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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0048100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0048100.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Chromodomain helicase-DNA-binding protein; TAIR: AT2G13370.1 chromatin remodeling 5; Swiss-Prot: sp|F4IV99|CHR5_ARATH Protein CHROMATIN REMODELING 5; TrEMBL-Plants: tr|I1JIZ0|I1JIZ0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0048100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:6587260..6606896) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTTTCTCCGTGCGCCTCTATCTCTCTCTAAAAAAAAGGGAAAGGACTTTGTTTCTCTCTCTTCCCTCTTTCATCTGCCG CACATCGTCGTCGATTAATCCAAATCGCCTCCTCGTCGCCACCGCCGCCGCCGCCGTAACCGCCGAATCTCGCCGCCGCT TCTTCATTACTTCGAATCTCGCTTTCTCGCTTTACCTCCAACAACAACACCATCCGATTTTTCTGTTTCCGCTTTCGGTA TCCCCCGCCGCCGCCGGCGATTCGGATTCCGACGAGTCCTTGTCGGAGGAGGAGGAGGTGCGCACGATTATTATCCCGCG CACCGTCGTTCGTCGCGGTTCCTTTTCCATTTCTATAACCAAAATTGGCGCTCGCTCCTCCGTTCTTTTGCAACTGGAAA GGTGAGAGGCCGCTTGCTCCTCCGTCATCGCCGCTCCGATTCGCTCATCTCGTTGTTGTTAGGTTTTGGAGATTAGGTTT CCAATTGCGGATTTCCGTCGGTCTCTATGTTTGGTAGGTCGCGCTCTCTGAGCCTTAGGGGTTTTAGTGTGAGCTTGCTT GTTGATCCGTTTCGATTGGATTTTGCGGTTGGTTTTGGTGAATTTACTTGTTTCTGATTCGGTGTTGGTGATTTTTGTGC ACTGCACGGTGTTGAAATTGGAGTTTGGCAAAATTTCGGTTTGAATGGAATTCAATTTTGACCGTTAACACTAGACACTC ATTCAAACCAGTGCCTTCACTCCTCAATCAACGTAGTTCGCTCGCGAATTTGCTATAATGCAGATAGGGCTGTTTTAAAC TTAGATTATGAAGTTCAAATTGAATTCGCTTTACTAGCTTCAAGTTCTACTTGAATTCAATTTGAAACTTCCTTGGTTGC CAGAAAATGGTGAAACTGAATATCATGAGGATTTTAACTAACTCGCTAGCTAGTGGTTTGTAAATGAGGTTCAACTCAAT 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TCTTTTTTGTTTCTTTCTAATGCCTTTGCATGCAACTGTCTTCTGCTAAACTTCTTAATTACTTTTCATGTCATCATCTG GTACCTAAGAGTCCCCAATCACTAAGGTATGTAGAATAGGAGACAATAGCAACACACATGGGCAGGGAGGTCATAATGTG TACTCAAGGAAATATAGGTGCTATTTACTTGATTGGAATGAGAATGTATGGGGTAAAGGAAAGGAAGGGTGAGGCAGGCC AGGATTGAGTGGAGACTTGGAATCTCAACTTGTCTTTGGCTATCTTCATATATATATATATTTTTATGTTATTATCCTTC TGAGTTCTGACTGTAAATGGATTTCTGTTATTATCTTCATTTCAAAATCAGGAATATTGTACATAAGTTCTAGGACCATA AATGGAGTTTTTGTCTTGTTTCCTACCATCATGTGTATATATGAGTATATGCATGCTTGTCTCTTTTTATTTGAATGCGA AGTCTCTTTTTACTATAATGTCAACATTTTCTTATTGGCTAGGAACTTGCTGTTCTTGGTGTTAAACATACCAATAATAG AGTTGGACGGAAGCCTTCCAAGAAAGAGAGAGAACAAATGAACACCTCACTGTTGCGAGGGCAGGAGAAGAAAAAAGCGG GTTCTGTTAAAGTTGATGTCCAAATGAGAAAGAATAGATTCCAGAAAACCCAAAAGGTTGAACCTATTGCAAAAGAGGAG GGTGAAATGTCCGACAATGAAGAAGTATATGAGCAGTTCAAGGAGGTAAAATGGATGGAATGGTGTCAGGATGTGATGGT TGAAGAAATGAAAACTTTGAAACGTCTTCACAGGTTGCAGACAACTAGTGCCAATCTTCCAAAGGAAAAGGTACACCACC AGGGCTTATTTCCTTCTATTATGTCTATTTCAAATATGTTGCACTACTTACTCCTCCCCATCTACTTTAGGTTCTTTCGA AAATACGCAACTATTTACAGCTTCTTGGGCGAAGGATAGATCAAATTGTGTTAGAACATGAAGAGGAACCGTATAAGCAA GATAGTAAGTGCTTTTTCCCATTCTGAATATTTCATGCTGTGGTGTTTCTTCATGGGACATGTTTCTGCTTTGTTATGTG TCTGGAATCCATTTATATTGTTGTTGGTGTCCTCCTATTTCCTCGTAGATTACAGGTAACTCCTGTGTTTTTTGGGGTTG TCGACTACTTGATTGAATTTTTTTTGTCTTGCTTATTTACAGGAATGACTGTGCGACTGTGGAAATATGTCTCCACTTTC TCCCATCTTTCTGGGGAAAGGCTTCATCAAATATATTCCAAACTTAAAAAGGAGCAAGAAGAGGCTGGGGTTGGCCCCTC TCATGTCAACGGGTCAGCATCTGTTTCATTCGGCCGAAATGGAAACCCGATCCATCACCATATGGAGAGGCAAAGAGGTT TAAAAAATATGACTAGCTACCAACTGCCAGAATCAGTTAGTAGTAATACAGGGAAATCTGAGGCATGGAAACGAAGAAGA AGAGCGGAAAGTGAGGATCATTTCCAGGTTCCACCTCAAAGATCCACGAGTAGTGGAGTCCAGATTACTGATCCTAACTC ACTTGGCATCCTTGGTGCTGGACCATCTGACAAACGCTTTGTTAGTGAGAAACCTTACAGGACACAACCCGGTGGGGTTC CTTTAAGACAAAGTTTCTCTTCAGGTATAAACTAGCCAGCTTTATGGGATCAGAGTGGCTATTACAATTTACAAGAGTGT TGGCAGTTGCTTTCACTCTGCAGCATCTCACAGCTTCACCTTGTATATTCTCCGGAATTGTTTTTTCCACCCATGGGAAT AAGATCCGCAGATCCCACTTTGGTGTCCTTAGGTTGATCTGGAAATATCCCTACTCTGGGATTTGCATCCTTGAAGGCTG AAGCTGATGAAGATCTGGTGCAAGATGAAATTGAGTCTTGCCAATTGTTTCTGTTTTTCCATTTTGATTTCTACCCTTCC TTGAAGAACGGGCCTAGCAAAGTGTTTACATAGCAAAAATCTTGAGAGAAAAAGATTTTCCCACTTGCTATAGACATACT TAGGAAAACTGTACATTGTCAGTTCTGCAATTTTATTGGACTTGCTTCTCACTGCATAAAGTATGTTAGTTGATCTAGAT AGAAATGTATTTGATTTTGTGGTAATTATACCTATATTGTCCAAGATTTTGTAACTCTTTGAAGTGGGATAGTGAATGAA AAATGAATTTTTGGCTTCTTGCTTTTGGTTAAATTTTTATAAACTTCCAGTGTATCATAGAATGCCTGTAAACACAGGTG ACTGTTTGAAACTGAAAATGCTATGACTTTAAATGGC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0048100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTTATTTAGGAACTTTTCAAATGAAACAGTCTCACATGATGTCATAGAAGATAAAAGCCAAGGACAGAATGCTGA TAGAGTCCATAGATCACTAGGTAATGAATGTCTCGATGCAACTTCGAGTGAGAAAGAATTTGATATGAACATGGAGGCAC AGTATGAGAGTGACGGTGAACCAGATGGTGCCTGTAGGCTACAAAATGAGGCTGCAGCCAATGATGGAGATGCTATTAAA AAACCAAACTTACAGACTACTGGTGGTAGTAAATCCGCTACGGTCCGGAGTTGGGGTTCAACATTTTGGAAGGACTGCCG ACCAATGCATCCTCAAAATGGTTCTGAATCTGGGCAGGAATCGAAAAGTGGATCGGACTATCAAAATGCAGATGTGTCTG AAGATAATTCATTGGACGGAAGAGCAGGAAGGTTAGACTCTGAAGATGATGACGAACTGAAGGAGGCAGGTAATGGTACA AGAGGTCATTCTGATGTTCCTGCGGAAGAAATGCTATCTGATGAATATTATGAGCAGGATGGGGATGAGCAAAGTGACTC ATTGCATTATGGTGAGATTCATAAGCCCACTGGGATGAATTCATGGCCTCAACGGATGGCTAAATCTAATAGAGCTATGC ATAGAAAATCTAGGATTTCAGATGATGATGATGGTGACTATGAAGAGGAAGATGCAGCAGATGAAGATGATCCTGCTGAT GCTGATTTTGAGCCTGCCACAAGTGGTCATGCTGCAAACAAGGATAAAGACTGGGAAGGTGAAGGCTCAGATGAAGATGA TGATAGTGACGAAAATCTTGATGTCTCTGATGATGATGATTCTTTTTATGCTAAAAAACCTAAAGGAAGGCTGCGAGGTA AGGTTGGAAAAAGCATACAATCTACCAGAGATCGCAAAGCATTTGCTCCATCTAGTAGACAAAGAAGAGTTAAATCATCC TTTGAAGACAATGAGTCAACATCAGAGGATCCTGACAGTGATAGTGATGACGATTTCAAAAACACAAAAAAGAGAAGTAT TCATGTCCGCAAGAATAATAGTCGCTCTTCTGTAACCGCAAGTTTTTCTACTCGTAACAGTGAGGTTCGCACTTCTAGTA GGGCAGTTAGGAAGGTATCATATGTTGAAAGCGATGGAAGTGAAGAAGCCGATGAAGGGAAGAAGAAAAAGGTTCAAAAG GATGAAATTGAAGAGGATGATGGTGACTCCATTGAAAAGGTACTTTGGCATCAGCCGAAGGGCATGGCTGAAGATGCTCA GAGGAATAATAGGTCAACAGATCCTGTTTTGATGAGTCACTTGTTTGATTCTGACTTTGATTGGAATGAGATGGAATTTT TGATTAAATGGAAAGGGCAGTCTCATTTGCATTGTCAGTGGAAGTCTTTCGCTGAGCTGCAGAATCTCAGTGGTTTTAAG AAGGTTTTGAATTATACAAAGAGAATAATGGAGGACATCAGGCACCGGAAAACAATCACAAGAGAGGAGATTGAGGTCAA TGATGTGAGTAAGGAGATGGATTTAGATATTATCAAGCAGAACAGCCAGGTGGAACGAATAATTGCAGATAGGATCAGCA AAGATATCTCTGACAATGTTATTCCAGAATACCTGGTCAAGTGGCAGGGACTATCTTATGCTGAAGCAACTTGGGAAAAG GACATCGATATTGCTTTTGCTCAACATGCAATTGATGAGTATAAGGCTCGTGAGGCTGCAATGTCAGTTCAAGGAAAGAT GGTAGATTTCCAGCGTAAGAAGAGCAAGGCAAGCTTACGGAAGCTTGAGCAACAACCTGAATGGTTAAAGGGTGGAAGGC TCCGTGATTATCAGCTTGAGGGACTGAATTTTCTTGTTAACAGTTGGAGAAATGATACAAATGTCATTTTAGCTGATGAA ATGGGTCTTGGGAAAACTGTTCAGTCCGTATCGATGCTCGGTTTTCTACAGAATGCTCAGCAGATCCATGGTCCTTTTCT TGTGGTTGTGCCATTGTCTACTCTATCAAACTGGGCCAAAGAATTCAGGAAGTGGCTTCCTGATATGAATATCATTGTGT ATGTTGGTACTCGTGCAAGTCGAGAGGTGTGTCAACAATATGAATTTTATAATGATAAAAAGCCTGGAAAACCAATAAAA TTCAATGCGCTGTTGACTACATATGAAGTAGTTTTAAAGGATAAGGCTGTTCTCTCCAAGATCAGATGGAATTATCTGAT GGTAGATGAGGCTCATAGACTTAAAAATAGCGAGGCGCAGTTGTATACAACGCTTTCGGAATTTAGCACCAAGAACAAGT TGCTTATCACGGGTACTCCTCTACAGAACAGTGTTGAAGAGCTATGGGCTTTGCTTCACTTCCTTGATCCTGACAAGTTC AAGAGCAAGGATGATTTTGTTCAAAACTATAAGAATCTTAGTTCTTTCAATGAGAAAGAGCTTGCAAATCTTCATATGGA ATTGAGGCCTCATATACTTAGAAGAGTTATCAAAGATGTGGAGAAATCATTACCCCCCAAAATTGAGCGTATCCTTAGGG TTGAAATGTCTCCTCTTCAGAAACAGTATTATAAGTGGATTTTGGAACGCAACTTTCATAATTTGAACAAAGGAGTTCGT GGGAATCAGGTTTCTCTGCTAAATATTGTGGTAGAATTGAAGAAGTGTTGCAATCATCCCTTCCTGTTTGAAAGTGCTGA CCATGGCTATGGTGGGGCCTCAGGAAGTAATGATAATAGTAAACTAGAGAGAATTGTCTTTAGCAGTGGCAAGCTGGTCA TACTTGATAAGCTTCTTGTTAGATTGCATGAAACCAAGCACCGTGTTCTAATTTTTTCTCAGATGGTTAGGTTGTTGGAT ATACTAGGAGAGTATATGTCACTTCGAGGGTTTCAATTTCAGAGGCTTGATGGCAGTACTAAGGCTGAGCTCCGACAGCA GGCAATGGATCATTTCAATGCACCTGGTAGTGATGATTTTTGCTTCCTTCTTTCAACACGAGCTGGAGGTCTGGGTATCA ACCTTGCCACTGCAGATACTGTCATAATATTTGACTCAGATTGGAATCCTCAAAATGACCTGCAGGCCATGAGTAGAGCT CATAGAATTGGGCAACAAGAAGTGGTTAACATATATAGATTTGTGACAAGCAAAAGTGTTGAGGAAGATATTCTGGAACG CGCTAAGAAGAAGATGGTTCTGGACCACTTGGTGATTCAAAAATTAAATGCAGAGGGTAAACTGGAGAAGAAAGAAGCCA AAAAAGGAGGAAGTTATTTTGATAAAAATGAGCTGTCTGCAATCTTACGGTTTGGAGCAGAGGAGCTTTTTAAAGAAGAA AGAAACGATGAAGAAAGCAAGAAACGGCTCTTAAGCATGGATATAGATGAGATTCTTGAAAGAGCAGAGAAGGTTGAAGA GAAGGAAGCTGGTGGAGAGCAAGGGGATGAGTTATTAGGTGCATTTAAGGTTGCCAATTTTTCCAATGATGAAGATGATG CAAGTTTCTGGAGTCGTTGGATTAAGCCTGATGCTGTGTACCAAGCAGAGGAAGCTCTTGTTCCACGTTCTGCAAGAAAT ATTAAAAGTTACGCGGAGGCTGATCCATGTGAAAGAAGTAATAATAAAAGAAAAAAGAAGGAACCTGAACTACCTGAACG AGTTCAGAAACGGCGGAAAGCAGAGTATTCAGCTCCTGTAGTACCAATGATCGAGGGAGCTTCTGCCCAAGTGAGAAGTT GGTCATATGGGAATTTATCTAAAAGAGATGCACTTCGTTTCTCTCGTGCAGTTATGAAATATGGCAATGAGAACCAAGTC GACTTAATTGTTGCTGAGGTTGGGGGTGCAGTTGAGGCAGCTCCACCTGAAGCACAGGTTGAACTTTTCAGTGCTCTAAT TGATGGCTGTACAGAAGCGGTGGAACTTGGAAATCTGGATCTAAAGGGGCCTTTGCTGGATTTTTTTGGCGTCCCAGTGA AGGCAAATGATCTACTGACCCGTGTCCAAGAACTTCAACTACTAGCAAAGCGCATTAGTCGGTATGAAGATCCCATTGCA CAATTCCGTGTTTTGTCATATCTCAAACCTTCAAATTGGTCGAAAGGTTGTGGATGGAATCAAATTGATGATGCAAGATT GCTTCTTGGAATACATTACTATGGATTTGGTAATTGGGAAAAGATTAGATTAGATGAAAGGCTTGGCCTTACGAAAAAAA TTGCACCTGTAGAACTTCTACACCATGAAACTTTCTTGCCACGAGCTCCAAATTTGAGAGACCGTGCTAACGCCTTGTTG GAGCAAGAACTTGCTGTTCTTGGTGTTAAACATACCAATAATAGAGTTGGACGGAAGCCTTCCAAGAAAGAGAGAGAACA AATGAACACCTCACTGTTGCGAGGGCAGGAGAAGAAAAAAGCGGGTTCTGTTAAAGTTGATGTCCAAATGAGAAAGAATA GATTCCAGAAAACCCAAAAGGTTGAACCTATTGCAAAAGAGGAGGGTGAAATGTCCGACAATGAAGAAGTATATGAGCAG TTCAAGGAGGTAAAATGGATGGAATGGTGTCAGGATGTGATGGTTGAAGAAATGAAAACTTTGAAACGTCTTCACAGGTT GCAGACAACTAGTGCCAATCTTCCAAAGGAAAAGGTTCTTTCGAAAATACGCAACTATTTACAGCTTCTTGGGCGAAGGA TAGATCAAATTGTGTTAGAACATGAAGAGGAACCGTATAAGCAAGATAGAATGACTGTGCGACTGTGGAAATATGTCTCC ACTTTCTCCCATCTTTCTGGGGAAAGGCTTCATCAAATATATTCCAAACTTAAAAAGGAGCAAGAAGAGGCTGGGGTTGG CCCCTCTCATGTCAACGGGTCAGCATCTGTTTCATTCGGCCGAAATGGAAACCCGATCCATCACCATATGGAGAGGCAAA GAGGTTTAAAAAATATGACTAGCTACCAACTGCCAGAATCAGTTAGTAGTAATACAGGGAAATCTGAGGCATGGAAACGA AGAAGAAGAGCGGAAAGTGAGGATCATTTCCAGGTTCCACCTCAAAGATCCACGAGTAGTGGAGTCCAGATTACTGATCC TAACTCACTTGGCATCCTTGGTGCTGGACCATCTGACAAACGCTTTGTTAGTGAGAAACCTTACAGGACACAACCCGGTG GGGTTCCTTTAAGACAAAGTTTCTCTTCAGGTATAAACTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0048100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALFRNFSNETVSHDVIEDKSQGQNADRVHRSLGNECLDATSSEKEFDMNMEAQYESDGEPDGACRLQNEAAANDGDAIK KPNLQTTGGSKSATVRSWGSTFWKDCRPMHPQNGSESGQESKSGSDYQNADVSEDNSLDGRAGRLDSEDDDELKEAGNGT RGHSDVPAEEMLSDEYYEQDGDEQSDSLHYGEIHKPTGMNSWPQRMAKSNRAMHRKSRISDDDDGDYEEEDAADEDDPAD ADFEPATSGHAANKDKDWEGEGSDEDDDSDENLDVSDDDDSFYAKKPKGRLRGKVGKSIQSTRDRKAFAPSSRQRRVKSS FEDNESTSEDPDSDSDDDFKNTKKRSIHVRKNNSRSSVTASFSTRNSEVRTSSRAVRKVSYVESDGSEEADEGKKKKVQK DEIEEDDGDSIEKVLWHQPKGMAEDAQRNNRSTDPVLMSHLFDSDFDWNEMEFLIKWKGQSHLHCQWKSFAELQNLSGFK KVLNYTKRIMEDIRHRKTITREEIEVNDVSKEMDLDIIKQNSQVERIIADRISKDISDNVIPEYLVKWQGLSYAEATWEK DIDIAFAQHAIDEYKAREAAMSVQGKMVDFQRKKSKASLRKLEQQPEWLKGGRLRDYQLEGLNFLVNSWRNDTNVILADE MGLGKTVQSVSMLGFLQNAQQIHGPFLVVVPLSTLSNWAKEFRKWLPDMNIIVYVGTRASREVCQQYEFYNDKKPGKPIK FNALLTTYEVVLKDKAVLSKIRWNYLMVDEAHRLKNSEAQLYTTLSEFSTKNKLLITGTPLQNSVEELWALLHFLDPDKF KSKDDFVQNYKNLSSFNEKELANLHMELRPHILRRVIKDVEKSLPPKIERILRVEMSPLQKQYYKWILERNFHNLNKGVR GNQVSLLNIVVELKKCCNHPFLFESADHGYGGASGSNDNSKLERIVFSSGKLVILDKLLVRLHETKHRVLIFSQMVRLLD ILGEYMSLRGFQFQRLDGSTKAELRQQAMDHFNAPGSDDFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPQNDLQAMSRA HRIGQQEVVNIYRFVTSKSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQKLNAEGKLEKKEAKKGGSYFDKNELSAILRFGAEELFKEE RNDEESKKRLLSMDIDEILERAEKVEEKEAGGEQGDELLGAFKVANFSNDEDDASFWSRWIKPDAVYQAEEALVPRSARN IKSYAEADPCERSNNKRKKKEPELPERVQKRRKAEYSAPVVPMIEGASAQVRSWSYGNLSKRDALRFSRAVMKYGNENQV DLIVAEVGGAVEAAPPEAQVELFSALIDGCTEAVELGNLDLKGPLLDFFGVPVKANDLLTRVQELQLLAKRISRYEDPIA QFRVLSYLKPSNWSKGCGWNQIDDARLLLGIHYYGFGNWEKIRLDERLGLTKKIAPVELLHHETFLPRAPNLRDRANALL EQELAVLGVKHTNNRVGRKPSKKEREQMNTSLLRGQEKKKAGSVKVDVQMRKNRFQKTQKVEPIAKEEGEMSDNEEVYEQ FKEVKWMEWCQDVMVEEMKTLKRLHRLQTTSANLPKEKVLSKIRNYLQLLGRRIDQIVLEHEEEPYKQDRMTVRLWKYVS TFSHLSGERLHQIYSKLKKEQEEAGVGPSHVNGSASVSFGRNGNPIHHHMERQRGLKNMTSYQLPESVSSNTGKSEAWKR RRRAESEDHFQVPPQRSTSSGVQITDPNSLGILGAGPSDKRFVSEKPYRTQPGGVPLRQSFSSGIN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 54 | 410 | 357 | - | – | |
| MobiDBLite | 80 | 99 | 20 | - | – | |
| PANTHER | 96 | 1687 | 1592 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 96 | 1687 | 1592 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 112 | 135 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 137 | 159 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 223 | 242 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 260 | 277 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 308 | 325 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 352 | 378 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 381 | 410 | 30 | - | – | |
| Gene3D | 404 | 491 | 88 | 1.3E-22 | – | |
| SUPERFAMILY | 406 | 489 | 84 | 2.55E-15 | ||
| CDD | 407 | 487 | 81 | 5.2391E-25 | – | |
| ProSiteProfiles | 409 | 497 | 89 | 10.929 | ||
| SUPERFAMILY | 500 | 577 | 78 | 2.16E-13 | ||
| Gene3D | 507 | 577 | 71 | 1.7E-20 | – | |
| CDD | 520 | 576 | 57 | 1.11108E-15 | – | |
| SMART | 520 | 579 | 60 | 4.2E-9 | ||
| ProSiteProfiles | 522 | 586 | 65 | 13.716 | ||
| Pfam | 523 | 577 | 55 | 3.5E-15 | ||
| SUPERFAMILY | 601 | 835 | 235 | 5.9E-54 | ||
| Gene3D | 605 | 844 | 240 | 6.4E-200 | ||
| SMART | 610 | 809 | 200 | 1.7E-35 | ||
| CDD | 614 | 835 | 222 | 4.96473E-130 | – | |
| ProSiteProfiles | 626 | 798 | 173 | 22.757 | ||
| Pfam | 630 | 902 | 273 | 2.0E-65 | ||
| SUPERFAMILY | 838 | 1119 | 282 | 7.04E-69 | ||
| Gene3D | 845 | 1075 | 231 | 6.4E-200 | – | |
| CDD | 920 | 1055 | 136 | 5.44624E-59 | – | |
| Pfam | 931 | 1044 | 114 | 1.2E-19 | ||
| ProSiteProfiles | 934 | 1085 | 152 | 19.487 | ||
| SMART | 960 | 1044 | 85 | 5.2E-25 | ||
| Coils | 1074 | 1094 | 21 | - | – | |
| Coils | 1128 | 1148 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1205 | 1231 | 27 | - | – | |
| Gene3D | 1342 | 1454 | 113 | 1.4E-24 | – | |
| SMART | 1512 | 1617 | 106 | 1.3E-29 | ||
| Pfam | 1523 | 1616 | 94 | 3.7E-16 | ||
| MobiDBLite | 1624 | 1648 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 1660 | 1674 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1660 | 1746 | 87 | - | – | |
| MobiDBLite | 1675 | 1690 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 1691 | 1707 | 17 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0048100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…