATAATAGTGATCCTGCACAAAATGGTGACTCTGGTTCAAACTCGGGA AGCCGTCGAACACCCAATCGACTACCTCCTGCTCCACCAGGTTCCTCGGGTTACAGATATTAACGAATAGCCGGCTGGTG ATTGCTTGACAATTCATGTTTTGATACATTTTTGGAGGGTGAGACTGCTCCCGCCCCATTTCATATACCTTTGAGGATAA GGTCGTCCAATTCTTTGTTTCTGCCAGGGTATTTAGGTTATGAGGAATGTTTGTGTAAATAGAAGACTAGTTTGTTAGTA TATATGTTTTCCGGGCTTGTCTCATTTCCGGGAAGTATGGAGTATCAACGCCGAACTTGAATACATTTATCATGTTTTGC TATTCAATATTCTTTCTTTTTACACTTATACCTTCTAATGTTTCTTTTTCACTTATGCTGGTTTTGGGAACTTGCACTCA TTTTTGTATGCAAACGGTGTATCATGCTCTCCTAAGATTGGAACAATTGCCAATGGGTTTATTAGAAACATTTGGAGTAT TTTATTCATATGGGGATATTTGTAGTGCATCTTTGTTTCTGCATAGTTATCTTTTCCAACCATTGATGGCTGGACATTAT TATTATATTTATTAAGTTACATTTTGGATTGTACTTTTAACCCGTAATTGTAGTTATGAATAGATTTTGTTCTCCTAACT CGTCAATTTTAGTTTAACTAAAAATTAATATTACTTCGTCTAACCTAAATGGCGTATGAAGTTATGAAATAGGCTTAATA CATCAGAAGGCCCCTGTAATTGTAAAGGGAATCAGTTCCAGGGCCTGAAGAATTTTCGCATCAAATTGGGTCCTTAAGAA ATTTTTTTTAATTCAATTAAGGCCAAATCTCAATTTTGTCCTAGTCATCAGTGACACCTGGCTTTTATAATTTTTTTTTA ATTAAAAAATATTAAAAAAATAATTTTTAATACCAAGTCATCAAATTAATCAGAAAAAAAAATTAAAAATCTTAATAAAA ACCTAATCTAATAATCCTAAACTAAACAGCCTAATAATCTAACTAATAAACTAATCTAATAATCTAACCTAATCTAACAA TCTAACTAAAAAACCTAATCATCTTCTGGAACCTTCCTCCCCCACTTTCTCCTCTTCTCGTTCAGATTGATCGACTGCCA TCCTCTCCGCCA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0054800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCGGCGATCGATGACTTGTCGGAGCTCGCTGATTCGATTCGCCAAGCCGCGGCGCTCCTCGCCGACGAAGACGTCGA TGACTCCAACTCCTCATCTTCCAGACGGCCTTCCACTTTCCTCAACGTCGTCGCTCTCGGCGGTGTCGGAGCTGGTAAAT CCGCTGTTCTCAACAGTTTGATTGGACATCCCGTTTTGCCTACTGGCGAAAACGGAGCTACTCGGGCTCCTATATGCATT GATCTGCAGCGAGATACTTCGTTGAGCAGCAAATCGATTATCATACAGATTGACAATAAGTCCCAGCAAGTCTCTGCAAC TGCTTTAAGACATTCGTTGCAGGACAGATTGAGCAAGGGCTCCACGGGCAAGAGTCGGGATCAAATACTTTTGAAGCTAC GCACTAGCACAGCACCACCTCTTAAGTTGGTTGATTTACCTGGGTTAGATCAGCGTATCATGGATGGATCGATGGTTAGT GAATATGTGGAGCATAATGATGCCATTTTGCTAATTGTTATACCTGCATCTCAAGCACCTGAAGTTGCTACATCTCGTGC TCTTAGAGTTGCAAAGGAATATGATAGCGAAGGTACCAGAACTGTTGGTGTTATCAGTAAAATTGATCAAGCTGCAGCAG ACCAGAAGTCACTAGCTGCAGTTCAAGCACTTCTAATGAATCAAGGTCCTCCAAAAGCATCAGATATCCCTTGGGTTGCA TTGATTGGTCAATCAGTTTCAATAGCTACAGCTCAGTCTGGATCTGCTGGTTCTGAAAGTTCCTTGGAAACTGCATGGAG AGCAGAGAGTGAAAGCCTCAAGTCCATATTGACAGGAGCTCCTCCGAGCAAGCTTGGAAGGATAGCTTTGGTTGATGCCC TGGCACAGCAGATTCAGAATCGTATGAAGCTTCGGGTCCCTAACCTTCTTTCTGGGTTACAAGGAAAGTCCCAGATAGTT CAGGATGAATTGGCGAGGCTTGGTGAGTCAATGGTCACCACTTCAGAGGGTACACGTGCTATAGCCTTGGAACTTTGCCG TGAATTTGAGGATAAGTTCCTACAACACATTACCTCTGGCGAGGGAGCTGGTTGGAAAATTGTTTCCTGCTTTGAGGGGA GATTTCCTGATAGAATGAAGCAATTACCTTTAGATAGGCATTTTGATATCAACAATGTAAAGAGGATTGTGTTAGAAGCT GATGGTTATCAGCCTTATCTTATTTCCCCTGAAAAGGGATTAAGATCATTAATCAAAGGTGTTCTGGAGCTCGCAAAAGA ACCATCTCGTCTTTGTGTTGATGAGGTACACCGTGTCCTAATAGAAATTGTGTCTTCTGCTGCCAATGCTACTCCTGGTT TAGGAAGATATCCGCCTTTCAAGAGAGAGGTTGTAGCTATTGCTACTGCTGCACTAGAAGTGTTTAAGAATGAATCGAAG AAAATGGTGGTTGCACTAGTTGATATGGAGCGTGCTTTTGTGCCACCACAACATTTCATTCGCCTGGTACAAAGGAGGAT GGAAAGGCAACGTCGAGAGGATGAGCTGAAGGGCCGACCCTCCAGAAAAGGGCAGGATGCAGAGCAATCTATACTTAATC GGGCCACCAGTCCCCAAACTGGTGCAAGCATGAAATCAATTAAGGAGGATAAGGATAAGGATAAGGAGAAAGACAAAGAC AAATCAAGCCAGGCAGAGAAAGAAGGGCAAGAAGGCTCTGGTTTAAAGACTGCTGGACCTGAAGGAGAAATTACAGCAGG ATTTTTGTTAAAGAAAAGTGCAAAAACTAATGGTTGGAGCAGGCGATGGTTTGTGCTTAATGAGAAGACAGGAAAGCTTG GGTACACCAAAAAGCAAGAGGAAAGGCATTTTCGTGGTGTTATTACATTAGAGGAATGTAACATTGAAGAGGTTTCAGAT GAAGGCGATCCTCCACCAAAAAGCTCAAAGGACAAGAAGTCTAATGGACCTGATTCTGGCAAAGTCAACCTTGTATTTAA AATTACTAGCAGAGTTCCTTATAAAACCGTTTTGAAAGCGCATAGTGCTGTTCTTTTGAAGGCTGAGAGCACAACTGATA AGGTTGAATGGATTAAGAAGATAAGTAACGTTATACAAGCAAAGGGAGGACAAATAAGGCTTTCATCTGAAGGCTCTACC ATGAGACAGAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGGACACCATGGCTCGAAGACCTGCTGATCCTGAGGAAGAACTCCGGTGGAT GTCCCAAGAAGTTCGTGGCTATGTGGAAGCAGTTTTAAACAGTTTAGCTGCTAATGTACCAAAGGCCATTGTCCTTTGCC AAGTTGAAAAATCTAAGGAAGACATGCTGAATCAATTATATAGCTCTGTCAGTGGTCAAAGCACGGCTAAGATTGAGGAG CTGCTTCTAGAAGATCAAAATGTAAAACGCAGAAGAGAGCGTATCCAGAAACAATCCTCGCTTCTTTCTAAATTAACACG CCAATTGAGTATTCATGACAACCGAGCATCTGCTGCCTCTAGTTGGTCAAATGGCAGTGCAGAGAGTAGCCCAAGAAGCA GCAGTGGACCAAGTGATGACTGGAGATCTGCCTTTGATGCAGCTGCCAATGGCCCTGTTAGCCGCAGTGGCTCATCGAGA TCTGGATCCAACGGTCATACTCGACATAATAGTGATCCTGCACAAAATGGTGACTCTGGTTCAAACTCGGGAAGCCGTCG AACACCCAATCGACTACCTCCTGCTCCACCAGGTTCCTCGGGTTACAGATATTAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0054800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAAIDDLSELADSIRQAAALLADEDVDDSNSSSSRRPSTFLNVVALGGVGAGKSAVLNSLIGHPVLPTGENGATRAPICI DLQRDTSLSSKSIIIQIDNKSQQVSATALRHSLQDRLSKGSTGKSRDQILLKLRTSTAPPLKLVDLPGLDQRIMDGSMVS EYVEHNDAILLIVIPASQAPEVATSRALRVAKEYDSEGTRTVGVISKIDQAAADQKSLAAVQALLMNQGPPKASDIPWVA LIGQSVSIATAQSGSAGSESSLETAWRAESESLKSILTGAPPSKLGRIALVDALAQQIQNRMKLRVPNLLSGLQGKSQIV QDELARLGESMVTTSEGTRAIALELCREFEDKFLQHITSGEGAGWKIVSCFEGRFPDRMKQLPLDRHFDINNVKRIVLEA DGYQPYLISPEKGLRSLIKGVLELAKEPSRLCVDEVHRVLIEIVSSAANATPGLGRYPPFKREVVAIATAALEVFKNESK KMVVALVDMERAFVPPQHFIRLVQRRMERQRREDELKGRPSRKGQDAEQSILNRATSPQTGASMKSIKEDKDKDKEKDKD KSSQAEKEGQEGSGLKTAGPEGEITAGFLLKKSAKTNGWSRRWFVLNEKTGKLGYTKKQEERHFRGVITLEECNIEEVSD EGDPPPKSSKDKKSNGPDSGKVNLVFKITSRVPYKTVLKAHSAVLLKAESTTDKVEWIKKISNVIQAKGGQIRLSSEGST MRQSLSDGSLDTMARRPADPEEELRWMSQEVRGYVEAVLNSLAANVPKAIVLCQVEKSKEDMLNQLYSSVSGQSTAKIEE LLLEDQNVKRRRERIQKQSSLLSKLTRQLSIHDNRASAASSWSNGSAESSPRSSSGPSDDWRSAFDAAANGPVSRSGSSR SGSNGHTRHNSDPAQNGDSGSNSGSRRTPNRLPPAPPGSSGYRY 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 3 879 877 0.0
PANTHER 3 879 877 0.0
SMART 4 258 255 2.4E-6
Gene3D 7 326 320 5.1E-42
SUPERFAMILY 32 316 285 4.95E-35
ProSiteProfiles 37 307 271 53.064
PRINTS 40 58 19 4.4E-12
Pfam 43 207 165 1.8E-31
CDD 43 307 265 4.34221E-53
PRINTS 65 82 18 4.4E-12
ProSitePatterns 66 75 10 -
PRINTS 177 195 19 4.4E-12
PRINTS 196 212 17 4.4E-12
Pfam 278 498 221 6.2E-22
Gene3D 335 522 188 1.5E-26
MobiDBLite 511 581 71 -
MobiDBLite 526 544 19 -
MobiDBLite 545 567 23 -
Gene3D 581 702 122 9.7E-18
ProSiteProfiles 582 706 125 15.435
SUPERFAMILY 583 715 133 6.56E-20
SMART 583 708 126 1.6E-15
Pfam 587 705 119 2.5E-12
MobiDBLite 635 660 26 -
MobiDBLite 640 657 18 -
Gene3D 703 812 110 1.0E-7
MobiDBLite 715 730 16 -
MobiDBLite 715 736 22 -
Pfam 742 824 83 5.0E-13
ProSiteProfiles 744 837 94 19.737
Coils 798 818 21 -
MobiDBLite 835 924 90 -
MobiDBLite 835 860 26 -
MobiDBLite 872 909 38 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function GTPase activity Catalysis of the reaction: GTP + H2O = GDP + phosphate.
Molecular function GTP binding Interacting selectively and non-covalently with GTP, guanosine triphosphate.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0054800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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