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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0103400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0103400.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ATP-binding cassette transporter; TAIR: AT5G58270.1 ABC transporter of the mitochondrion 3; Swiss-Prot: sp|Q9LVM1|AB25B_ARATH ABC transporter B family member 25, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RLN7|A0A151RLN7_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0103400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:15889675..15910480) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGTGATTGGTACTTGTTTTCTGCTGTGCGCACGTCATACCCTCTTTTGCTTTTTCTTTCAGGTTTTGAATGTTCAGGTCC CTTTCCTATTCAAGCTTGCAGTTGATTGGTTGACGGCTGCCACGGGCAATGCTGGTGCTATTGCTTCAAATTCGGCCGCG GTGGCTCTTTTTGCAACCCCTGCGGCGGTGTTAATTGGATATGGGATTGCACGATCAGGAGCTTCTGCTTTCAACGGTAT TTATTAATGAAGTGATTGTTATGATACTTATTTTGTCCTCCTGTTGAACTTAGTCATGGCGTTAGCACTAGCAGGCTTTG TAATTCTAAATTCTAGGCTTCTTAAAGGACACACTTCTTTTATCTACATTTTATGCCCATAGGATCCATATTTATGTTAA AGATTTAACTTCCACTCTTTTGGATAGACTGAAGGTAAATAAGTATTATTAAGGGTCAGAAGTCTAAGAGCCAGGTATGG TATATCCTCTAAGAGCTAAAATGAACTAATGTAAAACACGCAACAAAAGAAAAGAAACAGTGTAAATAGGAGAAAGCACG ATGCCCAAACCCTGTTCAGATTGGACATGGCAATACCCTTGCAACAACCATAGGCAGAATAGTATAGAGAATGGGAAAGA AATACCTTTAAGGATGTCAAGCCTCAAATAGTTTTTGAGCCGTCTAAGCTCATCACTAGCCCTAGCTGCTTGTGTCCTCT GTCAGACATTTGCATAATGTCCTTGATGCAGTTACTTTTATGTTTGTTTCTTTGAAAACAAACATAGTTTTTGTGATCCA TTTTGTTAATTTTTAATTTTTGGATTCAACTAATTATGGCAGAACTGCGGAATGCATTATTTTCTAAGGTAGCACTCCGA ACAATTCGATTGGTATCAAGAAAGGTATGCTGCTTTCATTGTTTCAGTGTATCTTAGAAGGAAAAATATTTTCAGTTCAT 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CATAAACAATTTAACCTTCATCTCAATGTGAAGTAGGCATATCACATGTGTGTTAAAGGTCTCTTGTGTGAGGGGGTATG CTGGTCTGTTAGATATATATACTCGTCCCTTGGCATTGCACTAGTTTGTTGCATTTTCTTGGAGCCAAAAGCTCTGCATT TTTATCGTAGTTCATTTTTCACTGAACTTACCTTGGAATGGGATTATGTAATTTTTGGTTTTATAGCTGTTGAATATCTG TTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAGATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATT TAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTT ATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAATCAATGAAATACACAATAATTATTTTATCAAAT TCAAGTTGGTATCAGAGCGAGTTTCGATCCTACCGCTGTGAGGGGGCTCCTCCCCCGTGAGCCCCCTCATGGTGACCTTC CAAATCTCTTTGGATTATTTTCACTCGTCCTGTGCTTCCGCGCTTGTTCGTTCTAGCCTTTTCTTACGGCCTCGTTTCTT TCTGATTATGGTCCCCTTTGTCTTGGAACCCTATTGACCCTTGTTTCTTAATACTTAAAACAACCGCGCCTTCTTCTTCG GCGCGTGAAGGTAACGCACAAACCTGAACTCGACGCGACGACCACATACATGTTCGTCCGTTGTAGTATAGTTGGTCAGG ATATTTGGCTCTCCCTCCTGGTTCTGTTCCAGATGTTGTTTTCTCCAGATTTTCCTTCCTTTAATGCAGTTGCGTGATTG GAAGAAATTGTGGGAATTGATTCAACAATTGTTTACTCAAGAATTCTTGATTGGAATGACATAATAATTCTTCACTGCCA GCGAGAGTATTGGTTACATGAAGTGGAAATATGGAATGCCAATGCGTTGGGATGGTGATATTGGAAGTTTCTGATGATGC CAGAATGAAGCAGTACCATGTGGCTCTTTGGTCCAATCCAGTTCTCAATTAGTGTGTTGGGTTGTTCTAGTTTCTTGTTT TTGGTTTCTTGGTTTTGGTTGGCACAGTGTGGTTTTGGAGTTGGAAAAGATTTTTGCTCTCTATTAAAGTGGAGAATTGG TTTTGCATTGTGTGGTTTGTTGGTGTATAAATTTTGGACTATTTTTGGGAATATCTCTCTCCGGCAGCAGCTGCTTCTCA AGTTAATTATATTTGTTAAAAGCTATGCATATGACATATATGCGCTAGCTTGAGGGGAAGATCTGAATATTGTTAAATCT TAATTATATTTGTTACAAGCTATGCATATGACATATATGCTATAGTTTGAAGGGAAGTGTTGGATATTGCTAAATATCCT AATAGAGACCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGGAGGGTGTATTCAAGAAGTGTTT GGTTGGATCTAATTGTATTGCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTTTCGGCCAGGTTTGGTTTTTAAGGTCCT CTATTTGACGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCTGGTCTTCCTCTTCCAGTTTGGTTTGTGGGTCTGCTGTGT TTTCTCATCTGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGTTCTTAGTTTGCGTCTCATGGTTCGTGATGCTCTTATTATATTGATCT TGGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTTGTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTTCGTTTGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTTTTCT GGTTTTAGGGCTTCAGCTGCAAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAGTTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCTAGCT GCGAGTTGCGCTGGCTCGCTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTTTGTGTCAAAGTTGACACCATTGTTTGTTTTAGAAGCCAT CAATCGATCGACCTCAAGTATGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGAGTTGTTGCTTCAGCCTTGTTTTGTTTTCG GGCGTATTGTTGCTGGTTTTTCGCCCTTGTTTGCTGACTCAGCTACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTCTT GCATCAATTTCAGCCAGATCAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCCTGCCCATGGATTTAGCAGAAGTTCGAAAGATTATTC AATTTGAAGTATGAGAAGTTGGCTTTTATCGCCATGGATTTACTAGAAGTTTGAAAGGTTATTCAATTCAGAAATTCGCC AAGACTGTCATTATTAAGGGATATCTATTAAGATAATTTTTTTCTTGGGTTCGATTTGTTACAAGCTTAAAGCTAAGTAA GCTTTAGCTTGAGGGGGAGTGTTGAATATCTGTTTAGATTTAGTTTACTATTAGTATTATCTCATTGAGATATAGTTTAG ATTTGTTTCTCTATTTTAGATTAGTATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATAGAGATAATATCTATTTAAATA GAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTCTTTGTTAGTCTATATATATTGTAGTTTTCAGTCAAGTATTAAT CAATGAAATACACAATAATTATTTTATCAAATTCAAGTATAGCGTTCAACTAATGTCTGTTTGAAACGACCACTTTTATC AACATGTCCCATTTTATTAGCACACGGGTTTATGCAAGTATTTTGGAGAACTTTTGTAAATAGCTTATGACTAGGGTCAG ATTTGTTTATGAATAAGAGCTTATGCTTACCCAAACGCGCCCTAAATATTTCTGGTGTTTCAATATTGTAATTTCTTGCC CGTCTTTGTTCTGTCTTCTCTTAGGTTGTGTGATGAAGCTACAAGTGCCCTTGACAGCACTACAGAAGCAGAGATTTTAA GCGCATTAAAGTCACTAGCTAATGATCGAACTTCCATATTCGTTGCTCACAGGCTTACCACTGCAATGCAGTGTGATGAG GTAACCTTTCTCTATCTAGGTTCATGTCCTTCAACATTAAACAATACTGAGTTTCCTGTATTTTATATATATGTCTAGCT ATAGTTTACATATTTATGATACTTATTACAAAATTTACATGAAGTTTGCATAAATTGGTCCAGAATCCAGTTAACTGATT TTGTCTCCAGTAGTAATCTCTATATGTCAGGACAACACATCATCACTGTAAACCAATACACTATGTATAAGTCTCATTTC ATAACAGTAGATTTACGATTAACTATTGTAGTTGGTTCAAAAATCCTTGTAATTAACGTTTTGTGATACTTATATGAAGA GTTTTTTTTTGTCAATGTTCAGATCATTGTTTTGGAAAATGGAAAAGTTGTTGAGCAAGGACCACATGAAGAGCTCTTAG CAAATGCGGGAAGATATTCACAACTTTGGGGCCAGCAAAATAACACAGTCGATGCAATTGACACAGCCATCAAAGTGGGA GCATAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0103400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGTTCAATGTAGCACCCACCATATTAGAGATATCTATGGTATCAGGTATACTGGCTTACAATTTCGGAGCTCCTTT TGCTTGGATTACTTCCCTATCAGTTGCTGCTTATATTATTTTTACACTGACTATCACTCAGTGGAGGACTAAATTCAGGA AAGCCATGAATAAAGCTGATAATGATGCCACTACAAGGGTTGTTGATTCACTTATTAATTATGAGACTGTCAAATATTTC AATAATGAAGTTTATGAAGCTGATAAGTATGACAAGTACCTAGAGAGGTATGAGGATGCTGCTCTGAAAACCCAACGCAG TCTTGCTTTGTTGAACTTTGGTCAAAATATTATATTTAGTACTGCTCTTTCAACAGCAATGGTGCTGTGTTCTCATGGGA TCATGAATGGCACGATGACTGTTGGTGATTTGGTGATGGTGAATGGGCTGCTCTTCCAACTATCTCTTCCTCTCAATTTT CTTGGTAGTGTTTATCGCGAGACTATACAGAGTTTAGTTGACATGAAATCCATGTTTCAGTTACTTGAGGAAAGAGCCGA CATCAGGGACAAAGACAACGCAGAGCCTCTGAGATATAATGGGGGGAGGATCCAATTTGAGAATGTACATTTTAGTTATC TCACAGAAAGAAAGATACTAGATGGAATATCACTTGTTGTGCCAGCTGGTAAAAGTGTTGCAATTGTTGGGACTAGTGGA AGTGGAAAATCAACCATTCTTAGATTGATATTCAGGTTTTTTGATCCTCATTCTGGAAATATAAAGATTGATGGTCAAGA TATTCGGGAGATAACCCTTGAAAGTCTGCGGAAGTCTATTGGTGTTGTTCCACAAGATACTGTACTTTTCAATGATACAA TTTTTCACAATATTCATTACGGTCGTCTGTCAGCAACAAAAGAGGAGGTCTATGAAGCTGCTCGGCAAGCTTCCATTCAT GATACAATCATGAGTTTTCCTCAGCAATATTCAACAGTCGTGGGAGAACGAGGGCTCAAGTTAAGTGGTGGTGAGAAACA ACGGGTTGCCCTAGCTCGTGCATTCTTAAAGTCGCCTGCAATATTGTTGTGTGATGAAGCTACAAGTGCCCTTGACAGCA CTACAGAAGCAGAGATTTTAAGCGCATTAAAGTCACTAGCTAATGATCGAACTTCCATATTCGTTGCTCACAGGCTTACC ACTGCAATGCAGTGTGATGAGATCATTGTTTTGGAAAATGGAAAAGTTGTTGAGCAAGGACCACATGAAGAGCTCTTAGC AAATGCGGGAAGATATTCACAACTTTGGGGCCAGCAAAATAACACAGTCGATGCAATTGACACAGCCATCAAAGTGGGAG CATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0103400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVFNVAPTILEISMVSGILAYNFGAPFAWITSLSVAAYIIFTLTITQWRTKFRKAMNKADNDATTRVVDSLINYETVKYF NNEVYEADKYDKYLERYEDAALKTQRSLALLNFGQNIIFSTALSTAMVLCSHGIMNGTMTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNF LGSVYRETIQSLVDMKSMFQLLEERADIRDKDNAEPLRYNGGRIQFENVHFSYLTERKILDGISLVVPAGKSVAIVGTSG SGKSTILRLIFRFFDPHSGNIKIDGQDIREITLESLRKSIGVVPQDTVLFNDTIFHNIHYGRLSATKEEVYEAARQASIH DTIMSFPQQYSTVVGERGLKLSGGEKQRVALARAFLKSPAILLCDEATSALDSTTEAEILSALKSLANDRTSIFVAHRLT TAMQCDEIIVLENGKVVEQGPHEELLANAGRYSQLWGQQNNTVDAIDTAIKVGA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 26 | 26 | - | – | |
| Gene3D | 1 | 194 | 194 | 6.8E-82 | ||
| ProSiteProfiles | 1 | 170 | 170 | 27.283 | ||
| PANTHER | 1 | 442 | 442 | 3.8E-248 | ||
| PANTHER | 1 | 442 | 442 | 3.8E-248 | – | |
| CDD | 1 | 178 | 178 | 1.77672E-104 | – | |
| SUPERFAMILY | 2 | 184 | 183 | 1.07E-35 | ||
| Pfam | 14 | 157 | 144 | 3.9E-24 | ||
| TMHMM | 23 | 45 | 23 | - | – | |
| Phobius | 27 | 48 | 22 | - | – | |
| Phobius | 49 | 112 | 64 | - | – | |
| TMHMM | 107 | 129 | 23 | - | – | |
| Phobius | 113 | 134 | 22 | - | – | |
| Phobius | 135 | 145 | 11 | - | – | |
| Phobius | 146 | 165 | 20 | - | – | |
| Phobius | 166 | 454 | 289 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 193 | 439 | 247 | 3.55E-90 | ||
| Gene3D | 195 | 450 | 256 | 4.6E-95 | – | |
| CDD | 204 | 439 | 236 | 1.67236E-155 | – | |
| ProSiteProfiles | 204 | 438 | 235 | 24.49 | ||
| Pfam | 220 | 369 | 150 | 5.7E-36 | ||
| SMART | 229 | 415 | 187 | 7.9E-16 | ||
| ProSitePatterns | 341 | 355 | 15 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Molecular function | ATPase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction. | ||
| Molecular function | ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, to directly drive the active transport of a substance across a membrane. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0103400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…