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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi3g1v0054800 |
Transcript ID | LotjaGi3g1v0054800.1 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Dynamin homolog; TAIR: AT1G59610.1 dynamin-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9LQ55|DRP2B_ARATH Dynamin-2B; TrEMBL-Plants: tr|Q9SDX4|Q9SDX4_ASTSI Dynamin homolog; Found in the gene: LotjaGi3g1v0054800 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:5716872..5729123) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAGGGACCCACCCGTCAACAGAGACAGACGACAACCATTTCAAAACGCGGAAGGAAGAGTGAGAGAGAGATATTAGAGA GAGAGAGAGAGAGAGAGCGTGGAAGTGCTTTTTGAATTTTCCCAATCGCCCTTCAATTCACTCCCAACAGAACCCAAACC CCATTCCTTCAATTCTAGAGAGAGAATCTCCGAGATCTACTCCCTCTCTTCACACAGATCGTACCCTCCGTCTGGGTTTA GGGTTCGGTTTCGATCGATCCCTATTCGAATTCGATTCACCTTCTTCCTCCTCCGTTTTTTGATCCGTTTGGTTGACCTA TGGCGGCGATCGATGACTTGTCGGAGCTCGCTGATTCGATTCGCCAAGCCGCGGCGCTCCTCGCCGACGAAGACGTCGAT GACTCCAACTCCTCATCTTCCAGACGGCCTTCCACTTTCCTCAACGTCGTCGCTCTCGGCGGTGTCGTAAGTCTCCATTT CTTCATCATCATCTTCACCGTAATTTATCAGTTACATACAATTCATTTCCAATTTTGTAGGGAGCTGGTAAATCCGCTGT TCTCAACAGTTTGATTGGACATCCCGTTTTGGTAAGCTAGATTTCAATTTCCATTTCTCTCGATTTTCCATTTTAGGTTC TCAATTCTACTAGTTTTAGTCTTAGAAGTGATAGTTTTAGTGAAAATTGAAGTGAATGTTTGTGATCTTCAGCCTACTGG CGAAAACGGAGCTACTCGGGCTCCTATATGCATTGATCTGCAGCGAGATACTTCGTTGAGCAGCAAATCGATTATCATAC AGATTGACAATAAGTCCCAGCAAGTCTCTGCAAGTCAGTTTCTCTTGTTAACCAAAGTGTCTGATCTATTCCATTCGCGC GTTTTTTCTTTCTCGAACGAAAGTATTCATGTGCTTTGTTTTGTTTTCCGCAGCTGCTTTAAGACATTCGTTGCAGGACA 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CAAGCTGCAGCAGACCAGAAGTCACTAGCTGCAGTTCAAGCACTTCTAATGAATCAAGGTCCTCCAAAAGCATCAGATAT CCCTTGGGTTGCATTGATTGGTCAATCAGTTTCAATAGCTACAGCTCAGTCTGGATCTGCTGGTTCTGAAAGTTCCTTGG AAACTGCATGGAGAGCAGAGAGTGAAAGCCTCAAGTCCATATTGACAGGAGCTCCTCCGAGCAAGCTTGGAAGGATAGCT TTGGTTGATGCCCTGGCACAGCAGATTCAGAATCGTATGAAGCTTCGGGTCCCTAACCTTCTTTCTGGGTAATTTCCATG CTGTGCAATTTGATATTATCTTATTGCTATTATGTATCATTGTTTGCATTTGTGGTCTTGTTTGTGGTGGAAACCTAAGA AGTTTACAATAAATAAATGGTTGGTGTTTCTTGGCATTTATGTGAAATGCTTCAGCTTATTGTTTTTTAACTTTTATATT TTGTTCACCACATGAATAACTATATAAGATTAAATGATTTGTGATATACACAATTGTGTCCTGTTAAAATGCGGTTGTTT TAAAAGGAAAAAATATGTTTTTTTATTGTTGTTTAAAATAGTCTCTTAGTCAATGTGCTCTTTTAATACATCCTTGATTT GATTATCTGAGCTATGTTTTTTCAGATTACTTTTGTTTTCTCACGGGTATTCTTGTTATTTATTAGTTGAATCAGTCTTA TCTGTGAGAAGTCCATATGGAAGTTTAGTAAGTTAAAATAGATAAGGTCAAAACAAACTAGTAGTTAGATCTGTTAGCAT ACAACATTCCAGTGGTTCTTGTAGAAGTTCTGGCTATTTGCTAAAACATTGGCAACTGAATTGCTCTCTATGAAATTTGG CTTTCAGTAAGGATTGCCATTTTAGTAAGTGAATTGTATTAATTTTAACTGATGTGATGTTAAGGTTACAAGGAAAGTCC CAGATAGTTCAGGATGAATTGGCGAGGCTTGGTGAGTCAATGGTCACCACTTCAGAGGGTACACGTGCTATAGCCTTGGA ACTTTGCCGTGAATTTGAGGATAAGTTCCTACAACACATTACCTCTGGCGAGGTATGTTTTCTCAATCATATATTTTAAT CGAACTTGAATTATTTGCAATGATGCTTATCATTGGGGGGGGGGGGGTGCTATTTCTTTTGTATCCAGTATTTATAGCTT CATTCTTTTGCACACTATAGTATATCTAGGGTCTCTGCACATTAGAAAAAACACTGGGCCCAATTTAATTTTAAGAAAGC AAAGCTTTTTAGGTTTGTGGAAATGAGAAAGAGCTTTATTTGATTGTTTTACATTTAAGATATTCATTATTATTGATCTG GTGCTCTGGTTATAAATATTACTGGTCCACATCCAATATCTGTTAGTTGCCATTTTATATAATGTCAACAACCGATGATC CCCTGAGATAATCCTTACTCTTTGCACAACCGATGATCCCCTGTGATAATCCATGCGCTAAACACCAAAGGTACCCTCTT GAAATCATACAAGTCCTTTCACCCCGCGGACTGCAAAGATTTATAGACCATGTATTGCCCCAATGCTCTGCTCTCCTTAT TTTACCATTCATTTGGAAGTGAACATGAAATAAGTGATCAATTGAGGGAGAATAAACCCAGTTTCTTAACATATACTAAA AAAGATTATTCCAATTGTGGCTCAGCTGAACACTAGAGAAATAAATGGGGAAGTTTCGTTTATAAATAATTTGGGAATTA TTTTGAAACTTCAGCATTTAATGATAAATTGGTTTTGACATTGTGTTGATGGACAATTAATGTGTTTGTTGCTTGAGTTT GTTATTGTTTGCTGAATTACTATAATTTTATCTGGCAGGGAGCTGGTTGGAAAATTGTTTCCTGCTTTGAGGGGAGATTT 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AGTTCTATTTTTCTGGTTTCTTACAGAGAATCTCTTTGCCTTATACTCTAGGTACACCGTGTCCTAATAGAAATTGTGTC TTCTGCTGCCAATGCTACTCCTGGTTTAGGAAGATATCCGCCTTTCAAGAGAGAGGTATGGTACTATGTAGTTTATTTAT TTTTTACTTGCTCGCTACCGATTTCTGTATGTTATGTGACATTGGAGTGCAATTTTTAATTGCATATTTTGCTTCCTTCT TCATGAATGTATCCCCCTGGGTGGGAAGTGGACTTTCTCTTTCTTTTTAATAACCTCGTTTAAAAACTTTCAAGGTTGTA GCTATTGCTACTGCTGCACTAGAAGTGTTTAAGAATGAATCGAAGAAAATGGTGGTTGCACTAGTTGATATGGAGCGTGC TTTTGTGCCACCACAACATTTCATTCGCCTGGTACAAAGGAGGTAATTTGGATTTGGACATTTTCTAAATGGATCCTGAT CTTCTTGTTTGGAGAATGATTTGTTCCCTACTCTATCTGTCTCTTTGATAGGAACCATATTTATCAATTCGGGTAGAATC TCTTAGTAGCCAACCCCAAAAGTGCTACAACACATAGTGGGATGGCTGCTGCTATGAATTTTTTTATATAGTTTATACAA TTTATTTATAAGATATACATATGAATGCCCAAAATTTGGACTCTACTAAGCTTACTAATATCTTCTAGTCAAGGCAATTT TGCAGAACTTGGAATCCTAAATAAGTTCTTCCTCTTGGCTTGTAAAACTTTACCGAAGACCCAAATCCATAAACTATTAT TTTCTACTACTAGTTGCTTATACCTACAGTTGTAGGCTTTTGCCTAATTTATATTTATTTAGTTATTCTGTGTTATTTAC TCTAGGATGGAAAGGCAACGTCGAGAGGATGAGCTGAAGGGCCGACCCTCCAGAAAAGGGCAGGATGCAGAGCAATCTAT 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ATTGCTTTTCATGTGTAAGTAATGTAAAATTGGACACTGCTGGTTCTTATAATTGGCTTTACATATGTGTGAGTAATGTA AAATTGGACACTGCTGGTTCTTATAATTGGCTTTAATGTAATGTAAAATTGCTTGCATAGGCAGCCAAGTAAGACCACTG ACAGAAAAACCTAATATTATAACCTAATTTTCCTGAAATGCATCATAGATGTTTGCACCTTGGAGTATGATTGTTCCTGT AGTTTCCAATTGATAAAAGTTTTTTTTTTTGAATCTGTGTTGCTTTTACATTCATTTAGACTGAGATGTAATTGGCTGCT TTTGGTGCAATTTTGTATATGTAGTGTTGACTTTATACTTTATACTTTCACTTCCACAGCTTGGGTACACCAAAAAGCAA GAGGAAAGGCATTTTCGTGGTGTTATTACATTAGAGGTATGGAGGATTATTATTACTTTTGCACATTCATATTCGTATTT ATAACCTAACAGCTTACTGTCTTCAATATACACATTATGAGGGAATAGATTATGACGTAATTTCCTTCTCAGCAATTAGT GATGCTTATTTAATTAAATTTATTGGTCCTGAACGTGTTTTATTTTTTTGCTTGAATAATTCAATTATTGTTGTCAAAAT TTCCCTTGATTGCGTTTCTCTAATGCAGTATTTAATATTTATGATGTTTTAGGTTTGAAAATAATTCTTTTAAAATTGCA AAGCCTTCAAAATATAAAAATGAAATAGGTGCACAATTGTTGATTTAGTTATTTATTTTAGATATTTGAAAGTTTGAAAC ACACTAATGATGTTCAATTTTTTCCTCCAGAATTTGTTGTTTGTTTGAACTCTTGAAATGAAACAGCGGTGAATATGTTT GTGCAACTGATATGTGGAATAAAATCTTTCACAATAGTTCTATTTTCCCTATAGGTTTAGTCATTTCATTCCAAGTCTGG TTTATTTTTTATGGGAAACTAGTGGATTACTGTCTATGCATTATTTTTCTCTCTCAAAGTTCCTGAGTTCTATTATGCTG GTAGGTTAAATTGATTAAATACCAACTTTTTTTGTTGGACAAGATATAATATCAACTCAAATTCCATAATATGTTTGTTT CTATGCTATGGATTCATGTTACTTCAAGCTTCTTAAATGGCATTTCACATGTCTAGAAAAATTGTCATCCCATGCATGGG TATGGGCTGGGTGCAAACCTTTGTTGGTGCACCAGTAGTCGGGTGGGTGGTTAGCTGACTCGTATATTATATGGATATGG ATATGGAGTAACCTCCAATTCTGTTAGGGTGATAAGTATGGCAAATCTTCCTTTTTGCTGGAAAATGCTTATTTAATCTA AATGTAAGATCATTTCAGTGTTCTACTTGAATTTGGATATTTTGATGTGTTTGTTTGTTATTGTTCCTTCTCTTCTTACT GTTATCTCTGGTGTCATAACTCAACTTTAAAGCTTAGGTTTTAATATGCTTGCCTTTTGCTAACTAGATATTCACTTGTA ATTTTCTGAAGTTTCACATTGTTGCAGTATGTACTGGCTTATGTTTTGACAGTCAGTGGGTTACACTGAAAATAGGGTGC AATTCATAGTCTTGATAAGCATCCAATTTAAATTACTATGCAGGAATGTAACATTGAAGAGGTTTCAGATGAAGGCGATC CTCCACCAAAAAGCTCAAAGGACAAGAAGTCTAATGGACCTGATTCTGGCAAAGTCAACCTTGTATTTAAAATTACTAGC AGAGTTCCTTATAAAACCGTTTTGAAAGGTAACTTATTGACACTGATAGTGCATACGAACTTTTATTTCTTTAGAAACTT CTGAAAAGTGAGAACATTTTAATTACATTGTTTTTCTCTATTGCAGCGCATAGTGCTGTTCTTTTGAAGGCTGAGAGCAC AACTGATAAGGTTGAATGGATTAAGAAGATAAGTAACGTTATACAAGCAAAGGGAGGACAAATAAGGCTTTCATCTGAAG GCTCTACCATGAGACAGAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGGTGAGTTGCTGGCTTAAAGCCACTGTTCGTGCTGTACATTTC GTATGATGTGGTCATTAGGCTTATATAATTAAATTCATGAATTAGTATATTCCTTGATTAACGAAGTTTATTAATCTGGT GATTTTTTGGTTAACCTTTGTGCACTGTAACTAATTTTATATATTTGGCCTTTTTGGGATCTCTCAAATCATTTTTTTAA ATATAAATCAATTTTGTTGAGGTTTTCCATTAGGGTGCTGGTCATGAAATTAAAATCAAAACTACTAAATGAAATCCAGA AAGCATTGAATACTTTATTTTAGTAATTAGGATTATTTAATGAAGGGCAATCATTTCTCAATTAACAAGCCCCTATACTT TATTTAATGGAACTTTGTGTAAGCCTTTGTTGGGAGTTCATTCAGTTAGGTGGAGCACAAACCTGACCAACTCGAAGCAA ACTAGAGGAGGTTGGGTCATGAATTCTCCAAGCCAATTTCCGTCACTTGTAAATTTGAATTTTATTGTGTCAAAATATCT GGGATGTAGAGTGCATTCGCTCAGCAATCGTGAGAACATGTCTAGATTCCATAAGTGTATCCTTAGTTTCATAAGTAGAC ATAATAAAAAAATGAGTTGAAGATAAATTGGTAACCCTGTTGTTTTTCTCTTTGTTGTATCTCAGGACACCATGGCTCGA AGACCTGCTGATCCTGAGGAAGAACTCCGGTGGATGTCCCAAGAAGTTCGTGGCTATGTGGAAGCAGTTTTAAACAGTTT AGCTGCTAATGTACCAAAGGCAAGCTTCTGCTTTTAACTTTTTATTTTCTATAATATTTTTCAGTTTTGTCGATGTTAAT TTTTAATGCTTTTTCTGGTTTATTGTTTGGCAGGCCATTGTCCTTTGCCAAGTTGAAAAATCTAAGGAAGACATGCTGAA TCAATTATATAGCTCTGTCAGGTTCAGAAATTTGAGATTTCCTTTACATTTACTTTTGTTTTCTTGAAAACAAAATTCTG GCATTTTGTTATAGGTTTTTGAAGATGTTCAATTGTTCTTGTCTTAATTAAATCTCTTGGTTGAAATCATCTAAATATAA TTTTTTACAACTTTCCGTTTCCTGATTATTATGTCTCTACTGGGGGGGGGGGGTATCTAGGAATAGGTGAGGGGACATTA CTGGTTTTACGAGAACTTGCATTCACGTGATACACTCCCTCCATGTTTGCGTGTGTGAGAGTAGAGGGAGGGAGGTACTA TTTATGTGTGTGTGAGGGCAGAGGGAGGGAGGTGCTATTTATTATAAAACGAATTACATGTGAATGTGAGAAGAGGTAGA AACAGAAATCATGGGTAGAGAAAAAAGGGAGAGAAATTGAAAATTTTCTCTGCGAAAGCTATGTATTGCTTTACTATCAC TGAACATTGTGTGTGTGTGTGTTGTGTTCTTCAAGGTGCAGTAATTCTGCTTTGTATGTCAATAGGGAAAACTCCGAACT TCACTCATGATCAATCATTCATTTTTATCATGTTGTACAAGTTACATGCTAACTGATCTGGATGCTACAATTTTTACATG TCAAATATTTTCACTGCTTCGATTTAAGTTTTGTTGAACATTTTTCTATCTTCCATAATTAGTGGTCAAAGCACGGCTAA GATTGAGGAGCTGCTTCTAGAAGATCAAAATGTAAAACGCAGAAGAGAGCGTATCCAGAAACAATCCTCGCTTCTTTCTA AATTAACACGCCAATTGAGTATTCATGACAACCGAGCATCTGCTGCCTCTAGTTGGTCAAATGGCAGTGCAGGTGTGTGT AAGCTGCCTTTTTTACTCATTTACATATTTATTAGATCTAATGTATTATAGCATTTAATTTTTGTATATATTGAAAATTG TCATCTTTGATGGCAGAATTTTATCCAGAACTTTGATGCTTTTACTTTCTGATTGTTCTTCTGTATAAAATATACATCGT GGACCTGTTGACTGTTGATTAATATGGTTAGGATAAATTACATGCGTGCAGAGATAACAATCTATGTATGTTTTTGGAAT CAGCTCTTCATTTTTCATTACCAGCTACAATTTGCATTCTACTTTGTAAAGCTTGCCTTGCACTTCAAAGGATTCAAATC GTATATCTCTTATTTATTTTTTAAAATTTTCATTTTTGGGTACTGAAGACACATCGTATTTGTTTTACAGAGAGTAGCCC AAGAAGCAGCAGTGGACCAAGTGATGACTGGAGATCTGCCTTTGATGCAGCTGCCAATGGCCCTGTTAGCCGCAGTGGCT CATCGAGATCTGGATCCAACGGTCATACTCGACATAATAGTGATCCTGCACAAAATGGTGACTCTGGTTCAAACTCGGGA AGCCGTCGAACACCCAATCGACTACCTCCTGCTCCACCAGGTTCCTCGGGTTACAGATATTAACGAATAGCCGGCTGGTG ATTGCTTGACAATTCATGTTTTGATACATTTTTGGAGGGTGAGACTGCTCCCGCCCCATTTCATATACCTTTGAGGATAA GGTCGTCCAATTCTTTGTTTCTGCCAGGGTATTTAGGTTATGAGGAATGTTTGTGTAAATAGAAGACTAGTTTGTTAGTA TATATGTTTTCCGGGCTTGTCTCATTTCCGGGAAGTATGGAGTATCAACGCCGAACTTGAATACATTTATCATGTTTTGC TATTCAATATTCTTTCTTTTTACACTTATACCTTCTAATGTTTCTTTTTCACTTATGCTGGTTTTGGGAACTTGCACTCA TTTTTGTATGCAAACGGTGTATCATGCTCTCCTAAGATTGGAACAATTGCCAATGGGTTTATTAGAAACATTTGGAGTAT TTTATTCATATGGGGATATTTGTAGTGCATCTTTGTTTCTGCATAGTTATCTTTTCCAACCATTGATGGCTGGACATTAT TATTATATTTATTAAGTTACATTTTGGATTGTACTTTTAACCCGTAATTGTAGTTATGAATAGATTTTGTTCTCCTAACT CGTCAATTTTAGTTTAACTAAAAATTAATATTACTTCGTCTAACCTAAATGGCGTATGAAGTTATGAAATAGGCTTAATA CATCAGAAGGCCCCTGTAATTGTAAAGGGAATCAGTTCCAGGGCCTGAAGAATTTTCGCATCAAATTGGGTCCTTAAGAA ATTTTTTTTAATTCAATTAAGGCCAAATCTCAATTTTGTCCTAGTCATCAGTGACACCTGGCTTTTATAATTTTTTTTTA ATTAAAAAATATTAAAAAAATAATTTTTAATACCAAGTCATCAAATTAATCAGAAAAAAAAATTAAAAATCTTAATAAAA ACCTAATCTAATAATCCTAAACTAAACAGCCTAATAATCTAACTAATAAACTAATCTAATAATCTAACCTAATCTAACAA TCTAACTAAAAAACCTAATCATCTTCTGGAACCTTCCTCCCCCACTTTCTCCTCTTCTCGTTCAGATTGATCGACTGCCA TCCTCTCCGCCA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0054800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGGCGATCGATGACTTGTCGGAGCTCGCTGATTCGATTCGCCAAGCCGCGGCGCTCCTCGCCGACGAAGACGTCGA TGACTCCAACTCCTCATCTTCCAGACGGCCTTCCACTTTCCTCAACGTCGTCGCTCTCGGCGGTGTCGGAGCTGGTAAAT CCGCTGTTCTCAACAGTTTGATTGGACATCCCGTTTTGCCTACTGGCGAAAACGGAGCTACTCGGGCTCCTATATGCATT GATCTGCAGCGAGATACTTCGTTGAGCAGCAAATCGATTATCATACAGATTGACAATAAGTCCCAGCAAGTCTCTGCAAC TGCTTTAAGACATTCGTTGCAGGACAGATTGAGCAAGGGCTCCACGGGCAAGAGTCGGGATCAAATACTTTTGAAGCTAC GCACTAGCACAGCACCACCTCTTAAGTTGGTTGATTTACCTGGGTTAGATCAGCGTATCATGGATGGATCGATGGTTAGT GAATATGTGGAGCATAATGATGCCATTTTGCTAATTGTTATACCTGCATCTCAAGCACCTGAAGTTGCTACATCTCGTGC TCTTAGAGTTGCAAAGGAATATGATAGCGAAGGTACCAGAACTGTTGGTGTTATCAGTAAAATTGATCAAGCTGCAGCAG ACCAGAAGTCACTAGCTGCAGTTCAAGCACTTCTAATGAATCAAGGTCCTCCAAAAGCATCAGATATCCCTTGGGTTGCA TTGATTGGTCAATCAGTTTCAATAGCTACAGCTCAGTCTGGATCTGCTGGTTCTGAAAGTTCCTTGGAAACTGCATGGAG AGCAGAGAGTGAAAGCCTCAAGTCCATATTGACAGGAGCTCCTCCGAGCAAGCTTGGAAGGATAGCTTTGGTTGATGCCC TGGCACAGCAGATTCAGAATCGTATGAAGCTTCGGGTCCCTAACCTTCTTTCTGGGTTACAAGGAAAGTCCCAGATAGTT CAGGATGAATTGGCGAGGCTTGGTGAGTCAATGGTCACCACTTCAGAGGGTACACGTGCTATAGCCTTGGAACTTTGCCG TGAATTTGAGGATAAGTTCCTACAACACATTACCTCTGGCGAGGGAGCTGGTTGGAAAATTGTTTCCTGCTTTGAGGGGA GATTTCCTGATAGAATGAAGCAATTACCTTTAGATAGGCATTTTGATATCAACAATGTAAAGAGGATTGTGTTAGAAGCT GATGGTTATCAGCCTTATCTTATTTCCCCTGAAAAGGGATTAAGATCATTAATCAAAGGTGTTCTGGAGCTCGCAAAAGA ACCATCTCGTCTTTGTGTTGATGAGGTACACCGTGTCCTAATAGAAATTGTGTCTTCTGCTGCCAATGCTACTCCTGGTT TAGGAAGATATCCGCCTTTCAAGAGAGAGGTTGTAGCTATTGCTACTGCTGCACTAGAAGTGTTTAAGAATGAATCGAAG AAAATGGTGGTTGCACTAGTTGATATGGAGCGTGCTTTTGTGCCACCACAACATTTCATTCGCCTGGTACAAAGGAGGAT GGAAAGGCAACGTCGAGAGGATGAGCTGAAGGGCCGACCCTCCAGAAAAGGGCAGGATGCAGAGCAATCTATACTTAATC GGGCCACCAGTCCCCAAACTGGTGCAAGCATGAAATCAATTAAGGAGGATAAGGATAAGGATAAGGAGAAAGACAAAGAC AAATCAAGCCAGGCAGAGAAAGAAGGGCAAGAAGGCTCTGGTTTAAAGACTGCTGGACCTGAAGGAGAAATTACAGCAGG ATTTTTGTTAAAGAAAAGTGCAAAAACTAATGGTTGGAGCAGGCGATGGTTTGTGCTTAATGAGAAGACAGGAAAGCTTG GGTACACCAAAAAGCAAGAGGAAAGGCATTTTCGTGGTGTTATTACATTAGAGGAATGTAACATTGAAGAGGTTTCAGAT GAAGGCGATCCTCCACCAAAAAGCTCAAAGGACAAGAAGTCTAATGGACCTGATTCTGGCAAAGTCAACCTTGTATTTAA AATTACTAGCAGAGTTCCTTATAAAACCGTTTTGAAAGCGCATAGTGCTGTTCTTTTGAAGGCTGAGAGCACAACTGATA AGGTTGAATGGATTAAGAAGATAAGTAACGTTATACAAGCAAAGGGAGGACAAATAAGGCTTTCATCTGAAGGCTCTACC ATGAGACAGAGCCTCTCTGATGGTTCCTTGGACACCATGGCTCGAAGACCTGCTGATCCTGAGGAAGAACTCCGGTGGAT GTCCCAAGAAGTTCGTGGCTATGTGGAAGCAGTTTTAAACAGTTTAGCTGCTAATGTACCAAAGGCCATTGTCCTTTGCC AAGTTGAAAAATCTAAGGAAGACATGCTGAATCAATTATATAGCTCTGTCAGTGGTCAAAGCACGGCTAAGATTGAGGAG CTGCTTCTAGAAGATCAAAATGTAAAACGCAGAAGAGAGCGTATCCAGAAACAATCCTCGCTTCTTTCTAAATTAACACG CCAATTGAGTATTCATGACAACCGAGCATCTGCTGCCTCTAGTTGGTCAAATGGCAGTGCAGAGAGTAGCCCAAGAAGCA GCAGTGGACCAAGTGATGACTGGAGATCTGCCTTTGATGCAGCTGCCAATGGCCCTGTTAGCCGCAGTGGCTCATCGAGA TCTGGATCCAACGGTCATACTCGACATAATAGTGATCCTGCACAAAATGGTGACTCTGGTTCAAACTCGGGAAGCCGTCG AACACCCAATCGACTACCTCCTGCTCCACCAGGTTCCTCGGGTTACAGATATTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0054800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAAIDDLSELADSIRQAAALLADEDVDDSNSSSSRRPSTFLNVVALGGVGAGKSAVLNSLIGHPVLPTGENGATRAPICI DLQRDTSLSSKSIIIQIDNKSQQVSATALRHSLQDRLSKGSTGKSRDQILLKLRTSTAPPLKLVDLPGLDQRIMDGSMVS EYVEHNDAILLIVIPASQAPEVATSRALRVAKEYDSEGTRTVGVISKIDQAAADQKSLAAVQALLMNQGPPKASDIPWVA LIGQSVSIATAQSGSAGSESSLETAWRAESESLKSILTGAPPSKLGRIALVDALAQQIQNRMKLRVPNLLSGLQGKSQIV QDELARLGESMVTTSEGTRAIALELCREFEDKFLQHITSGEGAGWKIVSCFEGRFPDRMKQLPLDRHFDINNVKRIVLEA DGYQPYLISPEKGLRSLIKGVLELAKEPSRLCVDEVHRVLIEIVSSAANATPGLGRYPPFKREVVAIATAALEVFKNESK KMVVALVDMERAFVPPQHFIRLVQRRMERQRREDELKGRPSRKGQDAEQSILNRATSPQTGASMKSIKEDKDKDKEKDKD KSSQAEKEGQEGSGLKTAGPEGEITAGFLLKKSAKTNGWSRRWFVLNEKTGKLGYTKKQEERHFRGVITLEECNIEEVSD EGDPPPKSSKDKKSNGPDSGKVNLVFKITSRVPYKTVLKAHSAVLLKAESTTDKVEWIKKISNVIQAKGGQIRLSSEGST MRQSLSDGSLDTMARRPADPEEELRWMSQEVRGYVEAVLNSLAANVPKAIVLCQVEKSKEDMLNQLYSSVSGQSTAKIEE LLLEDQNVKRRRERIQKQSSLLSKLTRQLSIHDNRASAASSWSNGSAESSPRSSSGPSDDWRSAFDAAANGPVSRSGSSR SGSNGHTRHNSDPAQNGDSGSNSGSRRTPNRLPPAPPGSSGYRY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 3 | 879 | 877 | 0.0 | ||
PANTHER | 3 | 879 | 877 | 0.0 | – | |
SMART | 4 | 258 | 255 | 2.4E-6 | ||
Gene3D | 7 | 326 | 320 | 5.1E-42 | – | |
SUPERFAMILY | 32 | 316 | 285 | 4.95E-35 | ||
ProSiteProfiles | 37 | 307 | 271 | 53.064 | ||
PRINTS | 40 | 58 | 19 | 4.4E-12 | ||
Pfam | 43 | 207 | 165 | 1.8E-31 | ||
CDD | 43 | 307 | 265 | 4.34221E-53 | ||
PRINTS | 65 | 82 | 18 | 4.4E-12 | ||
ProSitePatterns | 66 | 75 | 10 | - | ||
PRINTS | 177 | 195 | 19 | 4.4E-12 | ||
PRINTS | 196 | 212 | 17 | 4.4E-12 | ||
Pfam | 278 | 498 | 221 | 6.2E-22 | ||
Gene3D | 335 | 522 | 188 | 1.5E-26 | – | |
MobiDBLite | 511 | 581 | 71 | - | – | |
MobiDBLite | 526 | 544 | 19 | - | – | |
MobiDBLite | 545 | 567 | 23 | - | – | |
Gene3D | 581 | 702 | 122 | 9.7E-18 | ||
ProSiteProfiles | 582 | 706 | 125 | 15.435 | ||
SUPERFAMILY | 583 | 715 | 133 | 6.56E-20 | – | |
SMART | 583 | 708 | 126 | 1.6E-15 | ||
Pfam | 587 | 705 | 119 | 2.5E-12 | ||
MobiDBLite | 635 | 660 | 26 | - | – | |
MobiDBLite | 640 | 657 | 18 | - | – | |
Gene3D | 703 | 812 | 110 | 1.0E-7 | – | |
MobiDBLite | 715 | 730 | 16 | - | – | |
MobiDBLite | 715 | 736 | 22 | - | – | |
Pfam | 742 | 824 | 83 | 5.0E-13 | ||
ProSiteProfiles | 744 | 837 | 94 | 19.737 | ||
Coils | 798 | 818 | 21 | - | – | |
MobiDBLite | 835 | 924 | 90 | - | – | |
MobiDBLite | 835 | 860 | 26 | - | – | |
MobiDBLite | 872 | 909 | 38 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | GTPase activity | Catalysis of the reaction: GTP + H2O = GDP + phosphate. | ||
Molecular function | GTP binding | Interacting selectively and non-covalently with GTP, guanosine triphosphate. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0054800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…