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LotjaGi1g1v0321800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0321800
Transcript ID LotjaGi1g1v0321800.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description DNA topoisomerase; TAIR: AT5G63920.1 topoisomerase 3alpha; Swiss-Prot: sp|Q9LVP1|TOP3A_ARATH DNA topoisomerase 3-alpha; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RFA9|A0A0S3RFA9_PHAAN DNA topoisomerase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0321800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:77276639..77301861) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATCAAGTATATTGCTTAAAATTTGGAAGGAAAATAGGGAGGTTTAAAACCGATCATAAATTGCAGTGTTTTAAAAAAAAC GACAATCAATCACTGATTAATCAACCAATGCCAACGGAGAAACCAATAAATGAGTGAGTGTCAATTTCGAATTTGAAATT AGCATTATAGTATAAATTTTGAAATGAAAATTGTTTCTCAAATATGGAAACAATTGAATACAGTAGTCATTGAAATTAAT GTGTAACATTTTTTATTTATTAATATTTTTCAAATTCGAGTTCGGTGCTTAAATTATGGAAGGAAAATATGGAGTTTTAA ATATATGGGCCTCCATACAAAATGCAAATGAAAATGAGCTTGAAATGTTTTGATCCAAATGAATAGGAGTGTGACACTTG TCATGTAAAGAGGGGGTTTGGTGAGAATCATTCTTGGAGTGTTAAATCATCTAGGTGTGGCTTACAACCTTCCTCTTTTC TAAAGTATATAGATTATGACTTATGAGTTCGAAGACCCCTTGGTCTTCCTATAATACAATTTTGGCTTACCTTAAAAAAA AAACCGTGTCGGACCAATTTGGACTCCCTTCTTACTTGTGAGGAAAAACTAAAGTCAATGACAAAAACTAAAAATCAAAA TTTTGGAGGGATAGAAAACATTTTTTACAAGGATAAAATTCAAAAACAAAACATTACTGAATTTCAAAATGATGGCATTT GCTTTCTGATACTCCCACAACTTCGGCGGGAAAATCCAGACCCGATTGATGAAAAGCATTTGGCGGCCAAACCCTACCGT CCTCCTCTTCCACCTCCCCTAATCAACCACCACCATGGGGATCAACGTCCTCAACGTGGCGGAGAAGCCCTCGGTGGCGA AATCGGTGGCCACCATACTCTCACAGAACCAGGGTCTACGAGTCAGGAATGGCCATTCCCGCTACAACAAGATCTTCGAG 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TCAATTCCTTCTCATAAGCAGACTTGGCTAAATTTCGAGGGCCTAGAGCTTTACTAAAGTAAGCAATGGGATGATGTCCT TGAAGCAGAATTGCTCCAAGTCCTACCCCTGAGGCGTCACACTCCAACCGAAACTCTTGAGAAAAATCAGGCAACACAAG TACAGGAGCAGTTACCAGTTTATTTTTCAGTTCTTCAAAGGCACACTGAGCTGCCTCACCCCACTGAAACGCGTCCTTTT TGGTTAAATCCGTAAGAGGCCGTGCCACTTTCCCATAATCCTTGATAAACTTCCGGTAGTAACCTGTTAAGCCCAAGAAT CCCCTAACTCCCTTTACATTTTTGGGAACAGGCCAAGCTTTCACACTTGCTACCTTGTTTGGATCAACGGCTACACCATT TTCAGAGATCAAATGACCTAGGTATTCCACTGTTTGCGTAGCAAAATGACACTTCTTGCGATTTGCAGTCAAGCTATGAT CCTGTAGGCGCTGCAGAACCTCTCCCAACTGATTCAAGTGTGCTTCCCATGACTGATTGTACACCAGGATGTCGTCGAAG AACACTAAAACACCTTTGCGCAGCATTGGGCGAAAAACCTCATTCATCAAACTCTGAAAGGTTGATGGGGCATTCATGAG GCCAAATGGCATTACCAAGTATTCATAATGACCATCGTGTGTGCGAAACGCGGTTTTGTGCACATCTGATTCTTGAACTC TGACTTGGTGATAACCCGACTTCAAATCAAGCTTGGAAAAGTAGCGCGAACCATGGAGCTCATCAAGCAATTCCTCAATC ACGGGTATGGGAAATTTATCGGGAACAGTAACACGGTTCAAAGCTCGATAATCCACACATAGCCTCCAAGTTTGATCCTT CTTTCTGACAAGGATCACTGGGCTGGAATATGCGCTCGTGCTTGGCCTTATGATTCCAGATGCCAACATTTCGCGCACCT GCTTCTCAATTTCAGCCTTCTGATGGTGTGGATATCTATACGGTCTAACATTGACAGGTCCCTGACCCTCTTGAACTGTA ATACGATGCTCTCTCCCTCGCCCCGGTGGCAACCCAGTTTTGTCCCTAAAGACCTCATCAAAGCGTACCAACAGTGCCTG CAATTGCTTCTGTTGCGCCGGATTGAGACTTCCCTTGGCAGCTGGAGAGGTTGGCTCTGAGTGCGATTGCCACACTCCCT GCTCCTTAGCCTGCCCAGTGGTTAAAAGGCTTTGTAGTGAACCAAGATCTTCTCTTCCTGAATGAACTCCTTGCAGGTTG ACCCACCGCTGACCACTCCAAAAACTCATCGCCAACGTCTTCCAGTTGACTATCGTGTCTCCCAGCGTCCGAAGCCACTC GATGCCCAACACGATGTCAGGTCCACCAAGCTCAAACAATTGCGGAGAACACTCAAGCTCATACCCTTGCATCGCAATCT TCAGCCCTGTACAGCGTCCTTGCGCTTGGGACCGAAACCCATCTCCCATTTTTACTGACATACGAGGCGTATCCGTAATC TTCCATCCCATCTTGCGTACCAGGGTGCTATCCACAAAATTGTGAGTAGCCCCGCTATCGATCAGAATCTGAACTGGTAC TCCCTCGATGGAACCCAAAAGCTTCATGGTTTGCGGAACTTCTTCTGATGCTCTTCCCATGCTCCCCAAGCTCATTAAGC TCAATTCCGCCTCAGACTCGTCTGCTTCCTCGTTGATCTCCATCGCCAGGATGTTACCGTCGCCGGCGTCCTCCTCGTCA TCCTCCATTATCAACACGCGAAGATGTTTGTCGGGGCATTGGTGATTTGGGTGGTAAGATCCGCCACATTTGAAACAAAG GCCTTTTTGCCTTCTCTCCAACAATTGTGGGTATGTCAAATGGTTGAACCCGCGATCGCGAGGCCCAACCCTTCTCTCTC CTCCATTTTTTGTTTGCTCAGTTTTTGTGTTGTTGTGGTTGTTACTTCCCGAGCCCACTTCCTTTGCCCCCTTAACCCAC ACCCAATCCGCTCCACCCGACTTTCCTGACCCGCTTCCTCCAGAACGGTACCCCGAGTTGCCAAAACGGTTGCTCCGAGA TTGGCCCGATCCAGCATCGCTTCTCACCTCCTTCTCCACCGCTCTTGACACAACCAGCAAACGTGCCCGATTCATCCCTC CCATGGCCGCTAAGCTGCGCACTTTGCCCCGATTATCTTCTTTTAACCCATGTAGAAAATAACCCTGATACTGCTTCTCG GGCAACTTTGGGATCTGGGCAATGAGATATTCAAAATCTGAGATGTACTCGTCCACCGTGCCGCACTGGCGGAGCTCAGA TAATTGTTCGTAAACGTCTCCATCTCCGTTTCCACCATATCGCTCCAACAGTGCGTCCCGTAAACGTTCCCATGTCAGTA CCTCCTCGGATTCGAGAAGAGAGTTGAAGAAATGAATAGTCCCTCCTTCCATACTGAGCTGGGCCAAGCTCACCTTGACT TCCGGTGATGTTCCCTGTACTCGGAAGTACACCTCGGCGCGAGAAATCCAACCGGCGGGGTCCTTGCCGTCAAAAACCGG TAGCTCCACCTTCTTCACCGCTTGTCTAAATTCTGTGAGGGCATCGCCGTGCAGCTGATACGTGCCCCCTCCTCCCAGAT CTGGCGTTGAACCCAGGGTTTGATTCCCAGATTCGACGTTCCCCGGCGAAGCATTGATGTTGTTCCCTTCCGTTGCAATG GTTTTTCCCATCGCCTTGTCAACCATCGTGACTAACATCGAAGGGAGGTCCTTCATCGCAGTGGTAACGGCTGCCAATGA CGTGCGTATCGCCGCCAGCTCGTTCTCCATCGCATCGATCTTCGATTCCATCTGGATTACTGCCGCCTTCGTCTTCTTCG GTGGCATTCACCGTCTCCGATCAAGAATATCCGGCAGGTCGGACCAAATTGTTAGGAAACTATTTCCTAACAATGGAACT GTAAGTAAATTGCAAATCATTGGACTGAATGTGATTGTTTATTAACAGTGAAATGGTTAAACACAGAGAAGGAATGGTTT CCTCAATCTGACAAGAGCTAGGCTCCTAATAGGAAGCTCATTGCTTCCTATCCATCGAATGAAATACAATGATTCAGAAT CCCCCTCTACCTCTCTCTAAACCTTCTTATACAGTTATGGCTACAATCACTACCTCTCTCCTTTCTGTTAGAATCTAGCA CAATCAGTTGCCAGGTGGCTTGGTGACTCCTTTCTTCCTTCTAGAATAAACTAACCAAGTCTTAGGCCCACCTTTATCTT GCACCAAAGGCCCCGCTGCATTCAGGGGTCTAACAACCAACTTCATTTTCTCACTATGTATCAGTTTCCGAAGTGTCTTG ATAACTAATAAATCAAATAACTTTGAAGTGTTTAATACCTAATAAAAACTCCTTAGATAACCTGTGTGTATATGACAGCT TTAGTCCAAATTCTGACTAATTTGAATGATGACATTCAAGCATTTTTGGGAGATATTAACATTTGCTAATGAATATTTTT ATTGCGTTTAAGCAAGTTTATATGCTTCGCCTTTTTATTTTCCTTTCTTTTGATCTACAGCATAAAATAAGTCTAAAACA ATTGTGGTCACGAGTCATTGACAAGACAGAATTCATGTTTTAACCTGTTAGTAGCTATTCCAATTTCCAATTTTCATCAT GAATAATTATTGGAATCCTCTGATTATAACCATGTTTTCCAGCAAGAGCTCGGGGACCCACTGCATCAACCAGCAGCAAC GTCAACCATAATAACCCAAGGCAAACAGTTTGTATGAACTGTCAAGAAACAGGGCATGCTTCTAATGATTGTCCTTCATT GACTTTACGCTCCAGGAATGCCCAACATCCTAGAATGAACCAACAAAGTGGTAAGGTCTCTGCAACTTCAAAAATGCCAT AACAGTGCAGGTAGTCTAGCAAAATAAGAAACGTGTTTGTCAGATATTTTAGTGTGGCCATAGGGATATGAGCAAGCTGG TGATAGTCAACAATGGTAGATGAAGATCCTGATTCTGGTTTTTATGATTGGAAAACACTGATTTTGGATTTGGGGGATGG ATTACTATGCAGGGGAAACTTCTGTTTCATGCAGTTCGTGTGGAACACCATGTGCTTTGCGTACTGCAAATACAGCAAAT AATAGGGGAAGGAAGTTCTACTCATGTCCATCACAGGAGTGCAACTTTTTTGTGTATGTGAACTCCTTATCTTTGCCAAA TTGCTGTTACTAATTACCTATCTCATGGTTGACTCTTAATAATTGTATAGGCCAGAATGGTTAACCTGCCAACTTCTTTC CCCTTGGTTGATTTTCATCCACAAATAGCACGAGCGAACATTAATGAAATTGATTTAATTCTAACCACCATTATGTAATC TGGGAATCTAATTTTTGTAGAGACATTAACCCTGGTTTCAATTATGTGATTGTGATGAATGATGTCTGGAGCAGCTTATA GAGAAACTATACATATTGCATGGCTTTGGGATGATGGCTGTTTATTTATGTAAATCTTATCACCTCTATTACAGATGGGA GGATAGCCTCAACAACGGAACTGGAGGAAGAAGTTTTTCACGTTCAAATAATATTCCACCTTCCAACTCTAACCGAAATA GCGGCCGTGGATCTCGTGGCAGAGGTAGACAGAATGCGTCCAACTCTTCTAATGGGACTTTTGTGTCAGCCACCGGGGAT CCTGTTTCTGGTAGAAGGTGCTTTGTGTGTGGTGATCCATCTCACTTTGCTAATGTCTGCCCCAATCGTGGAGCCTGATG TCTCCTCAGTGATTCCTATCAGCTGTATAGAAGAAAACTAGGTTGGGCATTCCAAACCTTTCTATTTTTAGTGTTTTTTA AGCATTGACAAAGTATTTACGTCAATTTTTTTTGCATTACAAAAAGTTGGTACTGTTTTTATATGCCAATGCTAACTGTC GATTTTATTTATTTCTTTTATTCACTCATCATTTATCTTTTTTTTTTGAATGGCCTCATCATTTATCTTTTTTTTTTTTG AAACTCTCATCATTTATCTTTTTTTTTTGGTTTTCTCTCATCATTTATCTTTGGCATAAAGAAACTTGTAGCATTTGCAT ATTCAAAACTAATTCATTGAAGAGTCATTTTCAACTTGAATTTTGTTTTTTGGATAGGGAAAAGGGCTGCGCCTACCGTG TGTCAGTTTCAAACTGACACACGGTGCTTCAGTTTTACTATTTGAGGGATAAGACAAAAATAACCTTTCTTGCTCAAATT TTTCCATCTTTCTCCTTCCACCGTCACCAACACACTGTTATTGTTGTTCCTCCCTTTCCACCCCAGCTCCTCCGCCGCCG CAACCTCCACCCGCCAGTGCTGCCACCCTCCTCCGCCTTCACCACTCAAGATCGCACACCCATGATACCCAGATCCAGAA CCAGTAGCGGCGGAACCGGAGAGGATGGTGGCGTCGAGACAATTTCTTCATCTCCGATCTGCAAAACCTGAGCCACCGCC AACATCTCCGATCTGTTTGAGGTCGAAATGAAAGGGTCCAAAATCATATCCGACCCTTGCTCTCTTCTTTCTTCAAAACC CTTCTCTGGTTTTCTCTCTTTGGAGCAGCATGCATATAAGATTTATCTGATTGTTTCATCATTCTTGCTTATGTTGGGTT TTTATTAGGTGGCGGTGGTGGAGATGGTCCTTTCAGCGGCGGTGGCGGTTTCGGTGGGAGAGGCGGTGGTTGGAATTTCA ACAGATTTGGGGGTGTTGGAATTTCAATATATATTGCGTTCAAGAGGATTGTTCAGATTGTTACTGATGGATCAATTGCA CCCCTATTTAGCTAAATTGCTCTATCATGCTGGAATTGATGTCATTTTGGTTGCAATTTTGGAACTTGGAAATACCCATT ACGATTACAGAGATTTCTATTCCCTTTTGGTATGAGCAAAGTAGATTTGGAATTGTTGATTTTAATTTTTAGCTGCAACA TGATGAATCCCAAATTCAAAATTTCCAGATCTTGCATCAAAATATATTCAACATGAAGAGCCGTGGGAAAGAGAAGAAAG GGTAGCAGTGGAGGAAGAAGAAGTGGTGGGTCGCATGAATGGTGGTGGCCGGAGTTAACATGTCACAGGAAATAATAATG TGGGTGAATAGAAAGAAGTAGGGGTGTTTTAGTAAATTAATATATATTTAACAAATAAATTCTTTTAATGTTAATTAATC TTGGCCATTGAATTAAAAAAATATTATATCCATTGGTGAAAAATGAAACTGCAGCACCGTGTGTCAGTTTGAAACTGACA CACGGTAGACGAAACCAGGGAAAAGATATCATTTTAAATTCCATTACTTGCATTTATGCCCTTGAAGCCAGTAGATAGGG TTTTTAATGTAACAACCTGAGACTTTTCTATTCATGTCAATATGTTTTCATTGGACGGTCATCTAAAATATGGTTATGAG CCCTTGTGGAAGCCGGTTAAATAGGATAATGTCTCTTCCTCAAGGGTGGGTTTGGAATTTGGATGAACGATTTTTAAAAG AAAGAGAAGGATGAGATTAAGTTTCTATTTCAAGAAAAAAACTTCTAATTTATCAACTTTTTAAAATATAAAAGTAAACT GAAAGATTAGGCTTATCTACCGTGGATCAAGAAAAATATGGCTTTTAAGTTAGAAGAACTTCTTTGTAAATTAGTTTTAG TACATAAAGACCATATTGTAACTAATGTACACCAAATGTTAGTTGCAAAAACTTAGTTCATGAGTGGACCAGTATCCTTT TTCTTCAAAAACATATCTATTGCTCACATAAAAGAGAGTCTGTAGTGTCTGCTCCTCATGTATTTATTTAGGTCAAAGAT GAGAACCACAGATGCATTGCATGCAACACCAAACATAGTTCTGTTCTATTTGCATTAAACCAGTGTGTATTTTGTAATAT TTAGGTTCAATCATTTTCAAACT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0321800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGATCAACGTCCTCAACGTGGCGGAGAAGCCCTCGGTGGCGAAATCGGTGGCCACCATACTCTCACAGAACCAGGG TCTACGAGTCAGGAATGGCCATTCCCGCTACAACAAGATCTTCGAGTTCAACTACAACATCCGCGGCCAACCCTGCCACA TGCTCTTCACCTCCGTCACCGGCCACCTCATGGAGCTCGAATTCGAAGAGCGTTACCGCAAATGGCACTCTTGTGACCCC GCCGATCTCTTCCAAGCCGAAGTCCGTAAAACCGTTCCCGAGGACAAGAAGGATATCAAGAGGACATTGGAGGAGGAAGC TAGGCGGTGTCAGTGGCTTGTTTTGTGGCTCGATTGCGATCGAGAGGGTGAGAACATTGCGTTTGAAGTGGTCGACGTAT GTAGGCCGGTGAATCCTCGCCTCACGATCAAGAGGGCTCGGTTTTCTGCACTGATTGAGAGGGATATCCATGAAGCTGTG CAGAATCTTGTTGAGCCGAATAAGTTTTTTGCGGATGCTGTTGATGCTAGGCAAGAAATAGATCTTCGTATAGGGGCCTC TTTCACCAGATTCCAGACCATGTTGTTGAAAGATGCTTTTGTCATTGACAATGCTGGAGATGGCAGAAATCTTGTCTTGA GTTACGGCCCTTGCCAGTTCCCTACACTTGGATTTGTTGTGGAAAGATATTGGGAGATACAAGCACATGAGCCAGAAGAG TTTTGGACAATCAACTGCTCTCATAGGTCAGATGAAGGCCTTGCTAATTTCAGCTGGATGCGGGGCCATGTGTTTGATTA TACTTGTGCAGTTATAATCTATGAGATGTGCATTGAGGGACAAACTGCAACTGTCTCGAATGTTAGACACCAAGAAAAGC TGAAGTATCCTCCACATCCTCTAAATACTATTGAGCTTGAGAAACGAGCTTCACGATACTTCCGGATGAGCTCTGAACAC ACAATGAAGGTGGCAGAAGAACTTTACCAAACTGGTTTCATCAGTTATCCTCGTACAGAAACTGATAGCTTTTCTCCAAG GACTAATTTGCATGCAATTGTGCAAGAACAACAAGGGCATCCTGAATGGGGAATATATGCACAGCGGTTGTTGGACCCTG AGGCGGGACTTTGGAGAAACCCTAGAGGTGGCGGACATGATGACAAGGCTCATCCACCCATCCACCCCACAAAATTTTCT GCCGGGGAATCAGGATGGAGCCAAAATCACCGCAAACTATATGAGCTGGTTGTTCGCCACTTCCTGGCATGTGTCTCAAA GCCTGCAGTTGGAGCTGAAACCACGGTAGAAATTGACATTGCTGGTGAACTATTTTCTGCTTGTGGCAGGGTGATTCTAG AGAAAAACTACTTGGATGTTTATCCCTTTGAAACTTGGGGTGGATCATTGATTCCAACATATACTGTTGGTCAACAGTTC ACTCCAACAGCATTGACCCTTGATTCAGGAGTAACCAGACCACCACCACTTCTGAGTGAAGCTGATCTGCTGAGTTGTAT GGACAAGGAAGGTATTGGTACAGATGCCACCATGCACGATCACATAAAGAAGCTGCTTGATCGGTTTTATGCAACTAAAG ATGCTAGCACTCGATTCACACCAACTAATCTTGGTGAGGCACTTGTCATGGGATACGATGACATTGAAATGGCGTATAAA CTATGGAAACCAGAACTTAGATCTGCTATGGAAAGTGACATGAAATCCGTTAGTGAAGGGACTAAAGGCAAAGATGCAGT TCTGGCAACTAGCTTGGATAAGATGAAAGCTTGTTTCTTACATGCAAGATTGAATAAAGTGAAACTTTTAGAGGCCATGT CAATATTTTTCCAAAGATCAAATAGATCTGCCGGTGATGAGCTGCATGCAACTGGAGAAGTTGTTAGACGATGTGGACTC TGCCAAGAATCAGACATGGTGCTAAAGAAAAATCGAGATGGCAATTTTATGGTCGGATGCTTGGGTTTCCCTCAGTGTAG GAATGCCGTTTGGCTCCCTGGATCAGTATCAGAAGCAGCTGTGACCACCAATCCTTGCAACTTCTGCACTCCTGGTCCTG TTTACCGGATTCAGTTGAAGTTTCGGCAGCTGGAAATACCACCAAACTACAATATCAACCATTTGGGTTGCATTGGTGGC TGTGATGAGATTCTCAGACAGTTGACTGAAATATGTGGCACTGGCCCTCGCATGCCAGCAAGAGCTCGGGGACCCACTGC ATCAACCAGCAGCAACGTCAACCATAATAACCCAAGGCAAACAGTTTGTATGAACTGTCAAGAAACAGGGCATGCTTCTA ATGATTGTCCTTCATTGACTTTACGCTCCAGGAATGCCCAACATCCTAGAATGAACCAACAAAGTGGGGAAACTTCTGTT TCATGCAGTTCGTGTGGAACACCATGTGCTTTGCGTACTGCAAATACAGCAAATAATAGGGGAAGGAAGTTCTACTCATG TCCATCACAGGAGTGCAACTTTTTTGTATGGGAGGATAGCCTCAACAACGGAACTGGAGGAAGAAGTTTTTCACGTTCAA ATAATATTCCACCTTCCAACTCTAACCGAAATAGCGGCCGTGGATCTCGTGGCAGAGGTAGACAGAATGCGTCCAACTCT TCTAATGGGACTTTTGTGTCAGCCACCGGGGATCCTGTTTCTGGTAGAAGGTGCTTTGTGTGTGGTGATCCATCTCACTT TGCTAATGTCTGCCCCAATCGTGGAGCCTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0321800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGINVLNVAEKPSVAKSVATILSQNQGLRVRNGHSRYNKIFEFNYNIRGQPCHMLFTSVTGHLMELEFEERYRKWHSCDP ADLFQAEVRKTVPEDKKDIKRTLEEEARRCQWLVLWLDCDREGENIAFEVVDVCRPVNPRLTIKRARFSALIERDIHEAV QNLVEPNKFFADAVDARQEIDLRIGASFTRFQTMLLKDAFVIDNAGDGRNLVLSYGPCQFPTLGFVVERYWEIQAHEPEE FWTINCSHRSDEGLANFSWMRGHVFDYTCAVIIYEMCIEGQTATVSNVRHQEKLKYPPHPLNTIELEKRASRYFRMSSEH TMKVAEELYQTGFISYPRTETDSFSPRTNLHAIVQEQQGHPEWGIYAQRLLDPEAGLWRNPRGGGHDDKAHPPIHPTKFS AGESGWSQNHRKLYELVVRHFLACVSKPAVGAETTVEIDIAGELFSACGRVILEKNYLDVYPFETWGGSLIPTYTVGQQF TPTALTLDSGVTRPPPLLSEADLLSCMDKEGIGTDATMHDHIKKLLDRFYATKDASTRFTPTNLGEALVMGYDDIEMAYK LWKPELRSAMESDMKSVSEGTKGKDAVLATSLDKMKACFLHARLNKVKLLEAMSIFFQRSNRSAGDELHATGEVVRRCGL CQESDMVLKKNRDGNFMVGCLGFPQCRNAVWLPGSVSEAAVTTNPCNFCTPGPVYRIQLKFRQLEIPPNYNINHLGCIGG CDEILRQLTEICGTGPRMPARARGPTASTSSNVNHNNPRQTVCMNCQETGHASNDCPSLTLRSRNAQHPRMNQQSGETSV SCSSCGTPCALRTANTANNRGRKFYSCPSQECNFFVWEDSLNNGTGGRSFSRSNNIPPSNSNRNSGRGSRGRGRQNASNS SNGTFVSATGDPVSGRRCFVCGDPSHFANVCPNRGA 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 2 166 165 2.3E-62
PANTHER 4 828 825 3.6E-297
CDD 4 163 160 1.20438E-55
PANTHER 4 828 825 3.6E-297
ProSiteProfiles 4 149 146 21.257
SMART 4 139 136 1.5E-17
SUPERFAMILY 5 597 593 1.57E-156
Pfam 6 150 145 4.3E-18
PRINTS 113 126 14 1.8E-16
SMART 142 243 102 1.5E-30
Pfam 168 588 421 1.0E-107
CDD 170 599 430 8.41414E-147
Gene3D 172 599 428 5.1E-166
PRINTS 213 231 19 1.8E-16
Gene3D 237 495 259 5.1E-166
SMART 289 549 261 2.8E-80
Gene3D 297 427 131 5.1E-166
ProSitePatterns 326 340 15 -
PRINTS 331 340 10 1.8E-16
PRINTS 413 429 17 1.8E-16
PRINTS 511 525 15 1.8E-16
Pfam 636 673 38 2.0E-7
Gene3D 741 794 54 4.4E-5
SUPERFAMILY 752 779 28 3.84E-6
Pfam 762 778 17 0.0017
SMART 762 778 17 0.0082
ProSiteProfiles 763 778 16 9.307
Pfam 801 840 40 3.0E-12
MobiDBLite 846 888 43 -
SUPERFAMILY 887 914 28 4.54E-5
ProSiteProfiles 896 913 18 8.73
SMART 897 913 17 0.0089

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleic acid binding Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid.
Molecular function DNA binding Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid).
Molecular function DNA topoisomerase activity Catalysis of the transient cleavage and passage of individual DNA strands or double helices through one another, resulting a topological transformation in double-stranded DNA.
Molecular function DNA topoisomerase type I activity Catalysis of a DNA topological transformation by transiently cleaving one DNA strand at a time to allow passage of another strand; changes the linking number by +1 per catalytic cycle.
Cellular component Chromosome A structure composed of a very long molecule of DNA and associated proteins (e.g. histones) that carries hereditary information.
Biological process DNA topological change The process in which a transformation is induced in the topological structure of a double-stranded DNA helix, resulting in a change in linking number.
Molecular function Zinc ion binding Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0321800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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