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LotjaGi5g1v0300700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0300700
Transcript ID LotjaGi5g1v0300700.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein; TAIR: AT2G34930.1 disease resistance family protein / LRR family protein; Swiss-Prot: sp|C0LGQ5|GSO1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1; TrEMBL-Plants: tr|G8A217|G8A217_MEDTR LRR receptor-like kinase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0300700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:61790086..61809321) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTGTGAGTCTATATATATGTAAGGTTTGCGTGAGGGAATTATAGTGAAAGACACCATCAAAATACAATACAATTCTTCCT AATTAACATGGGAAGATACGTGAGTGGTGCTGCTGCATGTGTAGTCCTTCTCTTCCTGGCTGAAATTGCACAAGTGTGTT TCTTCTTGTGTGCAAATTCAAGCAGTGTCGTTGTCCCTCCTTGCATAGGACGAGAGAGGCAAGCTCTTCTTGAGTTCAAA GCTTCCTTTCAAAGTTATCCATCATTCAGCAGACTTTCCTCATGGAAAGAAACTACTAATTGTTGCGAATGGGAAGGCAT AGGCTGTGACAATATCACCGGACATGTTGTCAAGCTTGATCTCAGGAATCCTTGCTTCCTGTCACCACCATATTGTTACT TTGAGTTGCAGGAAGAACATCGTGTATACGCTCCAAATGTGAATCCATCTTTACTGCAGTTGGAATACTTGGCTTATTTG GACTTGAGCGGAAATCATTTCAATTCAAGTCCAATACCAAGCTTCATTGGTTCTATGCAACGTTTGAGGTATCTTTCTCT CAGGTACTCTTCTTTTGGTGGGAGGATTCCGAATAGCCTTAGAAATCTCAAGAACCTGCACCTACTTGATCTCAGTGAAA ATCATTTTGACGCCAGTAACATCACTTGGCTTTCTCAACTTCACTCACTCAAACACCTTGACTTGAGTTATATTGACTTG GGGAACACACGTGATTTGTTCCAGGTACTCAACATGCTTCCTTCCTTGTTAAATCTTAGCTTGTCGGGCTGTGGACTTGA AGACTCCCTCATTCCTCTCGGTGCTAATTTCCAAAACTTGACATCTCTTGTCCATCTTTATCTTTCAGATAATGAGCTTC ATGGTCCACTCCTTGATGCTTTCAGAAACTTGTCTTCCATTGAATACCTCTATCTTTCATACAATGGGATCCACGGTCCA 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CCATTTAAACTTATCACACAATAATCTTTCAGGACCAATTCCTAAAGGTAACCAACTTTTAACTCTGGATGACCCATCTA TTTATGCTGAAAACCCTATCTTTGCGGATCTCCACTCCCAAAATGTCCTGGTGATATTCACATCAAGCTCCTAATAGCAA AAATGACGAAGATGAAGATGACAAGAAAGATAAGGTGGAAAAATTATGGTTCTACTTTGTCATAGCAGTTGGCTTTGCAA CTGGTTTTTGGGGAGTTATTGGCACATTATTGTTCAAGAAGAATTGGAGCATGCTTACTTCAGATGGGTGGAAGAGTAGC TGACAAGATTTATGTGGCAGTTGTGATCAAAGTTGCAAAGCCAATGATGAGAAACCACACTCACGGGTAACGTTATGTTT CTTCTATATATTTCTATTTCATTTTCTAAAACTGATTGTGAATACATAGATTCTTTTATTGAATGGTTCTGGTGTCCTCA CATGCTCATTATATTCAACATTATTTTATGTCAATTGCATAGCTAATGAATCAAATTTCTTTGGCAGATGATAATGAAGA AAGTTGCATACCAGACGATGTTGGCAAGCTGGCTCAGGATTGCTTTTGTGTTTGTTGTTTTGTTTTTCCTCTTTATGTGC TTTTGTCCTTTCTGTTTTTGCCTTGGTGGTCCAGTCTCTGTTGCCTGACCCCTTATGCGATGTGTGTATCTAGGCATGAG ATTTTATCTCATGGAACCTTCATTTATTCAATAACATGTTCCTCTTTCAAAAAAAAAAAAGTGATCTGGAGAAGGAGGCA CAGAAATAAGTGTGGGAAAATAATGCCCTTTGAAAGAAGAAAAGAGCATATATATATATATAAACAACTTGTGGTGTTAC ATTTAAATTTGTATTACTTTTTTACCATGATTGCCTTCACTGGATTTGTACTATACATTATAGGGGCTCAAAATCCCTGC AGATGAATAATAATGTTTTACTATGGAGCATTGTGA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0300700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGAAGATACGTGAGTGGTGCTGCTGCATGTGTAGTCCTTCTCTTCCTGGCTGAAATTGCACAAGTGTGTTTCTTCTT GTGTGCAAATTCAAGCAGTGTCGTTGTCCCTCCTTGCATAGGACGAGAGAGGCAAGCTCTTCTTGAGTTCAAAGCTTCCT TTCAAAGTTATCCATCATTCAGCAGACTTTCCTCATGGAAAGAAACTACTAATTGTTGCGAATGGGAAGGCATAGGCTGT GACAATATCACCGGACATGTTGTCAAGCTTGATCTCAGGAATCCTTGCTTCCTGTCACCACCATATTGTTACTTTGAGTT GCAGGAAGAACATCGTGTATACGCTCCAAATGTGAATCCATCTTTACTGCAGTTGGAATACTTGGCTTATTTGGACTTGA GCGGAAATCATTTCAATTCAAGTCCAATACCAAGCTTCATTGGTTCTATGCAACGTTTGAGGTATCTTTCTCTCAGGTAC TCTTCTTTTGGTGGGAGGATTCCGAATAGCCTTAGAAATCTCAAGAACCTGCACCTACTTGATCTCAGTGAAAATCATTT TGACGCCAGTAACATCACTTGGCTTTCTCAACTTCACTCACTCAAACACCTTGACTTGAGTTATATTGACTTGGGGAACA CACGTGATTTGTTCCAGGTACTCAACATGCTTCCTTCCTTGTTAAATCTTAGCTTGTCGGGCTGTGGACTTGAAGACTCC CTCATTCCTCTCGGTGCTAATTTCCAAAACTTGACATCTCTTGTCCATCTTTATCTTTCAGATAATGAGCTTCATGGTCC ACTCCTTGATGCTTTCAGAAACTTGTCTTCCATTGAATACCTCTATCTTTCATACAATGGGATCCACGGTCCAATTCCTG ATGGTGTGTTTCAGAGCATGCCATCACTCGAGTATCTTGGTCTTGCGGGTAATGAGCTAAGTGGTCCAATTCCGTCCTGG TTTCGTAACTTTGAGAAGCTTACATTTCTTGATCTTTCATACAATGGGCTTCATGGTCCAATTCCTGATGGTGTGTTTCA GAGCATGCCATCACTCGAGTATCTTGATCTTGCGGATAATGAGCTAAGTGGTCCAATTCCTGATGGTGCACTACAAAACA TGTCATCACTTGTATCTCTTCATCTTTCAAGGAATAGGCTCAGCGGTCCGATTCCTGAGGCTTTTCGAACCATGACTTCC ATTAAATCCCTTTACCTTAATGACAACAATATCACTTCAATTCCATCATGGTTTGTTGAGTTAAAGACACTTCTCTACCT TGGCCTTTCATCAAATGAATTTACTACAACCAAATGTTCGCTTTCATCAATTCTCAGTAACATGTGTCATCTAAAGGGGT TATATTTCTCAGGGAACAAGTTCCGAGAAGAATCAATTGCAAAGTACCAATTATCTGGATGCAACAAATATGATCTAGAG GTATTGCATTTGTCTAATAATGAGATCAGTGGTCGCTTGCCAACTTGGTTGGGGCAACTTGTGAATTTAGAATATCTTGA TCTCAGTTCAAATTTTTTCTCTGGACCCATTCCCTTATCTCTAGGAAAACTATCAAAGTTGAGATACCTAGACATGTCAA AAAATAAGTTGGATGGGGGAGTCCTTCCTGATAATATTGGACAACTTGTCAATTTAACAAACTTGGATATTTCTTCCAAT AATTTTGTTGGTGTTATTCCTCAAACTCTGGGAAAACTTGTAAACCTACAAGGTCTTGACCTTTCAAACAATTCTTTTCA TGGTCTCGTTCCTCAAAGTCTCAATCAACTTGTCTATTTAAATCTCGCCAACAACCAAATCAGCGGTTCACTTCCAAAAA ATATTGGATATACAATGCCCTCTTTGTGGAACTTATTACTTGGAAATAACCACTTAAATGGTTCAATACCAATCTCTTTA TGTGAAACTGTGTTTTACAACCTTGACCTTTCAAAGAACAACTTATCTGGTGAAATCCCAAATTGTGGGAAAAATCATCG ACAAGCTTGGGAAGAAATAAATTTGTCATCAAACAAATTATCTGGGGTGATCCCAACCTCTCTATGCCAAACTAATCCAG CGAGACTTGTCCTTTCAAAGAACAATTTATCTGGTGAAATTCCAAATTGTTGGAAGAACGATGAACAGTGGGTAGAAATA GATTTGTCATCAAACAAATTATCTGGTGGGTTTCCAAGCTCATTTGGGAATCTTTCCCCATTGGAATGGTTGCATTTAGA CAATAACATGCTCAAAGGTGAACTTCCAGTGTCTTTGAGAAATTTGAAGAATTTGTTGATTTTGGATCTTGGTGAGAATC AATTTTCAGGGAGCATACCACCATGGACTACAAACACATTTCCTTCACTGCAGATTCTTAGACTGCGGCAAAACATGTTG AGTGGTAGCATTCCTTCACAATTATGCCAACTTACATCACTGCAAATTTTGGACCTTTCTCGTAACAAATTAGAAGGTTC AATTCCTCGGTGCATAGGAAATCTTCAAGGAATGACTAGTAAAAAATCATTAGACGATTTTAGTGTGGTGGACTCGGCTG GTGCACCTGTTGAATGGTCCCCTGAAGCCGTAAAAGAAGTCATAAAAGGAGCTGAACGCGAGTACATCAAAATCTTGAAG CTTTTAGTCAACATGGACTTGTCAGAAAACAATTTGGTTGGATCCATTCCTAATGGAATAACCAGGCTCACAGGATTGCA TGGCTTGAATCTGTCAAACAATCATTTGAAAGGAGAGATCCCTGAGATGATAGGGGAGATGAAATCAATTGAGTCTTTGG ACCTATCTAATAACCATCTGTCAGGCACAATTCCAAATAGCATGTCTGCTTTGACTTCATTGAGCCATTTAAACTTATCA CACAATAATCTTTCAGGACCAATTCCTAAAGGTAACCAACTTTTAACTCTGGATGACCCATCTATTTATGCTGAAAACCC TTATCTTTGCGGATCTCCACTCCCAAAATGTCCTGGTGATATTTCACATCAAGCTCCTAATAGCAAAAATGACGAAGATG AAGATGACAAGAAAGATAAGGTGGAAAAATTATGGTTCTACTTTGTCATAGCAGTTGGCTTTGCAACTGGTTTTTGGGGA GTTATTGGCACATTATTGTTCAAGAAGAATTGGAGGCATGCTTACTTCAGATGGGTGGAAGATGTAGCTGACAAGATTTA TGTGGCAGTTGTGATCAAAGTTGCAAAGCCAATGATGAGAAACCACACTCACGGATGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0300700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGRYVSGAAACVVLLFLAEIAQVCFFLCANSSSVVVPPCIGRERQALLEFKASFQSYPSFSRLSSWKETTNCCEWEGIGC DNITGHVVKLDLRNPCFLSPPYCYFELQEEHRVYAPNVNPSLLQLEYLAYLDLSGNHFNSSPIPSFIGSMQRLRYLSLRY SSFGGRIPNSLRNLKNLHLLDLSENHFDASNITWLSQLHSLKHLDLSYIDLGNTRDLFQVLNMLPSLLNLSLSGCGLEDS LIPLGANFQNLTSLVHLYLSDNELHGPLLDAFRNLSSIEYLYLSYNGIHGPIPDGVFQSMPSLEYLGLAGNELSGPIPSW FRNFEKLTFLDLSYNGLHGPIPDGVFQSMPSLEYLDLADNELSGPIPDGALQNMSSLVSLHLSRNRLSGPIPEAFRTMTS IKSLYLNDNNITSIPSWFVELKTLLYLGLSSNEFTTTKCSLSSILSNMCHLKGLYFSGNKFREESIAKYQLSGCNKYDLE VLHLSNNEISGRLPTWLGQLVNLEYLDLSSNFFSGPIPLSLGKLSKLRYLDMSKNKLDGGVLPDNIGQLVNLTNLDISSN NFVGVIPQTLGKLVNLQGLDLSNNSFHGLVPQSLNQLVYLNLANNQISGSLPKNIGYTMPSLWNLLLGNNHLNGSIPISL CETVFYNLDLSKNNLSGEIPNCGKNHRQAWEEINLSSNKLSGVIPTSLCQTNPARLVLSKNNLSGEIPNCWKNDEQWVEI DLSSNKLSGGFPSSFGNLSPLEWLHLDNNMLKGELPVSLRNLKNLLILDLGENQFSGSIPPWTTNTFPSLQILRLRQNML SGSIPSQLCQLTSLQILDLSRNKLEGSIPRCIGNLQGMTSKKSLDDFSVVDSAGAPVEWSPEAVKEVIKGAEREYIKILK LLVNMDLSENNLVGSIPNGITRLTGLHGLNLSNNHLKGEIPEMIGEMKSIESLDLSNNHLSGTIPNSMSALTSLSHLNLS HNNLSGPIPKGNQLLTLDDPSIYAENPYLCGSPLPKCPGDISHQAPNSKNDEDEDDKKDKVEKLWFYFVIAVGFATGFWG VIGTLLFKKNWRHAYFRWVEDVADKIYVAVVIKVAKPMMRNHTHG 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SignalP_EUK 1 23 23 -
Phobius 1 20 20 -
Phobius 1 4 4 -
Phobius 5 16 12 -
TMHMM 7 29 23 -
Phobius 17 20 4 -
Phobius 21 1023 1003 -
PANTHER 29 208 180 2.0E-230
PANTHER 29 208 180 2.0E-230
Gene3D 35 219 185 2.5E-43
Pfam 42 81 40 5.4E-12
SMART 125 148 24 360.0
ProSiteProfiles 127 148 22 5.386
SUPERFAMILY 131 465 335 2.82E-65
SMART 174 197 24 310.0
ProSiteProfiles 176 199 24 5.794
ProSiteProfiles 200 221 22 5.048
PANTHER 217 367 151 2.0E-230
PANTHER 217 367 151 2.0E-230
Gene3D 220 342 123 2.2E-32
Pfam 247 288 42 3.7E-7
SMART 251 277 27 51.0
SMART 251 274 24 19.0
ProSiteProfiles 253 276 24 5.186
SMART 275 299 25 20.0
ProSiteProfiles 277 299 23 5.494
Pfam 292 337 46 2.2E-8
SMART 300 323 24 140.0
ProSiteProfiles 302 323 22 4.793
SMART 324 357 34 230.0
SMART 324 348 25 27.0
ProSiteProfiles 326 348 23 5.918
Gene3D 343 468 126 2.8E-30
PANTHER 349 435 87 2.0E-230
SMART 349 373 25 5.3
PANTHER 349 435 87 2.0E-230
ProSiteProfiles 351 372 22 6.295
SUPERFAMILY 368 685 318 3.74E-52
SMART 374 397 24 29.0
ProSiteProfiles 376 397 22 5.587
Pfam 380 433 54 4.6E-10
SMART 398 421 24 6.4
SMART 398 419 22 420.0
ProSiteProfiles 400 422 23 7.281
PANTHER 440 661 222 2.0E-230
PANTHER 440 661 222 2.0E-230
ProSiteProfiles 450 470 21 4.632
Gene3D 469 540 72 2.5E-20
ProSiteProfiles 478 500 23 6.149
Pfam 479 537 59 1.5E-8
SMART 500 521 22 320.0
ProSiteProfiles 502 523 22 6.172
PANTHER 517 710 194 2.0E-230
PANTHER 517 710 194 2.0E-230
SMART 524 539 16 220.0
SMART 524 549 26 13.0
ProSiteProfiles 526 549 24 4.955
Gene3D 541 645 105 9.1E-25
SMART 549 578 30 620.0
ProSiteProfiles 551 572 22 4.955
Pfam 551 607 57 1.9E-8
PANTHER 566 764 199 2.0E-230
PANTHER 566 764 199 2.0E-230
SMART 573 596 24 9.4
ProSiteProfiles 575 595 21 5.717
ProSiteProfiles 596 618 23 6.588
SMART 619 643 25 210.0
ProSiteProfiles 621 643 23 4.878
Gene3D 646 1000 355 6.6E-107
ProSiteProfiles 669 690 22 4.555
SUPERFAMILY 693 995 303 5.1E-56
Pfam 719 775 57 4.2E-7
ProSiteProfiles 740 763 24 5.64
PANTHER 755 838 84 2.0E-230
PANTHER 755 838 84 2.0E-230
SMART 762 786 25 93.0
ProSiteProfiles 764 786 23 5.633
ProSiteProfiles 789 811 23 5.494
SMART 811 835 25 2.7
SMART 811 837 27 15.0
Pfam 813 835 23 0.066
ProSiteProfiles 813 835 23 6.233
PANTHER 879 977 99 2.0E-230
PANTHER 879 977 99 2.0E-230
ProSiteProfiles 881 903 23 4.747
SMART 903 927 25 41.0
Pfam 905 964 60 1.0E-8
ProSiteProfiles 905 927 23 6.118
ProSiteProfiles 929 951 23 6.618
PRINTS 930 943 14 1.6E-5
PRINTS 951 964 14 1.6E-5
SMART 951 974 24 130.0
ProSiteProfiles 953 975 23 7.111
Phobius 1024 1047 24 -
TMHMM 1025 1047 23 -
Phobius 1048 1085 38 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0300700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…