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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0001200 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0001200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Dynamin family protein; TAIR: AT1G59610.1 dynamin-like 3; Swiss-Prot: sp|Q9LQ55|DRP2B_ARATH Dynamin-2B; TrEMBL-Plants: tr|I1MQT0|I1MQT0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0001200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:232251..267769) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATAAAGTAGTACTATTACAGTCTATAGCATAAAAAAAGAAACTGGTTTTTCTGATATTGAGGAAGGTAAGCGAAAAAGCG CGAAATAGAGGCATGGATTTTACTTGTGCGTCGTAATCGTAAGAAGAAAAATTAAAACAAACAAAAAATGTTGAAATTGC AATCGCATATGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTAGCGTAGCATAGTATAGCAGTTGGTGATGGTGATTTAATTTGGATTTGA TTGCATTGCATTGCATCTGCATTTGCATTGACACCTAAACCGAAAGCAACGAAAACTTTGGAATCCGAATCTGTTGGCCG GAAACCTAACAGATCCGATGGAGGCCATTGAAGAATTGGTTCAGCTCTCCGATTCTATGCGCCAAGCCACCGCTGTCCTC GCCGACGACGAAGACATTGAAGACTCCAAGCGCCGCCCTTCCACTTTCCTCCATGTCGTTGCCCTCGGCAATGTTGTAAG TTTTTCTTCCAATTCATTCAATCACACATTCATTCATACATAGATTATAGATTATAGATTATAGATTATAGATTATAGAT TATAGATTATAGATTATAGATTATAGATTATAGATTATAGATAGATAGCATGAGAACTCGAAGAGATACTGTATTCTATT CCATGTGCTATGCTATTTTGGATCCACGATGCAACTAAACACAATTTATTTTACTGGTGGATCAGGGTGCTGGAAAATCT GCTGCCTTGAATAGCTTGATTGGACATCCTGTTCTGGTATTTTTTTTCTTGTTCTTTCTCATTTTTGCTTTCTATTATTT ACCACTAAATCGGTTCGGTTATAAACTGCACTGCAGCCAACTGGTGAAAATGGTGCTACCAGGGCTCCTATTAGCATTGA ATTGAATAGAGACACCTCTTTAAATAGCAAGTCAATTGTCCTTCAAATTGAAAATAATACTCAGCAGGTTTCTGCAAGTA 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GACCCATCTCAAAATGGCGATATGAGTCCAGGCTCAAATTCTAGCAGTCGCCGAACGACACCGGCACGGTTACCTCCTGC CCCTCCATCATCTGGTTCAAGATATTAGATAAAGCCACATATGGTTTAAACCAAAGTTATCAATTCACGACTGATGGATG CCTTCAAATTTTCAACTAATGTCGAGACTTTCCACCACCTTGAAGTGACTTAGTCGGAATGTCATAGGTTTGTAGATAAG TATTGATGCCCTACCAGTCATCTGAAGGTCATACGCAGTATGTGTCCAATTTTATTCCCTTACTGGGTATGTGGGGGCTT TGTTGGGTGAGATGATATTGTGTCTCCCCTACATTCTTTTACTCTTAAAGATGTAATTGTTTTGTATCCCATGCGATTAC CAGCATTTATATCAATGCGCGTTAATCATGAGTGCCTTTTTTTTTCTGGAACTTTTGTTAAGCACTTGATTGTTTCTGGT TGAATATAAGAAAAAGTTTGCGATTTTAATGGTTAGAATTTTCTTTTTTGGTCAAGTAATGGCTACAGAATTCACCATTG AATTGATGTCACTGGTCAAGTATATCCTTAGTCACTTGGCAATTTACTGCTAGTAGAAGGGTCTAATCGATCAGCGGAGC TGGAGCTGATGAAGACAATGGTATGATGCGCAGTACCCGCGAGATTCCGGGTAATTCCCTTATCGTACTATTTGATTATG ATGCTACACATTCTGTTATAGACTTAGCTTGAGTGACGTGGTTAAAGCTAGATGTGACAGAATTACCGTTCGACCTGATA GTATCCATCCTTGTTTCATAAGGATGTAACAGTAGAAGGAATAGAAGTTAAGAGACGGATTCTGATGAGAGGTCGTATGA GTTCCAGGAGTAGGGTAGTATCTTTTGCAAGGAGGAGTGTGAGAGAGTCATCAAGAACCTAAGGGCAAACGAGACCTAG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0001200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGCCATTGAAGAATTGGTTCAGCTCTCCGATTCTATGCGCCAAGCCACCGCTGTCCTCGCCGACGACGAAGACAT TGAAGACTCCAAGCGCCGCCCTTCCACTTTCCTCCATGTCGTTGCCCTCGGCAATGTTGGTGCTGGAAAATCTGCTGCCT TGAATAGCTTGATTGGACATCCTGTTCTGCCAACTGGTGAAAATGGTGCTACCAGGGCTCCTATTAGCATTGAATTGAAT AGAGACACCTCTTTAAATAGCAAGTCAATTGTCCTTCAAATTGAAAATAATACTCAGCAGGTTTCTGCAAGTTCTCTTCG ACATTCTCTACAGGGTAGACTCAGCAAAGGTTCATCTGGTAGGACCCGTGATGAAATATATCTCAAACTTGCTACCAGTA CCGCACCTCCATTGAAATTGATTGACTTGCCTGGACTAGACCAGCGGATAGTGGATGACAAACTGATCAGTGAATATGTC GAGCACAATGATGCTATTTTGCTGGTAGTTATTCCTGCTGCTCAGGCACCAGAAATTTCATCATCACGAGCCCTTAAAAT AGCAAAGGAGTATGATGCAGAATCCACCAGAACAGTTGGGGTTATCAGTAAAATTGATCAGGCAGCTTCAGAACCAAAAG CTCTTTCAGCAGTACAGGCTCTCCTATTGAATCAGGGACCCCCAAAAACCTCTGATATTCCATGGGTTGCTCTGATAGGC CAATCTGTTTCTATAGCTTCTGCGCAGTCTGGGAGTGGTGCATCTGAAAGCTCGTTGGAAACTGCTTGGCGAGCTGAAAC TGAAAGTTTGAAATCAATACTCACTGGAGCCCCTCAAAGCAAGCTTGGTAGAATTGCTTTGGTTGAGTCTCTTGCTGGAC AGATTCGCAATCGTATGAAGCTCCGCCTTCCAACTCTCCTCACTGGTCTTCAGGGAAAGTCTCAAAATGTTCAGGAAGAG TTAGTGAAGCTTGGTGAACAAATGGTCAGTGGTTCTGAAGGTACAAGAGCTCTAGCCTTGGAGTTATGTCGTGAATTTGA GGAAAAATTTCTTCAACATCTTACTGGAGGCGAGGGCAATGGTTGGAAAGTTGTTGCTAGTTTTGAAGGAAATTTTCCTA ACAGGATCAAACAACTTCCTATTGACAGACACTTTGACATAAGCAATGTCAAGAGGATTGTCCTAGAAGCAGATGGATAT CAACCTTATCTTATCTCTCCAGAGAAAGGTTTGAGGTCCTTAATCAAAGGCGTTCTTGAACTGGCGAAGGAGCCATCACG CCTGTGTGTTGATGAGGTACATCGTGTGCTTGTTGATCTAGTTTCTGCTTCTGCAAATGGTACACCTGGTCTTGGAAGAT ATCCTCCATTCAAGAGAGAGATTGTGGCAATTGCAAGTTCTGCCCTGGAGGCATTTAAAAATGAATCCAAAAAAATGGTG GTTGCATTAATTGATATGGAGCGTGCATTTGTTCCACCCCAACATTTTATTCGTTTGGTGCAGAGGCGAATGGAAAGGCA ACGCCGAGAAGATGAGCTAAAGAACCGATCATCCAAGAAAGCCCTTGATGCAGAGCAGTCAATTCTAAATAGGGCCACTA GTCCTCAAACAGGTCAACAAAGTGGAGGAAACTTAAAATCAATGAAAGAGAAATCCAGTCAACAAGACAAGGACACACAA GAGGGATCTACATCTGGCTTGAAGACTGCAGGGCCTGATGGGGAGATCACAGCAGGATATTTGTTGAAAAAAAGTGGAAA AGGAAGTGGTTGGACTAAGCGATGGTTTGTTTTAAATGAAAAGAGTGGCAAGCTTGGATACACCAAGAAGCAAGAAGAGA GACATTTCCGAGGAGTAATTACATTAGAGGAATGCAATATTGATGAGATTTCTGATGATGATGAAGCCCCTGCAAAGAGT TCCAAGGATAAAAAGTCCAATGGGCCTGATTCTTTAAAATCAGCCAACCTCATTTTCAAGATAACGAGCAAGGTCCCCTA TAAGACTGTTATGAAAGCTCAAAGTGCAGTTTTGTTAAAGGCTGAGAGCATGGCAGATAAGGTTGAGTGGATCAATAAGC TAAGAAATGTTGCCCAGGCTAAAGGAGGTCAAGCCGTTGGTGAACCTAGTTTTCCTATGCGACAAAGTCTTTCTGATGGC TCCCTTGATACTATGACTAGAAAACCTGCGGATCCAGAAGAGGAGCTCAGATGGATGTCTCAAGAAGTGCGTGGTTATGT TGAAGCTGTTCTTAACAGCCTTGCTGCTAATGTGCCAAAAGCAGTTGTTCTTTGCCAAGTAGAGAAAGCTAAAGAAGACA TGCTTAACCAGTTATACAGCTCTATCAGCGCTCAAAGCTCAGCAAAAATTGACGAACTGCTCCAGGAGGACCACAATGTC AAGCGTAGAAGGGAGCGTGCTCAGAAACAATCTTCCCTTCTTTCAAAACTCACCAGGCAGCTTAGTGTCCATGACAATAG AGCGGCTGCAGCGTCCAATTGGTCTGATAGAGGGAGTGCAGCAGAAAGCAGCCCAAGAAGCTCTGGACCTTCATCAGGTG ATGATTGGAGGTCTGCATTTGATGCTGCTGCTGCCAATGGTCCAAGCGACTTGTCATCTAGGTATGGTTCTGGTGGTCAT AGTAGACGTTACAGTGACCCATCTCAAAATGGCGATATGAGTCCAGGCTCAAATTCTAGCAGTCGCCGAACGACACCGGC ACGGTTACCTCCTGCCCCTCCATCATCTGGTTCAAGATATTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0001200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEAIEELVQLSDSMRQATAVLADDEDIEDSKRRPSTFLHVVALGNVGAGKSAALNSLIGHPVLPTGENGATRAPISIELN RDTSLNSKSIVLQIENNTQQVSASSLRHSLQGRLSKGSSGRTRDEIYLKLATSTAPPLKLIDLPGLDQRIVDDKLISEYV EHNDAILLVVIPAAQAPEISSSRALKIAKEYDAESTRTVGVISKIDQAASEPKALSAVQALLLNQGPPKTSDIPWVALIG QSVSIASAQSGSGASESSLETAWRAETESLKSILTGAPQSKLGRIALVESLAGQIRNRMKLRLPTLLTGLQGKSQNVQEE LVKLGEQMVSGSEGTRALALELCREFEEKFLQHLTGGEGNGWKVVASFEGNFPNRIKQLPIDRHFDISNVKRIVLEADGY QPYLISPEKGLRSLIKGVLELAKEPSRLCVDEVHRVLVDLVSASANGTPGLGRYPPFKREIVAIASSALEAFKNESKKMV VALIDMERAFVPPQHFIRLVQRRMERQRREDELKNRSSKKALDAEQSILNRATSPQTGQQSGGNLKSMKEKSSQQDKDTQ EGSTSGLKTAGPDGEITAGYLLKKSGKGSGWTKRWFVLNEKSGKLGYTKKQEERHFRGVITLEECNIDEISDDDEAPAKS SKDKKSNGPDSLKSANLIFKITSKVPYKTVMKAQSAVLLKAESMADKVEWINKLRNVAQAKGGQAVGEPSFPMRQSLSDG SLDTMTRKPADPEEELRWMSQEVRGYVEAVLNSLAANVPKAVVLCQVEKAKEDMLNQLYSSISAQSSAKIDELLQEDHNV KRRRERAQKQSSLLSKLTRQLSVHDNRAAAASNWSDRGSAAESSPRSSGPSSGDDWRSAFDAAAANGPSDLSSRYGSGGH SRRYSDPSQNGDMSPGSNSSSRRTTPARLPPAPPSSGSRY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SMART | 1 | 246 | 246 | 1.8E-6 | ||
| PANTHER | 4 | 876 | 873 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 4 | 876 | 873 | 0.0 | ||
| Gene3D | 9 | 323 | 315 | 4.2E-39 | – | |
| ProSiteProfiles | 34 | 304 | 271 | 48.76 | ||
| SUPERFAMILY | 35 | 313 | 279 | 1.1E-30 | ||
| PRINTS | 37 | 55 | 19 | 3.7E-10 | ||
| Pfam | 40 | 204 | 165 | 6.5E-31 | ||
| PRINTS | 62 | 79 | 18 | 3.7E-10 | ||
| ProSitePatterns | 63 | 72 | 10 | - | ||
| PRINTS | 174 | 192 | 19 | 3.7E-10 | ||
| PRINTS | 193 | 209 | 17 | 3.7E-10 | ||
| Pfam | 260 | 495 | 236 | 1.1E-21 | ||
| Gene3D | 332 | 530 | 199 | 1.9E-26 | – | |
| MobiDBLite | 508 | 572 | 65 | - | – | |
| MobiDBLite | 522 | 549 | 28 | - | – | |
| Gene3D | 567 | 704 | 138 | 1.3E-19 | ||
| ProSiteProfiles | 574 | 699 | 126 | 15.549 | ||
| SMART | 575 | 701 | 127 | 1.2E-15 | ||
| SUPERFAMILY | 575 | 698 | 124 | 1.84E-19 | – | |
| Pfam | 579 | 697 | 119 | 4.8E-12 | ||
| MobiDBLite | 631 | 650 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 632 | 649 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 703 | 728 | 26 | - | – | |
| Gene3D | 714 | 804 | 91 | 1.6E-8 | – | |
| SMART | 731 | 824 | 94 | 0.0041 | ||
| Pfam | 734 | 816 | 83 | 4.9E-14 | ||
| ProSiteProfiles | 736 | 829 | 94 | 20.148 | ||
| Coils | 790 | 810 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 800 | 819 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 824 | 854 | 31 | - | – | |
| MobiDBLite | 824 | 920 | 97 | - | – | |
| MobiDBLite | 870 | 906 | 37 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | GTPase activity | Catalysis of the reaction: GTP + H2O = GDP + phosphate. | ||
| Molecular function | GTP binding | Interacting selectively and non-covalently with GTP, guanosine triphosphate. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0001200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…