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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0534700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0534700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Nucleosome-remodeling factor subunit; TAIR: AT5G12400.1 PHD-finger and DNA binding domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4JYC8|PTM_ARATH DDT domain-containing protein PTM; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PNJ8|A0A0B2PNJ8_GLYSO Nucleosome-remodeling factor subunit NURF301; Found in the gene: LotjaGi3g1v0534700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:95147987..95168379) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTCAGTGTTCAGTTTATTCTCTCTCCGCACTACTTGGTTTGACCCACTTCCACCTCCATTTGGATTTTGTTATTAACTTC CGCACCCTTTTTCTCTCCCCCTTCTTTCCATTTCCATTTCCATTTCCATTTCTTCACCTTCTTCTTCTGCGTCCAAACCC AAAACCACCAAGGGTTTCGTGTTTCTCTCTTCATTCAGTCACACACCTTCTCTGTTTCCCATCAATTCAATCACAATCGC TGTTTGTGATGGAGTTCGTGGGCAAAACCGTGAAGAAAGAGGTCAAAGGGGTTGGGACTGTTTCTGGAACTGTCAAATCA TTCGACCCTTCAACGGGTTTTGTTGAGATCGCTTACGAAAATGGTCATTCTGAGAAGCTTGAATTCTCCGACGTCGCTCC CCTCTTGGAATTTCAACCGGAGGTGGGCAAGGTTAAGCCCAAGGTTGGCCGGAAACCCAAGAAGCGGCGTCGGGTCGAGC GGAAGCAGCGGCAAGGCGCGACGACGGGTTCAGGTAATGCTCTTGCTAGTGATAATTCGGTATCTGAGGGTGATGGGTTT AGTGGGGTGTTGTTGGATGCTGGTGTTTCTGGTAGTGAATTAGGGTGTGTGAATGAGAGTGGCTTGGCTGTTGAAAATGG GAATGGTGGGAATGTTAGTGGTAATGTGAATGGGAGTGTGGAAGAAATTGGGGTTGGAGAGAATTTGAATTTGAATTTGA ATGGGGGTGTGTCTGCTAATGGGGATTGTGTTAGAGAAGGGCTTGATTTGAATGGTGAAGTTAATCTGAATAATGGGTGT GGTTCGACTTTTAATGCTGCTGAGGGTAGTTTGGAGAGAAGAGATTGCATTGATCTGAATTTGGTTGTGAATAATGAGGG TGATGTCAATTTCAATGCGGGTTGTTCGGGAGGGGAAGCGTTGCAGGGGGAGGGTAAGTTTGACTTGAATATGGAGGTGT 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AAAAACAATGCTGCTAATGGGTCTGCCGAGGAATTATCTAGTCCTGTTTCTCTCCAACCTGTGAATGAGGTATATTTACA TCTTCTAAATCTGTATTGTTGATTGACGTGGAGAATGAAATGATAAATTTGCGCTTTTGTCACTTGAGCAAATTATGCAC TTTTTGATTGTTTAGTCATTAGTGTCTAGTGTTTATGTTGTAACTTCTACTGCACATGGGTACTTTCCCTAACATTAAAA AACATTTATTAGTAATTCAACCATATTCGTAAGAGGATTTGATGTTTGGCTTGGCTATGGATTTTGCTTTAGCATCGAAT TCAATTAATTACTATGGTCTAAGCCATTGGGGAGAATTGTATCTGCTTGTATTGGTTTGATTTCAATCATACACGAGAAT GTTCGTTTTTTGGGGTAGATAGAATGCATGCTAGGTTCAAATGAAGAAGTGAAGTATGGAGTTTCTCTGAGGATGTTGAC ATCTGCAGAATCATACTATTGTAAATAGCATTATTATAGGATAGAAGATTTTGATTCATAACTTTTTTTCTTCTCCTTCG CATATCATCATTATATTCTGTATTTATTAGGAAAAAATCTAATGCCCTTGCTTCGTGATTAACATTTATTAGGATTCATG AGCTAGAGTTTATAAATATTAGAGCTTTTAATTCGTAAATTATAACTCAAAAAAATTTGGATTTTTTAGCCCTTTCAAGT TGGTATCAATATTCTTGATTTTGGAGACTATGCTTTCGTGCAACAAGTCAACAACTCTAGCAGCCTTCATTGCAGCCGTC TTAGACTACTCGAACACCTTTGTGCTTCATGCTTCCAAAGGAATGCAGATCACCATTGATAGCTCTTTCCGCAATCAATT GCCGGGAGGAGCGCCTTTCTTATCGGCCCATAACTGAAAACCCATGGCCATCAGATCTTCTACACGCTCACACGCTGCTT TTGCATCACCATACTAGCAGGGTATGACGATGTGTTTGTCTGTTGTTTTAGTCAATGCTAGTGCCTTCTGCCTTGCCGTA GCCAGTTTGACCATGATAAGACCTTCTTTGTTCCAACCGGGAACCGTTTGCCACCTATTTTGCTTTGTTTTTCATTGTCA CCACATCCCAAATCAATGTATCAGCACCTTCTAGCCCTGTTTTAGTGTTCTATGGAGCCATCCTTCACTGTTGACCTTTC ATTTCCATTCAACCTTCATTTTGATGAGAAATCTACCCTTTTTAAACCTTGGCTATATCCTCAAAGTCGTATTGTCTATG TCTCTGTGGCTGTCACCTTTCATGAAATATTGTCGTTTTACACTACTCCTTGGCTTTAAGAGGATAATAGTCTTGAATCT GAATCTCTTGAGTCATCACTCTTTCCTCTTATGCAGGATTTGGCAGCATCTTCTTGCACTATTCCTGAGGACGACACTAC TTATGTGGACCATGCACCGATACACGCCACAAATCAAAATAGATATAGCTACCGGTATCAAAGACGGCGAAAACCCGATG TGGTCCAATAACATCTTTCATTTGAATAAGAGGTGAGTATATATAATTTTGAGCCTTTGGACAATCCTTTAGATAACAAC TATGAACCTAATCTTGATGATTTGTTGATTGCTTTGAGAAAAGGTGGGCGACCTCCAATAAACGTATCTACGATAGACTT TGATACCATCGTTTCCTATTTACAATGATTACGCTACATAATTACAATTCATACAAGATATCCTACCAATTTATGAGATG TCTAACACTCCCCCTCAAGCTGGAGCATATAGTCAGTCATATGCACCAAGCTATTGCATTTATAACTAATTCTAGGACCT CTCAAAAACTTAGTAATGACATTTGCAAATTGATTGTTTGATTTGACAAAGCTATTTGTGATGTCCTCTGATATGAACTT CTCTCTAATAAAATGACTATCTATCTCAATGTGTTTGGTCCTATCATGAAGTTCAGGGTTTTAGGCAATATGTAGGGTTC CCTGGCTATCTCAAATGTGTGTAATCTGTGTAGTGCTCCCAAATCTTATCTCTTTAAGTAACTATTTGAGCCACATGAGC TCATAGGTGGCAGAGTCCATGGCTCGATACTATGCTTCTGCACTTGACCTTGCCACTTCAATTTATTTCTTGCCTTTCTA GGAAATCAAGTTCTCACCAATGAAAATGCAGTTGCCAGTAGTAGATCTCGTCTGTAGGCCCTATATGCATTAGAGTAGCA TATAACTCGGTGCACATTGTTAGTAGGAAATCAAGACCTTTGTTTTCATACTAGAGACCGTTTCCTAGAACTCCGTTAAT ATATTTTAGAATGCCAATTACAACATCCTGATGTCCTTCACATGGTGAGTTAAGAAACAGACTAACCAGACTCACTACAA AGGAAATTTTTGGACAGTGACAGTGGGGTAGTTAAGTTTCCCAATTAGTCTTCTGTATCTCTCTAGATCTTAGAGTAGCT TCCCCTATCCTGGCATAAGGTTAGCACTTTAGTCCATTAAAGTGTCAATAGGTTTAGCATTCATCAATCTTGTTCCCTCC AAGATCTCCATCGCATATTTTCTCAGAGAAATCACAACACCATGCTTGGATTGTCCCAAGAAATAACAAAGATGCTGCCT TACTTGTGTGACGTCATGTTGATCATTCCCTGTTCTAACAATCTCGTCAACACAACCATGTGATTCAGATCTGGTTTCAA TCACCTGCCTCATGGTGGTTTTATTTGTATTCCTCAGTTGCAGGCAAACCTATCTTTAATTTGACGATGCTGCTGTTAAG AAAAAGTTAGTTCATTTTTCAGATGATTTAGAGTTTGTTGTTGATGATTTCTTGTTAGGACGCAATATTGAAAAATTTGC AGTTCCCTCTTCCTTTGAAAAAGACAACATCTTTGGTAGTTTTTATATCAGTTATGCTTTAAATAATTGAAGTGAAGTCT TCACTTGTAGTTGCAGATCCCATGCAATTAAATACTGTTGGCAGTCATGAATGCTATTTTCAATTTAAATAGCATGCCTA CTTACTGATTGTACGTTATGTCAACCTACCATCTTCAGTTATTCATTTTAGGTACCCAATCTTATACTTGGTTATCTTCA TTTCAGGTTTGATGATTTGCGTTGAAAGGACTTGGTTGAACATCAGATGCCAGCTTCTTGTGGGGTTGTTTTTCTTCCTG CAGGATTTGGTGGCAAATGTAGAATTTACTTTCAAAAAAAGTTCTCATACTTGGCGGTAGGAGTAATGATTGGTTATCAG GCATCTGCTCTAGTGCCTTCTGTTTCAACGTTCATAAAAAGGGAAGAAGAATAATGAAACAACAAGAATGGCATTGGCGG CGCACAAAGGCTGAAGATAATTGTAATCAGGACACAGATAGAGTTCATACATCATTGCATTCATGATTGCTATTCTAACC CATCAGCATTCATTGTAGCAGCATTCTTTAATTTAGGGTTTTTTAGATTTTTTCTACCCCTGAACTTATTCTCTGAAGTC TTTCAAATTAAACTCTTTCGCCAGGAAGGAAGGGAGTAGTATATAAATCATAGCAGAGTTTGGTAAATAGATTTTTTTTT GCAATCGCAGATAGCAAATAGACCATTGCTGTGTAATAGGATTTTTTTTTTCGGTAGTCCCCAATTACCAAAGAAGTTTA AAGTGACAGCATTTTTCTATTTAAATTCAAACAGGAAAATTATGGACTAACCATACTGGTGTCATCAATTTATGTTGTGA AGGAGTACTTAAGACCCTAGATTTTTCCCATGTTTTTGAAGGTTTGTTGTATTCTTCCCATATTTACAAAGTTAACTGGT ATGGTATGTGCATCAATTGCACATGCAGCGGAGTCCAAGGTACCCTCAGTATAATAACGCATATTGTTATAGTACAATGC TCCATTGCATCTCTAAACGGGACTCAAGTGTGGATTCAGTTTTTTTTATTCCCAATTTTGTTTTTTCGAAAATTGATTGT ACCGTATTAGAAAATAATTTTAAGGGGTTAAATATGTTTTTAGTTCTGACTTGTATATCCAAATCTGAAATGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0534700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGTTCGTGGGCAAAACCGTGAAGAAAGAGGTCAAAGGGGTTGGGACTGTTTCTGGAACTGTCAAATCATTCGACCC TTCAACGGGTTTTGTTGAGATCGCTTACGAAAATGGTCATTCTGAGAAGCTTGAATTCTCCGACGTCGCTCCCCTCTTGG AATTTCAACCGGAGGTGGGCAAGGTTAAGCCCAAGGTTGGCCGGAAACCCAAGAAGCGGCGTCGGGTCGAGCGGAAGCAG CGGCAAGGCGCGACGACGGGTTCAGGTAATGCTCTTGCTAGTGATAATTCGGTATCTGAGGGTGATGGGTTTAGTGGGGT GTTGTTGGATGCTGGTGTTTCTGGTAGTGAATTAGGGTGTGTGAATGAGAGTGGCTTGGCTGTTGAAAATGGGAATGGTG GGAATGTTAGTGGTAATGTGAATGGGAGTGTGGAAGAAATTGGGGTTGGAGAGAATTTGAATTTGAATTTGAATGGGGGT GTGTCTGCTAATGGGGATTGTGTTAGAGAAGGGCTTGATTTGAATGGTGAAGTTAATCTGAATAATGGGTGTGGTTCGAC TTTTAATGCTGCTGAGGGTAGTTTGGAGAGAAGAGATTGCATTGATCTGAATTTGGTTGTGAATAATGAGGGTGATGTCA ATTTCAATGCGGGTTGTTCGGGAGGGGAAGCGTTGCAGGGGGAGGGTAAGTTTGACTTGAATATGGAGGTGTGTGAAGAA GCCAAGGAAGCGCTAGGTGATGCTGATGGAAATGGACATTCTGTGGTAGATGCTAGGATGGGGAAACTCCAAAAGGAAGA GAATAATATTAATTGTAGATCTGTGGAGGATGATGGTGTTCATGGTAATTTAAATCATGTCTCGGATGCTATGAAATTGG GGGAAATTCAGGTTTCAGCTGAGCTTGCAGCTAAAGACTCATCTTTGTGTTTGATTGAGGAAAAGGAAGGTGATGGTGGC AAAGGAGATGCATCAGTGGTTGATTCTCAACAGGTTTCAAATGCTGTTTCTATGGAGGTTCAGCAAATGGATTGCCCTTC TGAAGCTGGTTTTGCTGTAGTTCATGAATACCAAGATGAGCCGGGAAGTCCATGCAAGCAAGGAAGTAGCCGGAGGAAAA GAAGAAAAGTATCAGATAATCTAACAACCACCCCACAGACTGTTATTAGGAGGAGTTCTCGCCGGGCAATAGCTAGAAAT CAAGTATCAAGCCCCATATTAGTGCAGGAGACTGATGATCCTTTGTTGTCCTTGGAAACCAGTGCCTTAACAGAAGAAAA ACCTTCCATGCCTGGTCCTGAGAAAATCGAGCAATGCAATGTTGTTCCTCTTCCGGAACTGCAATTACCCCCTTCTTCTA AAAATTTGAATTTAGATGACGTTCCTGTTCTTGAACTTTTTTCTGTTTATGCTTGTTTAAGATCATTCAGTACTTTATTA TTTTTGAGTCCATTTGAGCTGGAGGATCTTGCAGCGGCACTAAAGTCTGAAAGCCCAAGTATATTATTTGATAGCATTCA TGTTTCTATTATGCTAACTCTGAGAAAGCATTTGGAACACCTTTCCAATGAGGGTTGCCAGTCTGCATCTGATTGCTTGA GGAATCTTAACTGGGATTTCTTGGACCTGGTTACATGGCCTATGTTCATGGCCGAGTACCTTCTGATTCACGGCTCAGGG TTTAAAACTTGTTTTGATCTCAAGCAGTTGATGTTTAGAACTGACTACTACAAACAACCTGTAGTTTTGAAGGTTGGAAT TCTCCAGCACCTGTGTGATGATATGATTGAAGCAGAAGCCATAAGGTCAGAGCTTAACAGAAGATCTTTGGTAACTGAGA CTAGTGCGGGGTTTGATCAGAATATCTATTTTGACACTTGCAAGAAAAAAAGAGCTGAAATGGATATGTCTGGTGGCTCT TGCTTGACTAAGGACATTGTGGATGATACCACTGACTGGAATAGTGATGAATGCTGCCTCTGCAAGATGGATGGGAATTT AATATGCTGTGATGGTTGCCCTGCTGCATTCCACTCAAGGTGTGTGGGAATTACAAGTGATGATCTGCCTGAAGGTGACT GGTATTGCCCTGAGTGTGCAATGGGCACAGACAAGGCTTGGATGAAATCCCGAAGGTCTCTTCGAGGAGCAGAGTTATTA GGGATTGATCTTCATGGCCGTCTTTATTTTTACAGCTGTGATTACCTGTTAGTATCAAACTCATCTGATGAGGGTTCCCT TTTCAATTACTACCACAGAAATGATCTACATGTTGTAATTGAAGCTCTGAAGTCCATGGATTCTTCATATAGAGGCATAT TAATGGCTATGTACAAGCATTGGAATACGCCACCTGACTTAAGTGCAGGGGCTAGTAACTTGGGAGTCTTTAATCAAAAT TCCGGCAAAAACATGCAAATGTTGGGTGAATATTCTGCTATGCATACATCTGTAGCACCTTTTACTTCATCAGATGCATG TATGGACAAGAATCAGGCTGATTATCAAAGACAGTTGGACAAAACTTCAATAGATAGTCCTTGTAATGCTTCAGAAGGGT CAGCTAATACCACCCAAATGAGATCAGGCATCGAGAATGTTCAAATGAATGGGCTTTGTGTTTCCAGTAGATCTGATGAA TCCTTGATTCAGTCAGGAATGCCAGAAAAACATCGTCCCATTGGTGGCAGTTCTTTGACATCTTCTAGCTTAGATGGGGG ACATAAAATAGACTTGAGGTCTATAGGTGCTAGCCGTACCCCAAATACAGACAATAAGGATATGTCAGAAGCACCTTGTT GGATTGACTACACCAACTATTACAGCTTTGCTCGAATGGCCTCGTTAGTTGCACAGGAGTTAATGTGTAAGTTACCTGAA AAGATCAATAAGAATGTTGCAATGTCTGAGGAAGAAATAATTTCAGACCAAGCTAAGGCCATTATGAAGAAATCTACCAA CTTTTGCTGGCCAAGTATTCAAAACCTAAATGCAGCAGCCCAAAAGGAAAAATGTGGATGGTGCATTTCTTGCAAAGGTG TTAATGATGACAGAGATTGCTTGGTTAATTCTGTGGTGAAGCCTGTTTGTGAATTGTCTAAAAGTAATTCAGGTGGTCTT CAACCCATGAGGATCCAGAATGGACATCTTAGGGAGATTATATGTCAGATTTTCTCTCTTGAGGTTCGATTACGTGGGCT TTTGTTGGGTCCATGGTTAAATTTGCATCAAACTAATATTTGGCATAAGGATCTTTTGAAGACATCTGATTTTGCCGCTG TTAAACGGTTATTGCTTCTTCTGGAATCCAATTTGAGGCATCTTGCCTTTTCAGCAGATTGGTTAAAGCATGTGGATTCT GTTACTACTACGGGATCAGCTACTCATATCGTGGTCAGTTCATCACGCACTTCTTCAAGGCATAGTATTGGAAGGAAAAG GGCTAGGTATTCAGATGTTGAATCCAGCTCATCTTCAAGCACAGCTAGTGGTTTGGGAATGTATTGGTGGAGAGGTGGCA GGCTATCCCGAAAATTGTTTAATTGCAAGGTTTTGCCTCGCTCCTTGGTTACCAAGGCTGCTAGACAAGCTGGGTGTATG AAGATACCGGGCGTTTTATATCTTGAGAATTCAGATTTTGCAAGGAGAAGCAGATATGTTACCTGGCGAGCTGCTGTCGA GATGTCTACAAATGTTGAGCAGCTTGCTTTACAGGTTAGAGAGCTTTATTCATACATAAGGTGGCATGACGTGGAGAATG ACCATCCTCTACATGTGTTGGACAAGGAATCTAGAAAATCAGTCAGGCTGTTCAAAAAAGTAATTGTACGCAGGAAGTGC ACTAACGGGCAATCTGTGAAATACCTCCTTGATTTTGGTAAGAGAAGAGCTATTCCAGATATTGTTAGTAAACATGGATC TTTGTTGGAAGAATCCTCCAGTGATAGGAAAAAATATTGGCTGGATGAGCCTTATGTTCCCTTGCATCTTTTAAAGAATT TTGAGGAAAAAAGAATTGCCCGCAAGTCTGATGATAAGAAACTTGGAAATATTCTCGAGATTGGTAGAATAAAGAGGGTT CCTCAACAAAGGGGATTTTCATATTTGTTTTCTAAAATGGAAAGATCTGATTGTCATCAGTGTGGGCATTGCAAAAAGGA TGTTCCAATCAGGGAAGCTGTGAGTTGCCTTTATTGCAAAGGATATTTCCACAAGAGGCATGTCAAGAAATCTGGTGGTA CGATAACTGCTGCAAGCACATATTCATGTCACAAATGCCAGGACGGGGTGCTTATAAAGACTAAAACTAATAGAAGGAAA GTTGATTCGAAACTGAAGAAGATTGAATCACAGAAATGTAAAACGATCTCTTTAGTTTGTAAACCGGTGAACCTTAAAGG CACTAAAAAAGCATCAAGTAAGGTGCAACATGTGAGATCTCGAACTAATAAGAAAATCCCATCAAGTATACCTCTTCGTC GTTCTACTAGGAAGGCTAAATCCTTGTATATGAAAAGTCAAATGATTGGAGGACGTAAAAAAGGAACACAGAGTAAAAAG AATGTGGGACGTAAAAAGGGAAAGCAAAGTAAAAACAAGAAGGTGACCTGTCAGAAGTCCATGGAAACTGGCAAATGGAA GAAGTTGGTAGTAACTTCTAAACGTAAGCGAACCGGTTACAGTTACTGGCTTAATGGTCTTTGGCTGTCGAGAAAGCCAA ATGATGAACGAGTAATGCTGTTTAAAGAGAAAAAGCATGTTGTCTCTTCCAAAGATTTTTCTGGCTCCCGTGACCGTCCT AAATGCTGCCTTTGCTGTGGAGATGGATGCACGTTAAATTATATTGCTTGTGAAATCTGTGGAGAGTGGTTTCATGGAGA TGCATTTGGGCTCACTGTAGAAAATGTAGGACAACTTATTGGATTTAGGTGCCATGTATGTCGTGATAGGGATGCTCCGA TCTGCCCCCATATGAACAGTAGTGCATTGTCTCTCCCAAAAAACAATGCTGCTAATGGGTCTGCCGAGGAATTATCTAGT CCTGTTTCTCTCCAACCTGTGAATGAGGATTTGGCAGCATCTTCTTGCACTATTCCTGAGGACGACACTACTTATGTGGA CCATGCACCGATACACGCCACAAATCAAAATAGATATAGCTACCGGTATCAAAGACGGCGAAAACCCGATGTGGTCCAAT AA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0534700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEFVGKTVKKEVKGVGTVSGTVKSFDPSTGFVEIAYENGHSEKLEFSDVAPLLEFQPEVGKVKPKVGRKPKKRRRVERKQ RQGATTGSGNALASDNSVSEGDGFSGVLLDAGVSGSELGCVNESGLAVENGNGGNVSGNVNGSVEEIGVGENLNLNLNGG VSANGDCVREGLDLNGEVNLNNGCGSTFNAAEGSLERRDCIDLNLVVNNEGDVNFNAGCSGGEALQGEGKFDLNMEVCEE AKEALGDADGNGHSVVDARMGKLQKEENNINCRSVEDDGVHGNLNHVSDAMKLGEIQVSAELAAKDSSLCLIEEKEGDGG KGDASVVDSQQVSNAVSMEVQQMDCPSEAGFAVVHEYQDEPGSPCKQGSSRRKRRKVSDNLTTTPQTVIRRSSRRAIARN QVSSPILVQETDDPLLSLETSALTEEKPSMPGPEKIEQCNVVPLPELQLPPSSKNLNLDDVPVLELFSVYACLRSFSTLL FLSPFELEDLAAALKSESPSILFDSIHVSIMLTLRKHLEHLSNEGCQSASDCLRNLNWDFLDLVTWPMFMAEYLLIHGSG FKTCFDLKQLMFRTDYYKQPVVLKVGILQHLCDDMIEAEAIRSELNRRSLVTETSAGFDQNIYFDTCKKKRAEMDMSGGS CLTKDIVDDTTDWNSDECCLCKMDGNLICCDGCPAAFHSRCVGITSDDLPEGDWYCPECAMGTDKAWMKSRRSLRGAELL GIDLHGRLYFYSCDYLLVSNSSDEGSLFNYYHRNDLHVVIEALKSMDSSYRGILMAMYKHWNTPPDLSAGASNLGVFNQN SGKNMQMLGEYSAMHTSVAPFTSSDACMDKNQADYQRQLDKTSIDSPCNASEGSANTTQMRSGIENVQMNGLCVSSRSDE SLIQSGMPEKHRPIGGSSLTSSSLDGGHKIDLRSIGASRTPNTDNKDMSEAPCWIDYTNYYSFARMASLVAQELMCKLPE KINKNVAMSEEEIISDQAKAIMKKSTNFCWPSIQNLNAAAQKEKCGWCISCKGVNDDRDCLVNSVVKPVCELSKSNSGGL QPMRIQNGHLREIICQIFSLEVRLRGLLLGPWLNLHQTNIWHKDLLKTSDFAAVKRLLLLLESNLRHLAFSADWLKHVDS VTTTGSATHIVVSSSRTSSRHSIGRKRARYSDVESSSSSSTASGLGMYWWRGGRLSRKLFNCKVLPRSLVTKAARQAGCM KIPGVLYLENSDFARRSRYVTWRAAVEMSTNVEQLALQVRELYSYIRWHDVENDHPLHVLDKESRKSVRLFKKVIVRRKC TNGQSVKYLLDFGKRRAIPDIVSKHGSLLEESSSDRKKYWLDEPYVPLHLLKNFEEKRIARKSDDKKLGNILEIGRIKRV PQQRGFSYLFSKMERSDCHQCGHCKKDVPIREAVSCLYCKGYFHKRHVKKSGGTITAASTYSCHKCQDGVLIKTKTNRRK VDSKLKKIESQKCKTISLVCKPVNLKGTKKASSKVQHVRSRTNKKIPSSIPLRRSTRKAKSLYMKSQMIGGRKKGTQSKK NVGRKKGKQSKNKKVTCQKSMETGKWKKLVVTSKRKRTGYSYWLNGLWLSRKPNDERVMLFKEKKHVVSSKDFSGSRDRP KCCLCCGDGCTLNYIACEICGEWFHGDAFGLTVENVGQLIGFRCHVCRDRDAPICPHMNSSALSLPKNNAANGSAEELSS PVSLQPVNEDLAASSCTIPEDDTTYVDHAPIHATNQNRYSYRYQRRRKPDVVQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1682 | 1682 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1682 | 1682 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 61 | 98 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 65 | 79 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 82 | 98 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 358 | 385 | 28 | - | – | |
| SMART | 460 | 520 | 61 | 3.0E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 460 | 520 | 61 | 14.081 | ||
| Pfam | 464 | 516 | 53 | 4.2E-11 | ||
| SUPERFAMILY | 642 | 700 | 59 | 1.9E-15 | ||
| Gene3D | 650 | 716 | 67 | 1.5E-14 | ||
| ProSiteProfiles | 655 | 702 | 48 | 9.962 | ||
| SMART | 657 | 700 | 44 | 3.8E-12 | ||
| CDD | 657 | 699 | 43 | 8.64358E-16 | – | |
| Pfam | 658 | 700 | 43 | 5.7E-9 | ||
| ProSitePatterns | 658 | 699 | 42 | - | ||
| MobiDBLite | 886 | 905 | 20 | - | – | |
| SMART | 1380 | 1427 | 48 | 7.8 | ||
| MobiDBLite | 1508 | 1537 | 30 | - | – | |
| MobiDBLite | 1517 | 1533 | 17 | - | – | |
| Gene3D | 1570 | 1653 | 84 | 1.2E-6 | ||
| SUPERFAMILY | 1582 | 1649 | 68 | 1.22E-6 | ||
| SMART | 1602 | 1648 | 47 | 15.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0534700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…