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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0138200 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0138200.5 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DIS3-like exonuclease 2; TAIR: AT2G17510.1 ribonuclease II family protein; Swiss-Prot: sp|Q9SHL7|RP44A_ARATH Exosome complex exonuclease RRP44 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2R0N8|A0A0B2R0N8_GLYSO Exosome complex exonuclease RRP44; Found in the gene: LotjaGi4g1v0138200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:20530031..20554784) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGTCTGTGTATAACCGGTTAAGAGCTATCTGTAGCAATTCCATGAGGAAATTCTTTGTTTTTTCCAATGAATACCACAG GTAGGTTCTTTTGTTCTTTATTCTGTTTTGTTCTTATGGTTAACTTCTTTGTATTTATGATGAAAATTTATATTACAATA GCAGCATGCAAGGAAAACTAGAAATTTTACTTTACAAAGATTAGTGAAAATCTAAGGATGCAGCAAGTCTGCTCAATCTC TTTGTACCCGATGGGATGCAAGATAAAGAGCACTTGTTGAAAGCTTATTTAGTGCGTTTTCTAGTAGATAAGCTCCAATA AGCCTGTATCCAAACGCGTTCTTTGTTGCATATCCAAAATATAACTCAACCCCAAGCAAGCTTAGGGGCAGTCAATTGAC CCTAAACATATGAGCATTATGCTCTTCACACCCATGAAAAAGACTGCAAAGAATACATCTACAAATGTTCTGTTTCCTTG TTTTTATCAAAGCCTTTTGAATGAACCATTTGGGAAATTCACCCAATGCTGTTGCAAATTGAGTAGCTCTCGAAGCATGT GTTCAGAATGAGAGATGTGATCTTACTTGTGAGAGTAATGAATTTATCTGTGAGGCTAGCGAATGGAGCTCTGAATTAAC TGCTGCTTGTGATGTATGAAAGAAGATTAATTTTGAATTCCCAGCAATGGTTACTTTGTAATCCTGTAATTACTATTCAT TCTATTAATTGCAAAAAACGCACGAGTGTAGAAGGAAAACACACTGTTCCCAAATAACCCTGAATACTATTTGAAAGGAT TGTAGCCACCTTACTGTGCGGAAAAAGTGGTCTACTTCTTTGAACTGGATGTGCATCTAACACTCTTTTTACGAAAAAAG AGAGGTGTGAGGTCACAGGTCTATATTTTATTACTTACTGCTATCCAATTGAAAGACATCACTTTAGAAGACCCTAGGAA 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GACGCTTGGCAGCCAATTTGTACTGGAAGGGAATGAAAAATGACATACAGGAATTTGTGCGCGCGTGTGACACCTGCCAA CGTAACAAGTATATGGCAACAGCACCTGCGGGTCTCTTACAACCGTTACCAATTCCAGAAAAGGTGTGGGAAGACATTTC CCTTGACTTCATCACAGGGCTACCAAGGTCAAAAGGATTCGAGGCTATCTTGGTGGTGGTTGATCGACTGTCAAAGTATT CACATTTCATTCCTTTGAAACACCCATATACGGCTCGAAGCATCGCTGAATTGTTTGCCAAGGAGATCGTGCGTCTACAT GGTATTCCCGCCTCAATTGTGAGCGACCGCGATCCGCTGTTCATGAGCAATTTCTGGAAGGAGATTTTCCGACTGCAGGG AACACAATTGAGGATGAGCTCGGCGTATCACCCTGAGTCTGATGGACAAACGGAGGTGGTAAATCGTTGTCTGGAAACGT ACTTACGGTGTTTCTCCGCCGATCAGCCAAAAGCATGGGCCACCTGGCTCCATTGGGCTGAGTACTGGTTCAACACCACG TTTCATTCAGCAACTCAACAAACCCCTTTCGAGGTGGTCTATGGACGAAAGCCACCAGTTCTAGTACGATGGGCTCTTGG GGAAACGCGTGTGGAGGCTGTGCAAAAAGAATTAGCAGACCGAGATGAAGCATTACGCCAATTGAAGGTTCACTTGGCCA AGGCTCAAGATAGAATGCAAACCCAGGCGAATACCAAGAGGGTGGATAAATCGTTTACTATCGGGGAGTGGGTGTTTGTC AAACTCCGAGCACGCCGACAGAATTCTGTGGTCACACGAGTGCAACCCAAGTTGGCTGCGCGCTATTATGGGCCTTATCC TATAGAAGCCAGAATTGGAGCAGTAGCTTATCGCTTGAAGCTTCCACCGGCTTCGCGGGTGCACCCTGTTTTCCATATCT CGGTGCTTAAGAAAGCAATTGGCAACTATGAAGTGGAGCCTGAATTACCTGATCACTTGGAAGGAGAGACTCAACCCGTG GTCCACCCTGAAGCAGTGTTGGCTACTCGTTTGATTTCAAAGCATGGGGTGGAGGTTCCGCAGGTGCTCATCAAATGGGA GCAGGGCAAGACAGAGGAAGCCACATGGGAAGACGTTCTGACAATTCAAAGCCAATTTCCAGAATTTCACCTTGAGGGCA AGGATGCAGAATCAGAAGGGGGCATTGTTAGGACTGGTTCTGCAAATGGGCCAGAGGATGCATTGATTCATTATGGACCA AGTGGGCCAAGGGTTTGGAGAGTTTATTCTAGAAGGGGTAGGAAGGGAATAGCAGGGTAGATGGTTAACAGAATGGAGAG AGAGTGAGAAAGGTTGCAACGTCATACTATAAGGAGAATAGAGAGAGGTTGAGAGGTTATCGAATCTTTTGAGCTAATTT GAGTCATGGAAAGGAAGCTGTAGCTTCCTTAGGAGCAGTGCTCTGGTCAGGATTGGAATACCATTCCTTCTCTGTAATTT TCCCTTTCACACATTAATAAGCCATCTACGTTGAGTCCTTTGGTGTTTTTCCTGACTGTTTACTTGTTGGGATTTAGCAT CCTAACAGACAACAATACGTGTATACGTCTCACAGACGTTTATAACTACCTATCTGGTTATGCTCTATGCCATTTCTTTT TTAAATTGAGTACTGGATCATTGAAAGAGCATTTCGATTTAATTTTTATGATACATAAGACCATAACTTAATAGCTTCAA GCGGATCTACAACCCATTTATTATTTACCATGTTGAATCCTGTTCATGCTTAGTTTGACCTACTAGTCTGTTCAAGTGTT GGTACTGCCTTGGTCCCCAGACCCTAGAGTGTTGGCGTCTCTCCTATCTTCTAAGATGCACAATGCAGAAAGTTCATATG CATTTCTATTGGTTATTTGTTATTCTTCCTTTATTCATATGATATCTATTCTGTCTTTAACAATGTGATTAGAATATTCT CTTCGCATAATTGCTCTTGAACTTCTTACATATGTTCAGGAAATGACACCAGAAGCAGACATTATTTCCAGCAGATACAC AAAAAGTGTCATAAAATCCTGTGCAGCACTGTCTTATGTTGAAGCACAAGCGAGGATGGATGATAGGTGGGCTTTTATTT CTCCTTGGATGCTTTATGTTGATATGAATTGACTTGTCTTTAATTTTGTAATATTATTTAAAGCTAGGACTGAAGAAAAA AAAGTAGGTAACGTGACATATGTTTCTCTTCTGGGATTGTGGTATCCCAGCGTATATTCCTGCTACAATTGCTAGTGAAA TAGCTGTACTGACCCAATTGATTTTTGCAAAATAAACAAAAAGGTAAGACAGAGGATTGTATTCTGACAGCTATCAAACA AAAACCCACGCTAAATGACTGGGCACATGTTTATGCCAACAATTCGAACTGATTGTTGAAATATCACCTATGCTTTCTTG TTCAACTTTTTGTGTTAACATGATAATTTATTTTGTTGCCCCTAGGGGTTAGGCATCGTGTTGAAATGACTAATTGTTTC TTCTAGTCTATTAATGTATGCAATTTCTGTTTGGTGAAGATGTTTGGTCACTGTATTGTGTGTTCTCTTTGTACAGTCGA TTGATGGATCCGGTAACTACAGATTTGAGGAATATGAATAGTTTAGCCAAGGTATGGATTTTTGGATGCACATTTATTAT TTACTGAGATAATTATAACTATGGTTTTATTTACATGCTCTTTAATGAAATTGTCTGAAAAGTAAATCTCTGTTTATGAT CCATCAGAAAATGAGATTAAGACGTATTGACAACGGAGCTTTGACACTTGCATCTGCTGAAGTTAAATTTCAAATTGACA CAGAGACTCATGACCCCCTTGATATTGGTATAATTTTCTTAACTCTTAATGTCATTTGGTATTTCTTTTTGAGGTCGTGG AAGATGGGATTTTTTTTGTTATTCATCATTTCACTATTGAAATGTATGTCTTTTTTTCCTTTCAATCTTGTCAAATAGCC AATTATCCCAAAAACTCAAGCTGTTGGGTACGGGTCAAATGAATGGCTTTATATCATAGTCTAACAAATCCAATCCCTAA AATTTCAGTAGTAATTTATTTGCTTTCTCTTAAGTATGTTTCCTATATTTAAATTGGGAACTTTTTTGGAGAGAGATTGA GGTTAATGATATACATTTTTAATTGCTTTTAGCTATTCATTCATGAAAGGAGAAGGGAAAGTCAGTTCCTCCTTTTTTTA AAAATTAATTATTTTGTTTGCTTTTATTTGCAGGCATGTACCAAATCCGAGAAGCCAACCAAATGGTGGAGGAGTTTATG CTTGCTGCTAATGTTTCTGTTGCACAACAAATTCTTAGAAGTTTTCCTTTGTGCTCATTATTAAGGTTATTTTCTTATCT GGAACTTTAACTTTTATCATTATAATGGTGTTTTACTAGGATGAGGGAAACAGTATTGATCATATGAAGAGTTATTTTCA TAAATTTTATGTAAGGACATGAGTCTGTGAACTTTGGTAGATAGACTTAACATTAGAGAGAAGGATAAAAAATTACTCCT ACTCCCAAAATATGAGAATCTGATGTAAAATAAGCATTGAAGAGTATGACTATTGACATAACATGGACAATGCACAGACC CACCTACCATGTGCTGAAATTCAACTTTTTTTTATTAGAGGAATTGGGCGGCAAGGATCGAAATCTAGACCGCTTGGTCA TAGAGGCTTTAATACCATGTCAAGAACCAATTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAAAGGACTCCGAATGGTTTATAT TATATTTCTAACAGCTATTTTGGTAATTGTTTGTTGGATCTTGTGTAGGCGTCATCCAATTCCAACTAGAGAGATGCTTG AACCCTTTCTAAGAATTGCTACTGCGGTTGGCCTGCACTTGGATGTTTCATCATCGAAAGCATTGGCTGATTCCCTTGAC CATGCTGTGGTAAATATTTTTGTATTGTTTTCCATTGACAATATAATGATTTATGGATAGTGTTATTATATATAAATAAT GATGTAATGGGATCTGTATATTGTGGACCAAAAATAATTGAGCAAATTGCTAACCTCCCCTGATGTTTATCATCATTGTA CTGACCTCCCCTGTTGTTTATCATTATTGCCCTGACCTCTCCCATCTATGATTTAACCAGATACTAACTGCCATTATTTT ATTGGGGACATTGCACTTACCTCTCTCGAGGTTTATCTTTATTACACTGACCTCCCTTAAGATTTATTATTAGAACAATC AACATCCCTCTATCATTCTAAATGGTCTATAAGGAAGGGGGGTCAGTGAAATTTGTAAAATAGAGGAGAGATTAATGCAA TGATGATAAACCTCAGGGGTGGTCAGTGCAATTTGCCCAAAATAATTTGGTCCATGGGTGCACCAAGGGTATAACTGGTA ATGCATACACAATTATTACACATGCTTCAAACCGCCTTCCCTCCGTGCTCTGTCCCCCCCCCCCCCCCGACCACAATGCC GTCCTCTGTTGGCCATGGACCCGTTTTGCCCTTTACCACATTTTTCCTTCTCATTCCTCAGTGGGTGCTACAGGGCTCCA TGACCGCAGCTGTAACAAACGACATTGGTTTGTCAGCCAGATGTCTTCATCACCATTTGTCAGCAATAAAACCCCCTTTT CCCATGCTCACCACACTCTTTCTTGAGTACCACCGCTAGCCATCGCGTCATCGTTTTTTTTCCCACTGCACACGATCACA AACTGCTGATCATTCCATTGCGAGCTTCCATGGCTGTGTTTCTATATGCCTTGCCATTCATTCAAGTCACTGCAGTACAA CAGATCTTGACCCCCGTGTTTTCTGGAATGCAGCGCCAACCTTAACGATGCCTACGCCTACCCACCGACTTCTACTTCGA ACTGACAACAAATATTCTGTTACCTTCGCTGCTGTCGACTTTCACCTTCGAGAAATTATTCCTGGAATCTTGATCCCAGT GTTAAAATCATGAGCCTACCTCATTAGTGTACTGGCAGACCAAATTATTTTTGGTCCACCCTTGATATAATAGCTTATGT TGCAACATCTTTAATGATTGACTTTTAATACCTTACACATTGCTAGCTCAAACATTAGGTTTTGAAGGCCTTCATTTCTT TTCAATTTCTGTTTCTCTTATGCCATGTACTTTTTCAGGGTGATGATCCATACTTCAACAAGTTAATCCGTATTATGGCA ACTAGATGCATGACTCAGGTAATTGAATTTGAATGAGAACCCAGATTTACAGTTTATAAGCGAATATTAATTTTTTGTTT TGCTTTTTAGGCAGTTTATTTCTGTAGTGGGGATCTTAGCCCTCCAGAATATCATCATTATGGACTTGCAGCTCCTTTGT ACACCCATTTCACTTCACCTATAAGAAGATATGCGGGTAGGCATGTTATGATTTAATGTTTACTTGGTCAATTGTGCACG ATAATATGTTTTAGTTTTTTTTTTTTTCCTTGTAGATGTCATTGTGCACAGGCTACTTGCTGCTTCTTTAGGAATATCCA AGTTACCATCTGTATTTCAGGACAGGCTCCAGCTGACTAGTATTGCAGACAGTATGAAATCTCTTTCATGATCTATTAGA ACTTGGTCTTTTTTTCTTTTCCTTATGGAAGTTTTCTCGTGGTTAACTATATTCATCATGAATAAATTAGTACATTTTTC TTCACTGGTCTTATTCATTGGATGTGAAATATTTAAAATCATAATAACGCTTTTCACTCAATGTGGTTTAGATTTAAATT ATCGGCACAGGAATGCTCAAATGGCTGGGAGGGCCTCTATAGAGCTGCACACACTTATTTATTTCCGTAAAAGGTTTGCG ACATAACTTCCCCTCCCTGTTACTGTTAATGTTTTCTATCTATATGCACTTTGCAGCTTATTCTGGAGGTTGTTTATCTT CATTCATGCAGGCCAACAGATACGGAGGCAAGGATAGTGAAAATAAGATCTAATGGATTTTTTGTGTTTGTTCCCAAGTA ATGTATCTTATCCTTTTTCTTTTTCCTTTTTTAGTTTGGTTTTTCATATGACCAATGAAAAGGTGAATAAGGATGACAAA CAATAAAGAAAAAAAAAAGAATGTTTTGATTTATTCTAGCTAGTAGATGGTTATCTTGGAAAAATTCAATCGTTTAAGCA GCTATTAGATGTCTTTCTACTTTGACTGAGGTTGTCATTTATAGCTTGTGCGTGAACATTTTTTTCTGCCCACAGATACG GCATAGAAGGACCTGTATATTTGACAACACGAGCTGAAAAGGGAAATGGAGACTGGTATGTTGATGAGCAAGAGCAGAAG ATTAAAAAGATGGATGGAAGCGTTTCATATAGCATTTTGCAGTCAGTCCAAATTCACATGGAGGTTGTGGAGCCCCAGCC TAACAGGCCAAAACTTCAGCTTACTCTCATCTAG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0138200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTGTGTATAACCGGTTAAGAGCTATCTGTAGCAATTCCATGAGGAAATTCTTTGTTTTTTCCAATGAATACCACAG GGATACGTATGTTAAGGAAATGAGTGGGGAGACTAAAAATGATAGGAATGATAGAGCTATCCGGGTGGCTACTCAGTGGT ATCAGAATCATCTTGGTGGTGCAGTGAAGGTTTTGCTTATAACTAATGATAGAGAGAACAAACGGAAAGCTAGTGAAGAG GGGATTTGTGCAGAAACAGTTGAGTCATATGTCAAATCTTTGGACCGAACCGATCTACTTGACTTACTGGTGCGGCCTAC GTCTGAAGATGTAGACATGGAAGAGGTTGAAGATCTCAGACCATCCAAGAGGAAAGTAATCTATTCGGAGCATAAGCCGA TGTCAGAAATTACTTCCGGTTTGCATCGTGGAATCTATCATCAAGGGAAACTTCGTGTAAACCGTTACAATCCATTTGAA GCATATGTTGGCAGTGAGAGCATTGGTGATGAAATAATCATTTATGGGCGCTCAAATATGAATCGAGCTTTTGATGGTGA TATTGTGGCAGTTGAACTTCTGCCACAGGACCAGTGGCATGAAGAAAAGTCTCTATCTATTCGCGGTGAAGAAGATGAGG ATGACGACGAAGATGTTCATCTAGCTCCAAATAGTGCTGATGATGCACCGAGAACTATTCCCCAACAAGGTTCTACTGGA GGAATCAATGCAGTGTGCAATCGGCCATCTGGTGTTGTAGTGGGCATTATAAAGAGAAACTGGCATTCGTATTGTGGATC TCTGGAGCCAATGCCTCTGCCTGCAGGGAGTGGTGGTGTTGCTTATGCCTTGTTTGTTTCCAAAGATCGTAGAATTCCCA AAATTCGACTCCAAACCCGCCAACTTGAAAACCTGTTGGATAAGAGGATTATTGTGGCAGTTGATTCTTGGGATCGCCAA TCTCGTTATCCATCAGGCCATTATGTGCGAACTATAGGAGATATCGGTGATAGAGATACTGAGAGCGAGGTGGTATTGAT AGAAAATGATATCAACACAAGACCGTTCTCTTCACAAGTGCTAGCATGCTTGCCACCATTGCCATGGTCTGTCTCTTCTG AGGATTTCTCCAAACCAATTAGGCAGGATTTGCGTCATCTACGTGTCTTCAGTGTGGACCCTCCAGGCTGCACGGATATT GATGATGCACTCCACTGTTATGCTCTTCCAAATGGAAACTTTGAAGTTGGAGTTCATATTGCTGATGTGACAAATTTTGT ACATCCTGGAACTCCTCTTGATGATGAAGCTTCTCAGAGGGGAACATCGGTCTACCTTGTTGAGCGACGGATAGACATGC TTCCGAAACCTCTTACAGAGGACATATGTTCTCTTCGGTCTGATGTGGAAAGGCTAGCATTCTCTGTCATATGGGAAATG ACACCAGAAGCAGACATTATTTCCAGCAGATACACAAAAAGTGTCATAAAATCCTGTGCAGCACTGTCTTATGTTGAAGC ACAAGCGAGGATGGATGATAGTCGATTGATGGATCCGGTAACTACAGATTTGAGGAATATGAATAGTTTAGCCAAGAAAA TGAGATTAAGACGTATTGACAACGGAGCTTTGACACTTGCATCTGCTGAAGTTAAATTTCAAATTGACACAGAGACTCAT GACCCCCTTGATATTGGCATGTACCAAATCCGAGAAGCCAACCAAATGGTGGAGGAGTTTATGCTTGCTGCTAATGTTTC TGTTGCACAACAAATTCTTAGAAGTTTTCCTTTGTGCTCATTATTAAGGCGTCATCCAATTCCAACTAGAGAGATGCTTG AACCCTTTCTAAGAATTGCTACTGCGGTTGGCCTGCACTTGGATGTTTCATCATCGAAAGCATTGGCTGATTCCCTTGAC CATGCTGTGGGTGATGATCCATACTTCAACAAGTTAATCCGTATTATGGCAACTAGATGCATGACTCAGGCAGTTTATTT CTGTAGTGGGGATCTTAGCCCTCCAGAATATCATCATTATGGACTTGCAGCTCCTTTGTACACCCATTTCACTTCACCTA TAAGAAGATATGCGGATGTCATTGTGCACAGGCTACTTGCTGCTTCTTTAGGAATATCCAAGTTACCATCTGTATTTCAG GACAGGCTCCAGCTGACTAGTATTGCAGACAATTTAAATTATCGGCACAGGAATGCTCAAATGGCTGGGAGGGCCTCTAT AGAGCTGCACACACTTATTTATTTCCGTAAAAGGCCAACAGATACGGAGGCAAGGATAGTGAAAATAAGATCTAATGGAT TTTTTGTGTTTGTTCCCAAATACGGCATAGAAGGACCTGTATATTTGACAACACGAGCTGAAAAGGGAAATGGAGACTGG TATGTTGATGAGCAAGAGCAGAAGATTAAAAAGATGGATGGAAGCGTTTCATATAGCATTTTGCAGTCAGTCCAAATTCA CATGGAGGTTGTGGAGCCCCAGCCTAACAGGCCAAAACTTCAGCTTACTCTCATCTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0138200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSVYNRLRAICSNSMRKFFVFSNEYHRDTYVKEMSGETKNDRNDRAIRVATQWYQNHLGGAVKVLLITNDRENKRKASEE GICAETVESYVKSLDRTDLLDLLVRPTSEDVDMEEVEDLRPSKRKVIYSEHKPMSEITSGLHRGIYHQGKLRVNRYNPFE AYVGSESIGDEIIIYGRSNMNRAFDGDIVAVELLPQDQWHEEKSLSIRGEEDEDDDEDVHLAPNSADDAPRTIPQQGSTG GINAVCNRPSGVVVGIIKRNWHSYCGSLEPMPLPAGSGGVAYALFVSKDRRIPKIRLQTRQLENLLDKRIIVAVDSWDRQ SRYPSGHYVRTIGDIGDRDTESEVVLIENDINTRPFSSQVLACLPPLPWSVSSEDFSKPIRQDLRHLRVFSVDPPGCTDI DDALHCYALPNGNFEVGVHIADVTNFVHPGTPLDDEASQRGTSVYLVERRIDMLPKPLTEDICSLRSDVERLAFSVIWEM TPEADIISSRYTKSVIKSCAALSYVEAQARMDDSRLMDPVTTDLRNMNSLAKKMRLRRIDNGALTLASAEVKFQIDTETH DPLDIGMYQIREANQMVEEFMLAANVSVAQQILRSFPLCSLLRRHPIPTREMLEPFLRIATAVGLHLDVSSSKALADSLD HAVGDDPYFNKLIRIMATRCMTQAVYFCSGDLSPPEYHHYGLAAPLYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAASLGISKLPSVFQ DRLQLTSIADNLNYRHRNAQMAGRASIELHTLIYFRKRPTDTEARIVKIRSNGFFVFVPKYGIEGPVYLTTRAEKGNGDW YVDEQEQKIKKMDGSVSYSILQSVQIHMEVVEPQPNRPKLQLTLI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CDD | 1 | 90 | 90 | 1.6235E-40 | – | |
| Gene3D | 1 | 102 | 102 | 8.2E-35 | – | |
| PANTHER | 2 | 844 | 843 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 844 | 843 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 13 | 96 | 84 | 2.16E-5 | ||
| Pfam | 36 | 87 | 52 | 2.4E-5 | ||
| Gene3D | 116 | 224 | 109 | 8.1E-31 | – | |
| SUPERFAMILY | 125 | 333 | 209 | 7.54E-42 | ||
| Pfam | 129 | 220 | 92 | 1.4E-13 | ||
| MobiDBLite | 206 | 241 | 36 | - | – | |
| Gene3D | 261 | 336 | 76 | 2.0E-28 | – | |
| Pfam | 282 | 350 | 69 | 2.2E-18 | ||
| SUPERFAMILY | 339 | 757 | 419 | 3.48E-130 | ||
| SMART | 381 | 712 | 332 | 9.7E-138 | ||
| Pfam | 381 | 710 | 330 | 1.3E-95 | ||
| ProSitePatterns | 679 | 703 | 25 | - | ||
| SUPERFAMILY | 761 | 841 | 81 | 3.43E-12 | ||
| Pfam | 761 | 831 | 71 | 2.2E-8 | ||
| Gene3D | 761 | 845 | 85 | 1.1E-7 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | RNA binding | Interacting selectively and non-covalently with an RNA molecule or a portion thereof. | ||
| Molecular function | Ribonuclease activity | Catalysis of the hydrolysis of phosphodiester bonds in chains of RNA. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0138200.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…