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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0153600 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0153600.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase; TAIR: AT1G68890.1 2-oxoglutarate decarboxylase/hydro-lyase/magnesium ion-binding protein; Swiss-Prot: sp|Q15KI9|PHYLO_ARATH Protein PHYLLO, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|K7MEA2|K7MEA2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0153600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:25696212..25743420) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAGGACACTACCTCATCCTGCTTGCACAACTGCAAACTCTCACTGGAACTCCTCCCTACGTTATCCACTCCGCATTCATG AACCTGCCGGTGCCGGCGTTCCGCGCCTCGAGGCTCAGCAATGGGGCAGTGCTTCTGGTTCTCCCACCGCCGTTCACTTC TTCTTCTTCGGCGGTGGCCTTCGGCGGCGTTCGAAGAACGTCGGTGAGGGTTGAGGCTGCTGGAGGAGTGAGGTTCGACG GGCCGGTGCCCCTAAACGGCGATGTCGAGGAGAACGAAGTGGTTTTCGAGCACTGCGTCACGCGGACTCTGCCTCCGGCG CTGACATTGCAGGATGGACTTGACAAACTGAAGGAGGCTCTTGAAATGTTGAAGGTGGCGCCGCCTCGTTGCTCTGCTGG GTTCCTTAGGTTTCAGGTATCTCTTCATATTCCTCAATATCTAGGGAAACTAGTTCCTTTTAGTTGCAATGTGAAAGTTT GTGTGATTTCAAAGTTAGATAAATTTGACCAATGCCTGTAGGTGTAAGTGATTCGAAGTTAGTAGAAAAATTTAGGTTCC TTATGCAATGTCTCATTTAAGTTTGGAAGTGAAAAAAAAGGTTTTGTGAGCTTTGCTCTGTTTTATGGTTGTACTAAGTA TCCCACGGTCGGCAGCCATGTGACTAATCTGCTTGAGGCTCTGAGATCACATTAAGTGCATCAACTCAAATTGAACTACT CGGGTTCTAATATGATTTCCAAATACTTGGGTCTCAAACCAAAGTGTTAAATAAATGTGGAATCAATATAATTTAAACAG GCTAAGCACAAATTTGTTGTGGATGTATTATGGTTTACGTTCATGTAAATTGGGAAGGCCAAATTATTATGAAATTAGTG TTTTATAGTACAGTGAAAGGCTGTTATCTAAAGCACTGTAAGTTGGGGAGCGGTATATGCGGTGAGCTATTGGACTAGCG 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ATGGAACTGAAAGAGTCTCCTTTTTCCAGTCAATTCTGTGTCAGGCTTTCAGCAACTCTAGCTGTTTCAAATAACATGTT GGATCATGCCAGTGAATTATCTCACTCACTGAATGAAAGTGCCAATATTAATGCTGTTTGGGCGTCACTTATAATTGAAG AGTGCACACGACTTGGTTTAATGTATTTTTGTGTTGCTCCTGGATCTAGATCTTCCCCACTTGCTGTTGCTGCTGCAAGT CACAATTTAATCACGTGTGTTTCATGCTTTGATGAGCGTTCACTTGCATTTCATGCTATTGGATATGGAAGAGGATCTCA CATTCCAGCAGTAGTCATAACGTCATCAGGCACAGCAGTTTCAAACCTTCTTCCCGCTGTTGTGGAGGCAAGTCAAGATT TTGTGCCGCTTATTTTACTTACAGCAGATCGACCTCCGGAACTGCTGGATTGTGGGGCAAACCAAGCAATTGATCAGGTG AACCATTTTGGTTCTTTCGTGAGATTTTTCTTTAATCTCCCTGCACCCACTGATCAGATTCCTGCAAAGATTGTTCTTAC TACTCTCGATTCTGCTGTAAATCGGGCAACTTCTTCTCCTTGTGGTCCTGTGCATATTAACTGCCCTTTCAGAGAGCCTC TAGAAAGCAGTCCCCTTAAATGGTTATCAAGCTGTTTAAAGGGATTAGATTACTGGATGAGTAATGCTGAACCATTTACC AAGTATATCCATATGCGATTTTCTGATACGAGTATGAATGCTCCAGATGAAATGATTGAAGTTTTGAATCTGATTCAAGG AGCGAAAAATTGTCTTCTACTATTTGGTGCAATCCATACAGAGGATGAGATGTGGGCTGCTCTGCTTTTGGCTAAACACC TCCAGTGGCCTGTTGTAGCAGATATCTTGTCAGGGTTGCGGTTGAGAAAGCTTTTAACTTCTCTTCCTGATATTGAAAGA AATTTTATATTTGTTGATAATCTTGATCATGCTCTTCTCTCGGAATCTGTCAAAGACTGGGTCAAGATCGATGTGGTTAT TCAGATAGGAAGCAGGATAACTAGCAAACGGATCTGTCAAATTATTGAGGAATGTGCTCCTTTTTCATATATTATGGTTG ACAAACATCCCCTTCGTCATGATCCATCACATATTGTAACCCATAGGATACAAGCTACCATTTTTGATTTTGTGAGTTGT TTACTTAAGGATACAGTTCCTTATACAAGGAGCATGTGGAGCACTTCCCTACAATTGTTGAGTAAAATGGTTGGATGGCA GATACATTTTCAAATTACTGCTGAGTGCTCCCTAACTGAACCTTATGTTGCACATGTGATTTCAGAAGCTCTCTCCCCGG AGTCTGCTCTATTTCTTGGTAACAGTATGCCTATTCGTGATGCAGATATATATGGATGTAGTTGGTCAGTATGCAGGCCT AGTGTTCCATCTCTTATGCTGAATTCAGACCTACCAATCAACTTGGTGAGGGTTGCTGCTAATAGGGGGGCTAGTGGTAT TGATGGTTTACTTAGCACAGCCATTGGTTTCGCTGTAGGATGCAACAAAAAGGTTTTCTGTGTGATTGGTGATATTTCTT TACTGCATGATACAAATGGTCTGGCAATTTTGAAGCAGCGGAAATCGCGGAAACCAGTGACAATTCTTGTGGTTAATAAC CATGGAGGTGCAATTTTCAGTGTTCTTCCTTTGGCAGATAAAGTTGAACCCAGTGTACTGCATCAATATTTCTACACCTC TCATAACATTTCCATCCGTGAGCTATGCATGGCACATAGCGTCAAACATTTACATGCGAAGACAAAGGTGGAACTTAAAG AAGCCTTGTGTGTAGCCCAAAATGAACAAATGGATTGTATGGTTGAAATTGAGAGTTCCATTGATGCCAATGCCGATTTT CACAGAGTTTTGAAGAAAACCTCTCTCCAAACTGCACAACATACCATGAGATTCCTCTCCGTGCCATTCAGTCAAGGGTC TATTAAAGACGAGTTCCGTTTACTCAAAATTCGTAAAATATGGTGTTCAAAATATAGAATTGCTCTAAGTGCTCCTCCAA CATCAGCATCTGTTGGTGATAATTATAAAGAATTTTATAGAGAAGGGTTTATTTTATCTGTAATTCTTGAAGATGGGAGT ACTGGTTCTGGTGAGGTTGCACCTCTTGAGATCCATGAGGAAAATCTAGTGGATGCAGAATATCAATTGAGGTTTCTTAT TCATGTCATGGAACAGGTTGATATTAGTTGCTTCCTCTCTATATTGAAAGGCTCATTTTCATGTTGGATATGGAATGAGT TGGGCATCTTGCCAAGTTCTGTTTTTCCCAGTGTCAGATGTGGGTTCGAAATGGCTATCCTCAATGCCATAGCTGATGCA AAAGGCTCAACCTTGTTGAACATACTGCATCCCCCAACAAATGAGAACGGTGATTGTGAAAGGTCATTAGAAGTTCAGGT TTGTGCACTAATAAATTCAAATGGATCTCCAACTGAAGTAGCTAATGTTGCTGCCACACTAGTGGAAGAAGGATTTTCTG CAATTAAGCTAAAGGTAGCACGTGGGGGTGATCCAGTGCAAGATGCCGCATTAATACAAGAAGTAAGAAAGAAAGTTGGT CGCCAGATTATCATCCGTGCAGATGCAAATCGGAAATGGACTTATGAAGAAGCTATGAAATTCAGCTCTTTGGTTAAGGA TTGTAACCTGCAGTATATTGAGGAACCTGTTCAGGATGAAGATGATATTCTCATGTTCTGTGAACAAAGTGGATTACCTG TTGCCCTAGATGAAACAATAGATAAAATTCAAGAAAATCCCCTGGAAAAGCTAGTGAAGTTTACTCATCCAGGAATAGTT TCTGTTGTTATCAAGCCAAGCGTTGTTGGTGGATTTGAGAATGCAGCATTAATTGCACAATGGGCACACCAGCTGGGGAA GATGGCTGTTGTCAGCGCTGCATTTGAAAGCAGTCTGAGTCTGGCTGCATATACTCAGTTTTCTAGTTATCTTGAAATAC TGAGATTGAGTACATTCAAAGTGTTAAATTATAAGGAAGAACCTTCTGTAGCTCATGGTCTAGGAACCTATAGTTGGCTT AAGGAAGATGTAACACCTAATCCTCTTTTCGTTGGTCCTAATCCGCTTAGTGGTTTTGTTGAAGCATCTGTGGCAAATGC GAGTCGCGTACTACATAATTTTGAAGTCAACCAGAATGTTATCTGCAATATGATTACTGGGGAGCAAATTTGTCAGTACC AATTGAAAGTAGAGCATAACAATTTATCTTGTTCTTTTGAAGTTCGTGAGGTTGGCCTAAAATCAAATGAAAATGTATTA GTATTTCTTCATGGTTTTCTTGGAACTGGTGAAGACTGGATTACTATCATGAAGACCTTTTCCGGATCAGCAAGATGCAT TTCAGTTGACCTTCCTGGTCATGGAAAATCGATAATACATGGTGTAAGAGGTGCTGGTGAGGTACCATGGTTGTCAGTGG AGCTAATTGCTGATATATTACATAAACTGATTCACCATCTAGCTCCTGCTGAAGTTACAATAGTTGGGTATTCAATGGGA GCAAGGATTGCTTTGTATATGGCTCTGACATTTAGGAGTAAGATTAAGGCAGCTGCGTTAATATCTGCAAGCCCTGGATT AAAAGATCCATTATCAAGAAAAATTCGAGCAGCTAAAGATGATTCCAGAGCACGCTTTGTCGTTGAACACGGTTTACAAC TTTTTCTCAGTTCCTGGTATGCAGGAGAGCTGTGGAAAAGCTTAAGAAGTCATCCCCATTTCAATCGAATCATTGCTAGT CGCTTGCAGCATAATGACATACAGAGTCTTGCACAGATGCTATCTGGATTAAGCATTGGGAGGCAAACGGCATTGTGGGA AGATTTGCCAAATTGCAGAGTACCTCTTCTTATCATACATGGAGAGAAGGATACGAAATTTAAGAAAATTGCTCAAGCAA TGATGCATACAATATGCTCTGGCTTGGGGAGGAATGAGCACGCAGAAGGGAATAACATACATCAGGTGGTTGAGGTTCCC AACTGTGGGCATGCTCCACATTTGGAGAATCCTCTTCCTGTCATTACTGCCTTGAGAAAATTCATGTCAAGACTATGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0153600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MELKESPFSSQFCVRLSATLAVSNNMLDHASELSHSLNESANINAVWASLIIEECTRLGLMYFCVAPGSRSSPLAVAAAS HNLITCVSCFDERSLAFHAIGYGRGSHIPAVVITSSGTAVSNLLPAVVEASQDFVPLILLTADRPPELLDCGANQAIDQV NHFGSFVRFFFNLPAPTDQIPAKIVLTTLDSAVNRATSSPCGPVHINCPFREPLESSPLKWLSSCLKGLDYWMSNAEPFT KYIHMRFSDTSMNAPDEMIEVLNLIQGAKNCLLLFGAIHTEDEMWAALLLAKHLQWPVVADILSGLRLRKLLTSLPDIER NFIFVDNLDHALLSESVKDWVKIDVVIQIGSRITSKRICQIIEECAPFSYIMVDKHPLRHDPSHIVTHRIQATIFDFVSC LLKDTVPYTRSMWSTSLQLLSKMVGWQIHFQITAECSLTEPYVAHVISEALSPESALFLGNSMPIRDADIYGCSWSVCRP SVPSLMLNSDLPINLVRVAANRGASGIDGLLSTAIGFAVGCNKKVFCVIGDISLLHDTNGLAILKQRKSRKPVTILVVNN HGGAIFSVLPLADKVEPSVLHQYFYTSHNISIRELCMAHSVKHLHAKTKVELKEALCVAQNEQMDCMVEIESSIDANADF HRVLKKTSLQTAQHTMRFLSVPFSQGSIKDEFRLLKIRKIWCSKYRIALSAPPTSASVGDNYKEFYREGFILSVILEDGS TGSGEVAPLEIHEENLVDAEYQLRFLIHVMEQVDISCFLSILKGSFSCWIWNELGILPSSVFPSVRCGFEMAILNAIADA KGSTLLNILHPPTNENGDCERSLEVQVCALINSNGSPTEVANVAATLVEEGFSAIKLKVARGGDPVQDAALIQEVRKKVG RQIIIRADANRKWTYEEAMKFSSLVKDCNLQYIEEPVQDEDDILMFCEQSGLPVALDETIDKIQENPLEKLVKFTHPGIV SVVIKPSVVGGFENAALIAQWAHQLGKMAVVSAAFESSLSLAAYTQFSSYLEILRLSTFKVLNYKEEPSVAHGLGTYSWL KEDVTPNPLFVGPNPLSGFVEASVANASRVLHNFEVNQNVICNMITGEQICQYQLKVEHNNLSCSFEVREVGLKSNENVL VFLHGFLGTGEDWITIMKTFSGSARCISVDLPGHGKSIIHGVRGAGEVPWLSVELIADILHKLIHHLAPAEVTIVGYSMG ARIALYMALTFRSKIKAAALISASPGLKDPLSRKIRAAKDDSRARFVVEHGLQLFLSSWYAGELWKSLRSHPHFNRIIAS RLQHNDIQSLAQMLSGLSIGRQTALWEDLPNCRVPLLIIHGEKDTKFKKIAQAMMHTICSGLGRNEHAEGNNIHQVVEVP NCGHAPHLENPLPVITALRKFMSRL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 17 | 1370 | 1354 | 0.0 | ||
| Gene3D | 39 | 236 | 198 | 1.4E-61 | – | |
| SUPERFAMILY | 41 | 221 | 181 | 1.12E-36 | ||
| Hamap | 41 | 648 | 608 | 31.783 | ||
| TIGRFAM | 47 | 519 | 473 | 1.4E-119 | ||
| Pfam | 48 | 215 | 168 | 2.5E-30 | ||
| CDD | 49 | 210 | 162 | 2.09374E-81 | – | |
| SUPERFAMILY | 203 | 414 | 212 | 2.29E-7 | ||
| Pfam | 226 | 459 | 234 | 9.3E-21 | ||
| Gene3D | 249 | 431 | 183 | 7.5E-49 | – | |
| Gene3D | 437 | 657 | 221 | 1.2E-61 | – | |
| SUPERFAMILY | 437 | 630 | 194 | 9.11E-19 | ||
| CDD | 438 | 616 | 179 | 3.09192E-55 | – | |
| Pfam | 511 | 623 | 113 | 3.6E-7 | ||
| Gene3D | 679 | 816 | 138 | 1.4E-11 | ||
| SFLD | 703 | 1049 | 347 | 0.0 | – | |
| SFLD | 703 | 1049 | 347 | 0.0 | – | |
| TIGRFAM | 706 | 1009 | 304 | 4.8E-44 | – | |
| SUPERFAMILY | 707 | 798 | 92 | 9.42E-7 | ||
| Gene3D | 817 | 1054 | 238 | 1.1E-50 | ||
| SUPERFAMILY | 833 | 1050 | 218 | 1.02E-38 | ||
| SMART | 837 | 933 | 97 | 4.9E-16 | ||
| Pfam | 843 | 1031 | 189 | 7.4E-23 | ||
| ProSitePatterns | 885 | 916 | 32 | - | ||
| SUPERFAMILY | 1110 | 1384 | 275 | 4.32E-45 | ||
| Gene3D | 1113 | 1382 | 270 | 5.4E-62 | ||
| Pfam | 1120 | 1374 | 255 | 2.6E-20 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. | ||
| Biological process | Cellular amino acid catabolic process | The chemical reactions and pathways resulting in the breakdown of amino acids, organic acids containing one or more amino substituents. | ||
| Biological process | Menaquinone biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of any of the menaquinones. Structurally, menaquinones consist of a methylated naphthoquinone ring structure and side chains composed of a variable number of unsaturated isoprenoid residues. Menaquinones that have vitamin K activity and are known as vitamin K2. | ||
| Molecular function | Thiamine pyrophosphate binding | Interacting selectively and non-covalently with thiamine pyrophosphate, the diphosphoric ester of thiamine. Acts as a coenzyme of several (de)carboxylases, transketolases, and alpha-oxoacid dehydrogenases. | ||
| Molecular function | 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase activity | Catalysis of the reaction: 2-oxoglutarate + H(+) + isochorismate = 5-enolpyruvoyl-6-hydroxy-2-succinyl-cyclohex-3-ene-1-carboxylate + CO(2). |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0153600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…