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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0519700 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0519700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Auxin transport protein BIG; TAIR: AT3G02260.2 auxin transport protein (BIG); Swiss-Prot: sp|Q9SRU2|BIG_ARATH Auxin transport protein BIG; TrEMBL-Plants: tr|G7KRX3|G7KRX3_MEDTR Auxin transporter BIG; Found in the gene: LotjaGi1g1v0519700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:104341659..104364313) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCACAACACCAAAAGTGTAGTTGTGTGAAGAAAATTCCTTCTTACTGGTTAAGCAAACTTTCAACTGTAGCAGTAGCAGT AGTTAACTTGTTATTGCCTTCCTCTCTCCCCACACACACGTCACACTCTCCCTTTCTCCGTCACCGCCTTCAATATCATT TCCATAAAACCCTCTCCCGATTTCACTCTGAAGAATCACTCTCACTCTGTACAATACAAACCCCTCTCTCTCTCTCTCAT GATTTGTAACTGCCATGGCTGAGAACTTCAACATCCTCGCCGATGCTCTGTCGCTACCGTCCGGCGAGTTTCTGCAGAAG CTCCGCTCCGATGACGCCGTCAGGTCAGGACTCATCGCCGTCCACTCCGTTCTCCGCCGCGGCATCGAGCCTTCCGCCGA TGGTACTTTCCCCTTCCAGTCCTGGACTGACTCGCAGATTCAGGCGATTTCTTCGCTCGCGCACGCAATCGCTTCCGCTT CTCGATCTTTGTCAGGTGCTCATTTCTTATGCAGTTTCTTCTTCATCGGGACTTGCTTTTTCGATTGCGTTTCGTGCGAT TAGCTTATATTGTTGTGTTTTGTTGTTTGTGTGTGTAGTGGAGCAAGCGGAAGGGGTGCTTGTTGCGATTCTGCAGAAGT CCATAGAATTTGCTGTGTGTTATTTGGAGCAATCTGGATTCGATGATGATGATTTAGGAATTCAGGTACACATTGCGAAT CTCTGGCGAACTCAGTAGTAAGAAAATTCGATGGAAGTAGCGTGTGCAGGCTTTACTAAAATTTCAGCAAGATTTTCATT TGAAGAAGTCAATTTTAGTTGATATCCTGCACTTGAACAGATTGATAGCTGAATGTTTTTATTTTTCATACAAATCTTGT TTTTTAATCATCTTAGGAACTGCCTTTCCAAATTATAATGTTCAAATCCAATGAAGCAACAAAGTTGTGAAAAAGAGGGT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0519700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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GAAGAGTTTATCAGGGGATCAATGACTAAGAATCCATATTCAAGTTCTGAGATTGGCCCATTAATGCGCGATGTGAAGAA TAAGATCTGCCATCAGTTGGATTTGTTAGGTCTTCTTGAGGATGACTATGGAATGGAGTTGTTGGTCGCTGGCAATATCA TCTCTCTTGATTTGACCGTTGCACTAGTTTATGAGCAAGTCTGGAAGAAATCAAATCAATCTTCAAATGTAACTAATTCC AACTTGGCATCTTCAAATGCTGTCACCTCATCCAGAGATTTCCCACCTATGACTGTGACCTATCGGCTCCAGGGGTTGGA TGGTGAAGCTACTGAGCCCATGATAAAAGAGTTGGAGGAAGATAGAGAGGAGTCTCAGGATCCAGAGATAGAGTTTGCCA TAGCAGGTGCTGTTCGTGAATATGGTGGACTGGAGATACTATTGGGCATGATTCAGCGTCTGCGAGATGATTTCAAGTCC AATCAGGAGCATCTGGTTGCAGTTCTTAATCTTTTTATGTATTGTTGCAAAATTAGAGAGAACAGACGAGCTTTGTTGAA GCTAGGAGCTCTAGGTTTGCTTCTCGAGACCGCAAGACGAGCTTTTTCAGTTGATGCCATGGAGCCAGCTGAAGGCATAC TTCTGATTGTTGAAAGTCTTACTTTAGAAGCAAATGAAAGCGACAATATAAGTATCACACAAAGTGCCCTTACTGTCACC AAAGAAGAAGCGGGGACTGGTGAAGAAGCCAAGAAGATAGTTCTTATGTTTTTGGAAAGATTGTCCCATCCATTGGGGCT TAAGAAATCAAACAAACAGCAGAGGAACACAGAGATGGTTGCTCGAATATTGCCTTACTTAACTTATGGTGAACCTGCTG CAATGGAAGCTCTTATCCAGCATTTTAGCCCTTACTTGCAAGATTGGCGTGTATTTGACGATTTGCAGAAACAACATCTG AACAATCCAAAAGATGATAATATTGCTCAGCTAGCTGCAAAGCAGAGGTTCACTCTAGAAAATTTTGTTAGGGTTTCAGA GTCACTTAAGACAAGTTCCTGTGGAGAGAGATTAAAGGACATTATCCTAGAAAAGGGAATAACAGAAACTGCAATCAGAC ATTTGAAAGATAGTTTTTCCAATGCAGGGCAAGCTGGCTATAAGACCAGTGCTGAGTGGGCACAGGGTTTAACAGTTCCT TCTATCCCTCTTATATTGTCTATGCTAAGAGGTTTATCGATGGGGCATCTGCTCACCCAAAAGTGTATTGATAAGGAAGG TATCTTACCCTTGTTGCATGCCTTGGAAGGAGTTCCTGGAGAGAACGAAATTGGGGCAAGGGCTGAAAATTTGTTGGATA CGCTATCTAACAAGGAGGGAAAAGGAGATGGATACCTAGAGGAGAAGGTGTGTAAGTTGCGGCATGCAACTAGGGATGAA ATGAGGCGCCGGGCATTGCAGAAGAGAGAGAAGTTGCTTCAGGACCTCGGAATGCATCAAGAACGGTCTTCAGATGGAGG TGAACGTATTGTTGTTGCCCGGCCTATCCTTGAGGGTTTAGAAGATGTCCAGGAAGAGGAGGATGGGTTGGCATGCATGG TATGCAGGGAAGGATACAGTTTAAGACCTACTGACTTACTGGGTGTTTACTCTTATAGTAAACGTGTGAATCTAGGTGTA GGTGCATCTGGAAGTGCTCGCGGAGAGTGTGTTTACACTACCGTAAGTTACTTCAATGTTATTCACTTCCAGTGTCATCA AGAGGCCAAGAGAGCTGATGCTGCCTTAAAGAATCCTAAGAAAGAGTGGGATGGAGCAACACTTAGAAACAATGAATCTC TCTGTAATTCTTTATTCCCTGTAAGAGGTCCATCTGTTCCACAGGCACAGTATACTCGCTATGTTGACCAGCACTGGGAC AACCTCAATGCTCTTGGACGTGCTGATGGAAGCAGGCTCCGTTTGCTGACTTATGACATTGTTCTGATGTTAGCTCGGTT TGCGACAGGAGCATCATTCAGTGCAGATTGCCGAGGTGGGGGACGCGATAGTAATTCGCGGTTCCTTCCATTTATGATTC AAATGGCACGTCATCTCCTTGATCAAGGAAGCACCTCCCAGCGTCGAACCATGGCCAGGGCCGTATCAGCATATATAACT TCAACCACATCAGATCTCAGACCCCCTTCTCCATCTGGCACCCAACCTACAATGGGGACAGAAGAAACTGTCCAATTTAT GATGGTAAACTCACTTCTCTCAGAGTCTTACGAGTCATGGCTGCAGCACCGCCGTTCTTTTCTGCAGCGCGGAATCTATC ATGCATACATGCAGCACACACACTCACGCTCAAGTACTCGTGCATCATCCATTTCTGCTCCTGCTCAAGCTGTGGAATCT GGACGTTTGGACCAAAGTGCTACAACAGAAACAGGGAAGAATGATGAGCTTTTGTCTATCATTCGTCCAATGCTTGTTTA CACAGGCTTGATTGAGCAGTTACAGCATTTCTTCAAGGTCAAGAAATCCACAAGTGCAACATCTGGAAGTACTGAAGGGG CTTCATCTGCAACTGAAGGGGAAGATGAAAGAGGGAACCTGGAAAGCTGGGAATTGGTGATGAAAGAGAGAATCTTGAAT GTGAAAGAGCTGCTCGGATTCCCGAAGGAGATGCTGTCCTGGCTTGATGATATTAATTCTGCTAGTGACTTGCAGGAGGC CTTTGACATAGTTGGGGTTCTACCTGAGGTGTTTTCTGGTGGATTCACTCGTTGTGAAGACTTTGTCCAGGCTGCAATTA CTGCAGGGAAAAGTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0519700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAENFNILADALSLPSGEFLQKLRSDDAVRSGLIAVHSVLRRGIEPSADGTFPFQSWTDSQIQAISSLAHAIASASRSLS VEQAEGVLVAILQKSIEFAVCYLEQSGFDDDDLGIQNNFIHLLEIALVDGMNMVADVSQPTTSSALLDLLPMVDDLCGSF ADDYKKCHLEGYRCSREEKSMDWILKTLPSKHVPHDKQESGFSEQSYYQYLNNFVFLSQHWAVVHGECTRRLIFLCNKLA KVKDVFDERAVSHFRRRLSFILRILKILGSLMKDVLYVEYDASLMMGVASFSDTLSNLFRVRFEFVSTYATIEGSFENLV LMVVEEFLHNVQVIFGTSSVSQNIQASIIASILDSLDSSVWIYDPSAPNSKPPLAYFPRFVVYTLNLINDLKSQRHQVPF EWKDSDVKLVDSFADSLTSSPSCLVHLESVSLLKGYRFEELLKLIFPASSQWIFNLVQLAFFLHFEGLKLRPKMERSHSS LAKVVGTSEVENSVCQEDEALFGDLFSETARSVGSTDGCEQPTAAALVSSSSNQNMPIQAAIELLNFLKTCIFSTEWHPS LYVDACNKLSSRDIDILLSLLNCQGCCSEDNISDSCIPSHEDDKVGHVHELCFDLLHNLLTNHALNDSLEDYLVEKILKV ENGAFNYNDRTLALLAHTLFCRVGSAGSQLRTKICSGYVTFVLEKAKAVCVNCPSINDLVGTLPSLFHIEVVLVAFHLSS QQEKAMMANLIFSTLKEVPKLALDLSCTLLTCWALVVSRLILVLRHMMFHQQTCPTSLLVDVRSKLREAPLSSLSMQNKV NDHMSSWSSTALKSIAGGLIGDEVSISSLIEQLIDVSSSSSSLSGDDLAIGKLNLNWKDIYVTFSLVLGLWRGKKATAVE DFIVERYVFTLCWDFPYVVSEADHPSISWNQDQSVDLSDMSHFFHFCHLLLNHPEVIGKFTTFPEVVLSLLQHLNAMPIP DDIEELGWYFLRSGMWLSLVLSFTNVGIWRYCMDNSISGHGLNWTETSVGDENFAKHAGSMISSMIDSGQFALLVRLFSS LLNKHVQFCQKAFLDILSSKHKLAPGFSPFLLLKHTGVDKNLQDELLERSGSNAGELQSVLSLLSRLDAAVDKKASGILS RASWECILHGFPFHHSTPSATLLSCVLSVRGIIFVLDGVHKIKEACENIDLETEVLGHILDTAMNIKYDRIFESVHGKCD TIYHSLSAELELSDYANLTLLKQMEGFLKDINARGVCDCSAQEWIICKIIEILSSLRKDPSKSVIFHYYLGAEQVPGQMS KISQLYLGDCLVLVDSLDTCFSESVNVKVLGFIVDLLSGEQFPHLRMRIQRKFLDRDTDCVSKWLEKRLLGSIMKSDSGV NCTKGSSISLRESTMNFILCLVSPSSEQQSKELQQHIFNSALLSLDTAFLLFDIHVAKSYFNFMVQISRGEYLMKQLLMR TVMLMGKLEGNENLLPGLKFLFGFIGSVLNDCGSGKISLQRTTKKCSPGNSLGLGHASARLVGSKNSETFILSANQEAGS TSVECDATSLDEDEDDATSDGEVLSIDKDDEEDANSERALASKVCTFTSSGSNFMEQHWYFCYTCDLTVSKGCCSVCAKV CHRGHRVVYSRSSRFFCDCGAGGVRGSNCQCLKPRKFTGDSSVPVRGSNTFQSFLPFPEDGDQLPDSDSDFEEDVSFDVD NSLKVYITKELQEGIPSLLEELDIESKVLNLCSSLMPSIISRRDSHHSKDKKISLGEDKVISHGVDLLQLKKTYKSGSFD LKIKADYSNAKDLKSHLGSGSLVKSSLSVSVRGRLAVGEGDKVIIYDVGQLIGQATIAPVTSDKTNVKPLSKNVVRFEIV QLAFNPVVENYLLVAGYEDCQVLTLNPRGEVIDRLAIELALQGAYIRRVDWVPGSQVQLMVVTNRFVKIYDLSLDNISPM HYFTLSDDMIVDAILYTASQGRMFLIVLSENGHIFRFELSVKGNVGAVPLKELVQLQGKEIHAKGSSLYFSSTCKLLFIS FQDGTTLMGRPSSDAASLVEMSSVYEEQDNKLRPAGAHHWKELLAGSGLFVCLSTVKSNSALTVSMGEHDILAQSMRHSV GSTSPIVGVTAYKPLSKDKIHCLVLHDDGSLQIYWHAPVGVDAGVIAASEKVKKLGSGILNKAYAGTSPEFPLDFFEKTV CITPDVKLGGDAIRNGDSEGAKQSLVNEDGFLESPSPAGFKISVFNSNPDIVMVGFRVHVGNTSASHIPSSISIFQRVIK LDEGMRSWYDIPFTVAESLLADEEFTLSVGPTFNGSTLPRIDSLEVYGRAKDEFGWKEKMDAILDMEARVLGSNSSLSGS GKKRRSMQSAPIQEQVVADGLKLITKFYSSCRQQDCSRLEEAKIELGKLKCKQLLETIFESDREPILQASGSRVLQAIFP KKEIYHQVKDTMRLLGVVKSSSLLLSRLERGGTAGSGIIEEFTAQMRAVCRIALQRRSNLATFLETNGSKVVDALMQVLW GILDFEQPDTQTMNNIIMSAVELIYCYAECLALHGKDAGVHSVAPAVVLLKKLLFSTDEAVQTASSLAISSRLLQVPFPK QTLLATDDGVESVVSVPGPADTSARNNQVMIEEDTITSSVQYCCDGCSTVPILRRRWHCTVCPDFDLCEACYEVLDADRL PPPHSRDHPMTAIPIEVDSVGDGNEFHFTPDDVSDLPVPADSNMQNSSPSIHVLEPNDSGEFAASLIDPVSISASKREIN SLLLSELLEQLKGWMETTSGVRAIPVMQLFYRLSSAVGGPFIDSSKPDSLDLEKLIRWFLDEINLNRPFVARTRSSFGEV AILVFMFFTLMLRNWHQPGTDGSMPRQSGAADMHDKNVIQFPPSTSGSAKTSVDEQEKNDFASQLLRACDSLRQQSFVSY LMDILQQLVHVFKSPVNNESGHSNAGPGCGALLTVRRELPAGNFSPFFSDSYAKVHRSDIFMDYYRLLLENAFRLVYTLV RPEKHDKAGEKEKVYKLSYGKDLKLDGYQDVLCSYINNPHTNFVRRYARRLFLHLCGSKSHYYSVRDSWQFSSEVKRLYK HISKSGGFQNNPIPYERSVKIVKCLSTMAEVAAARPRNWQKYCLRHGDILSFLMNGIFYFGEESVIQTLKLLNFAFYAGK DAGQTSQKTELGDISSNKSGIISQESKKKKKGEDGAESGSEKSYLDMEAAVDVFTDKSGNILKQFMDSFLLEWNSITVRA EAKLVLYGVWHHAKPAFKETMLMALLQKVKFLPMYGQNIVEYTELVTWLLGRSPDTSSRHKVSDLVDRCLTLDVIRCIFE TLHSQNELLANHPNSRIYNTLSGLVEFDGYYLESEPCVACSSPEVPYSKMKLESLKSETKFTDNRIIVKCTGSYTIQTVT MNVHDTRKSKSVKVLNLYYNNRPVTDLSELKNNWSLWKRAKSCHLAFDQTELKVEFPIPITACNFMIELDSFYENLQALS LEPLQCPRCSRPVTDKHGICSNCHENAYQCRQCRNINYENLDSFLCNECGYSKYGRFEFNFMAKPSFTFDNMENDDDMKK GLAAIESESENAHRRYQQLLGFKKPLLKIVSSIGDSEIDSLPKDSVQQMMVSLTGPSCKINRKIALLGVLYGEKCKAAFD SVTKSVQTLQGLRKVLMSYLHQKHSDNSVASRFVVSRSPNNCYGCATTFVTQCLELLQVLARHPNSKKQLVSAGILSELF ENNIHQGPKAARIQARMVLCSLSESDVNAVTELNSLIQKKVLYCLEHHRSMDIAVTTREELLLLSEVCSLADEFWESRLR LVFQLLFSSIKVGAKHPAISEHVILPCLRIISQACTPPKPETPDKEQTLGKSSTKTKDETTQNVPSSLAGAVAVSGTKTF SDSSERNWDATPKTQDIQLLSYSEWERGASYLDFVRRQYKVSQAVKGSGQRSRSQRHDYLALKYALRWKRRAGKAAKSDL SVFELGSWVKELVLSACSQSIRSEMCTLISLLCAQSSSRRFRLLNLVVSLLPSTLSSGESAAEYFELLFKMIDSEDALLF LTVRGCLRTICTLITQEVSNVESLERSLHIDITQGFILHKLIELLGKFLEVPNVRSRFMRDNLLSDILEALIVIRGLIVQ KTKLISDCNRLLKDLLDSLLLESTENKQQFIRACINGLEIHGEERKGRTCLFILEQLCNLICPSKPEPVYLLVLNKAHTQ EEFIRGSMTKNPYSSSEIGPLMRDVKNKICHQLDLLGLLEDDYGMELLVAGNIISLDLTVALVYEQVWKKSNQSSNVTNS NLASSNAVTSSRDFPPMTVTYRLQGLDGEATEPMIKELEEDREESQDPEIEFAIAGAVREYGGLEILLGMIQRLRDDFKS NQEHLVAVLNLFMYCCKIRENRRALLKLGALGLLLETARRAFSVDAMEPAEGILLIVESLTLEANESDNISITQSALTVT KEEAGTGEEAKKIVLMFLERLSHPLGLKKSNKQQRNTEMVARILPYLTYGEPAAMEALIQHFSPYLQDWRVFDDLQKQHL NNPKDDNIAQLAAKQRFTLENFVRVSESLKTSSCGERLKDIILEKGITETAIRHLKDSFSNAGQAGYKTSAEWAQGLTVP SIPLILSMLRGLSMGHLLTQKCIDKEGILPLLHALEGVPGENEIGARAENLLDTLSNKEGKGDGYLEEKVCKLRHATRDE MRRRALQKREKLLQDLGMHQERSSDGGERIVVARPILEGLEDVQEEEDGLACMVCREGYSLRPTDLLGVYSYSKRVNLGV GASGSARGECVYTTVSYFNVIHFQCHQEAKRADAALKNPKKEWDGATLRNNESLCNSLFPVRGPSVPQAQYTRYVDQHWD NLNALGRADGSRLRLLTYDIVLMLARFATGASFSADCRGGGRDSNSRFLPFMIQMARHLLDQGSTSQRRTMARAVSAYIT STTSDLRPPSPSGTQPTMGTEETVQFMMVNSLLSESYESWLQHRRSFLQRGIYHAYMQHTHSRSSTRASSISAPAQAVES GRLDQSATTETGKNDELLSIIRPMLVYTGLIEQLQHFFKVKKSTSATSGSTEGASSATEGEDERGNLESWELVMKERILN VKELLGFPKEMLSWLDDINSASDLQEAFDIVGVLPEVFSGGFTRCEDFVQAAITAGKS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 698 | 698 | - | – | |
| PANTHER | 209 | 5093 | 4885 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 209 | 5093 | 4885 | 0.0 | – | |
| Phobius | 699 | 720 | 22 | - | – | |
| Phobius | 721 | 740 | 20 | - | – | |
| Phobius | 741 | 764 | 24 | - | – | |
| Phobius | 765 | 5098 | 4334 | - | – | |
| SMART | 1563 | 1633 | 71 | 4.3E-17 | ||
| ProSiteProfiles | 1563 | 1634 | 72 | 8.491 | ||
| SUPERFAMILY | 1787 | 2008 | 222 | 1.26E-10 | – | |
| SUPERFAMILY | 2589 | 2661 | 73 | 5.65E-18 | – | |
| Gene3D | 2597 | 2659 | 63 | 4.3E-14 | ||
| SMART | 2598 | 2641 | 44 | 2.4E-10 | ||
| ProSiteProfiles | 2598 | 2632 | 35 | 11.915 | ||
| Pfam | 2601 | 2633 | 33 | 2.6E-9 | ||
| CDD | 2602 | 2653 | 52 | 1.72429E-15 | – | |
| ProSitePatterns | 2604 | 2631 | 28 | - | ||
| MobiDBLite | 3142 | 3161 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 3143 | 3161 | 19 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 3648 | 4140 | 493 | 8.96E-5 | ||
| MobiDBLite | 3796 | 3825 | 30 | - | – | |
| Pfam | 4168 | 5072 | 905 | 0.0 | ||
| MobiDBLite | 4879 | 4898 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 4943 | 4971 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 5006 | 5025 | 20 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0519700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…