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LotjaGi2g1v0067700.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0067700
Transcript ID LotjaGi2g1v0067700.3
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like protein kinase; TAIR: AT3G47570.1 Leucine-rich repeat protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|C0LGP4|Y3475_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7H6H3|A0A1J7H6H3_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0067700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:15917755..15937760) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CACGTTTACAGAATTGTAACCCTAAAAGGCATGGACGAGCGAGATCGATGGAGGAGCACTTTCCTTTACTCCGCCGCCGT CAGATTCGCCGTGTTCTCGCCGGAGCAGAACGGTGGGAGTTTCATGGCGTCCAATGGCTCATTTTTTCATCGCCGGCGGT CATTGAGTCGGAGGAGAGGTTCGCCCCGTGCGACTGGCGAAGGTAAGACACCGTCGGTCATTGTTGTTATCTTTACCTGT GAGTTTTCCATGATGATGATGATGCTTGTGGTGATGCAGGTAGAACGCGGTTGGTTGGATTGGAAGTGAGGTAAATGGCT GATGAGTATAGAGTTGAGTTTTGATGGAAGAGTGATGTTAATGTTGAGATTTGAGAACACCAAAGCTTCTGACAGAGAGA AATCGTGAAATCGAGAAGGTAATTTCAATTGCATAGTTTAACATTTTTTTTAATTGAGTGCATTGAGAGTTTCAATGGCG ATTTATGTGATACTACAACAATAATAACAAAAGCCTTATCCCACTAAGTGAAGTCCGTTATATGAATCACACTAAGCTCG ATCAAAAACTAAATTATGTGTGATACTATTGATTTGTGTGATACTGCTAGATCCAATTTTAGGGCTTAAGGCAATCCTAC AAAAGGAGTGGTACTATTTATGAGAAAAGGAGCAAGATTCCGATAAATAAATGCAATAGATCAACTATATTGATCAGAAT GTTAAATTATCTTCCTATATGTACAGGGAGATAGGAACAATCTGAATGGGAAGCTTTAAATTTGATGTCAAAACTTGCAG TTAAGAAGATATATATTGTGTAAATCAGAGCATAAGTAGTGTAAGAGTGATTGGCAGAAATATATTAAGATTGTATTGCT ATGTGCACCAGGATGTAAGCATCTGTTTTAAGTAGAACACAATTGTAAGCATCTGATCACCCTTGATGTGAATGTTGATG 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ACCATTGATTTTATCCTCACCTTCTCAAAATGTTGGGAGAAATCAAAAAGTGTGAAAGGGCATTCCTTCCACCAAGCTTT AACCCACCACATAATGCGCATAATATGAATATCCCAAACACTTTCAAAAGAGAACTCCTTCTGATTGAAAACAGTGTCAT TCCGTGCTATCCATATGGACCAACATAAGGCATATGGGATAATTTCCCACAAAACAGGATCTGATTTAACACGGAGGGAG GGCCATTCCAACATCAGGTCCTGAAAAGAGGAAGGGATGCAGAAACATACCTCTTCTCGAGCCAAGATAGCATTCCACAA GCACCAGACTTTATTGCATCGTAACATAAGATGTGATTCAGATTCCCCTTCCAACCCACATATATCACAAATCATGAGGT CTCTATTATCTTTAACCTCTCCTATCTATCATATGTATAGTTTTAGAGTCTCTTACATTGCTGTCTAGGTCACCCAACTA TGGAAAAGTTGAGGAGAATGGTTCTGTAGCTTTGAAATATGAAGCCCTTTGAGTGTGAGTTATGTCAACTTGAAAAACAT GTTAGGGCACCATTTTCAAGCAGTATTAGTAGTCAAGTAGTGTCACTTTCCGAGCTCGTTCATTCCTATGTTTAGGTCCA GAGTCGTGTTATATTAGATTTAAGATTTAAATATTGTGTTACATTAAGATTTAAATATTATGTTACCTTTATTGGTGAAT TTTCAAGATGTACGTCGTTATTCTTAGTGAAAGATCGTTCTGAGCAATTTGGTGTTTTCAAGACTTTTTGTTGAGAGTTT AAGGATCAATTTGGCAAAACAATTTGAGTTTGGCACCGAGATAATGCAAAAGAATATTTTCCATGTCGTTTACTTCAGTC TTGGCATCATATCAATCCAAAGTTTGAGAAGTTTAGCAAAGTTATTTAGGAGTTTTACATGACTCATTGTGAAAAACATC ACTAACTTCTTAAATGTTCATCACTAGTTAAATTTAGTTACCTTGTTGTGTATATGGATGATTTTTTCATTACAGTTGAT GATTAAAAAGGGATTGATTAGTTGAAACAACACTTGTTCAAGTATTTACAAACTAAAGATTTGGGCTAATTACGAAACTT TCTCGTGATTGATGTAGCTCAAAGACGTGTGTTTCTATATCTCAAAGGAGATTTGTTCTTGATATTCTAGAAGAAGCTAG AATGCTTGATTGTATAGCTGTTGACACACCTATAGACCACAATTTGAAACTTCTTCCTAATCAGGGGTATCTTGATCTAG GGAGGTACACAAGGTTAGTGGGGTTGTTGAATTATCTTAGGATGACTAGACCTAACATAGCCTTTTCAGTCAGTGCTGTG AGTCAGTTTCTTAACTCACCTTGTGATAGTAATTGGAATGCAGTCATCCGGATCCCAAGATACTTAAAAGGATCACCCGA AAAAGAACTTGTTTACACGGATAAGGGTCATAATGATGTCCTTGGAATATGCTGATGCATATTGGGTAGGTGATGTTACT TAATACTAGGAGGATCACTACTGATTATTGTTTTCTTTTTGAGAAAAACCTAATATGTTTTCCTTTGTGCATACTAAGGA TCAACTTGCAGATATGTTAACAAAGTCTTTATGGGGTCCAAGGATAACATATAGATGTCACAAGTTTTGATAGATCCGAT ATATATACTCCAGCATCAAGAGAAGTGTTGAATATTTGTTATTAAATTTGTTATTTAGATTAGCATAATCCTATAAAATT AGGAATTGAGTTTGTTACATAGTTTTTCTATTTAGATTAGTAATATCCCATTAAATTAGGGGTAGAATTATATTTGACTT AAGAATATCCTCTTTTATGTATTTATAAATTGCAAAAGTCATATGATGAAATATACACAGAAAATATATTAATCGCAATA TCTTTCACACTTTTTATTTATTAAATGTGATCTAACAGTAATGTATTTTGTTTTCATATTTTATCTTTAAAAAAAATAGT GATATAAGAGTAATATAATATTTTTTTTTGCATGTAATAGAAAGTTATGTAAAGAGCGAAGATGATGATACTTGCATTTG CATACAGTAACAAGGACACCAAATTTTACTCTCTAAATGTTTTGCATAAAAACTAAAGTGTAGGAAGAGGATGTCACAGA CACACACTGACACATGTGTACATATATATATGTATGAATAACCACTAGCTTTGTGTTGCAGAATTTGGATCGGAAGGCAT TGTGTCCATTAAAGGAGATGTTTACAGCTTCGGTATTATGCTTATGGAACTATTTACAACAAAGAGACCAACAGATCAAA TGTTTGTAGGGGGAATAAGTTTAAGGTCATGGATCCAAGAGTCAATGCCAAATAAGATTATTCAAGTTATAGACCCGAAT CTGATGGAGGGAGAGGAACAATTTATTTCTGCCAAGGAAGCAGCTATATCAAATATCATGTTGTTGGCTTTGAATTGCTC TGCAGACTCCCTTGATGAGAGGATGAGTATGGATGAAGTCTTACGTCGCTTGATCAAAATCAAAACCACATTTCAGCAAG GAAATTCAAGTTAGGAAAAACCATAAAGTCATATTGTATTGTCATAAAAGGCTTTTGTTGTAATAATCTATTTGTTGAAA ATTCTCACACTACACAAAAAATGACCTTTATTGCACCTACTTTTAACAATTTTATGTGAAAGTACTAAATAACAATTTTA TAGAAG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0067700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTGTCACACGTTTCCCATGCTTCAATTGCTTGACCTATCTGGGAATTCACTTTTTGGTCAAATTCCATCAAGTTTGAA TCAATGTAAGGAGCTCAAGTATCTGAGGATGATCAGTAATCGATTATCTGGAAACCTGCCCAGTGATGTCGGAAGATTAT CTATGCTTGAGGAGTTGGACCTTAGTAACAACAATCTAACAGGTTCACTTCCTCCGTCTCTTTTCAACATATCCTCTTTG AGACTAATAAATCTTCGAAACAACTTCTTCAATGGCCAACTTCCTGAGGAGATGTGTCAGCATGCCAAGTCCCTCCAACA AATTTCTATCTTAAATAACAAAGTTGGGGGAATCATTCCAAGGTCTATTAACAACTGCACCTCCCTCAAACGCTTATTTT TGGGAGGAAATTTTTTTACAGGTACCATACCTCATGAGATTGGTGACTACCTAAGAAACCTTGAAAAATTGCATTTGCAA GGTAACAGACTGAGAGGGTCTATTCCAACAAGCATCTTCAACATCTCAGGGCTAATTAGTTTGTCACTATCAAATAACCA ACTGTCAGGCAACATTCCAATTAAAGCACATCATAGCATGTCCAACCTCCAGTTCTTGTACCTTTCAGCTAACAATCTCA GTGGAGAAATTCCCAGTGGCCTTTTCAATGCTACAGAGCTTCTTGAACTAGTACTTGCCAACAATACATTAACAGGAATC ATACCTGAATCAGTTGGGAATTTAAGAAATCTCCAACTCTTTTATCTGATAGGGAACCAATTGACTAGTGATCCAGCCTC TTCAGAAATGGGTTTCCTAACTTCATTGACCAATTGTAGACAATTGGAAAAAATTCTGCTATCATTCAATCCTCTTAACG GAACACTTCCAAATTCTATTGGAAACTTTTCAAACACTCTACAAACTTTGGATGCCTGGAGGTGTAATATCAAGGGTGAA ATCCCTTCACAGATCGGCAATTTAAAGAACTTGTTTGACATCAATCTAAACGAAAACCAACTTACAGGTCATGTTCCTAG TACAATTGGCACTTTGCAGCTTCTCCAACGTTTGGATCTTTCATTCAACAAACTAAATGGTTTAATCCCAGATCAGATTT GCCATTTGCTTAAACTGAATGAGTTGCGCCTTAGCGAAAATCAGATTTCTGGGCCAGTTCCAGAATGCTTAAGGTTTCTT ACTTCTCTAAGAAACCTTTACTTGGATTCCAATTACTTGAACGCTACAATACCCTCTTCCCTTTGGAGCCTCACAGATAT CTTGGAGGTGAACTTATCCTCTAATGGTTTTGTAGGGTCACTGCCAGATGAGTTAAGTGCCATGTTTGCTCTGATAAAAT TGGACATATCAAACAATTACCTTTCAGGGGAACTTCCAATTGGTATTGGTGGCTTGCAAAAGATAATGAACTTGTCGTTA GCTAATAATATGTTACAAGGGCGTATTCCTGATTCAGTTGGAAACATGTTAAGCTTGGAATTTTTGGACCTTTCTCATAA CCTTTTATCAGGCATCATCCCCAAGTCAATTGAGAAACTTCTTTATCTCAAATCCATCAACTTGTCTTATAATAAACTAG AAGGTGAAATTCCTTCTGGTGGCAGTTTCATAAATTTCACAGCTCAATCCTTCAACATGAACTCAGCACTTTGTGGGAAA CCTGAGCTAGAAGTACCACCATGTCCAAGTCATAGTGCGAAACATAACAGGACAAGAAACAAACTTTTACTGAAATTGAT TATACCATTAATTTTTGCTGGCATGTTTCTTGTTTTTGCAATTCTTCTGATATACCGGAAACAATGCAACAGAGGTTCAA ATAACTTGGATTTTCCAACACTTCTAACTACAAGTAGAATTCCCTACCATGAGCTTGTGGAGGCAACACATAAATTTGAC GACAGCAATCTTGTTGGAAGAGGAAGTTTTGGTTCTGTGTACAAGGGTAAGCTTTCAAATGGACTAATGGTTGCAATTAA AGTATTCCATTTTGAGAATGAGCAAGAAACATCAAGGAGTTTTGATAAGGAATGTGAAGCATTGTGCAATCTTCGCCATC GTAATCTAGTTAAAGTCATCACTAGTTGTTCCAATGCCTTTGATTTCAAGGCCCTGGTAATGGAATTTGTGCCTAACGGG GACTTGGAGAAGTGGTTGTATTCTCATAACTATTTCCTAAGTTTCATGCAAAGACTAAACATAGTGATAGATATTGCATC TGCCTTGGAGTATCTCCATCATGATAACCCCAACTCTGTTGTGCACTGTGACCTGAAGCCAAGCAATGTTTTGTTGGATG AAGATATGGTAGCTCATGTGTGTGATTTTGGCATATCTAAACTCTTGGAAGAAGGGCAACTTCAAGTGCATACAAACACT CTTGCAACTCCTGGTTATATTGCACCAGAATTTGGATCGGAAGGCATTGTGTCCATTAAAGGAGATGTTTACAGCTTCGG TATTATGCTTATGGAACTATTTACAACAAAGAGACCAACAGATCAAATGTTTGTAGGGGGAATAAGTTTAAGGTCATGGA TCCAAGAGTCAATGCCAAATAAGATTATTCAAGTTATAGACCCGAATCTGATGGAGGGAGAGGAACAATTTATTTCTGCC AAGGAAGCAGCTATATCAAATATCATGTTGTTGGCTTTGAATTGCTCTGCAGACTCCCTTGATGAGAGGATGAGTATGGA TGAAGTCTTACGTCGCTTGATCAAAATCAAAACCACATTTCAGCAAGGAAATTCAAGTTAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0067700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MCHTFPMLQLLDLSGNSLFGQIPSSLNQCKELKYLRMISNRLSGNLPSDVGRLSMLEELDLSNNNLTGSLPPSLFNISSL RLINLRNNFFNGQLPEEMCQHAKSLQQISILNNKVGGIIPRSINNCTSLKRLFLGGNFFTGTIPHEIGDYLRNLEKLHLQ GNRLRGSIPTSIFNISGLISLSLSNNQLSGNIPIKAHHSMSNLQFLYLSANNLSGEIPSGLFNATELLELVLANNTLTGI IPESVGNLRNLQLFYLIGNQLTSDPASSEMGFLTSLTNCRQLEKILLSFNPLNGTLPNSIGNFSNTLQTLDAWRCNIKGE IPSQIGNLKNLFDINLNENQLTGHVPSTIGTLQLLQRLDLSFNKLNGLIPDQICHLLKLNELRLSENQISGPVPECLRFL TSLRNLYLDSNYLNATIPSSLWSLTDILEVNLSSNGFVGSLPDELSAMFALIKLDISNNYLSGELPIGIGGLQKIMNLSL ANNMLQGRIPDSVGNMLSLEFLDLSHNLLSGIIPKSIEKLLYLKSINLSYNKLEGEIPSGGSFINFTAQSFNMNSALCGK PELEVPPCPSHSAKHNRTRNKLLLKLIIPLIFAGMFLVFAILLIYRKQCNRGSNNLDFPTLLTTSRIPYHELVEATHKFD DSNLVGRGSFGSVYKGKLSNGLMVAIKVFHFENEQETSRSFDKECEALCNLRHRNLVKVITSCSNAFDFKALVMEFVPNG DLEKWLYSHNYFLSFMQRLNIVIDIASALEYLHHDNPNSVVHCDLKPSNVLLDEDMVAHVCDFGISKLLEEGQLQVHTNT LATPGYIAPEFGSEGIVSIKGDVYSFGIMLMELFTTKRPTDQMFVGGISLRSWIQESMPNKIIQVIDPNLMEGEEQFISA KEAAISNIMLLALNCSADSLDERMSMDEVLRRLIKIKTTFQQGNSS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 581 581 -
Gene3D 2 100 99 6.5E-27
SUPERFAMILY 4 264 261 2.15E-53
SMART 5 29 25 41.0
PANTHER 7 148 142 1.5E-283
ProSiteProfiles 7 29 23 5.81
PANTHER 7 148 142 1.5E-283
Pfam 8 27 20 1.3
SMART 53 77 25 1.6
ProSiteProfiles 55 77 23 7.111
PRINTS 56 69 14 2.2E-5
Pfam 56 74 19 0.15
Gene3D 101 194 94 3.5E-25
PANTHER 140 263 124 1.5E-283
PANTHER 140 263 124 1.5E-283
SMART 151 175 25 6.1
Pfam 152 213 62 7.0E-8
ProSiteProfiles 153 175 23 6.418
ProSiteProfiles 177 199 23 5.918
Gene3D 195 267 73 4.7E-12
SUPERFAMILY 198 539 342 6.43E-63
PANTHER 199 899 701 1.5E-283
PANTHER 199 899 701 1.5E-283
SMART 200 224 25 1.3
ProSiteProfiles 202 224 23 6.349
ProSiteProfiles 226 247 22 5.001
SMART 248 271 24 86.0
ProSiteProfiles 250 271 22 5.494
Gene3D 268 577 310 1.8E-87
SMART 352 375 24 43.0
ProSiteProfiles 354 375 22 5.956
Pfam 355 413 59 2.3E-9
SMART 376 399 24 180.0
ProSiteProfiles 378 398 21 5.587
SMART 400 424 25 8.6
ProSiteProfiles 402 425 24 5.502
ProSiteProfiles 450 473 24 4.801
Pfam 474 533 60 7.5E-7
SMART 496 519 24 25.0
PRINTS 496 509 14 2.2E-5
ProSiteProfiles 498 519 22 7.165
ProSiteProfiles 522 544 23 5.363
Phobius 582 605 24 -
TMHMM 586 605 20 -
Phobius 606 926 321 -
Gene3D 613 716 104 2.6E-24
SUPERFAMILY 614 918 305 1.62E-71
SMART 639 920 282 2.7E-36
ProSiteProfiles 639 920 282 37.29
Pfam 644 912 269 1.4E-43
ProSitePatterns 645 667 23 -
Gene3D 717 925 209 2.8E-55
ProSitePatterns 760 772 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0067700.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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